XLOC_044817 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_044817
Unique NameXLOC_044817
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000022_pilon:1258529..1274834+

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_044817 ID=XLOC_044817|Name=XLOC_044817|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=16306bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000022_pilon:1258529..1274834+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atggcggTCCGGCTGCGATCGAGTGCTCACATGGTGAAATTTAGAAgctt tttttcacaatttatttGGTCTAAACGAGCTTTATGCTCTCTTCCTCCTT TAAATGAACCGCTTGACATAGAAAACATTCATTCCTCCACTTCCAACACA ACAGCTGGTAGTGATGCTGTAAGGATAACAACCTTATCAAATGGCTTAAA GGTTGCATCAGAAAATTCTTTTGGACAGTTTTCTACCATTGGAGGTATGT AATTTCCTATCACAGCAGGAGCTTGGAGTTTTATTGCTACAGTGATATTA ATGTGAAGGCAGTAGGCGTCCAGTTGACGtttttttGTGGCAAGTCTGAG TTTGGATGGCTCTCTTAtataaattgaaacttttttttttgttagttagt cacactagctagtaggaaatcaagctttcagaaaaaacattatATGTATT TGCatcaacaaggatgagagttacctgaatcaagttcaagttcccaagac aattaattaaaacttgaaaacttaaaataagccgggttattttttcatga atgaATCCTTTCagaagttttgcggcacatttttttgcctgcgagtcaag taaacgatacaGGTGCGCTTGGTTTGGGAAGGTGGAACACGAAcgcgaac tacccatgtctaaacttttcaatatatatatctccagaactaacagattt tttgaaattctgtaaaaaggtccaagttcctgaatagttttactaccgtg aaaaagggtaacttgcatcagtggaggctaacatgcatataccCCTAACC ATAACCATCAGTTAAATATTGGTTCATCTATCAGTTCCATCAATATGACC Aaaacatttctatttctatttctatttctatttggttgagttgcaggagg ctttagaggcctattctggcaactatagacgcttaccaatgagcatcccg tcagcacctttaACTGATttcccaattcccctcacatggcatgggttgac ccgggcgaaggaacgttcacttgccaagtgaactgccgtgagtgggaatc gagccctggccgcctgcacagaagccaaggtcgactaccactatactacg GCACATTTTGTTCAGCCATCCTCACTCTAAAGGTCGTAGTCCACTTAGCC TTTTTTGGTCGCCGTTCAATGCGCACGGCTCGAGCGCATTGTGCGCAGAG CGCTTTTATCCTTCCactgaaaattataaaaaagtggcgcgtaaaaaaaa aaaaaacataagcaAGAAAGATGGCGGCTATCAACAAGAGAGTTTTGCTT CTACTGATTTTAAGAAGAAGGTTGCAAGAAAGAACGAATAAAAGAACATC TCGATTTTGGATAAGAGACATATACAAAATGAGAAAAGCCAGAGGAGAGT TTCATTGCCTGGTCAAAGAAGGTTCGCTTTTTGACCAGGAATACTTTTTT AAGATGTTCAGAATGACCCCAAAAAGATATGAATTACTGCTGAGCTGGGT TGGTCCTCTGATAAAAAAGTGCAGTATCCGTCGCGAGCCTATCGATCCTG CTGAACGTCTCTCCGTAACGTTACGATATCTTATCTCAGGTGACGCCTTT TGCACTATCGCAGCCAGTTACAGAGTGAGTGAAACATCCGTTTCTCGAAT AGTGAAAGAGACCTGCAGAGTTATTTGGGAAGTGTTACTATCAAAGGGTT TTATCGAATCACCAAAGTCCAAGAAAGATTGGAGAAAAATAGCCAACGAT TTCGAAGCTTTATGGAATTTCCCAAATTGTATTGGAGCAATTGACGGTAA ATATGTTCGCATTCAATGCCCTAAGGGGACTGGTTCCCTTTATTTCAATT ACAAAAAGTATTTTAGTATTGTTTTAATGGCCGTTGCTAATGCCAGATAC CAATTCATTCTCGTTGATGTTGGTGACTATGGAAGGATAAGCGACGGAGG AATATTTGCAAACTCAGAATTTGGATGTGCAATTACAAATGATGCTTTTG ACTTGCCAAATCCAAGAAAGTTAAACGGCTCAAATAAGTACTTTCCTTAT GTATTCTTAGGAGACGAGGCTTTTCCCTTGCGTTCAAATTTGATAAAACC