XLOC_044936 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_044936
Unique NameXLOC_044936
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000002_pilon:3278091..3289191-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_044936 ID=XLOC_044936|Name=XLOC_044936|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=11101bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000002_pilon:3278091..3289191- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAAGAAATTTCTAGATTTTGTTGGTTTATTTTTCTGTGTATCTTTGT AATATTCACTGTCACTTCTGCTGAAGAAACGTGTGATAATCCGTATTCTC CATTGGTGAACTGTTCTTTACTGTAAGTATACTCATTTGCCCCAAATTAC CCAGAGTAATTACTTGGGTAAAAGGGGGTACAGCTACAGGTCAGGCAGGG GATGTGGCTGCTGGTCCATCAGGATCAGGGTCCAGCGTATCTTTATTCAG TCATCCGGGGTAGGGTTGCAAAAACACCAAAATAGAAAAATCAGTACCTC GTAGGGTACCTTTTTGGGGAAATTTAGAAAAAAATAGAACATTTTGAGAA CATTTTGGAATTTCAGTCCTATTCATTCAGGGTCACTTTTTTCATAAAAC AAGACCCAGCCACTTTACAGAACAGGGTCCATTTTTCGAACTTCAGCAGC ACACCCCTGTCGGTTGGCAAGGGTAGTACCCCCCTCTGGGAGAATTACCT TAGCATAGGTTCAACTCCAGGACCAAGACACAAATGCAGACAGACACACT GCCATATTTCTAAGCCATATAGTTTATAGTTATGATGGACTATTCATAAT TCCTATAACCCAAACCCCTACATAAATTTAACATTTTATTAATTCAACAA TTTATTATTATTATTAATATTATGATACATATTTCAGTCGAAAAAGATGG CAATATTAGTTGCTGTTGCTAACTTAACATAATTTGCATTTTTCGGTCAA TTTTGATTATGGTGAATTTAATTAATATAATTCTTACCAAGTCCATTCTT ATACAACCACCACAAAAAAGAAAAGTGGCGCATTCCTGGTTTTGAATGAG AAAAGAGTGTATACTACTACTCTACCTCAATGCATCTTTTTGTCAGAGGG TAATTACCTTGTATGGACACTGTCAACAAGAAGGTACAAATCATGCACCA 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AGGGGTCTTCTCAAAAACGTATGCTTGCGTACAGGGGGAGGGGAGGGGTC AAAGGAAAATGTACGTACGCAGAGAAAAAATTTTCATAGCCCTTTTTTGC TTGTTTTGTTGTCGATTTTTACGCTTCTTATACCCATCAAAGAAAAGAAA AAGTTTCTTAATAAACATTGAGTTTCATGTATGAAATAAAGGTCCGAACC GAACGATTTGAATTCGAGGGGGAGGGGGTGAATGAAAAAGTACATACTTA CCAGGGGGTATAGCCATTTGCGTACGCTTGCGTACAGGGGGGGGGGGTAC TCGATTTTCGACATTTTAGTGCGTACGTACTATGTGGACGGCCCCATAGT GGACCTGTAAATTAGCACAAATTTTTCGCGCTCTCTTCGCTCGCATTATT TTGTTTAAATGTTTTTTTGATTTGACTCCCTAATCTTGGCCAAGCAACCA TGTTATTGCCCTTTTCTCAAAGGAAGGTGATGGGATAGGTACTGCCTAAT TCTCAAATTAGAACTAAAGAATTATCCATAAAAAGAGCTTTTTGAGGTAC TTAGTTACAATAGTAAAACCATTCTAAAACATAATGCTTTTAGCCAAATA AGAAAGTGTTGAAATCAAAATTTTCTTCGGTCGACAGAAAGCATGGTTGC ACTTTGTCAGTAATTAAACTTTATCTTCTATGCTATTTGCACTTGGAAAT TAGATCGTTCGTCTGATAAACAGTGTATCCCTTACTCCTCATTTCATCAA CAATTCAGTTGATGGAAATTCGGGAAAATATTGCCGGTATTTCGGTATTC AGTGCCCCTTGAACCCCCCCCCCCATGTTACTTGCTTTACAACTTACAGC TGATAACTTTAATTAGTGTCAATAAATTCGAATCAATCAGAAATAAATGT