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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000120_pilon:320280..326972- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.14438.4.p1 ID=MSTRG.14438.4.p1|Name=MSTRG.14438.4.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6693bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000120_pilon:320280..326972- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TGCAAGAATGAACTTTTTGTTGGAGGATGAGCAGAAGCCTATTTATGTTA
CAGTCAAATGATTATTGTCATGGTATGCACTTAATCCTTTCAAGAGTCGT
CCATTGGTAAGTGTCACAAGATGATGTTTGCCAAGGCATGTTTTAGGCAG
TAGCGGCCTGGCTTAATTTTCTTGGTGGTGCAAACTATGAAATTGGCGCC
CCTGGTATTTTTGTCCTCGTTTGCGCCCTCTACCATTAAGTGAAAATATT
AAACTGTAAGAGTAGTGACTGGTTGAAAGTAACGCTCGGAATCTCTGAGT
TAACAAACTTTTATTTATACGAAGGTGGTGTAATGATAACTTGATATCTA
TTTCCTTGTTATTTCCTGGTCTTACTTTACTCTCGATTAAAGATCAATGG
CTGAAAGAGGCCCCAAAAATTCGAAAGTTGGCAGGATTCTTTGTAATTTT
GGCGCCGCAGGCAAAAAATTTGGTGTAAGAAAGGTCAAATAGCTTAAAAG
ATATTCTAAAAAGGAGAAAGTTAGTCCGCATAAGACCACAAAAACCACAG
CGAGCAGTTTCGATCAATCTCTCATTTGGGGATGAGCATCCTCTTTAACC
CCTGGTGGATACACAACACTTCTCTTGCTTTGAATTTTCGCAATTCAATG
TTGATAGTAGGTTTGAAAAAATTCTTAAAATAAAACGAAAGCGCCGCAGG
CGAAAAAAAATTTACATTGCACTTATAGAAGGCGTTAAAAACGTGTCAAA
GGGCGCCAAATCGCCCAACCAAACATCAAAAAAATTTTGGCGCCCCCTTG
AAAAGCTTTTTTGGCGCCCCTCTCAAGTCTTTCTGGGTGGTGCACTGCAC
ACCCTGCACCCCCTGCCAGGCCGCCACTGGTTTTAGGGAAATATTTATGG
CATGTGGTGATCAAAAACGATCTGAAATGTTTGGTTGTTTTATCTTTGAA
ATTCTGGCTGAATCGATGATATATTTGGTTTTCAGACTTTAAAAAATATA
TAAATTCTTATATATTACTTGAAATATTCCAATTTAAGTGATTCTTAAAT
TATCTTTAAATTATTTTTTGTGTTAATTGATGGTCAAAATAGATCAAGTA
TTGTTCCAAACGTGTAGAAATAGAGGAAGGAAACAAAAAACTGATAATTT
TACATTTCAAAAGACCCTAAAATGGTTAGGACCTCGGTATGATTTTTAGA
AGAAATTTGTTGACGAAAATTATTCTAATGGGAAAATACTTGCTGAAATC
TCATCCCGTAATTGAAAAATCCACTAAACCTAAATTTTCACTGGGAAGGT
TTCTTTGATTTTAATATCCTCTTACTGGATTCTAAGCTGTAATCGATTGA
ATGCAAAATCCAGACTCTATAAAACAATTGATTTTCCATTACTTACTTTA
TGTCAATTTGCTACCGGCCAAAATATTGTCACCGGGGCATTGAGACTAGA
GTGTTATTTGGAACTCTGGGAACTTAGTCTGAATCGCATAGACCTCTACA
AAACCCCATGTAGTATAGGGAGCACGAATCCGTTAGTGGATACCAGCAGC