TTATCCTCGAAGTGATCCACAAGAAAAGAAGGTTGTTGCAAATTATCGCA TATCTCGAGCAAGACGGGTCGTCGAAAATGCATTTGGGATAGCTACATCT CGTTTCAGATTATTTAGCAGACCAATAGCTGCATCTGTTGAAATTGCAGA GGAAGCTACAAAGGCTATAGTGGCTTTGCACAATTTTCTGATTCACACTT CTAACGAGAGTTGTAATAACTATTGCCCTCCTAACTATGTTGATCGTGAG CATAACGGAAGTATCATTCCAGGAGATTGGCGAGCTGAGCAAGCTAACGA AGGTCTAGATAACATTGTAAATATGGGGTGTTCAAATAACTATAAGAAAA GTGCTAAAGAGGTCAGAGATGACTTTTGTACTTATTTCAATAGCCCCTCA GGATCTGTTTCATGGCAATTAAGGAGAGTCAGAAGTACAGGAGCCGAAGA CAATGAGTAGATGTAACAGTTGtaatattttttagcttttatttCAAAAC GGTGCAATGTATGTTTCACTTAAAGATTCTCTAAATAAAAAACTagtttt taaaatcatttcatACTTCCAAGTTCACTCGGAGTCACTTTCAAGTTCAT AGAGCACTTCTTGTATTTTTATTCTAGCtttccgattttttttctttggc aatttttctaagattggTGCTAAACTCTTACAAAATAGCATATTGCCGGA ATCTTCTTTTCGAGGGGAAACGTTTTCTTTAGTGTTACCATCACAAGTCG AAGCCAGGGTTTTGACCAGCAAAGTGTCTATGCTATCCCGACGATCTTCA ATTCTGCGTTTCTCCCGTGCACGTCCCTTAGGCCCAGACTTCGAAAAGTT ATTACTAACCGATTTTGAATGTATAGACGAAGTGTTTTGAGGTTCAGTTG TGTCGGTTGGTGTGTATTGTAAAGCAGTCGAGGGGTTTGGCAGACCTGAA GTCGAACTCTGAACGATTCCGGTGGGGCTTTGAAGGCCAGCTGGTGGAGT GAGTCCAAACGGGGAACTTTGAGTTGTAGATGTGTGATTATACTCGAATA TCGGACTTGGCAGGTTAAGCGTAGATGATGAATTCATCTGTGATTGAGAA AAATCTGGTTCTTGAGAGATGTAGTTAGATCCTTTGTTTGACTTGTTCGA TACACTATCTTTCATAAAAAGGAGAAGGTCAAAGTGTTGACAGGAGGGTA TTTTGCCACTCGGTCTTCCTGATTTAAAGTATTCCGTCCGCTTTCTACAG GCTCTAGTGAAGGCATCTTTCAGGTTTCTCCATCTTGATTTTAACGTGTc agcttaaaaaagaaaaaaaaattgatttagaaATACTATACTCAAAAAGT CTTCACTCATAAATACtgactttttaaaaacaaattgctTTCTACAGAAA TAGTTAGTTTTGCCAAGGAAATTGTTTCTTATAGATTATTTTGGATAGTA TAAAGTCATCACTTACGTTCTGCAtgcaaattttttccaatctcTATCCA GGCTCGATTTTTCCTCTCGGtgtctttgtattttttgccTGAAGCACTCC ATATGATCGGGTTCGATTTGACCATGTCGATTAAAAGTTCATCTGAAATT TCTTTCGAGGCGTTTGCAGGATGAGTGATTTGAGCGTATTGTGAAGCTTC TACAGTGACACCTGGAGAAAGTGGCGGTTCTGGCTGGCTTAAGTTTTGCA ACGCTTGGAGGCCTTGAAGGGCTGCAATTTCAGCTCTTGCTGCTGTTGGA AAAGTTTGGTTTTGTTGGTGGACTGTTGACATTGAATTCATTGCTTGCTG GCTCATTGCAAATTGAAATTGGCTCCTTCTAAATTCTTGCATCCTTCTGA ATTCTTCCTCCTCATCCTGGTTAATTTCATTTGTTAAATCTTCCTCATTC CTTTCttcaaaatcaatatcctctTCGTAAAGATTATTATCCATTTTCAC TGACCCGATACACAACACACATATACacactatttcttttttctagtaga agttacttttatttttttcgaaaaaaatttaaaatgataaaaataaacac ACAATCAGTATGTTTACCTTCTCGCTGATTGGCTACTTCTGAAAAAACAA TAGAAGAGCTGTACAGCTTTGCGCACAAAGTTggattttttcaactttca aaaaagctcaCGCCGTTCATTGCGACAAGCCTTGAAGgcttaatttattt aatttatgcaaaaatcGAGCCGTGCGCATTGTGCGGCGACCaaaaaaaGC TAAGTGGACTACGACCTTAAGAGAGGCCATCACAGAATGAACTTCCTtat ataggatgaaccatattcatgtgtaCACTCCATCaatcacagagcctatt tgagatattttactaactagcccagagaaaaattttaaacctttattatt tgaatgcatgccttttaatactcaaatataaaaaaattaaacatttttaa cttggtcattagtcaaaaaagtcattaaaattgattagcctctgcgatgg agtgcaaggctgaaagccacatgaaaagacctttttttaaagaggcagcc