MSTRG.18491.1.p2 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.18491.1.p2
Unique NameMSTRG.18491.1.p2
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000199_pilon:518505..562774-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.18491.1.p2 ID=MSTRG.18491.1.p2|Name=MSTRG.18491.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=44270bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000199_pilon:518505..562774- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000199_pilon:518505..562774-

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GACACAGCTTTGGGAACAGCTTCAGCCAAGCATCACAAATTACTTGTGGA
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CTATCAGACAGGTTTGCCCTGGAAGCGGCTACTTCTGCACATGCGCAAAC
GTCTTCTTCTACTGAAGCTCCTTCTCAAATGAAACAAGCTTTACGGGTCG
CACAAACTACTGTAGATAGCTTAAAGAATTACGATAAAATGGAAGGGCGT
TTGAGAGCGGCAGAGCAATCTCTACTACAAAAGGATAAGTTTGAACAAGC
AACAGGTGCTCTACCCGATGAGACGCTTCCCATTGCCAATCAATTGGAAA
TTGCCATCGTTAAGATTAAAGAACACATCAAAACTATCATTTACGCTCGC
AACGAGACCAATAAAATGCAAGAGGAATACGAAGATCGCCAACTATTATG
GGAACAACACGAAGTTGAACTAGAACGAAAGATTGCCAAACTTGAAAATC
AACAGAAAGACTTTTACGAAGCAGCTAAGAAGGTCATCTATTTAGAGCGC
ATAAATCAGAAGAATGATCAAAGCGTCACAACTTTAGAAGGTGATATGAT
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AAGCGGAAGTATTAACTTCGGAGACTTGCGGAGCTAGAGGAGATGGTAGG
TGAGCAAGACACAGCTTTGGGAACAGCTTCAGCCAAGCATCACAAATTAC
TTGTGGATATGAGAAGCTTGAAGGAAGAAGCCGAGGAAAATATCAAAACG
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CAGGAGATCAAAACTCTGCAAGACCGATTGCAACTTGAAATCGAAGAACA
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CAAAAATCGCATCTGATAGACAGCTGATGCTGCAAAAGAAGGATGAAAAC
ATCATCAAGTATCAAGAACTCTTGAATCGATCCAGAGAGGTTATCAACGA
ATTACGCATCCGTGTTCCGCTATCAGACAGGTTTGCCCTGGAAGCGGCTA
CTTCTGCACATGCGCAAACGTCTTCTTCTACTGAAGCTCCTTCTCAAATG
AAACAAGCTTTACGGGTCGCACAAACTACTGTAGATAGCTTAAAGAATTA
CGATAAAATGGAAGGGCGTTTGAGAGCGGCAGAGCAATCTCTACTACAAA
AGGATAAGTTTGAACAAGCAACAGGTGCTCTACCCGATGAGACGCTTCCC
ATTGCCAATCAATTGGAAATTGCCATCGTTAAGATTAAAGAACACATCAA
AACTATCATTTACGCTCGCAACGAGACCAATAAAATGCAAGAGGAATACG
AAGATCGCCAACTATTATGGGAACAACACGAAGTTGAACTAGAACGAAAG
ATTGCCAAACTTGAAAATCAACAGAAAGACTTTTACGAAGCAGCTAAGAA
GGTCATCTATTTAGAGCGCATAAATCAGAAGAATGATCAAAGCGTCACAA
CTTTAGAAGGTGATATGATCAAACAAGCTAAGATGAAATTAAAACGGGAG
ATTGACCGACTCAAAGAACAAGCGGAAGTATTAACTTCGGAGACTTGCGG
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GCCAAGCATCACAAATTACTTGTGGATATGAGAAGCTTGAAGGAAGAAGC
CGAGGAAAATATCAAAACGCTAAAAAGTGAAATGAAACGGAGCTGAAAGC
ACAAGCGGACAGCCATCGTCAGGAGATCAAAACTCTGCAAGACCGATTGC
AACTTGAAATCGAAGAACATGTTAAGAAGATCAAGAAAGTTCATACACAA
TATGTCAACGCACCGCAACCAAAAATCGCATCTGATAGACAGCTGATGCT
GCAAAAGAAGGATGAAAACATCATCAAGTATCAAGAACTCTTGAATCGAT
CCAGAGAGGTTATCAACGAATTACGCATCCGTGTTCCGCTATCAGACAGG
TTTGCCCTGGAAGCGGCTACTTCTGCACATGCGCAAACGTCTTCTTCTAC
TGAAGCTCCTTCTCAAATGAAACAAGCTTTACGGGTCGCACAAACTACTG
TAGATAGCTTAAAGAATTACGATAAAATGGAAGGGCGTTTGAGAGCGGCA
GAGCAATCTCTACTACAAAAGGATAAGTTTGAACAAGCAACAGGTGCTCT
ACCCGATGAGACGCTTCCCATTGCCAATCAATTGGAAATTGCCATCGTTA
AGATTAAAGAACACATCAAAACTATCATTTACGCTCGCAACGAGACCAAT
AAAATGCAAGAGGAATACGAAGATCGCCAACTATTATGGGAACAACACGA
AGTTGAACTAGAACGAAAGATTGCCAAACTTGAAAATCAACAGAAAGACT
TTTACGAAGCAGCTAAGAAGGTCATCTATTTAGAGCGCATAAATCAGAAG
AATGATCAAAGCGTCACAACTTTAGAAGGTGATATGATCAAACAAGCTAA
