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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000083_pilon:135299..145621+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_012908 ID=XLOC_012908|Name=XLOC_012908|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10323bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000083_pilon:135299..145621+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgtCTTTTTCAAGAGACAAGCCCTCAGAATGGATGCATGTCGAGCTGAA
AAGGTTCAAAAATCAGGTATACCTTTGTGATTTTATTCTctctttcacaa
aaataatctgTTCCCACTCTTTGTCTATACTTTGCCTCTTTGTCCTTTGT
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ccttttttcatttgGCATCTTGTGTAATAAAAAAGCCCTTGTTGGAATTA
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GTTGGACTTTGATTGAAATGTGTGTGTTAGTGTTGGATCGAGAAAATAAG
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GGACTAGACCCATTtaagtccagcgaagggggcagaaccgacaaattttc
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gcttttttaagcaaaaaacgtaaaaacgcaaCCTTGAAAgcaagtgagct
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ggagccttagttaagcttattctgagctccatacagggttgagctggttc
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aaggacaaggtgaaagtgtcacggaaggacaataaTTTCAGACCTTGTAA
GTGAATATGAAGGAGGTTGCTTTGgaatgtaatttcattttttgttaggg
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aaaactggtgaaaaactttttgtcttgaaattgtcacggaaggaattcga
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ttaaaaatgaataaacctattaaactaactagggtatgtacttgttttaa
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ttatattttaacacttgtccttccgtgacaaacCTCACTAGTTGTGTCTC
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tggtgaaattcccttagaaagtatgcaaaacatatgcaaaaagaaagtat
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cgctcatcttttagaacaagcacttcaaaaaaacataacattagacataa
actcaagctgaaaaatcacccgcgaaggtacaaaaatatccttattcggc
tgacggtaaattattctcctgggaatagaaccgtcagacgatcaaatcaa
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gtttgcgtgttttgaaagtttgatgtacGTGTACTCTGTCTTGGTGGAAT
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aaaaggcttttgttgttctgtaaatatttctttttggattaagaaattcc
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gtctttttaatctttgtgtaaacttgcatatgttttgcatattttccaac
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tcttcgatcacgtatcgttatcaattatatatcgatcgtgaccgacgatt
atcgattatataatttaactacgcctggtttaaatgaaaacaaaagttaa
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atgattgataaacttggtggagttatcaaaacaaatttgttgtcaaagag
atttaacagtaagtgaaaatacagaccagaaatcaacaagtcccatgttg
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GAATCCAATGATTGACCATTACTGATATACTGTTGGAATCAGCTCTCctg
