MSTRG.14288.4.p2 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.14288.4.p2
Unique NameMSTRG.14288.4.p2
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000118_pilon:393422..414989-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
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>MSTRG.14288.4.p2 ID=MSTRG.14288.4.p2|Name=MSTRG.14288.4.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=21568bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000118_pilon:393422..414989- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TCTGAAAAATGAGTGCGAAGAAAAAGCCTTAAAGAATTTAAGTTTGTGGG AAACAGGTCAAAATGGCAACCTTCAGCCACCACAAGCTGTTGGTAACGCA TTATGCCCAAATGATTGCAGTGGTAAAGGCAAATGTGTCAATTCTACTTG TGTATGTGATGCGGGCTATTTATCGACAGACTGCTCTATCCAGACAGGTA GGATAAATTTAAATTAAGTTTGTTCCAAAAAGATAATTTCCTTGGATCAA ACGCTAAACAGTCCTCGCAGAATTCTTTCCAAGATATTCAAAGTCAAAGC AAAGCCAGAAAATAAGGGTGAATTATGGGCTGTAGTTTTTAAGTATTAAT TTTTGTTCCAGATTTGTATATCTATAAAGCGAGAAAAACATTTTTCAGAT AAGACCACTTTTGTTTTTTCAATTCCGTCACATGGGTAGGCTGCACGTAT CCCTTCTGATATGTTTTGATACAGGGGAAGTTTATCCTGTATAAAATCCC CGCCGTCTAAGAGTTACCCAAAATTAGGGTTAACCTCTTTCAATTTTTTT TGAAAAGGTCTAGAAATCCATCGATTGTATTAACCTATATCCATTCAAAC TTTTAATTCAATTTAATGAAATTTAAAGATCTCTCATATAAAACTTACTA ATTAAAATAATCAAGTTTCTGAAACACAAAAACAAAAGACGGGGGTGACT CTCGGGAATTTTACACACGATGAGCAGTGCCTCCAATGGATAACTAGGAT TTGAATTTTATCTTTTCTTTTTTTTAGGCGACAAACCAACTCTAGAAAAA GTAGCATTTAATGGTTTATGCGATATTAGAAATAAAGATTGCCTACGTAC GCGTGTTGTTGGGAAAAACTTTGTTAATTCACCAAAACTTGCATGTCAAA CCAATAAACTCAAGGTATGTTTGCCGAAGAGGGTAAATTGGATTTATTTA ATAGAAATCATTGATCTTGGTGCATTTATATTTTTGCAGTTAAAAATTAA GTTCAAGGCAAATCAATCTTTTCCATTCCGAGGGCAAAGCCCAATTCTGA ACACCCCCTTCTCACAGACACTGGGACCGCCTCCCACTGGAGCAAATGGC CAAAATATCGTCACCAGTGGGGAATTATACTCCAACTTTTGTCCCTGCTG AAAAAAATCAAATAAGTATTAAATCCTCATTGCAAAATATTGTGCTATTT TTTCAATTTCTACTGAATTATCTGACTTAAAAACAATGGCATTAAAAATC CAGCTATAATAAACATGAGAATATCGAGTTTCAATCCGTTATTTTTACCC AAAATGGCTGAAAAAAGTCTACCGGGTGTATGAGAAGGGGGTCTTTCTGA TTTCAAGCGCTTCTTTTTTTGTTTAAAGCTGATAAAACTGTACTGTGCTT CTTGATTCAGTAGAAGAAATTAAGAAAATTACTTTTTGCGATTTTAACCC TTTTTTTTGGCAATATTTTAGTCAACGAGCTCACATTAGAAAAACACCCA ATTCTTAAATTACTACACTTTACTCTGTCATCTAGCTAAATCTAAATTGA TTTGAAGTTGTCGGTTAATCAATGTATCATATAATCTTGATCAATATTTA TATTCTAACATTTCAGTTTACAACAGATCATGGCATCGACACAACCTTCA ATGGTGAATCTACAGTTCAGAAAAGTCAATTATTAAGTTTCGCAGAGTTG ACATGTGACATTCCCAATGTACCAGTTGATATCATGTTCTCCTCTACACA AAAAGGGATCCCAGTTGGAGGCTTTGATATACGATTGTCTAATGATGGAA ATAGTTTTACCAGTCAAAGTTCACAATTTGTTATTTATGATTCGAAATGC TTGATTTGTGATGCAGCAAGCCATAATTGCCGGTGGAAGGTATGAGAAAC TTTTCATTTAAAAACCCGGGGGGCACTCAATGTAAATGACCTACCAGACG TTCGGCCCTTAAGGGTAGGTTTTTCATAGTTCAGCTAGTGCACTGTAAGG