|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000014_pilon:399477..408653- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_039498 ID=XLOC_039498|Name=XLOC_039498|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9177bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000014_pilon:399477..408653- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGTGGATGCAGATGGTGCTACCAAATTCTCTGATCTTCAACATGTAGA
CAAAGCCTTAGATGAGTTGAAAGGAGGTAAAAATGGGATGGCATTGTGTG
TTGGATCGAGAGCACATCTTCAGGATGATGCAGTTGCACAGGTACTACCA
GTGGTTTGTTAAATTAATTTTGAATGAGTCATTTCATGCACCAAATTATC
CCGCTTCAGGCACGACGGAAGCTTTTTGGACCTACCCCGGTAAGGGTCCC
ATAAAATTAACCTCTATCTGTTCGACCGTCCGTCCGTTCGTTACCAACTT
TTCTCGAGATTGGTTAATTAGTTTTTTCTGATTTTTTGCACAACAATGTG
TAATTATAAACCCTCGAATGTGACGGAGCCCGATTTTCAAAAAAAAAATT
TTGGCCCAAAAAACGGCTAAAAAACGGGTTTTTTGGACTTTGTGAAAAAT
TGAATCATTAATTTTTTCTGATTTTTTGCATGAAAGTAGGGTAACATCAC
AGGTAAAAGATGGCTCAAGCATATTTTTGCAAAAAACATTTGTTGGCTCA
CAAAACGCATGTTTATCTATAAGAATCACTATTAATAAGCATATATCAAT
GTTCTTAGTCAACTTACTCAATTTTTTTATGAGATAGATGTTTTTTTTTG
CTTAATTTTGAAGAATATATGTGTGTTGCTTGGCGTGTTTTTATAGAAAA
ACTGGCCAAATTCGATATTTTTTTATAAGCACATTATCAATTACTTAAGT
ATTAGCTTTTCTCGAGATTGGCTCTTTCATTCTTGATGATTTTTTGCATA
AAGATGCATAACTATAAACCCTCGAATGTGACGGAGCCCGATTTTCGAAA
AAAAAAATTTTTTGGGCAAATTTGGGTAAACTTGGGCAAAAAAAACGGCT
AAAAAACGGGTTTTTTGGGCTTTGTGAAAATTGAATCATTAGTTTTTTCT
AATTTTTCGCATGAAAGTAGGTAAAAGATGGCTCAAGCAGATTTTTGTAA
AAAAAGAATTTTTCAGCTCAAAAAACGCATCTTTATCTATAAGAATCACT
ATTAATAAGCATACATCAATGTTCTTAGCCAAATTACTCAATTTTTTGAT
GAGATAGATGTTTTTTTTACTCACGAAGTCTTGAATATGAAAGAATATTT
CAAGAGCATGAAATTTTGGTTTCTAAACGTTTTTTTTATAAGAAACAAAC
GACTAATTTTAATAGATCGTCACTATTTGTGTTCTGAATGATTGTTTAAT
GGTCACGTCACGTAGATATCAATTACTAGGTCACAGTGTGGATGTAAACC
ACACTGAAACAACTGCCTTCCATCACGCATATCACGCTCGCTAAAAAAGC
GCGCGCACATTATTAACGCCTACATGTCATCTCCAGTACATTTTAGATTA
TTCATTGAAAACAAATTACAATATAGTCAATTTTCATGTCTCGATTATTC
AATTCCGAATAAAAGACATTCAGGGAAGAAAAAAGAGAAACACCTGGGTA
