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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000005_pilon:2597953..2603937- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_044483 ID=XLOC_044483|Name=XLOC_044483|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5985bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000005_pilon:2597953..2603937- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAGTTTCCTAAAAAACGAAATGGTTCAAAGATCAAATCAAAATGGAT
TGGTTTAAGGAAAAGAAAAACAAAAATTGCAGGACCACCTAAAATTACTA
ACTTTAAAATTTCAAATGTTCCAGTTACTAATGATGATAATGGTTACGAC
TGTGATGTGGAAAATTTTGATGAACATGATGTTGGAACTTATGATGAAGA
CTTTGTACCTAAAAAACAATGTTATGGTATTAACAAGGAGAAAGAATTAA
TTTGTTGGGACAAACATAACATTGATTATTGCTTGATTTATGCAATGAAA
TTTAACACTTTCCCGAGCCATTGCTGCTTTTGTAACGATGAAGTTATCAC
ATCTTTTGTATGGTGTAAATCATGTGGACCATTGTCCTTTTATTGTCATG
ATTGCGCTTATAAAATTCACAAAAACACCCTCTTTCATTCATTGGTTGAA
GTCCAGGTTTGTTTGTTTTCTTCTGGTCTGTCTATAATAGGCACCCTATT
GGATTTTAATTGTGGTTGATATTTTTCAAATTCGAAAGTTGGGGCTGGGT
TGATGACAAGTTTCATATAGAGGTTTCCCTATGTGAGTGGGATGACTTTT
TCCAGATGGAGGTCAGAGAGTTTATTGTTGATTTCAAAGTTGAGGGAGTT
AAGGTTGAGGAATATTCTCGAATATTTATTAAAAAGAACAAAAGGTCTGC
TCATACTTCTGAAGAAATTTAGAAAGTTAAGTGTTTAGATCTCTTTTGAA
AACATTTTTGTCTCAAGTTTAGGCTTGGATATGTCCTCAAGATGTATTTT
AAATGATTACAGGTTGATGGATGCAATGTCAAACCATTCAAAGTAAAATC
TGTTCTGCAAACTGATCATGTAAAAGCATGTACTTCAGCTTATTCAAGAA
CATTGACTGTGATTTCAGAAACAGGTGAATTTTATTTAGTTTGGCGTATA
CTTGTTGCAAAGTAATGACTGCCAGTACATTCTTAAATACACTCTCCTTG
GCTCAATCTAGGCTGCAAATAAGCATTGTTAGTCTTCAGTCATGTCCCAT
TGCAAAAAATGGTGGAATGACTGAAAGTCCTTTTGTGCACGTCAGTTTTT
AATGCTTTATTCATATAGGGAGTTTCGGACTGCGTTTAATAAAAATTCAT
AACAAACAGACTTGTACTTTTTATTTGCAACCCTTGCCCAATTATTACAA
ATTTGGATTATAGTAAAATCGTTAGTATAATTAGTATAATATTGTAGTTC
TTTTTATTTCATATGAGTATCGACAAGCAACTGTTTGAATATTATGGACT
TTTTGGTTATTTTTATTCGAATAAAACATATATAGAGAGTATTTTTAATT
ACTGATATTTACCTTAGGATCAACTCATCAATGTCAAATTTATTTTTGTA
AATGCACAGAAGAGTTCAATACTTTGGTACATCTGGATCTATGGCCAGTA
ACACCGATAAAGCCAAATACAGTTATTTCAATGAATTTGTTACACCTTTT
TGTTGCATTACAGTTGGAAGGGAAAATATCTTTTTCGTCTTTTTGTGATG
GTTTCTCTTGGAAAAGTGGAGTGGTTGATCATGACCTGGTAAGATACTAT
ATGGGTGAAGAAATTTCTAAAATTTTTGTCCAACTATCTTCTACCAGGGG
ATTGGGTGGCAGAGCAACATATGTAATGCATGCATTTTGTTCTTATTAGG
ACTCTAGTACTGTATATATTCTCATTTCATAAGAAACATTATAATACCCA
