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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000043_pilon:1673067..1680336- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_030420 ID=XLOC_030420|Name=XLOC_030420|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7270bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000043_pilon:1673067..1680336- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCATTTTCATCTTTCTTTTGTCTTTCATACAGTGTGGATAACAGTGA
GTGGATGAGGAATGGGGATTTTATGCCAACAAGAATTTCTGCGCAACAAG
ATGCTGTTAGTGTTATTTGCCATGCAAAAACAAGACAGAACCCAGAAAAT
AATGTTGCACTTATGACTTCTGCTAGGTATGTTTTGGATAGAGGAATAAT
TTTTGTTGTACATAATGGTTGTGTAAGATGCAATAAATAGCCATGTTATG
GTACTCCTTGGAATGGCTCATCAGCAACTACAAAAATGTGCTCAGTGTGT
AGGAGGATTTGTATGGACAAGTTGAATAATATTTGAAGCTTTAACATATT
AATTAAGATATTGACTTTTTTATTGGAAATTAATATTAGGTTAATCCTGT
TCAATTCAAGTGATAGTTTGTTTGTGAAGCTAACTATTTTTATTTGTGTA
ATATATGTAATTTATTATAATTTTTGCAAAGTATTTGGTAAATTGTTCAA
TTCTTTTCAATTTTAGTTTGGAAGTTCTTGTAACTTTGACTACAGACGTT
GGACGTATACTATCCAAACTTCACAATGTTCAACCAAAAGGAAGTGCAAA
CTTCTTAACAGGAGTTAAAATTGCACATGTAAGATAATGCATTTTTGTTA
TAATGGTACCTTTATCCGACTTGATGCAATTTGATTTGAACTTACCTTTT
TCATATTCTTATTGCAGAGCACAATATTTCAACTATCAACCTTTTTATTC
CTTGCGAATAGATAAGGTTTGATACATGCTTATTAACTGTATTCTCAACT
TCAGTTGAGTTAGAATCTGAGAATGTGTGTCTGTGTGTGTGTCTGTGTGT
GTGTGTGTATGTCCCAAAACTTTGGGGCAGCCTGGAGACTTCAAAAATTG
TTCGATTTGGCTGAAATTTGGCACACTTGTTCCTTGGGTGAATATCTGGG
GGTGTTTTTTTCATTTTTCAAAATTTTTGATTTTTGGGGCCTGGGGACGA
GTTTTTGCCAAAATGAGGCTAAAACTTTGGGGCAGCCTGGAGACTTCAAA
AATGGTCGGATTTGGCTGAAATTTTGCACACTTGTTCCTTGGGTGAATAT
CTGGGGGTGTTTTTTTCATTTTTCAAAATTTTTGATTTTTGGGGCCTGGG
GACGAGTTTTCGCCAAAACGAGGCTAAAACTTTGGGGCAGCCTGGAGACT
TCAAAAATGGTCGGATTTGGCTGAAATTTTGCACACTTGTTCCTTGGGTG
AATATCTGGGGGGTTGTTTTTTTCATTTTTCAAAATTTTTGATTTTTGGG
GCCTGGGGACGAGTTTTCGCCAAAACGAGGCTAAATTTTGGGGCAGCCTG
GAGACTTCAAAAATTGTTCGATCTGGCTGAAATTTTGCACACTTGTTCCT
TGGGTGAATATCTGGGTGTGTTTTTTTTTCATTTTTCAAAAATTTGATTT
TTGGGGCCTGGGGACGAGTTTTTCGCCAAAACGAGGCTAAAATTTTGGGG
CAGCCTGGAGACTTCAAAAATTGTTCGATCTGGCTGAAATTTTGCACACT
TGTTCCTTGGGTGAATATCTGGGGGTGCTTTTTGCATTTTTCAAAAATTT
AGATTTTTGGGGCCTGGGGACGAGTTTTTCGCCAAAACGAGGCTAAAACT
TTGGGGCAGCCTGGAGACTTCAAAAATTGTTCGATTTGGCTAAAATTTTG
CACACTTGTTCCTTGGGTAAATATCTGGGGGTGCTTTTTGCATTTTTCAA