ATCTAGTTAAAAAAACCAAAAGTAAATGGTAGACAAAGTAATGAGCCAAG
GCAAAATGAGATTAGCGTACCACTATGAAAGAAACCGCCTCCGGCGGTCG
ATAAATGTGTTAAATGCATAACCAGGTAGGTCCATAAAAGTATTACTTGT
TATATCTGGTACGGCGAATGAGGAAATTTAAGTGATTTTATAGCGATTTT
ACCGACGAAGAGGAAAATTTCGGTTTTTTTTTGTGAAAATCTTGTACGGC
AGTCGCTGTACCTGCCGTACCCGTCGCGTCGTGCCTACGCTTGGTGAATT
ATTTCCAGTCATGTGCAAATCGAAAATTTCTATCATACTAGGAAGTTAAG
TTGGGTCTGTGACAACGATTTCTTCATAAATTTATTCGTGACTTTTTTCT
TTGTTTCAGAGATCCTTCTTCAGGAACATTTTGATGTTTGGGTTTCATTT
CTTAGTTTCATTTCTTTGCGTCAAAGATATAAAAGACACACAGGTAATCA
ATTCATGATATTCATGACGTAATGTTTTCTACGGAAATACCCCGGTTTTA
GCCAGTTGTGATAAATTTAGACTAGACAAAAGTTGTATAAAATTTACCAC
TACTGGCAAAGACCGGGGTCTTTTTCCGTAGATAACATTACATCATGAAC
ATCATGAATTAGCTTCATAATAAATATAACAGGGTTTTTATGGATCCTGA
AAATGTTTGGAGATGAATCTTCAAACCCTTGAAAACTTTGAAACCTAAAA
CTTTTCAAGAGAAAGCTTTGAAAAGGTTGGTTAATTTCATGTATTCGAAT
AAACTAATAATCCACAAACAAGTGGTAAGTAAAACCTTGAATACCATGAA
ATAAGATTTAAGACAAAGTTCATAGACAAAACAGACTGTATACATATTGG
TTTCGATTCAATCCGATATTTGTTTCCATAAAAAGTTTCACTACTTTCAA
TTCACTACGGCAAAGTCAAGAAAAATTTACAAAAAAATACGAATTTAAAT
CGCCTTTCTCAATTTTCCTTTATTTTGTATTAAATTAAAAACAGAAGATA
AGTTTTATCCTTGAAGTAATCTTTTAAACGTGAGGTTTTCTTGGAATTTG
GTTATTTTATTTATCACTACGCTTCATTCAGACTAAGAAAAATCGCTAAA
AAGGGGAAATTTTTGACATATCTTTAGTAGAAGATTAGAAAGACGGGCTT
TTTTTTGTTTAAATCAGATTAAAATACACAATGTGGGTGATTATGTAGAC
CCTGTTTTCATAGAGATTAAAGAAACGTTGTATTTGACCCTGTTTTCTGT
ATATGTCAAAAATATATTTTTGTTCTGTACTTTTTTTGTCCCGTGTTATT
GTCCATATTTGATTGTCAGAAATTTCCCATGAGCTCCTCATTTTAATCAG
TTTCAATTAAAAAAAGAAATTCAAACCTCATCAGAATTTGCTGATATAGC
AAATAAAAAATGGTAGCCAATATGAAATAAAAATCCTATAGAACAGTCAA
CTAAAAGTTGTATTGGTCGATTTTTATGTCTGACATCGAAATCAAACTTA
TAGCTTACTCAATGATAACCGTTAAAATGAAGGCCTTGGGTTTTCCCCTC
AACGGTATTTAAACCTTTTATTTTTCAGGAGGGTAAATAAAGTCTTCCAA
AAAATGACATTCCGTACTTTTTGAGGGGTAAAAGAAATACCTCGTTGTAA
AGGTAATTTTGAGTGGCTTGATGTAATAGAATTGGCACCACGTTGTCACC
GCAAGTAAACTTCAATCCTTTTAATTCTCCTCTTATTATTTAGTGTGGTT
TCAAATTGTTCACACGAAAAGCTGCACTGACATTATTCTCAAGCTTGCAT
