XLOC_039300 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_039300
Unique NameXLOC_039300
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000086_pilon:423348..440763+

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_039300 ID=XLOC_039300|Name=XLOC_039300|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=17416bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000086_pilon:423348..440763+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCTTCTGTCCAAGAAAAGACCAAGATCAAAGAGATATTCTCAACATT GGCGGAGTCTGATGCTTCAAATAAACAAGAGAAGGAGGAGAAGGATCCTA ACATGTGAGTTTTTGATTGTTCATTTCCTTACTGACTTCGCTTTGTTTTA CAAGCCATGTATATaagccagacccgatcaatcgaacttgtcgaaccaat cgaacaatcgaactaatcgaactccatcgaacgattaaagttcgattaaa taaattaatcgaactctaagatttttttaaagattgtgagtgttcgatta agttcaatcaatgggtttcggttcgatcagttcgataaaccaattttgtt cgacaagtttgtgctgctccaccaccgtatattagcttcttttcaaagcc aaaatcggaatgtaaatcgggaaattacttccgataacggattacacact tttcctgtatccttttagcgccagaagaagcggtttgttggggcgggcgt agtattccgccactcggccgcgcgcgaaattgcaacagaggggctacgga ctttttttCCGGATAAACAAATATCCGCGTACAATAAAaatcaagctgtt aagtccgggaactgtcgaaatgggCAATCGTGTGCCAGGagaaagttttt gcaagcgagggaagatatgaggattttaatatcatcgaactattcgaact ttttactgaccgaactaatcgcactgctattgcttcaaaaattgtgagtg ttcgattaggttcgattaatttttttaatcgaactttaatcgttcgatgg agttcgattagttcgattgttcgattggttcgaaaagttcgattgatcgg gtctggtatgaggaccctgccgacgcaccggacttaacgaacaccggaca cgcgaaagtccggtgtaaattgagaatatttttttccaccggacaatctc tacaccggacttgaccagtccggtgcgtccggtgtttcttaattttttgt ttcgtaaatgtccggcgtccaaaattccctgtatgcaacaccggacttat tgcgtccggtgtagcgaaaggatactttttgccaccggacaaatacaccg gacagtccggtgcgtcggcagggtccttgtATATAGAGTTAAGTCACCAG TGCCACGAACGACCCCAGTGCACGAACAAgcgtctttgaacttgaaaaaa acaaccaaaaactttCTATAGAACTTACTTTGTGCCgcagaatagacctt ttcgcctttccgtccgccatcttgaattgtatgcaaaaatacaggaacaa aaatgccgtggttggatttatttggaatgtatgcaaaacatatgcaagtt tacacaaagattaaaaagacaacaaagcatcttataaataaatattataa tcattagaacaataaaagatggaatttcttaatccaaaaagaaatattta cagaacaacaaaagccttttaggaatttgttcttaaagacattgcatatt ctgttttcatgccataaaaaaattccacgaagacggagtacacactatca aactttcaaaacacgcaaactgaaagcagtaattatgacgtcacactttc tcaatgttttgatttgatcatttggtggctctattcccaggagaataatt tgcagtcagccgaataaggattgttttttaccttcgcggatgatttttca gtttgagtttctgtctaatgttatggtcttttgaaatgcttgttctaaga gatgagtgaatataattgtttttagttttcaagagaagcaaatttaatct ttcttctacaagattacactttaatacaatgccaattatgcatgtaagtt tttaattcatactttcttttagcatatgttttgcatactttctaagggaa tttcaccacggcaattcggccaccataatttttgcatacaattcaatatg gcggatggaaaggcgaaaaggtctatcctcaaacagttacatcaatatgc cttcttacctgtctttaaaaatataaatataagtaatcacggaaacaaag gacgcaaaaaaaaaagacttaaggtggcaatcaaaaatatgttccattcg ggtcctaaaacatcttcaaatccagtcagTAGTATATTTTGTCGGGtttt taagatctagtaaatcccGATGAATCAAGTCGGCATAGTAGaatcaacag aatcttatgCCACCATCCtaatttgccaaactaaatgtgCGCGCACATGT GTTAATCATAAAGCGGCCCTTATTTCCGGCCCCCAGGGTAGTGGCCCTAC CGTGTTGCTGAACTTtgacataaaaatttcaagggtacatgaaaaaactt