XLOC_012059 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_012059
Unique NameXLOC_012059
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000023_pilon:861835..875198-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_012059 ID=XLOC_012059|Name=XLOC_012059|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13364bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000023_pilon:861835..875198- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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CCTAATATTTTCAACTAGGCAAAACATTTCTCAGATAAATTTCTTGAGAT ATAGACTCACAAAAGGGCACAAGAAACGATCATTCAAACAAAGCAATCTT TTCTTTTTTTTTAATCGTAAGAAAATGCCCAAAATATTTTGAAAGTTTGA TCCGGACTGCAACAAGAGAAAGACTTGATAGAGTAATTCACAAAGGTTAT ATTGTACGACTTCTTATTGATTGAAACACTCTTTTGCACACGATTCAGTT TGACCCTCGATGTCCACTATTTGAAGGGAAAATGATTGGTTTTTGACGAT TTTGTGCAACAGAAACTGTCCGTTAATTGAGTGTCCGCCTTTTGCAAACC TTTTTATAAGGATCAGTCTAGAAACCTGCCGGGGAAAAGCATTTTGTCCG CTGATCAGAGGTTCTATGTATTTAAAGTCTATTCACGATAAGTGTGCACT CTTTTTTCATTTACCTATAACTTTTGAAGGAATTCCTCAATCTTTATAAA TTTGGTATCGTTGGAAAGAAATTAGTGAGTGGAACAATTTGGAATAAAAA AATCTATAAAAAATTCTAAAAATGAAGATGAAAATGAAGAAGAAAAAAAT GAAGATCTTGTAGAAAGGTGATATAACTATCATTTTCACTGAAGTGACAC CTTCATTATCGAACGTCATCACTGTGAAAAAATTTCTCAAAAATAATCAT TCAGTCAAAAGATATCAAACAAAGTTATAAGCTGATTGACGTCTAAAAAC GCTGTTTTCTGCTGTTTTCTGCTGTTTTTTGGGGTCAATCACTTATTAAC TTAGCATCATAACTTTATATTGAATAAATGTTTTAGTGAAATTTTTTCAC AGTGATGACCTCCTAAGATCAAAGAATCTCTCCAGTGAAAATGATAGTTA TAGCGCTTCTCTACAAGATCTTCATTTTTCTTCTTCATTTTCATCTTCGT TTTTAGAATTTTTTCAAAGACTTTTTTACTTCAAATTGTTCCACTCACAA ATATCTCTCCAATGATACCAAATTTATAAAGAACGAAGAATTCCTTCAAA AGTTATAGCTAAAAGAAAAAAGAGTGCACACTTATCGTGAACAGACTTTA ACTTCTCTGTTTTGTTTTTTTAATTTAGGTATACCTACTCGAAGAATTAT TGAGTCCTTTGTTGACACCGTTCCTGTTATGTTTCACTATAAGACACAAA TCACAACAAATTATTGATTTTTATCGTAATTTTACTGTTGAAGTCACTGG AGTGGGAGATGTGTGTTCCTTTGCTCAAATGGATGTCAGAAAACATGGTC ATAAAATGGTGAGTGGAAAGCTTAACCGGACTATATTGACTAGTTTTTGC AGGGTCTGAAAAAATCGGATCGAGTGAAGAAAGTATTTTAAAGAAGGCTT