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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000097_pilon:990535..994358- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.12740.2.p1 ID=MSTRG.12740.2.p1|Name=MSTRG.12740.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=3824bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000097_pilon:990535..994358- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CAGAGCAGAGTCTAATGAACCTCAATTAAAAGTTATCAGTGTTTAAGATT
CAATTGACAGCTCATTTAAAATGACTTAAACACCCCCTTCTCACAGACCC
GGTAGGACCTTTTCAGCCAGTGGGAGTAAAAGTAACGGATTGCTTATTCC
CATGCTTTTATGGCTGGGGATTTCAATTCCATTGTTTTAAGTAAAAAAAT
TCAGTGGGGATGAGAAAATTAGTAAATATTTTGCAGTGGAGCATTGGCTT
ATTGAATTTTTTTCAGTGGGGACAAAAATTGAAGGAAGATTTTCCACCGG
GGACGATATTTTGGCCAATTTTTCCAGTGGATCTGTGAGAAGGGGGTGTA
TCTGAACACGAGGTCTGCCAAACAATTCTATTGTGCTGTAGAAAATGCCC
CTACCCCAATTTCATAATGTTCTGAAATTATATTGAATCTAGTGAGGTAA
GAAAAAAGGTAATTCTAAATAAGATAGACCAAGCTGGCAAACAACGTTGT
TTCAACGTTTATCTAACGTTCACGAGGTCCATTTAACGTTAGATCAACGT
TGAAACAATGTTGTGTGCCAGTTCTAAATCCACAGTGAGCGAACGGTCAC
GTAACCAGAGGATTTCATGCTCTTTCGTATAAAAGGATCAACAGATCTAC
GTATAGGATCTCCTCTACTGTCACGAAGTGTTGACTATTCTATTTCTGCC
AAAACAAACATTAACAAATTTATGATGAATATTAAGTGATGCTAATGTCC
TTGTGAACAAGAGAGCAAGAATGAGATCATATTCCAATGACGCTGAGTTT
GAATTTCCCAAACACATTGTTTTTAATGTTGACAATCTCAACAAACTTAT
CGAGAAGCATCATTTCACGTCGCTTGGATTTGATCAAAAAGTACTTCTTT
TTGTATTGTTTGTAGATTCTCATGTTTTTGTTTTGAAATGAAATTGATCA
AGGCGGGAAGTCTATTTTTCATAACCTAGTTGAACATTTATCACGACTGT
GAGAGACCTGCAGTGGTATCATTTCATCTTTTAAACTCACTGTCTTAACA
TTCATATATTTCATCACTTCATAGAGATCGAGAAAGTCTACAGGAGATTT
GACCATGTCGTCCACAGAGTCTTTAGCAATGGAAGAAACTGAGAAATCGA
ACAGTTTGCAACCCATCGAACGTTTGAATGTGGATGGCTTTTTACGGATG
GTTGGAGGCTTTGGAAAGTTTCAAATCATCTTGGATATAGTATGCTGTAT
TATAATGTGTCCTTTTACTTTTCATGTACTTATTATGTACTTTGCTGCTT
TGCAACCAGAGTGGAAATGTGTTGAAAACAGTACAGTATGCTTACTAAAT
GGAACTTTTACGAGTGAAAATGACTTTCGTTGTCAAATTCCACGATCAGA
ATGGGAATACATGAAACCGAGGGAATATTCTATTGTGACGGAATTCGATA
TTTATTGTGATCGTGATTGGATGATTTACATGACAACCTCGATTCTGTTT
ATTGGTTGGATGTTTGGTGCAATCTTCATTGGTTGGTTGGCCGATAATTA
CGGACGCCGAAAAACGATGCTCCTTTCAATTGTAATGGTGCTAACAGCTA
