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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000285_pilon:397011..404564+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_037307 ID=XLOC_037307|Name=XLOC_037307|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7554bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000285_pilon:397011..404564+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) aTGAAGTATATTGTTTTGCTTGTCTTCGTTCTGATTGGCCAATCACAGGC
CAGCTCGTCAATTTCGTTACCAGAAACGAAAACATGGCGTCAATGTTTAG
AAGAATTGAAATTGCAAGAAAGCATCAAAAGTTACGGTAtcgaacatttt
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TTATCACAGACGTTTCTTGAAAacatgacgtcttccgcctcgaaaaaaga
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ggagaaaaattaccgttttaacaaatatttcctatatagataggaaatat
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TTATATTTacttttgatgacgctgagtccagtgaagtagactaggagcat
ttgacttattttcaaatgaaaacattcTTCATTCTTTTATTACCTGGcaa
aacaacgaaaatctggCGGGAtattttacagtccgcctaagcaaaaacAT
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ATGGAGAGAAtaatcaagggtaagtggagcgaCTAAGGACATTTACCTTT
CGAAAGATAGCTATAGAAAAAGGAGCCTTTGTCTACCTCTGATTGCGATC
CCAGACTTATTTACTTAATACCGTAGTGCGTTATgtatttaaaatgattt
tttcctttCAGACCTTCCTTCGCGACCATATTATTCGTCACCCAATGTGT
CGTGGACGACTTTACCATAAAAGCGGTTGGTCACGTGTTTATAATGATAA
TGGTCAAACGTTGGAACTTTACCgagataaaaaatcaaaagattattCGT
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GTGTATGCTGTTAGTGAGGTTTTACTACCTAATATCGGTAAGAATAATTG
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tttgatttgattttgggaGTAGGCTTTGTAACATATTTAAACTTTTAACT
TGGCTCAACTTTATAACTTTTATGGTAATCTCATAAAAACATGCATTCTG
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GAATTTCAGCCCTAAAGGAGCTGGAAGACAGACTTTGTAACCAATTTAAA
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GAAGGCGAGAAGATTTAAGCGACACAGTGATTATCTTTTTATACCACGAA
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ACCTCTGTCTAACTGAAAAATGGCACTCAGGGTATCCACActagtagcgt
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ACAGTAATTATGTTTTATGCCACGAATAGGTAAGTGCTTTTtcgtaaaaa
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GGTTTACTTTTACGGCTATCATATGCCACCCGTTCTTTAAATTTGCTTTC
TTATTTTCATAGATTCTAAACTAATGGACATACTTAAAGATCTCAAAGCA
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CAGTCTGGTAGAAGTTTATACTGTTTTCGCCCCTAACAACAAAGCGTTTG
ATGACCTTGACAACGCTACCAAAACGAGACTAAAAGAAGATCCCGGATAC
CTGAAATTACTTGTTGAATATCATTTGGTCAGAGGACGATATTCTACTGA
GACAATGACCAAAAGGTTATTTTACAGAACTGTGGCAAAAAACGGAACGA
TTAACTATCGCCTTTTTGCAAGTAGAGCTATGGTAAGCAACAAATATTCA
GTTACAAGTCAGGAATTTTTAACCTCTCCTAAGCAAAAAAGGCGAAGCCT
TAAACGTATTGCACTGCTTTCTCTGAATGATGGATTAAATCTAGCATCTT
TCTTTGCTTTTGTATTACATTTTCAAATCTTCTTGCGGTAAATATTACTT
CCAATCAAGCGTCTGTATAAAATCTACACACGGGCTGGAACTTATGTAGG
