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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000221_pilon:434643..438279- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.19403.1.p1 ID=MSTRG.19403.1.p1|Name=MSTRG.19403.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=3637bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000221_pilon:434643..438279- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GCTCTTTTTGGCAATTATTGCTGAAAACGGCAATTTTTTCAACAGTAAAA
TGCTGAATTAGCAGAAAAGTAAAAAAAGTTGGTTCAATTGGCTCAGTGTA
TCAAATCTCTCAGTTTAGTTGACACTTTGGTATCTTCATTGCATCACAGC
GAAAGTTGTTTTTTTAGTTTGTATTTTTGAAAGACCCCATCTGATTTAGG
CAGGGCTGTCAGATTTAGGACCACTCACAGTAGGGTTGGGAGCTTTGTTG
ATTTTAAGGTCTGTGAATTACCCGCTATTAGTATTTGTGAATGATAGCAT
TCTGTCGTGTCTCATGGCGCAATCGGTTAGACATTGGGTTTGTAAACCAA
GGTTGCTTGCATTTGTTGGTGGTTCAAGCCAGTTAGCCACACTAGCGTCT
CGCAAAAATGCGTATCAAAGATTAATCTTGCGAAAGCGATATAAACTTGA
CTTGCAAGCAAAAAAATATGCTCCAAAACTTCTAAAGGGATTCATAAAAA
AATAACCCTGTGCTTTTTAATGAAATTAACATTTTCGAAAACTATGAGAA
ATTGCCTAAAATTTGAGCCATATCAGGCCATACACGCCAAGCCAACCTTG
AAAACTAAATTGAAGATCAACTTCCCACTGACCTATTTACATGTGTGGAA
TTGGAATTATTTTTACTTTAGCGTATAAACAAGGCCTTGAAAATGGAAGT
GCTGTCTCGGGAATTGAATGAAAAAATTAGGTTGGTTTATATTCTGGCTG
TTGCACGTTTTCAATCAGTCATTTTTTCTCACTTTAAGTTTTCAAGTTTT
AATCAATTGCCTTGGGAACTTGAACTTGATCCAGGTAACTCTCATTCATG
TTGTTGCAAATACATCATGTAGATGACTGATGTTGTTTTTTAAGAAAGCT
TGATTTCCTAGTGTGACTAACAATAAAGTAAAACTTTCCTAATTATACCG
TTGTTTTGTATAAGATTTCCATTTCCACACAAGATTTCTTTGCCACTTTT
CTATCGGAAAAAGACCAGGACTCTGGGATAGTTGAAAAATTTTAAGCTTA
GGAAAGTTAGGTAGTTTTTTGAGTAAACACCACAGATTTAATTTATAAAG
CCCAAAAGGCTAGATGTTGTTCTTTGGCTACTATCCAGACCGTTTTTCAT
GCCCTTTAAGCGTCCCTGCCACTCTTGAAATCACTAAAATTTTGGTAAAA
ATGGCCATTTTAGTGGTAAAATGCTTATACATAATCCCCACAATGAAAAA
CTAGTATAATCCCATGGTTTAAATTCTAATTTTACGCGAAATGTGAAATG
CTTCTTCCTTCTTACTTTTGTTGTGGTTCATGGCTTTATTGTTTTGTTTA
TTACTTGATGAACAATTTTCAAAAGATTAGAACGTTAGTAATAGTGGATT
AAATCTTTTTACGAAGTTGAAATTGTAAATATTTGTAATTTGTTTTTGGA
CCTAACTTAGTCCGATCGGGCTGATTTTGTTAAAAAAAGTTTATTTGAGT
TGAAGAGTTATCAAAAAATTGACAAAACAAAAGGTATTGTTATTGTTGTT
GAGTTAATATTTTTGAGATATGTTGCTTGGTTAAGAAAAATTTCCTCCTA
