MSTRG.13219.7.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.13219.7.p1
Unique NameMSTRG.13219.7.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000103_pilon:1112719..1136161-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.13219.7.p1 ID=MSTRG.13219.7.p1|Name=MSTRG.13219.7.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=23443bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000103_pilon:1112719..1136161- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GTATTTGCTCTATTGTCTTAAATCCACCAGTGTGTTGTGCAATCATTGTT TTAGTATTTGAGCCATCCTCGCTCAAAGATTCAGGAAACGAAAAATACCC GAAAGTTCCAATACACTTTAACCAGTAACTTTAGGGTAGGTAATTGGTAA TTGTCTTTCACGATTGAAGGTAGAGGGGTAATGAAAGGGTGACAAAATCA CGTGAAACTAGCAACCTTTTTAAACTGTGATCTGAAACATCGTGAATCTA TATAAAGGATATCCTTAGACAAAGTTTTTAATCTGTTAGGGGCTTTAGAT TAAATGTCAACTGAGCGCAAATTTAGTGCTATAGCTTCGTGCGTTTATGT AGCATTAAAGGGGTTGTCTGTGATCATGCTCGCGTGTTACGATTTCGTAA AGTTTTGGAAAGAATCAAAGCTATTCTTTTTGAATTAATTTGAGAGTCCA AGGCAAGGCGGCTGGAAATTGTTCGGATTGAAACTAACATTTCGTTTTAG CTTGGAAAAGTGAAACTTTAACTTTTGAGCATCATTTGGGGCCGTTCACA TAGTACATACGCACTAAAGGGGGAGGGGGGTCTTCTCAAAAGCGTATGCT TGCGTACAGGGGGAGGGGAGGGGTCAAAGGAAAATGTACTTACGCAGAGA AAAATTTTTCCTAGCCCTTTTTTGCTTGTTCTTTTTGTCGACTTCGACGC TTCTTATAGGCATCAAGGAAAAGAAAATGTTTCTTAATAAACATTGAGTT TCATGTAAGAAATAAAGGTCCGGACCAAACGATTTGAATTCGAAATTTTC TTCGGCTGAGGGGGGGGGAGTAAATGAAAAAGTACGTACTTGCCAGGAAG GGGTTTAGCTATTTGCGTACGCTTGCGTAACACCCCCTCCGGGTATTTTC AATTTTCAACTTTTTAGTGTGTACGTACTTTGTGGACGGCCCCTTTCCGT GGTGCATTTGTTTTCAGGTGCTAGATTTAAACTTGTTTCGTGTTAACTGA GATCCTTTGTTCTAGTACTCAAGAGTGACCGATTAACACCATTTTCGACC AATAGAAAAGCTTCATTTTACCTCATAAGTATATGTAAACATAACAGTGT CATAGTTTTAGCACTCAATCTATTATCTTCAGGTTGTTTGGAAAATATTT TGTACCAGGGTTAAAAAACGTTTTGTATATGTGGTCCGAGAACGGACCGA AAACGAAACCCTCAAAGAAACTAAATTTGATCTAGAACTAGATTTGTTGT TAAATAGGGTCCGGTGTAATTATGGCCGCAACTTTCTTAAATAAAAAGGA TGTGTATGGTTTATGTTTCGATATTTACAAAACTTTGGGTTTGGTTTGTA GTGTATAATGTTATAAAAACAAGGGATGTCTACAACGGTTGATAACGTAA GTTGACTGTTGAAAAATTGTTTTCATTTCATTTTAGGTACTGTTTTAACC GCAATACATTTCCAAATATTCTATGTTTTCGAAAATTGTGGGCTCTTGTA ACCCTTTTGAAACCTTTAAAATGCGAGAAATTTGACATTTTATTCCGAAA TCTTTACTTTGTGATAGATATATTTGGATATTTGGTCTATATTTGACTTC TTAAGTAGCGAATATTTGCACAGTCTACTTTTATACTGACCGTTCTACTG AAAATTCATGCTATTCATTTATAATAAGTATAATACAACTTTTGTCTACT TTAAATTTGCCACTGTTGGAAAAAAACCGGGGTATTTCCGTAGAAAACAT TACGTCATGAATATCACGAATGCAAAAAACCTGGAAAATCTACCCAGTAC