atgttgaataattatgtactccagcataaaaacaacgatacagccatgca taatttttaaaatatgcatgatacagtaattatgcatgatacagtaatta tgcatggctgtatcattgtttttatgctggagtacataattattcaacat ggctgcctctttaaaaaaaggtctatatggttcatcctataaaggGAAGT ttattctatggtggcctatcttgaagtgaaggtggttgaacaaaatgttt ttggcatattgatggaactgtctatttaaaattgagaacaaaaatttgcg aagaaaaataaaccttgagcacaaaaaatgcttttttaaacacttttttc catcGGAAAACAAATAACctttatagacttaccttccccaaacattgatt AAATTTGACAATTTGACAATtaaaggccaatatttttggtttttctgaag gacaaaaggtataggaagctttactgaagcaGGGATagggctgggacaat ctatttaaaagatatggacgaaaaaaggcactttttttacttagaaactt taattctcttacccccgtcccgggcccccctgatatgagcaggggaacca tgttggccaccccttctgaaaatttcagatcaaaacaaacaaggaattaa ttcctacAACTCgattaaaattggaaaaagctggttttttgactgtttct gatcctaaagtgctattttttggtaaaagctatgcaatttatgtttggat ttctagaaagcttactcattgtcaatatattttttatttgaaagtaatct cttcatggaataaaaagatatattcaaatcttgtagggtcatttttcaaa aaaattttgccaaaatcgattttcgcatttcgccattttaccctacgcaa acgcacgtggatatagcgcttttgcagcattaatctttgatgcACATTTC GACGGGACGCTAGTATGTTATATAGTCAACTCATCCTCAGTTGAAGAATT TAAAGAGACCCTTAGTGTGGCCTGGAAagctaaaaagtttgaatatgatt gaaagtgtcactattgttgcatacctgtctatattataacaatgtaaata attaacccaaaatgtatgagcgattcatTGAGGCCCATGTGTCCGCATGG TGGCCtgcaaatttttaaaactatattattatttattattatgaCTAACT GTCTGTCCAAAcataacaaagaaaatatttgctTAGCTGTAGTACCttgt gaagtcaggtaacttgcatcagtggagggaaacttgccatcaaatgactg accaatcaaagcagcaaaatttcaaaacaattgaaCCACACATCTCcgct ctaccatttttgttttgatttaactttgtattttaatgaccagccaggtc attgatttaagggctatgcatgttagcctccactgatgcaagttacccga tctcactgTAATATTTACATTTAGAAATCAATCCATTTCCCACCTACAAG CCCTTtcagcaaagtttcaaacaacgCTGCTGCATTactggcaatgaatt ttgacttgaaaaatgTGGGTCCAGTTTCCTGGAAATGATCACAACACAGT TATTACACTACtaaatcaattatttttacaataaaatttgTCTTCTAACA AATCCAAAAATACAGTTTGTTAATTCAGGACAGATAAGCAGGacaaaaat aagtttttgaagttttcaacaacaaaaaaacacatagaatatctttcaaa ttcagtatgtctgtagagcagtaaaaaatataacttttcttttttcgcat tttcttgccaatgttccagaaatgaaaatgGAGGGATAATCATAGGCTAC ACCCTCCCAGAAATTTGGGGGTACCTagaaaaagtgttaaaaaagccaGG TATATACCTGGAAGTTTTCTTGTCATGTCACTAGTTGCTATTCTAGAGTT TTACTTAGAGCTACACTGACAGAGTCGATAGAGATTATGACAGATTAACT TTCACAGCACAACCTCTTTTATAGGCAAATTAGATCTCTAAAAATGAGGT TTGAAACTGGAAATCtaagtaataaaaaattatcttgACAActatttata gttttttttataattttcagctttaattGACTCTGGCTCACGATATGAAA TCGATTACCCAAGTGGAACAACTCATATGCTTGAAAAACTTGCTTTTCAG GTAACtactatttttttataaatgttaGGGGCCTGTAAATTAGGCCTTGC TAAAGTTTTTATGGCCaaaaaaaCTGACAGGCAAAACTCCTAACCCAAta gatagaaaaaaattgaagattgatACTTTTTCCAGGCCTAATTCAGGGAC CCACTCGCTAAAAATGTCACATGCAGTTGCGTTTTACAATGATTACATCC ATTAGGAGAAAAAGTGTTTTCCGATTGCTGCAATTGAGAAGATCGCATCT CTGGTACATTTTGTCTTCATATGATGATTGGGTCATTAAAATTTCATAAT ACTGAGTCTTTGTTTTAGAGCACAGAAAACTTCAAGGACAATGATGAAAT