gaatgGGACTCAatcaatgtgggttaagtaaaaacaaaaaataatgattc aaagacaTGCTCCGTTTGCCCGTGACCGCCATTATGGGAAAGATCCGAAC CTGTGAACAGCACCCaaaaaaaCCCGgcgattttaccaaatttcCGAATT gggttttcttgtaaataaacagtCGGTCGGACGACCCGAATGCAACACAT TTTTTATTGCCGcctaagtgtgagaacagagtaatcaaactcgttagaaa aagtaccattagaagtcataaaaaatcaacctgaataaatgcaatcgaaa ttccagagaacttcataattccccaaacaacattacattacaacGAATGT AAATACACAGATAGGGTGgaaaggccaaaattttcccctcaatttttaga aaccaaactaactttatttgaaagtccttacctttgtgagaaaaatgaga agtcatttattagaattggttaagtattcccaaagttattccattttcaa aacacaaaaaaatcaccttttcaaagaatcgcctccttacaccacgccag caagaaataattttcggaagcaccaaaatcgcgccaaaaatggcggatga aatctagtcttccgattgtagcctaatcttaccctgggtttactaaaaaa accgcaattgaaaagatgaaccagctcaatagcgacagctagccatttgt ttcaatgtgggtcgagaattttctggtgccgtggtcagcgctaaatcatg ttttcaccttgacgtagaaaaacatgaatatctttggaaagaaaatagat acctgaatgcagtttttttacttgtttctctgataattcctgattgattt aaaaaaaaagaatgaacagatttggatgatttataGGTAAGTACTAGAgt agagtagactacgctcgccaccgaagaggtttatttggaaagggtaatta tattttattgttcgcttcttttttaaagattcgccgggttggaaaagttt gaatttctttgtacatattttacctaccccaaatatttaggagcctgagt tttaaacgaattgttaagttgaaacaaacgataaatgtatcaaggtctgt tttatttaccccctggtgacttaacaaaagagacttaactcgatgttaca atccaattattgaaagtttgtctaggcctttttataatgagcgagacata cgttctctgattacggaattttcatattgacattttcgaggcaatGTAAC TGTCAAACTATCccttgcaatctctccaaaaattaaaataaacggagcac tagaacaacaccaaaccaATTTTGAATGAGCTAagtaaaaaatcatgaaa ttcgggatttttgtaaacatgtGAATAGAgcattaaaaaatacaactttt ctatttttccttttttttgtgcaaaagttctagaaatgaaaataaaagga taatgataattgaatactatcatCGTAAAGCTAGAAATCGCTTCGcgact cttcgcttgagaaattgagaaaatgattgacagattaaactTCATCTGCG CGGCAGCTCGCGGGTGTTCTGCGAGCATTCTTCAAGCGTTTTCTGGCGTT cttggctcaatcctcggaccgtgtTAAAAATTGTAGACtcagctgtgaca gatcatttcgatggaagttcttggaatgtttacaagactcttgatagaaa atcctttgttttattatcaatgatgacagtgccgtcaTTAACTTTATTAG ATCTGATATATCGATGGTTGTAAGTGCGCTTTACAGTTTTGATTCCCATC GAAGAATCATGTTCTGGTTTTCATGCTATTAGATgctgctgttttagagc tttagagctagcctgctgCTCCTAGGCCGAGGTCACAGATAATTTGTGTT CACGTCATTTTTGGCTCTAAAATATGGGTCGTCGGTGGGCAataaaaatg tcagaaaaataCACTCTGGCCATGGCTTGTTCAGGCGGCAAGAATCATCT AGCGCACTGTCTGCAGTTTGTTTATTGTTACGTGTGAAGCGGCAAAATCA GTTATGTAGCGCTCGAAAAcgcaaaaaaatctttgaaaaattgcaagtaG AAATTGTTTTAAACGCTTGATGACTAAAAACTAACTAGCGCTAAATCTGC AAATGTTCTTTGGAAAATATCACCTAAAAATTCGATAGATTCCCCGACTT TCTGactaaaaacaatcaaatttttcagatcaaaagtgagtcggtcggac aacgcgaacacaagttatttgtgatctcGGCCTTCCTACTAGCTGGAACT TTGATATTTCTTGGTTTAAAAAGCTATACCAGATGTAGCCTGAGAATCCA AGCATTAAACTTTTtccacagtctagtttttgatatttttgctgcttgtt tattaacgcttggtgcaggtaactcgcctgcagggagatttttccctgca atgcaggttcagCCTGactggccagctttcggcgcattacttagcagtac tttcacgcgcattttgaaaaatcgatgCGCgcacataatttatggaaaaa gctgattttgcaggaaaaagaaaaacaaatgaaaatgaaaacatagattc atttagaaacaaaaggGCTGTTGACTgaaagtctaaatacatgtggctga tgttttgatgtggtttttagtagtttttagagtctttagagcttgtgaaa gagttttggtaagttgattatgtgtgtttgtctgggtttccaaagttcag aaagtctgtcaacaaggattcacacacagactgtttataacattctgtgt