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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000246_pilon:251833..254844+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_007144 ID=XLOC_007144|Name=XLOC_007144|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=3012bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000246_pilon:251833..254844+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATGGTTGCTGGTTTAAGATTCTCACTGATTGTTTACATAACTGCAGC
ATTTTATTTACACTTTGTTGCTGGAAACTGTAAAAGGACAATTTTTATTG
ACGATGATGAATCACCTGATGACTGTACCCAAAAAGGCAGCTCCTTTACA
TGTGGATCATTGCACGCAGCCTTTGGTGTTGTCAAAGATGGAGATTGCAT
TTCTCTGACAAACACAACAACTCTGCAATCTCCAATTCAAAAAGACAATA
TCAAAAACGTTACAATATTTTCTAGGACAGAGAACACCAATGTTTTTTGT
AGTAATCAATCAGGGctgatattttcaaaatcatcacATGTAATTTTTGA
GAATATAACTTTCAATGACTGTGGTATGATATCTTCCATAGATTGGAATC
AAGGACTTTTGAATATATCTAGTGCAATTGCATTTATTCAATGTGACAAT
GTTAATATTAAAAGTACACATCTATCATTGAGTGCTGGCTATGGATTTGC
ATTTGTTGACTCAAACGTTTTTCTCAGAGAAAGCTCAGTTGTCAAATCCG
CTTTTGTGAACGTTTCGCATGAAAATGAATACTATGCAATTGGTGGTGGC
GTTTTGATAACCTTTCAATCTAGCTTCAAGGGAAGTAACCAGGAAATCAA
TATTGAATCTAGTctttttaaagataactttaaCACTGCTAAAACCTCAT
TGGGAAGCTCGATGTATGATGATTTACCTTTTGGAAGAGGGGCTGGTGTA
TATTTTTTATCCGGTCCAAACACAGAAAATAATGCCTTTATTGCAAATAA
TGTAATCGTTAGTGGAAACGAAGCAAATATTGGTGCTGGGATTTATATAA
GTTTTGCTGAAAATACAAAGAACAATAGTTTCAGTTTCATAAactgtcaa
ataaaaaataatcatgCACAAACTGCCGCAGGAGGTGCTTTAGGGCTTAC
CAGCTCTGAAATCAGGAATCACATACATTTCAAAAactctattttttcaa
ataatactgCCCAGATTGGAGGGGGTATCGCATTTGTATGGCCGGACACA
TATGATGATGCTAAACAGATTGGTATTTTCATGTTGGAGAATATTACTGT
TGATAGCAACCAAGCTAAAGTAGGAGGAGCTTTTCACTTCCAAAATgtat
ttgttgttttacaaaatgttaaaatagTGAACACAAACAATATTGATTTG
CCAGGTAAAGGTAGCTTTTATGCTCTACGATCAGAACTGCGCTTTATCGG
TAATGataatattatatataataaCAGAGGCTCGGCAATTGTAATTGACA
ATAGTCAGATGACTGCTAACGGTAGCATTGTGTTTCGACAAAACTTTGGA
GACACAGGTGGTGCTCTTGCTCTATATGAACACTCAAGATTGATACTCAC
CCAAAACTCACAACtgttatttgaaaataatacaGCTTATATGGAAGGTG
GTGCCATTTATGCTCCAACAGCTGGTCCACCAATGAGACCTTGGAATACA
ACTGAACTTAATATCTATGAATGTTTCATAAAGTTTGATGGTATATCATA
TTTGAATTTTCAAGGTAATGTGACTTTTCAGAACAATGATTGTAATGATG
GAGATAGTGATGATATCTTTATTTCCTCAGTACAGCCTTGTAGACATTTT
AACGAAAACCAAACACAAGTATTCAGCAGCTGGCCAAATTTTCATTTCCC
ATCAGAGAAATCTTCAATAGCATCTAATGCTATATGCATGTGGACTTTGA
AACGGAACGAATGGTATTCCTACCCTGGAAAACTCTTAAATCCACACATT
GTGCTACAAGATGATCGAGGCAATAATGTCAGCGAAAGCATGGATGTTAA
AATCTATCCTAAAGGGGAGGTAGTTATTGACACCAACAATGCTTTCGTAA
