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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000123_pilon:888089..893220- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.14662.9.p1 ID=MSTRG.14662.9.p1|Name=MSTRG.14662.9.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5132bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000123_pilon:888089..893220- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CGTTGGTTAAGTGCTATTTTCCATAATATTGTTATTGATGGTATCTTTCG
TTTTATTGAATTTGGCTATACAGTAAGATACTGTTTTATTATTCTATGAA
TTATCTTTAAGTGTTTAGTCGTTCTTTTGAAATACTTTTTTATAAGAACA
TCCAAAATTATTGAAGCCTCTGGATGTTCTTAGCTTTTTGGGTTTTAAGC
CTAAAAATGTTCTTACAATGTTCTTATTTTCTCTATTTTGTGATCTTTTT
TACCTATTTTCCTAAAAAATCGGGTCTTTTTGAGTCCGCAAAGCATTAAA
ATGTTCTTAACTTGTTCTTAGCATTTTGACTATCGAAGCCTTATGTTCTT
ATATGGTTTGTAGGAAAACGCGTAGGACACAATTAATTGAAGATTACCAT
ATCATTGGGGTCTGTTTTAAGTTATCTGTGATAGTTTAGTTTCAAATTAA
AGACCACAGAACTATAGTTTTGACTAGAAAGCTCATTCTTACTTTGTTTG
AATTTTATTTTTTAGAAAATATAACTCGACAAGGATGATTAGCTATGAAA
GTATTGTAAGTGGTATTTTTTCTTCCCAAATTAGAAAAACTTACAACATA
TTTAATATCTTTCACTGATTGTTCTGGAAAAAACAGATTTGTGTAAACGA
GTGGACTTCGTAAAGAAAAAGTTATAATGCCTCTTTAAACATTTCTCTGC
AGCTTTACACATTACTATTCTGATAAAACTACAGGTTTTTTCCTTATAAG
AACAAATTTTTGAAGCCTAAAAAATACTTCACCAATTTATGAGTATTTTT
GTCCAGTTTGCTAAGAAAACAGGTAAAGCCTTAAAATATTCGTAACTTGT
TCTTAATATTTTTGGCCATCAAGGCCTTATGTTCTTATATATTGTGTTCT
TACAAAAAATGTATATTTTTAAACAATTTTTATCAATCATTAAATTCCGC
ACAAACGGCTGCATGGCCCAAAAGGAAGTCGTATCTTATCTTATCTTATT
ATATGTTCTTATAATGTTTTGTTCTCATCAATTTTGTTCTTATTTAAATC
GTGTATATCTACAAACAGGAGGATTCGCAAGAGAGTGAACGAAAGAGTTT
CGAATCTTCGTCAAAGTATGGCAGCATACCTCCTCACGAACACAAATTGT
CTGTTGCATCATTAAGCCATAGTTTGAACAGTAATCAGAAAGTTCCTGCA
AGGCTTGGCTCACTTGATACTTTCAGAGGGTACAAAATTATTGTTTTGTT
CAAGTTCTTTTTCCAATTTTGAAGAAAAACACTGGAGGCAGTAAGGCCTT
TTAATCTCAATAGATTTATAGCCCAAAGGGCTAGGTGTCGTGCTTCAGCT
GAAGTGTGTCGTGGTTAGGTAGGAAATCTTACCTAGGTCACGTGACTTTA
CAGTAGAATTTCAGCGCTTGACCAATCAGATGCTTCGAGGATTTTCAAAA
ACAATACAAACAATATTTTTTCAGATATTCAATTTTTCTTTGCCTGCGAT
