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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000105_pilon:640278..653721+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.13348.1.p1 ID=MSTRG.13348.1.p1|Name=MSTRG.13348.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13444bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000105_pilon:640278..653721+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAATTGTTGTACAAACTTTgtgaaatatattttacactTTTAGTTTTaga
gagtgaagaattgatataaaaaagaagtgaagaagagatgtaaattgaga
aaatgaagagaatTTTGGTGGCAGAGCTGTTCCTGATACAACTCTTCGTT
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GGTAGGATGGAGTTGTTTCGTTAACATTTGATGGAACGGTAGGACCAACA
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TAAAACATCGATGAGCTCTTTGTCTGGATTGTCAAGGATGTTAAGAACTT
TCTTCAGGAACTCAAATGGAGGATGACAAAATTGACGACGGATTCGTTTA
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TTTCGTTTGTCCTTTTGGCGTTATTGCTTCCAAGCTACGTACGAATCATA
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ATAGTTTCCATCCACCTCTCGCATAGCTATTCTTAAATCTGAGTCCGATA
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TCTAATGTGTCAAAGATCTGATGAGGTATCTCACTACCATGGAAACCATG
GACTTCCTTTAGTCCAGTTACTGCTGATGTGGCCTCTTTCCAGGCCTTGG
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AAAATTTCACTTCAAATGGGACTTCTTACACCACCAGGGGGACAAGGTAT
GCTGCAGATGATTCTTCTGTTCTTTGAAATGAACGGATGTTCTGTaataa
ttgatgtttttttgtgAGAGGAAAATTAAGGAGAAGTCTGGTTAAtcaat
tttggtattttggaaagaaaaacgTTTCTGAAAATTCATGTATCTAAATT
TTTGTCATTGCTTTAAACAAAAAAGTCTTTGATATCTTCATGTCAGAAAG
TCTACAATTCTATTCTAGCCAACCAGCACAATCTAAAGGTTTCAGACCTG
AATAGTCAGGTGTTTAAAGGCTGAAAAGGTAGTGACTTGGACTTCTAACT
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CTTGGGTTTTGTTTGGAATGGAAGTCACTTTGGATGAGGATGAACTCTCA
TTGTGAAGCGCTAACATCACAACTATTGCCAAAAACTTTATTATTCAGAT
AAAATGGAGTTTCTTAGAACTCCTCTGTTTCAAACATTTGACTCCCCAAA
CCCTTGATAATCACAAAGCTTGACTTCTTGCGCCTTTTTTGCAAATAATT
GACTCAAatattccgggggggggggcacttgagTAAGATTGGGTACGAGA
ATGTTCCGCTGGTCAGAGTCCCTTTTTTAGgatctgaagatatctgacag
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gcccctcccccccccccgggggaaaTATTCTTATAACGTGTATCATTAAT
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TTTTTCAAGATGAGAATTGAAGGCGCTTTCCCTCGACAATGGATCATTGA
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GCTGCACGTGGCCCCTTTGACATGTTTTGAtagttacccccgtctttgtg
cTTTTGAATTTCAGAAACTTAATTAGCCTGATTAGTAAGTTTTAAATAAG
AGATCTTGAAGTTTCAATCTAAAATTTGAATGGCCAGGggttaatacaat
cattggatttctaaACGAAACAAGTTACCCCGAATTTCGGGTagctctcg
gacgggaattttacacacgattagcatcccctatatcaaaactaatcaga
agggatgcgtgcagcctattTCATTTCCTGGGTTGTCACTTTGGTCTATC
CAAAGTAGGAGCTACTCAAAATTgggctttcccagaaaaaaaaattattc
cccactgttgaggatattgatttttcgaagtatcgaacatcctggatatc
cactcttaaaaatatgctcaacccctggatatcgtattttttacttgaaa
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GGCCCCTGGATATCcccttttgaacaaaaatcgttaaccccctggatatc
