XLOC_042867 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_042867
Unique NameXLOC_042867
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000064_pilon:1313452..1325316-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_042867 ID=XLOC_042867|Name=XLOC_042867|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=11865bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000064_pilon:1313452..1325316- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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CTTATTCATTTTTAAACAGGTTTGTCACACGGGTCAATTTTATTCCATTC CTCAAATTGAAGCGAAAGAGACAGACACCTTTGGAGAAGTTGAAGTTCGC AAAACAACTGACGACTTTAATACAACCAGAAGCTTCATCAGTTTTTCTAA AGTATTTAGAATTAGAACCCGTTATCGAATCCGCCCTTGAAGATGACCTA ATGATATCAATCAATGAAAAGTTAACCAGCCAAAGCATCTTTAAGGCAGA TGATTCGAGGTCGGATCAAAATTATGCATTGCTGTTTTTTTTTACAGGAA AGGTTAGTATAAAATAGCAAACTCAAAGGTCTGCCAGGATTTCGATCATT GGAAAATCATCCAGATTATCTATAGAAATTCTGATTCTCTTCGCTTTGTT CACTTTAGTCACTGAACCACTGAACATAATCAGGGTATTTCGATGACGTT TTTATATTAAAAGTATATATTTTCAGAGAGCTTATGATTTTCTACATCTG ATCAGCCTATTATGACAATTTTTGAAAAAACGGAGAGAAAATTATTTTGG ATGCCAAAATTAACGAAGAAACAGACATAGTCCGCTTCTAAGAGCCACGA ATCCGGAGTCGAAAAGTTTTTAGTACTCTGATAGAAGAAAAGCTCGTTAT TTCAGCTAACGATTTCAAAAGAAACAAAATGATATGGTATACGAGCATAT ACACCTTTTCGACCGTAGTCGCGTGCCGCTTTATTATTTGATTTACCACC CTCAACTCAATCAAATCCTGATTATTATTATTTATTTAGATACTAGAGAG GGCAGGCTTCCAAAAGGCAGAAATACTCAATATCATAACAATCTTCATGG AGAAACACCTTTCTCCCTTTTTAAATGGAAGTGACAAACCCACCGAAGAA GTGGTAAAGGACGACGCCCTGGTGCAGGAGATGCTCGTATTAATAAAACA GGCGTCCACTTTGAATGAGGTAAAACTCAATGAACAAATTCTATTACCTT AAGGGCTCTGACCGTTGTGAAATTCTCATTTTTGTCATGTACCAAATTTA GATTTCTGCCTATGTAGCCAACAAAACTATGGCATGTTATATATATTTTA GTTAGACCAACTATTCCTGAATCTGAAAATTTAAAAATTGACATGAAAAA AATTGATGAAGAGGAAAATGTAGACCTTCGCGAAGAAGAGTATTTTAAAC ATTTAGGACCTTATTTTCGGCAAAGAAAAAAACATTTTGAAAAAATATTT GCGTATTATATGGTGTATCTTTAACCAAACTAAAAATGTATTTTCGGAAA ATTTCTTTGTCTCGAAATCTGTAAAAAAAAATGTGGCTTCCAATAGCATA CCGTCGCGAATCTAAAAATAGACATTGATTTTTATGTTTGACTGAAATTC AATCTCATCACCCTTTGCGTTTATTACGCTTGCACGCAAATTACACCCAA TTACAAAGGACTGTGGGATTGAATTTCGGTCAAATGAGAGAACTAATAAT CATGACTTTTGCATGACGAAGCGCTATTTTTCGTAGAAAAACGATCATTA TTCTTGATATATTTCCGAAAAATTTCAAATAGTTCAACTTTTTGCGGACA AAAAACTTCGAAAGAAAAGCTTAATTAGCCATTGAAAGGGTAATTTTATC AACGTCTTTTTAAAGTCGTTTTTACGCTAATTGCTCTGGGGATTTGAAAA ACATATCTATGTACAGTACAGGGTGTCCCTAATTAAAGTATCGAGTTTGA ACATGCGATTGAGTAGAAAAGTTTATGTGTGTTATAGCTAAAATATAAGA ACGTTCTCCATCACACAGGCTTATTACAAAAGGTAGTTACAACGTATAAA TTAATCGTAATGACAAAGAAAAAAGAGGGAGAGCTTAAAATACAATTTTG