AAATTTAGATTTTTGGGGCCTGGGGACGAGTTTTTTGCCAAAACGAGGCT
AAAGCTTTGAAGCAGCCTACAGCCCTCCAAAATGGTCGGATTTGGTTGAA
ATTTGGCACACTTGTTCATTGGGTAAATATCTGGGGGTCTACAATTGGGC
CTATGAATAATTTGAAGCCACTGAAGTTGAGCCCAGTGCGTTGCGCACGT
TCGACTATAAAACACAGGGATCCCACTCCTCCTAAAATTCCTAAAATCCT
CCTAAAATTCAACAAATTCTCCTAAATTCCTAAAAAATCTGAAATCACGG
TAGCTGATTATGTTTGTGTATTTGTATAATCAGACAAGAAACTAAGATTT
TTCCTCAGTAAAGTCAAAACAAACTGCGAGCAAGCTACCTGACCTTGAAA
CAACATGTTTAAAATATATTTTTGCACTGAAATATTTGAAACAAATGTTT
ATTGAAAGAGTGCAGACTTTATTAAACAAAGAGGGCTCAAATATTTTAAG
AGCAAGGTTTGGTGGTTTGCGCCCTCATCTGTGAATTTTTTACTTGAGCA
TAAGCTTTGTTACAATACAATGCCTTTCCCTGTTAATCTACTATTCTTTT
GTTTCGTTAAGCAAAAATGAAAAGAAATATGAACGCTGACAACCATTTTC
TAACTGGAAACTGCATTACAAAATGTTCTAAATAATCTGCTTTAATGTTT
TGCCATTCTATTTCATCTGCTATCATCGTCTACACGTTTTTTTTTAATAA
GAATACACTTTATAAGAATGTCCATGATGAAAATGGCCAAAAAATTAAAA
ATAATGCTAAGAATATCACCATCATGGAATTTTGCTACTCAAGCTAAGAA
TGCCATTTTTAGAGTATTTTCAATTATAAATTGTCAATTACCCCCAATTA
AGGATCACTCCTTTCACAAAAATGCCATTTTCTGCTTGAGACGTATGTAC
TAAATGTTAAATCTAGTCTGAATTAGGATTCTAACCTAAGAATGCTGTAA
GAATATTTTGGGATGAATCTCCCAAAAAAGTTAAGAATATCCATGATGAA
ATAGATTTACGCCATTCTTATAAAAAACGTGTATTTTTTATCTATTCAAT
TTTTGGAAGATCTAAAGATAAGTTTTTTGGTAACTAGCCTTCTGTTGAAA
TATCTTTTGTTACTCTGAATAAAATCAGTCTATATTGCTCAGATTACATC
TCAAATATGTCCCCAGTTTTTCTAATTCAAGATGACTTTTGTTAATATTT
TTGATCTTCTAAGTTAGCATTATGTATGACTGGTGATTTAGCCATATTGA
GAGAATTTCTTTTAGAACGAATAATAGTTTACCAATACGTAAAGTAGTTT
TATTTTTGTTACATTATTCCAGTCTTCCTGTGGGTGATCTTTTTTAGTAG
AACATCTTTCTGATTGCTGACTTCAGGTTGATTTTAGAAATTTATTTCTT
AAATTTTCCTAAAATCCTCCTATAAAAAATTGGAAATTTTCCTAAAATTC
TCCTAAAATTTGTCCTAAAATTAAGATTGGGATTAAGATTCAAGCGTGGG
ATCCCTGAAAACATTCAAATTATGATTTTATTTTTTATATCTTATTTTTT
TTTATCTACAGCTAGCCTTAAAGCACAGACAAGGAAAGAATCATCGCATG
AGAATTGTAATCTTTGTTGGCAGCCCTATTGAAGTAGTTGATAAAGAAGT
AAGCGAAAAATACTTTACTTTGTCTAAAATCTGAAAATCGAATTTCTCAA
AACATGGTCATATTGCATACCAAAAACATAAAAGTTGAATAAAAGTTTTG
ACCCTTCAAAGCCATTTTATGACAAAAAACAGGCCCAATTGCATTATGGG
CATTAAAAATAGAAAAATTGTTTTGGGAATGGATTTCTAGCAAGTATTTG
ATCAATTGAATCACGGTTCAGCACCTGAATTGCATTTTCACAATTTCAGT
AAGTTGTGAGCAACGGGTCAATGTTTGTAGGTTTTAAGGTGTAATAGTAT
AGGGTTTAAGGTGTAATTTGATTTTAACATACAGTTTTGAAATTATTTAG
GTACAAATGATCTAATTGTAGCATTAGTAACTTTGCAGTGAATCACTGTT