CATCTGATAAGGATTCCATCAAACTACAACTCAAGCAAAAAACTAAAGAT
CCCATTGCTTTTAATATCACAGTGAAAACTACTTCAAATCTTTTTCTTGA
GCAAAACCTCACTAATCTACATTTCAAAGGATGTCCATTTGGATATACTT
TTGACCAACATACGGGAATGTGTGAATGTGATATTATGAACAACCAAAAC
CTTAACATTGCATTTTGTGActctgaatatatttttttacaaaagaatgt
TTGGGTTAATCCTAGCCAAACAAAAACATACACCTGTCCAAATGAATATT
GCCATAATGACGAAGGCAGATTTAATCATTATAACAACGATTGGCAGTGT
GCACAGTATCGCCAACAAAACTCCACACTTTGTAGCAAATGTAAAGTAGG
ATTTTCTGCTGTTAGCGGAAGCTACGATTGCCAGGAATGCCCCAAGAATT
CAAAAGGCTGGATTGGTATCACTGCAATTTTGTTTTTCACCCTTCTTCTA
TTCGTCTTACTGGTTTTTGCATTAGGAGTTGATATTATGTCATACAATTT
GAATATATGTATTTATTCTTATGAAGTCATTGGATCACTTTATACCTCAG
AGCAAACCATTGACGTAATTTTGAGTTTCGTCATGTCAATCTTTCAAGTT
TCTGATCGCAATAGTATTTATCCGACTATGTGTCTTTGGTATGGTATGAC
AGCGCTAGGAAAAATGAGTATGGGGTTTATTGTACCTATTGTTATGCTGT
TTTGGATGGCTGTATTGTATGTTATTTGTATAAAGTTCaaacaagaaatt
tttataaataataCACAGTACAATTTGAAGGATCGCTGTTACAAGACCAT
GTCCATCATTGTTGTAATGTGTTTTTCTGATTTGTTACGTATTAGTATTC
AGATTCTCCATTACATTCAGATTGATGGTACCAAGTATGTGTACATGTAT
GCAGATGAGAAATGGTTTGGACCTAAACATCAACCACATGCTATTGTTGC
TGCAATCGTCATATTGTTTCTTGTTTTGTTCAGTATCGCTCAAATTGTTC
TACTTCGAAAAAGCAATGTTACCGTTTTCGTATGGCTTCGTAAATTTGAA
GATAATGTAAGT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000246_pilon:251833..254844+ >XLOC_007144 ID=XLOC_007144|Name=XLOC_007144|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=6024bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000246_pilon:251833..254844+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATGGTTGCTGGTTTAAGATTCTCACTGATTGTTTACATAACTGCAGC
ATTTTATTTACACTTTGTTGCTGGAAACTGTAAAAGGACAATTTTTATTG
ACGATGATGAATCACCTGATGACTGTACCCAAAAAGGCAGCTCCTTTACA
TGTGGATCATTGCACGCAGCCTTTGGTGTTGTCAAAGATGGAGATTGCAT
TTCTCTGACAAACACAACAACTCTGCAATCTCCAATTCAAAAAGACAATA
TCAAAAACGTTACAATATTTTCTAGGACAGAGAACACCAATGTTTTTTGT
AGTAATCAATCAGGGctgatattttcaaaatcatcacATGTAATTTTTGA
GAATATAACTTTCAATGACTGTGGTATGATATCTTCCATAGATTGGAATC
AAGGACTTTTGAATATATCTAGTGCAATTGCATTTATTCAATGTGACAAT
GTTAATATTAAAAGTACACATCTATCATTGAGTGCTGGCTATGGATTTGC
ATTTGTTGACTCAAACGTTTTTCTCAGAGAAAGCTCAGTTGTCAAATCCG
CTTTTGTGAACGTTTCGCATGAAAATGAATACTATGCAATTGGTGGTGGC
GTTTTGATAACCTTTCAATCTAGCTTCAAGGGAAGTAACCAGGAAATCAA
TATTGAATCTAGTctttttaaagataactttaaCACTGCTAAAACCTCAT
TGGGAAGCTCGATGTATGATGATTTACCTTTTGGAAGAGGGGCTGGTGTA
TATTTTTTATCCGGTCCAAACACAGAAAATAATGCCTTTATTGCAAATAA
TGTAATCGTTAGTGGAAACGAAGCAAATATTGGTGCTGGGATTTATATAA
GTTTTGCTGAAAATACAAAGAACAATAGTTTCAGTTTCATAAactgtcaa
