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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000134_pilon:184896..195950- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.15293.2.p1 ID=MSTRG.15293.2.p1|Name=MSTRG.15293.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=11055bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000134_pilon:184896..195950- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) AAAGTATCACTTCTTTTTGTTTTTTTTAGATGAGTGAAAATTTTATAATT
GAGAATGACCAAATACAGTGTATATATAAAAAGAAAAAAAGATATTTACT
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TTGGATACTTGTGTTCCTGCAGATTTAAAAATAGGGAAATGCAAATGATT
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TTGCATTTTTTTTCACTTGACAAAAATGAAACAAATTCTTACACTGTCAG
TTGTTTTTTGAATATTGAAGAATGATAGCTAAGTTTCCTAACAATAGACG
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CTACGCTGAGTGTATTTTCAAAGCGTAATAGAAGCATAAACTTTACACCC
TGTTGTGTGCTAATTAGAATATTTGACTTGGATCAGAGCCTGGTTTGGTC
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TTATACCCACAATTTACCTAAGGCCTGCTTAGTTATGTTTTTAATACTCT
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TTATCAAGGTTATTGATGTCTACCATTGACACTGAATTGGGTATATGATA
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ATGGAATTGGCTATTGGCTGAAATTCCTTCTTCTGAAAAAGGACTCTGAG
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CTCTTTCCTTTACAGCTTGGATGGAAGAACATTGCGTTTTGACTATAAAA
GAGACGCATTGACAGAAGAGAACGAAAGAATAATAAAGGAAATAAAAGTC
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TGCAGATACAGCGTGCAGATTTTAAAAGCAATGGAATGTCTTCTTTTTTA
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CTTGTACTAACTACTTTCCCCCTTGTATTATCGCATCTTTTCAGCAGTAC
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TTTTATATATCACCATCATTTATTATTAGGGTTTTCTATTGTCATGGGTG
ATGATATATCGTGACCGTTGGTTGAACACCATGGCACAGATAGACAAAAT
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TGGCTTGCTTCTTTAACAATTATTTTTAGTGTTATCCCTGCTTTTGATCG
TTTGCTTACAAAATGTGTCTCAGTTTGATATAATTTTTTTTGTATTTAAT
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GGATTGAAAAATGGGGAGAAGGTTGATGTATTAGCAATAAAGCAAACTGT
TGTGAGCGAGGAGTTTGTTGACCTAAGTAAAGAAGTAAGTTTAGTTTGAC
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GTACATTTATTTATGTATGTTTCAACCAATTTTGTTGTTTTATTCTCGTT
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AATCTGATTTTAATTTTCAAGGCACGTTCTTCTTTCGACTTATAGCTTCT
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ATTTTTCCGAGAATGAAGAAAAAATGGGTTCGAGAAAAGATAACGATCCT
TTAAAAGGTACTTTGATTTTGAAATACATCTTTACCCTTACAGCTGAATC
TCTGAATACCTTAAGGGAAATTTTCGCGGAATTTAATTTCGCGGTTCACA