TTTTCTAAAGTAAATACTTCTCTCAAGAAAGTTCTGCTTAGCTAAATGAA TGAATACTCAGGTTAAAGGGAAATCCTTTTGATCTTAGCTTGGTAATAAT ATGGGAACTTGATCATGCAGAGATGTTACTATAGTAAGCTTGTTATGTAA AATGCGATATTTTAATATACTGTGTAGATGACACCGATATCATGAATTAC ATAAAAAAGCCTAGAAAAAATCTTACCTGCGTGCTTTTTTTTATAGGATG AAATCAGTAACTTTTGGCACAGACTCGCCTGTTCTTTTGTTTTCGTGGCT TAAATATTATTATTCTTATGAGTTTTTGGCTCAGCATTTTTCTTAGCGAT TTCTAAAATCTGAGCCTGGAATTGTTCATGCTTTGGCTGAAATTGAGTCT TGAAAAATGGTTTTAAGGTATGTACAGTATTCATAGGGTTGGTCTTAATT GGATTTTTTTAGCGAGGTAATATAAATTGTATGTGAAATTTGAGAAAGTA GATCGAACCTGGTTTTACTAAAAGGAGAATTATTTTTAGAAATTGACTCA CAACGTCAAATCTATTGACGACGAATACTCTCTAAGGTTAATTGTAGGGT TACAGATCGCATGTCTAGAGCTTTATGGTTTTAAGTTTGACTCGTGTAAC TAACTATCTTATGGCCTGTCCAAAAGGACGTAAGTTTGGTGCAGAAAATT GGGGGCCTTAGACATGGTAAGCGTATTAGATTTTAGAAATGCCAGTTAAT GAAAGTAATTTTTTCTTTGAGAAATTAGTGAAAAAGTGCTTTATGACGTC ATAATTGGTGACATTAAAACTTAAAATTTGAATATCTCAAAAAAGTATTA CTTTAAAAGATCATGAAATTTTGCCCAATGAGGGTATCGGTAATATTCAA AATTTTGAAAAGAAAATTTCAATTTTTCTGATGTCATGTCATAAGTTACA CGGGGACTTAAATGTTTAGGGGGGTATAATTCCTTGACGGTCTGCTTTGG AATAACAGTTGTATTCAAGGGAACATTATTATTGTATTTCTGTATGTTTG CGAGTTTAGGAAGTGTTTTTGCGAGCGCAAATTTTTCAGTACTGATGCGG AAAACTGAACTTTTTAAGAATTGCTTTCAAAGCCACAGTGCACCAACTTC AAATGCAAATTTCTAGGCAAAGCAAAGTAGGTCATTCACATTAGTTTGTT GAAAAGCCATCTTCAAGATGTATCGTTTCAGCGTTCTACTTTTTTGAATT ATTGATTGGGCCATTCCATTTTATAGGATGGACGAACATTTCCAGAGGGT AATCTGAGAAAAATTTCCAGGGGGTGTTTTGTCATTTTCCTAGGGGGTAA AAAGGTATTCTAAAATTTCCAGGTGTTAAAAGACTGATTTTAATTCGTCC ACCCTCGCTTTAAGGTACGAAAATAATTTTTGCAAGGGTATTTTTGCAAA TTTTACCATTTTTCTAGGGGTTATCCACACATTTTCAATAATTTCTTTTT GACTTGAAAAGGTTCGTCCAACCCCCTGTATGGTTGATGGAACAGCCCAT TGGAGACCGAAACATTACTGAAGAAAATTAATGTACAATGTAGGAGTGAA ACTCTATCTCTAATTGTGCTTGAAACTTTTTAAACCTACTATTTTTCCTT TAGGCTGAATTTAAGGATACTATAATAAAGACACCTGCAGCCCTAAAAAG TAGAGCATTCGGCTACGGTTTCCAATATTTCAACCTTCAGCCGGATCTTA TCAATCAAAAAAATTTCTTGATACCTCCCACGTTAATGTGAAGCTATTTT GACCCTGTGTGATTAAGAGTTCGAAAAGAAACCCAGGGGAGATATAGTGA CGCCTTCCCTATCCGGGGCTGGAAAGACCATCGTTTAATAGCTTTTTGGC GTCCAGTTATCGGTAGTTCCTATTGAGTAATGATACAAACTAATTGTAAA AACGTCTTTTCGTTTATGGAGAGTGGAAGAAAAAGTGATATTTTTGGTAG TAAAGATCCCGCCTTTCTTGAATTTGGGATGATCTGGTAGTAAAACTCAC ACTTTATATTACTATATGGAAGGTGGAAACTCTTTAACTGGAGCCTCTTT GACTGGAAAGTCTCTTTAACTCGAACAAGTTTCATGGTCCCTTTAGTTAA CAATACCTTATGAACCTTACTTCTTAATTCAAAATTTCTTTAACATATAC AAATTTGTGTTCCCGTCCAGGTTCGAGTTATAGAGACTCCACTGTCTAAT AATACCTTAGGTCTCGACTGCGGTCGAGCAATGATGACGATGATGATGTC