MSTRG.15211.3.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.15211.3.p1
Unique NameMSTRG.15211.3.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000132_pilon:855691..889711-

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.15211.3.p1 ID=MSTRG.15211.3.p1|Name=MSTRG.15211.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=34021bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000132_pilon:855691..889711- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000132_pilon:855691..889711-

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CCAAATGTCGCGAAAACTAAAAATAATTTGGTACTTGGTAATAACCATCC
AGATGTCGCCAAGCAATTAAACAATCTTGCCTTGCTGTGTCAAAACCAAG
GCAAATATGACGAGGTTGCAGCTACTTTGAACAATTTAGCAGTGTTGTAT
GGCAAACGTGGGAAATACAAAGAAGCAGAACCACTATGTAAAAGAGCATT
GCAGATTCGAGAAAAGGGACCAAAGTAAATACAAGGAAGCTGCTAATCTG
TTAAATGATGCGTTGGCTATACGAGAAAAAACACTTGGACCTGACCACCC
TGCTGGACGTTACGAAGTAGCAGTACCACTCTGCAAACAAGCTCTTGAAG
ATTTGGAAAAAACTTCAGGCCATGACCATCCTGATGTTGCTACTATGTTA
AATATCTTGGCTCTCGTCTACAGATGATGCACTTAGTCAAGTTTCTTCAG
TCACAAGTTCAGTCAATAATGCTGGTGTTTACGAAATTCCGGCACGATTA
CGAACTCTCCATAATCTAGTCATCCAATATGCATCTCAGAAAATCAAAAC
AAAAAAGATGGCAGGCATCAGCTTATTTGAAACAAGGGAAATACAAAGCA
GCCGAACAACTTTATAAAGAAGTATTAACGAGAGCTCACGAACGAGAATT
CGGTAAAGATGATGAAATGAGGGTTGAAATGTATTATCAAAGAGCTTTGG
AAATTTACGAAACACAGCTCGGTCCTGATGATCCAAATGTCGCGAAAACT
AAAAATAATTTGGTACTTGGTAATAACCATCCAGATGTCGCCAAGCAATT
AAACAATCTTGCCTTGCTGTGTCAAAACCAAGGCAAATATGACGAGGTTG
CAGCTACTTTGAACAATTTAGCAGTGTTGTATGGCAAACGTGGGAAATAC
AAAGAAGCAGAACCACTATGTAAAAGAGCATTGCAGATTCGAGAAAAGGG
ACCAAAGTAAATACAAGGAAGCTGCTAATCTGTTAAATGATGCGTTGGCT
ATACGAGAAAAAACACTTGGACCTGACCACCCTGCTGGACGTTACGAAGT
AGCAGTACCACTCTGCAAACAAGCTCTTGAAGATTTGGAAAAAACTTCAG
GCCATGACCATCCTGATGTTGCTACTATGTTAAATATCTTGGCTCTCGTC
TACAGATGATGCACTTAGTCAAGTTTCTTCAGTCACAAGTTCAGTCAATA
ATGCTGGTGTTTACGAAATTCCGGCACGATTACGAACTCTCCATAATCTA
GTCATCCAATATGCATCTCAGAAAATCAAAACAAAAAAGATGGCAGGCAT
CAGCTTATTTGAAACAAGGGAAATACAAAGCAGCCGAACAACTTTATAAA
GAAGTATTAACGAGAGCTCACGAACGAGAATTCGGTAAAGATGATGAAAT
GAGGGTTGAAATGTATTATCAAAGAGCTTTGGAAATTTACGAAACACAGC
TCGGTCCTGATGATCCAAATGTCGCGAAAACTAAAAATAATTTGGTACTT
GGTAATAACCATCCAGATGTCGCCAAGCAATTAAACAATCTTGCCTTGCT
GTGTCAAAACCAAGGCAAATATGACGAGGTTGCAGCTACTTTGAACAATT