GCTTAAAATTCGGAAGTTTCGCGGGAATTTAATTTCGCGTTTGGGAGAAT
TTTTTGTTTCACAAAATGGCCTATTTTGCCCTCAGAATACGAATTTTGGG
GTAGTTATTTTAATCCTGAAAATATTCGTGTTTCGCGGAATTAAATTTCG
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TATAAGTATCAGGGTGCATGTAGCCTGGATAGGGTGCCTAAAGCAAAAGT
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AGGTATTTACTGTAAAGCCAAAGATGTGTCTTCTGAAATGGACTTAAAAT
AACAACAGATAAATACACTTTCTCTCGAATGCTTTTTCACATTTTGATAT
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ATTGATAATAGCTTTTCTTTTCAAATTGTTTAGGTCACAAAGTCTAGTAG
AGGCCACTATGTCTTCCCGTGTGCAGCAGCTTGTGCAAAGAGATTTTATG
ATTGAATATTGTTCCTTGAATGTAGAAGATCAAAATTTGAGAGGTGGGGC
CGGGTGTGACTACTCGTTGCCATGGAAACTGACGTCATTGGTTACTATGG
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GAATATATTAGGAGATATAAAGGAAATAAGGCAAAATGACGTCATAAAAC
GATGACGTCATCGAAAAATCAAAATTTGCCAAATTTCGAAAATTTTTGTT
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TTTTGCCTGTCGAAGGTTGGAGCTTGCCCAAGCACATTACAGGCAAAATT
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ATAGTAACCAATGACGTCAGTTTCCATAGCAACCGGTGGTCACACCCGGC
CCCACCTCTCAAATTTTGATCTTCTACATTCAAGGAACAATATTCAATCA
TAAAATCCCTTTGCACAAGCTGCTGCACACGGGAAGCTTTTTCGCGACAT
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TGTTTTGTTTTTATTTTCAATCTCAAACCTACATTAGTTGATTTACTCTA
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ATTATCTTGCGGATGAACCATTAAGTATGGCTGAAACAATGCAACATTTG
GAATTGACTGACAAAATCGTTAACAAATTGACAAAGATAAAAAACATAAT
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ATTTTTTTTTTACTTTGAATGAAAGCATACACCCGATGATCGGCTTCAAG
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AAGTAGAACACCTACACAGTATGCCATACTGAAAACCATTAAAAAACCAT
TAAAAAACCATTATAATTTTTTGTTGTTTTTTAATTCCTAGTTAATTTTA
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AACTGCCACCAAAGGATGGTTATTGGTTTAAGCAGGTGAGATATATTTAA
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ATAAAAAAGATGGGTAATATTTTTTTAGTCCTTGACTAAAGAAATTGATT
GTTAAATTTCATACTTTAGGGATATTTACGCGTAAAACGAAAAATTGTTA
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GAATCGCATCGTGGTAAGATTGTCTTTAGTGTACCAATGGTAACATGGAA
TTATAATTGAATCCCTCCTCTCTATAAACCTCATTTTACCCATTTTACTT
ACTTTGTTTAGAACGAACTTGCTTTTTGGACCTACCTCGGAGGTCCTTTA
AATTAACCGATGTTCGTGTGTTCGTTCGTTTGTTACCAGCTTTTCTCGGG
ATTGGCCCATTAGTTTTTTCTGATTCCCAAAAAGTGACGGAGCCCGATTC
TCGAAACAAAAATTCCGGCGGAAAATCCCGGAAATCGCTGAATTTCCTAA
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ACCATATCATCAATTTTTTTTCAGTCCCTTTGCGTTTTTATTTTCTATTT
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TATTTTACTGATTGCCTGAAACTGGGCTTAATACCAATATATCTCGATTC
ATATAATTTTTATTTTCGAATCAGTTTCACCGCTTGACGAATCTACAGAA
