MSTRG.13232.2.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.13232.2.p1
Unique NameMSTRG.13232.2.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000104_pilon:165376..184113-

Legend: exonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.13232.2.p1 ID=MSTRG.13232.2.p1|Name=MSTRG.13232.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=18738bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000104_pilon:165376..184113- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AAACAAAAATCATTCTTTTCTCGCGAGCTTCCATCGGTGATTTTCGGCTA TTCAACTGTCGCATCAAGGAACAAATTTCAGGCCCGGTGGAATAACCTTA AAAGTGGGGAGGCTGAAGGCTCAAAATGAGATCAAGTTTTCTAGGAATTT GAGAAAAAAATCTCATTTGGTCAAAGTTGGAGAGGCTAAATTCTCCCCAG TCTCCCCGCTTCCGCCGGGGCTGAATTTTCGATTCTCAAAATCAAATGAT AGTTATTGTATGATTGTGAATTATATTAATTGATGGCAAAAATAATTTTT ACTATTCTTTTCGAAAAATTTGTTTTTCATCTTCCAGAGGAATGCAAGGA CGACTACCCAGAAGAGTGCAAAGCCATCGAGCGCCGAAAAGCGGAACATG TCTGCCATTTTGATTTGGTTGGATTCAAAGGAAAAGTCAACGAGTATTGT CGAAAAACATGTGGACTTTGTTCTTGAAATGTTTTTTTTAAAAGATTATC TAATTTTAAAACATGACTTTTGTGACAAAACCTCGGGCAAAACCTGGACC ATTTATTTGAATCTGGGACACTTTCGAACGGTGTGTTTTATTTTTAATTT CGCTTTCGACCAAAATATTGTTAATAACAAAGCTTTTGAAAGTTTCATTT GAATTTTTAGTTTCGTTCTCGTGAAATTATTTCATCGG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000104_pilon:165376..184113-

>MSTRG.13232.2.p1 ID=MSTRG.13232.2.p1|Name=MSTRG.13232.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4464bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000104_pilon:165376..184113- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AGGAATGCAAGGACGACTACCCAGAAGAGTGCAAAGCCATCGAGCGCCGA
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GATCCACCCAAAAGGTTGGGTGCTCGGGCGTGACACACCCAGGGCGTCAT
CAATCATCAGTTTATGTTTGTTTTTATTCACCACGTGGCAATTATTTTGA
TAAACCGACTGATATCATACTCAACCTCAAACCGAGAATCACACCCATTG
AAGCCAAAACTAAATTCGGTATTCCGAATTGGATTCAATCAAATTTAACA
GTAAAGGTTACGAAAATTTACATTACAACGCTTCTACCATTGCAAACGCT
ACTCAGTCACAGCATGCGGTTCGGCTGAGCTACATAACAAATATAGACGT
TTTCACAAATCAACGCCGGACGTTGATGGAAGCAACGAGTTGGTCAAACT
CTCTCAACAATGTGCAAGTCAAATTATTCAAACTGGAAAAAGCACGTGTG
ACCATGAGGATTCTTATGGAATCAATATTGCAATACTTCCCTCTGTTTCT
CGGACTTCACACTTAGAAGAACTTATGGCAGCATGTTTCGCTGTCGTTAA
AGAAAGGCATAGTAATACCTGGTAGTTAATCCGGTTGCAGATAGCCCTAG
CCGTGCAGGGATGCAATGCCAACCTGATTATAACTTGGTTGAAGAGGAAT
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GAACATGTCTGCCATTTTGATTTGGTTGGATTCAAAGGAAAAGTCAACGA
GTATTGTCGAAAAACATGTGGACTTTGTTCTTGAATTATTTGGCGATCCA
CCCAAAAGGTTGGGTGCTCGGGCGTGACACACCCAGGGCGTCATCAATCA
TCAGTTTATGTTTGTTTTTATTCACCACGTGGCAATTATTTTGATAAACC
GACTGATATCATACTCAACCTCAAACCGAGAATCACACCCATTGAAGCCA
AAACTAAATTCGGTATTCCGAATTGGATTCAATCAAATTTAACAGTAAAG
GTTACGAAAATTTACATTACAACGCTTCTACCATTGCAAACGCTACTCAG
TCACAGCATGCGGTTCGGCTGAGCTACATAACAAATATAGACGTTTTCAC
AAATCAACGCCGGACGTTGATGGAAGCAACGAGTTGGTCAAACTCTCTCA
ACAATGTGCAAGTCAAATTATTCAAACTGGAAAAAGCACGTGTGACCATG
AGGATTCTTATGGAATCAATATTGCAATACTTCCCTCTGTTTCTCGGACT
TCACACTTAGAAGAACTTATGGCAGCATGTTTCGCTGTCGTTAAAGAAAG
GCATAGTAATACCTGGTAGTTAATCCGGTTGCAGATAGCCCTAGCCGTGC
AGGGATGCAATGCCAACCTGATTATAACTTGGTTGAAGAGGAATGCAAGG
ACGACTACCCAGAAGAGTGCAAAGCCATCGAGCGCCGAAAAGCGGAACAT
GTCTGCCATTTTGATTTGGTTGGATTCAAAGGAAAAGTCAACGAGTATTG
TCGAAAAACATGTGGACTTTGTTCTTGAATTATTTGGCGATCCACCCAAA
AGGTTGGGTGCTCGGGCGTGACACACCCAGGGCGTCATCAATCATCAGTT
TATGTTTGTTTTTATTCACCACGTGGCAATTATTTTGATAAACCGACTGA
TATCATACTCAACCTCAAACCGAGAATCACACCCATTGAAGCCAAAACTA
