|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000010_pilon:2046447..2052465+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_034049 ID=XLOC_034049|Name=XLOC_034049|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6019bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000010_pilon:2046447..2052465+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCTCGTAAAAGAACGCCAGTAAGGTCAACAGGACCTGTCAAAGGTAT
GTCTGGCTCTGCCACTAAAAACATTAAACCTGCTTGGTCAAAAATGCTTG
AACCGCAAGATACAAATGATTTAAAATTCAACAACAAATCAAGTTTTGCT
GCATACAATGATTATTCTGATGATTCTGATGAAGATGAAGGAGATGGACT
ATATCATAAAGGATTTACACAAAACATTGGAGATGATCGTAATAAACAAG
GATTCTCTTTACGTGATACTATGAGCAATTTGAATGTCAGTAGCAGATCT
AAACAATcagtaaatgatttttttgataatacACAACAGCAAATGCTTCA
AAAACCAACATCAAAATACACTAGGAATCCACAACATGTTTCGAATAGTC
AACAGCATCAACGTCCACATAAAAAGAGACATCAAAACATAGGACCTTTT
GAGCCAAACATTCCGCCAGACCTTGAAAAACATATCATTTCTGGTGAATA
TattgattttgctgaaattgtAATGTTGCTTGGATATCAAAAGACAGTAG
AAGATGCTTTTGCATTAATGGCAAAGGACATTCTAGTATGGTTAGATTGT
TTTATGTACTATACTTCAATTGTTGGGAGTGTGGCTCCAGGGAGAATAGC
AGGACTTATGAGATATTCTCGTATAATTATGTGGATTTATAAAGAATCTC
AAGACGTGACATCATGGTGGCGCTATGATAAAGCTTATAGAAGACTAGCT
GCCTTAAAACGTAAGTAATATATATTAAAGGACTTCAAGGATGGCTAAGC
AAAGAATGGGCCAATAGGCTTGACGTCAACAGCTTAGAAAAGCTGTAGAT
AAAGAACAATAAACTTGATAAACATGATTCATTATCAGGATAGAGCTATT
ACAGTGCTtcaatcactgacctttatatatccctggaccaagctgtATCC
AACATCTttaatcgaagttttttttaaattggtaccAGTAAAGAAGCTAT
TGCAGTGTTCAGAATTAACGTCTaccggcgctacatcatcaaaagttttc
gagggaaagtagatctagcgctctctatGCATTTACactgctattgagta
gtgccactattagggtaccacttttcaaaaaactctgatcaaagaatttt
ttggccgggattgagaaacttgctCCAAAGTATATAAAGGTTAGTGGCCT
CAATGAAGATTGACGCTGACTTGTGCTACAATGGACTGTGCTCAAACTCC
AGGAACACTTCCAGGCAAAGTGTTAGGGATGCATGGTGTAGATTTCTTAC
CTCGATGATGTATTGAAATTCTGTTGTTTTTGTTCTCAAAATAACCTTAT
ACATTTTAGATTTACAAAATTGGAGTGAAATAGATGAGGAATTATTTGGA
GGTGCTACTTCAGAAGTGTTTCGGCAGAGTTTACACTGTGATGAGTGTTT
AACTCAAGACCatgtgaaaaataaatgtccattcaaaaaatcaaatcagg
ATAATGGAAGAGCACGTGGTCCACTGTCACATGGTATGGACAATTCTTTT
AGGCTGTTTCTGTTGCCCGCTAGAAAACCTTGTTTCAACTTTAATATTGT
TATGTGAGCTTCtagagttgaaaataatcagaggcagtttaattgtattt
ttatttttgaaaattgagtaaatttcataaaaaatgggTACTACCACTAA