ATACAGAAGTATTCGTGACAAAAGTATTAACGCTCAAAAATTTTCTCAGG GAGTTTAGAATGAAAAGCCCTGTGTAAGAATCTTCAAAATTTATATAATT AGCAGGAGAGACGCTTATTAGGTACACAAAAGTAGTAAAGTAACTTTTTT GACCGCAATCAAGGGTGACCGTTCCTTTATGTAAGCTATCTACCAAAGTA AAAAGATAGGGGTCACCTCTTTATCCCTTGATTTCTTCACTTTTCCCTGG ATTTCTCCATGGCCTTGTGAACCTCAGCCAAACACTCTAACTCTATACTA TGCCAGCGCCAAAAGAACACTGTCTTTTCCATTTTAGTGGATGAGTGGCC ACGAAGCGGAACAAGAAAAACAACAGCAGCCGCAAGACCATCAAGTATTC GAGGATCTCGAAAAACAACAAGCTGAACATGGGAAAACTGAACTCTCTCT CATTCATTTCAAGGTATTACAAAACTTTTTTTTCTAGCCTTTGAAAATAA CACACAATATTTTTTGTGACCGAGATTTCCGATGTTTGCCTAGATTTTTT TTGAGAGATAGAGTTGATAGAGTTGATTGCTACAGTATCGACATATTCGA TATTTTTATTGATTTTACCCCTTCAAACCAAGCTTAATAGGGTATCAAAG GCATTTGGGGCTATGATTCAAATTTGCCAATTTTGTTTCCAACTGGATTA ATTTTAGCGACATTTTAATTCGCGTTTTCGCGAAAAGTATAATAGCGGTT GTGAATTGATGTGAATCGAATTTTATTGTTTTGTAAAATTGGTTCTCTCT TTTTCGATTTCAAATTACTGGAAGAGAAGAATAAGAGAAAACATTTTACA CGGATTTTCCAGCTGAGGGAGCAATATATTTGAGCTCGATTTATAGGGGT TTGAATTAGAAAGAGAGAGTTGACTCAAATCTTTTTCTCATTTTTTCTAG TATAAAAATCCAACATGGGAGCCGACAAACAGCGGAAAACAATATATTGA AAGCGTCCGAGAACACGGTATGTGCTTTTGAACTAACTTTTCGAAAAAAA AAAGCTCAAAATTAATTGCTGAAATCATGCGCAATGATAGACTTGAAAGT GTTTTTCAGTCTGAAACTAGTTTAGCAAGCTAGACGACTAATTTATACAT AGTAGAAATAAAGCAAAAAGTAATGGAGGGAACAAATTTTAGTCGTCTAG AAACCTTTGTGCACTAACTCCAAACAAAAGAAAAGTGTCAATATTGCAAT TAGAATTTTTTCCTGCTCAAAATAATTCTTGATAAAAAAAATATGTGTGG ATTTGTGTATTGAAAGTTTTTCATTTGAGTTGATTTTGTTTTGAGAGTTT GTTGTTGCTTGATAAATTGTTTTCTCGCTACGCAAGTTTCTGCGTAGCTA GCCCCTGTATCTATAAGGCTGGAACACCGGATTCTTCCAGTCGTTTATAC AAACTAAATCCCGTATTATTATTTTTATTATAGGTATTATTAGTATTACA CGCATTATAAACGACTCCAGTCTAGCCAGAAACTATTTTGTCCACTTTTT GCACTTTTTGAAGCTCAATAGCTTAATAGTCTCGAGTTAGGTAGAGAAAT CATATATAATCGCAATATATCTCTAGTCTTAATTGTTTGAGAGCTTTCCT AAAATATACAACAGGTCTCTTTTCTCATGCTAAAATTTTCATTAAATTTT GACCCTTTGATCGTCATATTTGTCCGAAAAAACACACCAAAATGTCCAAA AAAATTGGCACCTATGTTATTTTGATTCCCTTACCCCTTAACTTTCCAAA AATGTATAACATGTGCTTTGACTAAATATATCGAGTGATTTTACAAATTC CCCCCTATTAAAAGACACTAAGCAATCTAGAATGTAAAAGTATCGTTTTC CATAACTAAAAGTAATAGTCCCGCTGCTGAGGTCGATAAATGTTTCATTT