GGATAACATTCCTCGACTGTTGTCTTTGAAGAAATCATCGATATGCCGGG
GGTTTGTCGTCTATTTTATATtcgattcatgatattcatgacgtaatatt
ttttccggaaagaccccggtttttaccagtagtggcaaattttatacaac
ttttgtctagtttaaatttaccaccactggctaaaaccggggtatttccg
tagaaaacattacgtcatgaatatcatgaattgcatTCTCATGATTAATT
AGAATGTTCTCATTTTACTAGGGAAGCATTCAAAAATCACGGATAATTAA
TAACAATCAAATGGCTTTAAACGGCATTTGTCACCTCATCAACAAAGTTC
TCATACCCCCTGAAATAACAacctatgacgtcatcaatgataTTCGAAGT
TTGAGACTGATATCAAAGATGTATGACAAATTCAGTGAAGAGTTTAGACA
AGTTttggaaaatgaagataaagCCTATACATTGTTCTTACCGACAAATC
AAGCTGTGAAAGCCTTTTTCTACCAACAGAACCCGGTCAATGAAACCGAT
GCTATTCAAAAGTTGGAAATTCTAATCCGGAATCAACATTATGTCACTCA
ACCTTTGATTATATTAGAAGACGACAATCAGCCAGCTATTCCAATAAAAT
CgggtaatttcccgattttagGGTCCAGTTCCGATCGGGAAACACGGATT
TTGACATTGAGGAAACGAGAAAAACTAGAGGGATACTTGACACCGTATTT
CATTGAGGAATTCAAGTCCTCATTGGTTCAATTAAATCACGTGACCAGAA
ATGGAGTAATCCAATTGGTTGATTCAGTGTTCGatgggaaatcgaaagta
caAGTTACAAAAGAGATGTGGAAATCTTTACAAaaacgttggaaagataa
ttga Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000285_pilon:397011..404564+ >XLOC_037307 ID=XLOC_037307|Name=XLOC_037307|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3756bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000285_pilon:397011..404564+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) aTGAAGTATATTGTTTTGCTTGTCTTCGTTCTGATTGGCCAATCACAGGC CAGCTCGTCAATTTCGTTACCAGAAACGAAAACATGGCGTCAATGTTTAG AAGAATTGAAATTGCAAGAAAGCATCAAAAGTTACGGTAtcgaacatttt tcaaagatggCAATGGATATACATTTCTTCAGATTATTGTATTCAAAAGc taattacacattttttataccaaCGGACAAAGaTGAAGTATATTGTTTTG CTTGTCTTCGTTCTGATTGGCCAATCACAGGCCAGCTCGTCAATTTCGTT ACCAGAAACGAAAACATGGCGTCAATGTTTAGAAGAATTGAAATTGCAAG AAAGCATCAAAAGTTACGGTAtcgaacatttttcaaagatggCAATGGAT ATACATTTCTTCAGATTATTGTATTCAAAAGctaattacacattttttat accaaCGGACAAAGgttttaacaTGAGCGAAACATATCTCACCAATCAAA CATATTTCAAAAAGCGTCGATTCATGCAATACCATATTTATCCTGGAATT CACACCGCGCGTTCAGTCCGCGATGGTCGCGCGATCGTATCATTTGACGG AGATAAAGCGTATGGAAACAGGTTATATGATCGGTACACAAAGAAAATTC GATTTTGGATTCAAGGATCAGAGGTTTTACAGCACAACTTGAAATTAGgt tttaacaTGAGCGAAACATATCTCACCAATCAAACATATTTCAAAAAGCG TCGATTCATGCAATACCATATTTATCCTGGAATTCACACCGCGCGTTCAG TCCGCGATGGTCGCGCGATCGTATCATTTGACGGAGATAAAGCGTATGGA AACAGGTTATATGATCGGTACACAAAGAAAATTCGATTTTGGATTCAAGG ATCAGAGGTTTTACAGCACAACTTGAAATTAGGCAACAGTATAGTGCATA TCATCAATCATGCCCTTACTCCGCCCACAAGTGATTTGTTTCAATACCTC GAATCAACACGTGGACATTCAATTTTCCTGGATATTTTGGACAGATACCA AGTCTATTTCCAGTTCCCTTTTGGAGGAACAATCTTTGCTCCATACGATG ATGCTTTTGCTAACATACCAACGACTTATaaagataaaattttcaaaaat ggtctcaACACAAGAGCAACAGTATAGTGCATATCATCAATCATGCCCTT ACTCCGCCCACAAGTGATTTGTTTCAATACCTCGAATCAACACGTGGACA TTCAATTTTCCTGGATATTTTGGACAGATACCAAGTCTATTTCCAGTTCC CTTTTGGAGGAACAATCTTTGCTCCATACGATGATGCTTTTGCTAACATA CCAACGACTTATaaagataaaattttcaaaaatggtctcaACACAAGAAC CTTCCTTCGCGACCATATTATTCGTCACCCAATGTGTCGTGGACGACTTT