cgatatcctcaacacgAACTATTACGACacaaaaatgatcattttgctGA
GGTCGCACTATAGTTATGTTCCTCCCATATATGTGAATGCGAAATTTTTT
AAGACTTTTGGTTGACAGTAGAAAACCACCAAAAGACAAAATCCTAAGTT
TCTATCGAATAATCATAGAAGAAATCTGACCTTGAACGTTCATTACAGGG
AAAAAGAAAGTAGTTAAATGCGGTGCTTGCAATAATACCAGAACTCATTG
TCCAACTTTCAGGATATCGTATTTACCAAAGTGGTGACGATGCTTTCTCA
TTGAAAGCCTGGCTCACCACCAAATATAACATGTTCGATTTCAAGACGCA
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GTATAGAACAAAGGTTGAAAGAAACAGGCCGGAGTTTGGATGATATGGAT
GCGATTAACGAACAAATTAGACCATGGATGAGATACGTCAGGGTAAGATG
ACGATTTCGTACCAACTTGCATCAGTTTACGATTTTACTGATCGATTTCG
ACTCGAGCTGagcttttcttaattttttgaaattttcaggcttatttGAT
CTTACGATGTTCCTAAAAAggggtttaaaatctgttaaagtATGTACTTT
CTTTGTAATTTCTGAAATTGGAGGCTTTAGGGTtagttcttaatttgttc
ttaagttttggccaattttcagcctcgtgttcttatataaaaaataagga
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TGTTTTCTTTCTCGAATGTTCAGACCAAACTTTTCTGTGAGTTCTCTTCT
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TTTTCTGTGAGTTCTTTTCAGGACGGTGATAGGACTTTTCTGTGAGTTCT
TTTCAGGACGGTGATAGGACTTTTCTGTGAGTTCTTTTCAGGACGGTGAT
AGGACTTTTCTGTGAGTTCTTTCAGGACGGTGATAGGACTTTTCTGTGAG
TTCTTTTCAGGACGGTGATAGGACTTTTCTGTGATTTCTTTTCAGGACGG
TGATAGGACTTTTCTGTGAGTTCTTTTCAGGACGGTGATAGGACTTTTCT
GTGAGTTCTTTTCAGGACGGTGATAGGACTTTTAGATATTTGTGTGTATT
GTAGATTCAACGTAGTTATTCTGTTGGGAAAAAGATCCTCTTGATAAAAA
TCAAACAGTAAAAAGTTACTCAGATtctagtttttttcttttgactgtGG
TGCTGTAAAAATATCACTTCTTGATGACTTTCTACAAAAGTTTCTTGATT
CCCTTTCCATTGCACTTTCTTTTAGGATTATAACCGTGATGAGGCTCgaa
agaatttcgaaaaatcatGGAATGCATTCGGTGCTAAACGAATCTTAtca
caaaaacaatttcaggaaGAATATCTGTGAGTTTTTAATTTTCGTAAGTT
TTACATTTACTGATAATATCTAGAAAGTTGCGATAAATTTTTCGCTTGAT
AGCTTTAGTATCGCACTTTATCAAACTTTACttccttcatttttatttta
agtcTTATCACACTTTTGATACAGCTTCCGtttttttGGTAAATTACTTT
CTATGTTAAAGTGCATCATAGCACTTGTAAGTAAGTAAGAATGTTAATTA
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GCTACCCTGATGTTCCTTTTAATGCTGCCGAGGCGAACACCTTGCCCAAC
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TGCTGAACTTCGTATAAACCCTGCGGACACGCAGTTTCTCGATTCCGACC
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CCATACACATtagtaaatatggaaatatgacttttctatatttccaaagt
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tcaccaatgttttacagaccctcttgataattaaaagtttttaatcgtga
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AACATCAAGCAAAACTTTTGGCTATTGTCTGCAGTATCGTTCATTACAAT
GCTCTATTACTTAACCATGGTCTGAGTATAATGTACTGTGTTTAAAATTG
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GCGTCTCTGAATGGCGCTTGCTAAGTCAATCTTTgaggttgaaatttcaa
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TCTGAGCGCAATACTTGCTCGGAAATAAACCCAGGATAGTGTGAATAGTA
CACTTGTTATGAATTGGAAGAGTTGAAAAAGCAGAAGATTAAATTCCAGT
TCTACTCAAgggtcccgctaagggtccaagggtAAAAGTCGGGTGACACA
GATCCGTCCGCTGACAACCCAAGTACCCTGCCGGGAAAGTCCCTGAAAGA
GTTGAAAAAGCAGAAGATTAAATTCCAGTTCTACTCAAGGGTCCAGCTAA
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AGTACCCTGCCGGGAAAAAATTTCCGTTTTTGATAAGTAAGGAGCTGGAT