GTATGAAATTGTGATTAAAGGCCAATTTTTTGGTACAATTGGCACAAAAT TGGACAATTTTGGAGGAAAAATTCCACATTTTCTTGGAAAATTGCTAAAT TTTCGCCCTTCCGGGAGAGAAATTTTGAAAAAGTGCACTGTAAGGGTATG ATTTTTCATGGAAATTCACTGCACTGTAAGGGTCCGATTTTAGAAGCCAA ATTTTGGGCCGAACGTATGGTCGTTTTCAGATCGAGTGCCCCCCCCCCCC CGGGTTTAAAAATCTCAACCCGATTTTAATATAACGAGTATTTCATTCTT TACCCCAAGATAGGGCTTCCGTGTTAATATTTTGGTCAAAGTATCTGGTC ATTAGTGTAATAGACAGGTTGCAAAATTAAAGTCTGAAGACAAATCACGT TTTTACTCGAAATTTTCACATTCATTTCTGATTGATTCAAATTCATGGGG ATAAAATCACGTGAACTTTTTTGAGTAATCACATGTTTTGACTGCTTTGA TATAATTTTGCAACCCATGTATTATAACTCTTTCCATACTAAGACCATAC TGGCTAATCTCTAACAAAAGAAGACTTAGTCTTTTTGAAGAGTGCGTTAG GCAGTCAAGAACATCTTCAAATTAGCCTATCATAGGCTATTTAGCCGAAA ATCGATAAAAACCTCGATTTCTGACTAATTATAAATAGCCTATGATAGGC TAATTTGAAGGTGTTCTTGACTGTTAGGTGTGATAGGTAGCATTTCATTT CGATTAGAGCTACTTTTGCGCCTGACCTTGATGTAAGATTTCAGTAAGAA TGAGCACGGAAAAAGTGAGTGGAGACGTCCCGAAAAAGTGAGTGAAATAT TAGTTCGAGATGTCTACTCAGAAAGAACGATTGTATCATTTCTTTTATTT CATAGGACGACTCCTGTAGAGTGAACAATTATTGTTTTGCCAATGGTGAA TCTCACCCAACAGATTGGTGTAAAAAATGCGTTGGACAGAACACGTTTAC TGCCAGAAAAGGTAGGAGAAATTTACGAAATCCTTTTTCTAAACAATAAA ATGTAATGAGGCATAGTGATAGAAAAGCAGGAACTCGAATTCTAGGGATT CGCTGATCGAGCCTATGATATAACCATAAGACTTTTTTATATCTTTTTAC TAACAAGTGTGGAATTTTAGAACCTGTTTCATATATAGCATAGGAATCTA TGGTCTACGAGTCAAAATCAATATCTTAGAGCACTGTTGTATACAGTGTA GAGCAACCAGCCCTTTTTTGATCTTACACAATTAACACTTTCAAAAATAA AATAAGAAAAACGTAGAAAAAATTTCTCAAAAATTATGCCAAAACTGATT TCTTTTACAATCCTCCCAATAGTTTTTCTATCAAGATTAATCCTTTAAAC TACTTTACTCCATAGATAATTTAGCACCCGTCTTCCGGACTTCAACACCA TACAAAGTCTTCAAACATGCACGTATGAATTTCACAATACCCGTATCTGA TCCCGAACAAAAAAGAAC

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000118_pilon:393422..414989-

>MSTRG.14288.4.p2 ID=MSTRG.14288.4.p2|Name=MSTRG.14288.4.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=7077bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000118_pilon:393422..414989- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATCAGTCCTCAAACAATGATTCTGAAAGAAAGTGATGGTCCTAAAGATAT
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CTCTGCGACGGTAACAGACAAGAAAAGGAGTGACTTTTTCTATGCTGGTA
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AAAAGGTTTTGAATTTTACTTGTAAATTTACCCCTCAATACCCTAACAGT
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GGATGTACAGGTACAAATGGCCCCATTTGGATGAATGGCTTGCACCCGGA
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AATGAAGAGTTTTACGTCTATAATCTACTACCTGCACCTGGATGCCCAGA
GTCTTATTGTATAGATCCTTGCAAAGATCATATCGTTGATAATAGTACCA
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TGCAGGATCAGAAATGCCAACATCATGTCCACCTCAAAACGCATGTGATG
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CCTAAAGATATAACATTCAAAACAACAGTACCGATTACTTGTGGTCCTGG