aagttgaaataattaggaAGCAGTGGTTTGTCTGGCAGTGTATTCAGGAA
TTGTTCAAGATgttgtttaaaagtttgtttggtaCATTTTGTAAGGTTTC
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CAATCcctatttttatgtttgacattAACAGCTTTTGAATTacattttct
acccagtctctggttTGTGCACGCCGCCTGCATCATCGCTGTAATTGAAG
TTTGGAGTGATATCTTCTAGTATGCACCATGTGTAGATTATTCTGTAcct
ttctcttcttctttcaagACTGTATATTTTCAGTTGACTCAATTTTTCCC
AATAATTCAACTGGTTCAACGAAAAATGCcgttcaaaaatgatttttgca
gTAGCTCCAATTGTTGGATGAGGCATCGCTTTGACGAAGACCATAGTTGG
GAGCAATAGTCAAGATGTGGAATAGCAAGTGACTTCCAAAGGGTTAGCAT
TACATCAGTGTTCCATGTCTTGAAGGTTCGGAATATCCATGAGCTGATGG
CTTTGACTTTGCTGATTTGATTTTGGATGTGTTGACTGTAGCTCATATCT
ACATCCAAAGTGAACTCCAAGGTCTTTGACTTGGTTTTTGGTTTCAATTT
GGTATCAGAATAATAAACTGAATTTGGTTTCAGCTCTTCATTTTTCCCAT
AACACATTATGTTCGAATTTCAGTCCATTGAGTTGCATGTTATTGATCTC
TGACCATTTGTATACCCTATTGAGGTCACTTTGAAGAAGCTGAACATCAT
CTTGACTGGACACTTCTTTCAGCAGTCGTGTATCGTCCGCAAATGAGGAC
AGCACTGTATGATAAATATCTTCATCAATATCCTAAATCATCACAAGAAA
CAGGAGGGACACAGTACGGAGCCTTGGGGCACCCCAGATAAAACATCTGC
ACTTTTGGAAAGCCTTGCGTTGACTGAGACTCTGTGTTCTCTTTGTTAGG
AACGATTTAATCCAACAGAGAAGTTTTCCACAAATGCCATTTCTTTCAAG
TTTATGCAGAAGTATTGAGTGGTCAACCCGATCGAATGCTGCTTTACTGA
AGTCAAGGTAGATAACATCTACGCTGTCGCCAATTTCGATATGATGAATC
AATCGTTCAATGTGGGCAAGCAAGTAATTGGCTAAGGCAGGATCTTTCTG
ACCTAAATCCGTGTTGGTTAGTATTATATAGGTTGTTTCTTTCCAGGTGG
TCTtgcatgttttttcttacaatcttttcaaaaactttggttACATGTGA
TGTAAGAGCAACAGGGCGGTAGTTTTCTGGTAATTCttgatttccttttt
taaatattgGGGTGGATGTAACTTGTTTTAAGTATCTTTGGGGTGAATCc
tttatcatggatattctgACATATCAGCTTGAGTGGTTTTGCAAGCTGTG
ACTTGCTTTTAAGgagaaacatagctggaaagccATCTGGACCAGCAGCT
GAGTTAGGAGAGAGGGTTTGTATTTCTCTAATGAAATCTTCCTCTGTGAA
GTCAACATAATCAAGTTTCTCGGTCACTTGTGAAGGGCTGAGATTGGGGT
TGTCATATTGGGGTTTTGGTGGTGTGAATACAGATGTATATTGGTCTTGA
AGTATATTGGCCATCTGAAGATTGTTGTCTGCTAGCTTATTTGTAGTAGG
ATCCAATAACGGTCCAACTTTAGGTTTGgtttgagaaaatctttttgcat
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TCTTGATTGTGCCTTTCGTTTGTATAACTGGTTTGTAATTTTAGCTCAAT
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TCTTTTTCTTTAATGGCTTTCGAAGTGGAATGCTGTTTGTGGTGATAACG
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CTACCCAGTAGTAAATaaggggtatggggtggttttgggatttttccatg
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ttgtagtacacatacatgccgccttctagtacactgaccccccctgtTCA
GAAGGTgctcaaaaacataaaattatgtTAAAATCAGTCAGTCCaatggt
tttctttttacagtCATGATGCCAAtgacatcaatttgaaattgtttttt
caagtaaagaggCATCAATGCTGAAGTTTATAGTTTTGTATTACATTAAT
CAAAATATTAAgggaaattgcaaaaaaaatttccagctGCCTGTTTGAGA
tttctttttgtcagaaaaaggtaaaaaaacaaACTACTTTCTCCTAGTCT
AACCAGTTAGATCCATAATAatatctcttttttttctttttttctgtgat
tGAAGAGCAAAGAGAGCAGTTTTAATAAtcgcttttttatttatatgatT