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AATATTATATATTCTTAATTATATGgctgattacatttagcttagaaaTG
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TGATTGTGGGAATAATAGCCCcttgtttcattgaaaacatttcgaAATAG
CCCTTACTCCGTtcaggctattttgaaatgttttcaatgaacctcgggac
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GTTGTTTGAAGTCGAATTAATGGTATTGACTTTTCTCAGGACCCCTCGAT
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ATATGTGTCACAAAATCGAACAAATCTTTATACTTCCAGTATGTGATGAA
ACCGCTAGCGTAACAAACGCCATAAGCAGCCAGCGGCATCCAACACACCA
CAAAAATGATGAAAGATTTGATGCAGAAATTCAAGAATCTTTTCTCTGCT
TTATTGAAGGTTTTCTTCTTTGTTTCGTCTTGAGCCCCTGCTGTATCGTT
TTGTTGAGCATTTCTGAGAGTTCTTCGCTTCAACGTTCTCAAAATGACAG
CATAAGAAATGGTGATCAGAAAAGCGGTGATGAAAATAACCAGAGGTGTT
TTGATGTACTCTTTCTCATGGTCGTTGACTGCTATGTTATGTAGAATTAT
AGCCAGGACGGTTAACGCCCAAATTGCAACACAGATGATGCACTTTTTGC
TCCATTCCAGCATGTTATAATACATAGGTTTCTTGACAGCCAACACTCTT
TCCACCGTCAAAGCAGCCAATGTCAGGACGGAGACATACAGAGAAATGTA
AATCATTTTAAGCTGAAAGAAAAGTCTGTATTTGGGGTCAACTCCATTGT
TTTGTTCTGCCAGCTTCAAGATTTTGACCATTAAGATGAAGACACCAAGA
ATGATATCTGAAACAGCCAAATTCAAAATGTAGACGGTAGATTTGACTCG
ATCCATAATTTTATGTTTGAAGATGAACCAAATCTCGATGATGTTAAGGA
TGATCATGAGACAAGCGGTCAAAGGGCTTAACACCATGAATAAAAACGTC
TTGAAATccatcttttatcttttttggaTTGAGTGGTGGTTTTTGCATAT
ATTTGAACTGTAAGAATAaagatcaaaataaaatcttaaataCCCTGCAT
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TTCCAGCTGAGTTCCTAATCACATCATCATGCGCCAAAATAATTACGATG
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CCTAATCACACCCATGCAAACCTCTACATCATTATTTAGCAAATCCATTC
AAAAACGTTCTTATAAATTCCCCATTTCTCGACCCTCAAAAGGCTAAATT
AACAGCAAGATAGTCTCAATAAGGGTTATataattcatgaaaatttcgGC
TTTTTCCTTTATTTAAGCCGCTGTGAAGACCCTCCAAAGGCTCCACCGCC
AGAAGTCGGGTGgtacatacccgtcatctcgcaaacctagtacccccccc
atATTAAAATCTAAGGGAAAGTCTGAATTTCATGAAAATCGTTTACCGCA
AGATGaaattaatttgtaaatttcGTTTcccctgaaatatttttttcttc
tacaTTTGTGAAATCAAAGATCAAAGGTTTGACTCCCAGGTTTT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000105_pilon:640278..653721+ >MSTRG.13348.1.p1 ID=MSTRG.13348.1.p1|Name=MSTRG.13348.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=9360bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000105_pilon:640278..653721+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgaagagaatTTTGGTGGCAGAGCTGTTCCTGATACAACTCTTCGTTCT
TTCATCCGCAGGAGAAAAGACATGTTTCGAAGACGCTGCCAGTATCCTTG
GTGAATATGACAGTCTGTTAGCAGGACGAATCACCTTTAAGGATGTCTAT
CTAAACATGCCACGAATGAATGAGGAGAGGTTTTTTGAACTGATGGAAAA
TTTCACTTCAAATGGGACTTCTTACACCACCAGGGGGACAAGTGATTGGC
TATCGGAGATTTTCCAAGGTCTTGGAAATCAATATGAAGAATTGATGCAA
TTAAAGAAAAAGTTGAGCGCAGGCTATACCGCAATATCCAACTCCAAGGA
TGAActctttcaatattttgacaaatatgaAAgtGATGACAATAGTTACT
TTTTCAAGATGAGAATTGAAGGCGCTTTCCCTCGACAATGGATCATTGAG
AAATTATCATATCGAAGAGGATATCGTATTTACCAAAGTGGTGACGATGC
TTTCTCATTGAAAGCCTGGCTCACCACCAAATATAACATGTTCGATTTCA
AGACGCAGAGTTTTTGGCGTAACCGCTATTTGATGGTTTGGGAGGCGAAC