GGCTTAAATCACGACATCTAGCCCTTCGGGCTTTAAAAATCTGTGTTAAT
CGTCCAGGTGACGCAAGCTCTAAAATCTCTTAAAAGATTCTGCAAATCTA
TTTCTTAGAATTTATTTGCCATTACGTTTTTTCACGAGTTACGTGTTAAG
CATTAAATGCATTATGCTTCATGTATTATACGTTTCCCATTTTGTTTTAA
TGCGTTTTCTAGGCTTCCACACTTGAATTACTATTTCTAAAATGTGTCGC
TTCGATCCAAAACTTTTAGAGCATGATTTATTTTATAATGAAAATATTTT
CACTAACAGAAGTTTACTAAGTTGACTTACTATTAACATTATATAATAAT
TGTGTACCCTTTGAAAGTATCAAGACTTGAAGTCAAGTTAAAGCTATGGA
AATCTCCCGTGACTCAAATCCTAGCGCTTGCTTACAACGCTTACTTAGCA
TTATATGACTCTTATGAACGTTAGCTGGACGTTATATAGGACTTGAATCA
CCTTAAGGGAACTTATTTTGGCGGGAACTAGTTTTGACGAGCGGCAAAAA
TCCTGAAAATTTTTAATTTTGGTGAGAACTTATTTTGGCGATTGATGATT
TTTTTTTAATTTTGGCGAATGACAGCGTCAATCTATTCTATTTTGCCTTA
TTTGAAGCTTTTTTTGTGAGCTCAAGAAGTTATTTAGGCAAAATACCAAA
AAATCTAATTTTGGCCAGAACTTATTTTGGCGAGTGAGAAAAATATTTAA
TGTTGTCTAAATTAGCCGAATTAGCCAAAATTATTTTCCGCCAAAATAAG
TTTTAATCTTATAACCTTCCCGATTTTGACATTATGAATTTTTTCCATCT
AAGCCAACTGACGATTTGACAGAACATTCTTTTACAAGAAGTAACAGCTC
GCATAAAAGTTATGGTAGCGTTCATAGCAACAAGCAGTCTATCAGTGTTG
GAAATAATAGCGGAAAATATCAGAACTCTGGAAAATATATGGGAGCAGTA
ACCTTAGACAATGAACAAGAAGGGAAATCTACTAAACGATTGAGATCGTT
GGATACTTTCAGAGGGTACGAACTATTAATTTTAGTAACGTGGTCATGGT
CATCGAGAACACTAAAAATTTTAAAGAAAGCTTTTATGACAAATTAATTA
TACCCGGTTGGGGACTAGGGTTGGAGAATGTCGGGTATGTGTCGACTAGA
CCTCCGAAAATCAACCCTTAGAAAGAATTAAGGATTTAAAGCGGGAAGAC
TCTGCGGAAAAATTATCTTTAGCGAGACATTTTTTGAATAAATTTCCTAA
CCTTAGAGAGGTTTTGTTTGTCTTTTCATGATTTTTTTTACCTTAGTGAG
CCCAAAGGGGATGAATATCCCACCTTTAGAAAAACTAGGTAAGAATGGTG
GGCTATATCCGGACGGAGGGAGGCTATCTAAACAAGTGAAGGTTAGGTGC
CTCTTAGGTGCCAAATAAACGCCCCCCCCCTCCCCGCTTGTTAATTTTCG
AAAATTTTCCAACACCCCCCCCCCTCGGACCTTATTAGGACCCCCCGTTT
AATAATTTTTAAAAATATTTTCAGCTGTCAAAGAGAAAGACCCTTATTTT
GCTTTAAATAGCCTGATTTTAGCCTATATTTACCTTAATTTTAGGTTTTC
AGAAGTACAACTTCCACCCACCCCCCCCGGCAATTAGGTTCCCCCCGTTT
ATTAAAATCTCGAAAATTTTCCAACCCCCCCCGTTTATTCGAACCCCCCC
CCGTTTATTTGGCACCTAAGAGTACGTGTATATTCCGCCCTTCAGGGTGC
GTTTTTTGAACTGACCTTCTCTGTAACGGTTGGATAGATCAGAAAATTAG
ATATCGGTCCCAATAAAAGTCGTAAAATTAACAATATTTTCCTTCTTTTT
AATCCCGCTAAGGGTTTAAAGGTGAAAAGTTAGGCGACACATACCCGTCA