cagactatctacctgcaccaagctttataatcttagaactttgtgaggtg aggtattttttgtattttctaagattatgagcttggattcccaggctata cCAGACGGTACTAAAAACGAATGTTTGATTGTGATCAAAGTGTTcaatca ggtaacttgcatcagcggagggaaacttgcatagctatcaaatgactgac cgtcaactgctctaacttgggactatctgacaaaacatgggatggcaatt ctgccaccatttcaccgaacctccaaagccatttgatttgagtcaatgaa cggcgtattaaaaaatacacaatttctctttcgcactgagtaggctttta aatcgaaatatgaaaaaattcatAGTGGAACACACAAAGAAAcgttaata cacctttcccgtaatttgtAAAACTAGTGCGCacacattattttgatgct ctccatcgtttggtctctggaggtaaacaaacccgttcttgtctgcgttt ccttagggaaagttggttttttgagcgtTTCTTAAGTTTTCAgaagttct gtcgaacaaaaccccctcaaattttagtatgttcaatctattcatgatat tatactaCCCTGAAAATCTCTTGCCAAAAGAAGATTGTTATCAAAAGcat agttcggaagggggtcactaccccccctaccctagagctaccctccctac cctaggttcttcccccttttaaaatttgatgctacccccctcaaaatttt aaaatcctacaaaagaaaatagaacacactgcattgcgaaaaaaatagaa tcattttgaatcgaatgtttcaaacatactaaacaattaataaagaagac gttgcattgtaaattaaaaataaaacttctaatttgggaaaatacacaaa aaaacataccactgacatcttaccccccccccctttctagatgaaccccc ccccctttctaaaaacttccccctttctagaaaaaattctcttacccccc cccctttctgagattttctgaacatcgctacccccccccctttataaagg ggggggggtgcgaactatgAAAAGTcagaagctgaaaacccactttccac TTTCGTTTCAAGCCTTCACtgccacaataatttatgtaattactGTTTTG GTCAGTCAGGTTAAACATATACGTGGTTTTTTGTCACATGACCAAAGTGC CTACttaaacaatccgggggtaactGTCAAAGCAACACCTGCTGTGTTAT TCTttaaaagaaatatcttttgccATTGACaattaaaatataatataata tcaCTAAAAAAGCTGGTAGAATCGTAATCCTAAAATATCAAAGTTCCACC TACTGTAGGAACCCATTTCCAAATGCACTAAACCATTAGCTCAGAAGCGC ACTACATAAATCTCAGCACAAAAGCTTACTTGTATACTTCAGACATTTCT GTTGTTCCTTTGTAGATTAGATTTCAGTATCATTTATAGAAACCCAtttt acctttacattgcttttttgcttaatactttaatcttgttttgtttatgt ttttagtGAATCAAATGTCAGTTGTAACCCACAGAGTAAAGACTTGTTTC TTGAAAGAGTTAAAACATTCACGGTATGGTAAAATTTTTCATTGTAACCT TTTAAGTCTCTAGTTAAATTATTATTGAAAACAGTTTTGTCTATTTAAAT CAGTTTTATATTAAATATTGCTGAATTCCCTAAAACTTATTCACAAGAGC TGAGGTAATCCATTCTAATCCTGGCAGGAATTAAATTTGGGGGGATCAGC AAATAAGGCTAAActccccaaaattttaaaatggttTTTGTTTTACTAGT AGTAAAAGTATTGGCCAAAATTAAATACCTACCAATAGTAGCCAACCTTT AGCCAACCAAAGAATTAAGTTTCATtatatttgattaaaaaaatgataGT GATTCATaaaaaaaGCTGTAAAATAAAGTATATCATAATCGCTTTTCTCA TAGACAACTAACTGGGCAGCAAAACCAAATGAGCTATCACCCTTGAAATG TGCTCAATATGGTTGGTGCAATGAAGAACTTGACCAGTTGAGATGTGTCA CATGCAGTGCTACCATATTTGCTGGTATGCCTGATGATTGGGATTCATCA GCTTGTAAGGTTTTACtaaatgttttagatttttatagatttttggtaaa atcaaaCCTGAACCGAGACAGAGATCTAGATCCTCCAGTACTATGATTCT AAGACTTGATTTATTAtaatgttaaaaattcaaagttaaacttCCAATAC TTTCAGTGTTCTGTATTTATTGGCTTTTGGGATTGTCAAGGACGCCTTCG GAATACTTTTGGCATGAAAGAGCTGTGCCTTTGAATTATTTATGTATttg attatcaaattttaattcataagtattttcttttttagattctGACATTT GTAATGAGATCAAAGACAAATTGAAAATTGGACATCAAAAGCTTTGTCCT TGGCCACAGAACCCCTGCCCACCATCCTTTTTGAGTTTACCCTCGCGCTC AGCACAACAATGGAAAATGGAGATTCGGTCAGCATTTTGTGGGTTGCTGG AGTTGAAAGGAAATCTACCTGAGTTGAATGAAGATACTGTAGCATCAATG GTAAAATTCTTAAATATTTTAGGTTACACTCTTATtttatataagcataa cgtttaaaTAAGCACTCAAATTCGGTAAAAAATAGGCATAATGCTAAAGC GTACcctccaagctgaaatgcaaatAGAATTCTTGCTGCTTTTCTAAGAC