TGAACACGCACATAAAACTTTCTACTCATAGTTGTGTTTCGACTCGATAC TTTGATTAGGGACACCCTGTATGTACAAGGCACAAAATAATGAGTTATAA TACTTTTCTCTCTTTCTCCTTATAGAGTCGCAAATTTCAAAAACGTTGCT CAAAGTCGAAGAACAAGGATTGCAACGAAAATTGTCTGGTTGTTAGCCTC AGCAAAATCAACGCCCTTGTCAATGGAAAATTCACTGACGCAAAGATCAG ACGAGTCATTAAATTGATTCCTACGAAAAATTTGGGGTGCTGTGGAAAAA AGTTTTTTACAGGAGATTTGAATGCAAGCGGCAACAAAGAAGAGCTTAAT TGCATTCACATCAAGTTGTCGGTGTTCGATGACGCGTTCAAGAAGCTCTA TCCTAAAGGTATCATAAATATAATCTTGATCAATTAATTGAAAACTAGCT TTTTGGCACAAGGGGCCTTAGAGAATTCTCTAAAAGATTCAATGCGTCGA TGACGATTCAACCTTTACCTGAATTAGACATTAGGCATTTCTTGAACCCC AAATCTTTATATGGATTTACAGAAACAAGATGTGGATATATCACAGGGAA AAAACTACCTAGGGATGTTACCTTATTATTGAAAAGTGTTTTTCTCGAGG GGACCCCACTAAAACTCCATATGGTTACCCATATTCATATAAAATCCTTC CTTTGATAAATTATGGAAAGCTGGTAAAAAATGTGGCATTTGGTATTTCG AATAATTGAGGGTTTGAATAACTGGGAGTCTACTGTATATTTCTAGGTGC ATCCAGTACGGTCATTACGAAAAATCAAAACGAAAGTCTATCAGAAGGTA AAGCTTCCTTTTGTCATTACCAGGGGTGTGCCGGGTTCGAAATATAAGGG GTTATTAATCATATTAATTTTCTGAAAGTGTTTTAAAAATTACCATTATG GACCTTATATATAGATTTATGTCAAATATCAATAGGTCACTCGTCTTTGA GAAAGAAATTTCGAATAATTGAGGGTTTGAATAACTGGGAGTCTACTGTA TATTTCTAGGTGCATCCAGTACGGTCATTACGAAAAATCAAAACGAAAGT CTATCAGAAGGTAAAGCTTCCTTTTGTCATTACCAGGGGTGTGCCGGGTT CGAAATATAAGGGGTTATTAATCATATTAATTTCCTGAAAGTGTTTTAAA AATTACCATTATGGACCTTATATATAGATTTATGTCAAATATCAATAGGT CACTTTACCAAAATTTGACCCCAAGACTACAATTTTTTATCAATATTTTT TGTATATAGAAGAAGAAGAAGTCGATTATGACACCGCTACAAACCTTGGT AAGCTTCTAAACTTTGAATCGTAAATGAGCACACGCGTCGAATCCTAGAC CTAGAAGGTTAAGACCTAAGGAATTATCAAAGACACAGGAATAGTAACAG ACTATTTTTTGCAAATTTCTCGTGTACAAGCCTTGTGTTCACAGTGAGAT GTTTTGTCCCCCACCCAGATGGGGTTAAAGAGTGAGATGAGTTGAGATTG GGAGTTTGGCTGTGTTGTATTTGTCCAGGTGTGTTTGACATTTTTTGTTG TGTGTTTGCTTGTTTGCTTTTTTTAAACATCACTCTACCCCACTACCACC TCTCTTTCTGTTTCAAAGTTCAGGTAAAATCCTGCCAGCCGAAAAGAAAG TCTTGGACTCTACTTCCTGTCCATAATTGCGAGAAAGTTATACGTATAAA ATCTACCAAAGCACATATGCCATTTTAATTTAAAGTATTTTTTATAGACA TGCTCTTTGATCAAAGTCCTGAAGAAAGTACATCCGGTAGTAGAGGTATT AGCTAAATTTTTAATTTTTGTCCCCAAAATAATATATTAGTTGACATGGC ATCGCATAATGGCTGAATGGCATATAGCTCCGCTCTTTTCAGTCAGTATA GAACATCATAGCCCGATTTGACGAAATATCCGCATTTGACCTCGTTTTTG AACTTCGATCAGTTAAAATGACTAAAACAATAAAATTTAAATTCGACCAA AGATTCGCTATATTTCTTCTTTTAAAAATAGAGAATAAAACTTGAGTCAG CTAAAATAAATTAACAGTAAATAACAGTAAACTTCAGGTTGCTGGGATGG AGCATGTTGCATTGCACCAAAGCGAAAAAAACTTCTCGTATCCCCAAGCC CTAAATGTACAAAATAACAACAACAGAAATGCAGAGCTGCCGTCCTGCTC TGAACCTGTTATTAAGCTTTCTTTTATTATACCTATTACAATATAATTAC CATGTCAGGTCAGGCCTCAGTTATATAAAATCATTGGATCCTAAATAGTG GACACAACTCATTTCTTTTTTTAAAACACCCCCTTCTCACAGACCCGGTA