ATTCGCAATCCTAGATCTTTGACCTTATTATTCTCTTTGAGCAAAGAAGT
CATCCGTCAGTAACCCTAAATCTAAATAACTACGTAAATTTTATAATAAT
TTGATAAAGTAAGAAAGTTGCATGAACAATTTTTTTTTCAGAATCAGCAT
ATTGGTCATGATATTTGTTAATTATGGTGGTGGAAAATATTGGTTCTTTA
ATCACTCTAAATGGAATGGTATGTCATTTATATTTAGATTTATATCTGGT
ATTTCACCTTGTAACATTTTTTTAACCCTTAGCCTTAGCGACTGGGCCGT
TTATTTTCTAAGTTTTCTCAAAAATTGGAAAAAATCTAACGGATGTTTTT
TTGTTTTTGTTAATATATTTTTCATTCAATTAACATTTTAGTTTAAAAGG
CACGAAAACATAAGACCTAGAGGGTTAAAATTACTGGCTCACATAAAAAT
GTATTTTTTTATTTCACTTTTCATTCAGGATTGACCGTTGCTGATTTAGT
TTTCCCTTGGTTCATCTTCATAATGGGTGCATCTATTTTCATTTCTTGCC
GGAGCATACGTAGAAAAACAATTCCAAAGATAACAATCACGAAGAAAATA
ATCGTTCGATCCATCAAATTGTTTGCACTTGGATTATTCATAAATAATGG
TATAAAGCTACGCTCTATGAAATGTAACTAAAAATACTAATCTTCAAATT
TTGATAAATATACAACCTTCTCACAGCCTCGGTGGGACTCTAAATAATGG
TATAAAGCTACGCTCTATGAAATGTAACTAAAAATACTAATCTTCAAATT
TTAAATAAATGTATGCTCCTTTCTCAAAGCCCCGATGGACCTCTGCCCAT
TGGAAGAATCGGTTGAAAAATCGTCTCCAGTGGAGACAGTTCACCTTTCC
CACTGAACCATTTGGGCTGTGAACAATATAGTTGAAATTCCAAGTCATAA
ATAACGTGGAACTATCTATAGCCATTGTGCGCTTCAATTCTTCTTTTTTG
ATTCTAAATGGATTGAAAAATTCCACTGGGTCTGTGAGAAGGGGGTTTGT
AAATTTACTTGCCCACCTGTACGTGAAACTCGAACGGTATGTTTTATCGA
GTTTCATATTATTGTTTTCTCTGAATTGAGGTTTATTTTTTATCAGGAGT
GAGCGAGGGTTGATTTTTGATAAGTAATTGGCGGAGGGCGTCTATTCGAA
TTTGGATTAATTCACGGGAGAATTCTATTCGCGACTTTCTCGTGAAACAC
TCAAAGACTCGCACTTTGATTTTCTTTTAACTTCAACCAGCCCGTACGTG
AAACTCGAACGGTATGTTTTATCGAGTTTCATATTATTGTTTTCTCTGAA
TTGAGGTTTATTTTTCATCAGGAGTGAGCGAGTGTTGTTTTTTTATAAGT
AATTGGCGGAGGGCGTCTATTCGAAGTTGGATTAATTTACGGGAGGATTC
TATTTGCGACTTTCTTGAACGTATGGCATTGCATAGGGTGTTGTTTTTAG
CTTACATCGATTTTTCCTGCATACGTTCATAAGACTCACTCTTTGATTTT
CTACTTTTTCTTTAATCAGGGAAAGATTATGAGCATTGGAGGATACCAGG
TGTTTTGCAACGTTTCGCTTTATCATACTTGGTAGTGGCCATCTTGAATG
TGTGGTGTTCGCCTGAAGAAGAGACTGTCAAC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000123_pilon:888089..893220- >MSTRG.14662.9.p1 ID=MSTRG.14662.9.p1|Name=MSTRG.14662.9.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3582bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000123_pilon:888089..893220- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GGAAAGATTATGAGCATTGGAGGATACCAGGTGTTTTGCAACGTTTCGCT