TATTACTTCGTGTAAGCTGGTTATAGAAGTAGCACAAACTGTAAAAGATT
TTGTTTTGAGCTTCTGCACTGTAAGGTAAATTTATTGTGAAGTTCATTCA
TATTTTGCTAACTCTGCGACGGTAACAGACAAGAAAAGGAGTGACTTTTT
CTATGCTGGTATCAAGATCAGTACCCCAGGTTATCAGGAATTCCAACAGT
AACTGTGGATCAAAAGGTTTTGAATTTTACTTGTAAATTTACCCCTCAAT
ACCCTAACAGTAATGCAAAACATCAAGTTCTATGGTATGGCGCTCCACCA
AATGCAAATCGAAAGTTGTTAAAGAAAGAAACGCTACAAGGGACAGCACA
CCAATCTTATTTGTACAATAAACAAGCAGAGGATCTAACCTTTTTATCGA
TGCAAGATGAAGCGAGACACAATGCCCTGAAGGCAAACTTTCGCCTAACG
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GGATGCCCAGAGTCTTATTGTATAGATCCTTGCAAAGATCATATCGTTGA
TAATAGTACCAATGTATGGCAGAGAAGCACCGGGTTCTTAGCACTAAGTG
ATACAGCTGTCAGGTGTGATCGACAAGGATTTAAAACAGGATGGTATCGT
TTCAAAAGTAATGCAGGATCAGAAATGCCAACATCATGTCCACCTCAAAA
CGCATGTGATGCCGTGGTTCTATTGTTCAATTGTGATTTCGGTATCACTA
ATTATTGGAGCAAACTCGCAAGATCAGTCCTCAAACAATGATTCTGAAAG
AAAGTGATGGTCCTAAAGATATAACATTCAAAACAACAGTACCGATTACT
TGTGGTCCTGGTATTACTTCGTGTAAGCTGGTTATAGAAGTAGCACAAAC
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AAGTTCATTCATATTTTGCTAACTCTGCGACGGTAACAGACAAGAAAAGG
AGTGACTTTTTCTATGCTGGTATCAAGATCAGTACCCCAGGTTATCAGGA
ATTCCAACAGTAACTGTGGATCAAAAGGTTTTGAATTTTACTTGTAAATT
TACCCCTCAATACCCTAACAGTAATGCAAAACATCAAGTTCTATGGTATG
GCGCTCCACCAAATGCAAATCGAAAGTTGTTAAAGAAAGAAACGCTACAA
GGGACAGCACACCAATCTTATTTGTACAATAAACAAGCAGAGGATCTAAC
CTTTTTATCGATGCAAGATGAAGCGAGACACAATGCCCTGAAGGCAAACT
TTCGCCTAACGGATTCACTCCGGGATGTACAGGTACAAATGGCCCCATTT
GGATGAATGGCTTGCACCCGGATACTATCGGCCAAACAAAGACAGTTCCT
GTATGTGTTCGATTTCAGAGTGCTTGCTGTAAAGATACTTTCAACATTGA
TGTTAAAAAATGTCAGGAGGGAAATGAAGAGTTTTACGTCTATAATCTAC
TACCTGCACCTGGATGCCCAGAGTCTTATTGTATAGATCCTTGCAAAGAT
CATATCGTTGATAATAGTACCAATGTATGGCAGAGAAGCACCGGGTTCTT
AGCACTAAGTGATACAGCTGTCAGGTGTGATCGACAAGGATTTAAAACAG
GATGGTATCGTTTCAAAAGTAATGCAGGATCAGAAATGCCAACATCATGT
CCACCTCAAAACGCATGTGATGCCGTGGTTCTATTGTTCAATTGTGATTT
CGGTATCACTAATTATTGGAGCAAACTCGCAAGATCAGTCCTCAAACAAT
GATTCTGAAAGAAAGTGATGGTCCTAAAGATATAACATTCAAAACAACAG
TACCGATTACTTGTGGTCCTGGTATTACTTCGTGTAAGCTGGTTATAGAA
GTAGCACAAACTGTAAAAGATTTTGTTTTGAGCTTCTGCACTGTAAGGTA
AATTTATTGTGAAGTTCATTCATATTTTGCTAACTCTGCGACGGTAACAG
ACAAGAAAAGGAGTGACTTTTTCTATGCTGGTATCAAGATCAGTACCCCA
GGTTATCAGGAATTCCAACAGTAACTGTGGATCAAAAGGTTTTGAATTTT
ACTTGTAAATTTACCCCTCAATACCCTAACAGTAATGCAAAACATCAAGT
TCTATGGTATGGCGCTCCACCAAATGCAAATCGAAAGTTGTTAAAGAAAG
AAACGCTACAAGGGACAGCACACCAATCTTATTTGTACAATAAACAAGCA
GAGGATCTAACCTTTTTATCGATGCAAGATGAAGCGAGACACAATGCCCT
GAAGGCAAACTTTCGCCTAACGGATTCACTCCGGGATGTACAGGTACAAA
TGGCCCCATTTGGATGAATGGCTTGCACCCGGATACTATCGGCCAAACAA
AGACAGTTCCTGTATGTGTTCGATTTCAGAGTGCTTGCTGTAAAGATACT
TTCAACATTGATGTTAAAAAATGTCAGGAGGGAAATGAAGAGTTTTACGT