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CGAAAATGAAAAACTTTCTGGTAAGTTATAGAAATCTTTATATACGATAA
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ATTTTACTTGCTTCGTTTTGGACAAAAGTCCTTGCTTTTATGTATTTTAC
TGATTGCCTGAAGCTTGGCTTAATATCAATATATCTCGATTCATATAATT
GTTATTTTCGAATCAGTTTCACCACTTGACGAATCTACAGAAGAACATCA
GTCATTCCCAAATGCTGCCAACGTGTTGAAATCAGATTGCAACGAACAGA
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GGTAAGATTGTCTTGAAAAACCTCGGGGGGGGGGGTAACAGAAAATCATA
GTGAAACCTCTTCGTTAATTTTAGTATAGCTTTTTACTTGTTTGGATAAA
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TGAAAAGTGAGTCGGTATTGCAGAACCAGAACCCAGAATCCAGAACCCTA
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GATGTTTCTTTATAAGCACAGTACCAATTACTTTGTTATTATGTTCTCAT
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TGGACGTAACCTTGTACAATTGAAGTATCCTGTAATACGATTTTCTTTAC
ATTTTTCTTCCAGAATCGAGGTTCTGTATTAAAGAGTGTAATGAGGTAAA
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GGCATGGCTTGAGCAAGCTTGAGGCTTCTTTGGGGCTTTCTTGGGGCATA
GTATTTTACAGTATTTTCTAAAATGGAATTCCTTAGGTTCAGTTGCCAAC
TTTAATTATATTTCTTTATCCTATTTCCAGTGCCCGGGAGACAAATGGTT
TCATTTCGCATGTATCAATATGGATCCTGATGATGCACCAAAAACAAGGA
AGAAATGGTAACTTTTTTATTTTTTTATTTGAAATGTTTTTTTTTTCCTT
AGAAATTATCAAATGATTAAAGCTACTTCTATTGTAATCGAGAATGAAAA
GGCTTTAAACTGTTTCGTGATTCAAGCTTTCGATTTAATTTTTATTGCTC
TTTGCCCGTTGAAGGTACTTTTTCTAATATCAATCCTTTTACTTTTAGGT
ACTGTCCATCGTGTGCACAATCAAATGATTTAAACTAATCAACTAATCAA
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TATTATGAACTCCTAAAGAGATTTATTTACAGAATCAAGTAACCTTGATA
TTTTATAAAGTGCTTTATTTTATGTTCTTTTACTGTATATAACCCATAAA
AACGATGAAATTTATTTACAGAGTCAATTAACTTTGATATTTTATGTAGT
GCTTTATTTTATGTTCTTTTACTTGTATATATGAACCCATAAAAACGATG
AGATTTATTTACAGAATCAATTAACTTTGATATTTTATGTAGTGCTCATT
ACTTGTTTTAGGGGAAGAAATTTTCGCATTGAGCAAATTCTAGCCTGGGA
ATCCAAGCTCATAATTTTAGAAAAAAAATAAAAAATACCTTACTCTGCCG
AGTCAGCTTTTTCCATAAATTATGCGTGTGCATCGAAATTATAAAAAAGC
GCGCGAAAGTATAGCCTATACTAGACGTCACCCGCGTTTTTTTACGCAAT
TAACGTCTATTCCACTTTGCGACTTTTTCGAATGTTTTGAGCCCAGGTTT
TCGGGCTCTAAACATTCGATTTTTTGACGTCACTTTTAACTTTCGAAGCT
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TATTTTTCGAAAATCGTCAAAGTGGAACTCACTAAGAAACGAGATGAAAA
ATCCCGTTTTTAGTGAGGTGCTCGCTAGTGAAATACTGCTAAGTAATACG
CTGAAAATCTGGCCAATTAGACACCATTGAACCTGCATTGCAGGGAAAAT
CTCCCTGCAGACGCGTTAAACCAGCAGCAAAAACATCATAAATTTAGATT
GTGAACAAAGTTTAACGCTTGGATTTCCAGGCTAAGCAAATTCGTGAAAT
TTTGCATTTTTCAGGAATATGTAAACCTTTCAAAGAAGCTTTTCAAATTC
TCTTGTGTTTTTATCAAAAGTACTTGTTTTTTATGTTGTATAACGTGTGA
GTGTGTATAATATGTATAAAACCCATGAAAAAGATAAGAATTATTTACAA