CTACTGGGAACTGGGAGTGGGAAGCAATAAAAATCAACATAAATGACATA
TATCTGCCAAATAGCTTTTTGAATGACCCCTAAATATAGACTATTGTAAA
ACGGTTTGTTGCAAATCAAAATAAAAGCTGCATTATGAAACTTGACCTTC
ATGAGAGGGGAACATTTGATGATATAAAAGGGAATCGATTTTTTTAATCT
CTCTCAAGAGCTTTCATCATAATGTATCAATCCTTTTCATAACACAGATC
ATTGACTTTCATTCATAGATTATATCAAAACTCTAGTTTCGAATTTACAA
AAATTATCTTTCTTTCGCTTTTTCTATCATTTTGGTATAACATAGATACA
TCTTGAGTCAATATTTTGATCTGCTTTATAAAATTTATTACGTTGGGTAC
GATATGATGACTGCTCTCTTCATAAGACTCGCGTTATCTTGAATGTGTAG
GTACTTAGTCAAATTTTAGTATTATCAATTTATGAATTGAAATAATTGAG
TACTTTTTTTGATTGACGACGAATTTAGGACAAAACTTACGTGGGATTCC
TTTGAAATCTTTTGCTTTTTTGAAGGATTCCAACCTCTTTCTCTGTGTAT
CATCAGTTTTTTTATTGCTTACTGATAGCGCTAGATGATACCCTGACATT
GTCTGTTATTCTTTGGCGTCAATCAGTAACGTAAATAAAGCCTAAAATAC
ACGAGGACGAGGCTGGTAGGATTCTAAATGGAAATTTCACAATTAAATGG
TACTACAGTGGAGTTTTCATAACTCGAACACGCACGAGCAACACAAATTC
TTTCAGTTACAGAGTTACAGAGTAATGTTTATTTTAAGGCATTATTAGCT
GAAGGGACCATAAAACTTGTTCGAGTTCAGAAGACATTCGAGTTATAGGG
AGGGGGGGCGTACAGGTTTGACGGTGTGACGGTATTAACCCTTTTTTCTG
TCGGTGTTTCCGTGTTTGAGAAAAAAGTGACGTTATTTCGGTGTCAAACA
TGCCATGCGGTGACAAAATAGAAGATTTTACCAAATTTCGCTGTCGGTGT
TGACGGTAATCCAAGAAATATGCGTCGGTATTTCGGTGTCTACGACCCCC
GTACGCCCCCCCTCAGTTATAGAGGTTCTAGTTAAAAAGGGAACTCAGTT
GTATCGATGTCATTGCAAAATTGACTAGGAGATTCGCATGGTGATTAGAC
AAGAAAAATATAATCTATTGCTTAGACTTTGACCTATTTTCAACGAACGC
AATTCTAAATCGTTATCATGTTTGCATGGTGGAAAGGTATGTCACCCAAA
AGAATGTATTCAACCTCTGAAATACCATGACGTTGTCATTAGTTATGTTT
ATTTTTCGTCATCAGTTTTGTATGGTATGTCGTGTTATGTTGATCAACGG
AACATGTTATTTCCAAAGATTTTTTTTGCGTCATTCTAATCTTTCTGATA
ATCTACTGGACCGCACGATGAAATATGTATTTTTTTTCAACAATGTCTTC
TTATCTTTATTTAGTAGCAGAACACTGAGATCATCTCGGAAATGTTTGAA
TTGCGAGATCTGTGTATGTTTTGTGTGTGTAAATGTTGAATTTATGAAAC
ACGATCACAGCTTTCGTAGATATTATTTGGTGACAGTGAGACATAGTAAC
GATTCTGTTTCATGCTGTTACCCGGCTGTTTTCGTATCAGTAGTATTTCG
TTAAGTTGGAAGGTCAATGGAATCTTTCTGAACGATCGAAGGTTTTCAAA
CTTCTCCTCTGTTGTATTTGTCGGTAAACATACCCGATATCTAACGGGAA
AATTCATTGCCGTACGCTACGTTATACGTGAGACACACTCTGGCATATTG
TACTGTAGTACACGAGCGAGTGATTGATTGAATGTGTTTAGGACGGATAG
AAACGTTCTTACTACATCCATGTCTCAGTGACACTGGTGGAAATTATTCA
