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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000031_pilon:1104050..1106387+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_045255 ID=XLOC_045255|Name=XLOC_045255|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=2338bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000031_pilon:1104050..1106387+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTCCGGTTGCTAGACTAGTTATGGCTATCGTTCACTTACTCCTTGG
CTTTATTGGGCTTCCTACAAATGGATTGGCAGCTTATCTAATCATCAAAA
CAAGACAGTTTGAAAATCAATCTACCAGATTGGTCATGTATCTTTCTATT
TTTGATGGAATTGGTATGTGTTTTGTGTTTAATTTTAGATCTATATtgta
tactctcgggtacctaatagccgggggccccgctaattaaatttttcgaa
cattttccaaccaggacattcttatttcaacccccccgcttattgatttt
cgggaaattttttttgaatgttccctcttttgccctaattctgctgtatt
agcctctttttcgaaaattttccacccaggacatatttattccaaccccc
ccgcttattaatattcgagattttttccaacccccctgcttattccaaac
cccccggctattaagtacccgagagtaaaggCGCATCTCACTCAGTGCCT
TGGTCGAACATTTTCCATATCTATCttaaaattatatcaaaattcCAAAG
GAGATAGAATATCTACGTTTAAAGCTAAAAAACAGAAGGGATGAGttttt
ttCCAATGTTTGCCTTATCCCCGAAGGGATTGAAATTACAAGGTACTTGT
ATCAAACGGGAGGCTCTGTGACCCAAGTGTAGTGAAAAATTGACTGTTGT
GTAACTTTTCTCTACCATTTTTCATTGAAGGATCCATTATCATAAATGGT
GCATCAGCTATGTACATGTTAGCTTACGAAGAAATTGATTGCGTCATTCT
TTTGGTTGTACACGGTATTGTCAACCTATCAATTTTCTGTTGCTTTTcca
ttattgttttgattggttttGATCGGTTATTGAGGATCTTGTACCTGAAT
GATTACAGTTTGGTTTTCTCTGAAGGTACGTTTAATGTATTTATTtgttt
gggacacactgtacaaTTAATCAATTAAAAAACGGATAAAGGATTCCTTA
AAAGGGAACCAATTTTCGTGGCAACTAATTTTCCTAATCAATTGAACATG
AATATTTAAAAAGTCCATTCCCTTTACAGACCGGTCTCCAATTGCGTGCT
CTGCGATCAAACTTTTTCCAGCAAATCTTCCAAGCTATTggctaaaagaa
aaatgaaacaattccaTTGGTACCAGCTGACGCGACTTTCTCGAGCGCGC
TACAATTTTataacgtaatcttttttccaagctaaaaggattgaagccaa
aaggatGAGATCCCAGCATTAGCAAGAAGAAACCGGCCTTAAGTGTATAC
TCTTTTTGGTACCATGTAGAAACCATGTTAGCATAATTTAGAGTAATTGC
CTTAAGGGTGGTTTCAACCGAGCGCTCACTTTAAGCAAATAGACATTAGT
AAcgaaaagttttatttctttACTTAATGTTTAAGTCGGtatgaaaaatg
ccaaaaaatttgcaaattttacttaaaagtggcgttaattttgaccattt
ctctcaaattaaaggattttaggtatgattcgaagaaaATTGCGTGTATC
TCGTTCGGTAAAATGTGCGCACGATATACTAAATTGGTCCTTATATggct
aaacatttttttaaattcagtgtTTTGTGCATGACTACATGACACCAAAA
CCTCGGGTTTCCTCAGATCGCTCTGTTCGCACTAAATCCTCATATTGCAG
CAAGAGAGCTCctatgattggtttgttttccctattttcccacgcgtttg
tttttttgaaccGGTTGCTATTacgaaaagtttaatttttttacttaaTG
TTTAGGTCGGTATAAAGTTTCTCTCATTGTCGCCGCCGTGTCTACAGTCA
TCCAATCCATCTTGATTTTTATCGGGTTTTATATGTTCGGCTACGGGTAT
GCAACAATGTTCAGTCTCCCGATTAACGTTATCGGGTTAGTATTCATGAT
CATCTGTTATTGCATGTCGATCAGCAAGTTGAAAGAAATGAATGAACGCA
GCCGACAGATTTCAAATACCGATCGCAGCGTAGTCCGTATCGCATCTTTA
CACTTGGCAATGTTCGTTTGTTGTTTTACTCCGACTGTGATCTGGCAGGT
GGTTAATAAGCTACTATTATCTAAGTTTTTACCAGGTTATATTGATATTT
