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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000125_pilon:339423..353346+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.14763.2.p1 ID=MSTRG.14763.2.p1|Name=MSTRG.14763.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13924bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000125_pilon:339423..353346+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AGGAGTTTAGGAGAAGCATTGCAAGCTTAGTGGAACGTTTTGGAATGAAA
GATGACGTTTACAAACTTGTATTGAGGTTTGTATCTTTTCTAGTTTCTAA
TCTTCTACATTGAACTTCCCATAGACAATACCGAAAACTCCCTGACTTTT
GTAAAGCCCATTTGCACATTCAGTCCTAAGGTTGCTTTGCTCTCTAGCTC
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gacagacacaatGTTAAACTATTAATATTACaccctttttggacctaccc
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aaaaaattaagaatgtcgtaagaatattgccatcatgaaaattaaaagaa
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GCTAATTAAGAAGCTGacctattttattttatcttccTTATACATAGCTT
ATGTACTCGAAGACCACCTTTTAACTCATTTGAATGTTAGCAGATAAGCA
GTTTAAAAAGTATGTATGTTTTTTGCGactgtaaaatgaaaataagaaac
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CGCCCTAtcgcaaataaaacaataagTTTTTAATTCCAGACGTCTGTCta
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ggacACTCAGTCTCTTAACTTCAAAATGAATGCACGAGGGAAGAAGTATA
AGCAAATGGCGTTTGGATCATGGAAAGGATTCAAGAGAACGGTTATACAC
AACAACAAGGAACTTGAACTCAAAGTGAACGAAACTGCAGCAGACGTAGA
GAAGAACGTCCAGTGCTCATACTGCTCAAAACGATTCAAGAGTAATGGCA
ATCTTGTCAATCATTTGCAATTTAAACACCTTGAGGAACAAGAGAGTCAA
GAGAATCTTTCCTGCGACCTCGCTTCAAATTCCAGCATCACAAGAGACAG
AACAAAAGCAATTGTTCGTTCCGTTGTTGCAAAGCTGGTATCTGATGTTG
TTGATAACGTCGAACGTGCATCTCCAGCTGAAGATTGTGTTATCGTGGAA
GACAAACCAAAAGCGAAATCTAACCGTAGAGGGCAGAACAGACGGAATAA
GTATACAGCGCAGTTTAAAGCAACTGTTATCGAGAAGATGATGCCTGGTG
TTCTTAAAGAACACTTGGTAGAGGAATACAACGTTTCCCAGTCCAACATT
TCTAAGTGGCTTAAGAACAaggacaaaatttttaaagaggtTGCTGATTC
CAACCGTAAAACATTAACAAAAATGCGAGTGGGGACAAAGTACGTCCGTT
TGTATAGTGAGCTCCTTACTGAAGTTAGAAAAGCGAGAAGCCGTGGTTAT
TTGGTTAATTTCAATTGGATTTGGACAAAAGCCAGGAAGATATACCGTAA
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TCTTACGCCGATACAACATTCGGATGAGAGCACGACAACGTAACCGAAAG
TACTCAAAGGAACATTTCAGAGTAGCTTTGACCAAATGGCACGGATCTAC
TCGGGAACGCTTGATAAGAACTGGTCTTAATGATGACTATGATCAGAAGT
GGGGACGATTTCGACCAACTAATCGTTTCAACGTGGACCAGTCGCCTTTA
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AGCGACAATGCACCCTACAAGTATGCATCCGCGCTGAAGGGGAGCAACCG
AAACTGGCTATCATTTTCCGAGGTACTGGAAAGGGAATCAAAGAAACGGA
GAGATTATCGTATCACCCAGACGTtgacatttattttcaaaagaacgCTT
GGGCAGACACTGAGTTTTCTGTAGAGTGGGTAAATAAAACACTTGCCAAA
GTAGTTGCAGGGGTCGACCGTTACGTTCTGTTCTTGGACAACCTGACCGC
ACAACAAACCACTGAATTCAAGGAGGCTGTAAGCTCACAAAATGGCGTTT
GTTGGTTTGGACTGCCAAACGCAACCGATTTGTGGCAGGTTGTTGATGCT