AGAAATGCATACAGCTTCATATCATTACTCAAGCTGCAACTCTAAACCTA
ACTGATTATGACCAAACCTCTGGCTAGCCAAAGACAAATGAGAAAGATTG
TGTGCTTTTTTTGATTTCTTATCTGATATCAACAAAAAATCAGTGGATAT
TATATTAGTTTTTTCATGTTTCTCATATGAATATTAATATGAAACTATAA
ATTAAAGATGTCAACAACAACAAATGACCAAGTTGCTATCATCAACAATG
AACCACTGTTTGATTGTGATCCAACTGATGGTGACCCAGCTCATTGCAAT
TCAAAACCAATCAAGCTACAAAGGAAGTTAGGTCGCCTTCATGGATTTTC
ACTTATAATTGGATTGATTTTGGGCAGCGGTGTTTTTGTATCTCCTGGAT
TAGTTGCTAAAGACACAAGCTCTACTGGAATGCAACTGATCATGTGGGTA
GCAGGTGGGATCATTGCTCTTCTTGGCGCCCTTTGTTATTGTGAGATTGC
TTGCATGTTCAAAATGGCTGGTGGAAGCTATGCTAATATATTCAATATTT
ATGGTAGCATGGCTGCTTTCCTAACAGCATGGGTGAATTGTCTTGTGATT
GATCCCTCAAGTATTGCCGCAACTGCTTTAACCATTGGAACTTATGTTGT
TAAACCATTTTATGAAACTGATTCTAACGGAGAAAAAGTTGCCAAGCTTA
TTGCTTTTGGGTTGATTGTACTGGTATTTATTATCAATAGCTCTTCTGCA
AAAGTCACAAACATGATACAGAGGGTGCTATCAGTTATTCAAATATTATC
AGTTGCTTTTGTCATCATCATTGGAATATGGCAGCTGATTGAAAACAAGA
CAGGTAATTTTAATCACCCATTTTCTGGGACAGTTTTCAATAAACACAGC
CCTTTACATTTTGGTATTGCGTTATTTGGTGCTTTATGGTCTTATGATGG
TTGGGCATCGATGACCAGTGTGGTTGAAGAACTGGATAACGTCGAACAAA
ACCTGGTCCTCACTCTCATTACTGGTATTCCTTTCGTTATATTTTGCTAC
ATCATGGCTAATATTTCATTCTTGGCTGTATTATCTCACCAACAAATAGG
TGCTACAGACACAGTAGCCATTGATTTCATTGATAAGGTTCTGGGTGTGA
AAACATCTTACCTAATGATGGTACTTGTTGCATTATCAGCTTTTGGCAAT
CTTAATGGTAGCTTCTTTACTGCTCCTAGAACAACAATGTCTGCTGGACG
TGAGGGACATATGCCTTTCATTTTTTCGTTGCTTTATCATAAAAATGAAC
AGCCTATACCAGCTTCTGTATTACTCATGGTCGTTTCTTCTTTGATGTTA
CTTCCTGAAACAAGCAACCTTAACACATTGATTCTACTCTTCAGTCAAGC
TCAATGGATCCTTTACACAGCTTCTACAATCGGTGTGATCATTTTACGAT
ACCGTAGACCAGATATTGACAGACCATTCAAAGTTTTTCTCGGAATTCCT
GTATTTTTCTCAATCATTGGTGTTTATCTAGTGATCATACCATTCTTTCG
TTATTTTTGGCTGTCTATTGGAATGTTTGGTTTTATTGCTCTTGGAATGC
CAATCTACTTATTATGTGTCAAGTACTTACCTTCATGTTGTTCAAACTTC
ATGGAGATATGTAATATGAAATTTCAAGTCTACTTTGGTTTTGTCCCATG
CTCTAAGGAAACTTGAGTTTTTTCTTTAGCTGCAACTGGATTTAGAATCA
AATATAATTTTCATAATCGTCTTTTCCTTTTTGATTTGGGAGTGTCATTA
TTATTTTGTTGGCTCTGGATTTTTTCAATGATCAAGTGTTATAGCGTAAA
ATGCTCCTGATTTTTATTACCATTTTGGTATTTTTTTATATTTTAAACAT
TATTTGATTGTGGATTTTATATTATTTTTATTACAATCTTGGTATTTTTT
TATATTTTTATAAATTATTTGATTGTTCATTTTATGTTTTTTTTATATTT