TGTACAAAAGATGGAAGCTTTGGGAGGACATGTAGATTGCCAGGCATTCA GGTAAGAAGATATTTTATTTCATGGGACTTCATGGATACATCGTtactaa aattctaaaaatgccAATATCTTGTAATAATGAATTCTAAATTACTTTTA AGATAGAAATGCCGTATAATAGGCTTTTTGTGTTTAAGAATACATCATTG TAAGGTTGTAACTTCTTACTTGCTTAGGATTCTGGCACTTAATCAAAAAC GGCCAGGTAGCACAATCGTTAGAGCGTTGGCCCTGTAATCAGGCCAACTG GTTATGGGTTTGATCCCCAGTCACCACCATCTCATCAGCAAATTAGAAGC AAAGATCAGGTTATTCTAATTTATGTGGTAACTAACCGGGAGCTGAATGT AGGTGAGGTGATCCATCTCAGCAtccgatctcccaggtctagggCATATA AGGATTGAATATGACTCCCTCGCCCCAGTCCTCCCGACAGCAACTACATG AATAAGTACTTACATACCatcttcaacttttttcagGGATTGTGTAGTAT ATGCAGCTTCAGCTTTGAAACATAATGTTGGAGGTGTCATTGAAGTTCTC AGTGATGCAATTTGGAGATCTAACTTGAAAGATCTGGAGGTAACTCGATT TTGTATGTTGCTTGGTATAATTGTACCTATTGCAACTACatgaaaataat aaagtaaTTCACTTGAAATAAAGCACATTTACTTCATTTGACAATAGTAT ATATTGCTTTTGATTATGATTGGTCAAGAAGCACTTATCTGATGAATGAG AGTTCAACTCAACAAGAAGTTAATTgtatttataaaatttgttaataaaa acaaatcacTTCGACAAGACTGTCCAcctaaaaaaaacgaagaacagaca aaaaatgAACTGTGTCAATCAATGCAGTTTACACATATCTACTATAGCTG TGGACCATTTGGCTTTATTGCTTATTTATTCTGATTATTTTCCCTATTAA AGCTTGGAATATACGAgaacttttgaaataaaacttatTTCTATTGTTGT ATTCAGAATTCAGGTGGTATATTTTTGTTGGTAGTTGTCAGTCATTCATA AATTTAGTCTCTTACTTTCCCAATATTATAGCTACAACATACAATGATAT CGTTTTCTACCCAGAAACACTCTTAACCTTAATCATCTCTCAAACCTGCC AATTATTTTTACATAGATTGAGGAGCAGAGAGAGACCATTCGTTTCGAGC TTGAGGGATTGGATTTTCGACCTGACGTTGAACCTGAGTTGACAGATCTC ATTCATGCCGTAAGATAAATTCTTTGCAATttttacagtggagtctccgt aCCTTAAACACACACGgtaaacacaaatttgttcgagttaggaAATGTCT AGTtttggagtaaggtttataaggcactGTTAACTGAAGGATCATAAaag ttgttcgagttaaggagactccaCCTAAGgttttaaaatgatatttttat ggaCAATGCTTTTTTACATCTATATTTTACATCTTTCACATCAAATTAAA TCATCTGTGTCTTTCTAAGCATTTCTACATGCAAAGACAATTTTAAAGCC ATATAAAGACTTATTAAGCGATTTGAGGCTACTTTTAAGGGTACTatcct tgtcgaccgacggagGTGTGCCGCTAAGGTTAGAAAATTACACCCTACTC GGGActcgaaaaaagtgaccctgaatgggactgaaattacaaagtacaaa atttttcccaaacttttttcccaaattctcccaaaaaggtaccctacgag gaattgatttttctgttttggtgtTTCTGCGACCTTACCTGGGACTCATG TatgtgaaaaaggtaccctgaccagcgatACATCTCCGTACCCCTTTTAG CCAAAGTAAACCCCCCGGATATTTCGCTTTACATATAACAATTTGCTATT AAACACCTAAAGGTTTCACTGATGTTTTTATGTATAATGATGGTGCTTTC GCTTGTATCTATATTCCTCAATATGATGAATATATTTCGTCTTTACTTGA TACAGTTTATTGTATCGCTCATATACGTATTATTAATATAAGTTAAGAAG ATAAGTTAAGAATCTTTTCAGCTGACAACTGTCATAGTTATTAGACACCT GCTTTTCAACCGATCTCACAATTGTGTTTCTTCTGTTTAAAAACGTTGTT ATCGACTCAAACTGGATACAGAAAGATGCTATGCAGgggaaacaattttt taagacgTCAACATTGGACAAAAGGACAGTCCCGATTTCGATTCACCACG CGTTTCTTTTGTTGTCCATGCCCATTTAACTCAAAGTTATACTGGCCGTT GACTGCCGTGgcgtaaaaacaaaaaaattaaaaaaatttctaaaagtaAT ACACGTAGCTTGGCAATGAGCGTCAAATAATAACTAGTTTGTGGTTTTGA TAAAGGCTTTCGTTATGAACATCTCAAGCGTTTGTTTTGACCTTCTGGTG AATGAAGAGACTTTCTAGATTTTCGCACTGTATACACGAcgtgaatttcg