CGTGACACACATCTTAGAACTAACTTTTTTTGGTTTATATAGATTCCAAA ATCAAAAAGTTTCCACGATATTATCGTGCAAGTAACGAGTAATTGGCGAT TTTTTGCGTTTCCAGGCAAAATTGCAAGGCCTGGAAATTCATGATTTTTG GGGGGTCTTCAAATTAAAAAAATACCTATATCACATGATAGAGCTCTTCA AACTGAGCAAAAAAGTGTATTACACCAAAGTCCCAACTTCTCTAGATCAA AATTTATTGGCCTATTAGTGGTAAAAAACTGATGGAAAACAGGGAATTTC CCCACAATCTGCATTAATTTATGCAAAATTAAACACCTTTTTGACCACAA ATAATTGAAAATTATTTTGTGCGCCAAAATTAAAAAGATTCGTGAAATCC GTTCGTTTATATTTAAATGTATTGAATAGTTGGAACCTCTTAATAATATT TTACTTTCGTTACTTTCCAGCCCTCCAAGAATCGATGACTGCTTCGATGC ACCACAGTCATTTTCTTCAAAGACAATCTTCCCAATCCAATTATGTAAGT TCCCTTTCAAATTTCAGCCAGTGAGTAACTTATCAACCAACATATTTTTT GTGATTTGCCGTCGGGAACGAGAAAAGAAAACGGCTAATTGGGGTTTACT CAGACTTTATTAAGATGCAATCCCTTGAAATATGATTTATCAATTTTTCC ACAAATTAAATTTTTACAATCAAATAGAAAATTCGTCAAAAGAACTCAAG AACATTTAAAGCTCCAGTTCTTAGAAACATAATATATCAATTTTTCCACA AATTAAAATCTTAAAAACATTTATAGTTCTAATCCCTAAAAATGTGGTAA TCAATTTTTCCACAAATTAAAGTTCTTACAAACATTTAAAGTTCCAAGCC CTAAAAATATGGTAATAAATTTTTCCACAAGTCTTACAATCAAGTACTAG AAAATTCGTCAAAAGAACTTTAGATTATCGTAGCTTTTTCATTAACGACA AGACTCATTTATTCTTTGTAGAAGAGTCCCTTACCAGGTTGGTTTAGTGC AGATGGTTCTTTGATAGGCTAAATCAATATTGAACGTGCTATTTAGAGTA TTTTAAAAAATGGAAATCTTAATTAGGAATTTAATATACCAGGTCCTGCC AGGTGCCTGGAAACTCCCCCTCCCCTGTTATATTTTTCTAACCCCGGTCC TTATTATGCCCTCCCTGTCGTTTTTTATAAGAACTTTTGAAGAATTTTTT GAAGCCTTGGGATGTTCTTAACTTTTAAGCATAAAAATGTTCTTAACATG TTCTTACTCTCACCATTTTGTGAGCCTTTTTGTCCATTTTCTTAAGAAGC ATGGCCGTGCCGTTTTAGAGTCTGCAAAGCCTTAAAATGTTCTTAACTTC TTCTTAAGATTTTGAACATCGAAGCCTTGTGTTCTTATATAGTTTGTTCT TATATTAAAAGAATGTGTATTGAAAAATATCCGGGACACCCGGGAGTTAA CAGTCCCATATGATTACCCTTGTCAGCGAAGACATTTAAATGAAAAATAA GTTTGAATAGAGCTCAATTTCAAAATAGGGACAGGCGGTAAATATTTTTA TTGTGAGAGCTTCAAACACAGAGTTTCCATTTAAACTTTATATTTGTTTT TAAAATTTTCAAGCTAGTACAACAGAGTATTCGACAGTTTAATGAGCTCA ACTTTTATAAGGGAACTCTACTACTGTCAAGTCTTGAAAATCTTTCTTCA ATGATATCGAATATTTTGCTGGAGGCTCATCGCAACAGTATTTCGCTTAA AATATAAATATAAACTTCGAAAAAACAGTGAATTTTCGCAATTTCGATCG CAATTTTCAATTTTATTATTTGAATATTACTATATTTCGAGCTAATTCTC ATTTCCTGTCAAGGGGAACCCTTTATAAAATACTCTCTATAATTCGAACA