MSTRG.12992.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.12992.1.p1
Unique NameMSTRG.12992.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000101_pilon:69093..75282+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.12992.1.p1 ID=MSTRG.12992.1.p1|Name=MSTRG.12992.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6190bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000101_pilon:69093..75282+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
tttGATTGAAAACTTCTTTTGAACACTTCGTTATTGGTAAAGTTGTTATg taaagtaagttttttttccaccgaaaattttcaactttgtttttcaaatg ttgtcaaaatttttcgtaaaatcatacccttagagtgcattttcccccaa attttcgatccctttcgtgcaaaaaatggtcaaaattctagcatttttgg tcaaaatatctagatttttcaagaattttctgaaatttctacccttacag tgcacctctagtttttccgacccttacagtgcattttaaacatattggaa aaggtacccttaggacccgcacatacccgtcggtccttttgcccagctgc cccccccccgggcaacgcgtacataaatgctgtatttaaagacgaaagac aaatggagagagaaagtttgttgatatttttcatgttgacaaTAAACCAG CTATCACACTTTCACTtgtacaatatgggatatattttagGCTCGgaaaa attctgaactagaaaaagaaaagtattaatatataaataactgaaactga taaaaacgaagaaagtgaagaatatttttgttcattatGTATATTTACTG GAATTTTCAAAAGGTGATTTACATGGCtttttttCATTAATAGGTTCACC AAAGAAATGAGAGATGCTGTCAGAATGATTTTGGTGGCTTTGAGCCTTAG CTCATTTTGCACAAGTACAGTATATGAAAGTAAGTTGTAATAAGTGTATT TATTCCCTCCATCTAGTAATGGACCCAAGCTTGaaaaaaggtcactgaca aagtaaaaatgatttaaaactttataaaaaaattccgAAGTGAGTGAATC gatatgatgaaaaaaatttctgaaaatttttttggatccGTTAGAACGTT GAATACTTTGAAACGCAAATCTTAGATTGAAAGTTTACATCTTTCTGCAT 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GAGACAATTCCCATGTCTTTAATATCATTAATGTTCTCTTTCAGATGTCA ATCATTGGGGACCATGGTCCAGCTACACTACTTGCAGTAAGACATGTGAT GAAGGCAAGAAGTCAAGAAAAAGAGTTTGTATTCAAGCAAATCCTCCAAA TAAAGATAAAAGCAAAGATACTTGCCATGGTGATCAAATGGAATATACCA CCTGCAATCTTCGTCTTTGTTTAAGTAAGGTTTTTCTTGAATCTTTAAAA GAGCTTTTTTGCCACTATCTATGAACACCCCCCTCCCAGCGGaacttcaa ttcacgcaatcacgcaaatcgTTTCCCAAATTCATCAAATCAAAGCATGT CATCAGAATCTACAAAAACAATCATCAGAGGATGATACACAAGTAGCACA AGTTATGATTTGTCCACTTTTTACTGACACATACCAAAGAGTTGGATAGT TCAAAAAGCCTGATTCTTCATCACTAATAGCTTCAAAGTAATACAAATGT AAGGATACAACACATCTAGTGTACACATTCTACATTCACTAGCAGTGTTG TTATTTCGAAATCTCAGTAATGACAATTTTAAACCACCACGACTCACGGT TTTTACATTGAGTTTCGAATAGGGATACAATCAAAGACAGAAAATCCCAG TGGTAAAGAAATTGTTGAGTATATTTTCCAATGTTGACCAAatttcccaa tggggatagggATCCTAACGGGTCTATAAGACGGGGGATGTGTCAGGGCC TCaaaaaaaaTACTGAATATATCTATATCTTTCTAAGTACATTACTCGTT AAATGGAGAACTCTCACTTAGAATCAGTGTAATATTACTCTTTCACTTTG tgggatttttccaatttttttactttttactttcagTGAAGCCAACGTGT TACCACAAATACACTCCATGGTCTTTGGATGAAAGTGGAAACCCAGAAGC CTTATCTTACCACAAAATCCATTGCGCTGATTGGCATGTTCTTAATCGTG TCCGGTTAGATCGAAACATGTTTAAGAACAGATATAGATATTACTACCGC TGCTGCCATTCACAACTACCCTGTGACGATTCCCAAACGAAAAACAAACC CACACTCAATAACGGTACAATGGTTTCACTTGACCAACAACCAGTCCATT GTGGAAAATTTGGAGTTAGTTATTTGAAATTGAATACGATTATGgataaa