ataaaaaataatcatgCACAAACTGCCGCAGGAGGTGCTTTAGGGCTTAC
CAGCTCTGAAATCAGGAATCACATACATTTCAAAAactctattttttcaa
ataatactgCCCAGATTGGAGGGGGTATCGCATTTGTATGGCCGGACACA
TATGATGATGCTAAACAGATTGGTATTTTCATGTTGGAGAATATTACTGT
TGATAGCAACCAAGCTAAAGTAGGAGGAGCTTTTCACTTCCAAAATgtat
ttgttgttttacaaaatgttaaaatagTGAACACAAACAATATTGATTTG
CCAGGTAAAGGTAGCTTTTATGCTCTACGATCAGAACTGCGCTTTATCGG
TAATGataatattatatataataaCAGAGGCTCGGCAATTGTAATTGACA
ATAGTCAGATGACTGCTAACGGTAGCATTGTGTTTCGACAAAACTTTGGA
GACACAGGTGGTGCTCTTGCTCTATATGAACACTCAAGATTGATACTCAC
CCAAAACTCACAACtgttatttgaaaataatacaGCTTATATGGAAGGTG
GTGCCATTTATGCTCCAACAGCTGGTCCACCAATGAGACCTTGGAATACA
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TTTGAATTTTCAAGGTAATGTGACTTTTCAGAACAATGATTGTAATGATG
GAGATAGTGATGATATCTTTATTTCCTCAGTACAGCCTTGTAGACATTTT
AACGAAAACCAAACACAAGTATTCAGCAGCTGGCCAAATTTTCATTTCCC
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AACGGAACGAATGGTATTCCTACCCTGGAAAACTCTTAAATCCACACATT
GTGCTACAAGATGATCGAGGCAATAATGTCAGCGAAAGCATGGATGTTAA
AATCTATCCTAAAGGGGAGGTAGTTATTGACACCAACAATGCTTTCGTAA
CATCTGATAAGGATTCCATCAAACTACAACTCAAGCAAAAAACTAAAGAT
CCCATTGCTTTTAATATCACAGTGAAAACTACTTCAAATCTTTTTCTTGA
GCAAAACCTCACTAATCTACATTTCAAAGGATGTCCATTTGGATATACTT
TTGACCAACATACGGGAATGTGTGAATGTGATATTATGAACAACCAAAAC
CTTAACATTGCATTTTGTGActctgaatatatttttttacaaaagaatgt
TTGGGTTAATCCTAGCCAAACAAAAACATACACCTGTCCAAATGAATATT
GCCATAATGACGAAGGCAGATTTAATCATTATAACAACGATTGGCAGTGT
GCACAGTATCGCCAACAAAACTCCACACTTTGTAGCAAATGTAAAGTAGG
ATTTTCTGCTGTTAGCGGAAGCTACGATTGCCAGGAATGCCCCAAGAATT
CAAAAGGCTGGATTGGTATCACTGCAATTTTGTTTTTCACCCTTCTTCTA
TTCGTCTTACTGGTTTTTGCATTAGGAGTTGATATTATGTCATACAATTT
GAATATATGTATTTATTCTTATGAAGTCATTGGATCACTTTATACCTCAG
AGCAAACCATTGACGTAATTTTGAGTTTCGTCATGTCAATCTTTCAAGTT
TCTGATCGCAATAGTATTTATCCGACTATGTGTCTTTGGTATGGTATGAC
AGCGCTAGGAAAAATGAGTATGGGGTTTATTGTACCTATTGTTATGCTGT
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AGATTCTCCATTACATTCAGATTGATGGTACCAAGTATGTGTACATGTAT
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TGCAATCGTCATATTGTTTCTTGTTTTGTTCAGTATCGCTCAAATTGTTC
TACTTCGAAAAAGCAATGTTACCGTTTTCGTATGGCTTCGTAAATTTGAA
GATAATGTAAGTATGATGGTTGCTGGTTTAAGATTCTCACTGATTGTTTA
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GGGGCTGGTGTATATTTTTTATCCGGTCCAAACACAGAAAATAATGCCTT
TATTGCAAATAATGTAATCGTTAGTGGAAACGAAGCAAATATTGGTGCTG
GGATTTATATAAGTTTTGCTGAAAATACAAAGAACAATAGTTTCAGTTTC
ATAAactgtcaaataaaaaataatcatgCACAAACTGCCGCAGGAGGTGC