GCTGACTTTTTTAGGGTTACTTTTGAAGCTGTTTGAGCTTTTCAAGACCA AAGATTTTCACCTGCTGCTCCAAATTACAAAGATAACTTTCATTCTTTGA GCTGAATCAATGTGCCGacttaaaagttcaaaattttcatgaacccaaag aaaattcacgatttgaagtctaagcatataaataagcataaattcaggct gaaaatgagattttgctatGCATATTgagcggttagtgtaaaacgcaggt cacaggtcacaggtcgcaggtcacaggtcacaggtcaacaaagtgcagac cggaaaaaaaaaaaaaagatcataacatatacataacataacatcaatac atatacatagcgcattaaattacaaaaaagtaatacatgctatttagata ttataaaatgacaattgaatagaataacaacctattttgacatagtgaca ctgacttacaaaaataatgacaaaatcataaaatatgatgtctaacaaga caaaagcacgaaaaatatttattatacaaaatgtgatgtggatggtgtga atggatataaaatggcaccaaacagaagcttgcaaggaccctaagagagt ggttttagaaggatggaactaattaattattcagttattattttaatgtg ttaatgacaatttttgacaaaaatattgacagaattacaaaatatcatgt cttacaagagaaaaacaccaaaaatattcagcatgccgaatgcaatgata acaatatggctggatataaaattacaccaatcagaagcttgtgagttctc tgagaaggtagttttagagcgatttgttttattatatgtaaccatcatct aacattacaaacattacgatatgtaatatacctgtgtataatatggtttc aaatattttctggtctgcgttatacacggcgcaaactgcgaaagatcgat aaaagcacatggctaaattttgatgtttgaaatggttctatatggatgaa attgcttgagaattatgtttttgacaattctttgtgttttccaaacattt tcctctgcaatgacattgattagagttaacctgtcatcactgacctgtga cctgtgacctgcgacctgtgacctgtgacctgcgttttacactaaccgca tATTGAGCCTCGACCGAATTTTCCATTATGCTTaaaaaaaaGAGTATTAC CATCATAGGTCCAATGGTAAAGTCTTTCACCAGCTTTGCAAAAATTCATG TGTCACCAGGACTCTGTTAGCATTCTAAAAAATAGTTTTGGCTCTAATAA TCAACCTCTTCTAAGAAGAggttgatttcatttttaaaaaaacacCTGTT TTGCAATGATCCCGCTGTGAGAGATGGAAAGAATCCAATTGGGCAACGAT GGGAGAGTATCATAGGGTCGATGAATCCATAGACCTtatcataaattacg tcacaaacatcacttgacTCGTATTCAAACGATTATCATGGGggttatgt ctcttgagacattaaatgattctttatgaatagaaagtagttttgataaa atccgaTGAGAGTTGATCACCatggaaataatttcaaaacaaggcaagTG TTGTTTGTGTCGTAATTTATGCAAAGGTCTATTGACATTCTAATTTGAGG GGAACTAGCTGTGGTCGGTTGACCTGAAATTGGAATTCAAGCCTGGTCAC ACTCCATTAATAACAACAATAGAATATGCTGTTGTTACTGGAGCATAATC AGGCTTTAACCCCAATTATTCGTTTATTTGAGAATTTGGTTTGATGTTTA GGAAATATTatattcctttttttctctTAGAAAAGTCTGGATAACAGTTG CATCGAGAAGCTTTTGACAAACGTTTTTCGCCATTCTTGTGATACAGATG ATGAAGTGTTACAGGCTAAAGTTGCATGCATATTGGCTGTCACAGGCTGG AATGCAAGGTGAGAATTTCGAAATCTAATTTTACATCATGGGCTGTTCCA TTGAATTTCCATACAGGGagcttttaaaattcttttcataccttaaataA AGTCAGTGTTTTGCTCACTGGAAAtataataactttttaccccctggaaa atgaaaaagactctttagaccccctggaaattcttcacggaaatgttcgt ccaccctctgtatggatataaaatggaatggtccaTCAGTGAGGTTAAGC ATCGATAGACAAATCACAACGACAGATGAATTCGCGCCACGGCACTTTTC TACAGGCTAATCAGAAAGCAAGGTAGACTTACCTGCACAAATATATAAAC TTTGCTTCTAAGACGAATTTCTGactgctttttggacctaccgggaggtc ctttaatttgaccgttgttcgttcgtctgttacaagcttttctcgggatt ggctcattagtttttttttattttttgcacaatgatacaaaatagcaatg cctgaaaagtgacggagcccgatttttgaaaaaaaattttggggggcaaa tttgggccaaaaactacctaaaaataaagttttttggactttgtgcaaaa ttgcttcattagtttttcctgatttttggcagaaagatagagtgcaaggc accctaaaatgtggctaaagtaatttttctcgtcaaaatttttttcgtcg tcaaatacggattttcgcaaaatttgggccaaaaactacctaaaaataag gttttttggacttggtgcaaaattgcttcattagtttttcctgatttttg gcagaaagatagagtgtaaggtaccctaaaatgtggctgaagtaattttt