XLOC_029805 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_029805
Unique NameXLOC_029805
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000001_pilon:1688303..1697967-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_029805 ID=XLOC_029805|Name=XLOC_029805|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9665bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000001_pilon:1688303..1697967- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTAGTATACAGAAAAATAAAAACCAAAACCAAAATGTCTTTTTATGGATT CAAGAAACAATTTAACAAAACCAGTCAGGTGGGTATTTTTCAATTATAAT AGCATACCATAGAAAATGTAAAATGTAACCAGCAAATTTGCAGAACTAAA AAATGAAGCAACTTCCTAACTGTAGAAATTTTTGTCATCTTTCCTGACTT CATCGGCATAGCTCAACAAAAAATGATATCCTGATTATAATGGAAGCTAG AAATTTTACAAAAATCTTAAATAATAAAAACAAATTTAAAATAAAATATG ATAAAAATTCTATTAGACGAAAATTTTCTGTTCTATGGCCAGCTATGGCA TACCTTAGTGGGTGTTGCCCACTATGACCAAGTCCATCATTTCAATTATA CTTATGGAAATATCAAGCCACCCCTATTATTTGAGCAATTTGTAATTTTG CCTATAATAATTGACTTTTTGTGAAATTGAAAAATTAGTTTGAGTTATTA AGTTTTATTTTATCAAATTGTAATTTTATCTCAACAAAATATCTTTGTGA GGTTAGAAGTAAAAAATTATCATAACCAGGTTGTACAATTTTTCAAATCC ACAGCTTGAAGAACTTTTTCCAATTTTTTATAGTTTTTGAGTGAAAAGGT TGCAGGCAACAAAGGATCTCAACTAGACGAAGAATATGTGGAATTGGAAA GGGTATTGATTGAAAATTTACTATTATAATATAATATAAAAAATAATAAT ATAAGGTTTGCAGGGTTACAGGCCACCGTGAAGACACAAGAGCCTCTATA AGCCACTCGTATTTTTTACAATGATCTTTTTGATAATATGTTTTACAGCT TTTTGAAAAGAAAGGTTTCTTGCTCAGATGTCATTTCAATCAAAAAATTA GAAGTAACATTTTTAAATTAATATGAAATTCAGACTAAGAAATTTTTTAT 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ACATGTTAGTGTTACTTATTTAAATTACAAAACTTCTAGGTTCGGCTCTC ACAGACTTGGGTGAAGCTTTCAATCAAATTTCTGAGTTCAAAGATACCAT GGTAAGAAATTGAATTGGTCTTTCTGTCTTGTAAAATTATTAAGATTTTA AATGGGAATTAAATGTTTGATTTCAATGACTAATATCATTTTACCAAGGT ATCAGTGCTTTTAAATATTTTTCCAAATATAAGAACTAATTGAATGTAAT GCTGGGTTATTCTCAACAGGCTTGAAATAACATTAAACCAAGGAAACCAG TTTTTGTTCAGGTAGATACCAGGATGAATTAAGCTAACCATCATCTTTTC TTTCTTTTAGGAATATAGCGTCAAACAAAACTTTTTGGATCCGCTGTTTC AAATTCAACAAAAAGATTTGAAAGAAATTCAAGTATTCTATCAATTTTAT AACTTCTTTTCTAAATATTTTTTAATCCAAATCTTTAAGCTTTTTTGTTT TATTCGTAACATTTAAAAACAATATTCAAAGGCCAAAATTACTGATAATC TCCACTATTAGGGATATTCTTGACATCATCAGAATAATGACGAATGATAG