XLOC_015028 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_015028
Unique NameXLOC_015028
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000582:34955..45331+

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_015028 ID=XLOC_015028|Name=XLOC_015028|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=10377bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000582:34955..45331+ (Clytia hemisphaerica)
ACACACCAATGGGATCAAAAGCCAATCATTTTCCAATGCCAAAGACTGAA GTTCAGGTAAGAACACTCGCAATCACAGTGTTGTAATCATCACACGTGCT ACTCACAGGAATGGCGTTTCATTTCTCCTTGTAATAACTCTAATAATCGC TGAGCACTAATCAGAGAGAATGCAACCAGGAATTGAACTCACAACCATAC GAACTTATTGCATCAAAGTCGTgctaatttttgggaaattttttttaact ttttcaaagtCCTCTAATTTTTTCCAGACATTGATGCAATATGTTTGAGT AGCTCAAATCCTAAACATGTCTCCAATTTTTAGGCCTCCGTTAGATTTTC ATGATTATGGGCTTTCTTAAGGTCCATTGTACCAAAGTATTGTCCATTGT CCAGTACGTGACAAAGCTACATTTTTGCTTTGCTACAACATGTATAAAAT GACTTCAAAGTAAGAAAAGAACATCTAGGGTGAGTGAGAAACAAGCTTTA GTACTATGAAAATCActaataaaaaagttacaattttTTTGTTACGTACG CAGACGTACGGGACACATATTGCATAGTAACCTTGTAAAACCAACTAAAg ctttgaaatcatttttccttGGTACAAACACTTTGGTTATAAAGAACCAC AAAATGTAGAAGGAGTGAGTGGCCAGTATATCAACAGGGTATTTTTTTGA GACACCAAAATACGGATGTCATGTACGAGGCAATTTTGCACCCGAAAACC AAATCAGTGACAAACATGATGTTGTAGCTTTTTTAATGACCTTTAGATTT CTTAAATTCAACCATAACATTATTAGTGTGTCATTAAGGACTGATTTCAC ATCAACATAGTTTACAGCCGGAGCTATAACATGGAGAGTGAAAATTGTCA CGTTGGTGAATTGCAGAAAAATCATACAATGTCCTGTCCGCAACAAAAGC ACCATTTATGCTTACAAGTCAAGATCTGGGAACTAGAGAACCCCTCTGTT TGTTTTGTTGTGATATACTAAATGGTTTCTTCCGTTAAAGATGTTTATTG CCTTCAAATAATgtattctgaattttttaactGGTACAAACTAAAAATAT GgtccaaaaatttgttcagTCTGCAACGGCACCAAAGTcttaatttctca ttttttgagaCATCTTTAATGTTCTAACTGTATCAAGTCAATAAACTATA GGGAACTACATGCTTTTTGCAGCAGTATGCTTTTACTTGACTTTACATTT ACTGGCTATGAGTGGAAAACTTTTTGTCCTGTCCGCAACAAAGTGTCCGC AAcatttttctcgagattggggCTGTAACAAATAAATTCTATAACACTCC AAGGAAGGCTATTTAGCAAAGTTCACAAAAATGTAGCGTTCTTAGAAATT GCATTTGCCAAAGTTATGGGTCCTCAAAAAGTGCCTGTTGCGGACGGGAC ATTGTATGATTTTTCTGCAATTCACTCACGTACGggacaaaaaaaaaacg tttaccaTGCATATAATACGAGACAGTGAAATATCAGTCTCCTTGTGTTT TGAATTAAGAAAGTCTTAAAACATGTCATACTAACGCAAAACCATGGAAA AATATTTCCCCTATGCGCCACAATAGCCAgcttatgtatttgcacttttg aggacgataaaatgactgaagcgatttggaaaaacctgcaaaatcaagga cggtaaaagtgctgatttaccgtcgtcctcagttggtcatgatctagtca aattagaaccttaacgtctccgtcgctgaaaaacacgcatacataaactc ggtaatatctCTAAAACAAGAGAGAGTTAGGGACtaatcttttttaggct