|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at sc0000112_pilon:169838..181846+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.13790 ID=MSTRG.13790|Name=MSTRG.13790|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=gene|length=12009bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000112_pilon:169838..181846+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TAGAATTCGAATTTCTTCAACAAACGTTCCATTTCTCCCATGAGGCATGG
CTGGAAGAAACGAAGAATCCAATCCtttctctttttcaaactttgtcCAT
AAGCCAGATGAAACTAACACTGACGAAAGTGAGTATTCGAATTTCTGATT
GTCGTTTAGATTAAGTTTTGTATAAATATTATACTAgctattttttataa
taagaacAATTAAATTTTGAATGATGTTACAAGTTCCTAAAGAGATTGTG
TATGTTCTtatctttgatgattttcaagctcggttgttcttaatatttta
ctattttcactTAACCAAACAGGGGCTTGAAATCtgcattttcttctttt
tcgctGGTTTGAAACTCCTTACTACTCCAATATACCAGTCCTTTTGCCAG
TCAGGGATAACACacaggcaaaaatatttttttaataaagacaAACTCTC
TTCTTGCATGAATTTTTACAGccgatgtttgtttatctttgtcgaccagc
actatatgtagccgttataagcctttgtaggctaatcacaaatgaaaact
actgcaattgcagtataccgcaattgaggacAGTTTGCTAATCCAGAGTC
CAGACCTGCCAACTTGAGATGTTCATAGGGGGTAGGGGCGTACAGGGTTT
GCTATTTTCGAAATACggaataattttgctaaaatttctgagattccata
aaaaaatacttgcaattctgataccaattttttgggtatttttcctcgtt
ttgacaatataatttttcatcaaatttgatttttcacgtatgaattccga
aaaaggagGATAAAAGCTTTATATATAATATCGAAATTCCCaaacaaaaa
ttcatggatttccgatactgAAACTATTTCAGCATTCCGAAATACtgaag
gaattttgcctgatttccgaaattccttAGAAAAAAGGGttgatttccgc
aattccgaaatcgACAGGTacataatgcataaaacataatgcatattgca
taatgcataatagtattgtgtaatttagagaatcattttatattttctaa
aactctcctttgtagaggctaaaaccgcgaaaacctctttaaagagtttc
ttaagtaaacattgcaatcagagggatttccccagacatgatatttactt
ttcgaatccgaacaaaagagaaaacattcgaatcataacaacaaagggtt
ttccgtcagcataaataataaaaaaatgcaaCAGATTAGATTTATCAGAA
AGGTTTCCTCCTTCTTctttctaaaacaaaagtaaacacactaaacacat
aaacattgtcattcgaatgtaaaaagattcaaagtttattttctttgatc
tagcttttgcatgaagctctttaatttatattggcttattctaacaaaaa
gcattcacatggttaatgctttgtaagagggaaaaccTGTTGAACTTTAT
tagcaatttttcgaaaagatctctgagaaaacccagaataaagatcttgc
tataaaattaacGTTTTCGAgtaaagtaatatacggaggagatatttttg
tgtttttttctacactatactacgttctgtaaaatacaactataacgtag
tggtctaaagaaacggctattcttttttagaatcaaccttacaatctagt
ttttatatttataaaaactagattgtggacgtgtggaaaggaatgtcggc
