|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000270_pilon:61533..68574+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_035469 ID=XLOC_035469|Name=XLOC_035469|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7042bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000270_pilon:61533..68574+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAAGAATCAATCACCCAAGGACTGAAAAGCCTTCAGTAAGTATAATC
AAGCTTATTTTTCTAGAACAGTTATTATCTTTTTTACCGATCATTTCTTT
TGCATGttaataattaaataattaagtttaGATTCAATTATAAATACTCA
TGTCAACTTTTTGACTTGGaagtagttttgaaaagatGGAAACATAACAA
TAATGATTTTGTCTTTCAGGTATGACAAGTTGGGTAGCTTGAAAGTTAAA
GAAATGCTTAAGTCAGCAGATTTAGACTCAGATTTCATTCAATTAGTGTG
CTGGCTGGTTGATAAATTGAAAAGCTTGGTTGATGTTGACATTGCAAACA
TATCTggtataaaatttttcttgaatgtATAATAAACTTACTGTCTACTC
TGTAAGCCAACCAGCAAATTGAGGGTAAACTATGTgaccttgaaaatttg
aatactACTTATCCTTTCACCTTGGgtaaaacattgaaaagaataatatt
tgtttgtttgtaatgTCTTAGTTTGTCGTCTTACTGTATTTTCAAAACGT
GTTTATCATCtttatgattatttttataaaacttttttgtaaagCAGAGA
ATAATCCCTCCCGAATCCCATGCTAGggtaaaataaatttaaattttgaa
aaacattcagataaataactttggaaaactggcaaaaaaaaTCCTTAGAT
CATGAAGATAGCGTATTACCTGAGGACTGGAAGATGGCGCATGTCACGCC
AATCTACAAGAACAAGGGTGCTCACAACCTAGCCATAAACTACCGTCCAG
TCAGTTTAACATCTATAGTATGCAAAATGATGGAGTCAGTGCTACGAAAA
GCAATTATGGATCATCTTgtggaagaaaatcttttatctgaaaaacagTA
CGGTTTTATTGGTAAGCGATCAACAGTCACTCAACTTCTTTACTACATTG
ACCAATGTTGTGAAACGATGGCAGAAGGCAAAGTTGTCGATtgcatctat
tttgattttgcaaaagcgTTTGACACCGTCCCTCACAGGAGGTTAAAGAA
AAAACTGGAATGTTACGGGGTAGGTGGAAGTCTACTAAACTGGATAACAT
CGTTTTGTCAGATCGCAAGCAGCTGGTCAAAGTCAACTCAGCCAAATCAA
CAACTAACCCTGTCGTAAGTGGGATTCCtcaaggaagtgtacttggacCT
CTGCTATTgtcatttacatcaatgatttgCCAGACAAAGTAGTTTCGGAT
GCATTTCTCTTCGCTGATGACACGAAAATAGTGAAGACTATAGATTCGGT
AGAAGACTCTATCGTTGTACAAAGAGATATCGATGAAATGGAAAAGTGGT
CTCAGGATTGGTTACTCACGTTCCATCCTGATAAATGTCATGTCTTAACA
ATAGGTAAATTCGCCAACATCAAGCATGCACACAGATACCAGCTTGAGGT
AAtgaacttgaacatgtttttgaagaaaaagacctcGGCATCTTGATCGA
TTCGGAACTAACTTTCGAGGAGCATATATCCAAACAGGTTAACAAAGCAA
ATTCAATCCTTGGAGTCATCAAAAGAAGTTTTAACGACTTGAGTCCTTCG
GCACTTTGTACTCTGTACACCACCTTTGTCAGACCTCACttggaatatgc
acaatcagtaTGGCAGCCAAAATTACGTCGTAGTATAAACTTGATTGAAG
GTGTTCAAAGACGGGCGACAAGACTGATTCCTCAATATCGTAATCTCCAC