GCCTAGTGTATTTTTTAAATTAAACTATGGAACAAGTATTCATGCATATA
CATCTGTATTTTTTCGCTGCTCTCTGGACAATTTCTGATTTATCTTTTTC
ATTGATTTGGCAAGGCAGCGTTTATAATACAGACCCTCCTGTGTGTTTTC
ATAACCTGTCGATACTGTGCTCATTTCGTCGTAAAACAAATCATAACGAT
GCACGCTAATGCATACACGTGACGTCTACTACCATTTAGCCCACTTGGTG
AAATGAAACATGCCATACTTGGAAAGCAAGGCCTCCACCTGTAATCAATT
AGTATTGCATTCCAAAAGTTTCACAAACATACTTTCATAACAACAGAAAC
TAAGTTGAACGTGACAACCATGAGGCAACCCTACTATTATATGCTGACAA
AAGCTTGTTTTACGTTGCTTAATTGCCAAGGATGACGGAGTTAATTAACA
ACGATGGATGTAATTAATGGTTTTACGAGCTCATACTGATAATGAGGGAA
AAACTAAACGGTTTATTGTAATCAGAAAGATTTTTAGTTCAGTTTGTATT
GATTGAAGGTTTTTTTCTTTAAGTTTGACATGGTGGTCACATTGGATAAG
AAGATTCTTATTTCTTTAAGGTTATATTTTTGTATTCAGAGGTACTCAAT
TCCTGTGTAACTGAACAAAAAACGGTTCAAAATAGCTGTTCTATCTTTTC
CTAAGCTTAAGATTGAAAATTACTACCATTTGAACCATTGGTGGGCAAAT
TTGCTTCTTTGTTTCCACTGGGATTCTACGAAAATTAAAATTCATCCCAA
GTGAAAGTGGGTTCAGTGGGTTAAACCATGATGGTTATTGACAGCCATCC
GAGCAAGTGTGTGGTATTTGGCTTGAAGGCGGTCGCGAGCTAGATTGAGA
GTGGTGCACGCGGGAGAGTAGATGAGGGTCCCCCGTGGGAGGGGGGAGAG
TGGATATGAGGACGCGCGAATTTTCGAATGTTTACGAAAAGTGCATTGCA
ATGTCTTCATAAAATCTTTATTTTTGTTTAGAAATTCGAAAGAGGAAAAA
TGGTAGCTGCAACCAGAGGTGAAAATTGCAGTGGAGGTGGCTCCACCATG
AATATTTTCAAAAAACTTTTTAATGGAATAACTGCATTGAAAAGTGGAAT
TCGTAATCGAAAAAATGATGGACCTATGCTTAGTGGGATCTCTGGATTTG
ACTCAGATAGTGATGATGATTGTGAAAATGAGTTTGTTTACACAGATCGT
AGGGAGGAAATGATGCTTTTGGATGCCAAATTTGGATCGAATGAAACTCA
CTTGCCTATTATTCAACAACATTTACAGCCACGAAATAATCAATTAGACT
ATCTTGGCCATGGTGGTTTTAGTATTGTTAAAAAATGCTGGTCAGAGAAA
CACGAAACCGATGTAGCTATCAAGATTATTTTAATGGACAAGGAAAATAA
TAACTTATATTTGCAGAAATATTTACCGCGGGAACTTGAAATTTGGGGTG
AGATATCAAAGTTTCAGAACCAAAATATATTGAGAATGATAGAAAATTTT
ACTGGGACTGGATTCACGTATGTTGTTATGGACGTAGTAGATAATGGTGA
TCTATCAACTCTAATGAAATTTGGAGCCTTGACTGAACATAAATCTAGAT
CTATATTTCGAGGACTTTTTGAAGCTGTTCATTTTCTGCATAAATTGGGA
ATCGCTCACCGTGATATAAAACCTGAAAATTTACTTCTGACCAAAAGAAA
TGAAGTTAAATTAGCAGGTAATTGTTTTCTTATTGCCTTCTTGGTCTCGA
TCGATGTCTTTTAGGACTGTTATAGTCTACATTCATTTTTATGTGATGTT
GGAGGAAAAAACTTTTCCCGGATGGGAACTTTTTTAATTTTTGCGTCCAA
CCTTTCTCATGTTCTCACTTTTTTACCAGATGAAGTGCTAATTCTAAAAT
TTCTTGTTCACGGAAAATAATGTGATACACTTCTCTCGACCAATAACAGA
