MSTRG.15269.2.p2 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.15269.2.p2
Unique NameMSTRG.15269.2.p2
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000133_pilon:742668..771839-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.15269.2.p2 ID=MSTRG.15269.2.p2|Name=MSTRG.15269.2.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=29172bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000133_pilon:742668..771839- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTTTATTTCTTTTCTTTGTAGAGAAGTGACACAGAGAAAAGTTACAAAAA TTAAAGAATCTCTCATTCCGGCTTGAGTCGTGAGTGAGTGAATTTACATA GCCGTTCAGTTTTGGTATATACCTACACAAAGATTTGTTTTATTTTTTTG GGCTTGTAAAGGACTTTGATGGTGTGAATATATAAAAGTAAAGGTCAAGC AAACATTATCGTATAATTTTGAAATGGTTTTTATATGTTGATGTGGAGTA CAATTTGAAAAATATTTCTTCGTTGAAAAGTTTCAATAAACGAGAAGAAT TTGTTGTGAATAAAATACAGACTTACTGAACTTACAGAATTAAAATGGCT CGACACTGGTGTGTTTTGGTCTGCTTTTTATTACTGATGAAAAATGTCAA CCCAATGATTTGGATGTAAGTATGAAATTTATCAACTTTACTTTAGCTTG TTGAAAAAAATCCCAAGGTAAAAACTAAAAATAAGGCTAAGCCACAGATA TCTGTAAAGCCCAAAGGGCTAGATAAGCAACTTTAAGCTTTCTCCAGCAA AAAAAAGTGAAGCAAAAATTTGACTTTTTAAATTTCGTGCCGATGGATAG GATCTAGCATTTTAATTGTTTTCGGAGCGCGAGATCAAAACAAGTAGGTG GCAAACGCTATTTCACATCTCTCAAACCGGTGAAATTGCATATTTTAGTC AGGTAGGAAATCCTTCCAAACCTAGGCTTCACTGTCTCTTTTTTCTCGTC AAATTTCGTAATTTGACCGCAAATTGACGGAAAAAAGAGCTAGAGTAAAC ATCAAACGAAAATAGTAGTGCCATCTCCTAAAGGAGTATCAAGTGCTTTC ACAAAAGGTGCACACGCGAAACAAGCGCGAAATCATCGGGAAAATGTTTC AGCTAAAAACACCGCCAGCTACGGTGTAATAAAAGGGTAAGTGGCGCTAA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000133_pilon:742668..771839-

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AGCAGCTGTAGTTTTCACTTTTCTTGGCTGGATCAAACTTTATCTGTCAC
AAAAAATTGGAAGTAAATCTGTTATGATGGATGAACGACAACAGTATTGG
GCATCATGATGTGTTTATTTTCCATTGGAATGATGGCCAAATCCATTTAC
AACTTGGTACAAAAGAAAATACCTTTCAATGTTGAAACTTTGTTAGACAT
AGCAACATCAGTAGTGGTGGTTTGGCATTTCCATACTGTTGATGAAGTCT
TTGCATCAAAAGCTAAAGAAAGAATTTGAAGGTTTACATGTCGATAGTGC
TGGTACACTAGGATTTGGCAGGGCTCTGGTTCACCGACCTTAACATACCA
CGAGTTTGTGAAATGGAGGAAAGCAGTAATACGAGTCAGTTATATCTCCA
TATTTATACAATTAGTGTTGGCTGTCACCTCAATAGATGAGTTCCGAAGC
TGATGATGTCCGTTTTCTAGCGGAACTCACCGAAGAAAAATACCGGTTAA
CACATGGTGCCAAAGTACAGAAAATTCCTGTGTCGCCATTAGCAATTGTT
TATCGGGAAGAAAAAATTGATCCTGGAGGACTTGGTGGAGATTTTTTCAT
AGGAAATGATAAAATTGTGCACTTTGGAAGAATTATTCTTGCATGAAAGG
AAAGAAGTTTTGACCATGTGTACATTTGCAGCAACCAGTATGGCAGTAGC
ATTGATGTTAAGTTTGACAGTTTACCATTTCACAAATTTATGGTTCCTGG
ATGGCATTGTTGCAATCATCATTGCTCTTGTCATGATGTTCTATGGAATT
AGGAATTCAAGTTACTGTTGATCACAAGTGTAGCAGCTGTAGTTTTCACT
TTTCTTGGCTGGATCAAACTTTATCTGTCACAAAAAATTGGAAGTAAATC
TGTTATGATGGATGAACGACAACAGTATTGGGCATCATGATGTGTTTATT
TTCCATTGGAATGATGGCCAAATCCATTTACAACTTGGTACAAAAGAAAA
TACCTTTCAATGTTGAAACTTTGTTAGACATAGCAACATCAGTAGTGGTG
GTTTGGCATTTCCATACTGTTGATGAAGTCTTTGCATCAAAAGCTAAAGA
AAGAATTTGAAGGTTTACATGTCGATAGTGCTGGTACACTAGGATTTGGC
AGGGCTCTGGTTCACCGACCTTAACATACCACGAGTTTGTGAAATGGAGG
AAAGCAGTAATACGAGTCAGTTATATCTCCATATTTATACAATTAGTGTT
GGCTGTCACCTCAATAGATGAGTTCCGAAGCTGATGATGTCCGTTTTCTA
GCGGAACTCACCGAAGAAAAATACCGGTTAACACATGGTGCCAAAGTACA
GAAAATTCCTGTGTCGCCATTAGCAATTGTTTATCGGGAAGAAAAAATTG
ATCCTGGAGGACTTGGTGGAGATTTTTTCATAGGAAATGATAAAATTG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15269MSTRG.15269Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15269.2.p2MSTRG.15269.2.p2-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15269.2.p2.exon13MSTRG.15269.2.p2.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15269.2.p2.exon12MSTRG.15269.2.p2.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15269.2.p2.exon11MSTRG.15269.2.p2.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15269.2.p2.exon10MSTRG.15269.2.p2.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15269.2.p2.exon9MSTRG.15269.2.p2.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15269.2.p2.exon8MSTRG.15269.2.p2.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15269.2.p2.exon7MSTRG.15269.2.p2.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15269.2.p2.exon6MSTRG.15269.2.p2.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15269.2.p2.exon5MSTRG.15269.2.p2.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15269.2.p2.exon4MSTRG.15269.2.p2.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15269.2.p2.exon3MSTRG.15269.2.p2.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15269.2.p2.exon2MSTRG.15269.2.p2.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15269.2.p2.exon1MSTRG.15269.2.p2.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000133_pilongenomesc0000133_pilon:742668..771839 -