TACGAAGAACGTTTAAAAAGACTCAAGCTTCCATCTCTTGAGTTCAGAAG
GCTTTTCAGTGATATGGTGCAAATAtataagcatattcatttttacgaCC
CACAGACAACTCGgaacaagtttgttaaaaaatccCGTCCAACCAGATTC
CATGATCATGAATTTGTTCCAAACTTTGCTGATGATGGTTTTCGTGGGGC
TCAGACAAAATCTTTCTACTATAGATCGATCCCAACATGGAATGCACTAC
CGCGATTTGTCATCGAGTCGACCTCAATCAAATTGTTTAAAGAAAGCCTA
AACAAAGCGTGGGAAAAACACCAACTAAGATACTTGACATATTAATATTG
TAATTAGAAATCGGTTCGTAGAGGTCCACCTCGGGCCTGTGAGCTTGTAT
ACATCATAATAATAATGAAGTGCAGTATGCTGATCTTGGGTCGCCAAGTG
AAAATTaagaaacaaagatataaaacaACTATAATTTATTTCTCTTTATT
ATATTTTAGGCGAAGCCGATACCTTCTGTCTTGAATTAATTGGCATCCTT
CGTGATTTGGGTAagctttcaaatgttttttcgaTACATTTGGCGCCTAA
AAGCCACAGCTATTCTTACCATAAAGAGCTTATAATATACATGTCCTTTG
TGATTtaaatttttgtggtttttatataaatcattttcaaaaattcacta
tacagaaaaatactgaattttcctctgttttctttttctagCATGTCCTT
ATGCAAGTATTATTGGTGGTAAGGGTTTGCAAACAGAGAAAGGCAAAATG
TTCACCCTAGGTATATATtatattgtaaaattttcctATGATGAACAaaa
ttagaatcaattttaactGTCCACACTCCGTGTGAAACATTGAGACTGTT
AAAGACTTgctttattatattatattgcAAGTATTTTGTGCTaattctca
aattttaggcTAGACTCAAATTTGAATCGCAAAAAACAACTTCAAGCACA
TTAGGTTGAAAAAGTCTCAATCTTCGAAACCTCAAAATTCTTGAATCTTA
ACTTTTAAAGGCTTCATGGTAGTTTTTTGTCTTATTTAAGATTACTTGAT
TTCTGAATTACAAGCAGCACGTATGTGTTCAAGTATGAATGATGATGATT
CTAAAATGGTAAGACCAGATTTTGCTCAGAGTGTTGTTATTTTGGAGAAA
CTTACCCCCTAAGTAACTATCCTTTGAACCCATTAtacttcaaaatttta
tttacattttttttattacatGATTGCATGAAATGAAAGTGAAGCTTTTT
CGGAAAGTGGTTCTTTACAAGAATAAAGCTTTTTAAGAGAGACTTAGATC
TTTTTTGAAATAGGGAATAATTTCAAGATTATCAACCAGGCTATTTCGAG
TGTTATGTTCTGACCACTATCATTTTCTCTCATTAATCCAGAAAGAAGTC
GAAAGTCTAACATTAGGTtttgtttgttatatttttaggATGTGGACAGT
GGGTCTGCAGTCTCCATACCTATCGCAAATATCATGCAAACTTTGAATGT
CCCGATGAGTAGTAATAATAATGTGAACACCCTTTTTAACGATATTAATC
AAAAGGTATGTTGAAATCATcacgtttcttttttttgattgagGATTTTT
CACAACAAACTTTTTATTACAAAGACTCTAATGAAAGGATCTTTGTTTTT
AACAATAGTCATTCATAACAAGTAAATTACTATTCAAAGTCATTAGCCTG
AATTATTTTCATATGAGGCAATAAAGTTACTGAGATTTATGCTAAAGTCA
ATCAAAACTATTTTTACTCCTTGatcatataatttttttttCttcaaaac
cttagcTACAAGAAAGGTTGAAAACATTACCAGTCGATCACCTACAAGAA
CCTTTACTGAAGAAATCTCTAAGCGAAGAACAATGGGTAGGCTTTTCAAT
CgttttacttttcaaaatccttcaaaatttattcttCATATTAGTTGTCG
TTCATGTGATTCCTTTTAGTTGTATGTTAAAAGTTGTATGCTATGTGaaa
aagatattcttgaagagAaaaatctttcaggTttttgaaacgttgaaaaa
taaagataaaaatgaagatgaagattttttCttctggtTCAAATATCATG