GGAAAATGGGTACTAAGGTTCAAGTCATTAACAGGATCTATTTCATTAAT
TGATTAATTTTAGTGAGTTAACTCGCATAGTGCTCTTTCATCCAATTCTG
ACGCCATGTCGTGACAAGGGTTGTTTTGGAAAGACACAGGGGTGTTGTAC
TCAAAATCTGTCACAAGAATAAGTCCCATACCATAGTAAAGTTTCTTTCT
ACTATTACATCTCTCACATCATTATGAGGATATCGTCCATTCACATTAGG
TATAGATTAGATATATTTAAGCCCCTTTGAATAGCTATTTTGATGGGCCC
TTCCTGAAGGGTTGGGAATCACAGACCTAAATATACATTGAAACAATTGC
GAGACATGATGAATTTAGCTTCAGATGATTTTGTTTTCATTTAAGATTTT
ACCTTCGTAACCAAAGACAATCCTGTCTCATCGGAGCGTTGTGGAACGCC
CGGATTCCTGGCCCCGGAACAACGGGATTGCGGATACTACGATCCCTTCA
AGTCAGATATGTGGCAAGTCGGGTTGACATTATATTACATGTTCTTTGGT
GACATGCCTTTCACATCAAGCCGTAAGAAACATTTAATAGATGAAATAGC
ATCATGCAGGAATAAATATCGAAACGTTCCGATGCCGACTGGTAGAATGT
TATCGAAAGATGCCAAAGACCTTGTAGCGGGAATGTTACAACTTGAAATT
GATAATCGTTGGAATATACAGCATGTGAAAGCGAGTTATTGGTTAAATCC
TACTGAAAGGAATTTGGTGAATAGAACCCCGGTAAACGATAGTGATGATT
AATTATCATGTGTCTTTGACTTGAAAAAAGTGATGTACAGTACATGATAA
TGCATCTTACCTCAAAGTCATCCAACATTACATCACGGACTCATCAGTTG
ATTGTTTGCAGATGACGTTTGACTAATTTAAATACTACATTGGTTGTAAG
TGACCAATCAGCTGATACTATGTTGGACTTGGATCGAAACCTGGTTCGAA
AATCAATCCTTAAAAGAGCTGCTGTAAGATTTCGAACACTTTAAACAAGG
TTTTCAAATTTTTTGATAATTGTAATTCTTTGGAGCACGAGTATTAGTGT
TTTTAAATCGCTCCCTTCCAAAAAGGCTCGATTCCTTTTTTTGGCCTTTT
TCAAACTGGAACCCAGTCCCTTTGTTCGTTTTTTTATGATTCT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000120_pilon:320280..326972- >MSTRG.14438.4.p1 ID=MSTRG.14438.4.p1|Name=MSTRG.14438.4.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2250bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000120_pilon:320280..326972- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATTTTACCTTCGTAACCAAAGACAATCCTGTCTCATCGGAGCGTTGTGGA
ACGCCCGGATTCCTGGCCCCGGAACAACGGGATTGCGGATACTACGATCC
CTTCAAGTCAGATATGTGGCAAGTCGGGTTGACATTATATTACATGTTCT
TTGGTGACATGCCTTTCACATCAAGCCGTAAGAAACATTTAATAGATGAA
ATAGCATCATGCAGGAATAAATATCGAAACGTTCCGATGCCGACTGGTAG
AATGTTATCGAAAGATGCCAAAGACCTTGTAGCGGGAATGTTACAACTTG
AAATTGATAATCGTTGGAATATACAGCATGTGAAAGCGAGTTATTGGTTA
AATCCTACTGAAAGGAATTTGGTGAATAGAACCCCGGTAAACGATAGTGA
TGATTAAATGGTAGCTGCAACCAGAGGTGAAAATTGCAGTGGAGGTGGCT