TGGTTGTGTTTGGTTTATATGTGTTGGTATCTGTCCATTCGTCTTTCAAT
GGTTTCATCTTCCTGACCGTCAATCGTGAAGCACGTCAACAAATCTTGAG
ATTCTTCAACCAGGTAATGCAAAGATTAAGGCGATTTTTCAATCGGGAAC
AAGTTGCACCAGCAGTGCCTGTAGAactaaataattga Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000031_pilon:1104050..1106387+ >XLOC_045255 ID=XLOC_045255|Name=XLOC_045255|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1782bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000031_pilon:1104050..1106387+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTCCGGTTGCTAGACTAGTTATGGCTATCGTTCACTTACTCCTTGG
CTTTATTGGGCTTCCTACAAATGGATTGGCAGCTTATCTAATCATCAAAA
CAAGACAGTTTGAAAATCAATCTACCAGATTGGTCATGTATCTTTCTATT
TTTGATGGAATTGATGGCTCCGGTTGCTAGACTAGTTATGGCTATCGTTC
ACTTACTCCTTGGCTTTATTGGGCTTCCTACAAATGGATTGGCAGCTTAT
CTAATCATCAAAACAAGACAGTTTGAAAATCAATCTACCAGATTGGTCAT
GTATCTTTCTATTTTTGATGGAATTGGATCCATTATCATAAATGGTGCAT
CAGCTATGTACATGTTAGCTTACGAAGAAATTGATTGCGTCATTCTTTTG
GTTGTACACGGTATTGTCAACCTATCAATTTTCTGTTGCTTTTccattat
tgttttgattggttttGATCGGTTATTGAGGATCTTGTACCTGAATGATT
ACAGTTTGGTTTTCTCTGAAGGATCCATTATCATAAATGGTGCATCAGCT
ATGTACATGTTAGCTTACGAAGAAATTGATTGCGTCATTCTTTTGGTTGT
ACACGGTATTGTCAACCTATCAATTTTCTGTTGCTTTTccattattgttt
tgattggttttGATCGGTTATTGAGGATCTTGTACCTGAATGATTACAGT
TTGGTTTTCTCTGAAGGTCGGTATAAAGTTTCTCTCATTGTCGCCGCCGT
GTCTACAGTCATCCAATCCATCTTGATTTTTATCGGGTTTTATATGTTCG
GCTACGGGTATGCAACAATGTTCAGTCTCCCGATTAACGTTATCGGGTTA
GTATTCATGATCATCTGTTATTGCATGTCGATCAGCAAGTTGAAAGAAAT
GAATGAACGCAGCCGACAGATTTCAAATACCGATCGCAGCGTAGTCCGTA
TCGCATCTTTACACTTGGCAATGTTCGTTTGTTGTTTTACTCCGACTGTG
ATCTGGCAGGTGGTTAATAAGCTACTATTATCTAAGTTTTTACCAGGTTA
TATTGATATTTTGGTTGTGTTTGGTTTATATGTGTTGGTATCTGTCCATT
CGTCTTTCAATGGTTTCATCTTCCTGACCGTCAATCGTGAAGCACGTCAA
CAAATCTTGAGATTCTTCAACCAGGTAATGCAAAGATTAAGGCGATTTTT
CAATCGGGAACAAGTTGCACCAGCAGTGCCTGTAGAactaaataattgaG
TCGGTATAAAGTTTCTCTCATTGTCGCCGCCGTGTCTACAGTCATCCAAT
CCATCTTGATTTTTATCGGGTTTTATATGTTCGGCTACGGGTATGCAACA
ATGTTCAGTCTCCCGATTAACGTTATCGGGTTAGTATTCATGATCATCTG
TTATTGCATGTCGATCAGCAAGTTGAAAGAAATGAATGAACGCAGCCGAC
AGATTTCAAATACCGATCGCAGCGTAGTCCGTATCGCATCTTTACACTTG
GCAATGTTCGTTTGTTGTTTTACTCCGACTGTGATCTGGCAGGTGGTTAA
TAAGCTACTATTATCTAAGTTTTTACCAGGTTATATTGATATTTTGGTTG
TGTTTGGTTTATATGTGTTGGTATCTGTCCATTCGTCTTTCAATGGTTTC
ATCTTCCTGACCGTCAATCGTGAAGCACGTCAACAAATCTTGAGATTCTT
CAACCAGGTAATGCAAAGATTAAGGCGATTTTTCAATCGGGAACAAGTTG
CACCAGCAGTGCCTGTAGAactaaataattga
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000031_pilon | genome | sc0000031_pilon:1104050..1106387 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 361-891:1808 |
| Aaloc | 166-357:733 |
| Aaloc | 1-162:1 |
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