GTATCCTATCAAGTTTTCTATGTCATTGGATGtgtaaagtttatttttgt
tttacaaTGATTGGAATCTGATCATAATTAAAATTACTGACCTTTTTACC
TTGACTGTGGTTGCAACTTACTATCAGTCGCAGCactaccataagttggt
ctaatgtgaAAATGCCCCATCTAATTCCCTATcctttctttagagatagg
aataaaaggaaggtcggaatcactgattgacaCTATATTTCTTTGAGAGG
ggaaatgtctttttttaataagcggTTCCGACCTTACGGTATTTAATTGA
TACTTTTCATCTCTTTTTGTGTATTCTCCAGGTGCTAAACCAGAGGGAGC
TGTTTCACCTCGAAGAATGGATGTTGTTGAACAAGCGCTTgcaaatcctg
agaaaagtGCCCGTAGACCTGCTGAAGGGCTTCAACTAAAATTTGCATTT
GGGTAATTTAATGATTTATAATGCTAACAgaaaggaacaaacaataacAA
ATTGATGGATATTAAATTACATGATATCTGTACACTGTGAAGGTAGTCTC
ACAGTATACAgtgtcacaggaaaaaatcattaaatcacACTCGTATGAAT
ACTGATTTCCTAAGGTGGGATTCGGTTCGTTTTTCACACCGGTGTGAAAT
CGTAAATAGCATCCTTAGTGTTTACACCATGATGGATTGAGTATCAGATT
AAAACACCTCAATTTAAAACAAGTCAGACTGGGATTGCAGATTGAGAGTT
TAGTTTGATAATGGATTCAATCCACCATGGTGTAAACACGCAGGGTCTTA
ACTTACCTTTCCACACCTGTGTGAAAAACGAACCCGGTCACACACTGGGA
AATCAGTTTTCACACGAGTTTAATTCAACgattttttctgtgtttgttcG
AAAAAATGCTGAGCAGAATTTATATGAAAAGAAATCCTCATAATCTATAT
GACCTAATAAATATgaactaaattttaaaatgctgatttgcaaaaaataa
atctaGTAAAATTTGCGATATTTTTGGCTCGCAAGAATTGatctaataga
ccttatcgaagatttttattttttctaaaacagcggtGCATTGTGGGGTT
GTTTCgagggtattacaatagaattccctcgaggaattcctaatgagatt
tgtactagtaataacatggtttggagggtgatttgggaatAATAGTCCCG
AGGTtcattaaaaacatttcaaaatagcctgaACGTAGTGAGAATGAAAC
AAGGGGCTATtatattgtaatacccccgaaacaatcccacaatgcatcga
ttttttagaaaaatcaaaaacttcgaTAAGATCTGATTaaagaagatgac
accaaaagctcaaacaatcgaagaaagcaagaaactaaaaaagaaacaaa
tgcttttttctttcagatatCATGGATACAATGCATGCAACAATGTTTTC
TATACACAATCCAATGAAATTGTTTTCCACACAGCTGCTATTGGAATCGT
ATACAACCAAGAAACGCACGAGCAACGGTTTTACTTGGGGCATGATGATG
ATATCTTATGTTTGACTGTACATGATGAGGAGGATTTTATTGCTACAGGC
CAGGtacaatgttttttataagaacaaaactaTATAGGAATATGAGGTTT
TGATGGTcagaatattaagaacaagttgatgaaaacatttttaagcaCTT
TGCTGACTCTAGAACATCCaatttctcaggaaaatggacaaaaatattca
caaaatggtgaaaacaagattatgttgagaatatttttagcCTTAAAGCT
CAAGAAGAACATCCGGAGGCTTCAGAAATCTTAGATGTTTTTATGAAAAC
GTGTATGAGTCAAAGAGTTTATAGACCGGATACTCTAGCTTGATGAAAAT
TTTCGTCTTACTGCCCTTGGCAAAATCTCTACATTTTAATAAAGGCTTGT
TTTTAAAGTCAGGGTATTcttttagttcttgagataaGAATTGTACTAAA
AAATGAATGATAAAATTCCCCCAAGGCTTGTAGATGTAGAGATAGTGTAT
TGCAGTGATACTCAGATCACTATAATATGTTAGCTTCAAAATGTTAGTTT