CCACCATGAATATTTTCAAAAAACTTTTTAATGGAATAACTGCATTGAAA
AGTGGAATTCGTAATCGAAAAAATGATGGACCTATGCTTAGTGGGATCTC
TGGATTTGACTCAGATAGTGATGATGATTGTGAAAATGAGTTTGTTTACA
CAGATCGTAGGGAGGAAATGATGCTTTTGGATGCCAAATTTGGATCGAAT
GAAACTCACTTGCCTATTATTCAACAACATTTACAGCCACGAAATAATCA
ATTAGACTATCTTGGCCATGGTGGTTTTAGTATTGTTAAAAAATGCTGGT
CAGAGAAACACGAAACCGATGTAGCTATCAAGATTATTTTAATGGACAAG
GAAAATAATAACTTATATTTGCAGAAATATTTACCGCGGGAACTTGAAAT
TTGGGGTGAGATATCAAAGTTTCAGAACCAAAATATATTGAGAATGATAG
AAAATTTTACTGGGACTGGATTCACGTATGTTGTTATGGACGTAGTAGAT
AATGGTGATCTATCAACTCTAATGAAATTTGGAGCCTTGACTGAACATAA
ATCTAGATCTATATTTCGAGGACTTTTTGAAGCTGTTCATTTTCTGCATA
AATTGGGAATCGCTCACCGTGATATAAAACCTGAAAATTTACTTCTGACC
AAAAGAAATGAAGTTAAATTAGCAGATTTTACCTTCGTAACCAAAGACAA
TCCTGTCTCATCGGAGCGTTGTGGAACGCCCGGATTCCTGGCCCCGGAAC
AACGGGATTGCGGATACTACGATCCCTTCAAGTCAGATATGTGGCAAGTC
GGGTTGACATTATATTACATGTTCTTTGGTGACATGCCTTTCACATCAAG
CCGTAAGAAACATTTAATAGATGAAATAGCATCATGCAGGAATAAATATC
GAAACGTTCCGATGCCGACTGGTAGAATGTTATCGAAAGATGCCAAAGAC
CTTGTAGCGGGAATGTTACAACTTGAAATTGATAATCGTTGGAATATACA
GCATGTGAAAGCGAGTTATTGGTTAAATCCTACTGAAAGGAATTTGGTGA
ATAGAACCCCGGTAAACGATAGTGATGATTAAATGGTAGCTGCAACCAGA
GGTGAAAATTGCAGTGGAGGTGGCTCCACCATGAATATTTTCAAAAAACT
TTTTAATGGAATAACTGCATTGAAAAGTGGAATTCGTAATCGAAAAAATG
ATGGACCTATGCTTAGTGGGATCTCTGGATTTGACTCAGATAGTGATGAT
GATTGTGAAAATGAGTTTGTTTACACAGATCGTAGGGAGGAAATGATGCT
TTTGGATGCCAAATTTGGATCGAATGAAACTCACTTGCCTATTATTCAAC
AACATTTACAGCCACGAAATAATCAATTAGACTATCTTGGCCATGGTGGT
TTTAGTATTGTTAAAAAATGCTGGTCAGAGAAACACGAAACCGATGTAGC
TATCAAGATTATTTTAATGGACAAGGAAAATAATAACTTATATTTGCAGA
AATATTTACCGCGGGAACTTGAAATTTGGGGTGAGATATCAAAGTTTCAG
AACCAAAATATATTGAGAATGATAGAAAATTTTACTGGGACTGGATTCAC
GTATGTTGTTATGGACGTAGTAGATAATGGTGATCTATCAACTCTAATGA
AATTTGGAGCCTTGACTGAACATAAATCTAGATCTATATTTCGAGGACTT
TTTGAAGCTGTTCATTTTCTGCATAAATTGGGAATCGCTCACCGTGATAT
AAAACCTGAAAATTTACTTCTGACCAAAAGAAATGAAGTTAAATTAGCAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000120_pilon | genome | sc0000120_pilon:320280..326972 - |
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