TAATAATCTTGTCTCTTAGTCTTAGTAATTGTTCAAAAACTTTCAAAATA TGGACCGATACTGGGCGCGACTGGTGTTTATCGTACCATGTTTGTTTCAC GCCATCGGATTTATCCTACTCCTAATCGTTCGTCGCGAAAGTAAAGACTA TTTTCATTACTGGCTTCTAACGTCGTTATCCTTATCTGAATGTCTTTTCT CATTGTCATTTCTGGTCCGTTATTTATTCGAATCACATTATGACGTATTG TATTATACTATTTTGATTTCCGATGCTGGAATCATCATTTTCATAGATTT GATTATGCAGTTGATCGTTATCAACCGGTTTTTGGAAATCTACGTTAATA TCCGTTACCCGACTTTTTGGAACGTACGCAAAACGAAAATCGCGATACTT ATCTGTTTCATCCTATCTCTAACGACTGCTGTCGTGTTACGTTTTGTGAA AGGGAAACGGTTAGAAGCTCTTTTCCCCGTCCTATCGCTATACTTGTATC CTATACTGAGTTTGGTATTCCTTGTGTCAGCTACAATCACTTACGGATAT ATCATGAAGAAGATCTACTGGGCGAGAAAATCACAAATCATTCAACTATC ATCTCCTCCACCTTCTACATCTAAAGAAGAGACCACTGGAATAGAGAATG AACATGATGCCGATAGACCCGTTAAAAGACCTTCGAAGAGTCGTCCGAAA AGTGGGCTACTTTTACCTACGCTACTAATTGTGACTTATTTGGTGTTCCG AGTGGCACCTGTTATATTTTTCTTTCACCACGCCGTGGAAGGCAAATTCC CGACTAATTTAGAACTTATGTTGACTCAAGGGCTAGTTTTTCTTAGCCTG ATGTCTGACGTGCTAATATACGTGTTGATTTTTCCACCAATCCGAAACTG GCTTTGGAAGAAAGTTTGTAACAAGACGTTTTGTTCTGCCTGATGAGAAC GAGGCTAGAAATGACGTCATCGAATACGATTTTCAATTTTTCACTCTAAC TAAATTAAACTAATGTTCGTGATATTGTCAGTTTTTAATTAGTAATTTGG ACAAAAAGATTTTTTATTATTGCTGCGAAAGCCAATCATAACCATTTAAA CGATCACGTGACTGTATTTTTGGGGGTCGTATCCTTGAAATAAAATACAA ATTTATTTAAACTTTCATGATTTATCACGTGCTTTTCCAGCTAACCAATC AAATCTCACTGTTCATCTCTACGAACCAATCAAATCTCACTGTTTGTCTC TACGAACCAATCAGATACACAGTCTGTTTTTTCCAACAATCAT

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000103_pilon:1112719..1136161-

>MSTRG.13219.7.p1 ID=MSTRG.13219.7.p1|Name=MSTRG.13219.7.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4914bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000103_pilon:1112719..1136161- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TGTTTGTCTCTACGAACCAATCAGATACACAGTCTGTTTTTTCCAACAAT
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GAGACAGCGTTATATGATGAACTGATGAAGGTTGATCCAGAACGAGCCAA
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ATAAGAATGAGGTGGATGACGAAGAATCCGATCAAAGAGGTATACAAAGG
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CCCATCACATGATTGATATCTTTGACTCCACCCAAGAGTTCACCGTCATT
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GAAAGTTCCTATCATCGTTGGAGGGACAAATTATTTCATTGAAGCATTAT
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GCTACAAGGACACCAAATTGGTTGTCATTCTGGGTAGTACGGCGGTTGGC
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TAGTGCAGATTCTATGCAGCTAACCAATCAAATCTCACTGTTCATCTCTA