ACCTA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000134_pilon:184896..195950- >MSTRG.15293.2.p1 ID=MSTRG.15293.2.p1|Name=MSTRG.15293.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=32832bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000134_pilon:184896..195950- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) TTTCACCGCTTGACGAATCTACAGAAAAACATCAGTCGTTCCTAAGGATA TTTACGCGTAAAACGAAAAATTGTTAACGATGACGATGGCGAGGATGATG AAGGGTTGATAGCGAACATGATACCAAGCATAATACCGAGCATGAGGATG TTGACAGTGAACATTTCATCGTTGAGGAATCGCATCGTGATAATGCTCTC ACCCGCTGCTCGAAATTATTGCTCAAAACTGCCACCAAAGGATGGTTATT GGTTTAAGCAGGAACAACTACTGTGGACGATAAAAGTGACAGTAAAAATG AGGTGATTATCTTGCGGATGAACCATTAAGTATGGCTGAAACAATGCAAC ATTTGGAATTGACTGACAAAATCGTTAACAAATTGACAAAGATAAAAAAC ATAATGAAAGAAAATATTAAAGCTTCTACAAAAAGAATTGGAAGAGATTT CTACCTCCGCTTGGAGTCAACCCATTTATTTTTCCGAGAATGAAGAAAAA ATGGGTTCGAGAAAAGATAACGATCCTTTAAAAGCTTACGTCGTGGCTCT GTTGGAATACCAAAGTGGGATTGAAAAATGGGGAGAAGGTTGATGTATTA GCAATAAAGCAAACTGTTGTGAGCGAGGAGTTTGTTGACCTAAGTAAAGA ATACTTAAGAACTATTGGAATTCACTGTGATCTCGAAGAAGAAATCACTT TACTATTGCAAAACAACTGCCATGTAGAGGATATTTCCGTCTTTCTAACG CTGGAGAGAAATATCTTGAATAAGGCCAGTGTACCTGGTTTTCTATTGTC ATGGGTGATGATATATCGTGACCGTTGGTTGAACACCATGGCACAGATAG ACAAAATCACCGAAGTCGTCAAGTCAGCTTTGCCAACAAGACAACCAAGA TGGCAGGCTGCTTTTGGGTTGCTGATTTATACCAAGATGTTGCTTGGATG GAAGAACATTGCGTTTTGACTATAAAAGAGACGCATTGACAGAAGAGAAC GAAAGAATAATAAAGGAAATAAAAGTCTTGATCGAAGAGCATAAGTCGAG CATTGCAAGAAATATGTGGGAAGGCTTCCGTGATCATCACAATAAATGAT TCAACAATGACACCAAGCCAGGCCGAAAACCTTCTTCAAATACACGAAGG AAACACACAGGGGTCAAAGAACATGGGTACAATGCACAGTAAATGTTGCG CAATAACCATCTCATCAAACAATGAGGAACCTGAACGATGAAAGCTCTCA TATCACCTTGTTGTTTGGAAAAGAAAAAAACATTGGAAAATCGTTGACAC AAAAGATTCTTTTCTATGGCCAAGGAGGAGACCAGTGGAAGAAGAGCAGC CTTGTACTTGGTGGTGGCAATTCCGTCCAATCTGGCATATCAAGCTTGAT ATTAAAACTTAATGCATTTCAATGCAATGAAGACAATGCTGTTGATATGA AATCATTTGGTTTATCAAGGTTATTGATGTCTACCATTGACACTGAATTG GCTTCAAATTAAAAATAGAAAGATCTTAAACGAAGATACAAAGGTTTTCA TGTTGTCAACACACGACAGTGACCTCCAAGATCTGGAGCTAACTTTGGAG CCATGTTTACTTGAAAAGTCAATATGTAAAAAAATTAATAAAAGAAACAT CCTTCTTTCAAGGACAGCGTTCAACAGTTTAGATAAGCTACGAAATAGTT TGAGCAGTGCTACACGACATGAAATCCTTGTGAATGGAGATATTCCAAAT GTGAACAAAGTGATTTCAAATCTGAAAGACTGGCTTGTGAGAAACATTAC GGAACCAAGGAATGTGAAAGTTCCAACAACAATAGGCTACAGTCTAGATG ATAAAGTTTGGTACTTAAGTCCCGAGATGAGTGAAAATTTTATAATTGAG AATGACCAAATACAGTGTATATATAAAAAGAAAAAAAGATATTTACTGGA TGGCATTATTAATATAGTGGGGTATTTGGTGAAAGAGGATGTAACAGTTG GATACTTGTGTTCCTGCAGATTTAAAAATAGGGAAATGCAAATGATTTCA AATTTCACCGCTTGACGAATCTACAGAAAAACATCAGTCGTTCCTAAGGA TATTTACGCGTAAAACGAAAAATTGTTAACGATGACGATGGCGAGGATGA