AAAAAACGTATAGAACAAAGGTTGAAAGAAACAGGCCGGAGTTTGGATGA
TATGGATGCGATTAACGAACAAATTAGACCATGGATGAGATACGTCAGGG
ATTATAACCGTGATGAGGCTCgaaagaatttcgaaaaatcatGGAATGCA
TTCGGTGCTAAACGAATCTTAtcacaaaaacaatttcaggaaGAATATCT
TGGTTTACTACACAACGTGACGTCACAAATGCAACCCTACTTTAAAGATA
ACACCCTTCTCTGGACTCAAGAAATATTCAATAGCTGGATTGGTTTGTTT
GGCACCCCCAATCATTATTGCTACCCTGATGTTCCTTTTAATGCTGCCGA
GGCGAACACCTTGCCCAACTTTCTACGCTTGAAAATCAAAGTAGTGTCTA
ATCCCGGTGAAACGTGGACGGCAGAAAATGCGCGGATCCTGGCCAAAAGT
GTCAAACACAGTACGAACGATATCGGATTATGTTCGAAGGGTGAAAACAT
CAAGCAAAACTTTTGGCTATTGTCTGCAGTATCGTTCATTACAATGCTCT
ATTACTTAACCATGGTCTGAatgaagagaatTTTGGTGGCAGAGCTGTTC
CTGATACAACTCTTCGTTCTTTCATCCGCAGGAGAAAAGACATGTTTCGA
AGACGCTGCCAGTATCCTTGGTGAATATGACAGTCTGTTAGCAGGACGAA
TCACCTTTAAGGATGTCTATCTAAACATGCCACGAATGAATGAGGAGAGG
TTTTTTGAACTGATGGAAAATTTCACTTCAAATGGGACTTCTTACACCAC
CAGGGGGACAAGTGATTGGCTATCGGAGATTTTCCAAGGTCTTGGAAATC
AATATGAAGAATTGATGCAATTAAAGAAAAAGTTGAGCGCAGGCTATACC
GCAATATCCAACTCCAAGGATGAActctttcaatattttgacaaatatga
AAgtGATGACAATAGTTACTTTTTCAAGATGAGAATTGAAGGCGCTTTCC
CTCGACAATGGATCATTGAGAAATTATCATATCGAAGAGGATATCGTATT
TACCAAAGTGGTGACGATGCTTTCTCATTGAAAGCCTGGCTCACCACCAA
ATATAACATGTTCGATTTCAAGACGCAGAGTTTTTGGCGTAACCGCTATT
TGATGGTTTGGGAGGCGAACAAAAAACGTATAGAACAAAGGTTGAAAGAA
ACAGGCCGGAGTTTGGATGATATGGATGCGATTAACGAACAAATTAGACC
ATGGATGAGATACGTCAGGGATTATAACCGTGATGAGGCTCgaaagaatt
tcgaaaaatcatGGAATGCATTCGGTGCTAAACGAATCTTAtcacaaaaa
caatttcaggaaGAATATCTTGGTTTACTACACAACGTGACGTCACAAAT
GCAACCCTACTTTAAAGATAACACCCTTCTCTGGACTCAAGAAATATTCA
ATAGCTGGATTGGTTTGTTTGGCACCCCCAATCATTATTGCTACCCTGAT
GTTCCTTTTAATGCTGCCGAGGCGAACACCTTGCCCAACTTTCTACGCTT
GAAAATCAAAGTAGTGTCTAATCCCGGTGAAACGTGGACGGCAGAAAATG
CGCGGATCCTGGCCAAAAGTGTCAAACACAGTACGAACGATATCGGATTA
TGTTCGAAGGGTGAAAACATCAAGCAAAACTTTTGGCTATTGTCTGCAGT
ATCGTTCATTACAATGCTCTATTACTTAACCATGGTCTGAatgaagagaa
tTTTGGTGGCAGAGCTGTTCCTGATACAACTCTTCGTTCTTTCATCCGCA
GGAGAAAAGACATGTTTCGAAGACGCTGCCAGTATCCTTGGTGAATATGA
CAGTCTGTTAGCAGGACGAATCACCTTTAAGGATGTCTATCTAAACATGC
CACGAATGAATGAGGAGAGGTTTTTTGAACTGATGGAAAATTTCACTTCA
AATGGGACTTCTTACACCACCAGGGGGACAAGTGATTGGCTATCGGAGAT
TTTCCAAGGTCTTGGAAATCAATATGAAGAATTGATGCAATTAAAGAAAA
AGTTGAGCGCAGGCTATACCGCAATATCCAACTCCAAGGATGAActcttt
caatattttgacaaatatgaAAgtGATGACAATAGTTACTTTTTCAAGAT
GAGAATTGAAGGCGCTTTCCCTCGACAATGGATCATTGAGAAATTATCAT
ATCGAAGAGGATATCGTATTTACCAAAGTGGTGACGATGCTTTCTCATTG
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ATTAACGAACAAATTAGACCATGGATGAGATACGTCAGGGATTATAACCG
TGATGAGGCTCgaaagaatttcgaaaaatcatGGAATGCATTCGGTGCTA
AACGAATCTTAtcacaaaaacaatttcaggaaGAATATCTTGGTTTACTA
CACAACGTGACGTCACAAATGCAACCCTACTTTAAAGATAACACCCTTCT
CTGGACTCAAGAAATATTCAATAGCTGGATTGGTTTGTTTGGCACCCCCA
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CATGGTCTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000105_pilon | genome | sc0000105_pilon:640278..653721 + |
|