CAAAGTTGGAGACCAAAAGGACTATTTTATAAAAAGTTATTCAAGAAAAC
CATTTTGTAGGTTTTAAGAGGTAAATAAATATCTAAAACTGCATTTTTCA
CGAAGCAATAAAAATTTTCTTATCAGCTTTTACCAAAAACCATACCTAGG
GAAGAAATTCATAGGTAGCCTAAACTCACCAGACAAAGTGTCAGCCCTTA
CTTTTTCTCAATCAGAATATACGAGGGAACCTCTTTTATTGTAGGTTTTA
AGGGATATCCACTGGTAACAACTAAATTTTAATATTTTTGTTTCTATTTT
TCATGTTTAGCTCACAAAAGTAGCTAAGAAATTAAAGAAAGAAAAAGTCA
ATGTGGATATCGTGTTATTAGGTGAAAATGTAAGTACCTCCTTTTTGGCT
TTTTTCTACCTTGAGAGTCTTATATAAATCAACCCCTTGTTAGCCCGTTA
GTAAGTAACAGCTTTATTAGTGATTGGTTCAAATTCTTCTGGTTTTCTGC
AGTATAAACCATAAACTTGAGTGGTATTAAGTCGTATATTTTTCACCTCT
TTAAAAAACCTGATCTTGTATTTCTTTTATAGACACCAACCCACGATAAA
CTCACACAATTCGTTGAAACTATAAATGGAAAAGAAGGCACAGGGTACAT
CACTCATTTTTGACAAACAAAAATGTTCATTTGATTCAGATTTCAAGTTT
CTTTGAGAGATTGCCCTATGTAATTTAAATATTGCATAAAGAATTACAAT
CATATATTTTTGCCTAAAATGCATTTTGTCAAAGACTTCGTATGGCATTA
TTGCATGTCTAAGAGAAGCATCACTCTTTAGGATAATAATTGTATAATAT
TTAAATCAAACATCCTTGTCATTTAACGTTTAGGAGTCACTTGGTTGTTG
TACCACCAAGTCCTAACCTAACAGATGCTTTACGTACATCACCAATTGTG
CAAGGAGAAGATGGCTACACACCGGCTGGTGGTGATTTTGGATCTGGTTT
TGATGTAGATCCAAATCTTGACCCTGAATTAGCATTGGTGAGTTTTGAGC
TCATTTTTGTCTCTTTTAAATCTACTCATATTTGAACAGAATATCAACTT
TTCGATTAATGAAGACAATGCCCTTGAAAATTACTATAATATAGTTAACA
AAAAATGTAAGAAAATGATAAATGTTTTGGAAAGATTTACAGATTCTTTT
AGAAGTATAACACAGGCAAAAATACAAATGCCTCTGTCACGTGTTTCCTT
CAGAAGTACAGCTTAAGTAAAATGAAATGAAATTAACCTTTTTCAGGCTT
TGAGAGTATCCATGGAAGAGCAAAGGCTGCGTCAAGACCCAACAAAACCT
GAAGGAGAAGGTGCTGCTACCACTACACCGGCTGCTGGTGGAAAAACTGA
AGCTACTACTGGAGGAACTGAAGATTCTCTTTTGATGAACGCCATGTATC
CTGGTGGCGTAAGAAATTTATGCTTTTTACAGATATTTTAGTAAAATCTT
GTCAGGATTCAGAAAAGTGTGATTCCTTTCTTTGACTTGGTTTCTAAAAA
AATTATTCTGTAATAGAATGGTCTAGTTGTGTAAAAGTTGCATACAGATT
TATATGTAAAGTTATATGATAGTTGAGGCAGTGAAAATTATCGTATTAAT
ACTGACAGTTTCATGTCTTATTCAAACAATCCTCAGTTGAAAATAAAATT
TGTAAAAAAACTAGAGTTCCGTTGCTCCTACAAAAACAACTTTGCTTAGT
CCTTGGTGACGTGAAGTTGTAATATATGTACAGTTATACAGAATTTTCCT
TTATTAATATTGATGACTTGAAATATTACCTTACGAACTCAAATTTCTTC
AGAACTCTGTTGATTTCAATGCAATGTCAGAGGAAGATCAAATCGCATTA
GCCATACAGATGTCAATGAATGATGCTAATGCAGATGACGCTAAAAAAGA
TACACCTACCGCCATGGATACTGATGTAAGAGAACGTTTTTTCAATATGA
TGATTTATTCGAAATTCCTTATAGAAATTTCCAAAAGAGAGAGAGTCCAA
AAGAACATTCATCAACTAAATACGAATATAACGAGGTCTTTATCTAACAC
AACATGACACAATTGTTCTAAGATAGATTTTGGCAAACCGTGGTACAGTG