ctcggaaaatttttttcgtcgtaaaatacggattttcgttttttggggaa attcccttttaccattttcctgttagcagcttttctcgggattggctcat tatttttttttaattttttgcacaatgatacaaaatagcaatgcctaaaa agtgacggggcccgatttttgaaaaataatttttgggggcaaatttggac caaaaactacctaaaaataaggttttttggactttgtgcaaaattgcttc attagtttttcctgacttttggcagaaagatagagtgcaaggcaccctaa aatgtggctaaagtaatttttctcgtcaaaatttttttcgtcgtcaaata cggattttcgcaaaatttgggccaaaaactacctaaaaataaggtttttt ggacttggtgcaaaattgcttcattagtttttcctgatttttggcagaaa gatagagtgtaaggtaccctaaaatgtggctgaagtaatttttctcggaa aatttttttcgtcgtaaaatacggattttcgttttttggggaaattccct tttaccattttcctgttagcagcttttctcgggattggctcattattttt ttttaattttttgcacaatgatacaaaatagcaatgcctaaaaagtgacg gggcccgatttttgaaaaataatttttgggggcaaatttggaccaaaaac tacctaaaaataaggttttttggactttgtgcaaaattgcttcattagtt tttcctgacttttggcagaaagatagagtgcaaggcaccctaaaatgtgg ctgacgtaatttttctcggaaaattttttttcgtcgtaaaatacggattt ttgcaagtttgggccaaaaactacctaaaaataaggttttttggacttgg tgcaaaattgcttcgttagtttttcctgattttatgcataaagatggata aaaagtggctgaagcagtttttttcggaaaattttttttggccgtaaaaa ttgcattttcttatttggggaaattcccttatatcattacgcacggagcg agcgttagcgagcggagtgcgactcttttggcaaacgcatgcgcgtaagc aaaatttacaaaatttcaatgatatgcgggcactaaaaatggaaattcac cttttttttcgtctagccgctattccaccttgtttagcctctggaatgtt tcaactttgaaaatttcgaaaattagcgttttttaagaagaagtcgttgc agtgtcaatctttcgcaaatttaaaaacccactttcccttggaaaaaatt gacgttttttggttttttgggacccttggggcacaaggtacatgttgacc gcaaaaattccaaaattcccgaattgaccgttgacaacattaggggtaaa gaggACCCACTGACGTcacgggtttgggaaaaacttcaaaatgcgatatc tcgagtttgaagaagagtggagaggtcgttgacccctcattttatcggga attttatggggaatgatatgggagggtttataaggcttgagtaggacttt caaatttggctgcatttttagccattttcagctgatgacgtcatcaaaat agaaaacatgcgatatctcgagtttgaagaagggttgagaggtcgttgac ccctcattagatcgagaactttatggggaatgagatgggaAGGTTTATAC GGCTTGAGTAggactttaaaatttggctgaatttttagccattttcagct gatgacgtcatcaaaacaaaacaaaatgcgataactcgagattggaaagg aattgagaggtcgttgaccccttattctatcgggaattttatggggaata agatgggaaagtttataaggcttgagtacaattttcaaacttggctgaat ctttagccattttcagttgatgacgtcatcaatacaAAAAATGTGATAAC TcaagattggaaaggagtttggaaatggctaacccctctttggatcggGA AATTTATCGAGAATGCAACGAGAGAGGGATGTTATGAGGCCTTAGGAcga cttcaaataaaaattagTTAACCTTTGGGTAAGCagcgtgagaaaatcaa aacaaaacagccgaaaagaactgaactctcggaataaataatgggaaaaa cgtaaaaaaaactattttttgatgagcCCTTACTCCATTaccattctttc caaaaagtcagtgaaattaaaactgatgaaatatatagaaattattacaa aactactcgacacacacgtgacacgacccaaagcaaataaattcagcttt cgGCACTTTCGTTCGTTTCATCGTGAAAACCAAACATTTCTTTTCATCGT GTatgcataaaaacttgaaattctttaatacttgtcaagaatatattttc cataacaaaaccagggaaattcaatgtctttgattaaaccaggtgtaacg agggatttttgtaaaaagtctctCGTGTCTCTCCCAATCTTCCACAAAAC TGgtctttgttttgacttttcagcgtcaattcttcaacaatcaacatTTC TTACTTCGATAATTCGACACATTTACAGCTTGACGATAATTGAAAGTCGA GTAGTTCGCCCCAATTAGTTTTTGTtgtaaaaatgttgtttcagaccATT CATAGCTTAAACCAGCATGCATTTTCTCAtctatgcatcgaaacaaaaac atcgaaaagtgttatcaatctgatagagaaacgcaataatgaagaatttc