aaacaatatttgaGTTACACATTTGAATGTTGTAGACCTAGGAATGAGCT AGCTGGAACTATATGTTATAAGGGGAACACAGGATTCAAAAAGAGGAAGG CGCTTGATGAACATTCGATCTCATGCACCAAGGATGATCGTTACTTCATT GCaaattttaacttaaaaattaaCCATACACAAGACAGTGTCCGCTATGA TTATGAATGTTGTAGAATCGACCCAACcgttaaaaacttttaaatttgta ttttttgctaGAGCTTTATAGACTTGTTTTTCTTTGGAAGGGATCATGCG ACGGTTTCAGGGGGTACACAATAGCATAAAATTTGTcgagaaaattttaa acaattttaataTTATGTATATATGGGATGTATGCGAAGCTTAATGTATG TAAGGGATTTTATCTTTATTCAAGTTTTAACAATGAAATGGAGTTTCCTT CCCAAGGAAATCCATTTGAAATTTGACCTTAGGTTATTTAATGTGTTAGC GGTGGCAATAAACCTCTAAATAAAGATAATAAACGGAGAAAGTTGGATGC TAAGACGTCGATAGAAGTCAAATATTAATTACATCTTCCAATGAAAATCG ACTCTTTTCTAATTTAAAGTAGCTGCAACTTTTTGATGGAGTCTTTCCAA AACAATGCGCAGCTTAATTGAATCAAAGAAAGTGAAGCTTAGGATTATAT 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000101_pilon:69093..75282+

>MSTRG.12992.1.p1 ID=MSTRG.12992.1.p1|Name=MSTRG.12992.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=10626bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000101_pilon:69093..75282+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAGAGATGCTGTCAGAATGATTTTGGTGGCTTTGAGCCTTAGCTCATT
TTGCACAAGTACAGTATATGAAAGATGTGGTCAAGAATTCGATGTGATTG
GATGTTTCACACAAACCACAAAAGCTGAACGTTTCAATAAAACCTTATCT
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TGACACCAATACCTCCAAAAACATGTCGATGGGGAAATTGGACCAAATAT
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ATGTTTAAGAACAGATATAGATATTACTACCGCTGCTGCCATTCACAACT
ACCCTGTGACGATTCCCAAACGAAAAACAAACCCACACTCAATAACGGTA
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AGTTATTTGAAATTGAATACGATTATGgataaaaaacaatatttgaGTTA
CACATTTGAATGTTGTAGACCTAGGAATGAGCTAGCTGGAACTATATGTT
ATAAGGGGAACACAGGATTCAAAAAGAGGAAGGCGCTTGATGAACATTCG
ATCTCATGCACCAAGGATGATCGTTACTTCATTGCaaattttaacttaaa
aattaaCCATACACAAGACAGTGTCCGCTATGATTATGAATGTTGTAGAA
TCGACCCAACcgttaaaaacttttaa
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12992MSTRG.12992Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12992.1.p1MSTRG.12992.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12992.1.p1.exon1MSTRG.12992.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12992.1.p1.exon2MSTRG.12992.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12992.1.p1.exon3MSTRG.12992.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12992.1.p1.exon4MSTRG.12992.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12992.1.p1.exon5MSTRG.12992.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12992.1.p1.exon6MSTRG.12992.1.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12992.1.p1.exon7MSTRG.12992.1.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12992.1.p1.exon8MSTRG.12992.1.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000101_pilongenomesc0000101_pilon:69093..75282 +