ACATCAGActtttttagaatactctaTtttgaaccttgctttttcaactt
tttaaaagtttttatcatccttggaaatatttttccaacaGTGTAGGCGA
AAGGGTTAACTCTTCTTCTTCCAAATGTCAAATACTGGCTCAAAAGCCTT
CTACACGTTTATTGGGCACATGTGACCAAGCTTTAGAGACATGTCTCAGG
ACTGTGGACTTTatgtcattttttcaactttcagtCAAAAGTTAGTCAAA
TCAACGATGCGATGTGCCAAGACTACAAACAAAGACGTGAAGTGTTGATC
AAACGAGTTGATGTCACTGTTCAATCCTTCTGCTGGTCCGAAAAACTAAA
GGTATCGTCAAAAACTTTCGTCTAATTAAACAGATGGGTGaaaaaaaGAC
GAGGTGACTGGGACGCCTAAATTACAAAGGCATCATTTAAGAAATAGAGG
AATAAGGAAATTTAAAGCTTTACTTTGTGACCTTTTCCTTGCTAGATTTG
ACCTTTTCAAAGCCAATTCCGAGCTACCGAACATTTTTCGGAACAAAAAT
TGACGTCTGTTACTAGAAAGATGTTCcccaatgaaaaagaaaagaattct
cTCTCGTTCGAATTTTAAAGAACAGAATTATAtttgaattaaagaaaatt
ACAGGGAGAACTTTCCAACTGAAAGGGTCAATACTTAAGTTCGAATgaca
gaaaaattcgaattacaaaggTTCAAACTAGAGAGAGTTGACAGACagtt
ttcaccattttctttACTTTAGTCTACGCCCGAACAAGTTGCCACTGCGT
TCCAACCCATCAGACAACAATTACACGCAGATTCAATCACATCCACTGCT
GACATCCTTGCCACAAGAACTGGTAAATCATTAAACTTATTCATTTGAAT
AACGCTGACGctacttttttcaatttgagatttttgatattttgatcaaG
GAGCGAGCCTAGAATCACAAACTTTTACATTTTGGACACACACACTTACC
CTAATACAAATGTGTGTTACCCCATTCATTATCATTGACCATACAAAAAG
AGGACGTATATACTGATTTCATTTTCCCTCCTCAACTTTAGACCTTTATC
CAGTCGAGAAGACCAGTAGTGGTGCAAGTCGAGAAGCCACCAAATGTGAT
CTCAACAAGATCATCATACCTAAGGTATTGTTCAGGAAATTGTACAATCC
TCTTTACCCATCTGGTAcgaaacgttgtttcaacgttcattcgACATTAA
ATGATGTAGTGGATGAATGTTGACataacgttgtgtaccagcttgGTAAG
TGTGTAGCGAAATGACCTCTTTCTCggcctttttttgaaattctaaaaaa
cgGTTTGAAGAGAAATCATAGATTTGAACATCCCATATCTCTCATAATGC
TTAAGACTAACCTCTTTTCTAATCAATTCTATTCCCCATTGAAGGCTTTG
TCAGACTATTCTATCCAAGCGAAATGTAATTTTGAAATCTGACTGCTATT
TGAGGGCACTCTTTGGAGTATCCATTGAGTaatatggaaaaaatctcaca
acttaataagcggggaaGGGgcgggttggaataaaaatatcctgggtgga
aaattcttgaaaaggaggctaatacagcagaattaggacaaaagagggaa
ctttcaaaaacatttccccaaatattaataagcggggggggggctggaat
aagaatgtcctgggtggaaaattttcgaaaaattaattagcgggggcggc
tattaggtacccgagagtagagaAATACAGATTTGACTTTATTTACTAAG
GTACCGGATAGAGGTGGCCGCCCATCGAAGCAAGCGCCACCTCCTGAGAT
GCCCAAGTTCATGAAGAGAGTTGCTGACCCGCCCCGTGGCGGTGGCGGCG
GTGGTGGTAGAGGAAGAGGCGGATACAGAGGTATCCTTTCTTTTCACTAA
CTTAATATAACTCTTTTCAACTATTTGGTATGAATTTGAAACGTATTCAA
AAGTtaagacaaaaagaaaatttagggttttaaaattgttttgctttgaT
CCATTTCTCTCtgcgtgtttttttttttcatattataaGTATCATTAAAG