CTATAATCTACTACCTGCACCTGGATGCCCAGAGTCTTATTGTATAGATC
CTTGCAAAGATCATATCGTTGATAATAGTACCAATGTATGGCAGAGAAGC
ACCGGGTTCTTAGCACTAAGTGATACAGCTGTCAGGTGTGATCGACAAGG
ATTTAAAACAGGATGGTATCGTTTCAAAAGTAATGCAGGATCAGAAATGC
CAACATCATGTCCACCTCAAAACGCATGTGATGCCGTGGTTCTATTGTTC
AATTGTGATTTCGGTATCACTAATTATTGGAGCAAACTCGCAAGATCAGT
CCTCAAACAATGATTCTGAAAGAAAGTGATGGTCCTAAAGATATAACATT
CAAAACAACAGTACCGATTACTTGTGGTCCTGGTATTACTTCGTGTAAGC
TGGTTATAGAAGTAGCACAAACTGTAAAAGATTTTGTTTTGAGCTTCTGC
ACTGTAAGGTAAATTTATTGTGAAGTTCATTCATATTTTGCTAACTCTGC
GACGGTAACAGACAAGAAAAGGAGTGACTTTTTCTATGCTGGTATCAAGA
TCAGTACCCCAGGTTATCAGGAATTCCAACAGTAACTGTGGATCAAAAGG
TTTTGAATTTTACTTGTAAATTTACCCCTCAATACCCTAACAGTAATGCA
AAACATCAAGTTCTATGGTATGGCGCTCCACCAAATGCAAATCGAAAGTT
GTTAAAGAAAGAAACGCTACAAGGGACAGCACACCAATCTTATTTGTACA
ATAAACAAGCAGAGGATCTAACCTTTTTATCGATGCAAGATGAAGCGAGA
CACAATGCCCTGAAGGCAAACTTTCGCCTAACGGATTCACTCCGGGATGT
ACAGGTACAAATGGCCCCATTTGGATGAATGGCTTGCACCCGGATACTAT
CGGCCAAACAAAGACAGTTCCTGTATGTGTTCGATTTCAGAGTGCTTGCT
GTAAAGATACTTTCAACATTGATGTTAAAAAATGTCAGGAGGGAAATGAA
GAGTTTTACGTCTATAATCTACTACCTGCACCTGGATGCCCAGAGTCTTA
TTGTATAGATCCTTGCAAAGATCATATCGTTGATAATAGTACCAATGTAT
GGCAGAGAAGCACCGGGTTCTTAGCACTAAGTGATACAGCTGTCAGGTGT
GATCGACAAGGATTTAAAACAGGATGGTATCGTTTCAAAAGTAATGCAGG
ATCAGAAATGCCAACATCATGTCCACCTCAAAACGCATGTGATGCCGTGG
TTCTATTGTTCAATTGTGATTTCGGTATCACTAATTATTGGAGCAAACTC
GCAAGATCAGTCCTCAAACAATGATTCTGAAAGAAAGTGATGGTCCTAAA
GATATAACATTCAAAACAACAGTACCGATTACTTGTGGTCCTGGTATTAC
TTCGTGTAAGCTGGTTATAGAAGTAGCACAAACTGTAAAAGATTTTGTTT
TGAGCTTCTGCACTGTAAGGTAAATTTATTGTGAAGTTCATTCATATTTT
GCTAACTCTGCGACGGTAACAGACAAGAAAAGGAGTGACTTTTTCTATGC
TGGTATCAAGATCAGTACCCCAGGTTATCAGGAATTCCAACAGTAACTGT
GGATCAAAAGGTTTTGAATTTTACTTGTAAATTTACCCCTCAATACCCTA
ACAGTAATGCAAAACATCAAGTTCTATGGTATGGCGCTCCACCAAATGCA
AATCGAAAGTTGTTAAAGAAAGAAACGCTACAAGGGACAGCACACCAATC
TTATTTGTACAATAAACAAGCAGAGGATCTAACCTTTTTATCGATGCAAG
ATGAAGCGAGACACAATGCCCTGAAGGCAAACTTTCGCCTAACGGATTCA
CTCCGGGATGTACAGGTACAAATGGCCCCATTTGGATGAATGGCTTGCAC
CCGGATACTATCGGCCAAACAAAGACAGTTCCTGTATGTGTTCGATTTCA
GAGTGCTTGCTGTAAAGATACTTTCAACATTGATGTTAAAAAATGTCAGG
AGGGAAATGAAGAGTTTTACGTCTATAATCTACTACCTGCACCTGGATGC
CCAGAGTCTTATTGTATAGATCCTTGCAAAGATCATATCGTTGATAATAG
TACCAATGTATGGCAGAGAAGCACCGGGTTCTTAGCACTAAGTGATACAG
CTGTCAGGTGTGATCGACAAGGATTTAAAACAGGATGGTATCGTTTCAAA
AGTAATGCAGGATCAGAAATGCCAACATCATGTCCACCTCAAAACGCATG
TGATGCCGTGGTTCTATTGTTCAATTGTGATTTCGGTATCACTAATTATT
GGAGCAAACTCGCAAGATCAGTCCTCAAACAATGATTCTGAAAGAAAGTG
ATGGTCCTAAAGATATAACATTCAAAACAACAGTACCGATTACTTGTGGT
CCTGGTATTACTTCGTGTAAGCTGGTTATAGAAGTAGCACAAACTGTAAA
AGATTTTGTTTTGAGCTTCTGCACTGTAAGGTAAATTTATTGTGAAGTTC
ATTCATATTTTGCTAACTCTGCGACGGTAACAGACAAGAAAAGGAGTGAC