GTAGAGCATTCGGCTACAGTTTGCAAGGTTGGGGGTTTAACCCCCAGCCG
GGTCATACCAAAGATTCTCAAAATAGTACTTGATGCCTGTCTGCTTGATG
CTCGGCAATTAAGAGAATGATCAAGGGTAAATGGAGAAATCCAGGGAGAA
AGAGTGACGCCCTCCCCTACCTTCGGGTAGATAGCTATCGAAAGAGGAGT
CTTCGGGTCGCCTCCAACTGCGGTCGCATACTTACTTACTAGATTTTGTA
TTCTACTAGATCTGTATTAATGTAAATTACAAAACTCTCTCATAAAAATG
AACTCGTTAGATTTTGCTTTCTATACCGATTAATATAACAATAGCGTTCA
GTTTGAGGTCGTTGTTGTTATTTTCTGCCCGCCCAGTTTGATTATTAGCC
CGAGAGGGCTAATAATCAAACTGCAAGGGCAGAATTAATGACAACAACGA
ACGAAAGCTTAACGCTATTACTATTATTATTTATATCGGACATTCAAACA
ACGTTTTTTTCTAGCGTCGGCCAAATCTTTTCGCTTCAATGCAATGACTT
CAACAAGTTTTGAGTACCCTTGCGAGTGGGCCACAAATGACCAAAAAGTG
TTTTTTTCTGACGTTAGTTTCGTCTTTTCTCTTCAATGCAACGACTTCAA
TAAAGTTCCGAGCGGGCCGCAAATGACGTTATCGCCCTATAACCAGGGCG
GTTAATGATATTTCAGCCCTCAGAAGCGCGACGCCTTTTCTCAGCGCGGG
TATGACTATTTTAGTCATAGAACCTTTCAATACCGCCCGCCGTTCGAATC
TTTAATGGCTTACTTAATGACCGCTATATGGATAATAATACCCATTTAGT
ACTCAATATTCTGAGGACATTCTCAAACACTTATGGCACTATGGACCTTT
TGCTATAAAGATGTCATGTTGAATAATTAAAACTCCATCATCAAAACGGT
GATAAAAATAATTTTTAATCGGTTGTTCATTATTTTGATGCTGGAGATTT
TACTTATTCAGCATAATTCTAACTAGAAAAAAGTCTATTCTAAACCTACC
ATATTTTCCCTCCTAGACACCAGCACCTGCTTCTGATCAACCTATGGATG
AATACCAAGACTATAGTGAAGTCATGAACAACCCTGAACTCTTACAACAA
ATTGTTGGCAATCTACCTGGTGTCGATCCTAACAGTGCTGATATTCAAAA
TGCATTACAAGCACTTAGCGAAAACCAAGAAGGCGAAAATAAAGATAAAA
AAGAAGAAGATAAATCATGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000043_pilon:1673067..1680336- >XLOC_030420 ID=XLOC_030420|Name=XLOC_030420|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2298bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000043_pilon:1673067..1680336- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCATTTTCATCTTTCTTTTGTCTTTCATACAGTGTGGATAACAGTGA
GTGGATGAGGAATGGGGATTTTATGCCAACAAGAATTTCTGCGCAACAAG
ATGCTGTTAGTGTTATTTGCCATGCAAAAACAAGACAGAACCCAGAAAAT
AATGTTGCACTTATGACTTCTGCTAGATGTCATTTTCATCTTTCTTTTGT
CTTTCATACAGTGTGGATAACAGTGAGTGGATGAGGAATGGGGATTTTAT
GCCAACAAGAATTTCTGCGCAACAAGATGCTGTTAGTGTTATTTGCCATG
CAAAAACAAGACAGAACCCAGAAAATAATGTTGCACTTATGACTTCTGCT
AGTTTGGAAGTTCTTGTAACTTTGACTACAGACGTTGGACGTATACTATC
CAAACTTCACAATGTTCAACCAAAAGGAAGTGCAAACTTCTTAACAGGAG
TTAAAATTGCACATTTTGGAAGTTCTTGTAACTTTGACTACAGACGTTGG
ACGTATACTATCCAAACTTCACAATGTTCAACCAAAAGGAAGTGCAAACT
