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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000135_pilon:222656..228678- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.15366.1.p1 ID=MSTRG.15366.1.p1|Name=MSTRG.15366.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6023bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000135_pilon:222656..228678- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTCAAATTGAATATACTGAGAAAGGAAGACAAACGTTAGAAGGACAAATT
CATTTGTTGATTTTTGAGAGGGAACATTTAATTTGAAAAAAATACGTAAG
TAACTTTTGATTTTTGACAGGGTTATACAGAATCATGAAATCGTTAGGCT
CTGCTCATCCTCTAGCGAAAGAAGTTTCTTATAGGAAGTATATCTATAGA
GGTCTGCGATTCAGACTATGAAATCGTGTGAAATTTTCACATGAAAAATC
TCATCTCATTGGGCTCTTCCAGAAAATGTCCGTACATGGGGGTGGAGGAT
ATATTGTCCGGGGGTAGCGAAAAATCATCAAAATTTGCCTTGTCCGGGGG
GTAAATTTGCTCTGTCTGGAGGTAATTTGGCTTGTCCGGGGGGCCAAAAG
TCACTTTGTCCGGGGGGTAAATCACTGAAAATTGTTATATCCTCCACCTC
CCATATTCAAATTTTTTTTCTGGAAAATCCCATTTTAAGAAAGATTTTAT
TTATTTAGTATTGTCGATGCGTTAAAGATATACTCGAATAGATAGGATTT
CAATCTTATTGAAGAAAAATTTCTCACTTTGCCAAAATTCACTGTCTCAT
TGTAATTGACCTAGAAGATCTTTGTCGGAGGAAAATCTTTTTTCACGATA
AGATGTTTATCAATCGTGATGAAACCGTACTTGTCCAGGGTTAAATCACA
AAAATAAATCTCGTACAATTTTTTCATTCAAGAAAAAACCAGAAATCAAA
ATCAAAATCTCGTGCATCTAATTTGATTGATTTAACGCTCGGTATTACCT
ATGTATTTATGCTTCTAAAAGCATTCCCCACCAATAAAAAAGTCCCCAAT
ATTTTTCAGCGTAGGGATTTTTCGTATTGACCAGAAACCATTTTTCCGGA
AATCACCACGATTGTCCATTTCGATTTTCCCAGTATACACGTGTGCGTGC
TGCAAAATTTGATGACGAATCATGACCTATAAAAAAGCGTTTGAAAAGTT
TCTAACAGATTAAATACCTCCTATGTATTGAGAGGAAAGGAACTAAGCGC
TTATAAGACAGTGAAGATTTGCAACTTTAGAATAAACAACAAAGTAACGT
TTCAAAGTAAGTTCACAAAAATGCTTGATAGTTTAGTTTGATTTTAACAA
GAGGCTTGAAAATTAAAGTCGTAGACAGCAAAACTTTGTTAAATGACAAT
AGTATCCAGGTTTACATTTTTTTGAATAGAAACAAAGTTTTTAAAATTGT
AGGGAAAAAATCTAGCTTCCCTCTTTCTTGTTTCAGGATTCCTACCAACT
ACCTCTAACAACACCGAAAGACACAGCAGCAGTGACAGACCAATACTATC
AGAATTAACAACTATCAAACCAAACACAATGCCAGAACTACAACATCAAC
AATCTTTAGAAGCAGTAACAGTTACAACACCTATTACCAATCAAACTTCG
CCACCACAACCAATAACAACAAACAACCAGCATTCTGAACATGGGATCCA
ATTTTGTTGGTTTATCTTCAGTCTTCCTCTTGTCAGCTCTTTCCTCTCAT