TTATCATACTTGGTAGTGGCCATCTTGAATGTGTGGTGTTCGCCTGAAGA
AGAGACTGTCAACGATTGACCGTTGCTGATTTAGTTTTCCCTTGGTTCAT
CTTCATAATGGGTGCATCTATTTTCATTTCTTGCCGGAGCATACGTAGAA
AAACAATTCCAAAGATAACAATCACGAAGAAAATAATCGTTCGATCCATC
AAATTGTTTGCACTTGGATTATTCATAAATAATGAATCAGCATATTGGTC
ATGATATTTGTTAATTATGGTGGTGGAAAATATTGGTTCTTTAATCACTC
TAAATGGAATGGAGGATTCGCAAGAGAGTGAACGAAAGAGTTTCGAATCT
TCGTCAAAGTATGGCAGCATACCTCCTCACGAACACAAATTGTCTGTTGC
ATCATTAAGCCATAGTTTGAACAGTAATCAGAAAGTTCCTGCAAGGCTTG
GCTCACTTGATACTTTCAGAGGAAAATATAACTCGACAAGGATGATTAGC
TATGAAAGTATTATGGTATCTTTCGTTTTATTGAATTTGGCTATACAGGA
AAGATTATGAGCATTGGAGGATACCAGGTGTTTTGCAACGTTTCGCTTTA
TCATACTTGGTAGTGGCCATCTTGAATGTGTGGTGTTCGCCTGAAGAAGA
GACTGTCAACGATTGACCGTTGCTGATTTAGTTTTCCCTTGGTTCATCTT
CATAATGGGTGCATCTATTTTCATTTCTTGCCGGAGCATACGTAGAAAAA
CAATTCCAAAGATAACAATCACGAAGAAAATAATCGTTCGATCCATCAAA
TTGTTTGCACTTGGATTATTCATAAATAATGAATCAGCATATTGGTCATG
ATATTTGTTAATTATGGTGGTGGAAAATATTGGTTCTTTAATCACTCTAA
ATGGAATGGAGGATTCGCAAGAGAGTGAACGAAAGAGTTTCGAATCTTCG
TCAAAGTATGGCAGCATACCTCCTCACGAACACAAATTGTCTGTTGCATC
ATTAAGCCATAGTTTGAACAGTAATCAGAAAGTTCCTGCAAGGCTTGGCT
CACTTGATACTTTCAGAGGAAAATATAACTCGACAAGGATGATTAGCTAT
GAAAGTATTATGGTATCTTTCGTTTTATTGAATTTGGCTATACAGGAAAG
ATTATGAGCATTGGAGGATACCAGGTGTTTTGCAACGTTTCGCTTTATCA
TACTTGGTAGTGGCCATCTTGAATGTGTGGTGTTCGCCTGAAGAAGAGAC
TGTCAACGATTGACCGTTGCTGATTTAGTTTTCCCTTGGTTCATCTTCAT
AATGGGTGCATCTATTTTCATTTCTTGCCGGAGCATACGTAGAAAAACAA
TTCCAAAGATAACAATCACGAAGAAAATAATCGTTCGATCCATCAAATTG
TTTGCACTTGGATTATTCATAAATAATGAATCAGCATATTGGTCATGATA
TTTGTTAATTATGGTGGTGGAAAATATTGGTTCTTTAATCACTCTAAATG
GAATGGAGGATTCGCAAGAGAGTGAACGAAAGAGTTTCGAATCTTCGTCA
AAGTATGGCAGCATACCTCCTCACGAACACAAATTGTCTGTTGCATCATT
AAGCCATAGTTTGAACAGTAATCAGAAAGTTCCTGCAAGGCTTGGCTCAC
TTGATACTTTCAGAGGAAAATATAACTCGACAAGGATGATTAGCTATGAA
AGTATTATGGTATCTTTCGTTTTATTGAATTTGGCTATACAGGAAAGATT
