XLOC_035885 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_035885
Unique NameXLOC_035885
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000263_pilon:119101..132845-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_035885 ID=XLOC_035885|Name=XLOC_035885|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13745bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000263_pilon:119101..132845- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AGAAATATTAACCTGTTAGGTGCTGCTGGAGTTGTATGAGATTGTGGTCG TGTTACAAAAATACAGGCTGTTTTTAGGATACAAATAATATCTCTGAATA TCTATCTGAAACTTTCTCCAGACCTTCCCCATAGGATGCTTATGCCTCAG GAAAAAGTCACCTAAAATTGCCCGCAGCCAAACGCCCACGCCATAACTTC TCCAAAAATCTTCTTGATACATAGAAAGGCTATTGTTTTCGCTAGATGCG AAATTAATGATATAATATGTTATATACAATTAAATTGATATAATAATAGT ATACCAAAGCTATTCTGCAAGCTAAATCTGCTCTGAATAATTTTAAAATT GGCAAAGATTTTTAAACAGAGCGCGGGCTACATGTGCTTTTCTGCCAGAA ATGGCAGAAATACCTTGAGTGGATAAATTTTGGCGTGGATTTAATTTGGC GATTGGCCAAAATACAAATTTTGGCGAGGATTTAATTTGGCGATAGATCA ATTTTGTAAAATTTGACGAGGATTTAATCTGGCTTATTGGAAATTTTTCC ACCTGAAATAGTGAAAATTACTCAAAATTATACTAAAAAGTTGTGATTTT TGTTAAATTTGGAGGGGTTTTAATTTGGTGAATTGCCGAATTTGGAAATT TTGGCGAGGATTTAATTTGGCGAATTTTGGCTGAATTCGCCAAATTGGCC AAATTTAATCCCCGCCAAAATTTATCCACTTAAGGTAAATATATTCATTT TTTCACCAAGAGACACTTTGAAAATTCTTTTGATTGCTATAAATTGGCAG TTCACAGCTGGAGTAACATGTTGATTATCACATTTGTGATATTTATTGCT CTGACAGTTTTTTTTGGGTATTTCATTAGGTACTTCATGGATGGGCTCCA TGCTTTACAACTACCTGCTACTAATCGCACTGACTCAACTTCAGTATTTT 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ATTTGTCCGTCTGTTACCAGCTTTTCTCAAGATTGGCTCATTAGTTCTTT CTGATTTTTGGCACGAAGATGCAAAATGGCAATGCCCAAAAAGTAGTGAT GGTTTTCGAAAGAGAAAAAAATTGGGCAAATTTGGTCTAAAAATCACCCT AAAATAGGGTGACTTTTAGATTTTTCAGATTTTTTCCAGAAAGATAGGTT TTCGAAAGAAAAAAAAATTAGGCAAATTTGGTCTAAAAATCACCCTAAAA TAGGGTGACTTCTAGATTTTTCTGATTTTTTCCAGAAAGAAAGAGGGCAA TTTGTTCCAAAAAATGGCCAAAACGATTTTCCCCGGAAAATTCTTATTCA CCGTAAAAAGCCTTATGTGACTTTTCTCCAAGATTGCTTAAGTCAAAATC ATGAGCTTCTGAAATCATGAGCTTCTGAAAAATCACCAAAAGTAGTTTTT GTTCGCTAAGAGTATAGATGAAATAGTACGTATCAAATTTGTTATCTCTT TTGTCGAAATGTTTGGCTACACACATCCAATATTAGGTATATATTAGATA TATATCTTGACTAGGGGATACTAATCGTGTATTAACTTCCCGTCTGAGAG TTACCTCCAATAACCTCTGTCAATTGAAATTTTAAATATCTATTCTATAA AACTTACTAATCAAGTTAATTAAGTTTCTAAAACTCAAAAGACGGGGTAA TTTCTGGATGGGAATTTTATACACAACATCCATCCCCTAAATCAAAACAA CAGAGGGGATGCGTGCAGCCTAGTGAAGTGTTTAGACCTAAACTATAGAT CGAACAAAGCACATTCAAAACTCGAGGATAAATAATTCTTCTCTCTGCAG TTCTCCAATGGTTGTGTGTGAAAACAAGGGAATTACTTTTTTCAAGCTAG CTTCAAGCCAAAATCATGAGCTTCTGAAAAATCTGCTGTACCACTGCAAG 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000263_pilon:119101..132845-

>XLOC_035885 ID=XLOC_035885|Name=XLOC_035885|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1296bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000263_pilon:119101..132845- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAGCTTTTGATATTGATATCGATCATTAGTTTTGTGGCTGGAGAAAG
CTTGGTCTTGACAAAAGACAATTTTGACCAACATGTAATGGACCCATCTA
AAAATGTTTTGGTTGAATTTTATGCTCCATATGAAGCTTTTGATATTGAT
ATCGATCATTAGTTTTGTGGCTGGAGAAAGCTTGGTCTTGACAAAAGACA
ATTTTGACCAACATGTAATGGACCCATCTAAAAATGTTTTGGTTGAATTT
TATGCTCCATGGTGTGGTCACTGTAAAAATCTTGCTCCAGTATATGAGAA
AGTAGCTGAAACATTCAAGAATGAACCAAAGGGTGTGGTCACTGTAAAAA
TCTTGCTCCAGTATATGAGAAAGTAGCTGAAACATTCAAGAATGAACCAA
AGTGTATTGTTGCGAAAGTTGATGCAGATTCTGAAAAAGAAATTGGCTCA
CGTGTATTGTTGCGAAAGTTGATGCAGATTCTGAAAAAGAAATTGGCTCA
CGATTTAGTGTCAGTGGTTTTCCCACCATCAAGTTTTTCTCGAAGACCAA
TAAAGATGGAGAGGAGATTTAGTGTCAGTGGTTTTCCCACCATCAAGTTT
TTCTCGAAGACCAATAAAGATGGAGAGGAGTACTCTTCTGGACGATCTGA
GCAGAATTTCATTGACTTTTTGAATGAGAAATGTGGCACCAATCGTGTGT
CAGGAGGTGGTATTGATGATAAGTACTCTTCTGGACGATCTGAGCAGAAT
TTCATTGACTTTTTGAATGAGAAATGTGGCACCAATCGTGTGTCAGGAGG
TGGTATTGATGATAAGGCTGGAAGAATCGATGCTTTTGACACAGCTGCAG
AAACCTTCATGAAGAATCCAGCTGGAAGAATCGATGCTTTTGACACAGCT
GCAGAAACCTTCATGAAGAATCCAGATGAACGGGAAAGTTTGATCGCACA
ATTGGCCGATACTGCTGCTGGTGAAAGTGATCCCGAGATGAACGGGAAAG
TTTGATCGCACAATTGGCCGATACTGCTGCTGGTGAAAGTGATCCCGACT
ACAAAAAGTCTGGTGAATACTATGTCAAGGTTATGAAAAAGATTCAAGAG
AAGGGAAACGAATATGTCACTAAAGAATTAGCTCGTCTTCAAAGAATGCT
TGGTGAGATTATTTCTTTGTGACTACAAAAAGTCTGGTGAATACTATGTC
AAGGTTATGAAAAAGATTCAAGAGAAGGGAAACGAATATGTCACTAAAGA
ATTAGCTCGTCTTCAAAGAATGCTTGGTGAGATTATTTCTTTGTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_035885XLOC_035885-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000263_pilongenomesc0000263_pilon:119101..132845 -
Properties
Property NameValue
Aaloc526-648:124
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