TATTAAACTTACCGTCCGACAATAGTTAAATGTATAACAAAGTAGCTTAC AGTTGCAACAATTGAAATGGAAGAAATTTTGGCTTTGTTGGCCACCTTAT CTGAGGTTCGGTCAGTGTGCATCAAGACATCGATGGTGTACTTATCCTTT GGGATCATTGGAAATTTGATGATCAGTGCCTATTTCATTGGAATCCAAAA AAACAAAATGGCCAAAATGAGTACTTATCATTATTTAATCATCAAATTAG CCAACATTGACCTACTCGTATGCTTGTTGTATGGATTTATAAACATATCG ACAATAGCTGAGGCTGACTATATGGTTTCACCTAGAACAAATGTTGTATT TTTCCTGGCAGCTATATACCTTCCTCTGAAGACACTGTCTATATGTGTTT TAATGCAAATCTCATATTTGAGGTACCAAAGCATTGTACATCCTTTAAGA AAACCATGGAATAAACTTCGATTCACATTTTTGTTCATCACTGTTGGTAT TTTTAGTGTCGGTCTGTCAGCTACGCACGCCACGATTTATTATAAAGGAT GGATAAAAGATTTGGTATCGGGCAAAGATGCTACATTGTGGCCTTTACTG TCGTTCATTTACAAGATTGTATTAGCCTTTACCGATTTGGTGGTACCGAT CACTGCTATGGTTTTCTTTTACTATCGATCTTGGAGAGTTTTAAATGAGA AATCAGTGGCTGTAAATTCGAATGAAGAAGAACATATTAGAAGAAGAAAT AAAACGGCTTTGAAAGCTTTGAAATTTCTTCTCTTGGTTTATGTGATATG TATTTTTATACCAAGTCTTTTTGACTTGGTTCTATACCTATTTGTATTGA ACGCGCAGCAGTTCGACCACTTCAGTCCTCTAAATTTGAAATTACAGATG ATACATAACGTTCTATTTTATAATTTCTCGATACAAAATTACGTCTTGAA TTTCGTGGTCTATGTTGCTCTAATGAAAGACTTTCAACGATTTGTAAAGA AGATTTGGTTCTTTTGGTTAGATTGAAGTAATGTATATGAACCTATACAG ACTGGGGTCGTTTATAATTTGTGTAATACAGTAATATTGGTGTTATATGA TAATTTTATACATAATTTTTAAGGGACAGAATCAGTTGTATAAACTACAA TATTGGGTTATTCCTGAAATAGTTTGTACCCCCATGTTGAGGAGGTGTGA CGTTCAGGGTGGTCTGGAAAATAGAAAATCCAGAGTGGTCCGGTTTTTTT AATGAAAAAATCCAATTTGGTCAGTAAAATTGGGTTGCGAATCCAGGGGA GTCATCTATTATAAAGGTCGAATTGCCTAGCATCTCACGCCATAAAACTA ATTGTGGCGCAGACTGAAAGAAGAAGTGGACAGAAGAGAAATTTCCTGGG GAATTCTGTGAATGACTCCTCTGGAGTCAAGCTTTGAAGAGAACCAAGCG GGAGGAAAGCCTCAACACTGCATGATCTCAAAAAAGAAAAATATATGCAT AGCCCATTCCCCCTTTCATTATTTTTTGGTTATTTTCTACTCTTTAAGAA TTGGTCAAGTAGAAAGCTAGACTCGAACCTATATGAATATAGATGGTCCA TATTAAAATCGTGTCAATTGAATTCTCGTATTCCATAATGATCGCTTGTA AAAATTACGAGCGTCAAGAGCCCTGCTCCTTAGGAAACCCCTGTTTCTAC TTTCTATGGGAAACTTTAGAATAACTAGAATAAACGGCATTTCTGAAAGG TTAGCCACCAGTCATTTTTTGATATCTTCATGATGGAATGATTTATACGT ACAGTTGACTCTTTCTAATCCGATCTTCGAGGGACCAAATATTTTCTTCG AAAATGAGAAAGATTGTAGATGAGATGGAGTTTATAAGATACTTTGATAA