gtgactgatccttttgtttcgataataacatcaaagcgggacctaatttt
cttctcgtttctttctttcctttttctttctcataacttcaagctttccc
tcaTACTCtcccaagcgtggttagctcaagtggTTAGAGCGTTTGTAATc
atgggtttccgagttcgatccctctgggtgttaaacttttcaattcttca
aatttcttattttaattctctttctattaAAATGAAGGTCTATCAAACAA
GTAAGtagcatatattacctccgctctctgtgtaaggtttagataagcta
tgatagcatcacttaataagaacttttttaagtttttttttcttcaatct
tttttttaccacaagcgattattcaaggctgagatatagaagaacAGGTA
TAGGCATTTGCGCCTGCGTTTGgtgactgacagtttcagtttcactactt
tcactttcactttcagccagcaAGTGAGCGAGCGTgataattgatttccg
ggtcaaaatgtttgacacttgatccaatcgtttgcttatctttcttgcgt
ggtcgtcatttgaatttcagtattcaatgcttataaaatacggttgttat
aaCAGGGTATCAAACTCCTCACTAAGAGTAGGGACCgcgaaagacggggg
taaaatggttggaatcgaccaaaatgttgtttttaggttttagacCACCT
ATAACCATGGGATAAGTTTTAGAAACATTCTTATCATTAAATAAATGTCC
TGTAAAAGTTTGGTggccataactttattttttatgaaaatatgagcaat
tttgtaaaattttgaatggcagACGACCTACCAACAGAAAATTGGATTTA
GACAGGTGAGCGCGTCCTCAAACCCCCatgatgttatacatttttggaac
tggaagagatcagcgctgtttgttttttttgtctcattgacccaatcaaa
tcctacaaaaaattattcagttttttgtGGGAAAAAGCCACTTTTGAGGG
CTTTAGCTGTCCTCCCCGGTATTAAGACaaagataatatgaaatttcaac
cttttttacatattgtttgttaataaaaattaacattttcaaccgCGCTC
TGCTGTCttttttggctcaaagtttATTGGTATTCGAGAAATTCTACAAA
ATTGTCGAGCGCGTGTTTGTTTACAATTCGAAAGTTCAAAGTCCACGGAG
AGTGACAATCTGCCAACTCTCCGACATACAGGATATTTTCGAttcattcg
tacggcaaacgaaaaatttgaaaaaaaaaattgataaaaaattaaaactt
tgtctTGAGAACCTTCGTGCCAAGTTTCAATGCTATAGCATTAATAGAAG
TAAagttattgtaaaaaatgtattttttgacataacccccggattttcac
ttttaaacctatttaaccatgatttttacaaaaatcctcgaaaatcgttc
cataaaaagggtcattttcaggagatagaaaatttcatatctcGAGAACG
GCTTGGccgattttgatgaatgacccctcattttttttcttttttcatgc
tctttccaatgagcatggtttcaatgcgctaaaaacaatttgaaaaaatc
attgcggTCCCTACTAagagggaacagatcatagattcgaattgaacgcg
taattactaatagcaattaacattacataatgcgtcgatatctcttcact
cCCATGAAATGTggttcaaaattaaagtgatgagcacgaaaacaaaatca
agaattgaaaagtttgacacccagagggatcgaactcggaaacccatgAT
TATGAGGCAAACGTTCTAAccacttgagctaaccacgcttgggaGAGTAT
GAGGGAAAGCTTGAacttatgagaaagaaaaaggaaagaaagaaacgaga
agaaaattagttcccgctttgatgttattatcgaaacaaaaggatcagtc
acgccgacattcctttccacacgtcagcaatctagtttttataaatataa
aaactagattgtaaggttgattctaaaaaagaatagccgtttctttagac
cactacgttctatgaaaatcaaaatggatcatggattttcttcatcatcc