TTTAGGGCTTACCAGCTCTGAAATCAGGAATCACATACATTTCAAAAact
ctattttttcaaataatactgCCCAGATTGGAGGGGGTATCGCATTTGTA
TGGCCGGACACATATGATGATGCTAAACAGATTGGTATTTTCATGTTGGA
GAATATTACTGTTGATAGCAACCAAGCTAAAGTAGGAGGAGCTTTTCACT
TCCAAAATgtatttgttgttttacaaaatgttaaaatagTGAACACAAAC
AATATTGATTTGCCAGGTAAAGGTAGCTTTTATGCTCTACGATCAGAACT
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TTGTAATTGACAATAGTCAGATGACTGCTAACGGTAGCATTGTGTTTCGA
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ATTGATACTCACCCAAAACTCACAACtgttatttgaaaataatacaGCTT
ATATGGAAGGTGGTGCCATTTATGCTCCAACAGCTGGTCCACCAATGAGA
CCTTGGAATACAACTGAACTTAATATCTATGAATGTTTCATAAAGTTTGA
TGGTATATCATATTTGAATTTTCAAGGTAATGTGACTTTTCAGAACAATG
ATTGTAATGATGGAGATAGTGATGATATCTTTATTTCCTCAGTACAGCCT
TGTAGACATTTTAACGAAAACCAAACACAAGTATTCAGCAGCTGGCCAAA
TTTTCATTTCCCATCAGAGAAATCTTCAATAGCATCTAATGCTATATGCA
TGTGGACTTTGAAACGGAACGAATGGTATTCCTACCCTGGAAAACTCTTA
AATCCACACATTGTGCTACAAGATGATCGAGGCAATAATGTCAGCGAAAG
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ATGCTTTCGTAACATCTGATAAGGATTCCATCAAACTACAACTCAAGCAA
AAAACTAAAGATCCCATTGCTTTTAATATCACAGTGAAAACTACTTCAAA
TCTTTTTCTTGAGCAAAACCTCACTAATCTACATTTCAAAGGATGTCCAT
TTGGATATACTTTTGACCAACATACGGGAATGTGTGAATGTGATATTATG
AACAACCAAAACCTTAACATTGCATTTTGTGActctgaatatattttttt
acaaaagaatgtTTGGGTTAATCCTAGCCAAACAAAAACATACACCTGTC
CAAATGAATATTGCCATAATGACGAAGGCAGATTTAATCATTATAACAAC
GATTGGCAGTGTGCACAGTATCGCCAACAAAACTCCACACTTTGTAGCAA
ATGTAAAGTAGGATTTTCTGCTGTTAGCGGAAGCTACGATTGCCAGGAAT
GCCCCAAGAATTCAAAAGGCTGGATTGGTATCACTGCAATTTTGTTTTTC
ACCCTTCTTCTATTCGTCTTACTGGTTTTTGCATTAGGAGTTGATATTAT
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TTTATACCTCAGAGCAAACCATTGACGTAATTTTGAGTTTCGTCATGTCA
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GTATGGTATGACAGCGCTAGGAAAAATGAGTATGGGGTTTATTGTACCTA
TTGTTATGCTGTTTTGGATGGCTGTATTGTATGTTATTTGTATAAAGTTC
aaacaagaaatttttataaataataCACAGTACAATTTGAAGGATCGCTG
TTACAAGACCATGTCCATCATTGTTGTAATGTGTTTTTCTGATTTGTTAC
GTATTAGTATTCAGATTCTCCATTACATTCAGATTGATGGTACCAAGTAT
GTGTACATGTATGCAGATGAGAAATGGTTTGGACCTAAACATCAACCACA
TGCTATTGTTGCTGCAATCGTCATATTGTTTCTTGTTTTGTTCAGTATCG
CTCAAATTGTTCTACTTCGAAAAAGCAATGTTACCGTTTTCGTATGGCTT
CGTAAATTTGAAGATAATGTAAGT
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000246_pilon | genome | sc0000246_pilon:251833..254844 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1-3012:1 |
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