TTGTTTTATTACTGGTTAACGACCAACCAAATCAAATAAGAGCTTGTAAA AACTTCTCCCAAAGATTCGAAGTACAGTGAGAAATCTATACCATTCCCAA ACTAACGGGCCGATATTTTAGTTTGAAAGGTTTGAATAATAGAGGTTCGA ATTAGAGAGAGTTGACTGGATTGTAAAAATTAAAATCGTTCTGATAAAAA AAAGCGTGTATTTAAGGAAATACTTGAACAACTTGATATATATTCTCAAA TCTGTTCTCACTTTTAGGGTCAACCAGGATTTTCGAGTATGAATAATGAC TACATGACGACATTTATTGGATTGCAATCACTGGGTTATCCTTCTCTCGA ACCGAGTACGGCAATCATACCCGAACAAGAAGATGCGCTAATGAATGCCA GTATGATGTACGCACACGGTGTAAGTCGGTTCATATAATTAGTTTTTGCA GGGTTATTTAAAGTGATAAGGCGTATAGTCTAGCAAGCTAAACGACTAAT TCAGACATAGTAGAAATAAAGCAAGTAGGTATTATGTAATTCTGGTTGTA ACTTCCCTTGATAAATATCTATTCATTTTTTCAGATGCATGACCGTCAAC AAACGTCACTATCCGGACCACCCACCTTAACGAACCAATCAGAACAAGGA ACTAGCGGTAACCCACAGCAACCATTGCGCCCCGGTGTCCAACGGGAATG GAGACTACCCTCAAGTGTCGGAAGGTAAGATGGGTTTTCAGATCTGAAAT GTCTTTTAAAGGTGCTTTGGTTTGACTTTTGAAGATCTGCATGTTACCAA CTTTTTCGAGTTTCTCGTATTATTGCTAAACCAAAGCTAGGTATGTTAAC AACTCGAAGTGCTTTTCTTTATTGGAGAATTTACAAAATAGCTTCTGGAG CACTCTAGCGATATATAAAGCTATGTACGTCACAATTTGGAACATTTGGA ATTGGAAATTTCGCTTGGATTTAATTTCGCAGATCTACAATGGGCTCTTC CAGAAAAAATCCGTTCATGGGGGGTGGAGGATGAATTGTCCAGGGGTATT GAAAAAATACCAAAAAGTTGCCATGTCCAGGGGGTAATTCCAATGTCCAG GGGTAATTTTTTGTGTCCACGGGGTTGATTTGATGTTTGTCCAGGGGTAT AACCCGTGTCCAGGGGGTTAAAAATCAAAATGTCCAGGGGTAATTCATGA AAAAAATAATATATCCTCCACCCCCCATGAACGGATTTTTTCTGGAAGAG CCCAATCTTACACGATTTCGCGAGATATATTTTCGCAAAAATGACAAAAA TTCTCTCATCCGATTAAAATATTTCAAACTAAACATTGTTTTAATATTTT CTTTTGTAGCAGTGGGCATGAAGAAGACAGCCATCTGTGCAAAACGAATG AATCACTTCTTTAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000023_pilon:861835..875198-

>XLOC_012059 ID=XLOC_012059|Name=XLOC_012059|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1866bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000023_pilon:861835..875198- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CAGAATATAATATACAACCCAGAGACGTTGATGCGGCAGATATTACATGT
TTGTCATTATATACCGGACACGTGGAAAGGGAAAGCTCATACTTTGCATG
TTCGCGAAGAATTCTCAAGACTTTTCCAATATAAATTTCAGAATATAATA
TACAACCCAGAGACGTTGATGCGGCAGATATTACATGTTTGTCATTATAT
