XLOC_044223 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_044223
Unique NameXLOC_044223
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000365_pilon:75414..91252-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_044223 ID=XLOC_044223|Name=XLOC_044223|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=15839bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000365_pilon:75414..91252- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TTGTTACTGTTAGCATTGTGTTTTCATTACACAAAAGACGGGAATCCGTA TAGAGAAGCTTTGTTTCGGTGTAAACCGGGCAGGAAATCAGAAGGTAAAA GAATTTCTTGACATCTATGTCTCACAGTATAAGAAAATTTAAACAAAGGG TCTGCCTACAAACAAAGATTCTCTTTTTATGAACAATTTCATTAAACCAT CCATATTTTGATTTAAAGAGTCAGCATTGTACATTCTTTGAGCTAAATGT GTGACATTTCCGTGTACCATTCATATCAAAGTCTCTTCTTTAAGCTTGCT TGAGGAGATATCAATGTAGAAAATGTTTCCTTGTGTCGTCTGTAGGTCCT GAAGCAGCAGTTGGTCGATCATTTCCCTTAAATTTCAAACGTTTATATTC TTCACTCACAAGGTTAGTCAGTTGATGTTTTTTTTTCATCCTAGTTTTGA TTGGCTTATCATGGTGGCCGAAGCGAGAAATTAACGACCAGGGGTGAAAT TAATGATAAGATGATACACTATTTTTTTATATTATAGAAGTATATTTCGC AGGTCTATTGACCTCTATGAAATAATCTCATTTAAATTTACAGTTTATCT TTATAATGTAACAAAGTTCTTATTCTTATTGTACAAGTATTTTTTTCATA TAAAGTCGAGTTCTTGGGCTTCCACGGACTTTCCACTGGAAGCTGTCATC GTTCTTCTTCATATTTCGTTCTTTTGCCTTTTGGCACCATTCCTTAACGA GGTTTCGTTCGTTTTTTGACAGATCGTCTGTTGCTTTAAATTCGTAACGG CGTCTTGAATTGCAGATCCCCTTTAGCACCTTTTCTTTATCTTCCTCACT TTGAAATGTAAGTTTCAATGGACGGTAATGTTTTTTCTCTTCGTTTTCAA GTGTTAGGGTACCGATTCTTTCTGATTTTTTTACCTTGATTTCTCCTATA 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TTCCTCAGCTTAATACTCAGTAATTTTACGAAAGGGATCAAGGTTAAGTG GAACAATCCACAGGGAAAGAGTGACGCCCTTCCCTACCTTCGGGTAGATA GCTATCGAAAGAGGAGTCTTCGGTTCGCCACGACTGCAGTCGCATACTTA ATAGCGAGTTTATGTATTTTCACTTTTGAGGACGGTAAAGGGACTGACAC GATTTGGAAAAACCCGCACTTCTGACAGGCAAAATGGAGGACGGTAAAAG TGCTGATTTACCGTTGTTCTCAGTTGGTCATGATCCAGTCAAATTAGAAC CTTACCGTCTCCGTCGCTGAAAAACACACATACATAAACTTGGTAATTAC TAAACTCGTTAACATTAGTGAGGTTAAGTATACTGGGATAATCACGAGGA CGGACGAAAAATGTGATGGGCTAGTGGAAATACGAAATTTGATTGGTTGA AACTCACTAGCCTGTTAAATTTTCGTTCGTCGTCGTGATTTTACCGATTT ACTTAACCTCACTATTGACGAATCATTACTTTTACTTGTAGGGATTTGAA GCATGACCAGACAGTACTCCTTCTTTATCTTCTCTTGCACAAAAACGAAT CATTTCATAATTTCGCGTTACGTCAAAAAGACCTACAATCAGTGGTAAGA CTACTTTTTAGATATTCATGATATGCACCTTGTAATGTCTTCTCGTTTTG ACATTACATCACGAACCGAACAGCTTGTTGGTTGCAAGTAACGCTGTATT TGACTGATTCTACGTCACTCGCAATCAATACACCTATCAATTTTTAGCGG TGCGGTCTGGGACTGGTAACGAAAATACAACAATTTCCAACAAATTTTCC TTCTAAATTCACTAACCATCCCTTAAAAAGCCGATCGCACCACTTAGGGC TGGTAGGTGTATTAGCTGTTGTGTATATGGGTATTTGTAATGTCAGAAGA 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AATCGAACCCTAAATTTCAAGATGTCGTTCATAATATTGATAGTGTAAGT CATCTTTTTATGAAAACGATTTATTTTTCATATTTTGTTAATTTAAAAGC AGAAACTTTCGCAGGCAGAAACTTTTGCGAGGTTGCAAAATCGCGAAACT TCGTGAACTTTACTTTTGGAACGAATTCAGCGGATAGAACTTAAATAGCG AATTTTAGAATGTTATTTCATTTTGCAGGCGAAAAGCGATAAAAATGCAC AAAAACTGAAAATTGAGTACAAAATTGCAAATTATGGAAGCAAACGGTCA AATCTTTAGAGGCGATTCCTTAGGCAAATGGAACGTCTCCTTCCATAATG GCTGAAGTTACTTAATTTAACATAAGCATGAAAAACATCTGTTGACCCTC