GTCTAATCGCACCTTTTGTCAACAACATTTATGTGTTTATTATCTTTCGT
TTCATTGTTGGTTTCTTCATCCCTGGAGGAGGTGTAATCATGTTTGTTTT
AATCTCTGAGATTGTCAACGATAAATATCGACCACTGGCTGGTATTATTT
TGTGGGTCTTCTTCACCTTAATTTTATGCGTTATGGGACTGTTAGCATAC
CTCATACCTAAATGGAAAATATTATTCATCATCTGTACAGCACCTTTTTT
CGCCACTTTGCCGCTCTTCAAATTCATCCCTGAGTCTGTCCGCTGGTTGA
GACTAAAAGGAAAAATCGAAGAAGCTTTGGAAATATTTCAACGAATTGCA
GATTGGAATGGACGAAAATTGAACCCTAACGCTTCCTTATCGATGGTTCA
GGGAGTGGAACACTCTTCAAACCCTTTGGATTTATTTAAAACAAAACGTA
TGGCTATCAAAACATTGATTCAGGGATTTGCTTGGATGGTTAACGGTATG
GTTTACTATGGAATCTCATTAGCTTCGGATGACCTTGGTGGATCCTTGTA
TCTCAACTATGTTTTGGTCAGCTTGATAGAGCTACCTGCCCATGTTTTTG
CTATTGATTTTTCCAACAGATTTGGACGCCGTAAAACTACATCGATTTCG
ATGATCTTAGCTGGTATATTAACCCTTGTTGTTGCATTCATTCCTAAATC
ACATAATGAGTTTAGAGTGATGTTTGGTATGCTTGGAAAGATGCTTATTA
CTGTCAGTTTCGATGTCATCTATACCTGGTCTGTGGAAATCTATCCTACC
AATATTCGATCAGAAGCAATGGGATTCTTACAAATTACAAGTCGTATAGG
AGCAGCAAGTGCACCTTGGATAGCCAAAGCAGTAAAGGTCATTCATAACA
CATTACCTTTTTTAATTATGGGAGTCTTAGGTCTGTTAGCTGGTATAGCT
TGTTCCATTTTACCGGAAACGAAAGGACAGGAGACACAAGAGACAGAAAA
TGACGTCACTGAGGAAGTATTTTTCATGGACGAATTTAAGTAGATAATAA
TATTCTGCGAGTAATCTGAATGCTGTAAATGATTACTAGAAAATTAAGTA
AAAATTTCGTACCCGTTGGAAAGTACCCTTGAATTTCAGTCTTTATCCCA
CTTTATACCACTGAGGAATAAAGTTCCACCGGGGTTGTGAGACAGGGGTG
TGAAGAGGTGCAAAGTTTAAATCTTCCAACAATATTGTTCCCGGGATTGT
TCCATATAAGACACTGTCTCGTTAGCTTAAGGAAAAGGGAAATAGAATGA
ATTCAAGGATTCTTTCACATGTAGAACCTCCTTACTGACAGCCCCGGTGG
AACCTTATTCTTCAGTGGGGATAAAAGTTCCTATTGAAATCCCAATAGGG
ATATAAATTCTTTTGTATCAAGGTTAAAAAATCCAGTGGGGATGGTTTTG
GAGTGCAATTTTTAAACATGGAATTTCGAAGAGGGGGTAAAATCAACGTC
AATTTCCCAGTGTGGCTGAAAATCTAAGGGTACTTTTTCACTGGGGACGA
AATTTTTGCCAATTTTTTACATTGGGGCTGGGGTCCCAGCGGGTCTCTGA
CACAGGGGTGTTTACTGTTTTTCAACTTCTTCTTTGATCGTGTATTTTTG
TCTTAGAAGTCTCTTTGATTTGTTTTCTGTTTTGAAAATTGAAACCTATA
GTTTTTCTGGATATAAAGAGGCTCAAGTGTATTGGGATCCTACAAAATAC
CCCTTTGTGACAGACCCACTTGGTCCCCAGCCCCGCTGGAAAGTTCGACA
AAAATTTCATCCCCTGTAGAAAAAAACTCAATTTCAGCCCCACTGGGAAA
CTTACTTTGGTTTCATCCCCATTCGAAATTCCATGTTTAAAAATCGCACT
CCAAAACCATCCCCACTGGATTTTCAACCTTTGAACAATAGAATTTCTAT
CCCCATTGGGATTTCAATAGGAATTTTTATCCCCACTGAGGTTCCACCGG
GGCTATGAGGTAGGGCTGTTACAAGAGAAATCCTAGATGACTTGCTTCAA