AAATATCATTTTCAATCTTCTGTTCTTTCAGCATCACCGTAAAAAGTTGG AAAGTAGGCGGTTAGATTTTGACTACAAGAAAGGAAAAGGTGCAAAAGGT CAGTATCTAAATCAATTTTTTGCCCTAAATTATACTTTTATCCTTTTTTT CATAAATTGACTTTGATGTAGCTACGGTACTGTACACTAAAGCTGAACGT TTTCACTATACACTTCGGATAAAGGATGGGAAAGTGAAGACATTATTTGT ATCCAAAGTTCAAAGCACAGAGAAACTATTTCATTCATATGTTTTATTTT GCAACAAACACAGTTTTAAAAAACTACCAATTCAATTAGCTTTTTCTTAA TAGGGCTAAACAATTCGACATTTAAATATACATTACGAAGCACAGTTCCT GTAGTGTTCATACTGCTTTCTAAAATATTGAACTCAAATAATTTGATTTT TGAACTCAATGCATTTTCTTCTCCTTTTTTCTTCTTTTCAATCCTTCATC CTGATGAATTACAATACAAAATTTACTTTCCAATCGTGTAGGAGGAGGTA GATATTTTATTCAATTTTACTAAAAAAACTAAACTAAAACTAAAAAAATA TATATAATTGTATTTTTAACCAAAAATAAAACCAAAAATTAACTAAAATT GATTTAAAAGAACTAACTTTTCGAATTTACAACTAAAATTCAACTACTAA GAATCTTGATTGTAAGTACCAGAGAAACTACTACATTTTTACCTCCACAA AATTTCATGCAATTAATTCATAAGATTTGAATTCAAAAAATTACTCATGT CTTGGTATAACATTTTGACTAATTGCATTTTACATGTCTTCTAGGTGAAG TTTTGTGCAAGAATCTTGAAATTATTCTTTTTTATATTTCAAATCGTATA GATTCTAAAGAAAATAACAGCCTCACCCTTCAAATTCATTCTCTTAAAGT GAGACCCTCACTTTTTTTCAGATGCTGGCTAGACATTATTAACTGATTCA TTCATTTATACCTTATGCACCTAATATTTTTCTAGCCTCACACATAAGCA CCCTCTCATTTACTAAATTTCATTCATTCATTCATTCATACCTTATACAC CTAATGTTTTTTTCTAACCTAACACATAAGTATACTTTCATTTACTAAAT TTCATTCATTCTTTCATTAATACATACACCTAATATTTCTTTTTTTTTGC TGATGGCACACATAAATTCATTCATTCATTCATACCTTATACACCTAATA TTTTTTCTAACCTAACACATAAGTATACTTTCATTTACTAAATTTCATTT ATTCTTTCATTAATACACACACCTAATATTTCTTTTTTTTGCTGATGGCA CACATAAATTTATTCATTCATTCATACCTTATACACCTAATATTTTTTCT AACCTAACACATAAGTATACTTTCATTTACTAAATTTCATTCATTCTTTC ATTAATACATACACCTAATATTTCTTTTTTTTGCTGATGGCACACATAAA TTCATTCATTCATTCATACCTTATACACCTAATATTTTTTCTAACCTAAC ACATAAGTACACTTTCATTTACTAAATTTCATTCATTCTTTCATTAATAC ATACACCTAATATTTCTTTTTTTTGCTGATGCCACACATAAATTCATTTA TTCATTCATACCTTATACACCTAATATTTTTTCTAACCTAACACATAAGT ACACTTTCATTTACTAAATTTCATTCATTCTTTCATTAATACATTCACCT AATATTTCTTTTTTTTGCTGATGGCACACATAAATTTATTCATTCATTCA TACCTTATACACCTAATATTTTTTCTAACCTAACACATAAGTATACTTTC ATTTACTAAATTTCATTCATTCTTTCATTAATACATACACCTAATATTTC TTTTTTTTGCTGATGGCACACATAAATTCATTTATTCATTCATACCTTAT ACACCTAATATTTTTTCTAACCTAACACATAAGTACACTTTCATTTACTA