TAGCAGTGTTGTATGGCAAACGTGGGAAATACAAAGAAGCAGAACCACTA
TGTAAAAGAGCATTGCAGATTCGAGAAAAGGGACCAAAGTAAATACAAGG
AAGCTGCTAATCTGTTAAATGATGCGTTGGCTATACGAGAAAAAACACTT
GGACCTGACCACCCTGCTGGACGTTACGAAGTAGCAGTACCACTCTGCAA
ACAAGCTCTTGAAGATTTGGAAAAAACTTCAGGCCATGACCATCCTGATG
TTGCTACTATGTTAAATATCTTGGCTCTCGTCTACAGATGATGCACTTAG
TCAAGTTTCTTCAGTCACAAGTTCAGTCAATAATGCTGGTGTTTACGAAA
TTCCGGCACGATTACGAACTCTCCATAATCTAGTCATCCAATATGCATCT
CAGAAAATCAAAACAAAAAAGATGGCAGGCATCAGCTTATTTGAAACAAG
GGAAATACAAAGCAGCCGAACAACTTTATAAAGAAGTATTAACGAGAGCT
CACGAACGAGAATTCGGTAAAGATGATGAAATGAGGGTTGAAATGTATTA
TCAAAGAGCTTTGGAAATTTACGAAACACAGCTCGGTCCTGATGATCCAA
ATGTCGCGAAAACTAAAAATAATTTGGTACTTGGTAATAACCATCCAGAT
GTCGCCAAGCAATTAAACAATCTTGCCTTGCTGTGTCAAAACCAAGGCAA
ATATGACGAGGTTGCAGCTACTTTGAACAATTTAGCAGTGTTGTATGGCA
AACGTGGGAAATACAAAGAAGCAGAACCACTATGTAAAAGAGCATTGCAG
ATTCGAGAAAAGGGACCAAAGTAAATACAAGGAAGCTGCTAATCTGTTAA
ATGATGCGTTGGCTATACGAGAAAAAACACTTGGACCTGACCACCCTGCT
GGACGTTACGAAGTAGCAGTACCACTCTGCAAACAAGCTCTTGAAGATTT
GGAAAAAACTTCAGGCCATGACCATCCTGATGTTGCTACTATGTTAAATA
TCTTGGCTCTCGTCTACAGATGATGCACTTAGTCAAGTTTCTTCAGTCAC
AAGTTCAGTCAATAATGCTGGTGTTTACGAAATTCCGGCACGATTACGAA
CTCTCCATAATCTAGTCATCCAATATGCATCTCAGAAAATCAAAACAAAA
AAGATGGCAGGCATCAGCTTATTTGAAACAAGGGAAATACAAAGCAGCCG
AACAACTTTATAAAGAAGTATTAACGAGAGCTCACGAACGAGAATTCGGT
AAAGATGATGAAATGAGGGTTGAAATGTATTATCAAAGAGCTTTGGAAAT
TTACGAAACACAGCTCGGTCCTGATGATCCAAATGTCGCGAAAACTAAAA
ATAATTTGGTACTTGGTAATAACCATCCAGATGTCGCCAAGCAATTAAAC
AATCTTGCCTTGCTGTGTCAAAACCAAGGCAAATATGACGAGGTTGCAGC
TACTTTGAACAATTTAGCAGTGTTGTATGGCAAACGTGGGAAATACAAAG
AAGCAGAACCACTATGTAAAAGAGCATTGCAGATTCGAGAAAAGGGACCA
AAGTAAATACAAGGAAGCTGCTAATCTGTTAAATGATGCGTTGGCTATAC
GAGAAAAAACACTTGGACCTGACCACCCTGCTGGACGTTACGAAGTAGCA
GTACCACTCTGCAAACAAGCTCTTGAAGATTTGGAAAAAACTTCAGGCCA
TGACCATCCTGATGTTGCTACTATGTTAAATATCTTGGCTCTCGTCTACA
GATGATGCACTTAGTCAAGTTTCTTCAGTCACAAGTTCAGTCAATAATGC
TGGTGTTTACGAAATTCCGGCACGATTACGAACTCTCCATAATCTAGTCA
TCCAATATGCATCTCAGAAAATCAAAACAAAAAAGATGGCAGGCATCAGC
TTATTTGAAACAAGGGAAATACAAAGCAGCCGAACAACTTTATAAAGAAG
TATTAACGAGAGCTCACGAACGAGAATTCGGTAAAGATGATGAAATGAGG
GTTGAAATGTATTATCAAAGAGCTTTGGAAATTTACGAAACACAGCTCGG
TCCTGATGATCCAAATGTCGCGAAAACTAAAAATAATTTGGTACTTGGTA