aaaattcaaatttacagctttctacctttgattttctggtagaaaaacga
cccacggcatggcccgaacagtttgggcctgttcggaccatgctcgggcc
acaaaaaagtattattgaatcggcccgaacattttgttcggaccatgttc
aggccatgtatttacaattaATACGGATTTGCTTGGGCCATGTTCGAGCC
ATATATAACGGCAACTTTGATCCCTCGATTTCACTTCCCTATCCGCCAGA
TTTACCGTTTAGTGAAGTAGTTTTTAACATTAGAACGAATAAAGTGCGac
tgttaaatcttttttataaaaacataagctATACGAACAAAAGGCTTTGG
TAACCAAAGTGACAAAAAAGCAGGTTAAGGACGTTCCCGTAAAGTTCTAC
TCTAAAACCCTCAaacaatttgtgttttttgtaaatataataAGTCTTAT
CACGATATCGcgcaaattgttttctttaattgCGATTGtccgggccatgc
cgtgggtcgtgtagaaaatggtatatttgttttgttgaaagtattatctt
tcaaattctccttattatagcctctaaaattgacattttcaaatattatg
cattatgcaatatgcattatgtattatgcattttgtactcgtcgattccg
aaataccgtacgccctcCACTTCATCTTGCGTGagattttcagaaatcag
aaattgggaaattttttcaaaaaatcagaaatcacggaaaaagatttctg
aaaatcaagaaattggGGCAACTTTTTTCCTAAAAACAGAAATCTTTCAA
AGATTGCATGAGATGTTAACATTGTTATTGTGAGTGACAACCAATTTACA
TGAGGCAATGTGGAAATGCGTGAGTCTAAgggatatttttctcaaaaatc
aaaaatgcgTGACAAATcgtaaatctttcaaaaattgcatgaGGTGTTAA
CATTGTTCTTGTGAGTAACAACCAATTTACAGGAGGCAATGTGGAAATGT
GGAAATGTGTGAGTCCAATgagtgagagttggcacctctgcTTTAATCTG
CATGCCAGAGAAGAAAATGtgtgaatttccaaggcaattgaattaaaaac
ggCATAAAGGAGTGGAATCCCCAACGCATTCTGTGTTTATGAGTTTGCTA
AATGACGCGCccgacgcgccttgaaaatttgacgcgtcCTATGATTTCGa
tgcgccttgaaaatttgacgcgccttagGGTTTTGATGTGCCTTAAGTTT
TCGACGGTTTTGACGGACGGAATAATGGGACCAGTCTAATCATACATGGT
TGGTATATAAAAGAATGCCGGTGTTAGCAAAATGATCATTTCTTAAGAGA
TTAAAGTCGACCCGTTCCATTTATCGGCTGTACACTTTATGTACGCTTTA
TTAGTCTTATTTCATAGAATTTGTGCATGCtacacaggggggggggcaag
cagttagtacagaaCACtatgtgtactaactgattCTTGGCAAAATCTTT
AACCCACCACCACCCCCTGTCACTTAGTACACCGTGTACTAACTGTTTTT
GACCTTGCTCAATAtatataccacccccaaaaataagAATACGTCTCTCT
ACGGTGCATTCCAGGTGAATTTCACACTCCAGAGAGGTTTTATGAGGTGt
gtttttacctgtttttacCACTAACTACtttcaaacaaatgaaaataata
acaaattatGGAGGTCAATGATGAGAGTGACTACGAATTTACAAGGACTA
GCTGGGACTAGGAAATTTTAGAGTatcttttttatcctttttcatggttc
cgactggggttctagccccccccccccgccaaatttaggtccccctgAAA
GCAAAGTCCCCCCAACATGATAAAAGTCCTAGGTCCCAGAATAGaatttg
atgaataatttttttttctaagtgaATATTTACCAGTTTGTCAATGAAAA
CTGATGAAAACActagtaaataaaaaattagtaGTAACACTAGGAGAAAT
AATACTTAGCAAAATTATACGACTTATGGACCCTTGCTGACCCTTGAGTT