TTTTTCTATGCTGGTATCAAGATCAGTACCCCAGGTTATCAGGAATTCCA
ACAGTAACTGTGGATCAAAAGGTTTTGAATTTTACTTGTAAATTTACCCC
TCAATACCCTAACAGTAATGCAAAACATCAAGTTCTATGGTATGGCGCTC
CACCAAATGCAAATCGAAAGTTGTTAAAGAAAGAAACGCTACAAGGGACA
GCACACCAATCTTATTTGTACAATAAACAAGCAGAGGATCTAACCTTTTT
ATCGATGCAAGATGAAGCGAGACACAATGCCCTGAAGGCAAACTTTCGCC
TAACGGATTCACTCCGGGATGTACAGGTACAAATGGCCCCATTTGGATGA
ATGGCTTGCACCCGGATACTATCGGCCAAACAAAGACAGTTCCTGTATGT
GTTCGATTTCAGAGTGCTTGCTGTAAAGATACTTTCAACATTGATGTTAA
AAAATGTCAGGAGGGAAATGAAGAGTTTTACGTCTATAATCTACTACCTG
CACCTGGATGCCCAGAGTCTTATTGTATAGATCCTTGCAAAGATCATATC
GTTGATAATAGTACCAATGTATGGCAGAGAAGCACCGGGTTCTTAGCACT
AAGTGATACAGCTGTCAGGTGTGATCGACAAGGATTTAAAACAGGATGGT
ATCGTTTCAAAAGTAATGCAGGATCAGAAATGCCAACATCATGTCCACCT
CAAAACGCATGTGATGCCGTGGTTCTATTGTTCAATTGTGATTTCGGTAT
CACTAATTATTGGAGCAAACTCGCAAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14288MSTRG.14288Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14288.4.p2.exon19MSTRG.14288.4.p2.exon19Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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MSTRG.14288.4.p2.exon16MSTRG.14288.4.p2.exon16Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14288.4.p2.exon15MSTRG.14288.4.p2.exon15Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14288.4.p2.exon14MSTRG.14288.4.p2.exon14Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14288.4.p2.exon13MSTRG.14288.4.p2.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14288.4.p2.exon12MSTRG.14288.4.p2.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14288.4.p2.exon11MSTRG.14288.4.p2.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14288.4.p2.exon10MSTRG.14288.4.p2.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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MSTRG.14288.4.p2.exon8MSTRG.14288.4.p2.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14288.4.p2.exon7MSTRG.14288.4.p2.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14288.4.p2.exon6MSTRG.14288.4.p2.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14288.4.p2.exon5MSTRG.14288.4.p2.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14288.4.p2.exon4MSTRG.14288.4.p2.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14288.4.p2.exon3MSTRG.14288.4.p2.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14288.4.p2.exon2MSTRG.14288.4.p2.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14288.4.p2.exon1MSTRG.14288.4.p2.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14288.4.p2MSTRG.14288.4.p2-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000118_pilongenomesc0000118_pilon:393422..414989 -