CCTACTAGAGGTAGAAAACTTATTTCATAAACACTTTGTATGGGAATTTC GTATAGATGGTCAAAGGTTTGGAACATATTCAGGGGGGCTCTTGCAGTTA CTCCTTGACACTATGTGGAGTAACTGCAATTTTGGACATTTTCTACAGAC ACCACCACCCTTGCAGTTATTCCATAGTGTACTAACTGATTGTACCCTCA AAATTGGTGTATACCACCCCCAAAAGTGCCAAATTTGGCAATTTTTTCAA TGAATTCCTCATTTTTGATACCATTTTACTGGGTTCGTCTTATTAACGAC CGTTCAAGAGTTATATATCTCAATTATTTTCCAAGTTTGTTAAAGTATCT TTCATGCCTTGATTGAAGAAAAAATTTTGTGATTTTTTCTGACTTTTGAA AAAAATGTTTTGAATTTTTTTACTTCCAGAATTTTTAAAAACCTAAAATT TTAAGTGAAAAATTGAAAAATGTGCTCACTTAGTACACCATATCCTACCA AAATCGACAATTTTGGGCTTAGGCACCACCCATGTTGCAGTTAGTCCACT 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ATTACTTTACACTTTTTTTGACATTTGTACGAGTTGCAATCCCACAATTC AATGCGGCTCAATTAAAAATACGTGCAAGTTGTTTTATATCTTTTGTCTA ATGATGCAATTAAGGTACAAAAGAAATTAACGCAAAGGTTGATAGGATTG GAACTCGTACAAACACATCGAGAGTAATGATTATGTCAAAAGTAAAATCT ATTTTTAGACTCAGCGCGGTGCGCTATTTTGAGAATTTTTCTGCGGTTTT TACAGGCATACCAGCAAAAATTTTTTTGCTGCGTACAAGTGCGTAAACAA TACACAACAGCCCTGAGCCTGACTTCCTAACAAGTTGAAATTTCTTTTCT ACATACCCGGAGTCTTGATATTTTTCCTTTGTATAATGGCAATAAGAACG TTTCCCCGGAAATGAAAGAGAGTTTAGCCATCCTAAAGTACCCTTATCAT TCCTTGGTATGTCGGAATTTCAATTCCTGATTCTTTTTTTTTCTGTAGAA AAATGCACACTTGAAGTTCAAATACATGGAAGAAGAAGCAGCAGAAGAAT TCTTCGTCCCTTACATCTGGTCAATTATTTACAAATCTTCTTTCTTGTAT TGGAATTCCGATAAAATACTACTGTTTCATCCTGTTTGA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000365_pilon:75414..91252-

>XLOC_044223 ID=XLOC_044223|Name=XLOC_044223|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3894bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000365_pilon:75414..91252- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGGGAGTAGTTATTCATCAATCTCTGACCTACCTCAAAACGAATTCTT
ATTGAAACTATGTAATGAAGTTCCAATCAAGCGTGATGATAAATTTTGGG
ATCAATTATTGTCATTCAAGTTTTCAACACCTTTGGAAAGATGGGGAGTA
GTTATTCATCAATCTCTGACCTACCTCAAAACGAATTCTTATTGAAACTA
TGTAATGAAGTTCCAATCAAGCGTGATGATAAATTTTGGGATCAATTATT
GTCATTCAAGTTTTCAACACCTTTGGAAAGATCCAACAGTCGGTTGATAA
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TAAGAGAAAATACAGAAAAATTGTGTTCTTCGATAGCATCCAACAACAAG
GTGACAGCGAATTTCACCACTTTGGTTGATGTTGCAATATTTTATGGAAG
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GCAACAAATGTCGCAATGCATTAATGATTATCAGATTATGTTGCGAACAC
ATGGTGGAAAACAACACTGAAGATGTTTGCGTGGCTTTCTTCAATACACC
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TTGCTACAATTGACAGAAATCATTGCTTTCGTAGATGCTGAAATCGAAGT
CGATATTGGAAGAATTCTTGCTACAATTGACAGAAATCATTGCTTTCGTA
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GGCAACCTCTCCAACAATGCTAGTGAAACGGTTCGAAAACTTTTACATAA
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CCTACAATCAGTGGGATTTGAAGCATGACCAGACAGTACTCCTTCTTTAT
CTTCTCTTGCACAAAAACGAATCATTTCATAATTTCGCGTTACGTCAAAA
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Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
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XLOC_044223XLOC_044223-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
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Properties
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