GGAATTGCTCAACTGCTCAAAACTTTGACCAAAAAGGAGCAGGATGATTG
GCTTATGGATGACGAGAATTCAGATAAGTGGTATGGGCATACCGAAGACA
AAAAGTCTTTCACGGCTTCTGAAAGGAGAATTTTAATCTCCCATTGGTGT
GGGGAAGCATGGAAGAAGGTAATTTCAGGAACTTACGATAGTTTTATCAA
AGGCTGCTGGGAAAGAACTGGATGTCTTATTACAGCAGATGGATCTGAAG
ATGAGAAAATCAAACCAGAAAGCTTATCTGACTACAAAGTACCACCACCA
ATTGATTACGTCGAAGCCACCATCTCAGTCGCTGTTGCAAACGTAGTACC
AGAAGTGATCATCGACCCGTCTATCGAACTGGAGCCAGAGCCAGAGGTTG
AATTGGAGGAGGAGGAAGACCCGACCGATGAAGAAGAGGTGCAGCTCGAC
AGAGAAGAGGATAGAACTTTTGCAGATGAAATGGTTGGGATGAAAGTGAA
GGTTTTGTACGAGCACGGTTGGTGCGAAGGAGAGATTGTATACTTTAACA
AAGCCCTTCAAGAATATAAAGTTAGTTTTGTTGATGGTGACGATGATTTC
ATTCCCGAGGACGAGGTTGGAACTGCAGATGTCCAAGTGattatttaaaa
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TACATAGCTTAGCTGTTTAATACATTGTAtttattcttttgtcttttatg
CATACACATAAGAAAGTTTTCTGTTTTTACATTACTTTTCGATGATTTTG
AGACAATGACTggtaaaatctgaaaattaacCTTAAGAATGTGTTAAGAA
TATTATATGATGATTTCgacaaaaaagttaagaatatccatgatgaaatg
gatttacaccattcttataaaaaaaaaagcgtgtatttattaagctgtgc
atttttctgatagtggtttttataaagaaaagcgcttaatcgctttttta
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tgtgtttcactgtttcaatgttcactgattagtttgataaccaggtaggt
ccataaaagtatcgcttgttatAATCATTAATTAGAGTTATAGATCAAGG
GCCCTTGTTTGCTGAAAAGATTTTCCTTTGCGTGATAGTAAAACATATTT
GGCTGTTTTCAGGGCTCGAGCCTTGACAGCCTGGTTGCATATAAAGGAGA
AACTGATTCTGCACATTTCATCACTTTTTGACTATttcaattaaaataat
tttgtttttctagaAAACTCGAAGACCGGGATGAATCAGTTAGAGCCGAA
GGAATTATTTCACTGGTAAGCGtttctttcagaatttcttcagaattttt
tgccagcactttacttcaatttctttttgcaACCAGCTTCCCATTGGTCA
GTGTTTTCCTGCAAATAGCTGCCAGTTGGTGACCATAGCTGTATTGGTAC
TAGTagtaacatggtttagagggtgatttgggattaataaccccgaggtt
cattgaaaacatttcaaaatagcccgaacgtaccgagaataccatgttat
tccgcgttaattatatggtcaaaaaaagaattgaagaacactcaatcgct
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actgacactcttattttgattggcttaaaaatttcttacgatattttgtt
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TATATATTTGACATTGCGTCCGTTTGGTTATATATAAGCTTATAAGAAAA
GAAAGATAACTAGCTTCCTACAAACAAGGTTAGTGGTAAGTCAAGGAATG
TTTTATGTCTGGGCCTAAATGTTGAGAATGGTTTTTtcttcgtgtttttt
ttttctattttgatcaAAAGGCTTGGAGTGACTTCTTAAAATGATTCAAT
AACCAGTATACCTTGTATTTTTAGAACCGTCTTTATATATAACTAAAGAC
TTTTTTCCTACTGATCTTCATTTAATCTCCTGGATCGGaaaaaaaaCGAT
CTAGTGAGCAGATATATAGATACCTGTCCCAATTTATGGATGTCCGTAAG
TATCATGCCGTACTGATAACATGTTTTCGTTTTTGAATTTCCAGGCGACA
CTGCAAGTGAAAACAGAGCGTGAACTCAAAATCCTTCTCGACATTCTTGA
ACTTGATTCGAGTACTTATGTGAGAGCTCAAGTCATTCGAACGTTTGTGG
CTCTACAATGGGTTCACCCCAGGGTCATACGAGCTTTACAAGAAAGACAA
AGAAATAATGCTGATTTCCTCTCAGAGTAAGTAAAATCTATCGAAAAAAT
AGACTTGATTTGTTTAAAAGTTTAGGAGCTGTTTCATTATGATAATACCA
GCTTATTGGAAtaattttcgcgtgttacattACAAGCAGAGCGAAATTTT
CTGAATTCGATTTCGCCCATaggcatactggagaagtgggacgtgggacg