GAATTTTTTCAGTCATTTTTTAAAACACCCCCTTCTCACAGACCCGGTAG AATTTTTTCAGTCGTTTTTTATGACCGAGGATTTAAATTCTTTTGTTTTC AAGTCAGAAAATTCAGTGGGGATGGTAAAAATAACATAATATTTTGCAGT GGGGATTGGTTCATTTGATTATTTTCAGTGGACACAAAAATTAGAGGATA ATTTTTCCGCCGGCGACGATATTTTGGCTAATTTTTCCAGTGGGAAGCGT TCCCAGTGGGTCTGTGAGAAGTGGGTGTTTTGAAAAACCCTTTTGGAAGT ATCTCTAAAAAGAAGATGCCTCTAATTAGTGGACATCTCCCTGATGCCGT CCGTTAATTAGAGGTTTCACTGTATTCTAAATGTAAAAAAATTTATATGA TAAGATAAATGGTACATTGTAACAAATCCTTACACTCAGCCGCAGACGGA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000064_pilon:1313452..1325316-

>XLOC_042867 ID=XLOC_042867|Name=XLOC_042867|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4092bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000064_pilon:1313452..1325316- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCAGATGCAAAAGAAGAACAAACGAAAAAAAGATGGCAGATGCAAAA
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TCGTATGTTTTTGGGGGAGAAGAAGGTGACAAATTGGGCCGTTAAAATTA
TTGGGGCTGTTTGTTTTAATGGCACGGTAGAAGGCTACATCATAGAACAC
CCCCCGTGCACTTTATATGATGAATCCAAAAAAAAAACAACACTGGAGGT
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GGGCCGTTAAAATTATTGGGGCTGTTTGTTTTAATGGCACGGTAGAAGGC
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TCAAATACTGTTCGGACCAGTACCTGTCCGATTATCTATTGAAGATGACG
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CAACTTTCACCGTCCGTTTTTTTAAAAAAGATGGGCTTACTGTAAAGGAG
GTGTCAGAAGAAGAGTCTGGCTATGTTGTTACAGGAAAGACCTTCACACG
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TACCTCGTAAAACAAGGATCAACTTTCACCGTCCGTTTTTTTAAAAAAGA
TGGGCTTACTGTAAAGGAGGTGTCAGAAGAAGAGTCTGGCTATGTTGTTA
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GGATTTCACAACCTTATCCATTTTGTTAGAAATAACACCGGTGCTAATTT
TCCGGCAGCTGCTCAAATTTTTGGAGCAGCTTTTATGGCGCTGAATTTTC
AGTCCATTGTTAAATGCTTTGGGTTTGCACCAATCCCCATTGTCATTGGT
TGTCCAGGGGTGACAAAATCAACCATGACAAAGCTAATTTTACGATCAGT
GGGAGTAGAAGGAAATGTCTTTGAAAACTTGGACGGTGGATTTCACAACC
TTATCCATTTTGTTAGAAATAACACCGGTGCTAATTTTCCGGCAGCTGCT
CAAATTTTTGGAGCAGCTTTTATGGCGCTGAATTTTCAGTCCATTGTTAA
ATGCTTTGGGTTTGCACCAATCCCCATTGTCATTGGTTGTCCAGGGGTGA
CAAAATCAACCATGACAAAGCTAATTTTACGATCAGTGGGAGTAGAAGGA
AATGTCTTTGATCCAACGTATCCATCTTTGGTAGAACTGATATCGGGTTC
CCCGATACCACTGTTATGGGAAGATGCAGAAAATTTTTCTGTTCTCGGAG
ACTTGGTCATGCTGATTTACAATAATATCCAACGTATCCATCTTTGGTAG
AACTGATATCGGGTTCCCCGATACCACTGTTATGGGAAGATGCAGAAAAT
TTTTCTGTTCTCGGAGACTTGGTCATGCTGATTTACAATAATTCTCAACG
ATCAAAATGTGATAAAGCAAGCCAGCCTCCACAATCTATGCCAATTTGTA
CCACCAATGGCTGTTTTTTGAAGAAAATTAACGATCCTGTTAAGTATGAC