ATGAGCATTGGAGGATACCAGGTGTTTTGCAACGTTTCGCTTTATCATAC
TTGGTAGTGGCCATCTTGAATGTGTGGTGTTCGCCTGAAGAAGAGACTGT
CAACGATTGACCGTTGCTGATTTAGTTTTCCCTTGGTTCATCTTCATAAT
GGGTGCATCTATTTTCATTTCTTGCCGGAGCATACGTAGAAAAACAATTC
CAAAGATAACAATCACGAAGAAAATAATCGTTCGATCCATCAAATTGTTT
GCACTTGGATTATTCATAAATAATGAATCAGCATATTGGTCATGATATTT
GTTAATTATGGTGGTGGAAAATATTGGTTCTTTAATCACTCTAAATGGAA
TGGAGGATTCGCAAGAGAGTGAACGAAAGAGTTTCGAATCTTCGTCAAAG
TATGGCAGCATACCTCCTCACGAACACAAATTGTCTGTTGCATCATTAAG
CCATAGTTTGAACAGTAATCAGAAAGTTCCTGCAAGGCTTGGCTCACTTG
ATACTTTCAGAGGAAAATATAACTCGACAAGGATGATTAGCTATGAAAGT
ATTATGGTATCTTTCGTTTTATTGAATTTGGCTATACAGGAAAGATTATG
AGCATTGGAGGATACCAGGTGTTTTGCAACGTTTCGCTTTATCATACTTG
GTAGTGGCCATCTTGAATGTGTGGTGTTCGCCTGAAGAAGAGACTGTCAA
CGATTGACCGTTGCTGATTTAGTTTTCCCTTGGTTCATCTTCATAATGGG
TGCATCTATTTTCATTTCTTGCCGGAGCATACGTAGAAAAACAATTCCAA
AGATAACAATCACGAAGAAAATAATCGTTCGATCCATCAAATTGTTTGCA
CTTGGATTATTCATAAATAATGAATCAGCATATTGGTCATGATATTTGTT
AATTATGGTGGTGGAAAATATTGGTTCTTTAATCACTCTAAATGGAATGG
AGGATTCGCAAGAGAGTGAACGAAAGAGTTTCGAATCTTCGTCAAAGTAT
GGCAGCATACCTCCTCACGAACACAAATTGTCTGTTGCATCATTAAGCCA
TAGTTTGAACAGTAATCAGAAAGTTCCTGCAAGGCTTGGCTCACTTGATA
CTTTCAGAGGAAAATATAACTCGACAAGGATGATTAGCTATGAAAGTATT
ATGGTATCTTTCGTTTTATTGAATTTGGCTATACAGGAAAGATTATGAGC
ATTGGAGGATACCAGGTGTTTTGCAACGTTTCGCTTTATCATACTTGGTA
GTGGCCATCTTGAATGTGTGGTGTTCGCCTGAAGAAGAGACTGTCAACGA
TTGACCGTTGCTGATTTAGTTTTCCCTTGGTTCATCTTCATAATGGGTGC
ATCTATTTTCATTTCTTGCCGGAGCATACGTAGAAAAACAATTCCAAAGA
TAACAATCACGAAGAAAATAATCGTTCGATCCATCAAATTGTTTGCACTT
GGATTATTCATAAATAATGAATCAGCATATTGGTCATGATATTTGTTAAT
TATGGTGGTGGAAAATATTGGTTCTTTAATCACTCTAAATGGAATGGAGG
ATTCGCAAGAGAGTGAACGAAAGAGTTTCGAATCTTCGTCAAAGTATGGC
AGCATACCTCCTCACGAACACAAATTGTCTGTTGCATCATTAAGCCATAG
TTTGAACAGTAATCAGAAAGTTCCTGCAAGGCTTGGCTCACTTGATACTT
TCAGAGGAAAATATAACTCGACAAGGATGATTAGCTATGAAAGTATTATG
GTATCTTTCGTTTTATTGAATTTGGCTATACA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000123_pilon | genome | sc0000123_pilon:888089..893220 - |
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