CAGCTTCCCATCAACCGACCATCCAAGAAATCTGTTGACAAATCACTTTC
AATTGTGAAAAGCAGTTTGGTGGGCCTTGCGAAACATCAATTTGAACTGG
TTGTAACTTCATTAGTACATTACATTAAAGATATTCCAACAATTGTAAGT
TTACATAATCCTGTATGAAATCAAATTGGAAATCTAAACCTTGCTTGAAT
TACAAtggaataaaaatattaaaagtttaaattagggtattgtattcatg
atattatagcTATGCATCGGTTTTGTATTTTGAAGTTTATTCTCTAACTT
CAATATCTACTACCAGGCCATTTTTTATGCCCTTTTAACGTCCGATGAcc
ggacgctgcccctcctgaaatcactaaaattttggtaaaaacagcctttt
tagcggaaaaacacaagaaaaagtgccctttgtGCCACCAATggacgctg
ccctgcctttctaaaatatggcctgactACTTCTTGTTTCCCAACTGGAA
AAAGTTTTGTATCAGTACAACATTTCTAACCATACCCTTTGGTGTATCAT
AATAAGCAAGTACATTAATTCTTACTTCCTTTTGTTTTAGAATTTGTTAC
CCATAGAACAACAACCACTTGCAATCCAATCAAACTTGATTGTGGTTACG
ACAATTGAGCATTGCTTTGAAAAGGTAAGATAGCCAGATTATCCATATCT
TAAAATAGCCTAAAATGAGGCCAAGCCTATATCTATGAGTCTTCGAAATg
atcttttgaaagtttttttttgcaaactgaaGATGTCcacaattttttct
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TCTGAAGAAAGCTCATCATTATCGGATGAAACAGTGAAAAGACAACTCTT
GAATACTCTGTGCAGCGTAAGTAATAACAATTTTATATTCAAATGGTTAA
AAAATTATTCTGTTATTACTTTTATAATTGAATATCACTACTACAAATTG
AAATAACTTCTTCAAAGAAATCATTGTATTTGAAGtaattttttggttaa
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GTTTCTCTAATACTTATTTTAATGTCCTTGCTCTATActatatttttcag
ctttgccagcttggaaAAAACAGGTTTTGAAGTCTCAAGGGAccaattaa
tgaaaaattaaaatggaaaccCATCTATACtactttttagaatttagaaa
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GTAGTCAAAATTTTACAAGTCTCACACTTAATGTTTTCAACATAATggtt
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GCATTCAACGAAGCTAACCAGAAAGTTGGCAGACATGTTGGAAATATCAT
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GAGATTAAACCTATTACTTTAATAATTGATTACATATCTTGACCTTACTG
AAATTTTGATATTAATTAGGCTGAGAATAGACCCAGTCTGACTTAAAATG
AATgaattgaaagtaaaaattctattttatttgaGCTCGCTCTTTGCCCA
AAGGGTTTTTCTGGTCCTGTTTAATGTATCACTGatagatttttctttta
aaagaatgatAGTTGGATCTGtttttttcattataaacatttttttcctt
taagaatgcggaaaacattttaaatttctaaagaaaTATTCTCAACAAGT
TGTCCTGAAAGGCTTATGCAAGTCCATATGGAATTGGATTGAAACCTACC
CTGAACAGTTTTGCAAcatttataaaaatccaaatacCCAACTATCAGGT
AACTAACTAACTTATTTGTGCTAAGGCCTGAGTGCCGTGAGGAATTTAAT
CTTTAGTGTATGGTTTGTTTGCACTACAGAAAACAAATtatttgactttt
atttgataGGAAGATAATttgaatacacgggtttcgaattaaatctggcg
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cgattgactttttattttaatgttttttgttttcataatgacccataaag
tctgtcaaaatggaaaaatgagctaaaattgcttgatacacggcaaattt
tcgttctgtttacttgatatttttcgtgcaaatttacatgggatcaaagc
taaagctaagcaaaaatttaattcgaaacccgtgtattgatATTACAAAG
TTAGATTTGTTTTGTTAGACAGGAGTCATTTATAAATCATAATCTGTGTA
CCTTATTAGAACGAATTGCACttttttgcagtttaccctttttggacaaa
tttctttcattttcctagggattttttcagattttttcagattttttcga
taaaattggaattcTCTGAAtgagtcgtctagcatgctagattATATTTA