ACTTCAAAATTGAGATTTATTGAAAAATATTGATTAGAGATCTATTTTTA
AGGTCACTTTTTGTTTTGAACCAATGAAGCAAAAGCTGTCCTTCCCAGGC
AAAACAAATTGACATCTTAACTATTTTCAATCTGGCGTTTGTACAAAAAC
CAGGCAAGCCGTGCAACTTTGATGTAATTTAACTCGTTTCAAATTCTACC
ATACATATTCCACTCTAGCCCCTGGCTATACCTCATTTGCTTGAACGGAG
CAAACACAAAAAAATCTACACAATTCTATAATCCAAAAAAAATGTTACAA
GTAAAAACCGTACAGTAAATTCTCTTGATGTTGATCCTGATCTCTACTTT
TCCCTTTTTTCTATATCAAGTATTTTGAGAAAAAACAATCAACAATCAGC
ATTTCAAAAGGCATCTCCACTGTGATAATTTTTAGTCGTTCAGTTAGGAG
AGAAATATATTTTGAAAAAAAACTACTTTTTAGAAGAGATACCTGAACCG
CATGACCCAAACGGATTCATTAGATCAATTCAGACATTTCCGTCGACAAT
TAACAAGTCTGAAGACAATATGCCCGAACTATGATGGTTTGGAAAAGTGT
GCATCTTGCCCCAAGGTATTAAAAAATTTAAGTCTTTACTTTTTTTAAAC
ATAAACAAGCTACCGTATGTCCATTTTGATCAAGTGATTCCCTATATCTC
CCTCAGTAATTTTTGAATTTTTATGTAACTTTGCTTGTCTCGAAAGATTG
TGGTGTCAAACAAAACATTGGGGACTGTTTGTAAACTGCTGTAAGATATT
TATTTTGCATCGTAGAATATGAAATTACACATATAAATCAAAATATTTTT
AAATTGGACAATTTGATTCTTTTAAGGAGAATGGAAGTATTTTCTACTGC
TTTGACGCCAACTTTGGACTTGTGTTAAAAAGCTCTGCTTCTAAATCAAA
GAGACTCGCTATGCGGTCGGAAAATCTATTTATCCTTGATGAGGAAGTAA
AAACCTTTATGGAAAGCTACGATGATACTTTGAAGACAAAGGTACAGGAT
TTAATTACGTTGTGAACTTTTATTAAAAGATTAAAATATTTTTCAAGTCC
GTTAAAGGCTTTTTATTGACAATCAATGTTTTGAAATAATAAACTAACTC
CAAATTGCTACACAGTGTTTCATGCTATGCAGTCGTCAGATAATTCGTTT
GTGGTTGTTTTTTGCAACCATTCAGACATTCTTCAGCACTGTGTGACTCT
ATTTTTCTTTTTTACTTAATGTATCAACAAATAGAAAATTTCAAGGTAAA
TTTTTCATTCAAACGAATATAAACTTGAGCCGAAAGGCGTGTGTTTTCAT
TCAGTTGTTCTGATTGTTGATAAAATAGACGATTAATAATAACATCTTAA
GAAATTGATTTTGTAATGATTTGTAGAATGAAATTTTGGGAATCTGCTCA
AAATTTGCGAATTTGTGAAATTCTATTTTAATAAAGTAATTTTTTTCAAT
TGGCTTAGGATTGCAGCAATTTCCAAGCTGGCAACAATTTACGGTCAAAA
CGAAAAACGAAGAAACTCAGTGTAACTGGAGTATTTGGTACATTAAGTGG
ATTAATTTTCACGTGGACTTTTTTTTGCGAATTAGGCTCTTTTTTACCTG
ATTTTTTTCATTTAGCTGATGATTTTAAATTTTTTCATAGAGGACTAATT
TTGGCAAAGATGGCTGAAATTCGCGAAAATCGCAAAAATTAATCCACGTG
AAATTTAATCCACTTAAGGTATGTCTTGTCGTCATGAGTTCCCGAAGCTT
TTCTTGAATATGCAACACGGTGAAAGGTAATGATTCAGAATTGCAGTAAT
GCATAAACGAGCAGTTTTTATTCTCAACTTCAAGCGTGCTAGAATCTTAG
AACAGTGAATACCTAGGGTACTTTAGTTTTTTGGCCTTGGAACAGTTTTT
ACGTCGAAACAAAGATGACAGCATTGAGATAAATTTTTTGTTAAAAATCT
TAAATTTGTTCTATCTTAGCAATAGAGAACAGCTAGCCGATATCTAGTTT
GAAATTAGAAAATGGGTCCAATATAACACGGAAACACTTCTTATAATACA
TAATCTTCAAGTTTACAATTTGTCAAGCTTTTAAAACCAGAATTTGAGAC
GGATAGAACTCCAGTGGTTGTGTAACACAAGGAGTGTTGATAAGATTTTT