AATTTCATTCATTCTTTCATTAATACATTCACCTAATATTTCTTTTTTTT GCTGATGGCACACATAAATTTATTCATTCATTCATACCTTATACACCTAA TATTTTTTCTAACCTAACACATAAGTATACTTTCATTTACTAAATTTCAT TCATTCTTTCATTAATACATACACCTAATATTTTTTTTTTTTTTTGCTGA TGGCACACATAAATTCATTCATTGCATTCATACCTTATACACCTAATATT TTTTCTAACATAAACACATAAGTACACTTTCATTTACTAAATTTCAGTCA TTCATTCTTTCATAATACATACACCTAAATATTTCTTTTTTTTTGCTGAT GGCACACATAAATTCATTCATTCATTCATACCTTATACACCTAATATTTT TTCTAACATAACACATAAGTACACTTTCATTTACTAAATTTCATTCATTC TTTCATTAATACATACACCTAATATTTCTTTTTTTTTGCTGATGGCACAC ATAAATTCATTTATTCATTCATACCTTATACACCTAATATTTTTTCTAAC TTAACACATAAGTACACTTTCATTTACTAAATTTCATTCATTCTTTCATT AATACATTCACCTAATATTTCTTTTTTTTGCTGATGGCACACATAAATTT ATTCATTCATTCATACCTTATACACCTAATATTTTTTCTAACCTAACACA TAAGTATACTTTCATTTACTAAATTTCATTCATTCTTTCATTAATACATA CACCTAATATTTCTTTTTTTTTGCTGATGGCACACATAAATTCATTCATT CATTCATACCTTATACACCTAATATTTTTTCTAAGCTAACACATAAGTAC ACTTTCATTTACTAAATTTCATTCATTCTTTTATTAATACATACACCTAA TATTTCTTTTTTTTGCTGATGGCACACATAAATTCATTCATTCATTCATA CCTTATACACCTAATATTTTTTCTAACCTAACACATAAGTACACTTTCAT TTACTAAATTTCATTCATTCTTTCATTAATACATACACCTAATATTTCTT TTTTTTGCTGATGGCACACATAAATTCATTTATTCATTCATACCTTATAC ATCTAATATTTTTTCTAACTTAACACATAAGTACACTTTCATTTACTAAA TTTCATTCATTCTTTCATTAATACATTCACCTAATATTTCTTTTTTTTGC TGATGGCACACATAAATTTATTCATTCATTCATACCTTATACACCTAATA TTTTTTCTAACCTAACACATAAGCACACTTTCATTTACCATTCATTTATT CTTTCATTCATTAATACATACACCTAATATTTTAAATTTCTTATTTTTGC TGATACATAACATAAACACTTTTTCATATTTTACATATACTGAAATTTTA TTCACTCGTCTAATATGACATATGCATTTCTAAAACATTTTAATGATCTT TAATTTACTGAACCTTACTAATTTCCCTTATGCAACACTGCAATTTTTAC CAAGATTTATATATAAGCTATTGCAGTGGTGTTTATAAATCTTGAATAAT ATGATAGTTTTGAGCAAGGGGCTACTTATACTACACAATATATTGGTGAA CAATATTCGACAATATGTTTTGCGGACCATAATGTAAAAAGTGAACAACA GGTTTCGTTATAAAAAGGAATTTCTTTCTGTAAAATTCCCTTATATTGTT GGAATATTGCAAGTTGAGCTGGCATTATACCGTGGAAATCTTTTCGACAT CTTTTCAATATATTGCCGACACTAAGTAACATCTTTTCAATATATTTCCG ACACTAAGTAACATCTTTTCAATATATTGCCGACACTAAGTAACATTTTC TCAATATATTGCCTGACATTGTGTAGTGAATGTAGCCCTTGACAGTTTGT TTATTAATCGAAGTTCCCATTTTTATTCGTCACTAGCGATTTTCTTATTA TGCATTATAATTCATCTTATCCAAATTCCATAATTGTTTGGGGTTTTACT CAAAACCTATTGACGAGATTTCAGTCTAGGCTCCAAATTTGTATAACTAT