atttttgaagaGCCTTGttgatttgacttttttttttcgttgaCTGATTT CGCTTACGATTCCTCGGCTCCTACATTTCAAGGTTATTAGTGTCTCCCAA ATTACCGACTTTTCTTTGCGGTCGCTGATCGTAAATTTTCATCCAGTGGG TCAGTGTCTCCCGAAAACTTCGATTTGCAAAACCATAAATAAACGGGTTA CACACGTGACTCAATGTTGCTAACATTATGAAGGCTAGAAATACGAAGGA GGGAATCTGAATGTATCGCTGGATTACAAAACTCGTAATTAAAGGtgttg aaaacatgaaaaatgataCCACTATTATAGTCAGCGTTTTAAACGCTCTA GAATATTTCCAATTCTGTTTGGCACGCGGTACAGTCGTTGAAGAACGAAT GTTGACTTTGAATTTCGATTGCGCCGAAGATTCCCATAGCTTCTTAAAGC TTTTATAATAGCTGAAGCCTAATCCGCTCATGACGCATAGATAAATAATC ATAAATATAATCGACATAAATTTGGGGCCTTTTTCTCTTGGTACTGAACA AATGTATATCGTTGGATCAAATACGTACCAGCCTCTAAACACCATAATAA CGATGCAGAAGGGGATGGGTAAAACCCAGACCAAACTCACAATAATCTTG ATTCTTGGTTGACTGTTTATCCAATCGAGTCTGCTAATTCAACATATTTT AATGTAACGATTGACACTGATAGCCAGAATGTTGAACAATGATGATGTAA ATACAGCCATGGTTACCAACCAAGCCTTGGATTTGACATACTTCGAAACC AAGAGTCCATTGCCGTTTTCCTTTGGCTAGAGCATAAATCACAAAAATTA AGTTCAATGATGTTAAAATGTCTAATATAGCCATATTAAATGTAAAGAAC ACTCCTGTATCAGAGGCCCAGTCAGATTCGCCCCGGTCGATAACCCGGTA TAAAAATCGAGTGAAGAACAATGGAAATCTCAACCCTGGCAAAAAACGAG AACTTTATCAAAAGCCCCGATTTTGAAATAGCACATACCCAGGGAAAAAT ActgacttttgaaaattaccGATTTTATTGACCCAGCGATTGAAATCTTG GTCACTGATCACTTTGTTGTTGTGGTAGATAAGAATGTCCAGTAAATTAC CGACAACTCAAACCAGAACGATTATAAGTAAATAAATCGTAACTGGAATG ATAACCACGTCATTCGACGTGGCTTGATCCATTGTCATCGTCGTCGATAT CCAGGAAATTCAATACCAAAGCTTCTATTTAACCAGTAAAAATGACGACA TGATAATCCTACTAAAGTGCGTGATCGATCACTAGAATCCAAGAGCATTT TTTATATCGAAAGCTCCCAATTATTCATCGTCTCACCAGAAAAGGTGTAG ACTTATAGTAGCTTTTGCCTCCTTGGTAAAATTTCTTGGGAGATCTTTTA ACGTATGTTCCCTGTGGTCTTTTTCGATTtctctgtttttcttttgttaa cgAAAATTGACCTCGTTTAAGTATAATTCACCTTTTTATTGTCAAACTTT CAATCATTATCTATTATTATTCTATTTTTTCACTATTTCGTGGCTTGCTG CAGGTGGTTGTAAAGTGGTCGCAAAAAGATGGTTGAAATATTGATCAAAT GAGATTATTTTTACTAGATTAATAAGATTAGACGTTCGTTTCCCTTTTGT TTATGTCGGTTTTTTGAACCTggttggaggtcctataaactAACCTTTTT CCGTTcattcgtccgtccgtctgctACAAGATTtcctcgggattggctca ttagcttttctttttttttcgctaaAAGATGCATATTAGCAAGGCCTGAA ATGTGAAACAGcccaattttttaagaatttctttccagcttaatatgccg gaaatcgccattttttcgcgaatttttttgaatttttttcttacatatct ttattttttcttactttgaaaaagttttaatttcaaaacgTCGAATTAAA TATggcgctttctttgttttcacgcgtactttttctgaaaaccggcgatg gattttattttcaatccggcgtttgtatGAAAATCACGGGTCACCCGGGT CACGGTTTTTGGATAGCAAatataagtggcttcatttcctatCCAAGAGA TTCCTCTATAGCCTCTTCGGCGTTCTAAGCTCAATGGTCCAGTCATTCTA GCTTTCTGCCTATGTATCAAATTCGCTTTGTTCTCATTTAGGCAGCATTC AATGCTAACACTCTTGGTTTACCAAAGCTTTGTCCAGCAGAAAACATTGA TATGATGAGTCAAAAAGTCTTGAAACATTTCATTCAACGATACTATCGTC CTGAACGAATCACCATAGCTGGCGTTAACGTGGAGCATGATGAATTGGTC AAACAATGTGAGAAATATTTTGTGGACCACCAACCAGGATGGCTTGGAGA GAACATAGTGGATCCAGACGCCTCGATTGCCCAATATGTTGGTGGCCTAT TGAAGGtaatcttaggttccaaataaacgggggaagGCGGTTGGAAAGTT