TGAAGGGTTGATAGCGAACATGATACCAAGCATAATACCGAGCATGAGGA TGTTGACAGTGAACATTTCATCGTTGAGGAATCGCATCGTGATAATGCTC TCACCCGCTGCTCGAAATTATTGCTCAAAACTGCCACCAAAGGATGGTTA TTGGTTTAAGCAGGAACAACTACTGTGGACGATAAAAGTGACAGTAAAAA TGAGGTGATTATCTTGCGGATGAACCATTAAGTATGGCTGAAACAATGCA ACATTTGGAATTGACTGACAAAATCGTTAACAAATTGACAAAGATAAAAA ACATAATGAAAGAAAATATTAAAGCTTCTACAAAAAGAATTGGAAGAGAT TTCTACCTCCGCTTGGAGTCAACCCATTTATTTTTCCGAGAATGAAGAAA AAATGGGTTCGAGAAAAGATAACGATCCTTTAAAAGCTTACGTCGTGGCT CTGTTGGAATACCAAAGTGGGATTGAAAAATGGGGAGAAGGTTGATGTAT TAGCAATAAAGCAAACTGTTGTGAGCGAGGAGTTTGTTGACCTAAGTAAA GAATACTTAAGAACTATTGGAATTCACTGTGATCTCGAAGAAGAAATCAC TTTACTATTGCAAAACAACTGCCATGTAGAGGATATTTCCGTCTTTCTAA CGCTGGAGAGAAATATCTTGAATAAGGCCAGTGTACCTGGTTTTCTATTG TCATGGGTGATGATATATCGTGACCGTTGGTTGAACACCATGGCACAGAT AGACAAAATCACCGAAGTCGTCAAGTCAGCTTTGCCAACAAGACAACCAA GATGGCAGGCTGCTTTTGGGTTGCTGATTTATACCAAGATGTTGCTTGGA TGGAAGAACATTGCGTTTTGACTATAAAAGAGACGCATTGACAGAAGAGA ACGAAAGAATAATAAAGGAAATAAAAGTCTTGATCGAAGAGCATAAGTCG AGCATTGCAAGAAATATGTGGGAAGGCTTCCGTGATCATCACAATAAATG ATTCAACAATGACACCAAGCCAGGCCGAAAACCTTCTTCAAATACACGAA GGAAACACACAGGGGTCAAAGAACATGGGTACAATGCACAGTAAATGTTG CGCAATAACCATCTCATCAAACAATGAGGAACCTGAACGATGAAAGCTCT CATATCACCTTGTTGTTTGGAAAAGAAAAAAACATTGGAAAATCGTTGAC ACAAAAGATTCTTTTCTATGGCCAAGGAGGAGACCAGTGGAAGAAGAGCA GCCTTGTACTTGGTGGTGGCAATTCCGTCCAATCTGGCATATCAAGCTTG ATATTAAAACTTAATGCATTTCAATGCAATGAAGACAATGCTGTTGATAT GAAATCATTTGGTTTATCAAGGTTATTGATGTCTACCATTGACACTGAAT TGGCTTCAAATTAAAAATAGAAAGATCTTAAACGAAGATACAAAGGTTTT CATGTTGTCAACACACGACAGTGACCTCCAAGATCTGGAGCTAACTTTGG AGCCATGTTTACTTGAAAAGTCAATATGTAAAAAAATTAATAAAAGAAAC ATCCTTCTTTCAAGGACAGCGTTCAACAGTTTAGATAAGCTACGAAATAG TTTGAGCAGTGCTACACGACATGAAATCCTTGTGAATGGAGATATTCCAA ATGTGAACAAAGTGATTTCAAATCTGAAAGACTGGCTTGTGAGAAACATT ACGGAACCAAGGAATGTGAAAGTTCCAACAACAATAGGCTACAGTCTAGA TGATAAAGTTTGGTACTTAAGTCCCGAGATGAGTGAAAATTTTATAATTG AGAATGACCAAATACAGTGTATATATAAAAAGAAAAAAAGATATTTACTG GATGGCATTATTAATATAGTGGGGTATTTGGTGAAAGAGGATGTAACAGT TGGATACTTGTGTTCCTGCAGATTTAAAAATAGGGAAATGCAAATGATTT CAAATTTCACCGCTTGACGAATCTACAGAAAAACATCAGTCGTTCCTAAG GATATTTACGCGTAAAACGAAAAATTGTTAACGATGACGATGGCGAGGAT GATGAAGGGTTGATAGCGAACATGATACCAAGCATAATACCGAGCATGAG GATGTTGACAGTGAACATTTCATCGTTGAGGAATCGCATCGTGATAATGC TCTCACCCGCTGCTCGAAATTATTGCTCAAAACTGCCACCAAAGGATGGT TATTGGTTTAAGCAGGAACAACTACTGTGGACGATAAAAGTGACAGTAAA AATGAGGTGATTATCTTGCGGATGAACCATTAAGTATGGCTGAAACAATG 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Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
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