gtgggacgctaaggtgggacggtagtgggacgctaaggtgggacggtagt
gggacgctaaagtgggacggtagtgggacggtagtgggacgctaaggtgg
gacggtagtgggacgctaaggtgggacggtagtgggacgctcaggtggga
ctgtagtgggacgctaaggtgggacggtagtgggacgctctctcgtaagg
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ACTCTCAAATGATTACGCCAGTATCgacaaaataacaatgaaaatcctGC
CTATTGTTTGTATGCgcgaatgaaaatgttttacgcaattacattacgtc
attttttattactttttatggtaatataaaaacatttgctCTCTCCGAAG
AAACATGACTaactagctcagtcggtagagcatcaGATTCAAGGTCAGGT
Ggtccagggttcgattcccccacacgtatttttttttcttttctaaacta
ATCTATCCACagggatcaaaaatatttcagacctgatcaaaaatatttca
gacctgatcaaaaatatttcagacctaatcaaaaatattgatttttcaag
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CTTTaatcttttgatacttttgatacaattttcatcCAAAATCTGTCTTT
GAATCATACAAAGTTCCAATACACTTTCCTCGAGATATACATgggggggA
TAttggcaaaaaggggtacggatgctccggggAgggggggtactaggttg
cgaggtgacaggtatgtccgaggcaaaaatcgaaaattgcccctttgaga
gacaaaattttgatgattttgggaccctttgagagattttttccctaaat
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GTGTTAAAAATTGGTTGGCTAGTCAGACAGGCTAATAAcgttttttctga
aacaaatattcttttgacactttttgccGGACAAAATCGGTTCGGAAAAA
CTGGAGCAACCTTCGATTGCCTTATCGGACTTTTTAGCTGTTGGACTAGA
TGATGTCGGATGCATGACTTTTGAAGACTCCTCCCCCCAGTTTGTGAAAT
CATCATTCTGAGCAGTTTTCCAAGAGAAAAATCTGTATTTCCAATTAAAT
AAGACAGGCTATGAATTTTCGCAtaggaaattgattttctgtggtttctc
aagggaataataatcttctttttcaaaaagaaaaattcaactaatgattg
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gaaaatacgtaacaactaattttccttagaaaatacgcaacaactaattt
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tttccttggaaaatacgcgataactaattttccttggaaaataaggGACA
ACTAGTTTTccttgaattaattattttaatcttcttatcttctaatCTTT
CTTATCCGTTCGGGCTGACCTTCAgcacagctggtttatttccTTAATCC
TAGGAAGcgtttctctttataaaaataattttacataaaaatatagcatg
cttttgtttcgaaactgctgatgcaagatttaattacaaaaaatataaca
tgatagttttcgagtgttatatatatttagTGCAATCGGCTCTTGCATGt
tggaaataatctaaaatcatttctttaagaagtcaataccttgacagggt
aaaatTATACAAGTCATGGCAAAATAAAGGTCTCATGATAATCATTGTTC
ACTTCTCTTGCACATCAGCTGCGTGGCCGAGTGGATAAGTCGATGAAACG
GCAACTTAAGGGTAATGATTATAGAGAGTTTGAATCCTATACGGGTGCGA
CGaaaattgtgttattttgtctgttttgtcaacattgatcaaactttttc
tggttttatgagctcttattgatatttttgaaaatttccgttaaaatttt
aagaaacaaaaattggggggggcagtcaggcaaattgaccgacgccgCGA
CGGGTATCTGCAGCGGTTTAggctatctgatattccgatggcgtattggc
ggccgcccacgctaaagcatACTGTCAAttggtaacccccccccccccgg
agtgtCACCTCAGCTCAATGCAGTTTGattcaagtacagtatttcaaaat
ggataaGGTTGATTAgcgggtggagagtcaagagtcaagagttatgactt
tcccttgtcttgaaaatctaatgttccaaaactttcaactaaaaaaatgc
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ccgtgagcaatctcgttatatttatcaaaagtaatatacttgtggaaagc
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tttaattcatatttccaataattaagtacttgacctgtccctcttcactg