ttctcaatcgaaaaaatacaatacatcttctttttctgtgtatCAGTAAT GTATAACCATTtcacagaagaaaaaaaaagctgctgcatttattttgaag cttcgggatcgaaaattttttctttattttgatgtttataTATTCGGCGG GAACTTGTCgaatttttttgttcgaatctaacaagattttcgaacaaaaa cattcgaaattatagAGATCCGGGATTCCTGAGTTAtttttttccgagtt acgaaaaaactGAGTTATCCcgagtgatgacgtcatttttggaataaggt gacgtcattttacatttcataactcggtttattttgcttcctttaacttt ccaaattatttttcattttgtaactcgtgatttttgcttcctttagcttt cgagttaatttttattttctaactcgggaaattgtgcttcctttaactat CCGAGTTATTGTTCCTTTTTTAACTcaggaatttttgcttcctttaactt tctgtaAGTAGATTTACGTTACACTGATTGGCCTCATAAAAAGGCTCgcc tcgtaaaatatttctcgtattgcactcaaagtTTTAGGGCCAaagcaaaa tgacgtcatcgtcaCAAGATTCgcagtattttgagttttgatccgtttta agttgtaatttttagatttatggaattttagattttgatttgggattttc gggaaaaaagtacgatattcttttgagcagTGGATTGATAGCCTCCACCT CTTCTTATATAACTAGTGGGCTCTATagaatccctttcgctttgcgaaca cgagactcgttctccgtgcgtaaccccttttacgattgatttttagggaa aaagagcatttctcgcgattggattgatatttttttctgaatttttgcac tttgatgtaaaatggtaatatttaaactCTGAtgaagcctgattttcaaa atataatttgtgggcaaatttgggccaaaaagtgcctaaaaatggaattt ttggactttgtaaaattgcttcattagttttttctgattttttggacaaa gatgaagggcaaggttctctaaaacgtgactgaagtagtttttttcgaaa aatttattttgaccgtaaaaatcggattttcttatttggggaaattccct tttgtcatatttagggaaaatgagcatttctcgagattggcttggtattt ttttcttatattttgtaTAGTGATATAAAAATGGTAATATGTAATGGTAA TTTGGGTAGAAAAGTgcctaatgtttttttttttttacttttttgactat tttgagctctgatactcacggtaatctattcaagctgctcactacacttt ctTATTCCCTTGCTATTTAtcctatttttttctgattttgatcaacagtc cattcagcatgttgcttgtttttctaGAAGCAAAGTTGAAATACTATGCT GATTGACTTTCCGAGATGACGAAAAGTCTTTGTGAATAACTCTCCCTTTA ATTTAAGTCAACCCATTGATGACCCTATACGCTTTTGGTTTAATTTGCCA AGAAACCTTCACATggtttttgtataatttatttttaaatttaagtCAAC CCATTGTTGAAGACCCATCCATCACGTGTTCATTATGTGGCAAAGAATCA GGTTTATGGCATTACAAGTCGCTCTCCAGTCGCCGGAATGCCAAACAGCA AAAACTACATTTCGAATCCGCGACCTCACAACAATCATTATCTGAAGATT TTATGTCATCAAGAGTATCAGTCAAATCCGAGAACAGTACACATTCGGGA AGTGTCACACACGAGCTCTCAAAACTGGCAACTAGTAGCGACTCTTTAGC CCATTCAGACCTTTTGAAGCCAGCAGGATCTCAAGAATCGTTAGTCAATC TTAGGGTATCGGACAGTAAACACATGAGTATAGATCATGATCATGATGAT GCAGACTCGATGGGAGGAGGACACTATCATAGCTCGCACCCTCCACACAG TATCATGAAATCATCCATCTTCAGTGAGCCGGCCCGTATCCCTCTAGCCA CCCCTCAAGAGTTGATGAAAGAGTTACTTTTGAGTACGGCGCCAGGAGGC CGGTCTCATTCGATTTACAGCGACTCCATCTTCAGCGAAGTGGGATCCGA ATGTTTCGAGAAAAGGCTTGAAGATACGACAGAAAAAGATTTAGGTACGT CTTTAAAACGATTTAAGGGTGAAGGAAGTCTTAATGAAATTAcgtttctt aaaaaacattttattttagttttttcttgcttttgttttcttctttctct tgtcattttAAGTCGATTCCTGAATTAAATTAATACAGACCCAAACGGAA GCACTCCTTCGGgacaaaaaatcattattaaaTATTGTAGGTGTTTCGGA TATATTTATGGTGTACAAAGTAATCTGTATACATAATGTGTAGATAACGA GTCCTCTCATTTACCTACTTACAGAATTAGAGAAAGCGATTACCGAGAAC CCACCATCCAGCCACCCAAACCACGTCCAACAACAATGGATGAAAGAACT CTTATTCATGACTGCCGACAACACCAACATTGAAGCTACTGAATCGGTAA TGAGTGAAATTGGTTCCATCTCTTTTGACCGGAGATTAGACTCTCATTCC ATAGCTCACACGCCGCGCGCCATGACGCCAGTACATCAAACGGAGGACGA AGATGGTGAACCGGTGAGAACGAAACGTATGCGTTTTCAGGTATGAAACG TTTTGGTTTACCTTTATAGCACATTGCTATTTTCGTCTCGGTCGGAAAGT