AGTCTCAACGATCAAAATGTGATAAAGCAAGCCAGCCTCCACAATCTATG
CCAATTTGTACCACCAATGGCTGTTTTTTGAAGAAAATTAACGATCCTGT
TAAGTATGACAGGTTTGTCACACGGGTCAATTTTATTCCATTCCTCAAAT
TGAAGCGAAAGAGACAGACACCTTTGGAGAAGTTGAAGTTCGCAAAACAA
CTGACGACTTTAATACAACCAGAAGCTTCATCAGTTTTTCTAAAGTATTT
AGAATTAGAACCCGTTATCGAATCCGCCCTTGAAGATGACCTAATGATAT
CAATCAATGAAAAGTTAACCAGCCAAAGCATCTTTAAGGCAGATGATTCG
AGGTCGGATCAAAATTATGCATTGCTGTTTTTTTTTACAGGAAAGGTTTG
TCACACGGGTCAATTTTATTCCATTCCTCAAATTGAAGCGAAAGAGACAG
ACACCTTTGGAGAAGTTGAAGTTCGCAAAACAACTGACGACTTTAATACA
ACCAGAAGCTTCATCAGTTTTTCTAAAGTATTTAGAATTAGAACCCGTTA
TCGAATCCGCCCTTGAAGATGACCTAATGATATCAATCAATGAAAAGTTA
ACCAGCCAAAGCATCTTTAAGGCAGATGATTCGAGGTCGGATCAAAATTA
TGCATTGCTGTTTTTTTTTACAGGAAAGATACTAGAGAGGGCAGGCTTCC
AAAAGGCAGAAATACTCAATATCATAACAATCTTCATGGAGAAACACCTT
TCTCCCTTTTTAAATGGAAGTGACAAACCCACCGAAGAAGTGGTAAAGGA
CGACGCCCTGGTGCAGGAGATGCTCGTATTAATAAAACAGGCGTCCACTT
TGAATGAGATACTAGAGAGGGCAGGCTTCCAAAAGGCAGAAATACTCAAT
ATCATAACAATCTTCATGGAGAAACACCTTTCTCCCTTTTTAAATGGAAG
TGACAAACCCACCGAAGAAGTGGTAAAGGACGACGCCCTGGTGCAGGAGA
TGCTCGTATTAATAAAACAGGCGTCCACTTTGAATGAGAGTCGCAAATTT
CAAAAACGTTGCTCAAAGTCGAAGAACAAGGATTGCAACGAAAATTGTCT
GGTTGTTAGCCTCAGCAAAATCAACGCCCTTGTCAATGGAAAATTCACTG
ACGCAAAGATCAGACGAGTCATTAAATTGATTCCTACGAAAAATTTGGGG
TGCTGTGGAAAAAAGTTTTTTACAGGAGATTTGAATGCAAGCGGCAACAA
AGAAGAGCTTAATTGCATTCACATCAAGTTGTCGGTGTTCGATGACGCGT
TCAAGAAGCTCTATCCTAAAGAGTCGCAAATTTCAAAAACGTTGCTCAAA
GTCGAAGAACAAGGATTGCAACGAAAATTGTCTGGTTGTTAGCCTCAGCA
AAATCAACGCCCTTGTCAATGGAAAATTCACTGACGCAAAGATCAGACGA
GTCATTAAATTGATTCCTACGAAAAATTTGGGGTGCTGTGGAAAAAAGTT
TTTTACAGGAGATTTGAATGCAAGCGGCAACAAAGAAGAGCTTAATTGCA
TTCACATCAAGTTGTCGGTGTTCGATGACGCGTTCAAGAAGCTCTATCCT
AAAGGTGCATCCAGTACGGTCATTACGAAAAATCAAAACGAAAGTCTATC
AGAAGGTGCATCCAGTACGGTCATTACGAAAAATCAAAACGAAAGTCTAT
CAGAAGGTGCATCCAGTACGGTCATTACGAAAAATCAAAACGAAAGTCTA
TCAGAAGGTGCATCCAGTACGGTCATTACGAAAAATCAAAACGAAAGTCT
ATCAGAAGAAGAAGAAGAAGTCGATTATGACACCGCTACAAACCTTGAAG
AAGAAGAAGTCGATTATGACACCGCTACAAACCTTGACATGCTCTTTGAT
CAAAGTCCTGAAGAAAGTACATCCGGTAGTAGAGACATGCTCTTTGATCA
AAGTCCTGAAGAAAGTACATCCGGTAGTAGAGAGTTGAAACGTTTAACGG
ACAATTTGTCAAAGAATGAAACGGTCCTGGGCAAAAGAGCAAAAAAAGCG
AAACCATCTTAGAGTTGAAACGTTTAACGGACAATTTGTCAAAGAATGAA
ACGGTCCTGGGCAAAAGAGCAAAAAAAGCGAAACCATCTTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_042867XLOC_042867-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000064_pilongenomesc0000064_pilon:1313452..1325316 -
Properties
Property NameValue
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