CTTAATTGCCCTCTGAAATAGTGCCAAGAGGCTTAACTTTTTCCAGGAAG
CTTTTGCAAAGGACTAAGTTATGTGTAATACAATTTCAAGTACAAGCTGT
TAAAAGGTATTCCTGACTGTCCTAGAAATAAGATCCATAAAAAAgataga
atcataaaaaagatagAATCGTAAACCTGTCATAAACTGataacagtaaa
aatctgagaaaTCTAGTTTAAAATTCTCAGTTATTACACCTTTTTACTTC
CAAAATTCTGTATATACCACCCCTTATGGCAGTTAGTACAAAGGTGTACT
AACTGTATTTGCAAATTTGCAAATATAAACCACCCCTTTTGGCAGTTAGT
ACACAGGTGTACTAATTGCATTtcgcaaatttgaaaaatggacccaccac
ggtactaagtgTCATAGGTGtcgtgtactaactgcttgcccccccccTGT
GCTACACgttatttctattcaatttacaggGGAAAATGCAGAAATTTGTC
CCTTCACAGAAAACCCAACTTTTTGTAATCATCTTTGActtgggaatttt
tgaaaagttttccatTGTCGCTGTCTTTGTTAAATGTACATCTCAATTTG
GAAAAGAGtgatttaaaataataatttgattactgcagtgacatagaaaa
aaatcatgtactgaaaacacGAATTATGGCTTGGTAATAAAATACTCGGG
AAAAAGTTTTGTATCCTCAATCGCTCATAGAACGACACTGGGATAAGAAC
AACATTCTTTATGAGACATGGAGAAAACTCTGATCTTCAAATTACTGATC
TCCATTACTAAGTAACTGAACTTAGGTAgtgtcaaattatcagggcacgt
caaattatcagggcgcgtcgattttttagggcgcgtcaaattatcagggc
gcgtcgatattttaaggcgcgtcaaattaccAGGGCGCATTTTTAGGGCG
CATTTTTAGGGCGCGTAGGCGCTTGGGCGCGTAACATTTTAGGGCGCATA
ACATTTTAGGGCGCATAGGCGCGAAGGCGCGTTAAAAATTTGAGGGCGCG
TTAAAAATatgagggcgcgtgggcgcgtaaggcacgtcatttagcagact
cctgTGTATatacatggattttcatcggaatttccaaccaccactgaaaa
aaaacaatatttgtgatatcataatatttttgaggctggaaaaattttta
aaatgtacgTCATCCGACAGGGGTAACGCAAGTTTTCTGGAATCGTCTat
taaaacaatgacacatttTACGTTGTATTCAATTTAACTTGAGTCCTGTC
AGTTtagacttaaactcctatatatttcaggattagaaactagactagtc
ttacctcttttatcttttccttttcaACAATatatacaatgctgacaagt
tgacacaacacgttgacaagtaatccctacgagatgtttatatcaaaata
ggggggggggtccaaaattacactttttgagtttgaccatcttttttaaa
taaatttttcatgctgattccgaatttgaaatCCGTTTTTCCATATCTTT
TACCCCTGAGCGGCTACCGGAGACCCTTTTTTCGGAAAACCGCCCAAAAC
Cgctaaaagtcaatttttttgaaattttccattttgaatagctttctagt
gatgtgatattttttttaaatcagtttttcatgctgattccgaatcTTAA
ATTCATTTTGTCATAGCTCTCACCCTCGGCCTGGTATAGGAGGctgtttt
ttttactaaaatcttcgaatcaaaggaaaattgataatttgaaaatgttt
gaatttgaatgaacttcgaatgaaaaatttaatgataacAACTTGTTTTA
GATCagattttcatgctgattccgaatttcAAATCAGtttttttGCATAT
CTCATACCCATGGCCTGCTACGGGGCCGGCTACATGAGGTTCCTTATTCa
gaaaatatcgcaaaaatgtactgaaatgaaaattttcttaaggAGATTCT
TGTACTAGGATTCCATTTATCAAAACATCTGGTTATACATTCCTTGTTAC
AAAGAGTTTTGAGTACTTTATGCAATAATGCAACGATGCAACCCTATGAA
