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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000058_pilon:250516..255866- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_002648 ID=XLOC_002648|Name=XLOC_002648|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5351bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000058_pilon:250516..255866- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GAAGATGAAGGAATTGAATTGATGGGAATCAAGTTTTATGGAACACCATG
GTAGGTATTTCTAATAATCATGCTTGTTTATTTTTTTTAAAAGTATCAAA
TATTTGTTTCTCATTCAACTATGAAATTGTAATCTTCTATAAGAAAATAG
TAAAAATAGCACATAACACTCGGCTAAAAACTTTCCCCTTCGTTGTTTTC
ATTCTAAGGTCCTTAAAACTAAAGCCGTTCTAGATCTCCTAACTTAAGGG
TGGAATATTTTCATGTAAGATACTGCTTTAATAAACAGATCAAAGTCTCT
TCAAAAAAACTTGTTTGATTCTGCAAAAAATAGGTAAATTCTTGGAAATT
TCTGTACTGTAGCTTAAAGGTTTTGTTTTTAAATAAGAGTGTTATCGTTA
GGTTACTCATCAATTTCAATTTACAAGTTTTTTCACATTGAATTGACATG
GATGTGAAGCAAGATTGGTCAGAAAAAGGAAAAGAAAAATATTGTTTTGC
TTTTATCAGCACGATATAATAATAGGAAGACACTGTCCTGATATGAAACA
TGTGTTTGATATGAAAATTCCCGTGTAAAATATTTTAAGTATTTAATATC
AATGTCTTATTCTCAGGCATCCAGAGCACCGTGTAGGAGATGCTTTTTCA
GTCAAGTGTGGTGAAGAATGTCTATCTAAATGGGAAAAAATACCTTTCGA
CACTGATGTCCTCATGACCCATACACCGCCTTATGGTGTTTGTGATGAAG
GTCACCATATTAAGCATGCTGGATGTCCAGAATTGTTGTATATTGTTCAA
GAGAAAGTCAAACCGAGAATCCATGCATTTGGACACATTCATGAAGGTAT
GGTTTTTGTATGGTTCAATTTTGTTAATCTCTTTTTCCTTGCCACTTTTA
TCATATTTCTTCAGTATTATAAACTGGAAAATCTTAATGTATTTGTTATT
CTTAAACCTCCTTTATTCTTACACCCCAATTGAGGGTAAATATAACTGAC
TGAAACTCAATGGGGATTGATATTTCCATGTTTTTTTATGGCTAGGGATT
TAAATTCTTTTGTTTTCAATCCGGGGGGGGGGCACTCGATTCAAAAACGA
CCATACGTGATGCCTTAAATCAAGCCTTTGAAATCGGACTCTTACTGTGC
AAAGAAAATTTTGAAAAATTTGAGCAAATCTGAGCGAAAAATCGACCCTG
TTACGGTACATTTTCTTAAAAATCTTTGACCATTTTCAGGCAAGATATGG
TCAGATTTTCGAAATTTTACACCCTTAGAGTGCAGTTTTTCTCATCTTGC
TGATTTTGACCCTTACTGTGCACTTCGGAAAGCATAAAATTCAGTTGGGA
TGTGAAAATAGCATTATATTTTGCAGAGAGGATTGGTTTATTTGATATTT
TCAGTGGGGACAAAAATTGGAGGATAATTTTCCACCTAGGCTAATATTGG
CTGATTTTCCCTGTGGGAAGGAAGGGGCGGGTCCCAGTGGATCTGTGAGA
AGGAGGTGCATTTTTATAAAAAAAGATACGAGAAACAGACAATACGTATA
TTTCATCGTGTGCCGAGGACCATCAACTCAAAAAATTCTTAACCAATACG
TCTTAATAAGGATAATATTTATCATTAAGTGTCAACAACACACACTAATC
AGTACAATGCTTTTTATAAGCACTTAGTAGAGATTATCTAGTTTTTATTA
AAATAATGCATTGTTTGGTCATTGAAAGTTATTATAAACTCATTATAAAC
AACTATATCTTGATTAAAATGTTTGGCTTTGATTTGAAAAAATAAATAAT
GCTCTGATAAAATAATGCTTATCGATAAACTCAAGTTCTTATAAAATGAC
CAGTTGTCATTTGTGATGTACATTATGGTTTTCCGAGAAAATACTTTACT
GTTAATGTAGACAATAATAAGTTTTAGACATTTTTTAGTACATGAAAAGC
TCGTTTATGAGTGGTTTGTGTAACAATCTTGTGAATTTGTTGACTGTTTC