CATGTAACAAACACATAAAGATTTCGAGTAAAAGCGTGATTTGTTTTCAG ACTTTTTACTTTGCAACCTGCGTATTTTTGACTTTACGAAAGTTTCTGCT TTCGATAGCTTTGTACGTCTAAATTAACGTTCTTCTAATGATGGTGGTTT AGACCTAATCCGAAATTTCGGGAGGCTGAACCGGGAGCCGGGAGGCGGGA GGCTGAAATCGAAAGTGGGAGACGGGAGGCGGGAGGCTGAAAACGAAAGT GGGAGGCGGGAGGCTGAAATTGAAAGTGGGAGGCGGGAGGCCGAAAACGA AAGTGGGAGGCGGGAGGCTGAAATTGAAAGTGGGAGGCGGGAGGCTGAAA ACGAAAGCTGGGAGGCGGGAGTCGGGAGGCTGAAATCGAAGGTGATAGGC TGAAAACGAGTAGACGAAAGGCCGAAAACGAGAACTAAGTCGCAAAGATA AACAAAATCTTGTGAAGATAAACAAAGACAACGGTTTAAAAACACTCTCA CGAGTTCCGTATCGTTTGTTAGTATACGCTTTTTCAATTATAATAAGGAA CCTTACGGAGCCTGGAGTATGTAATTGATCTAAACAGTTAGCCTAGCCCA TGAGGTCAGTTCACCCGTATATGCAGTAGTGTTTTTATAAGGATTTTTAA ATTGACCAATTTTGTATACGTTTTTGTATCGGCTCGATAGTACATTGCTA GCGTGCCGGACTCAGAATCATTGACAAGAGACTTTGGTAGTTCGAGCCGG GGTCAAATTTTCAGTTTTGAAAAAAAATTCTAAGTCGCAAGGAGTTCTAA GCATTTCGCTACATTTCACTCTTGGTGTTTTCAAGTTAGTCTTTAATTAT TGGAAATATGAATTAAAAAGGAAAATACTTTCATTTGTCTTTTTTTCTAC GCTCAATGTCAATTTTCAGGATAGGACTCGAGGTTTGTTTACGTCAGAGG AAACCCCGTTCTATTTAATTGTTAAAAAAATTCCATGACACAGCATTCGA AAAAGTAGAATAATTGGGCTTTCCACAAGTATATTACTTTTTGATAAATA TAACGAGATTGCTCACGGAAATATCTAACCCGGGCCTGTCAATCATTTTC TAGACCTGTCAATCACTTTTTTGGCAGCATAATCAGTCAGTTTTGCTTTT CTTTTCACTTGTGGTTCTGAAAAAAGTGTTTATAAGATAATAAAAAAAGA CGAAAGACGATTTTTTTGCATTTTTTTAGTTGAAAGTTTTGGAACATTGG ATTTTCAAGAGAAGGGAAAGTCATAAAACTCTTGACTCTTGACTCTCCAC CCGCTAACCAACCTGATCCATTTTGAAATACTGTACTTGAATCAAACTGC ATTGAGCTGAGGTGACACTCCCGGGGGGGGGGGGGTTACCAATTGACGGT ATGTGCGGCATAAAAATTTCGAAAATTGGCTTTTGTCAAATTTTAAACTC TTTTAGAGCAAAAAAAATCAAGATTTTCGAGCAATCAAGATTTTTTGAGC AATAATTTTTCCCAGATTTGCTGAAATTTCCACCCTTACAGTGCATTTAT TAAAAGTCCACCCTTACAGTGCATTATAAAATAAATTGGAAAACATACCC TTAACCGCCGCACATACCCGTCGCGGCGTCGGTCAATTTGCCTGACTGCC CCCCCCCCCAATTTTTGTTTCTTAAAATTTTAACGGAAATTTTCAAAAAT ATCAACAAGAGCTCATAAAACCAGAAAAAGTTTGATCAATTTTAATTTTA ATTAAATTCTCCTTCATCACCAAATAACGTTTTGGTATAACACTACTATG TCCCTTAAAATGAAATAAATAAGAGCGTCTACCTACAATGTACAGTAAAA ATTTCGTTTTTAGGGTAAAATAAAAAAATAATCCTTATACCGTGTATGTT GACAAAACAGACAAAAAAACACAATTTTCGCGTCGCACCGTATAGGATTC GAACTCTCTGAAATTATTACCCTCTAGTTGCCGTTTCATCGACTTATCCA CTCGGCCACGCAGGTGATGTGTAAGTGAAGTGAACAATGATTATGATGAG ACCTTTATTTTGCCATGACTTGTATAATTTTACTCTGTCAAGGTATTGAC TTCTTAAAGGAATGATTTTAGATTATTTCCAACATGCAAGAGCCGATTGC ACTAAATATACATAACACTCGAAAACTATCATGTTATATTTTTTTGTAAT TAAATCTTGCATCAGCAGTTTCGAAACAAAGCTTGCTATATTTTTATGTA AAATTATTTTTATAAAGAGAAACGCTTCCTAGGATTAAAGGAAAAAAGAG AGAACGGAGAAAACACTTGGTTTCAAAACATACTTTTTGAAATATTTTTT