tttagtACTTATCAAGAGTATCCTGTGAAAAGCCAAACTAATTGATATCA AAGCATTTTAGAAAGGATAAAATCTAAACCTTCGCTTAACACCACTTTAT GCAAACGACCCCTTGTAGCCGAATGCTTTATCTTTAGGCTACTACACTTT CAGGGTatggtttttggacctacctaaggtagtcctttaaattaaccctt gtccgttcgttcgttcgttcgttcgtccgttcgtctgttgccagcttttc NAATTTTAACCTTTCGTCTACTGCAAGAAAGACACAACACTTTTTCTTTG ATATTAGTAAGTTTTTAATGGCTTTGTTTTTCAAGttagaaaaatattga agtcgAGTGTTGCCCAGTGTTGTTGACATTTCCCACATGTATGGTATGGT AAAAAATAAGCTTTTGTTTTGAGaactttgtttatttatttattttggaa GCGAGCAGAAAGTAGAGAGGAGATTTTAGTAAACCATAGATCGTCAAGTC ACGATAGTCCATAcagttttttgtgtttttggttGTCTTCAAAGAAATGG TGGAGGAAACAGAACCAACCTGGCAGGAGTATTGGGATGACGAGACACCA CCATGGCAATTAAAAAAACCGAGTCCCGAcctggaaaaatattttcccga ttttttgaACAATGGGGAAATAACTGATGGGAGACGTGTTTTTATACCTT TATGCGGGAGAAACCTAGACATGAAATGGATCTATGATCAAGGTCTTACA GTTGTTGGAGTAGACGCCATCGAGAAACCGATTCGGGAATTTTTCGGGGA GCACGGTATCCCAGTTAATGTTCAAGAATTAGAATCGGGTTACAAAGTTT TCACTTCGCCAGACAAGAGACTTACTTTAATTGTGGGTGATTTATTTGGG CTTGATGAAAATTTAGTCGGCGGgagatttgattatttttatgaCCGAGC AAGCTTTGTAGCTTTAGACAGTGATACACGACCAAACTATGTTGGGCTCT TATACCGGTTCTTGAAGCCCGGGGCGGTTGGCATGTTGGAGTCAGTTGAG TATGATACGAAATGGAACACGTCTCATCCATACCCGTTGTTTGCGAAAGA TTTAGAGGATTTGTATGGCGATCAATTTTCGTTCGAGGAATTGAGCAGAG GCAATGATCCATCTTCGTCTTATCCAAGAATTAAAGTAGCTTATAAAGTC TGTAGAAATAAGAAATAGAAACATTTTAATTGTATGAGGTTTTAAAATCC GTAGGTAACAATATCAACTTCTTACGGATATTGTTATACCAAAACAATgc agaatttgaataaaatacgTTTCCAACCTAATTTCATTTCCATGTCTTTT CTACCTCAATATGTTTCATCCTTTAGGCTACtcgaaattttgagtttttg aggtgataACGGGTGccatttttggtttttcaattGCCGATCTTTAGATA GGGGTGTCTGAAAAATCCTTATTGGTAGTCCTTCTCAAAAGGACCGCTGG TGGGGCCTCGCCCACCTGGGATGGACttgatttcttttcaaaatgtgGAG GAATgcaaccactttcaaaattagaaaaagaaggGATGAAATAAGGTTAC AAATCgctttcttcaaaataaaaactcaACATCAATGTCTGAGAGAACTG TAAAGgatcataccattttcaaagtgGAATCATTGTTCTTTCATCATCTA CCCTTTGCCCTTTCCAAACGAGCTTTCTTAAATTGaccatttgaaagaaa acaagacgacttaaagtcgaaaatttcgcctagagtTTGAACTGCAtgag gaaaaacaagaagtagagatctACTTTACatatcgagccttgatgaaaca atttcacaagaacaacgaggcttaaaatcactaaaaaataagaccaattt aagaacaattgttgttcaatttttaagaactcttataaagtatatgctta taaaaagtaaatatgctcacattgcacgccatcccttgtttactttgtaa gaacaagaactaattaccgaaaggtatatcaccgtctatcaagagttatt gatttgattcttataaaataaacgcttataagaaaaatgaatatgctcat attgtgctccgtcccttgtttactttgtaagaactaattaccgaaaggta tatcaccgtctatcaagagctactgatttgattcttataaagtatatgct tataagaaaaataaatatgctcatattgtgcgccatcccttgattacttt