TCTTAACAGGAGTTAAAATTGCACATCTAGCCTTAAAGCACAGACAAGGA
AAGAATCATCGCATGAGAATTGTAATCTTTGTTGGCAGCCCTATTGAAGT
AGTTGATAAAGAACTAGCCTTAAAGCACAGACAAGGAAAGAATCATCGCA
TGAGAATTGTAATCTTTGTTGGCAGCCCTATTGAAGTAGTTGATAAAGAA
CTCACAAAAGTAGCTAAGAAATTAAAGAAAGAAAAAGTCAATGTGGATAT
CGTGTTATTAGGTGAAAATCTCACAAAAGTAGCTAAGAAATTAAAGAAAG
AAAAAGTCAATGTGGATATCGTGTTATTAGGTGAAAATACACCAACCCAC
GATAAACTCACACAATTCGTTGAAACTATAAATGGAAAAGAAGGCACAGG
ACACCAACCCACGATAAACTCACACAATTCGTTGAAACTATAAATGGAAA
AGAAGGCACAGGGAGTCACTTGGTTGTTGTACCACCAAGTCCTAACCTAA
CAGATGCTTTACGTACATCACCAATTGTGCAAGGAGAAGATGGCTACACA
CCGGCTGGTGGTGATTTTGGATCTGGTTTTGATGTAGATCCAAATCTTGA
CCCTGAATTAGCATTGGAGTCACTTGGTTGTTGTACCACCAAGTCCTAAC
CTAACAGATGCTTTACGTACATCACCAATTGTGCAAGGAGAAGATGGCTA
CACACCGGCTGGTGGTGATTTTGGATCTGGTTTTGATGTAGATCCAAATC
TTGACCCTGAATTAGCATTGGCTTTGAGAGTATCCATGGAAGAGCAAAGG
CTGCGTCAAGACCCAACAAAACCTGAAGGAGAAGGTGCTGCTACCACTAC
ACCGGCTGCTGGTGGAAAAACTGAAGCTACTACTGGAGGAACTGAAGATT
CTCTTTTGATGAACGCCATGTATCCTGGTGGCGCTTTGAGAGTATCCATG
GAAGAGCAAAGGCTGCGTCAAGACCCAACAAAACCTGAAGGAGAAGGTGC
TGCTACCACTACACCGGCTGCTGGTGGAAAAACTGAAGCTACTACTGGAG
GAACTGAAGATTCTCTTTTGATGAACGCCATGTATCCTGGTGGCAACTCT
GTTGATTTCAATGCAATGTCAGAGGAAGATCAAATCGCATTAGCCATACA
GATGTCAATGAATGATGCTAATGCAGATGACGCTAAAAAAGATACACCTA
CCGCCATGGATACTGATAACTCTGTTGATTTCAATGCAATGTCAGAGGAA
GATCAAATCGCATTAGCCATACAGATGTCAATGAATGATGCTAATGCAGA
TGACGCTAAAAAAGATACACCTACCGCCATGGATACTGATACACCAGCAC
CTGCTTCTGATCAACCTATGGATGAATACCAAGACTATAGTGAAGTCATG
AACAACCCTGAACTCTTACAACAAATTGTTGGCAATCTACCTGGTGTCGA
TCCTAACAGTGCTGATATTCAAAATGCATTACAAGCACTTAGCGAAAACC
AAGAAGGCGAAAATAAAGATAAAAAAGAAGAAGATAAATCATGAACACCA
GCACCTGCTTCTGATCAACCTATGGATGAATACCAAGACTATAGTGAAGT
CATGAACAACCCTGAACTCTTACAACAAATTGTTGGCAATCTACCTGGTG
TCGATCCTAACAGTGCTGATATTCAAAATGCATTACAAGCACTTAGCGAA
AACCAAGAAGGCGAAAATAAAGATAAAAAAGAAGAAGATAAATCATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000043_pilon | genome | sc0000043_pilon:1673067..1680336 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 946-1149:205 |
| Aaloc | 823-945:1569 |
| Aaloc | 661-822:2125 |
| Aaloc | 508-660:2537 |
| Aaloc | 445-504:2839 |
| Aaloc | 376-444:3111 |
| Aaloc | 289-375:3910 |
| Aaloc | 178-288:6754 |
| Aaloc | 1-174:7271 |
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