TTTTTTCAATTTCCAACCAAACCTTAAACAAAAAGCTTGGGAACTTACAC TTCTTTTCTCTCCTTTTTATGAACAGTACCAGAGGAAGAATTGCAAATGG CTGAAGAGAAATTCGATGAATCGAAGAACCTAAGTTATAACAGCATGATG AACTTTATGGAGAGTGATGTATGTATTTGATGTTTTTGGACCTACCCCGG TGGGGTGGAGGTCCTATAAATTAACGTTCGTTCGTTCATTATTACTATTA GCTTTCCTCGTGATTGGCTCATTAGTTTTTTCTGATTTTTTGCCCAAAGA TGTGTAACTAAAAACCCTCGAATGTGACGGGGCCCGATTTTCGAAAAAAA AAATTTTGGGCAAATTTGGGCCAAAAAACGGCTAAAAAGAAATACAGCCG CTTTAAGACCAACTAACTGTCAGCTCTACTGCTATTTGACGTCAGATCTT GTCTTTTGATCGTACTGAAGTCGGTATGTTTTTGAACTTCAGGCGGCTGT ATTTCTTTGTGTCTTTTAGTCAGAGAGTTGTTGTAATACTTTTTTCTGCT CAGAATTTCATGGTCTTTCAGATGGTATCAATCATTTTCGTTTATTTTGA GTTTTGAAAATCAGCTATTTCTCTAGCCCTTATTTCCCTTGCAGTTTTGC CTATGGCGTCACTATTTTGGTCATAAAAAGTTTTCCCGGGCCTAATCCGT ATCCTCCCTCTCAAAAATATCTTGTAATATACTGTTCCTTTGAATAGACT AAAAATGGCTAGGTCGTAGAAAAGATGTCACGGAACCCAAGGCTTGGCCC CCTACTAAAAGTGTAATAATGTACATTTCCATTCAAATATATTTTTCACC AGGTTGAGCACGTGGGTCAATTACATTCATTCACGGAGGCTGTTGCTGAG TACCACAAACAATGTGCTGAAGTCATGGAACGAGTCTGTGCTGAACTCGG TGAAAAGTAAGTAAAATCATGGCATTTTGCACATTGAGTTTAAAAGCTAG ACAGGAATCTTGAACCTTTATAAAGCAAGAAAAAGTGGACGATAGATTTT ATTTTAAGATTGGAGTTTTTTTGGAATTGGTACCCGAGAAGAAGCCATGG CAGTGTTAAAAATTAATGTCTAACGCCGTTATATCATCAAAAGAATTTGA GGAAAAGTAGGCCTAGCGCTCTCGATGCATTTACACCACTATCGAGTAGT GCCGCCATTAGGGTACCACTTTTCAAAAAACTCCGATCACGAGTAGTGCC ACCATTAGGGTACCACTTTTCAAAAAAACTCTGATCAAAGATTTTGCTTT ACCAGGATTGGGAAACTTGGTCCAGGGTATATAAAGGTCAGTGGTTTTGA ATAGGGAATAAGTGGCTTCATTTCTCATTCAAGAGTGTCCCCTCTTGCCA CTTCGGGGCTTCAAACTCAACGATTTTGCATCTAACTGGTTCACCAGAAA ATTAAAACAAATTCAACAAATGCTAAAATAATTTTATTCTCTTCTTTAGG TTGAATGAAGCAGCCAGCCGACCACGCGCTGAACGTAGCTTTATTTCCCG CCCTGTCTCCAAGTTCAGTACAGGAAGTACTGAGTTTGAAGTACTTGAGG CTGACGGTAGTGCGGCATCCGCCTCTATTTCGGCACCTGTTGCGCCCGCC CGTGATGTAGCCCCGCCCGTATTGGCGGTTCCACCTCCACCCTCCAAAGT TCCCAGTGCTCGTGCAATTTATGATTTCGAGCCAGGTGAGTGGATCGTTC GTTTATTTTACTTCGACTTTTTTCCATTCAAAATTTAACAATTCAAGATT TTCAAAACCTCCAATGACACTTTTAAGGGGTTTGACCGTAGTGAAATTTT TCACACACTTTAGGCGTACAAACTTTCGTGAGGTTGAGAATCGCATTTTC TTTTCGAGTTTCACGAAAAAGTCTTTTTTGAGAGGATAAACCTTCGCGAA TCAAGGTATGAGAATGGCTTAAGGGCTCTGACCATAGTGAAATTTTCATA ATTGCCGTGTTTAAAATGTGTTTTCTGACTGATGTAACCAACAAAACTAT