CATGAAATATTTGATTGTTAATTTGTATGAACTTGAC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000221_pilon:434643..438279- >MSTRG.19403.1.p1 ID=MSTRG.19403.1.p1|Name=MSTRG.19403.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1509bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000221_pilon:434643..438279- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCAACAACAACAAATGACCAAGTTGCTATCATCAACAATGAACCACT
GTTTGATTGTGATCCAACTGATGGTGACCCAGCTCATTGCAATTCAAAAC
CAATCAAGCTACAAAGGAAGTTAGGTCGCCTTCATGGATTTTCACTTATA
ATTGGATTGATTTTGGGCAGCGGTGTTTTTGTATCTCCTGGATTAGTTGC
TAAAGACACAAGCTCTACTGGAATGCAACTGATCATGTGGGTAGCAGGTG
GGATCATTGCTCTTCTTGGCGCCCTTTGTTATTGTGAGATTGCTTGCATG
TTCAAAATGGCTGGTGGAAGCTATGCTAATATATTCAATATTTATGGTAG
CATGGCTGCTTTCCTAACAGCATGGGTGAATTGTCTTGTGATTGATCCCT
CAAGTATTGCCGCAACTGCTTTAACCATTGGAACTTATGTTGTTAAACCA
TTTTATGAAACTGATTCTAACGGAGAAAAAGTTGCCAAGCTTATTGCTTT
TGGGTTGATTGTACTGGTATTTATTATCAATAGCTCTTCTGCAAAAGTCA
CAAACATGATACAGAGGGTGCTATCAGTTATTCAAATATTATCAGTTGCT
TTTGTCATCATCATTGGAATATGGCAGCTGATTGAAAACAAGACAGGTAA
TTTTAATCACCCATTTTCTGGGACAGTTTTCAATAAACACAGCCCTTTAC
ATTTTGGTATTGCGTTATTTGGTGCTTTATGGTCTTATGATGGTTGGGCA
TCGATGACCAGTGTGGTTGAAGAACTGGATAACGTCGAACAAAACCTGGT
CCTCACTCTCATTACTGGTATTCCTTTCGTTATATTTTGCTACATCATGG
CTAATATTTCATTCTTGGCTGTATTATCTCACCAACAAATAGGTGCTACA
GACACAGTAGCCATTGATTTCATTGATAAGGTTCTGGGTGTGAAAACATC
TTACCTAATGATGGTACTTGTTGCATTATCAGCTTTTGGCAATCTTAATG
GTAGCTTCTTTACTGCTCCTAGAACAACAATGTCTGCTGGACGTGAGGGA
CATATGCCTTTCATTTTTTCGTTGCTTTATCATAAAAATGAACAGCCTAT
ACCAGCTTCTGTATTACTCATGGTCGTTTCTTCTTTGATGTTACTTCCTG
AAACAAGCAACCTTAACACATTGATTCTACTCTTCAGTCAAGCTCAATGG
ATCCTTTACACAGCTTCTACAATCGGTGTGATCATTTTACGATACCGTAG
ACCAGATATTGACAGACCATTCAAAGTTTTTCTCGGAATTCCTGTATTTT
TCTCAATCATTGGTGTTTATCTAGTGATCATACCATTCTTTCGTTATTTT
TGGCTGTCTATTGGAATGTTTGGTTTTATTGCTCTTGGAATGCCAATCTA
CTTATTATGTGTCAAGTACTTACCTTCATGTTGTTCAAACTTCATGGAGA
TATGTAATATGAAATTTCAAGTCTACTTTGGTTTTGTCCCATGCTCTAAG
GAAACTTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000221_pilon | genome | sc0000221_pilon:434643..438279 - |
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