TCATTGCTTGTTTAATAGCATACAGAGTGGGTGTAGATGAGAAACGCCTA
CAACCTTTACCTTTCATCCCATTTATCAGTGACATCGGCGACGTCAAACC
AGGATCTAGCTTCTTCACATTCTTTCTAATCCTTAGCAGTCTGGTGACTC
TCATAATTATCACAGTCAGGTATTACCAAGTAGCTTCCAAAGCTGAAACT
GACAAGTCTAGAAACAGCTCCCCAACAGAATTAAGAAGCAACAGGGATAA
CCCGTTAGAAGAAGCAAGAACCAAACGATCCATACAACGATTGAATACAG
CAGCTTTGGTATCAAGTTGTATTTTCCTGGTTTGTAAAATTGGTGTGTCA
TCTTTTCAGTTGAATAACTATAAAAAAATTCATCTTGGTTTTGCTTGCTT
TTATTTTTTTGGTGCAGCCCTTTATACTGTTTTTCAAGTTTGTATCACTT
TCAAGATGATTGGTGGTTTAAACGGACTGAAAAAACTCCTTACAGGGGAC
ATGTCTTCGAAGTGTCAAGGCTCTGTCTTTTTATCAAGAGTTATCTGTTC
TTTGGCACTTATCATCAATTTTTTCATTGTTGGTGTTTTTGTTACTGTAC
CCTCATTGAAAGTTCATAATCGTGGTGGAGCCAATGTGGGTCAAAGTGCT
GAATGGGCTTTCGCTGGATTCAAATTATTTTTCTTCTCGACATTTTCGTA
TGAATTCTGGAAAATTCGTTTCACGTTTCTAATGAAGTTTGATGAGATTG
AGAAAACGAAAACCGAAAGTTTCCCGATCAAAAATTGTGACACTACCGAT
GGGCTGCCATCGCAAGTATCATACAGCAAACTGCAATGATCGTGACATTT
GTATTGTATAGGCTTAACTCGCCATTTTGATTAAGTCTGATATGTGATAC
ATAAAGTTCTTTCATAAAGATTTGCGAGTTGAAGAGCTAGATGTCAATGA
ACGTTAAAAATTAAATAACTTTAGACTGAAAATTTGACTTCTACGATTTT
AGTCCCTTGTAGAACGCAAACTGTGATTCAAAAAATTCACCTTGTATCTT
GTATTTATAGAGACGACGAAGGTTGGGGGCCATCTTGCATAAGTTCATTT
TTAATTTATCAAGATTTTTAAACAAATTTGAATATCAGATCAGAGTTTTA
ATAGTGATCTAAATTAAATAATGTTATTGTAAATACGTTCCTTGATTTCA
TTTAAGTATCAAAAGTTTTACCTATTTTTACAGTTTTTTATACAAAATGA
TATATTTTATGTTTTCCAACTCCATGTCCAATATATTTATTTTTCTTGAT
TTTTAAAGTAAAGAAATTTTTAAAGTACAGTATTTTTGAATTTTGAGTGA
AATTCAGCAGAGACAATATCGAAGACATTTGCACCATCAGATGGTTTGAG
ATATTTGGCCTTAGTACCTTCTACGGTCCTGAGTAAAACCTCCAAGTATT
TTGGCCTAACTATCGAGATAACACAATTTGAAATTACTGAAAATGAGTTC
TTACACGGTTAAACTTTCGTTGTAATTCTTACTAAAAGTAAAAATATCTC
AAACCATCTGATTATCCCTTTAAATGGTAGGCGTGATACAATTTTGACCG
CTCTTTGGTGACCACTTCTTGATAACCTTTCTCGGAATCCTAAAAGGGTG
AATTAAAGGAACTGGGTTCGAGTTTTTAAGAGAGGTACTATTCAACAGTT
GTCAATTCTAATTCCCCCCCTCAGAGCAATCTTTCAATTTCGTAATTCTG
TAACTTTCAGACGTTAAAAGTTAAGTTTATTCTTTTAATGTAAATAGTTT
TTGTTTATTTTATACGTGACAAAACAAACAAAAGAAGTAAAAACGTTTTC
GACTGTTCAAAAATGACACACGCGAGTTATCTTTATTCCCTACGTATTTT
TCCTCTAAAATGAAACGTGATCTTTAGGCCTCAGGCCTTCTAGAAAACTC