GGCATGTTATACATTTTCTGTTAGAAAAACTATTCCTGAACCTGAAAATT CAAAAATTGCATTGAAAAAAATCGATGAAGAAGAAAATGAAGACTTTTAC GAGGAAGAGTATTTCAACTTTGAAGAGCTTAGTTAAGGCGAAGAAAAAAC ATTTTGAAAGATTTTTCGTTGTAGATGGTGTATCTTTTACCGAACAATAA GAATTTTTGCGGAAAACCTTTGTAAATGCTTCTTTGCCTCGAAATCTTCA AAATAGTGGTTTTTCATCAATTTTTCATCTGGATTTTGCTTAAAAAAACA GTCATAACTTTTGACACATCTTTTCAGAAAAATTTCCGCAAAATTTAAAA TAGTTCAATTCTTTGCGGACAGTGTAAAGAAATTTTGTAACAAAAAAGTT AATTACCCATTAAAACTAAGCACTTTTTGTAAAAAAGGGTGATGCGACAT ATTATTAACATCTTTTTAAAGTTCATAACGTCATTTTTGCAATTAAATTC TTAATTACTCTTAAGGGATTCGATTAAAAAGTAATTTATAAAGACAATTC TTTGTTAAAAGTGTTAAGGAACCTGAAATATAACTTTTATGTGCAAATAC CAAAATCAATTTTTGGACTATGGTCAGAGCCCTTAAGGGGCTGAAATTCG CGAAAATCGCGTAATTTTTCTGCTTCTGAAAGTTTGTACGCCTAAAGTAC TATGTACAAAGTATGAATTCTGCCTATTTTATCCAACAAAAATATAGCAT GTTATACATTTTTGTTAGACTAACTGTCGCTTGATCTTAAATTTGAAAAT TGGACTGAGAATAAGATTGAAAAATGAAGACCTTCCGCTGCAAGAACCTC TCTGGGTCAGTAGAACAGGTCACTTTAGATACACTTAAAGAATCTTAAAG TATTATATTTTCTTTTAAATAGAAAATGAGGGTGAATTGCCTTTCAACGA AGGTGATATGATCGAATTAACTGGACGAATTGATGAGAATTGGCTTGAAG GTAGATTTAATGGGCATTCTGGTTACTTCCCGGAAAATTACGTCGAAATC GTGGTACCGTTGTAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000001_pilon:1688303..1697967-

>XLOC_029805 ID=XLOC_029805|Name=XLOC_029805|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2280bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000001_pilon:1688303..1697967- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTAGTATACAGAAAAATAAAAACCAAAACCAAAATGTCTTTTTATGGATT
CAAGAAACAATTTAACAAAACCAGTCAGTTAGTATACAGAAAAATAAAAA
CCAAAACCAAAATGTCTTTTTATGGATTCAAGAAACAATTTAACAAAACC
AGTCAGTTTTTGAGTGAAAAGGTTGCAGGCAACAAAGGATCTCAACTAGA
CGAAGAATATGTGGAATTGGAAAGGTTTTTGAGTGAAAAGGTTGCAGGCA
ACAAAGGATCTCAACTAGACGAAGAATATGTGGAATTGGAAAGGAAAGTT
GATATTGTGACACAAGGGATTGGAGATTTCCAGGCAAAAGTCAAGGAATA
TTTGCAACCTAATCCAAAAAGTTGATATTGTGACACAAGGGATTGGAGAT
TTCCAGGCAAAAGTCAAGGAATATTTGCAACCTAATCCAAATGCAAGAAC
CAGACTAGCTATGCAAGGCGCCATTCAGAAGGCAAAAGGACAACAACGGA
ATGTTAGGTACCCACAGCCTGAATTCAACTTAGGGGATGTATTCACAAGG
GCAGGTGCTTCTTTGGATGACGGCTCGCCATACTATGCAAGAACCAGACT
AGCTATGCAAGGCGCCATTCAGAAGGCAAAAGGACAACAACGGAATGTTA