TTGATGGATTGTGTGTATTTATAAAAAATAAATGATCTGATTTTTCTTAG CTCTTTGTTACCTATTCCTTGACCAAAAACGTTTGTGCGTGGCCTTATAA ATGAGCCTATTCTATAAATTAGAATTATGTTTGAAAACGAGAAATATTTT AGCGATGAACGGATAATAAACCATTTATTTGGACGCAGTCTCATCCAATA TGAAAAATATGGGGCTACGAGAAAAGATATTGGACTCGGCGAAGCCTCGT CCAATATCTTTTCTCGCACGCCCAACATTTTTGCATATTGGATTCGACTT TGTCCAATAACTGCTTAATATTGACCGGCCACGTGACATTAATCATCCAA TCAGTTTTCTTAAAAATGATTGACAGTTGTATTGCAGGGCTATAAACACC TTTATTAACCGAAATTAGTGCTTTAAACGTCGAATTACAAGATCTTTTTT CGAGCTAATGAAGGAAACCATTTCATTTGGACAATTATTAGTTGGGTGAA AGTGACTAAGTTGTAAATTTCGTCGGGGAAAAGTGACGAATTTGAAATTT TGGTCGGGGGAAAGTGACGAAAATGGCTCTAGGTGACGAAATTTTTTCCC TACGAAAAAAACCCCGACTAGATAAAACTCCGACTAAATAAAACTCTGAT ATTTTTTCCCCCGTTAAGGTATTGGATCAGGTCCGGCTTGAGGAGTCGCT AGTTGAAGTCTTAACCAGTTTTTAAAGCTGGTAAAACATTCAGCTTGAGC TCATTTTACGGATCAGATTTCACACTAAAAACTGGTAAAGAACTCGTCTC CCAGCTGGTTAAGAATTCTGCCAACTGGTTAAGAATTCAAACAGCGACCC CTCAAACCGGACCTCAGTGGAACCTCTAATTAGCGGACACCATCGGGGAA AGGGGTTAGTGTCCGCTAATTAGAAGTGTCCGCCTTTTAGAAACTTTTGA TCTCGGAGCTCCAATTTTGAAATTAGGCCATCCCAGGGTGTCGAAAATAC AAAATTGGGGTCTAAAGTACTTATCTGCATTCACTAGGTCATAGAAGAAC AAGAGAAAGGTTATTAAAACGCAACAAGTTAGTTTTTAACAAATGAAAGA AAATCTAGAAATATAACACCAAAATTGAAAATACAATTCGTTGAATGGAT CAAGGGAAAACCTGGGAAAACTGGAAATTTGTAGAAATAATTTGAATAAT AAGACTAATAAGTGCTTGAAATAAAAATATCTAAAAAATTTTTTCTCGAT TTTGGACGTTTGTGACCCGTTTGATATTCAATGTCCGCTAATTGGAGAGC TGAAATAAGGGTTTTGGCCATTTCGTGCGAAAAAATTTGTCCGCTAATTA GAGGGTCCGCTAATTGAGTGTCCGCCTTTTAGAAACTTTTTTATGAGGAT TTGACTAGGAAACGGCCGGGGAAAATCAAATCGTCCGCTAATCAGAGGTG TCCGCCTTTTAGAGTGTCCGTTAATTAGAGGTTTTACTGTATTTATTTCC CCTGTCTAAATACACTCAGAATTAAGTTTCTCTAGAATGCGAGAAATCTC TTCGTCGTGACTTTAGTCTTGAAATGTCCAAAATTTGAAAAATATCAGCC AAAATTTTTTCTAATGAAGTCCAAACAAAAAGACTTTGCTTCAGCCACTC TTGATGATTATGCTAGTCATTTTGTTTCTTCTTTTTAGTACGGAGGCCAA AAACACGAAGATGTTCTGTTTACAAAGTTGAGGTGTCAAGCATTGGATGG TATTGAATGCTGTGGAAGTCGGACTTTCCTCCGTGGGAACGTACCCTGCA TTAAGTAAGTATGAGAAAAATCTCAAAACTTAATAAGCAGGGGGTTAGAA TAAAAATGTCCTGGGTGAAACATTTTTGATTTTTGAAAAGGAGGCTAATA CAGCAGAATTAGGCCAAAAGAGGAAACTTTCAAAAACAGTTTACCAAAAA TCAAAAGTGGGGGGGGGGCGGTTATTAGGTACCCGAGAGTATATATCATG CATTTTTGATGAGCTCTTTTGTCAATAGGTGAAATCTCATTGGTTCATTA AGTGTTAGAAATTAGATGAGGCGAGATTCATTGTTTCTGCCATCGTTGAA AGAAAATATTTGGACTTAAAAAAGGCCTGTAAACTTGGCAATCCTTCATC AAATGACAATATTTTTCGATCAATGCTTTCTTCAAAGTGCACTTCTTGAT GCTTTCCTCCAAAATTTTCAAGTGACGTTTTGTTAACAAATTGAGTCTGA AATCGTTTGTGCTTATAAAGAACCTTTCATTTTTTGGCTTAAGAAAATAT CTTTTCAAAACAAAATTTAACGGACAACGAAACTAAACAAAAACTTGTCT CGTGTGGCTAAGTTTTATTTAATATCGTATATTAAAAGGGTAGAAATCTT