CTAATGAACTCTTGAAAGAAAACCCATTAATTTAAGTCTCGCCTAATTGA
AATTACAAAGGTCTATCTAAAACCTGGTTTATCCCAGGTGCTATCGACAG
TCGATGTGTGTTTTGATCTAGAATTTAGAGGACCTTTTGCTTTAAAAACA
ATTTTACACCCCTGTCTCACAGCCCCGACCGAGCTATTTTCCTCAATGGG
GATAAAAATTCGAAATTTTCCAGTGGGGCTGGGGTCCCAGCGGGTCTGTG
AGACAGGGGTGTAGTATATTTTGATTAATACATAAGTTTTGACCATGAGT
CAGAACTCTTTGAGACAAATGCTCCCTCTAAAGACACGAAAGGTTAATGT
CAGACGCACATTAAAGAGAAGTAATCCAATACTTCTCAAATACTGTACAC
GTTTGCTTTTCATAAGAACATCCAAAATTTCTGAAGCCTTGGGATGTTCC
CAACTTTTTGAGTTTTAAGCCTAAAAATGTTCTTAACATGTTCTTATTTT
CACCATTTTGTGAGTATTTTTGCCTATTTTCATAAGAAATTGGATGTTTT
AGAGTCCACAAAGCCTTAAAATGTTCTTAACTTGTTCTTAATAATTTGGT
CATCGAAGCCTTATGTTCTTACATAGTTTGTTCCTATAAACAACCTATAC
TTTTCAAATAATGTAGATTCGCATTATTGACACATATAAATAGATGATTG
ACACAAGAGGTATTCAGATTTCCTTTTACAGAATTCTTTTACTGATGTGA
TGTTGGCTTTCGAGAATCTCTTGTGTCAAGTTTCGTCTACCATCACTTTA
AAAGTTTTCGGTATCTAAGTCTTGTATGGTCTTGTAATATTTAAACTTTC
ATGTCTTTCGTGATTGGGGTTGCCAGTTTAAAGCTGTGGGACCACACACC
CTGGATTTTATGGGGCAACATATGGGCAACATATATAACTTTACAGTTAT
ACACAAATTTTACACTTTTTTGGATTTTTGATGTTTTTTCTACTAAAAGG
TTGTAACAGTTGGTAACAGGTCTGAGACAGGTGTTACACCCTTGTTTTTT
TTTAAATGGTGGTTCTATCATTTCATCATGGATATCATTAACCTTGTCAA
ATATTTTTATATTATGCGGAGTATCAGAATCCGCTCGGAGCATTAAAAGC
TTCAAAACTTAGTGTAATAAACTTGAATCTTGATTTTTTAACCTTTCAGT
GAATGGAAGACTTCAAAAACTGAGATAAAACAAAAGAAATCGAACTTCGT
GATAACAAGAAAAACAAAATGGCTGATTCGAAAATACAAGCCGAAGAAGA
AACAAGAACAACATTAAATGCACCAAATCATGCCAACAACAGAAAAAGCT
ACCAAATCAATCTGCGTTGGATTATCTTCAGCTTACCTATCATCAGCTCT
CTCTGCTCCTTCATAGCTTGTCTGATGGCGTACATTATCGGCGTGAATAG
TGGAACATTGAAACCGTTACCTTTTATACCTTACATCAGCGATACAGGAG
ACTTTAAACCGAATTCAAGTATATTTACTCTATTCTTGATTTTAAGCAGC
TTTGCAACGCTGGTTATTGCTATAGTACGTTTTTACCAAATTGCAGCCGA
AGCTAGATGCTCTATAGCGAACAGAGCAGCTTTAGTATCTGCATTTCTAT
TTTTGCTTGGTAAAATCGTTGTTTCGTCGTTTCAACTTTCATCAAATATT
TTCGTCCATTTTGCAGCCGCTGGGTTATATTTCCTTGGTGCAACGATCTA
CACGTTATTACAATGTTACATTACTTATCGATTCCTTGGTGATTCAATTA
ATAAAGAAAGATTCGTCAAAGATTCTACTTGGAGACGAGGATGTATTGTT
TATTTGATTCGTGTAGTGTGTTGTGTCGGTCTAGTAATCAATTTAATCAT
ATTTGGCGTATTTGCAACAATCCCTTCTTTAGAGATTCATAACAGAGGTG