gtaagaactaattaccgaaaggtatatcaccgtctatcaagagctactga tttgattcttataaagtatatgcttataagaaaaataaatatgctcatat tgtgcgccatcccttgattactttgtaagaactaattaccgaaaggtata tcaccgtctatcaagagctactgatttgattcttataaagtatatgctta taagaaaaataaatatgctcatattgtgcgccatcccttgattactttgt aagaactaatttaagagttattgatttgattcttataagtaaatgcttat aagaaaaatgaatatactCATATTGAGCGcagtcccttgtttactttgta agaactaattaccgaaaggtatgtcaccgtctatcaagagctattgattt aattcttataaagtatatgcttataagaaaaatgaatatgctcataatgt gcaccgtcctttgtttactttgtaagaactaattaccgaaaggtatatca ccatctatcaagagttattgatttgattcttaaagtatatgcttataaga aaaataaatatgttcatattatgcgtcatcccttgtttactttgtaagaa ctaattaccgaaaggtatatcaccatctatcaagagttattgatttgatt cttaaagtatatgcttataagaaAAATAAATATGTTCATATTatgcgtca tcccttgtttactttgtaagaactaattaccgaaaggtatatcaccatct atcaagagttattgatttgattcttaaagtatatgcttataagaaaaata aatatgttcatattatgcgtcatcccttgtttactttgtaagaactaatt accgaaagttatatcaccgtctatcgagagtttttgatttgattcttata agtaaatgcttataagaaaaataaatatgctcatattgtacgccATCCTt tgattactttgtaagaactaattaccgaaaggtatatcaccgtctatcaa gagctattgatttgattcttatacagtatatgcttataagaaaaataaat atgctcatattgtgcgccatcccttgattaatttgtaagaactaattacc gaaaggtatatcaccgtctatcaaaagttattgatttgattcttataaag tatatgcttataagaaaaataaatatgttcatattatgcgtcatcccttg tttactttgtaagaacNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNgagttattgatttgattcttatacagta tatgcttataagaaaaatgaatatgctcatattgtgctccgtcccttgtt tactttgtaagaactaattaccgaaaggtatatcaccgtctttcaagagt tattgatttgattcttataaagtatatgcttataagaaaaaacaaaaact gtgaagctaaagacacaaagatatatgacgtaatccaaacaAAACCtacg aaaatcgtccgtggttatacgagcgtgtaatttgtaaattaattttagtg agttcgtccaccgtatcaagtactttcgttttctatttttttttccgaCC CGCGACGACCCACGAAAGctgattgtaatactttcgctaggcgaaattaa aaaagaaaattacatttattttgtttttaacttgGACTTACTTTTTTGTA GTTTTGGCACAAACATTTGTCAACGATTCAGTCTATCAACGAGCAGTTAT GTTCACCACAGATTGTCAGTGTGTTGACCACACTCGAAGATCGAAACAGC ACTTACGCACACTCCTTCCATAACATCAAACGTGATCTTGCAAAGGTAGG TTTTTTCGTTGTGTCTCTTTACTTGTTCGTTTTTCCCATTGTTTATTTCT CACTTCATTTATCCTGAATGCTTTTCGACCGTTAAATTAAAAAAACCAAA ACGATTCGAATCGATTCTTAAGAATATCTAATATTGTATTTATTagtggt ttctttgttttcaaagtgaaattttttcccaaatcttTCGGTTGGCCATT CATTTTAACCCggtgtttatatttttttaaacatgcGAACCTTGCGTCTC TTTGGAAATAGGCTTCTTTTGAGCCATGCCTAAAGATAACAATGCTCGTA AACTCTAACAACTTGTATTATATTAATCAAATAAGTTTTGCTCTTGTTCA CTACACTGAAGGGAAAAAACTTTATCGGACAAATTTCTTCGTCGGGGAAA