GTGGAACGCTGGTAAGTCCAGCTTTCTTCTTTATTCTAACATCTGACCCT
TCCCTAGTCTTGATGAAGATTTTTCTTTGCTCAAAGCTCCAGATCAGGTA
TGGCTTATTCTATTGACATTCATTCCAAAAAGAAAAGAATTCATGTAATG
CTTTGCTAGTTGCTACCTTTGAAAGTAAGTTTTCAATCTATATTCTTAAA
GAGACATCATGATTAGTAGTGTTCGGTGTACAGTATATCAATTATCAAAT
CATCAGATAAAAAAGTTTACTTTGTAATTCTGACGAAACTAGAAATTGAC
ACTCTTACATAGACCTTGCATTGGTTTATGCGGGAGCTCAATTATTTCGC
TACTTAACTTAAACGTTAAAAGTTCTTTCTTCGAAACTGAATTTACACAA
ATTAATGTTCATACCGTTTTTATTTTTTCACTTCTCTATTGCAAGGAAGC
AATTCAAGAAGTTCATTTCATATTTTGAGTTTTGAGAGATGAAAAATTAA
TGTTTTCAAAAATTAACGACTATTGGAGCCAACCAGTTTGGCGCTGTAGT
TGTAGAAAAGAAAAACAAAATTTTAAAAATGAAAATCACTTGTATTAAGT
GCTGATAACACTGGCAACCCACTAACTTTATAAGGAAGAATCATTCCTAA
TAACTTCACAGAAAAAGTGTTTTGATTTACACTTTAGAAGAAGAATTTTG
TTCTGACGTACCCATAAAACAGTCGGAGGCGACCCGAAGGCTTCTCTTTC
GATAGCTATCTATCCGAAGGTATAGAAGAGCGCCACTCTTTCTCCCTGGA
TTACTCCACTTACCCTTGATCCTTCTCTTAATTGTTGAGTATCAGCAGAG
AGGCAGCAAGTACCATTTTCGGAATCTTTGTTATGACCTACAACCTTGCC
CACCGTAGCCGGATGCTCTACCACTGAACTACGGTCGCTTAAAAAAATAT
AAAACCTACCCTAAAAACATAAGCGGAACAAATTCAAAAACCAATCTTGT
CTAAAATAATATTGCGAAAGTAAAAATAACCTTATTTTGTTTTTTGAAAA
GAAAGCTGGTACTACTGTAGAGGATCGAGGAAAATAAAATCAAGAAGGTT
GTTTTTGTTTTTTTCTCAACGCTTGAAAATATTTTTGAAGTGAATGTGGA
CCGACACACCTTGTGGAATACTGGCACATAAACTTTTTATAAAATCAATA
TCAACATAAAAAGAGAGATAAATAGAAATGTTTCTTTCTAGCCTTCTGGT
GTCCAGTAACTTAGCCTGGACCCAATTCTTGAATCTGAATTTGAAGTAAA
AATCAATCGATTTCGATTGGTGCATCCAAAATTGTTACATAAAAATACTT
AAGTTACATAAATATTTTGATAAATTTTACTCTTATGCTCTCGAACCTAT
ACAGCTGTTTTTTTCTTCAAAATTCCTAATTTTAGGTGTGAAGGAGGAAA
AATAAGATACGAATTTTTGGAAACCTTCGTTTTATTTTCCCCCAAAAAAT
TTGTGTCGGCGAAACACGAATTATAAACTTCTGGCGAAATCACAGAAAGG
CGTCATGTATTTTATGCTTGAAAATTTTTTCTTTACAATCAACTAATATT
ACTTGGCTATTCGCAGCCTAACGAGAATCTTCAACCCACTATTGATCCTC
GTGATCGAAGTATAGACATAATTGGGCTATTCCAGAAATACTATGTACCC
CCTATGTTGAGGAGTTGTGACGTCCAGGGTGACCTTGGAAATATAAAATC
CAGGGGTCTGGTTTTTGTTGTGTAAAAATGAGAAGCTCTCAAAAAATGAA
AACAATAATCCAAGTTGGTCCTGAAAAATCGAGAAAAAAAATAAATGGGA