GAGCCAATGTGGCGCAAGCTACAGAATGGGCGTTGGCAGCATTTAAAATT
ATATTCCTATCAACATTCACTTATGACTTCTGGAACATCGAGTTCAAATT
TGGAATGGAATTCAAAACAATCCAACCAAAAGATTTTCCTTCACCAGAAA
CTCAAGTTTCAATAGATATCGAGGACAATATTAGACTTGCTAGATATACA
AGATTTGATTCGAAGGAGCCAAATAAAGTGAAAATTGAGTTCCATACATG
AATAAAACATGACGTTAAATTTCAATCGAGCTAAAAACCGTAATTCACGA
AGCCAAATTGAACATTGTTTTTCCAAAAAGATATGCCTTAATCTCATTTA
CCATGGTTGTAGTCTAAATAATCGATTGAAAGTGAAATATAGCTACAATC
CTTCGCAGGGGGATTTCTTGTCTCAAATATTTTGTCCATGATTGTACATA
TAATTCAAAGTTTAGATTTTTAAGGAAATAAAAAATAATATTTCAGGACA
CGACTAACAATATTTTTGATTTATATAATTTGAAATTATTTTCAAAAAGA
TTACGGTTATCCCTTCGTGTATT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000135_pilon:222656..228678- >MSTRG.15366.1.p1 ID=MSTRG.15366.1.p1|Name=MSTRG.15366.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=933bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000135_pilon:222656..228678- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTGATTCGAAAATACAAGCCGAAGAAGAAACAAGAACAACATTAAA
TGCACCAAATCATGCCAACAACAGAAAAAGCTACCAAATCAATCTGCGTT
GGATTATCTTCAGCTTACCTATCATCAGCTCTCTCTGCTCCTTCATAGCT
TGTCTGATGGCGTACATTATCGGCGTGAATAGTGGAACATTGAAACCGTT
ACCTTTTATACCTTACATCAGCGATACAGGAGACTTTAAACCGAATTCAA
GTATATTTACTCTATTCTTGATTTTAAGCAGCTTTGCAACGCTGGTTATT
GCTATAGTACGTTTTTACCAAATTGCAGCCGAAGCTAGATGCTCTATAGC
GAACAGAGCAGCTTTAGTATCTGCATTTCTATTTTTGCTTGGTAAAATCG
TTGTTTCGTCGTTTCAACTTTCATCAAATATTTTCGTCCATTTTGCAGCC
GCTGGGTTATATTTCCTTGGTGCAACGATCTACACGTTATTACAATGTTA
CATTACTTATCGATTCCTTGGTGATTCAATTAATAAAGAAAGATTCGTCA
AAGATTCTACTTGGAGACGAGGATGTATTGTTTATTTGATTCGTGTAGTG
TGTTGTGTCGGTCTAGTAATCAATTTAATCATATTTGGCGTATTTGCAAC
AATCCCTTCTTTAGAGATTCATAACAGAGGTGGAGCCAATGTGGCGCAAG
CTACAGAATGGGCGTTGGCAGCATTTAAAATTATATTCCTATCAACATTC
ACTTATGACTTCTGGAACATCGAGTTCAAATTTGGAATGGAATTCAAAAC
AATCCAACCAAAAGATTTTCCTTCACCAGAAACTCAAGTTTCAATAGATA
TCGAGGACAATATTAGACTTGCTAGATATACAAGATTTGATTCGAAGGAG
CCAAATAAAGTGAAAATTGAGTTCCATACATGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000135_pilon | genome | sc0000135_pilon:222656..228678 - |
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