TTTAGAATTCTGATAGAACTAGAATACATTTGATATTTTCATGGAAGAAA
TATGGGATGTAAAGTACAACAATGTAAAGAAAAACATACACGACATTACT
GCAAGCTTTGCAAGGATAAAGATTCTGATCATTTTTGTAATCAATGTCCA
GAAAGCCTTACACTGTATCATGGCACAGCTGAAAACTGTCTTGGACCTAT
TACGAATTGGGGTCTTGAACCAAGTAAAGGTGGACGCTTACGTCTAGGTC
CTGGAATTTATTTTGTTAAAGATTTAGATGAAGCTAAAAGTATCTCAAAA
AATAAAGTTTCTAAAGATCTCGGTGGTGGTATAGGTGTTGTTTTGCATTG
TCGAGTGAACTTGGGAAGAACCGTAGACTTAGGGAACAATTCTGGATGCA
CCTGGCAAGGAAATTATGATTCTGCAACTTCAATTCACCCTCCATGGAGC
AGCTTACAAGGTGGATGGGTTATTTCATATGCTTTCCCTGAATATTGTTT
GAAAGATGAAAAGAGATGTGTTATATATGGTATAAGCATCGGTGATGAGA
CTGTCGAAAAAGCTGATGGATATCGTTGGAAAGAGACTTTAAACATTGTC
AAAGATATGAACCAAACAGCAGATAAACCAACCATTGATTCTAAAGTTAG
AGAAATAACCAGTTTTCTAGCCTATGGTACAGGACATACAAATAAGTTTC
TACCGAGAGGGACAACCCAAAGATTCAGGAAGGCAATATCAAGCTTCAAG
TGTCAGACTCGATTTCCTGATGTATGTAGCTTAGCTTGTAGATATTGGTA
CATTACATTGAAATTATTTCTGTACTTGTTTTATTTTTGTAACACAATTG
CATCTATCGTTCACTTGTTTGCTGACAGTAATGATGAGATGAAGCCAGCT
TTGATATCATTCACCGTTTTCTTTACTCTTGTAACCTTATTGAAACTGCT
TTATGTATTATTTCATATATATGTTTTGTAAAGACAAAATGGAAGAAAGT
GCTTTTGTTATGTTGGCTGCAAATGTTTTAATTGCATTTTTCTTTGAAAT
GCCAATGTTAGTTTCACAAGGTTACGCTTTGAAGGAGATTCCGAAAATCG
AATGGAAAGACCATGTTCAGGATATGATGGTACATTTCGAGTTCATGGTG
AACTTCTTTGTCACATCATTAATTGATTTTGTACTTTACAACATTGCTCT
AAAGAAAGAGAAACCTTGTTTTTATTTGTTTTTAGCTATCATGTACACAC
CAATCGTCATATTTATCGCATGTTCTATCTGTTATGCTCCCGTTTATGTG
ACACTAGCTGGATGGGTTTATTTACCTGATGCTTTGATGGATCTCTATGG
AGGACAGATTAAAGGAGGTGTTACGTTTCTTTTGCAAATATCAATGTATG
TTGGAGTTTTTGGGCTTTGGATTTGGACAATTTTGTTGGGTATTTTAGCT
CTTTTAATGATTATTGCATTTTTTATTGCTGTTTGTGTTAATTGTCTAGC
ATGATAGCAAATTATCATCTACTCATTTTTGGATTATATTAGATAATATA
AAATGATTTAGAATGAAAATAATTATCTGTTAATATAAAACAGCTATTTT
CCATATAAAAAGCATTTTTTTAAGTTATAAATTATTATTACTTATTAATA
AGCGCTCCCTCCTGCTAACAGTCCTTCCAACTCCCCCCTGCTTATTAATT
TTTGGGCAAATGTTTTTGAAAGTTCCCTCTTTTGCCCTAATTCTGCTGTA
TTAGCCTCTTTTTCAAAGATTTTACACCCATGACATTTTTTATTTCAACC
CCCCGGCGGATTATTAAGTTTTGAGAATTTTACCACCCACTCTGTATGTT
CTAAACCCGCCGCTATTAGGTACCCGAGGGTACATATCGTTAATGTTTGT
CAAAGGAATCCCTTTATTTGAAATTGAGCCCATCCAAAAAAAGCCAAATC
TTTTGGGTTGACATCTTACTCTACTATATGACAACCATATTAAAGAAGAA
ATTCTAAATCTTGATTTCATACTTACTAACCTTAGATTTTTGTTCAGGAA
TCTCTTTATAAAAGGTCCTCCATTTTGATTTAAGCAGCCAAAAAGTGAAA
TCGTTTGAGACCACAAAGAAGCAGCCCTAAATTCTTAGTGAGAGATACAA
TGTTCTTCCTTTGCACAGACTTGTTAAAAGCAAATTAACTTTTTTAAATG
ATCAATTAGGTCCATAAGATCACAAAAACGAGTGGTGAGAAAATTTTGAC
CATTTTGCTGATCCCCTAGTGACGTCATCACTTTCGCTGGGGCTTGAAAA
TGAAAGTGAAAATCAAAAGCTTAAATATGGCTCAAATGAAAGATATTTAT
CCAAGGATGAAAAATATCACAACATATACCTAAAAATCAGTGAACAAAAA