ACCGGACACGTGGAAAGGGAAAGCTCATACTTTGCATGTTCGCGAAGAAT
TCTCAAGACTTTTCCAATATAAATTTGTATACCTACTCGAAGAATTATTG
AGTCCTTTGTTGACACCGTTCCTGTTATGTTTCACTATAAGACACAAATC
ACAACAAATTATTGATTTTTATCGTAATTTTACTGTTGAAGTCACTGGAG
TGGGAGATGTGTGTTCCTTTGCTCAAATGGATGTCAGAAAACATGGTCAT
AAAATGGTATACCTACTCGAAGAATTATTGAGTCCTTTGTTGACACCGTT
CCTGTTATGTTTCACTATAAGACACAAATCACAACAAATTATTGATTTTT
ATCGTAATTTTACTGTTGAAGTCACTGGAGTGGGAGATGTGTGTTCCTTT
GCTCAAATGGATGTCAGAAAACATGGTCATAAAATGTGGATGAGTGGCCA
CGAAGCGGAACAAGAAAAACAACAGCAGCCGCAAGACCATCAAGTATTCG
AGGATCTCGAAAAACAACAAGCTGAACATGGGAAAACTGAACTCTCTCTC
ATTCATTTCAAGTGGATGAGTGGCCACGAAGCGGAACAAGAAAAACAACA
GCAGCCGCAAGACCATCAAGTATTCGAGGATCTCGAAAAACAACAAGCTG
AACATGGGAAAACTGAACTCTCTCTCATTCATTTCAAGTATAAAAATCCA
ACATGGGAGCCGACAAACAGCGGAAAACAATATATTGAAAGCGTCCGAGA
ACACGTATAAAAATCCAACATGGGAGCCGACAAACAGCGGAAAACAATAT
ATTGAAAGCGTCCGAGAACACGCCCTCCAAGAATCGATGACTGCTTCGAT
GCACCACAGTCATTTTCTTCAAAGACAATCTTCCCAATCCAATTATCCCT
CCAAGAATCGATGACTGCTTCGATGCACCACAGTCATTTTCTTCAAAGAC
AATCTTCCCAATCCAATTATGGTCAACCAGGATTTTCGAGTATGAATAAT
GACTACATGACGACATTTATTGGATTGCAATCACTGGGTTATCCTTCTCT
CGAACCGAGTACGGCAATCATACCCGAACAAGAAGATGCGCTAATGAATG
CCAGTATGATGTACGCACACGGTGGTCAACCAGGATTTTCGAGTATGAAT
AATGACTACATGACGACATTTATTGGATTGCAATCACTGGGTTATCCTTC
TCTCGAACCGAGTACGGCAATCATACCCGAACAAGAAGATGCGCTAATGA
ATGCCAGTATGATGTACGCACACGGTATGCATGACCGTCAACAAACGTCA
CTATCCGGACCACCCACCTTAACGAACCAATCAGAACAAGGAACTAGCGG
TAACCCACAGCAACCATTGCGCCCCGGTGTCCAACGGGAATGGAGACTAC
CCTCAAGTGTCGGAAGATGCATGACCGTCAACAAACGTCACTATCCGGAC
CACCCACCTTAACGAACCAATCAGAACAAGGAACTAGCGGTAACCCACAG
CAACCATTGCGCCCCGGTGTCCAACGGGAATGGAGACTACCCTCAAGTGT
CGGAAGCAGTGGGCATGAAGAAGACAGCCATCTGTGCAAAACGAATGAAT
CACTTCTTTAACAGTGGGCATGAAGAAGACAGCCATCTGTGCAAAACGAA
TGAATCACTTCTTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_012059XLOC_012059-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000023_pilongenomesc0000023_pilon:861835..875198 -
Properties
Property NameValue
Aaloc886-939:55
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