taaagattttgatattttgttgcagggggggggggcaagcagttaaTACA TAACACTATGTGTATTAActgctttttgaaatttttccaaagGACCACCA CCCCTTGACACTTAGTACACTGTGTATTAACTGTTTTTGACCCATTAAAT ATATACACCAGCCCCAAAGTGCTTCTGCAGCAGCTGACAAAAGGTGTACG AATCCGATTTTTGCCCTGCTTAAtgattgatatatttttttaatttcaag gaaCCCTTTGAAGAATCCTTCAATATGCTTTCCGAACATCGTCATTGGTG TCCCTGGACCAATATATTATTGGCCTCCCCGACTCATGATGACGTCCACG CGCCAGCTCAATCAGATAACGTTTCTTCAACCACTAGCGGTTTCGAACGT ACACCGAGGAATATTTTCGGTTCTCGAACACAGGCGTTACCGGGTTGGAA GATCGTGTTGATGACTATTTTTCCGGCGCTTGGTCGAGATGTGAGCAGTC CAGTGGTAAactcttgaaaattttgataaaacataaTCATGTATGAAATT ATAGCCTCCGTATGTGGTTATATTTCTATCGAATTGCTTTTTGATTTACC TAATTCTTGTAAGGCGATGCTCGATGGCTAAAAAAGCATGTTCAAATAGT GTAATTATTAAGATAGTCTACATATAAGGGACTTTAATCATATAACTGTA CCGTAAGCTTGACAATAGTAGAAATTTGATGATGTATACATCATTATTTC ATATTGGTCAAAATGTTTATGTTATACTTCTGTTTAAAAGAATACTCTTA GGTggcaaataaacggggggggggttcgattAAACGGAgggggtttgaaa attttcgaaattttaataaacgggggggggctaattgccggggggcgttt atttggcacctaagagtacgtcATAAGTataatttttagaaatatttcaa tgTCTACCGATTGTCTCTAAATTGTGTTTGTTTTATACAGTCACCTCCAC CACCAAACGAAGCTTGGAAATCAGTTCGTACACTTCTCGGTGATTGTGTA TCTCCTTATAAACCAGCTGCTACATCATCTACAACTTCTAGTGCACCATC TTCATTGAACACATAG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000086_pilon:423348..440763+

>XLOC_039300 ID=XLOC_039300|Name=XLOC_039300|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3816bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000086_pilon:423348..440763+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCTTCTGTCCAAGAAAAGACCAAGATCAAAGAGATATTCTCAACATT
GGCGGAGTCTGATGCTTCAAATAAACAAGAGAAGGAGGAGAAGGATCCTA
ACATATGTCTTCTGTCCAAGAAAAGACCAAGATCAAAGAGATATTCTCAA
CATTGGCGGAGTCTGATGCTTCAAATAAACAAGAGAAGGAGGAGAAGGAT
CCTAACATtGAATCAAATGTCAGTTGTAACCCACAGAGTAAAGACTTGTT
TCTTGAAAGAGTTAAAACATTCACGtGAATCAAATGTCAGTTGTAACCCA
CAGAGTAAAGACTTGTTTCTTGAAAGAGTTAAAACATTCACGACAACTAA
CTGGGCAGCAAAACCAAATGAGCTATCACCCTTGAAATGTGCTCAATATG
GTTGGTGCAATGAAGAACTTGACCAGTTGAGATGTGTCACATGCAGTGCT
ACCATATTTGCTGGTATGCCTGATGATTGGGATTCATCAGCTTACAACTA
ACTGGGCAGCAAAACCAAATGAGCTATCACCCTTGAAATGTGCTCAATAT
GGTTGGTGCAATGAAGAACTTGACCAGTTGAGATGTGTCACATGCAGTGC
TACCATATTTGCTGGTATGCCTGATGATTGGGATTCATCAGCTTattctG
ACATTTGTAATGAGATCAAAGACAAATTGAAAATTGGACATCAAAAGCTT
TGTCCTTGGCCACAGAACCCCTGCCCACCATCCTTTTTGAGTTTACCCTC
GCGCTCAGCACAACAATGGAAAATGGAGATTCGGTCAGCATTTTGTGGGT
TGCTGGAGTTGAAAGGAAATCTACCTGAGTTGAATGAAGATACTGTAGCA
TCAATGattctGACATTTGTAATGAGATCAAAGACAAATTGAAAATTGGA
CATCAAAAGCTTTGTCCTTGGCCACAGAACCCCTGCCCACCATCCTTTTT
GAGTTTACCCTCGCGCTCAGCACAACAATGGAAAATGGAGATTCGGTCAG
CATTTTGTGGGTTGCTGGAGTTGAAAGGAAATCTACCTGAGTTGAATGAA
GATACTGTAGCATCAATGAAAAGTCTGGATAACAGTTGCATCGAGAAGCT
TTTGACAAACGTTTTTCGCCATTCTTGTGATACAGATGATGAAGTGTTAC
AGGCTAAAGTTGCATGCATATTGGCTGTCACAGGCTGGAATGCAAGAAAA
GTCTGGATAACAGTTGCATCGAGAAGCTTTTGACAAACGTTTTTCGCCAT
TCTTGTGATACAGATGATGAAGTGTTACAGGCTAAAGTTGCATGCATATT
GGCTGTCACAGGCTGGAATGCAAGtCAACCCATTGTTGAAGACCCATCCA
TCACGTGTTCATTATGTGGCAAAGAATCAGGTTTATGGCATTACAAGTCG