GTCACCTTTCCCAGGCCTCTTTTGACGCTCCTTAAAATTCGACGCTCTTC
TATTAGATATGTTCTATTATTCGATAATATTGAAAGTCACCATCAACAAG
AAACTCTCATAAACGACGCTCTACTATTGGTCCCTTAATTGATGAAAATC
CAATTCCCTTTGAAAATATAATTATGGATCGTCCACTTGCTTATGATTTT
CTATTGATTTGGTAGTTTATAACTTCTTTTATTCTAAAAGGCTTTTACGG
ACCTATTCTGTTTCATAAAAAAGACTAGCAGAGAACGTCAAAGTCTCCTT
ATCATCATCGTTCTGACGTCAGTGACGTTAAATTGACATACGAGCCGCAC
GTCGGGCAACACGAGTTCCGTTCTAAAAGCGGACTATTCGATCTAGAATT
TAAAAATTGATCAGCTGGAATCAGTGAGCTCTCAGCATCAAGCATCAAAC
TGTCATGGCTGTTCGTTTCTTTTGGGTAAACCCCTTTCTTAAGATTGTAA
TCAACCACTGATTTAGAGATTGACGCATACAACTCTTTAATGTTATGCGA
TGAATTGCCTCCACCACCGCTTGAAGAATCTTGTGTGATCCTATAGAAAA
ACAACAGTTTTCTTTTCACCTTTTTGTTCACACGGTTTACTAAATATTGA
GTCGGTTGGAACGAACATGGACCCACTCCAGCTAAGATGATGATAACAGG
CTCGTCACTCAAGTCTGATAAATATTTCTCAAATTCACTTTCATCGTTAC
TGACCCCGTCTGTTACGATCAACATCACATAAAATACATCACTCGAACTT
TCTCGAACCTCTCCAATTTCAACCAAGTTGGATTTATCATAAAGTTTCGA
CATAATCTGTTTAAAGTATGTTGGACCACCTGGTTCTACCATGGGGATAA
TATCTTTATAGCTTAGAATAATGGCGTCTAGATCCGCATTATTTTTATTG
ATTTCAAAACAATAGTCGTCAATTTCACCCTTTGTTAAAATATTGTCGTT
ATTGTTGTTGTTGTTACCCACGAGTTGAAATTCGTTATTACCATCTATCG
CCTTTAGATTATTCAATGTGCTTTCTATGAAGCATTGACTTGATCTGTTA
TTGGGTTGACTTTCCAATACTTTCGAATATAATTTCCCACCGAACCCATA
CAAAGGGATTCGCTTGCAATAATATGATAACCATGTTCCTACTTGCTTCA
GAGCGGTGATGTAATCATTGCTACCATTTTGTTTTTGAAGATGATGTAAC
GAACGCTCATTGGTCAATGGGCAACCGTTGGAGAGAGTGAAATCGATGCC
GATGCTACATTTGATTTGAGTTCCACTGCGAATGTAATCGACCAATGAGA
ATTGTTCATCCACTGACACGTGATACAGTTTCAAATAGCCTGCATTCGAT
TCCTTGTTTTTAGCACGGCCTAACGAACGTTTTGAGCTTGACATTCTACG
CAAGTTGATCTCCTTTACCAGTCCCTTATAGCTTTGCAATTGGTGTAATG
TTGTCACAAGCTGACCTTTAATCTCTGGTTCACCTTTTGCGTTGTGTGCT
AAAATTTGAAAGAGTAAATTTCCATCCCTGTCTCCATTACAAAGCTTCTG
TATGTTAATACTGAATAGTTTCCAACGCGGATAGTTTGCTTTGAAAATGA
CTTCACTCCGATAGACAGGATGGTAGGTATCCTCGAAAATCTCTCGATTA
ATTTGAAGAAATACACTTGCTCGATTAAAGAAATGTTTCTTGGCCAGTTT
ACCAGCACCTAGACTTAAGCGTACTTCTTTTTTGCTTTCAATTGAGTTCC
GAACCGGTATAGCACACATTGACAGTGTCCCAGTCTTCTTACCGCTTTCA