GTTGacaaaaagaaaatgcttaGCCAACTCAAAAATAATAGTcctatttc
ttttcaaatttagaaCTTAGTGAAAAGCTTTTTCAACTGGTGGAAAATTG
GTCCGAAAACTCGaaaaaaaGATCAATATCATGGCCACTGCAAGGATTGC
TTCTCCTTCTCTCACCTGTATGT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000083_pilon:135299..145621+ >XLOC_012908 ID=XLOC_012908|Name=XLOC_012908|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1686bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000083_pilon:135299..145621+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgtCTTTTTCAAGAGACAAGCCCTCAGAATGGATGCATGTCGAGCTGAA
AAGGTTCAAAAATCAGatgtCTTTTTCAAGAGACAAGCCCTCAGAATGGA
TGCATGTCGAGCTGAAAAGGTTCAAAAATCAGCTTCCCATCAACCGACCA
TCCAAGAAATCTGTTGACAAATCACTTTCAATTGTGAAAAGCAGTTTGGT
GGGCCTTGCGAAACATCAATTTGAACTGGTTGTAACTTCATTAGTACATT
ACATTAAAGATATTCCAACAATTCTTCCCATCAACCGACCATCCAAGAAA
TCTGTTGACAAATCACTTTCAATTGTGAAAAGCAGTTTGGTGGGCCTTGC
GAAACATCAATTTGAACTGGTTGTAACTTCATTAGTACATTACATTAAAG
ATATTCCAACAATTAATTTGTTACCCATAGAACAACAACCACTTGCAATC
CAATCAAACTTGATTGTGGTTACGACAATTGAGCATTGCTTTGAAAAGAA
TTTGTTACCCATAGAACAACAACCACTTGCAATCCAATCAAACTTGATTG
TGGTTACGACAATTGAGCATTGCTTTGAAAAGCATTCTGAAGAAAGCTCA
TCATTATCGGATGAAACAGTGAAAAGACAACTCTTGAATACTCTGTGCAG
CCATTCTGAAGAAAGCTCATCATTATCGGATGAAACAGTGAAAAGACAAC
TCTTGAATACTCTGTGCAGCCTGATAATTCATCCAGATGCATTCAACGAA
GCTAACCAGAAAGTTGGCAGACATGTTGGAAATATCATCTATTTTATCAG
TAAACATCACTTCTCATCAGTGTTCAGTAGGATTGTTGAGAGCTGATAAT
TCATCCAGATGCATTCAACGAAGCTAACCAGAAAGTTGGCAGACATGTTG
GAAATATCATCTATTTTATCAGTAAACATCACTTCTCATCAGTGTTCAGT
AGGATTGTTGAGAGGTTGTACTCTTTGGTAGAAAACAATGAGGACAGTAC
TATTGCAGATAATTTGGAATTGATACGATACTTACATGTTCCTATAGAAG
GACTTAAATGCTTGTTTGAAGGTTGTACTCTTTGGTAGAAAACAATGAGG
ACAGTACTATTGCAGATAATTTGGAATTGATACGATACTTACATGTTCCT
ATAGAAGGACTTAAATGCTTGTTTGAAGaatgcggaaaacattttaaatt
tctaaagaaaTATTCTCAACAAGTTGTCCTGAAAGGCTTATGCAAGTCCA
TATGGAATTGGATTGAAACCTACCCTGAACAGTTTTGCAAcatttataaa
aatccaaatacCCAACTATCAGaatgcggaaaacattttaaatttctaaa
gaaaTATTCTCAACAAGTTGTCCTGAAAGGCTTATGCAAGTCCATATGGA
ATTGGATTGAAACCTACCCTGAACAGTTTTGCAAcatttataaaaatcca
aatacCCAACTATCAGaaCTTAGTGAAAAGCTTTTTCAACTGGTGGAAAA
TTGGTCCGAAAACTCGaaaaaaaGATCAATATCATGGCCACTGCAAGGAT
TGCTTCTCCTTCTCTCACCTGTATGTaaCTTAGTGAAAAGCTTTTTCAAC
TGGTGGAAAATTGGTCCGAAAACTCGaaaaaaaGATCAATATCATGGCCA
CTGCAAGGATTGCTTCTCCTTCTCTCACCTGTATGT
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000083_pilon | genome | sc0000083_pilon:135299..145621 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 736-843:10216 |
| Aaloc | 592-732:9307 |
| Aaloc | 484-588:8874 |
| Aaloc | 361-480:8333 |
| Aaloc | 292-360:7748 |
| Aaloc | 208-291:7491 |
| Aaloc | 67-207:6904 |
| Aaloc | 1-66:1 |
|