GGTACCCACAGCCTGAATTCAACTTAGGGGATGTATTCACAAGGGCAGGT
GCTTCTTTGGATGACGGCTCGCCATACTGTTCGGCTCTCACAGACTTGGG
TGAAGCTTTCAATCAAATTTCTGAGTTCAAAGATACCATGGTTCGGCTCT
CACAGACTTGGGTGAAGCTTTCAATCAAATTTCTGAGTTCAAAGATACCA
TGGAATATAGCGTCAAACAAAACTTTTTGGATCCGCTGTTTCAAATTCAA
CAAAAAGATTTGAAAGAAATTCAAGAATATAGCGTCAAACAAAACTTTTT
GGATCCGCTGTTTCAAATTCAACAAAAAGATTTGAAAGAAATTCAACATC
ACCGTAAAAAGTTGGAAAGTAGGCGGTTAGATTTTGACTACAAGAAAGGA
AAAGGTGCAAAAGCATCACCGTAAAAAGTTGGAAAGTAGGCGGTTAGATT
TTGACTACAAGAAAGGAAAAGGTGCAAAAGTACCAGAGGAAGAATTGCAA
ATGGCTGAAGAGAAATTCGATGAATCGAAGAACCTAAGTTATAACAGCAT
GATGAACTTTATGGAGAGTGATTACCAGAGGAAGAATTGCAAATGGCTGA
AGAGAAATTCGATGAATCGAAGAACCTAAGTTATAACAGCATGATGAACT
TTATGGAGAGTGATGTTGAGCACGTGGGTCAATTACATTCATTCACGGAG
GCTGTTGCTGAGTACCACAAACAATGTGCTGAAGTCATGGAACGAGTCTG
TGCTGAACTCGGTGAAAAGTTGAGCACGTGGGTCAATTACATTCATTCAC
GGAGGCTGTTGCTGAGTACCACAAACAATGTGCTGAAGTCATGGAACGAG
TCTGTGCTGAACTCGGTGAAAAGTTGAATGAAGCAGCCAGCCGACCACGC
GCTGAACGTAGCTTTATTTCCCGCCCTGTCTCCAAGTTCAGTACAGGAAG
TACTGAGTTTGAAGTACTTGAGGCTGACGGTAGTGCGGCATCCGCCTCTA
TTTCGGCACCTGTTGCGCCCGCCCGTGATGTAGCCCCGCCCGTATTGGCG
GTTCCACCTCCACCCTCCAAAGTTCCCAGTGCTCGTGCAATTTATGATTT
CGAGCCAGGTTGAATGAAGCAGCCAGCCGACCACGCGCTGAACGTAGCTT
TATTTCCCGCCCTGTCTCCAAGTTCAGTACAGGAAGTACTGAGTTTGAAG
TACTTGAGGCTGACGGTAGTGCGGCATCCGCCTCTATTTCGGCACCTGTT
GCGCCCGCCCGTGATGTAGCCCCGCCCGTATTGGCGGTTCCACCTCCACC
CTCCAAAGTTCCCAGTGCTCGTGCAATTTATGATTTCGAGCCAGAAAATG
AGGGTGAATTGCCTTTCAACGAAGGTGATATGATCGAATTAACTGGACGA
ATTGATGAGAATTGGCTTGAAGGTAGATTTAATGGGCATTCTGGTTACTT
CCCGGAAAATTACGTCGAAATCGTGGTACCGTTGTAAAAAATGAGGGTGA
ATTGCCTTTCAACGAAGGTGATATGATCGAATTAACTGGACGAATTGATG
AGAATTGGCTTGAAGGTAGATTTAATGGGCATTCTGGTTACTTCCCGGAA
AATTACGTCGAAATCGTGGTACCGTTGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_029805XLOC_029805-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000001_pilongenomesc0000001_pilon:1688303..1697967 -
Properties
Property NameValue
Aaloc1015-1155:142
Aaloc778-1011:1616
Aaloc673-774:2264
Aaloc583-672:3038
Aaloc514-579:7135
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Aaloc238-378:8350
Aaloc163-234:8658
Aaloc94-162:9033
Aaloc16-93:9666