CTGAGCTGCTTTTAATTTATCTGCTTAGAATATAATCAAAGATGTAAAAA
tcaaattggtaaaaatatctTGAGCTAGTACACTTCTTCCAAATGCAATG
ATTGACCGCATTGGACATTCAAAAGTTGATATTGGCTTTACCAAGCCGCG
TATCATTGTTTGAAAGGTTAAGTTACAATGAAAGTCATAGGGATGTATAG
ACATTATACCGAATAGACAGAATCTAAAAATTCTACATTCGAATAGTTGT
TTATTGAACCAATCAAAAGGCGCTAtttttttATCCATCACTTAAAATAC
TTGCTTGAATAGATTTGAAGaactaaaacttttttaaaataaatcagaCC
TTAAGCTGTTGATTTAATTACAATATCATTGGTGTCCATTATTAAGGACT
TCCACAAATATGACTATCTGTTCAAACAAGGGTTCTTTGAAAAGttaatt
agaaaaaagttttgagaaattaaattatCTTGTGAACTTCTAAGTAGTAA
AACGTCCCTCCTTTCCAGGGAGACAACCATGTAAATGCTTTCATATTGGT
CCATTTATTTGGAAGTTACTTTTTAGGAATAGGTTATATTTCTTAAACAT
TGGTATCTTTCAATAGATTCACTATAAACCTGTTCTTATATGCCTTgttt
gaattaaaattatttgaaaaattccatATATTAGCTATCTGTATAGCCTA
GTGATTTTAATTGATTTAACTAATTTAAGTGATTTAACTTACCCCTTAAA
TGCCCTTAAATTATTAAGGCTTTAACAATTATCAACTTTTCAATGTTCAA
TTAATTTAGGGAATCATTGTATTTGAAAGGAGTTCACTAGCTCAAGATAG
TTTAAACGAGATTCTAAGCAGGATGAATTTTGCCTCATGACTAGTTGAGC
AGATAAATTAATAGCAGCAATACAAAGGGTTAGCTCATTGGATAAAGATA
AAGTACTCAAGACACCCTATGACGATGAATGTATAACATTAGCCAAGTGT
CAAAACGCCACAGACAAACTAAAAGCTTAGAAATATCCTTTCAATAATAT
CGATTTTtgcacattttttgcaatattttctgAATAAGGAACCTCATGTA
GCCGGCCCCATAGTAGGTCAGTGGCCGGAGATATGCAgaaactaattttg
aatttgaaatcagCATGAAAACTTGATCTAAAACAAGTAgttatcattaa
atttttcattcataGTTCATTCAAagtgaaacattttcaaattatcaatt
ttccttAGTTTCGaagattttagtaaaaaaaacagCCTCCTATACCAGGC
CGAGGGTGAGAGCTatgacaaaaagaatttccgattcggaatcagcatga
aaaactgatttaaaaaagatatcacATCACTAGAAAGCTATTCataatgg
aaaatttcaaaaaaattgactttcagcGGTTTTGGGcggttttccaaaaa
aagggtcTGCGGTAGCCGCCCAGGAGTAAGAGATATGGAAAAATGGattt
caaattcggaatcagcatgaaaaattaatttaaaaaagatggttaaacat
caaaatttccaaaaaaagtcatttttggaccccccctaatcaaaatctgc
aacaaaaacaaaagtggtctctttTACTGATTGCTTCCTCACACCTTTTG
GGGGActgtttattaaatttccatcAATGAGATTGCCACATTTCAAAAAA
CCCTTCTTTTTAGCACCtttggcctctcagtgcctttcACAatgggcggc
tgtaaaatcttACCGTTCAcaatatttgtttcaatccgttatCCTATAAG
GCTTAGGCTTTTTTGCATCTTCCATtttctgaagaaagcgggaatttgat
gcaagagttagattgtcaataAAGCTGAACAATGCCGTAAAAAGTTTAAT
GAAACAACTTGCAAAAAAGTGATACATGGGAAAGTTTCActtttaatttg
ttttattgaaatAGGGGATTTAGTCTTAACTCAAGGCTAAATGGAATCAA
GTTTTAAAAAAGCCTGGCATTGAAAATCTCAATTGTGATACTGTGAACAA
CTTTTTGCACCGTTAGCACCAATTAAAACATGTCAATTTATGCCTGAAAA