CTCTCCAGTCGCCGGAATGCCAAACAGCAAAAACTACATTTCGAATCCGC
GACCTCACAACAATCATTATCTGAAGATTTTATGTCATCAAGAGTATCAG
TCAAATCCGAGAACAGTACACATTCGGGAAGTGTCACACACGAGCTCTCA
AAACTGGCAACTAGTAGCGACTCTTTAGCCCATTCAGACCTTTTGAAGCC
AGCAGGATCTCAAGAATCGTTAGTCAATCTTAGGGTATCGGACAGTAAAC
ACATGAGTATAGATCATGATCATGATGATGCAGACTCGATGGGAGGAGGA
CACTATCATAGCTCGCACCCTCCACACAGTATCATGAAATCATCCATCTT
CAGTGAGCCGGCCCGTATCCCTCTAGCCACCCCTCAAGAGTTGATGAAAG
AGTTACTTTTGAGTACGGCGCCAGGAGGCCGGTCTCATTCGATTTACAGC
GACTCCATCTTCAGCGAAGTGGGATCCGAATGTTTCGAGAAAAGGCTTGA
AGATACGACAGAAAAAGATTTAGtCAACCCATTGTTGAAGACCCATCCAT
CACGTGTTCATTATGTGGCAAAGAATCAGGTTTATGGCATTACAAGTCGC
TCTCCAGTCGCCGGAATGCCAAACAGCAAAAACTACATTTCGAATCCGCG
ACCTCACAACAATCATTATCTGAAGATTTTATGTCATCAAGAGTATCAGT
CAAATCCGAGAACAGTACACATTCGGGAAGTGTCACACACGAGCTCTCAA
AACTGGCAACTAGTAGCGACTCTTTAGCCCATTCAGACCTTTTGAAGCCA
GCAGGATCTCAAGAATCGTTAGTCAATCTTAGGGTATCGGACAGTAAACA
CATGAGTATAGATCATGATCATGATGATGCAGACTCGATGGGAGGAGGAC
ACTATCATAGCTCGCACCCTCCACACAGTATCATGAAATCATCCATCTTC
AGTGAGCCGGCCCGTATCCCTCTAGCCACCCCTCAAGAGTTGATGAAAGA
GTTACTTTTGAGTACGGCGCCAGGAGGCCGGTCTCATTCGATTTACAGCG
ACTCCATCTTCAGCGAAGTGGGATCCGAATGTTTCGAGAAAAGGCTTGAA
GATACGACAGAAAAAGATTTAGAATTAGAGAAAGCGATTACCGAGAACCC
ACCATCCAGCCACCCAAACCACGTCCAACAACAATGGATGAAAGAACTCT
TATTCATGACTGCCGACAACACCAACATTGAAGCTACTGAATCGGTAATG
AGTGAAATTGGTTCCATCTCTTTTGACCGGAGATTAGACTCTCATTCCAT
AGCTCACACGCCGCGCGCCATGACGCCAGTACATCAAACGGAGGACGAAG
ATGGTGAACCGGTGAGAACGAAACGTATGCGTTTTCAGAATTAGAGAAAG
CGATTACCGAGAACCCACCATCCAGCCACCCAAACCACGTCCAACAACAA
TGGATGAAAGAACTCTTATTCATGACTGCCGACAACACCAACATTGAAGC
TACTGAATCGGTAATGAGTGAAATTGGTTCCATCTCTTTTGACCGGAGAT
TAGACTCTCATTCCATAGCTCACACGCCGCGCGCCATGACGCCAGTACAT
CAAACGGAGGACGAAGATGGTGAACCGGTGAGAACGAAACGTATGCGTTT
TCAGgaaCCCTTTGAAGAATCCTTCAATATGCTTTCCGAACATCGTCATT
GGTGTCCCTGGACCAATATATTATTGGCCTCCCCGACTCATGATGACGTC
CACGCGCCAGCTCAATCAGATAACGTTTCTTCAACCACTAGCGGTTTCGA
ACGTACACCGAGGAATATTTTCGGTTCTCGAACACAGGCGTTACCGGGTT
GGAAGATCGTGTTGATGACTATTTTTCCGGCGCTTGGTCGAGATGTGAGC
AGTCCAGTGgaaCCCTTTGAAGAATCCTTCAATATGCTTTCCGAACATCG
TCATTGGTGTCCCTGGACCAATATATTATTGGCCTCCCCGACTCATGATG
ACGTCCACGCGCCAGCTCAATCAGATAACGTTTCTTCAACCACTAGCGGT
TTCGAACGTACACCGAGGAATATTTTCGGTTCTCGAACACAGGCGTTACC
GGGTTGGAAGATCGTGTTGATGACTATTTTTCCGGCGCTTGGTCGAGATG
TGAGCAGTCCAGTGTCACCTCCACCACCAAACGAAGCTTGGAAATCAGTT
CGTACACTTCTCGGTGATTGTGTATCTCCTTATAAACCAGCTGCTACATC
ATCTACAACTTCTAGTGCACCATCTTCATTGAACACATAGTCACCTCCAC
CACCAAACGAAGCTTGGAAATCAGTTCGTACACTTCTCGGTGATTGTGTA
TCTCCTTATAAACCAGCTGCTACATCATCTACAACTTCTAGTGCACCATC
TTCATTGAACACATAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_039300XLOC_039300-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000086_pilongenomesc0000086_pilon:423348..440763 +
Properties
Property NameValue
Aaloc1783-1908:17291
Aaloc1528-1782:16551
Aaloc1264-1527:15977
Aaloc664-1260:15097
Aaloc535-660:9781
Aaloc325-534:7591
Aaloc172-321:7154
Aaloc106-171:6708
Aaloc1-102:1