TTCGAGatttaaataaacggggggacctaattgccgaaaatctgaaatct gaaaatattcttaaaaattaataaacggggggggggggggggtgggtgtg gtcctaataaggtcaagggtggttggaaaattttcgaaaattaacaagcg gggggaggcgtttatttggaacctaagagtagggTTTCAGTTCGTATTCA CCAATCATCAACTTATTTGAGATTTATTCAACTTTTTAGGAAAAGCGGTG TCTtatatattgtcttatatatatttatatataaGCTATAGGCTTGTTGT TGGAGGGGCGTTGTAATCTTTTAGACTACCTTTTCCCATTGTGGATTATT GTTATTAACAACTTAGTTTCTGTATTCAGCTTACTGAAGATTACAGAATT TTAAtgctaaaaaaaagaagataaagcAACGAAAGTGCTAAGCATAAGCT ATAGGCTCCTTCATTGTTGAATTTCACAAGTTTGCTTGTTGCTTTTCTGA AACCTAGCGttgtaaagaaagaaattatgctttttttaaatttattgttT AGCATCGGAACCTGTCTATCAAGgttcaatttattttcaaagaaaccaGT GTGGGCTTGAAGCATTCGTTAGATGATGTTGGTACAAGTTTGCACGTTAC TAAGCCTTATGAATGTCTTACTATTATTTTGCACCAAGTAGAAAATGTGC Gttttttttgacctaccccggtggggtggaggtcctataaattaacccgt gttcgttagttagttagttagttagttagttaccaacttttctcgagatt ggctcattcaatttttctgattttttgcacaaaggtgcattactataaac cctcgaatgtgacggagcccgattttcgaaaaaaaattttttccggccgg tagaaccggaaatgtcccgaaaaaagcggttttttgagattttctcgaga ttttatcattagttttttgcgattttttgcacatagatgcacattagtac tgccgaaaaggtgtcgaaaaccgtttgccgaaaaaaaattttttccggtc tgtagaaccggaaatgtgccggaaatcgtcgtttttttcacatttccgtc acattttttcaacttatttaattgtttctttacagaaaaatgttccttAT Gacgatgcccaaaacttagcattgtttgatttccaaaaaaatcatccttt gaatccggaactccttaaaaatcgccggaacaggcgaaaaccggcgtaaa acggttttccttcattttttcaacttatactcgacagattttcatgattt tttgcacaatgatgtaaaatggcaatgcccaaaatgtgacagagcccaat tttcgaaaaagAaatttttccggccgctagaaccggaaatgtcccgaaaa aagcggttttttgagattttctcagttttaattttctctgaatgattgat taaagtgtcgatattatttttctttcaccgttaaacatcgatgcgtttct taattgctttctccgttccaatagatatataaatcgaaatttaaaattat acattacttccattaaattctaattattcgttttataaataggtaggtcc attaaagtattacttgttcgTTCTAGGATCACCGGGAAGCACCTCGTTTA CAGCCTGGTATCACACAACTCCCTGAACTCCTGCACGTGGCCATTGGTTT CGAAAGTGCAAAATACACCGAACAAGATATGTTTGCATTTGCAGTTCTCA ACATGTTACTTGGTGGTGGTGGATCTTTCAGTGCTGGAGGACCTGGTAAG TATATGTTATCTATTATCATAATGGCATCAACCACTTTATGCTTTCGCTT TAGTTTTTAGCGTCTACAGTGTTGAAATTTCTAACAATGATAATTCCTTA CTAATATAAGAAGCCATGGTTACCGGAATCTCGGAAATTTTAAGAATAGT TTTAAATAGTCAAGACTCGCCGTTTCTGGTTTTAGAACTGTATATTTAAG TTAATAGTTTCTAATCTGTTCTTCTATTATATCAAGCTGTAAAGAATTAT TTGAACTAACTATTTTGTTAATAATGGTCAATAAGTCAATAGCAATGGTC AATCCtgaactttcaatattatccaTATAATGTCTTAAACTGATGCTACC TTGTTTAATATGCCAATATTTGGACCCTaatacaggcccggcggaagcgt ggagactggggagactctTTTGAGCAAAATAGACTTTTTTCTCCAATTCA TGGCGAATTCCATCTCATTTAGATCCTTTAGCCTCTCCACTTTtatggtt gttccgccgggcctttAATATGAACagtttattttcaaatgaattaACAC CAAGATCACCTTTAATGAAATTCATACATTCTCGCTTAAAATCTTAGGAA AAGGAATGTACTCTCGCTTATACACGAATGTGTTGAACAGAAACCATTGG ATGTTCGCCTCAACCGCTTTCAATCACTCGTACGCCGACAGTGGCTTGTT