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Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.18491MSTRG.18491Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.18491.1.p2.exon33MSTRG.18491.1.p2.exon33Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.18491.1.p2.exon32MSTRG.18491.1.p2.exon32Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.18491.1.p2.exon31MSTRG.18491.1.p2.exon31Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.18491.1.p2.exon30MSTRG.18491.1.p2.exon30Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.18491.1.p2.exon29MSTRG.18491.1.p2.exon29Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.18491.1.p2.exon28MSTRG.18491.1.p2.exon28Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.18491.1.p2.exon27MSTRG.18491.1.p2.exon27Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.18491.1.p2.exon26MSTRG.18491.1.p2.exon26Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.18491.1.p2.exon25MSTRG.18491.1.p2.exon25Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.18491.1.p2.exon24MSTRG.18491.1.p2.exon24Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.18491.1.p2.exon23MSTRG.18491.1.p2.exon23Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.18491.1.p2.exon22MSTRG.18491.1.p2.exon22Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.18491.1.p2.exon21MSTRG.18491.1.p2.exon21Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.18491.1.p2.exon20MSTRG.18491.1.p2.exon20Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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MSTRG.18491.1.p2.exon17MSTRG.18491.1.p2.exon17Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.18491.1.p2.exon16MSTRG.18491.1.p2.exon16Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.18491.1.p2.exon15MSTRG.18491.1.p2.exon15Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.18491.1.p2.exon14MSTRG.18491.1.p2.exon14Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.18491.1.p2.exon13MSTRG.18491.1.p2.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.18491.1.p2.exon12MSTRG.18491.1.p2.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.18491.1.p2.exon11MSTRG.18491.1.p2.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.18491.1.p2.exon10MSTRG.18491.1.p2.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.18491.1.p2.exon9MSTRG.18491.1.p2.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.18491.1.p2.exon8MSTRG.18491.1.p2.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.18491.1.p2.exon7MSTRG.18491.1.p2.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.18491.1.p2.exon6MSTRG.18491.1.p2.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.18491.1.p2.exon5MSTRG.18491.1.p2.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.18491.1.p2.exon4MSTRG.18491.1.p2.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.18491.1.p2.exon3MSTRG.18491.1.p2.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.18491.1.p2.exon2MSTRG.18491.1.p2.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.18491.1.p2.exon1MSTRG.18491.1.p2.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.18491.1.p2MSTRG.18491.1.p2-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000199_pilongenomesc0000199_pilon:518505..562774 -