GAATTCTGCTTACATGTAGATTATGGctgtttttcattcaaagaaGATTA
AGGAAAACTGTAAGTTTTCTAATGTCAACATTGCTCATCtgattccgaca
cccttcttggGAGCTGGGAATAATCAGAAAACACAGGCACGCAAACAAAA
CTCCAGCTCAGTCAAAATAATCAGTTCAATTCAAGCTGTACCAGCCCCCA
AAGATATACAAAATCGCCAAGTGTCTCGGAAGCTTAGCCCCGTACAACCC
CCACCAGGGCCCCAGACCCTCCACTGTCCTTCTCACAACTTCAGCCTAAT
TGGCTACACTAGCAAAAAATGTGTCTTGTCTTTCAGCGTGAACACTACTA
GCCAAATCTGGCCAAATCCATACTGGCCAACTTTGCTatttgaaatcttc
aaattttttggtTTGGGATAATAAATTAGGCTGTTTGCCTGAGAACAAGa
catgtttttcttaaaaaaatatttttttgactaGGTCTTGTCGTTGTAAC
ACAAGAGGGAGACAGCTGTGACGAAAATCCATTtagattcaaaaactttc
aaaagaagACTGATAGTTTGGCATCAAACCACTCAAAGAATGGAAAAAGC
AAGAAATTGCAGGTATTTTGAAAAGCTTTGTTAATTTTCTGTTACTTTAT
TTATTCTTATGTATAACTTAATTAAAACTACCAAGAAAAATAGGCTTCCA
GAAATCCACCAGGTGAACTTTTGAGAGTCAGCTGGctgcaaaactttttt
tatatattgaaGGATAATCAAGGAAATAAGGAAATCTTAAAGTAAATATg
acaaattttccagttggtaactaattttattttgtaCTTAACTTACTAAG
CTCTTGTTAAGAACTCATGTTTGATTAGACAAACCAGCCTTCACAAGTAT
CAAACTGAACAAACTGGTCAAATATACATTATGGTTTGTAAAATACTAAT
CAGACAGtaccaaaatttttctcaacttcagttgagctataatctgagaa
tgtctgtatgtctgtctgtctgtatgtatgtctgtatgtccgtccgaaaa
ctttagggcaggctggacacttcaaaaaaggtcggatttggctgaaattt
ggcacacttgttccttgggtgaatatctggggtgtttttttcattttttg
aaaattttgatttttggggcctagggacgagtttttcgccaaaaacgagg
ctaaaactttggggcagcctggacacttcaaaaaaggtcggatttggctg
aaatttggcacacttgttccttgggtgaatatctggggtgttttttttca
ttttttgaaaattttgatttttggggcctggggacgagtttttcaccaaa
acgagctggcagcctggacacttcaaaaaaggtcggatttggctgaaatt
tggcacacatgttccttgggtgaatatctgggggtttttttcatttttga
aaattttgatttttgggcctgggggcgagtttcagccaaaacggacaaag
tatatttgctacctaatactaaatatttgaaagttacaattgggcctcta
ataacgggaaaatctgaagttgagcccagtgcggtgcgcccGTTCGACTA
TGCAAATCATATCCAATTATCCAGATCTACCATTGGTCAGAATTTTAAAT
TCTTAGTGCTTgtcaattttaagattttaagggGCTCCCCCCAAGATGTT
TCTAGCATAGGAAGATGCTTGAAGGGCTAAGACCCTACAATGTTTTGgac
aaaTttcCttttttttaaatagaagcGAAAAAATGCtttaaccatttttt
tttttttttcaagattgttGAAGATTTGGATAGTGTCACAGACATATTTG
CCGACCTACCATCCCCTTCCGTTGATGACAAAAGCCTGAAAATTAAAGTC
AAAGAGGAAGATGAAGATATTTTTGCAGAGGATGCAAATTTGGAAGGAAT
TACATTCAC
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000112_pilon | genome | sc0000112_pilon:169838..181846 + |
|