AGATAATGATACAATATTAGTAGAGTTAGAATATTCAGAGCAAACTTAAG TTCTACTAAAAAGTCGTATTTCATCGGGCGAACTTAGAATTTCTTTTGAT ACATTTTATAAAAGAAATCAAAAGACTTTGACGACCAATTACCAACAAAT TCAACTCTTGTTTTTCTTTATTATTCCATGGTTCAACAAATAATTGTTAC ATTGTAACTTACAACCATTTTGTTATAATTTGCAAGTCTTATTTTCAAGA GCTGCCCCATTGACCGGTGTAAAAAGGAAATTTCTAATTATTACGGATTT TTAAATCAGAATTCAAAGCTAGTTTCGTGATATTTGGACTTCTTTTGAAA AAATTTCATGGAAATTTAAAGACGATACGGCACATCAAGTGTAAAAAAAT TGCCGCCGAGAGACAGGGGTTTATTAAATACAGTATCAACGTGCAAAGAG CACCAATTTTCACATATTTCCGACTTTAATTTTGCAGGTATTCGGGTCAT TATTTTGTAACGACGTTGTTATACTCGATACTTGTTGGATTCTTCGGCGT GGATCGTTTCTGTCTAGGACATACAGGTACAGCAGTTGGTAAACTACTGA CCATCGGAGGAGCTGGTATTTGGTGGTTTGTTGATATTATTTTGTTGGTT ACTGGAGAGCTACAACCAGCAGACGAGAGTAACTGGAACCCCTATTATTA A

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000002_pilon:3278091..3289191-

>XLOC_044936 ID=XLOC_044936|Name=XLOC_044936|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1068bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000002_pilon:3278091..3289191- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAAGAAATTTCTAGATTTTGTTGGTTTATTTTTCTGTGTATCTTTGT
AATATTCACTGTCACTTCTGCTGAAGAAACGTGTGATAATCCGTATTCTC
CATTGGTGAACTGTTCTTTACTATGAAAGAAATTTCTAGATTTTGTTGGT
TTATTTTTCTGTGTATCTTTGTAATATTCACTGTCACTTCTGCTGAAGAA
ACGTGTGATAATCCGTATTCTCCATTGGTGAACTGTTCTTTACTGCCAGA
AGAATTTGTGATTTGTGATAAACTACTTGATGTTAATGAATCAACAAGAG
AAGCTATAGGTTATGGATGCTATAAAGCCAGAAGAATTTGTGATTTGTGA
TAAACTACTTGATGTTAATGAATCAACAAGAGAAGCTATAGGTTATGGAT
GCTATAAATACGGAGGCCAAAAACACGAAGATGTTCTGTTTACAAAGTTG
AGGTGTCAAGCATTGGATGGTATTGAATGCTGTGGAAGTCGGACTTTCCT
CCGTGGGAACGTACCCTGCATTAATACGGAGGCCAAAAACACGAAGATGT
TCTGTTTACAAAGTTGAGGTGTCAAGCATTGGATGGTATTGAATGCTGTG
GAAGTCGGACTTTCCTCCGTGGGAACGTACCCTGCATTAAGTATTCGGGT
CATTATTTTGTAACGACGTTGTTATACTCGATACTTGTTGGATTCTTCGG
CGTGGATCGTTTCTGTCTAGGACATACAGGTACAGCAGTTGGTAAACTAC
TGACCATCGGAGGAGCTGGTATTTGGTGGTTTGTTGATATTATTTTGTTG
GTTACTGGAGAGCTACAACCAGCAGACGAGAGTAACTGGAACCCCTATTA
TTAAGTATTCGGGTCATTATTTTGTAACGACGTTGTTATACTCGATACTT
GTTGGATTCTTCGGCGTGGATCGTTTCTGTCTAGGACATACAGGTACAGC
AGTTGGTAAACTACTGACCATCGGAGGAGCTGGTATTTGGTGGTTTGTTG
ATATTATTTTGTTGGTTACTGGAGAGCTACAACCAGCAGACGAGAGTAAC
TGGAACCCCTATTATTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_044936XLOC_044936-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000002_pilongenomesc0000002_pilon:3278091..3289191 -
Properties
Property NameValue
Aaloc322-534:214
Aaloc205-318:1414
Aaloc124-204:7514
Aaloc1-120:11102