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ccttagcgtcccactaccgtcccacttgagcgtcccactaccgtcccact
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agcgtcccactaccgtcccaccttagcgtcccacgaccgtcccactttag
cgtcccaccttagcgtcccactaccgtcccaccttagcgtcccactaccg
tcccacttgagcgtcccacctgagcgtcccacctgagcgtcccaccgtcc
cacgtcccacttctccagtatgcccgCCCATAGTGTTTTGAAAACTCGAA
ACTCTCATAAaacaactttgaaattttcgtaaaaaattggttttttgTTT
TGGATTTAATTTCAAGTGATCAGGAGCCTTCTCCAACAACAGCAATCAGA
TATAGTCATACTTACCTTGTCTCTACAGGGAAGCAGAGAAAGCCTTAAAA
GTCTTGTTAGCATGCACGCCGAAATCCCCGTCACCTTGAGTTAAATACAC
AAGCAATCGGACAAAAAGGTTTGTCAAGAAGATTCATTTGCTTTGTCTTT
ATCTTTATTCTCTCATTTTGTTCGAAAATCCGTCGATTTTACCCGCTAAT
AGGGCttttttttGGCATATCTGTGCCTATAGAGTGTACCATGGAGCTCT
TTGCCCTTCTTGGAATAAACTTTCCTCTAGAAACAGATTATTCCAAGTTC
TTCTAACACTCTTTATATTTCATTGAATGGAAAAGAATTGCTTGAAGGAA
TTTGATTAAACACTCATTTAACTCCAAATTTATAATTGATAGACGTCTCC
ATTAGTTTTTACTCTTGCTAAATAACTTCCCAATGGAGAAACCAGCCTTA
ATTGGATATTGaagattaaatatttttataatactttttttcTAGCTTTA
ATTTTCACCTCTGTTATTTTAGCGATCTGGATTAAGTGTTGGAACGTTAG
ACTTTGTCGGTGTGTTATTGTAAAAtcttatttaaatattttatatatga
tcAATCAGAAATCTTCGCTTTACattcggggggggggcactccaggtaag
tgacctaccggacgtacccttaagggtaggtctttttgactttggaaagt
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tgtaaaatttgagaaaataccaaattttcaggtaaaatttgagaaatttc
aaaaacttttgccCTGAAAGGGGCAaacaatttcgaaaaattgcactata
agggtcgattttcagccaaatctttcctgcactgtaagggtccgatttta
gagacctgatttttggccgaacgtacggtcgttttcaaaatcgaatgCCC
CCCTGGCTTTACATTATGATACCAGTGAGGGAAGTTCaaaaaaaGTACGG
CATTGCAGATAGGAAGAAATCCCTGATTCTTCCGGTTATTATTCACATAC
TAAGTGTTTATTTAGTGAAGTGAAATTCATCTTAGTTAAGAAGAAAATGA
GTTTTAGCAAGTTCCTTGGTTTTAGCGAACCTATAGGAAAAATGTTGTAG
AATCGGGAGGGATTTTTTAATGAGTTGATTTTCAGCATCGACCTTTTAGT
GACGTTAgagaatttgatttattttagtgtgtatttagataatgtttaaa
tttatttattgattaatttattgttgtgaagatttggtttaccttttttg
gatttaatACATTAAATTGTCTTCTGTCCTGTGATACTTTGCTACTGAGA
CTTCCTGAATATAAAAGCTTTTTTCTCAGAGATGGGCTAAAGGTATTATT
TTGAGTTCTACTTCGGTGTTGAAAATTATGTATGTATTAGACATATGTAT
GTATTATTGCACCCCGCTAAGGTCAAATCAAAGATTCATAAATGATGCTT
TATGCCTCTCTGTTTGATTCTCAACATACTTTCGGGTAGACAGCTGAAGA
AAAGTTAGCCTTTGGGTCGTTTCTGATTGCGGTTGCAAACCTACTGAATA
ATACTATGGTTCTCTATAGTGACTCGTGTTCCACTCTTTTCTAGAAAACA
AAtatcaaagtaaacaaagtagaTAATAATTTACACAAAAGGAATCATTT
AACAACAACCATATCATTACAAGCATCAATCATGAAGCAATCTTTGAATC
CCAGAGATAGCGGTAAATACATTGCAGAGAATACCAAATATGTTCAAATT
CAGCACAAGGAAATTCCAAAAGCAGCTCTCAGACTGAAAGAAGTGATGGG
TAGAAACAAATATTCAATCAAGAAATGGAAAGAATGGCCTCTTCATCCTA
AAGCAATGAATGATGATACTCTGCATTGGATATTGACCGTTGAcacatta
aatttttcattttggttgCCTAGGAACGAGCCTCAGTTTCAAGTCGAGTA
CAAAGGGAAGACGTATGAAGATTATGAAGCACTGTGCGCATGCGTAAATC
GAGCAGTCGAGGTAAACAGCAATTAATtagctacacgctttttataagaa