TTGTATACATTCAAGTGCTCATCCGTCGGAGGTATTATATTTATCTTGGT GCTAGTGCGaacagttgagctagaatctgacaatgtgtgcttgtctgtct gtgtgtcacaaACGCTTTAGGACAGCCTGTTGCTGTTTCAATGTAACTGA TTGCATCGCTGTAATTCTTCTTCCAGGCACGAAAAATGGTTCGAGTTATC ACAGAAGAATATGCGAAACTGGTAACCGAACCCTTCAATCAAGCAAGTTG ATTTAAAGTCAATTCGAACTTCTatgattcgaatctttctttctcCTTCT ATTGAATTAGAGATGGTTTGTTGAAGATTGTTGATAGTTTTGTTGGAACt actttttaaaacaaaatattggCTTTAAATCTTATCCAGTATTTTATATT CTATATATGTCCCAATGTCCATTGAATATGAAAAGGCTTTTATATAAATA AATTCTTACTACTGGCAACTATCTTCAACACAATAAAATCTATTGAATGA AATTCTGCGTCTAGGTTGAAGTAGCACGAGCGAAGAAACAAGCACAATCA ATGTTAATGATGAATCTTGAATCACGAATTGTACGCTTCGAAGATATCGG ACGGTAACATAATTATTTATGATAAATAATGAAGgtttataaatttattt aattttgtggTACTTAAAGTGTAAAATTCAGTGGCGTGGTGACAGGAGGG CTTTCCCATCCCAGCGGCTTATTTTTTAGGGGCGCCAAAATACAAAGGGC GCaaaaaaaGacgcctctgattactaatttcggcgcccctttgctttttt acaTTTAGGAACAGCAGTTTTCGGCCGAAAAGAGAGCAAATACCCAAAAC TCAGAAGTTTTTGTACTCTTTTCGCTACAATAATTTATACaaagatattt acttttaaAAACCACGCCACGCTACTGGTCAAATTAGGATTTCTTCTTGT AAAGAATCGGGAAATGTCAATGAAAAGGTGTGGTGAATCTAGACGGGCTG AGGACGATCTAAccttttacaaaatttatctttttttttagacAAGTGCT TGGACTAGGCAAACGCATTCAACCACAAGAACTTTATGAATCCTTAGGTA TACAACCTCTTCTTTCCCATCCAGAGACTACTTGTTTGATTTTAAAGTTC ACCGTTAACTGTACTAATCTGTAATTATTACAACTTCTATAGTTATGTCA CCAATCTCAGTATGGTTTTAGAAATTAGGATTTTAGATTGATTCTCTATA ATAATTGTACGTAACTTTAAGTTTCGTGGTTCTGTACTTATATTCAAATG TACACGAAGAAGTGATCTGTGTTTGAACAATTGTGcgttcaaaagttaaa aagtaagAAGGGATAATCAATCAATTAAAATATGTTTAAACAAAAGgata ataaatataaaaaaaatactagttttagatattataattttttgaaattt cagatgCTGTGACTAGCGAGGATTTACGTCGCATCTCAGAAGAAATGTTG GCCACA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000022_pilon:1258529..1274834+

>XLOC_044817 ID=XLOC_044817|Name=XLOC_044817|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2868bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000022_pilon:1258529..1274834+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atggcggTCCGGCTGCGATCGAGTGCTCACATGGTGAAATTTAGAAgctt
tttttcacaatttatttGGTCTAAACGAGCTTTATGCTCTCTTCCTCCTT
TAAATGAACCGCTTGACATAGAAAACATTCATTCCTCCACTTCCAACACA
ACAGCTGGTAGTGATGCTGTAAGGATAACAACCTTATCAAATGGCTTAAA
GGTTGCATCAGAAAATTCTTTTGGACAGTTTTCTACCATTGGAGatggcg
gTCCGGCTGCGATCGAGTGCTCACATGGTGAAATTTAGAAgctttttttc
acaatttatttGGTCTAAACGAGCTTTATGCTCTCTTCCTCCTTTAAATG
AACCGCTTGACATAGAAAACATTCATTCCTCCACTTCCAACACAACAGCT
GGTAGTGATGCTGTAAGGATAACAACCTTATCAAATGGCTTAAAGGTTGC
ATCAGAAAATTCTTTTGGACAGTTTTCTACCATTGGAGctttaattGACT
CTGGCTCACGATATGAAATCGATTACCCAAGTGGAACAACTCATATGCTT
GAAAAACTTGCTTTTCAGctttaattGACTCTGGCTCACGATATGAAATC
GATTACCCAAGTGGAACAACTCATATGCTTGAAAAACTTGCTTTTCAGAG
CACAGAAAACTTCAAGGACAATGATGAAATTGTACAAAAGATGGAAGCTT
TGGGAGGACATGTAGATTGCCAGGCATTCAGAGCACAGAAAACTTCAAGG