GTAAAATCAACACAGTTTGTTTACGATATTTCGTTCTATTTTCAGAACTT
CATCAGGTATGATACTGCACAAGCGTTAACACATTTTTAAATGCTACAAA
ATCAGTGATGCGTAAATCAAAAGCGAGAAATAAAAAATTCTAATGAACAA
AGGAAAAAATTCTATAGGGAATAAACCAAAGAAAATGTTAAAAAGATTTA
ATAAAAATAGGTGCGTAGCGATAATATTTACAACGTTAAAACAGTACAAT
AAAATTGATGAAAAAAATCCCGCGGGGAATAATCGTCGAAAACAATAAAA
CGAAAAATTAAACGAAAAAGGTTTCGAATTAGCCGATTAGCACAGTAAAC
GCAGTGGAAATTAAAACGGAAAATTAAATGCTCGTGTCCCCTTCTGGCTT
ATTCAGGACAAAAAGCAAAACAAAAAGAAATGGGAACACCTGATACTAGT
AGAGCACACAAATCAATATTTGAAAAGTTATAAAGGGAAATAGCTAAAAA
ATAACGTCATCGGCAATTAAAAAATCTTAAGTCAGCTTTTTAGAGAAATC
ATAAGGCCGCGAAACGCCAATAGACTGAGCAAATGATGCAATTTTCTTTA
ATTTTGTAAAATATTCGTCCGGCAAAAGAATTTTACTAACGAGGTACCTC
TTGCCTATTTGCGCCCCGAAAGATCTGCCGTAGGGGAAGGGCAGTTGCCT
CCTTTTTCTCATCCAGGTTACCATTCTATGTTGCCTTTGCACTTAGGCTT
TCTTAAATCGTTCTTGGTTTTTCCCTTTCTTTCATAGCATACGGCATTGC
CAAGGATAAAACGACAACGTATCTCAACGCATCGATTTGTACACGCCGTT
ATCGGTCAGACAATTTACCGTTTGTCATCGATTTGAAGCCTATCGAGAAA
AAAACTGTCGATTTCTTACCGAATGTTCTGGATGGGATTGAAACGATTTA
A Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000058_pilon:250516..255866- >XLOC_002648 ID=XLOC_002648|Name=XLOC_002648|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=888bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000058_pilon:250516..255866- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GAAGATGAAGGAATTGAATTGATGGGAATCAAGTTTTATGGAACACCATG
GAAGATGAAGGAATTGAATTGATGGGAATCAAGTTTTATGGAACACCATG
GCATCCAGAGCACCGTGTAGGAGATGCTTTTTCAGTCAAGTGTGGTGAAG
AATGTCTATCTAAATGGGAAAAAATACCTTTCGACACTGATGTCCTCATG
ACCCATACACCGCCTTATGGTGTTTGTGATGAAGGTCACCATATTAAGCA
TGCTGGATGTCCAGAATTGTTGTATATTGTTCAAGAGAAAGTCAAACCGA
GAATCCATGCATTTGGACACATTCATGAAGGCATCCAGAGCACCGTGTAG
GAGATGCTTTTTCAGTCAAGTGTGGTGAAGAATGTCTATCTAAATGGGAA
AAAATACCTTTCGACACTGATGTCCTCATGACCCATACACCGCCTTATGG
TGTTTGTGATGAAGGTCACCATATTAAGCATGCTGGATGTCCAGAATTGT
TGTATATTGTTCAAGAGAAAGTCAAACCGAGAATCCATGCATTTGGACAC
ATTCATGAAGCATACGGCATTGCCAAGGATAAAACGACAACGTATCTCAA
CGCATCGATTTGTACACGCCGTTATCGGTCAGACAATTTACCGTTTGTCA
TCGATTTGAAGCCTATCGAGAAAAAAACTGTCGATTTCTTACCGAATGTT
CTGGATGGGATTGAAACGATTTAACATACGGCATTGCCAAGGATAAAACG
ACAACGTATCTCAACGCATCGATTTGTACACGCCGTTATCGGTCAGACAA
TTTACCGTTTGTCATCGATTTGAAGCCTATCGAGAAAAAAACTGTCGATT
TCTTACCGAATGTTCTGGATGGGATTGAAACGATTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000058_pilon | genome | sc0000058_pilon:250516..255866 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 316-477:163 |
| Aaloc | 85-312:4735 |
| Aaloc | 34-81:5352 |
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