GGAAAAGCTTTTAGGATCTTTCAATCTATCAATATTAGAACTGCGAGCTA
TAGAAAAAGACTTGTTCGATTTGATCTTGATCAACAATGTTGTCGGTAGT
CATTGACTTCACAGCAATAAACTGGTAAACTTTAGCCTTGAtttttttGG
TCGGCCAGTTTCACTAAGTTTCAGTTGTTAAGTTGATTTTAAATTACCAa
tgaatttgtttgttttaggtCGAGGTGGCTCGTCTGATCGAGGTGGCGGA
GGTATTTACTCtcgtgtttttctttaaaaaaagtctgaAAGTTGAGATAT
GTTGTACACCTCAACGataagaaagttttttgagATGGTAAGCATGTTTT
AGcattaaaaacaacaaagacTTATACAGAATTTTTTGCTATTATTTTGA
GCTGAAATTTAGCTCAGTgttaaaaaaatacgaaaagaaacgagaaaatc
tttttcataatttttaaaaatacgtTCTTATATCATGACCCGattaaagt
ttattgaaaaagcCTTAGATAAAGTCAGCCCTGATAACGTGAAGGGATTT
GATTCAAGTTTACTGGGCTTGGATATTGTTTAATGTCTTTTTCTGTAAGT
GCGCCAATGTAATGACTTCAGACATATGACGCCATTCAATCCTTGTAAAT
TTGAACACGAGTAttttttttGATCTCCTCAATTTTACCATTAGGAGGAG
GAGGTGGCGGTGGTGGTGGAAATGATAGTCAAGGTGGCGGTGGAGGTGCA
AGAGGCGGTGGGCGTGGTGGATACAACAGGGGTGGAAGTAAGTTTAACGT
TTTTAATTTACTTGattcaaaaacaaatatttccttGTGAATTTGAATCT
CTTTgtaccttttttgaagtgtgcTCtttttttGCTACAGTCTGGAAACC
ATGTTACTTAACCCACTAAATTAAATTCCTTTTACATTTAATTCCAGAAT
CTAATTGGCGTGGAAAACAAGGTGGAAGGGGTGGCGGGCGCGATTATGAA
AGCCGCCCTTCTTCAGGTGACAGTAAAATGTATTACAGTTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000270_pilon:61533..68574+ >XLOC_035469 ID=XLOC_035469|Name=XLOC_035469|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2424bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000270_pilon:61533..68574+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAAGAATCAATCACCCAAGGACTGAAAAGCCTTCAATGAAAGAATCA
ATCACCCAAGGACTGAAAAGCCTTCAGTATGACAAGTTGGGTAGCTTGAA
AGTTAAAGAAATGCTTAAGTCAGCAGATTTAGACTCAGATTTCATTCAAT
TAGTGTGCTGGCTGGTTGATAAATTGAAAAGCTTGGTTGATGTTGACATT
GCAAACATATCTgGTATGACAAGTTGGGTAGCTTGAAAGTTAAAGAAATG
CTTAAGTCAGCAGATTTAGACTCAGATTTCATTCAATTAGTGTGCTGGCT
GGTTGATAAATTGAAAAGCTTGGTTGATGTTGACATTGCAAACATATCTg
GCGAAGCCGATACCTTCTGTCTTGAATTAATTGGCATCCTTCGTGATTTG
GGCGAAGCCGATACCTTCTGTCTTGAATTAATTGGCATCCTTCGTGATTT
GGCATGTCCTTATGCAAGTATTATTGGTGGTAAGGGTTTGCAAACAGAGA
AAGGCAAAATGTTCACCCTAGCATGTCCTTATGCAAGTATTATTGGTGGT
AAGGGTTTGCAAACAGAGAAAGGCAAAATGTTCACCCTAGATTACTTGAT
TTCTGAATTACAAGCAGCACGTATGTGTTCAAGTATGAATGATGATGATT
CTAAAATGATTACTTGATTTCTGAATTACAAGCAGCACGTATGTGTTCAA
GTATGAATGATGATGATTCTAAAATGgATGTGGACAGTGGGTCTGCAGTC
TCCATACCTATCGCAAATATCATGCAAACTTTGAATGTCCCGATGAGTAG