TTATTGTTTTATCATCATCAGAAATAGTAGTTGCATTGTTGTTTTAGATT
GGGCTACGCCGTTCTTCTCCTTGATCAGATACTGAACGATACAGAAAAAA
AGAGGTTGGATGTGCACATCATATATGATATTGCATGCGTTTTGAAGTCA
CATTTGCAGGTAGAAAATTAGGAAAACTTTTTTTTCTAATGATCATACCT
CATTTAAAATTTCTTTTTTCAAAAGAGTGCAAATAACTCTATATAATAAC
TCTCTAAGACTTTTTGTTTTATGTAAATCACTGTAACATTTCTTTGTAGA
TATTGACTTAGATCACCGACCTACCTCTCCCATCTAATTTTAGCCTATTA
CACGTAAGACTGTATGTTAATATTTTTTACGTTATCTTTAGAAAAAGAAT
ACTTTTACCAAGTATCAAGATTTCAAATTTGGCATCCCTGTTTTTCATTC
GTATGGTCACAGAGGAGACTGTCAGGTGATTATTGAATTCTATGATGGTT
TTTCTGCTTTCAGAATTTTGAAAATTTTGCGATTTCCGCGAATTTTGAAC
AGATTCGCGAAAATTTATTCTCGCAAAAACACTTTTCAATAAAGTCTACG
CTCGACCATAAATTCTCCAACAGCTTGGAATGTAATTTTGGGATACCTTT
TGTGTTGATGGTTTTGAAAAATCTCAGGCTTCAACGCTCTATCTTACAAA
AAATAGTGAAAATCACAAATAAAAACAAAAGTCGACAAATTTTCTTTTCT
CGCTTCATTTTTTTGAAAGTTAATTTGTTATTTTTAGGTGAAAAATTCAA
TCAGAAGATTAGATTCTTTTGGCCTTATGGATGGTGAATTGATGGAACGC
CCTCTGGTCATATCTTCGATCATTCTCAAAGATTACCAAGGAGATGACTC
CAGCTCACCGCACGGATTTACTTAGTGATGCTCTGCTGCATTTTGGCTCA
AAGAAAATGGGAAATATCGGTATGATTACTTTGAAAAGTTCTATACTAGT
GTTACATAATTATGATATTTTTAAGCTGATTAATCACTTGGTGTCATCTA
TTAAAGCTTTGTTTATCACTGGTAACGCGAAACATGATTGGATTTTTAAA
TCTTTACTTAGGCTTTACTTTTATTTTCTTTTAGGAAAATATCTCGTGTT
TCTATTTCAAAAAGCAACAAGAACTTTGAATTCTTGCGATTCAGAAATTA
AAACGATTTGCTCTAAACTGCCTGGTAAGTTATAATTTTTTGATTTAGAA
TAACTTATTCTAGTAAGCATGAAGCTTAGCGAATTGAGGTCTGCTTTAAT
AAGTTCTCGTCAAAATCTATATTAGTTCAATTCTTAAAACAAGCTCTCGC
TAAAAGTCATTTCGATACAGTCGGTTGGTTCTAAAATTCTTCTTTAGAAA
AACATTGTAAATTTAGAAGAATTTAAAAGAAAACAGTTCAAAAAGGCCAG
TCAAATTTTAACACTTTTTCAACACTATTCTAGTTAATTTGAAAATTCTA
TCATGACTGATTCATGATACCTTTTATAAAATTCCTAAAAGAATTGTTCA
AAACATTTAGCTCATGTGGATGAAGAAATTATCAAATCATGGAAAAAAGA
GGAGGATAACGCCGTAAGCCAAAATGGAAAACTTATACAGAAAAGTTAGT
ATTTTGCAACGTCATCTTTTTCTCGTTACTGGAATGACTAAGTAGAAATC
TGTCGAACCAATAAGGTATAAGCCCCGAAGGGGCCAGAGTGGAATCTGGT
GGTAGGATTTGAAGCCAGTTAAATCCTACCAAATTATTTTTTTGCCGATC
CCCCATATTGAATTCCTGTACTGAAAAAACTTGGGTCAACCGCTAAATTA
TTTTTTTGGCAAAATTTCTTCCTTTAAGGTTGAGTTATGGGGACTTAAAT
GTATTTAAAAATATTTCGATTTTTGTACGTGCTGGAGTGCTTCAAAAATG
AAGAATAACTCTTTTTTATTATTCTTTAGAAAAACTGACCCATTTGATTG