TGTTTAAAATGAAAATCTTTGAAATCTAGGTCACCTCGAAGTAAATTCTC
AACCTCTAAATCATCTGTTGTACCTAGAAGTTTACATTTTTGTAAATCTC
TAGAACTCAAATTATCACCATCATACAAAGACGCCTTTAAACGTCTATTG
TCCGTATTGTTTGTATCGACATAAAAGGTTTCAGTGAACAAGGGTCTGTG
ACAATTCGCTATAGTTTCCGTTCTGCCGTACTCAAACCATTTCCCGTAAC
GGCGGACGTGTAGTACGACAAATGGATCAGTTTTGCTGAACATATCAACA
GATATGATGTCACGGCACTTGATAAATAACTCGACGTACATCTTATCTCT
CTTACTAGCCTCTTTGGCGATGTTTTCAACGCGCGTTTTCGTTGGTGATT
TTGGCAGGTAGATTGTTGGTGACTGTGGAAGACTCGTTGTTGAAGCAATC
ATTAAGTCTGGCATCACTTGTGATCTTTTCTTTTTGAACATTGTTCAAAT
TTATTCTGAAAATTCGATTATATGTTAAAGTCACTCTTCTTCACATTCAA
AACGTATCTCTAGTAAAAACAGGTTTCTACATAAACGAACCAGTTAGTTA
TGAAGGTTCTTCTTTCAAATGTGCGAATTCTTTTTTCAATACTACACAGT
AATGCTCGTTTCTTTTTTTCCAACCGTTTCATTAATTGCTCGTGAACGTC
TGGTACCAAAACTTTCATGTACATTTTGATGAAAGCTCTATTGTAAAGAA
AAGTAAAAGAATAAGTTAATTATGACAGTTTTCTCAAAATTGTTTTCATC
GCGTTACCATAGTAACTACAATTATTATTATGGTACAAGATTTTTCACAA
AATGTAATAATTTCTAATGTCATTATTTGATAATTTGCACCAGGGAATTT
ACATAATAATGTGAATTTTCTTTGTGTTATTCCTCTTTGAAGTTTCGAAA
TCGTTATATTACTTGCAAATTTTCGAGGGCCGCCCCTTTCAAAAGATATA
TGGGATGTTAAAGGCTTTTTCTTGAAAGGGTACTGCTGGACCCAAGGGGC
TTCTTGTGCATAGTTTTACCAAGGCACTAATGGACCTTGTATGTAAACCG
ACCCGATATCTACTAAAATTTAGAAATTTATTGCCGTAAGGGCAATATTA
TACGTGAAATACACACTGCTGTATGGACCTTATAATGCAAACCCTGCAAA
GAATATAGAATTTCAATGCAGAATTTGATATGTTTAATTAGAAAAGTAAG
AAAAATCTAGCTTTTCACCTAGTTTTCCAAGTACCAAGTTTTCTATCTAT
CCGCCTATACTACACCCACTTTTGCATTTTAATGTCATCCTATAAGACTA
GACAGTCATGGTTTCGATAAAAGAGGAGGAATACGCAAGGACTCATTGGG
AGCGTCCATATTCTACATCAAATGTTTCAGTTTATATTGTATATTGTAAA
AGGATCTGGTTAATAGCGGTTGTTTAAAAGGATATTTTTTCAGAAAGGAG
CCACGAATTATGCCAGGCAAAAGTTTTTATGACCAAAAAACTGAAGTTCA
GGCAAAACCCCTCAGCCCCCAAAATATGTAAGGGTTGGCCCCTTACTATA
TAAGGGGAATTTGAAAATGGTCGTCAGAACTTTACATATTCTCCTCTTGT
ATCAATTTTATCAGGGCATTTGATGTCGAACTTCTGTACATAGCGCAAAG
ACTAGGAATACCAATCGAAGAAAAAGCTGTCAATTGGCAAGAAATTGATG
GTAAGAAACCTTTTACGGCATATTTGGTTAGATTTATCAGGTCTTATCCC
TGTTTACTTTATTTTTTTCATATAGAGTTTCATGGAGTTTCGATCGGATG
ATTCTATCCACAAGAAACTACATCATTCGTTTTTTTACTCAGTTTCCCTT