TAATAATAATGTGAACACCCTTTTTAACGATATTAATCAAAAGgATGTGG
ACAGTGGGTCTGCAGTCTCCATACCTATCGCAAATATCATGCAAACTTTG
AATGTCCCGATGAGTAGTAATAATAATGTGAACACCCTTTTTAACGATAT
TAATCAAAAGcTACAAGAAAGGTTGAAAACATTACCAGTCGATCACCTAC
AAGAACCTTTACTGAAGAAATCTCTAAGCGAAGAACAATGGcTACAAGAA
AGGTTGAAAACATTACCAGTCGATCACCTACAAGAACCTTTACTGAAGAA
ATCTCTAAGCGAAGAACAATGGtCAAAAGTTAGTCAAATCAACGATGCGA
TGTGCCAAGACTACAAACAAAGACGTGAAGTGTTGATCAAACGAGTTGAT
GTCACTGTTCAATCCTTCTGCTGGTCCGAAAAACTAAAGtCAAAAGTTAG
TCAAATCAACGATGCGATGTGCCAAGACTACAAACAAAGACGTGAAGTGT
TGATCAAACGAGTTGATGTCACTGTTCAATCCTTCTGCTGGTCCGAAAAA
CTAAAGTCTACGCCCGAACAAGTTGCCACTGCGTTCCAACCCATCAGACA
ACAATTACACGCAGATTCAATCACATCCACTGCTGACATCCTTGCCACAA
GAACTGTCTACGCCCGAACAAGTTGCCACTGCGTTCCAACCCATCAGACA
ACAATTACACGCAGATTCAATCACATCCACTGCTGACATCCTTGCCACAA
GAACTGACCTTTATCCAGTCGAGAAGACCAGTAGTGGTGCAAGTCGAGAA
GCCACCAAATGTGATCTCAACAAGATCATCATACCTAAGACCTTTATCCA
GTCGAGAAGACCAGTAGTGGTGCAAGTCGAGAAGCCACCAAATGTGATCT
CAACAAGATCATCATACCTAAGGTACCGGATAGAGGTGGCCGCCCATCGA
AGCAAGCGCCACCTCCTGAGATGCCCAAGTTCATGAAGAGAGTTGCTGAC
CCGCCCCGTGGCGGTGGCGGCGGTGGTGGTAGAGGAAGAGGCGGATACAG
AGGTACCGGATAGAGGTGGCCGCCCATCGAAGCAAGCGCCACCTCCTGAG
ATGCCCAAGTTCATGAAGAGAGTTGCTGACCCGCCCCGTGGCGGTGGCGG
CGGTGGTGGTAGAGGAAGAGGCGGATACAGAGgtCGAGGTGGCTCGTCTG
ATCGAGGTGGCGGAGgtCGAGGTGGCTCGTCTGATCGAGGTGGCGGAGGA
GGAGGAGGTGGCGGTGGTGGTGGAAATGATAGTCAAGGTGGCGGTGGAGG
TGCAAGAGGCGGTGGGCGTGGTGGATACAACAGGGGTGGAAGAGGAGGAG
GTGGCGGTGGTGGTGGAAATGATAGTCAAGGTGGCGGTGGAGGTGCAAGA
GGCGGTGGGCGTGGTGGATACAACAGGGGTGGAAAATCTAATTGGCGTGG
AAAACAAGGTGGAAGGGGTGGCGGGCGCGATTATGAAAGCCGCCCTTCTT
CAGGTGACAGTAAAATGTATTACAGTTGAAATCTAATTGGCGTGGAAAAC
AAGGTGGAAGGGGTGGCGGGCGCGATTATGAAAGCCGCCCTTCTTCAGGT
GACAGTAAAATGTATTACAGTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000270_pilon | genome | sc0000270_pilon:61533..68574 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1120-1212:6950 |
| Aaloc | 1027-1116:6697 |
| Aaloc | 994-1023:6221 |
| Aaloc | 862-990:5701 |
| Aaloc | 781-861:4994 |
| Aaloc | 679-777:4673 |
| Aaloc | 562-678:4135 |
| Aaloc | 481-561:3606 |
| Aaloc | 364-480:3239 |
| Aaloc | 298-363:2843 |
| Aaloc | 229-294:2494 |
| Aaloc | 178-225:2262 |
| Aaloc | 40-174:221 |
| Aaloc | 1-36:1 |
|