ACATGACAATTGACATGACAAACGACAAATGTCTG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000005_pilon:2597953..2603937- >XLOC_044483 ID=XLOC_044483|Name=XLOC_044483|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3662bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000005_pilon:2597953..2603937- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAGTTTCCTAAAAAACGAAATGGTTCAAAGATCAAATCAAAATGGAT
TGGTTTAAGGAAAAGAAAAACAAAAATTGCAGGACCACCTAAAATTACTA
ACTTTAAAATTTCAAATGTTCCAGTTACTAATGATGATAATGGTTACGAC
TGTGATGTGGAAAATTTTGATGAACATGATGTTGGAACTTATGATGAAGA
CTTTGTACCTAAAAAACAATGTTATGGTATTAACAAGGAGAAAGAATTAA
TTTGTTGGGACAAACATAACATTGATTATTGCTTGATTTATGCAATGAAA
TTTAACACTTTCCCGAGCCATTGCTGCTTTTGTAACGATGAAGTTATCAC
ATCTTTTGTATGGTGTAAATCATGTGGACCATTGTCCTTTTATTGTCATG
ATTGCGCTTATAAAATTCACAAAAACACCCTCTTTCATTCATTGGTTGAA
GTCCAGATGGAGTTTCCTAAAAAACGAAATGGTTCAAAGATCAAATCAAA
ATGGATTGGTTTAAGGAAAAGAAAAACAAAAATTGCAGGACCACCTAAAA
TTACTAACTTTAAAATTTCAAATGTTCCAGTTACTAATGATGATAATGGT
TACGACTGTGATGTGGAAAATTTTGATGAACATGATGTTGGAACTTATGA
TGAAGACTTTGTACCTAAAAAACAATGTTATGGTATTAACAAGGAGAAAG
AATTAATTTGTTGGGACAAACATAACATTGATTATTGCTTGATTTATGCA
ATGAAATTTAACACTTTCCCGAGCCATTGCTGCTTTTGTAACGATGAAGT
TATCACATCTTTTGTATGGTGTAAATCATGTGGACCATTGTCCTTTTATT
GTCATGATTGCGCTTATAAAATTCACAAAAACACCCTCTTTCATTCATTG
GTTGAAGTCCAGGTTGATGGATGCAATGTCAAACCATTCAAAGTAAAATC
TGTTCTGCAAACTGATCATGTAAAAGCATGTACTTCAGCTTATTCAAGAA
CATTGACTGTGATTTCAGAAACAGGTTGATGGATGCAATGTCAAACCATT
CAAAGTAAAATCTGTTCTGCAAACTGATCATGTAAAAGCATGTACTTCAG
CTTATTCAAGAACATTGACTGTGATTTCAGAAACAGGATCAACTCATCAA
TGTCAAATTTATTTTTGTAAATGCACAGAAGAGTTCAATACTTTGGTACA
TCTGGATCTATGGCCAGTAACACCGATAAAGCCAAATACAGTTATTTCAA
TGAATTTGTTACACCTTTTTGTTGCATTACAGTTGGAAGGGAAAATATCT
TTTTCGTCTTTTTGTGATGGTTTCTCTTGGAAAAGTGGAGTGGTTGATCA
TGACCTGGATCAACTCATCAATGTCAAATTTATTTTTGTAAATGCACAGA
AGAGTTCAATACTTTGGTACATCTGGATCTATGGCCAGTAACACCGATAA
AGCCAAATACAGTTATTTCAATGAATTTGTTACACCTTTTTGTTGCATTA
CAGTTGGAAGGGAAAATATCTTTTTCGTCTTTTTGTGATGGTTTCTCTTG
GAAAAGTGGAGTGGTTGATCATGACCTGAAGAGATACCTGAACCGCATGA
CCCAAACGGATTCATTAGATCAATTCAGACATTTCCGTCGACAATTAACA
AGTCTGAAGACAATATGCCCGAACTATGATGGTTTGGAAAAGTGTGCATC
TTGCCCCAAGAAGAGATACCTGAACCGCATGACCCAAACGGATTCATTAG
ATCAATTCAGACATTTCCGTCGACAATTAACAAGTCTGAAGACAATATGC
CCGAACTATGATGGTTTGGAAAAGTGTGCATCTTGCCCCAAGGAGAATGG
AAGTATTTTCTACTGCTTTGACGCCAACTTTGGACTTGTGTTAAAAAGCT
CTGCTTCTAAATCAAAGAGACTCGCTATGCGGTCGGAAAATCTATTTATC
CTTGATGAGGAAGTAAAAACCTTTATGGAAAGCTACGATGATACTTTGAA
GACAAAGGAGAATGGAAGTATTTTCTACTGCTTTGACGCCAACTTTGGAC