ATAACCATCCAGATGTCGCCAAGCAATTAAACAATCTTGCCTTGCTGTGT
CAAAACCAAGGCAAATATGACGAGGTTGCAGCTACTTTGAACAATTTAGC
AGTGTTGTATGGCAAACGTGGGAAATACAAAGAAGCAGAACCACTATGTA
AAAGAGCATTGCAGATTCGAGAAAAGGGACCAAAGTAAATACAAGGAAGC
TGCTAATCTGTTAAATGATGCGTTGGCTATACGAGAAAAAACACTTGGAC
CTGACCACCCTGCTGGACGTTACGAAGTAGCAGTACCACTCTGCAAACAA
GCTCTTGAAGATTTGGAAAAAACTTCAGGCCATGACCATCCTGATGTTGC
TACTATGTTAAATATCTTGGCTCTCGTCTACAGATGATGCACTTAGTCAA
GTTTCTTCAGTCACAAGTTCAGTCAATAATGCTGGTGTTTACGAAATTCC
GGCACGATTACGAACTCTCCATAATCTAGTCATCCAATATGCATCTCAGA
AAATCAAAACAAAAAAGATGGCAGGCATCAGCTTATTTGAAACAAGGGAA
ATACAAAGCAGCCGAACAACTTTATAAAGAAGTATTAACGAGAGCTCACG
AACGAGAATTCGGTAAAGATGATGAAATGAGGGTTGAAATGTATTATCAA
AGAGCTTTGGAAATTTACGAAACACAGCTCGGTCCTGATGATCCAAATGT
CGCGAAAACTAAAAATAATTTGGTACTTGGTAATAACCATCCAGATGTCG
CCAAGCAATTAAACAATCTTGCCTTGCTGTGTCAAAACCAAGGCAAATAT
GACGAGGTTGCAGCTACTTTGAACAATTTAGCAGTGTTGTATGGCAAACG
TGGGAAATACAAAGAAGCAGAACCACTATGTAAAAGAGCATTGCAGATTC
GAGAAAAGGGACCAAAGTAAATACAAGGAAGCTGCTAATCTGTTAAATGA
TGCGTTGGCTATACGAGAAAAAACACTTGGACCTGACCACCCTGCTGGAC
GTTACGAAGTAGCAGTACCACTCTGCAAACAAGCTCTTGAAGATTTGGAA
AAAACTTCAGGCCATGACCATCCTGATGTTGCTACTATGTTAAATATCTT
GGCTCTCGTCTACAGATGATGCACTTAGTCAAGTTTCTTCAGTCACAAGT
TCAGTCAATAATGCTGGTGTTTACGAAATTCCGGCACGATTACGAACTCT
CCATAATCTAGTCATCCAATATGCATCTCAGAAAATCAAAACAAAAAAGA
TGGCAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15211MSTRG.15211Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15211.3.p1MSTRG.15211.3.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15211.3.p1.exon8MSTRG.15211.3.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15211.3.p1.exon7MSTRG.15211.3.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15211.3.p1.exon6MSTRG.15211.3.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15211.3.p1.exon5MSTRG.15211.3.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15211.3.p1.exon4MSTRG.15211.3.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15211.3.p1.exon3MSTRG.15211.3.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15211.3.p1.exon2MSTRG.15211.3.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15211.3.p1.exon1MSTRG.15211.3.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000132_pilongenomesc0000132_pilon:855691..889711 -