ACGTCGTCAATTTTGTGAAAATCCTTGTCACCATCACTTGAAGTTGACAG GAAAGATTTTATTTCTCATCTTGAAAACTTGGTCACTtgcctaaaaattt ttttcacNCCATCACTTGAAGTTGACATGAAAGATTTTATTTCTCATCGG GAAAATTTGGTCACttgcctaaaaattttcttcacttCATGTACAGGCTG AGCACGAGACGATGACAATCGTTCGATTTCTTGGAACGTTGGAACCTTAC TTCACTTTAATTGAGAACGGATACAAACTACATGAATTGATTCAAGTCTT TTCACCTATGATGCACACATTATTATTGATGTGGACATACTCAAAGTAAA TTTTAGCTATGATTATTTTATATTCTCATcgttttttatcgtttttattt aaaatcgaGAGGAGGAAAGGACGTTTTGGGGCCATCAAAAAGAccttttt gaacaaattttatgtAATCATGATTTGTAATTTTAGAGAAccctttcaga aagtaactaaAATATCTTTGGGGTGTTAAAAAGGTAAACTCACGGCTCGT ACATTTATTTACACCCGATCCAGGATTTAGGGAGTAACACTTCGAGCCTA CTATAGTTTGTTTCGTAATATATACGAGTAATCTGTCCGTCCGTCTTTCA TCCATCTACTATTAATTATTTTGGGCTATTGTTGCACATTTTAGCTAGGT AGATCATACAAACTATCACCCGAAAATATAACCGTTTCAGATATTATCAT GGTCCTGATCAAATCAATCGTTTATTACAAATGATCGCAAATCTGGTGGT TTTCAAAGCAAGAGAAATCGTTGGCGAAGCATTCATTGATGACCCAgagg taaaaagaaaaaagaatccaACTGTTAGCTTCTTTTTATACAAGAGTAAA TCTTTGTTAAGTTCTCATAAAAATGTTTCCCAAAGATTGCAATCCGCCAT TTTGGTCATATATTGGCTACTTTGGCAATTTATTGGAAGAGCTCTCAACA TAATAACGCATGACACGTTTTTGATCAGTGCAGTTTGATGGCCCTTTATG GCGATTTATGatgtaaatatttatttatCTTTCAGAGTCAAGGATTTCTC CGTCAAAGTTTGAAGATCTGTGCAGCATTTCGTGGTACTTACTTGGACAC CAAAGATAAAGCTGATGAAATCAACACATTCAAAGTAGAAGAACAAGCTG AACTGAAGTAAGTACCAAGGATACACCTATATGATATGCTGAATATATTT GTTTTTGTCCCCAGTCTTAATGCGAGAAAATTTCTAAAGCGATACTGTAA AGGCTCAGACAGATTTGGGAATAGCAATGGCAGTGCAGGCGCTGCGAAAG GAGTGTTATTCGAGAGTTTGTATATCTTTCTACCCTTTGAGGATGGCCAA TAGCTTTGGCGCGTAGAATCCGACAATGTCCTTGAGCATTCATTCAGGCT CATTAAAAGCTTCTGTCctattaaaaaattattgaacaCTTTCCGCTACA GAAACTTGCCAATATGCTCTCAAAGCCTTATCGAAAGATCATAATGATAA CGAGTCAACGAGGGTAAAATAATACATACTTCTTTCTTACAAACCATATC TCCTGTCCTGATTGTATTATTGGCGAGACAAATTTCATTGCTATTCACGT AATGTATCGTTTTCTTAACAATCTAATTCTTTTTCAGTGAGGAACAGGTC GGAGTGACGTGGCATAGTTCAGTGTATAAGAACGCGCGCACGCAAAGAGG CGCCGGCCTGTTTAACAAAACACGTAACGAACATGAATACGAAGAGAATT TCTGGGAAGATTCACCGTGGCCTGCGCGAAACAGTCCTGTCTTTGACGTT TTAAACAAGTACATGGAACGTTGCAATGATGTCTTAGAATTGGTTGAAGT GTCACAACAattcaagaaaatcaaattcgCATCAAACCTTGACGGTGCTG GTGAGCCTAGCTTGAATTCACAGATTGTTGATATTGttaatgattttgat gacgcACTGGCTCAGTTCAATTGCTCGGTAAAAGTAAGTACATTTTCTAT TTCTTGATTGTTGTTATAGTCAATAACATTGTCTTTGTGTAAATGAAATT ACCgtgtttaaatttttgtttgcctttAGAACATTTTGTGGCTGTCAGAC GTGGACTAGTTTTTCGTAATACGTATAAAACATTGTGGTATATACAACTA GCCGTCAAGGCGTCGTCTTAGACGGGCTGTTATATATAATGAAAAAGAAT TGCCGTCTGCTCAAAAATCGCTAGCGGAAAAGCTTCAAGGGGGGATTGGA