GACTGGTTTCTGGTGACCCCTTGTTCGTTGCTGTTTATTTAATTGTAAAA
AAGTACCTTATTCTTATTCTTGTCAGTTTTAATTTAGTTTTTTTTTAAGT
TGTTAATGTTTTGACTACTATTTTTTGAACTTTCACCTTACTTCATCAAT
TTTGTGGAATGAACTTGTCAAAAC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000097_pilon:990535..994358- >MSTRG.12740.2.p1 ID=MSTRG.12740.2.p1|Name=MSTRG.12740.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3378bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000097_pilon:990535..994358- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AGATCGAGAAAGTCTACAGGAGATTTGACCATGTCGTCCACAGAGTCTTT
AGCAATGGAAGAAACTGAGAAATCGAACAGTTTGCAACCCATCGAACGTT
TGAATGTGGATGGCTTTTTACGGATGGTTGGAGGCTTTGGAAAGTTTCAA
ATCATCTTGGATATAGTATGCTGTATTATAATGTGTCCTTTTACTTTTCA
TGTACTTATTATGTACTTTGCTGCTTTGCAACCAGAGTGGAAATGTGTTG
AAAACAGTACAGTATGCTTACTAAATGGAACTTTTACGAGTGAAAATGAC
TTTCGTTGTCAAATTCCACGATCAGAATGGGAATACATGAAACCGAGGGA
ATATTCTATTGTGACGGAATTCGATATTTATTGTGATCGTGATTGGATGA
TTTACATGACAACCTCGATTCTGTTTATTGGTTGGATGTTTGGTGCAATC
TTCATTGGTTGGTTGGCCGATAATTACGGACGCCGAAAAACGATGCTCCT
TTCAATTGTAATGGTGCTAACAGCTAGTCTAATCGCACCTTTTGTCAACA
ACATTTATGTGTTTATTATCTTTCGTTTCATTGTTGGTTTCTTCATCCCT
GGAGGAGGTGTAATCATGTTTGTTTTAATCTCTGAGATTGTCAACGATAA
ATATCGACCACTGGCTGGTATTATTTTGTGGGTCTTCTTCACCTTAATTT
TATGCGTTATGGGACTGTTAGCATACCTCATACCTAAATGGAAAATATTA
TTCATCATCTGTACAGCACCTTTTTTCGCCACTTTGCCGCTCTTCAAATT
CATCCCTGAGTCTGTCCGCTGGTTGAGACTAAAAGGAAAAATCGAAGAAG
CTTTGGAAATATTTCAACGAATTGCAGATTGGAATGGACGAAAATTGAAC
CCTAACGCTTCCTTATCGATGGTTCAGGGAGTGGAACACTCTTCAAACCC
TTTGGATTTATTTAAAACAAAACGTATGGCTATCAAAACATTGATTCAGG
GATTTGCTTGGATGGTTAACGGTATGGTTTACTATGGAATCTCATTAGCT
TCGGATGACCTTGGTGGATCCTTGTATCTCAACTATGTTTTGGTCAGCTT
GATAGAGCTACCTGCCCATGTTTTTGCTATTGATTTTTCCAACAGATTTG
GACGCCGTAAAACTACATCGATTTCGATGATCTTAGCTGGTATATTAACC
CTTGTTGTTGCATTCATTCCTAAATCACATAATGAGTTTAGAGTGATGTT
TGGTATGCTTGGAAAGATGCTTATTACTGTCAGTTTCGATGTCATCTATA
CCTGGTCTGTGGAAATCTATCCTACCAATATTCGATCAGAAGCAATGGGA
TTCTTACAAATTACAAGTCGTATAGGAGCAGCAAGTGCACCTTGGATAGC
CAAAGCAGTAAAGGTCATTCATAACACATTACCTTTTTTAATTATGGGAG
TCTTAGGTCTGTTAGCTGGTATAGCTTGTTCCATTTTACCGGAAACGAAA
GGACAGGAGACACAAGAGACAGAAAATGACGTCACTGAGGAAGTATTTTT