AATTCGGTATTCCGAATTGGATTCAATCAAATTTAACAGTAAAGGTTACG
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CATGCGGTTCGGCTGAGCTACATAACAAATATAGACGTTTTCACAAATCA
ACGCCGGACGTTGATGGAAGCAACGAGTTGGTCAAACTCTCTCAACAATG
TGCAAGTCAAATTATTCAAACTGGAAAAAGCACGTGTGACCATGAGGATT
CTTATGGAATCAATATTGCAATACTTCCCTCTGTTTCTCGGACTTCACAC
TTAGAAGAACTTATGGCAGCATGTTTCGCTGTCGTTAAAGAAAGGCATAG
TAATACCTGGTAGTTAATCCGGTTGCAGATAGCCCTAGCCGTGCAGGGAT
GCAATGCCAACCTGATTATAACTTGGTTGAAGAGGAATGCAAGGACGACT
ACCCAGAAGAGTGCAAAGCCATCGAGCGCCGAAAAGCGGAACATGTCTGC
CATTTTGATTTGGTTGGATTCAAAGGAAAAGTCAACGAGTATTGTCGAAA
AACATGTGGACTTTGTTCTTGAATTATTTGGCGATCCACCCAAAAGGTTG
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TGTTTTTATTCACCACGTGGCAATTATTTTGATAAACCGACTGATATCAT
ACTCAACCTCAAACCGAGAATCACACCCATTGAAGCCAAAACTAAATTCG
GTATTCCGAATTGGATTCAATCAAATTTAACAGTAAAGGTTACGAAAATT
TACATTACAACGCTTCTACCATTGCAAACGCTACTCAGTCACAGCATGCG
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GAATCAATATTGCAATACTTCCCTCTGTTTCTCGGACTTCACACTTAGAA
GAACTTATGGCAGCATGTTTCGCTGTCGTTAAAGAAAGGCATAGTAATAC
CTGGTAGTTAATCCGGTTGCAGATAGCCCTAGCCGTGCAGGGATGCAATG
CCAACCTGATTATAACTTGGTTGAAGAGGAATGCAAGGACGACTACCCAG
AAGAGTGCAAAGCCATCGAGCGCCGAAAAGCGGAACATGTCTGCCATTTT
GATTTGGTTGGATTCAAAGGAAAAGTCAACGAGTATTGTCGAAAAACATG
TGGACTTTGTTCTTGAATTATTTGGCGATCCACCCAAAAGGTTGGGTGCT
CGGGCGTGACACACCCAGGGCGTCATCAATCATCAGTTTATGTTTGTTTT
TATTCACCACGTGGCAATTATTTTGATAAACCGACTGATATCATACTCAA
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CGAATTGGATTCAATCAAATTTAACAGTAAAGGTTACGAAAATTTACATT
ACAACGCTTCTACCATTGCAAACGCTACTCAGTCACAGCATGCGGTTCGG
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GATGGAAGCAACGAGTTGGTCAAACTCTCTCAACAATGTGCAAGTCAAAT
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ATGGCAGCATGTTTCGCTGTCGTTAAAGAAAGGCATAGTAATACCTGGTA
GTTAATCCGGTTGCAGATAGCCCTAGCCGTGCAGGGATGCAATGCCAACC
TGATTATAACTTGGTTGAAGAGGAATGCAAGGACGACTACCCAGAAGAGT
GCAAAGCCATCGAGCGCCGAAAAGCGGAACATGTCTGCCATTTTGATTTG
GTTGGATTCAAAGGAAAAGTCAACGAGTATTGTCGAAAAACATGTGGACT
TTGTTCTTGAATTATTTGGCGATCCACCCAAAAGGTTGGGTGCTCGGGCG
TGACACACCCAGGGCGTCATCAATCATCAGTTTATGTTTGTTTTTATTCA
CCACGTGGCAATTATTTTGATAAACCGACTGATATCATACTCAACCTCAA
ACCGAGAATCACACCCATTGAAGCCAAAACTAAATTCGGTATTCCGAATT
GGATTCAATCAAATTTAACAGTAAAGGTTACGAAAATTTACATTACAACG
CTTCTACCATTGCAAACGCTACTCAGTCACAGCATGCGGTTCGGCTGAGC
TACATAACAAATATAGACGTTTTCACAAATCAACGCCGGACGTTGATGGA
AGCAACGAGTTGGTCAAACTCTCTCAACAATGTGCAAGTCAAATTATTCA
AACTGGAAAAAGCACGTGTGACCATGAGGATTCTTATGGAATCAATATTG
CAATACTTCCCTCTGTTTCTCGGACTTCACACTTAGAAGAACTTATGGCA
GCATGTTTCGCTGTCGTTAAAGAAAGGCATAGTAATACCTGGTAGTTAAT
CCGGTTGCAGATAGCCCTAGCCGTGCAGGGATGCAATGCCAACCTGATTA
TAACTTGGTTGAAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13232MSTRG.13232Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13232.2.p1MSTRG.13232.2.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13232.2.p1.exon6MSTRG.13232.2.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13232.2.p1.exon5MSTRG.13232.2.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13232.2.p1.exon4MSTRG.13232.2.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13232.2.p1.exon3MSTRG.13232.2.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13232.2.p1.exon2MSTRG.13232.2.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13232.2.p1.exon1MSTRG.13232.2.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000104_pilongenomesc0000104_pilon:165376..184113 -