AAGTTCCGTTACAATTACAATAATCTCTATTAAAATAATAATGCTATATC TTTTTTAATTTACTCGTCATTGTCTAACATCTCCAACTTTTATGACCTGA TAATTTTGTTCTTTTAGAATGTATTGGATCTGGACAAAGGCCTTCCCTTC GAATCtgctttctttaattttcattctaAAGTTCGGGTAAGTGATAGTCT GTcgaattttttaagtccagaatcCTGATATGATTGTTTCTTTGGCTCAC TTCGAATCTTTCTGTCGGGAAGTAGTAAGTCTATCccttttttctatttg cgctagacctgagAGGTCGAATgatgaggtggagcgccacacatACTCTC AGCTCCCTGTAACTTGGTGCCTAGAttagattacccaatctaagctattC GTTCGCTAAGTTGGCGAAGACCAGggctcgaacccacaacccttggaTTG TAATGCGAATGCTCTATCGACTGAGCTGCCCGGGACCACTGTCAAGACCT CTCTACAGTNTTGTATTTAACTATGCACTATTCTTTAATTCCATGTGAAA ATTATGTCAGCGCGATCAGATTAATTCCCTCGAGAGCGGCTTCCATACGG TAGTAAAAAAGACTGCACACTCGAAGCGAATGGAATAAAACAGCTGTTAT GGCCAGAATCCTTAGATTTTGTTTGGCTCACCTCGAATTTTTCTGTTAGG ATTAGTTTTCTTTATCCACATTCATCAATTCATCAGAATTGACTCGACTA TTTCTTCAGGACTTGGAATCACAGTTCGGCATGCTTGTAGCAGGTAGTTT GAAAGAAGGTTGGGATATCAAGGCCAAATTACGTCTTTTGGATGTCTTTG AAGGGATTACCACACGAGATTTGATCCAGGTTTGTATCAAAGTTTAATTA TTTGTTTTTACGAAAATAGAAATGAATATGCCTTCTGATCAGATTTATAT GATAACTTTTTTCGAGCTTTAGATGTTAATAACCTGGGCCGATCcttttt gattcaaaatttcatttgccATATAAATATCAAGGGGGGTTCCCTGNAAA AAATGATAACTTTTTTCGAGCTTTAGATGTTAATTACCTGGGCCGATCct ttttgattcaaaatttaaGATGCCATATAAATATCAAGGGATGTTCCCTG TTTTACgagaaagaaatgtttttcttttttctataagGGAATTTTCCCAT TTTGTTGACCACGAGTGCATAGCTAGAGTGAATGTTTAGATTCGCGATGA AAACACAGACCTAAAAAACCCCTTCTGCTTTAGAATGTCAACCTTAGTCC GAGTTAAAAAGGTCGGTGAAACCTTCAACTTCAACAGAACCTACCCTGTA ATGTTATTGAATCGATTCCCAAAAATTATAAAGCTAGGTAGCTCATAACG GAGCTAAATAAAGGAAACATAATTCATTTTTCTTGCCCCTCCTACCGCGC CCTCGAACCAATATTTGATATCCTTTGGCTTTCGAGCTCAAAATGATTGA AAGACCGTTACAATTGTTTTTTACATGAACCTTTTTAACGTATTAGTTTA TTCCGTTCCTTGGAATGAATCTTAAAAtccaatattttaattttgtagAC GGTGTTACACGATATTTTATCAACGTTTATTGAACACGTGGAGAAAGAGT TACAAAGCACAAAACAATTGTTCGATCAAAAGATGAACAAGaaaacaagc catcaacatctcTCTCCTGTCACCAAN
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00026721TCONS_00026721Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00026722TCONS_00026722Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00026721-proteinTCONS_00026721-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000582supercontigsc0000582:34955..45331 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.98 1.26 3.28 3.36 21.7 18.63 3.38 6.83 1.11 2.83 2.43 2.48 0.28 0.49 0.11 0.22 0.05 0.42 0.61 0.3 0.42 0.69 0 0.18 6.45 4.41 0.36 0.26 0.28 0.4