TTGTGTTAAAAAGCTCTGCTTCTAAATCAAAGAGACTCGCTATGCGGTCG
GAAAATCTATTTATCCTTGATGAGGAAGTAAAAACCTTTATGGAAAGCTA
CGATGATACTTTGAAGACAAAGGATTGCAGCAATTTCCAAGCTGGCAACA
ATTTACGGTCAAAACGAAAAACGAAGAAACTCAGTGTAACTGGAGTATTT
GGATTGCAGCAATTTCCAAGCTGGCAACAATTTACGGTCAAAACGAAAAA
CGAAGAAACTCAGTGTAACTGGAGTATTTGGTATGTCTTGTCGTCATGAG
TTCCCGAAGCTTTTCTTGAATATGCAACACGGTGAAAGGTATGTCTTGTC
GTCATGAGTTCCCGAAGCTTTTCTTGAATATGCAACACGGTGAAAGATTG
GGCTACGCCGTTCTTCTCCTTGATCAGATACTGAACGATACAGAAAAAAA
GAGGTTGGATGTGCACATCATATATGATATTGCATGCGTTTTGAAGTCAC
ATTTGCAGATTGGGCTACGCCGTTCTTCTCCTTGATCAGATACTGAACGA
TACAGAAAAAAAGAGGTTGGATGTGCACATCATATATGATATTGCATGCG
TTTTGAAGTCACATTTGCAGAAAAAGAATACTTTTACCAAGTATCAAGAT
TTCAAATTTGGCATCCCTGTTTTTCATTCGTATGGTCACAGAGGAGACTG
TCAGAAAAAGAATACTTTTACCAAGTATCAAGATTTCAAATTTGGCATCC
CTGTTTTTCATTCGTATGGTCACAGAGGAGACTGTCAGGTGAAAAATTCA
ATCAGAAGATTAGATTCTTTTGGCCTTATGGATGGTGAATTGATGGAACG
CCCTCTGGTCATATCTTCGATCATTCTCAAAGATTACCAAGGAGATGACT
CCAGCTCACCGCACGGATTTACTTAGTGATGCTCTGCTGCATTTTGGCTC
AAAGAAAATGGGAAATATCGGTGAAAAATTCAATCAGAAGATTAGATTCT
TTTGGCCTTATGGATGGTGAATTGATGGAACGCCCTCTGGTCATATCTTC
GATCATTCTCAAAGATTACCAAGGAGATGACTCCAGCTCACCGCACGGAT
TTACTTAGTGATGCTCTGCTGCATTTTGGCTCAAAGAAAATGGGAAATAT
CGGAAAATATCTCGTGTTTCTATTTCAAAAAGCAACAAGAACTTTGAATT
CTTGCGATTCAGAAATTAAAACGATTTGCTCTAAACTGCCTGGAAAATAT
CTCGTGTTTCTATTTCAAAAAGCAACAAGAACTTTGAATTCTTGCGATTC
AGAAATTAAAACGATTTGCTCTAAACTGCCTGCTCATGTGGATGAAGAAA
TTATCAAATCATGGAAAAAAGAGGAGGATAACGCCGTAAGCCAAAATGGA
AAACTTATACAGAAAACTCATGTGGATGAAGAAATTATCAAATCATGGAA
AAAAGAGGAGGATAACGCCGTAAGCCAAAATGGAAAACTTATACAGAAAA
AAAAACTGACCCATTTGATTGACATGACAATTGACATGACAAACGACAAA
TGTCTGAAAAACTGACCCATTTGATTGACATGACAATTGACATGACAAAC
GACAAATGTCTG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000005_pilon | genome | sc0000005_pilon:2597953..2603937 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1777-1830:55 |
| Aaloc | 1693-1773:474 |
| Aaloc | 1603-1689:900 |
| Aaloc | 1483-1599:1185 |
| Aaloc | 1420-1482:1249 |
| Aaloc | 1336-1419:1645 |
| Aaloc | 1225-1335:1988 |
| Aaloc | 1168-1221:2466 |
| Aaloc | 1087-1164:2728 |
| Aaloc | 922-1086:3360 |
| Aaloc | 790-921:3753 |
| Aaloc | 571-789:4617 |
| Aaloc | 457-567:5174 |
| Aaloc | 1-456:5986 |
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