ACCATAAAAGCGGTTGGTCACGTGTTTATAATGATAATGGTCAAACGTTG GAACTTTACCgagataaaaaatcaaaagattattCGTTTGTTGAGAGCGC GGGTGTTATGTCTGTGAAGCAAGTTAGAGAAGGATGGGTGTATGCTGTTA GTGAGGTTTTACTACCTAATATCGACCTTCCTTCGCGACCATATTATTCG TCACCCAATGTGTCGTGGACGACTTTACCATAAAAGCGGTTGGTCACGTG TTTATAATGATAATGGTCAAACGTTGGAACTTTACCgagataaaaaatca aaagattattCGTTTGTTGAGAGCGCGGGTGTTATGTCTGTGAAGCAAGT TAGAGAAGGATGGGTGTATGCTGTTAGTGAGGTTTTACTACCTAATATCG ATTCTAAACTAATGGACATACTTAAAGATCTCAAAGCAACCAAATTTATT CAATATGTTCAAACGGCCGGATATCTACCATTATTGAACAGTCTGGTAGA AGTTTATACTGTTTTCGCCCCTAACAACAAAGCGTTTGATGACCTTGACA ACGCTACCAAAACGAGACTAAAAGAAGATCCCGGATACCTGAAATTACTT GTTGAATATCATTTGGTCAGAGGACGATATTCTACTGAGACAATGACCAA AAGGTTATTTTACAGAACTGTGGCAAAAAACGGAACGATTAACTATCGCC TTTTTGCAAGTAGAGCTATGATTCTAAACTAATGGACATACTTAAAGATC TCAAAGCAACCAAATTTATTCAATATGTTCAAACGGCCGGATATCTACCA TTATTGAACAGTCTGGTAGAAGTTTATACTGTTTTCGCCCCTAACAACAA AGCGTTTGATGACCTTGACAACGCTACCAAAACGAGACTAAAAGAAGATC CCGGATACCTGAAATTACTTGTTGAATATCATTTGGTCAGAGGACGATAT TCTACTGAGACAATGACCAAAAGGTTATTTTACAGAACTGTGGCAAAAAA CGGAACGATTAACTATCGCCTTTTTGCAAGTAGAGCTATGGGAAGCATTC AAAAATCACGGATAATTAATAACAATCAAATGGCTTTAAACGGCATTTGT CACCTCATCAACAAAGTTCTCATACCCCCTGAAATAACAacctatgacgt catcaatgataTTCGAAGTTTGAGACTGATATCAAAGATGTATGACAAAT TCAGTGAAGAGTTTAGACAAGTTttggaaaatgaagataaagCCTATACA TTGTTCTTACCGACAAATCAAGCTGTGAAAGCCTTTTTCTACCAACAGAA CCCGGTCAATGAAACCGATGCTATTCAAAAGTTGGAAATTCTAATCCGGA ATCAACATTATGTCACTCAACCTTTGATTATATTAGAAGACGACAATCAG CCAGCTATTCCAATAAAATCgggtaatttcccgattttagGGTCCAGTTC CGATCGGGAAACACGGATTTTGACATTGAGGAAACGAGAAAAACTAGAGG GATACTTGACACCGTATTTCATTGAGGAATTCAAGTCCTCATTGGTTCAA TTAAATCACGTGACCAGAAATGGAGTAATCCAATTGGTTGATTCAGTGTT CGatgggaaatcgaaagtacaAGTTACAAAAGAGATGTGGAAATCTTTAC AAaaacgttggaaagataattgaGGAAGCATTCAAAAATCACGGATAATT AATAACAATCAAATGGCTTTAAACGGCATTTGTCACCTCATCAACAAAGT TCTCATACCCCCTGAAATAACAacctatgacgtcatcaatgataTTCGAA GTTTGAGACTGATATCAAAGATGTATGACAAATTCAGTGAAGAGTTTAGA CAAGTTttggaaaatgaagataaagCCTATACATTGTTCTTACCGACAAA TCAAGCTGTGAAAGCCTTTTTCTACCAACAGAACCCGGTCAATGAAACCG ATGCTATTCAAAAGTTGGAAATTCTAATCCGGAATCAACATTATGTCACT CAACCTTTGATTATATTAGAAGACGACAATCAGCCAGCTATTCCAATAAA ATCgggtaatttcccgattttagGGTCCAGTTCCGATCGGGAAACACGGA TTTTGACATTGAGGAAACGAGAAAAACTAGAGGGATACTTGACACCGTAT TTCATTGAGGAATTCAAGTCCTCATTGGTTCAATTAAATCACGTGACCAG AAATGGAGTAATCCAATTGGTTGATTCAGTGTTCGatgggaaatcgaaag tacaAGTTACAAAAGAGATGTGGAAATCTTTACAAaaacgttggaaagat aattga
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000285_pilon | genome | sc0000285_pilon:397011..404564 + |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 1246-1878:6922 |
| Aaloc | 928-1245:6115 |
| Aaloc | 700-924:5112 |
| Aaloc | 469-699:1167 |
| Aaloc | 235-465:526 |
| Aaloc | 1-231:1 |
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