CATGGACGAATTTAAGTAGATGAGATCATATTCCAATGACGCTGAGTTTG
AATTTCCCAAACACATTGTTTTTAATGTTGACAATCTCAACAAACTTATC
GAGAAGCATCATTTCACGTCGCTTGGATTTGATCAAAAAAGATCGAGAAA
GTCTACAGGAGATTTGACCATGTCGTCCACAGAGTCTTTAGCAATGGAAG
AAACTGAGAAATCGAACAGTTTGCAACCCATCGAACGTTTGAATGTGGAT
GGCTTTTTACGGATGGTTGGAGGCTTTGGAAAGTTTCAAATCATCTTGGA
TATAGTATGCTGTATTATAATGTGTCCTTTTACTTTTCATGTACTTATTA
TGTACTTTGCTGCTTTGCAACCAGAGTGGAAATGTGTTGAAAACAGTACA
GTATGCTTACTAAATGGAACTTTTACGAGTGAAAATGACTTTCGTTGTCA
AATTCCACGATCAGAATGGGAATACATGAAACCGAGGGAATATTCTATTG
TGACGGAATTCGATATTTATTGTGATCGTGATTGGATGATTTACATGACA
ACCTCGATTCTGTTTATTGGTTGGATGTTTGGTGCAATCTTCATTGGTTG
GTTGGCCGATAATTACGGACGCCGAAAAACGATGCTCCTTTCAATTGTAA
TGGTGCTAACAGCTAGTCTAATCGCACCTTTTGTCAACAACATTTATGTG
TTTATTATCTTTCGTTTCATTGTTGGTTTCTTCATCCCTGGAGGAGGTGT
AATCATGTTTGTTTTAATCTCTGAGATTGTCAACGATAAATATCGACCAC
TGGCTGGTATTATTTTGTGGGTCTTCTTCACCTTAATTTTATGCGTTATG
GGACTGTTAGCATACCTCATACCTAAATGGAAAATATTATTCATCATCTG
TACAGCACCTTTTTTCGCCACTTTGCCGCTCTTCAAATTCATCCCTGAGT
CTGTCCGCTGGTTGAGACTAAAAGGAAAAATCGAAGAAGCTTTGGAAATA
TTTCAACGAATTGCAGATTGGAATGGACGAAAATTGAACCCTAACGCTTC
CTTATCGATGGTTCAGGGAGTGGAACACTCTTCAAACCCTTTGGATTTAT
TTAAAACAAAACGTATGGCTATCAAAACATTGATTCAGGGATTTGCTTGG
ATGGTTAACGGTATGGTTTACTATGGAATCTCATTAGCTTCGGATGACCT
TGGTGGATCCTTGTATCTCAACTATGTTTTGGTCAGCTTGATAGAGCTAC
CTGCCCATGTTTTTGCTATTGATTTTTCCAACAGATTTGGACGCCGTAAA
ACTACATCGATTTCGATGATCTTAGCTGGTATATTAACCCTTGTTGTTGC
ATTCATTCCTAAATCACATAATGAGTTTAGAGTGATGTTTGGTATGCTTG
GAAAGATGCTTATTACTGTCAGTTTCGATGTCATCTATACCTGGTCTGTG
GAAATCTATCCTACCAATATTCGATCAGAAGCAATGGGATTCTTACAAAT
TACAAGTCGTATAGGAGCAGCAAGTGCACCTTGGATAGCCAAAGCAGTAA
AGGTCATTCATAACACATTACCTTTTTTAATTATGGGAGTCTTAGGTCTG
TTAGCTGGTATAGCTTGTTCCATTTTACCGGAAACGAAAGGACAGGAGAC
ACAAGAGACAGAAAATGACGTCACTGAGGAAGTATTTTTCATGGACGAAT
TTAAGTAGATGAGATCATATTCCAATGACGCTGAGTTTGAATTTCCCAAA
CACATTGTTTTTAATGTTGACAATCTCAACAAACTTATCGAGAAGCATCA
TTTCACGTCGCTTGGATTTGATCAAAAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
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| sc0000097_pilon | genome | sc0000097_pilon:990535..994358 - |
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