GTATAAAAATCTTACTcggccggcacacaacgttgtttcaacgttcattt
gacagttgtattgaagtttttacaagatgctcacataattggttattcaa
aacaatagagatgacgcgttctttagaaaaatacagtaaaagtttttgtt
tgaatagttaacgaccaatccaatgacaaaaattcttgtaaatgttCAAT
CATttgacgttatatggacgttgtgaacattagataaacattCAAGTCCA
CGGAGGGGATAATTATAGTTCGTACCTACTTTCATAAGGGGAGGGGGTGA
CATCCTCCATAATATcgaagaaaaaaagtgttgggATAAGAAGAAGCTGG
GAGTTTAAGAAGAGGATCCATTTGGCAGCTTTTTTAAGatcaaaatcaaa
agttgaaattgCATTTACTAATTCTTTTCTCTGATTCTCTTTGAGAACTT
TCTTTGAGTAAAGTTTCATCTTATGCCtttatcatcattttcaaaCGATT
CTAAGTCGACATTTGTAAATTTCTTTCTAGATTGGGAGAAATCCTTGTAC
ACAAGTATGGGATATTGTTTCATTGAAATGTGTGGCAGTTTTAAAAGGTT
TCCACAAACGGGGTATCATCTGTGTCGATTTCTCAGGTAAAAATCCTTTT
TATTCTTAACTAAAGGGGTGAGCTAGAATAGGGTCTGAGTCTGTTGGTTT
ACAAGTTATTAGATAAGTATATCAAGTCAATAGagcctaaaaaaaaattt
aaaaaaagataatatcTGGGAAGTCTTAGGAACCAAAAAATTGTTAGCTA
TTCTGCGAACTTGCATACACCGGAAAAATATACCAACCTAATTTCCCATG
CTGGAAGTGTATTACCAATGTGTTAGGGATAACGGATTTCCACACGTgga
aaactaatatttttaacttCCCTCGCAGTGACTAGACATGCTATCTTTTA
AGAAACTTTCATTAGACCATGAGGCGAAAGCCTAGCACTATATTCCTAAA
ATTGGAAAGTTTatggaaaaattaacaaaataactttaaattttattttc
ataggaGATGGAGATAAATTAGCAGATGTGGGATTGGACGATGATCATTG
TATTTGCATATGGAATTggagaaaagaagaaaagttagCTAGTACAAGGT
TCGTTTACTTAGGTTAAAAGTCATTGAAGAAGTTTGAAAACTAGTCTATG
TTATGGACATATCCAGGCCATATACTTTTACGTTCGGAGTAAATAAGATA
CGACGTTACTTATCTGACAGACTTTTTGAATGAACAAGAAATAATACAAC
AATCAAAGCTGGTAACAACATTGTTCCAACGTTCTGCTAACGTTCATGTT
GGTATTATAGATATTAGAATGACGCTGTTTTACCGTATTCTATAGTTGAG
TTGCTTTAGTCAAACAATTGAAGCTATTTCTGTTAATGGTCGATAAATTG
TCCTTGAAGACTCCTATCAAGAGATTTTAACATAATGTGAATCTGAAGAA
ATAAAATAAGCTAGAGGAAGGGTTCTAATTTTCTTTCTGGTGCTTTTTAC
GAAACCAATTCATTCTCTCACCCTCAGAGGTCATAAAGATGTCATCTACA
ATTTGGAATGGAACCCATATGATGTCAACAAGCTGGTTTCAGTTGGAGTG
AAACATATCAAATTCTGGACATTGAATGGTAAACATTTTCTTACTCGATA
TTCAGGGAGGtttttttACAAGTGGTTTATCTGGACAGTTGGAACTCATC
GACTGTGACAGTTTATTTAACATTTAAGAGAAGTCGAGGTCAAGGAAGTT
AGTCAACATCGGTCGATTTGGCCGTAGCCGGAATGCCCCAGGAGTCATTT
TATCATgtgtagattttcatttttatgtgtTGATTCCTGAAAGTTTGTGT
CGTCAATCCTGCGATTTTTCGGCCTTGCGAAATTGTGTACGCCTGAAGTA
CTTTTTGTATGATAGCAAAGATTATTTCTTCAATCATCACCATCCCCCTG
TCACACATATCTTATGCGGGGGGCTACTGAAATGTATGTAAACAAGCAGG
TTGTAGTGTGATCTCGGTCTTTCCTTCCTTTTCAGGCAATAAAATCGAGA