catcgaatAGTTTTAATAGCCTCTGGATGTGCTAAACTCTTTgtgtttta
agccaaaaaatgttcttaaaatgttattaatttcaccatttcgtgagcat
ttttgtccatttctaAGAAATCAGTTGTTTTTAGAGGTcgcaaagccttt
aaatgttcttaactttttcctagtattttggccattgaagccttatgttc
ttatatagtttgttcttataaaaaacatgtatttgcTTAGTATCACTTTA
GCACGGGGTTTATTTAAAGAAGACTGGATGGCCGCGATCAAGTAGCCCGC
TCGTAAATGGTAATTCTCAATGTTGAGCTTTTCTATAAGCGGAATGTAAA
GCTGTTGGCCAGGTGTTAGTATTccgttttaaattttatttttcaactcc
aagtagttcaATTCTATTTGGAACACAGGTTGTCATGCTGTAGCAAACGG
taaaattaaaaatggcttttttaaaaatctaattaataatctaactttcg
aattttttcaggAAGGAATCCTCATAACGACTGCTTCTTACAACAAAGAA
ATCTCCCTGGAAACGGTTAATCAAGTGTTTCGATCATCCAATGGGACAAC
ACTTCCCATGCTCAAACAACGGTGGGAAAATCTACGCCAAGTGGGTTTAG
TGCTATGTGAAAAATTTAACGGAAATTTCGCGAATGTTATCAAGGAAGCT
GGTGAAGATGTAGAGAAACTTATAGAACTTGTCACGActaatttttcttg
tttcaacGATGTTGGTTGTTTTGAAGGGCAGCCAGTACAGTTCCAAAAAC
GAGTACAAATTCTAATTGCGGATATTTGGGCCTGCTTCGAAGCAACCGGA
CACGGCCGTTTCCGTAATATTCACCATTTAACTATGTTTCCAGATTACCG
GGTCCCTCAAGCATTGTTATCCCTGGGTGTGGTCACGTACACGGATGAGT
TTATGAAACGTGTGCAGAGTGAGAAATTACTCCCACACGGAGAGCGCGAA
GAAATGGAAATACGTGGTTGTTCTATTCACGCTATTGAGCTTTTACGGGA
ACATTTAAATAAAAGTTTAATGGGCGTTGAAAATGAGGAACCCATTCTTA
ATTCAGTATTGATCGACTTTTATTTATGGGATTTTGCTACCGAGAATGCT
TCGGATCTTGGAAGCTTCCCTGAACATCGCACGAGGTCTATTTATTATTG
ACTGGACATAACATGATTTTACAAATGTTCTAGTTGTCAGATATGATTTA
TATATGATATTATATTTACTACGAAAAGAAAGTAATCCTAGAAATCAACT
GAGTTTGTTCCTACCAAATCTTCTTAACTACAGAAGGCGAGATTTCATTA
AAGTTCAAACTATGAATAAAGCGTAGAATAGGACAAGATGGTCAAATTCA
TTAAAGTTAGCTAAGAATAAGAGAAGCCCTACATGGAAATTACAAAGGAT
TTGACATTTGCTCCGGAGCTCAAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000125_pilon:339423..353346+ >MSTRG.14763.2.p1 ID=MSTRG.14763.2.p1|Name=MSTRG.14763.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=594bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000125_pilon:339423..353346+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCTCAAACAACGGTGGGAAAATCTACGCCAAGTGGGTTTAGTGCTATG
TGAAAAATTTAACGGAAATTTCGCGAATGTTATCAAGGAAGCTGGTGAAG
ATGTAGAGAAACTTATAGAACTTGTCACGActaatttttcttgtttcaac
GATGTTGGTTGTTTTGAAGGGCAGCCAGTACAGTTCCAAAAACGAGTACA
AATTCTAATTGCGGATATTTGGGCCTGCTTCGAAGCAACCGGACACGGCC
GTTTCCGTAATATTCACCATTTAACTATGTTTCCAGATTACCGGGTCCCT
CAAGCATTGTTATCCCTGGGTGTGGTCACGTACACGGATGAGTTTATGAA
ACGTGTGCAGAGTGAGAAATTACTCCCACACGGAGAGCGCGAAGAAATGG
AAATACGTGGTTGTTCTATTCACGCTATTGAGCTTTTACGGGAACATTTA
AATAAAAGTTTAATGGGCGTTGAAAATGAGGAACCCATTCTTAATTCAGT
ATTGATCGACTTTTATTTATGGGATTTTGCTACCGAGAATGCTTCGGATC
TTGGAAGCTTCCCTGAACATCGCACGAGGTCTATTTATTATTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000125_pilon | genome | sc0000125_pilon:339423..353346 + |
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