ACAATGATGAAATTGTACAAAAGATGGAAGCTTTGGGAGGACATGTAGAT
TGCCAGGCATTCAGGGATTGTGTAGTATATGCAGCTTCAGCTTTGAAACA
TAATGTTGGAGGTGTCATTGAAGTTCTCAGTGATGCAATTTGGAGATCTA
ACTTGAAAGATCTGGAGGGATTGTGTAGTATATGCAGCTTCAGCTTTGAA
ACATAATGTTGGAGGTGTCATTGAAGTTCTCAGTGATGCAATTTGGAGAT
CTAACTTGAAAGATCTGGAGATTGAGGAGCAGAGAGAGACCATTCGTTTC
GAGCTTGAGGGATTGGATTTTCGACCTGACGTTGAACCTGAGTTGACAGA
TCTCATTCATGCCATTGAGGAGCAGAGAGAGACCATTCGTTTCGAGCTTG
AGGGATTGGATTTTCGACCTGACGTTGAACCTGAGTTGACAGATCTCATT
CATGCCGCAGCATTCAATGCTAACACTCTTGGTTTACCAAAGCTTTGTCC
AGCAGAAAACATTGATATGATGAGTCAAAAAGTCTTGAAACATTTCATTC
AACGATACTATCGTCCTGAACGAATCACCATAGCTGGCGTTAACGTGGAG
CATGATGAATTGGTCAAACAATGTGAGAAATATTTTGTGGACCACCAACC
AGGATGGCTTGGAGAGAACATAGTGGATCCAGACGCCTCGATTGCCCAAT
ATGTTGGTGGCCTATTGAAGGCAGCATTCAATGCTAACACTCTTGGTTTA
CCAAAGCTTTGTCCAGCAGAAAACATTGATATGATGAGTCAAAAAGTCTT
GAAACATTTCATTCAACGATACTATCGTCCTGAACGAATCACCATAGCTG
GCGTTAACGTGGAGCATGATGAATTGGTCAAACAATGTGAGAAATATTTT
GTGGACCACCAACCAGGATGGCTTGGAGAGAACATAGTGGATCCAGACGC
CTCGATTGCCCAATATGTTGGTGGCCTATTGAAGGATCACCGGGAAGCAC
CTCGTTTACAGCCTGGTATCACACAACTCCCTGAACTCCTGCACGTGGCC
ATTGGTTTCGAAAGTGCAAAATACACCGAACAAGATATGTTTGCATTTGC
AGTTCTCAACATGTTACTTGGTGGTGGTGGATCTTTCAGTGCTGGAGGAC
CTGGATCACCGGGAAGCACCTCGTTTACAGCCTGGTATCACACAACTCCC
TGAACTCCTGCACGTGGCCATTGGTTTCGAAAGTGCAAAATACACCGAAC
AAGATATGTTTGCATTTGCAGTTCTCAACATGTTACTTGGTGGTGGTGGA
TCTTTCAGTGCTGGAGGACCTGGAAAAGGAATGTACTCTCGCTTATACAC
GAATGTGTTGAACAGAAACCATTGGATGTTCGCCTCAACCGCTTTCAATC
ACTCGTACGCCGACAGTGGCTTGTTTTGTATACATTCAAGTGCTCATCCG
TCGGAGGAAAAGGAATGTACTCTCGCTTATACACGAATGTGTTGAACAGA
AACCATTGGATGTTCGCCTCAACCGCTTTCAATCACTCGTACGCCGACAG
TGGCTTGTTTTGTATACATTCAAGTGCTCATCCGTCGGAGGCACGAAAAA
TGGTTCGAGTTATCACAGAAGAATATGCGAAACTGGTAACCGAACCCTTC
AATCAAGCACGAAAAATGGTTCGAGTTATCACAGAAGAATATGCGAAACT
GGTAACCGAACCCTTCAATCAAGTTGAAGTAGCACGAGCGAAGAAACAAG
CACAATCAATGTTAATGATGAATCTTGAATCACGAATTGTACGCTTCGAA
GATATCGGACGGTTGAAGTAGCACGAGCGAAGAAACAAGCACAATCAATG
TTAATGATGAATCTTGAATCACGAATTGTACGCTTCGAAGATATCGGACG
acAAGTGCTTGGACTAGGCAAACGCATTCAACCACAAGAACTTTATGAAT
CCTTAGacAAGTGCTTGGACTAGGCAAACGCATTCAACCACAAGAACTTT
ATGAATCCTTAGatgCTGTGACTAGCGAGGATTTACGTCGCATCTCAGAA
GAAATGTTGGCCACAatgCTGTGACTAGCGAGGATTTACGTCGCATCTCA
GAAGAAATGTTGGCCACA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_044817XLOC_044817-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000022_pilongenomesc0000022_pilon:1258529..1274834 +
Properties
Property NameValue
Aaloc1384-1434:16256
Aaloc1327-1380:15843
Aaloc1237-1323:15315
Aaloc1171-1236:14977
Aaloc1039-1170:14700
Aaloc868-1035:13927
Aaloc604-867:11992
Aaloc511-603:8417
Aaloc409-510:7738
Aaloc325-405:7169
Aaloc247-324:6773
Aaloc1-243:1