AACGTACAACAACTTTTGGTAAAGCAGGCGAGTTAACAGACATGCTTTGC
ATCTGTCACTCACCTCTTGAAGATGTCGTGTACACAGGAGCTGCGTCAGG
AGAAATTTATGTCTGGCAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000010_pilon:2046447..2052465+ >XLOC_034049 ID=XLOC_034049|Name=XLOC_034049|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3354bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000010_pilon:2046447..2052465+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCTCGTAAAAGAACGCCAGTAAGGTCAACAGGACCTGTCAAAGGTAT
GTCTGGCTCTGCCACTAAAAACATTAAACCTGCTTGGTCAAAAATGCTTG
AACCGCAAGATACAAATGATTTAAAATTCAACAACAAATCAAGTTTTGCT
GCATACAATGATTATTCTGATGATTCTGATGAAGATGAAGGAGATGGACT
ATATCATAAAGGATTTACACAAAACATTGGAGATGATCGTAATAAACAAG
GATTCTCTTTACGTGATACTATGAGCAATTTGAATGTCAGTAGCAGATCT
AAACAATcagtaaatgatttttttgataatacACAACAGCAAATGCTTCA
AAAACCAACATCAAAATACACTAGGAATCCACAACATGTTTCGAATAGTC
AACAGCATCAACGTCCACATAAAAAGAGACATCAAAACATAGGACCTTTT
GAGCCAAACATTCCGCCAGACCTTGAAAAACATATCATTTCTGGTGAATA
TattgattttgctgaaattgtAATGTTGCTTGGATATCAAAAGACAGTAG
AAGATGCTTTTGCATTAATGGCAAAGGACATTCTAGTATGGTTAGATTGT
TTTATGTACTATACTTCAATTGTTGGGAGTGTGGCTCCAGGGAGAATAGC
AGGACTTATGAGATATTCTCGTATAATTATGTGGATTTATAAAGAATCTC
AAGACGTGACATCATGGTGGCGCTATGATAAAGCTTATAGAAGACTAGCT
GCCTTAAAACATGTCTCGTAAAAGAACGCCAGTAAGGTCAACAGGACCTG
TCAAAGGTATGTCTGGCTCTGCCACTAAAAACATTAAACCTGCTTGGTCA
AAAATGCTTGAACCGCAAGATACAAATGATTTAAAATTCAACAACAAATC
AAGTTTTGCTGCATACAATGATTATTCTGATGATTCTGATGAAGATGAAG
GAGATGGACTATATCATAAAGGATTTACACAAAACATTGGAGATGATCGT
AATAAACAAGGATTCTCTTTACGTGATACTATGAGCAATTTGAATGTCAG
TAGCAGATCTAAACAATcagtaaatgatttttttgataatacACAACAGC
AAATGCTTCAAAAACCAACATCAAAATACACTAGGAATCCACAACATGTT
TCGAATAGTCAACAGCATCAACGTCCACATAAAAAGAGACATCAAAACAT
AGGACCTTTTGAGCCAAACATTCCGCCAGACCTTGAAAAACATATCATTT
CTGGTGAATATattgattttgctgaaattgtAATGTTGCTTGGATATCAA
AAGACAGTAGAAGATGCTTTTGCATTAATGGCAAAGGACATTCTAGTATG
GTTAGATTGTTTTATGTACTATACTTCAATTGTTGGGAGTGTGGCTCCAG
GGAGAATAGCAGGACTTATGAGATATTCTCGTATAATTATGTGGATTTAT
AAAGAATCTCAAGACGTGACATCATGGTGGCGCTATGATAAAGCTTATAG
AAGACTAGCTGCCTTAAAACATTTACAAAATTGGAGTGAAATAGATGAGG
AATTATTTGGAGGTGCTACTTCAGAAGTGTTTCGGCAGAGTTTACACTGT
GATGAGTGTTTAACTCAAGACCatgtgaaaaataaatgtccattcaaaaa