ATGATTTTTCTAATTGGGTATTTAATGCCTCATATGACCAACTAATCCAT
TGTTACCATCATAATCTTTTTTTTCATTCACGATTTTTAGGTTCCAAGAT
GGTACCTATTTTTAGTTGGATTCAAATGGGCAAAGATTTGTTATTGATCC
GAGCACGTTATGTGATAGGGGCATGGGCACTACAGCCATCTGGTCAACCC
AATTTAGTTGATGTTGATGAGGATTAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000014_pilon:399477..408653- >XLOC_039498 ID=XLOC_039498|Name=XLOC_039498|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1032bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000014_pilon:399477..408653- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGTGGATGCAGATGGTGCTACCAAATTCTCTGATCTTCAACATGTAGA CAAAGCCTTAGATGAGTTGAAAGGAGGTAAAAATGGGATGGCATTGTGTG TTGGATCGAGAGCACATCTTCAGGATGATGCAGTTGCACAGATGGTGGAT GCAGATGGTGCTACCAAATTCTCTGATCTTCAACATGTAGACAAAGCCTT AGATGAGTTGAAAGGAGGTAAAAATGGGATGGCATTGTGTGTTGGATCGA GAGCACATCTTCAGGATGATGCAGTTGCACAGAGATCCTTCTTCAGGAAC ATTTTGATGTTTGGGTTTCATTTCTTAGTTTCATTTCTTTGCGTCAAAGA TATAAAAGACACACAGAGATCCTTCTTCAGGAACATTTTGATGTTTGGGT TTCATTTCTTAGTTTCATTTCTTTGCGTCAAAGATATAAAAGACACACAG TGTGGTTTCAAATTGTTCACACGAAAAGCTGCACTGACATTATTCTCAAG CTTGCATGTGGAACGCTGTGTGGTTTCAAATTGTTCACACGAAAAGCTGC ACTGACATTATTCTCAAGCTTGCATGTGGAACGCTGGGCATTTGATGTCG AACTTCTGTACATAGCGCAAAGACTAGGAATACCAATCGAAGAAAAAGCT GTCAATTGGCAAGAAATTGATGGGCATTTGATGTCGAACTTCTGTACATA GCGCAAAGACTAGGAATACCAATCGAAGAAAAAGCTGTCAATTGGCAAGA AATTGATGGTTCCAAGATGGTACCTATTTTTAGTTGGATTCAAATGGGCA AAGATTTGTTATTGATCCGAGCACGTTATGTGATAGGGGCATGGGCACTA CAGCCATCTGGTCAACCCAATTTAGTTGATGTTGATGAGGATTAGGTTCC AAGATGGTACCTATTTTTAGTTGGATTCAAATGGGCAAAGATTTGTTATT GATCCGAGCACGTTATGTGATAGGGGCATGGGCACTACAGCCATCTGGTC AACCCAATTTAGTTGATGTTGATGAGGATTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000014_pilon | genome | sc0000014_pilon:399477..408653 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 382-516:136 |
| Aaloc | 295-378:463 |
| Aaloc | 226-291:5885 |
| Aaloc | 142-225:7269 |
| Aaloc | 1-141:9178 |
|