atcaaatcaggATAATGGAAGAGCACGTGGTCCACTGTCACATGATTTAC
AAAATTGGAGTGAAATAGATGAGGAATTATTTGGAGGTGCTACTTCAGAA
GTGTTTCGGCAGAGTTTACACTGTGATGAGTGTTTAACTCAAGACCatgt
gaaaaataaatgtccattcaaaaaatcaaatcaggATAATGGAAGAGCAC
GTGGTCCACTGTCACATGGTGCTAAACCAGAGGGAGCTGTTTCACCTCGA
AGAATGGATGTTGTTGAACAAGCGCTTgcaaatcctgagaaaagtGCCCG
TAGACCTGCTGAAGGGCTTCAACTAAAATTTGCATTTGGGTGCTAAACCA
GAGGGAGCTGTTTCACCTCGAAGAATGGATGTTGTTGAACAAGCGCTTgc
aaatcctgagaaaagtGCCCGTAGACCTGCTGAAGGGCTTCAACTAAAAT
TTGCATTTGGatatCATGGATACAATGCATGCAACAATGTTTTCTATACA
CAATCCAATGAAATTGTTTTCCACACAGCTGCTATTGGAATCGTATACAA
CCAAGAAACGCACGAGCAACGGTTTTACTTGGGGCATGATGATGATATCT
TATGTTTGACTGTACATGATGAGGAGGATTTTATTGCTACAGGCCAGata
tCATGGATACAATGCATGCAACAATGTTTTCTATACACAATCCAATGAAA
TTGTTTTCCACACAGCTGCTATTGGAATCGTATACAACCAAGAAACGCAC
GAGCAACGGTTTTACTTGGGGCATGATGATGATATCTTATGTTTGACTGT
ACATGATGAGGAGGATTTTATTGCTACAGGCCAGATTGGGAGAAATCCTT
GTACACAAGTATGGGATATTGTTTCATTGAAATGTGTGGCAGTTTTAAAA
GGTTTCCACAAACGGGGTATCATCTGTGTCGATTTCTCAGATTGGGAGAA
ATCCTTGTACACAAGTATGGGATATTGTTTCATTGAAATGTGTGGCAGTT
TTAAAAGGTTTCCACAAACGGGGTATCATCTGTGTCGATTTCTCAGgaGA
TGGAGATAAATTAGCAGATGTGGGATTGGACGATGATCATTGTATTTGCA
TATGGAATTggagaaaagaagaaaagttagCTAGTACAAGgaGATGGAGA
TAAATTAGCAGATGTGGGATTGGACGATGATCATTGTATTTGCATATGGA
ATTggagaaaagaagaaaagttagCTAGTACAAGAGGTCATAAAGATGTC
ATCTACAATTTGGAATGGAACCCATATGATGTCAACAAGCTGGTTTCAGT
TGGAGTGAAACATATCAAATTCTGGACATTGAATGAGGTCATAAAGATGT
CATCTACAATTTGGAATGGAACCCATATGATGTCAACAAGCTGGTTTCAG
TTGGAGTGAAACATATCAAATTCTGGACATTGAATGGCAATAAAATCGAG
AAACGTACAACAACTTTTGGTAAAGCAGGCGAGTTAACAGACATGCTTTG
CATCTGTCACTCACCTCTTGAAGATGTCGTGTACACAGGAGCTGCGTCAG
GAGAAATTTATGTCTGGCAAGCAATAAAATCGAGAAACGTACAACAACTT
TTGGTAAAGCAGGCGAGTTAACAGACATGCTTTGCATCTGTCACTCACCT
CTTGAAGATGTCGTGTACACAGGAGCTGCGTCAGGAGAAATTTATGTCTG
GCAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000010_pilon | genome | sc0000010_pilon:2046447..2052465 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1546-1677:5888 |
| Aaloc | 1444-1542:5379 |
| Aaloc | 1351-1440:4857 |
| Aaloc | 1243-1347:4331 |
| Aaloc | 1057-1242:3118 |
| Aaloc | 937-1053:2034 |
| Aaloc | 763-933:1362 |
| Aaloc | 1-759:1 |
|