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GTCTGTTTTTTCCAACAATCATTTACCACACAACCGGGGAAACGCATTCA
AGTTTAATGAAAAAACAACAAGATCAACCAGGCTCAAGCAAGTTGATTGA
TAACAGAGATGTTATAGCAGAGACAGCGTTATATGATGAACTGATGAAGG
TTGATCCAGAACGAGCCAATCAATTGCATCCAAACAATCTACGAAAAATA
TCCAGAAGTTTGCAGAGCTTCGAAATCGAAAAGCATTTTTATTTCCCGGT
TCAAAACGAAGACACGGTGATAAGAATGAGGTGGATGACGAAGAATCCGA
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GAGGAGAAACAATGCATACCCCATCACATGATTGATATCTTTGACTCCAC
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TATTTCATTGAAGCATTATTATGGGATTTCTTGATCGAAGGAGGGTTGGA
TGATGTGGATCCAAAGAAAGATGTTTGTACCTTTCTTCAAAAGAATGATG
TCATCAACAATGAACTCGTGCTACAAGGACACCAAATTGGTTGTCATTCT
GGGTAGTACGGCGGTTGGCAAAACAAAGTTAAGCATCGAATTGGCAAAAA
TGTTTGATGGGGAGATTATTAGTGCAGATTCTATGCAGCTAACCAATCAA
ATCTCACTGTTCATCTCTACGAACCAATCAAATCTCACTGTTTGTCTCTA
CGAACCAATCAGATACACAGTCTGTTTTTTCCAACAATCATTTACCACAC
AACCGGGGAAACGCATTCAAGTTTAATGAAAAAACAACAAGATCAACCAG
GCTCAAGCAAGTTGATTGATAACAGAGATGTTATAGCAGAGACAGCGTTA
TATGATGAACTGATGAAGGTTGATCCAGAACGAGCCAATCAATTGCATCC
AAACAATCTACGAAAAATATCCAGAAGTTTGCAGAGCTTCGAAATCGAAA
AGCATTTTTATTTCCCGGTTCAAAACGAAGACACGGTGATAAGAATGAGG
TGGATGACGAAGAATCCGATCAAAGAGGTATACAAAGGTCTTGATATTAT
CACAAACAAAGTGACACCAGAGGAGAAACAATGCATACCCCATCACATGA
TTGATATCTTTGACTCCACCCAAGAGTTCACCGTCATTGATTTCAAGCAA
CGAGCATTGAAAGTCATCACAGATCTGGTAAAGAGACAGAAAGTTCCTAT
CATCGTTGGAGGGACAAATTATTTCATTGAAGCATTATTATGGGATTTCT
TGATCGAAGGAGGGTTGGATGATGTGGATCCAAAGAAAGATGTTTGTACC
TTTCTTCAAAAGAATGATGTCATCAACAATGAACTCGTGCTACAAGGACA
CCAAATTGGTTGTCATTCTGGGTAGTACGGCGGTTGGCAAAACAAAGTTA
AGCATCGAATTGGCAAAAATGTTTGATGGGGAGATTATTAGTGCAGATTC
TATGCAGCTAACCAATCAAATCTCACTGTTCATCTCTACGAACCAATCAA
ATCTCACTGTTTGTCTCTACGAACCAATCAGATACACAGTCTGTTTTTTC
CAACAATCATTTACCACACAACCGGGGAAACGCATTCAAGTTTAATGAAA
AAACAACAAGATCAACCAGGCTCAAGCAAGTTGATTGATAACAGAGATGT
TATAGCAGAGACAGCGTTATATGATGAACTGATGAAGGTTGATCCAGAAC
GAGCCAATCAATTGCATCCAAACAATCTACGAAAAATATCCAGAAGTTTG
CAGAGCTTCGAAATCGAAAAGCATTTTTATTTCCCGGTTCAAAACGAAGA
CACGGTGATAAGAATGAGGTGGATGACGAAGAATCCGATCAAAGAGGTAT
ACAAAGGTCTTGATATTATCACAAACAAAGTGACACCAGAGGAGAAACAA
TGCATACCCCATCACATGATTGATATCTTTGACTCCACCCAAGAGTTCAC
CGTCATTGATTTCAAGCAACGAGCATTGAAAGTCATCACAGATCTGGTAA
AGAGACAGAAAGTTCCTATCATCGTTGGAGGGACAAATTATTTCATTGAA
GCATTATTATGGGATTTCTTGATCGAAGGAGGGTTGGATGATGTGGATCC
AAAGAAAGATGTTTGTACCTTTCTTCAAAAGAATGATGTCATCAACAATG
AACTCGTGCTACAAGGACACCAAATTGGTTGTCATTCTGGGTAGTACGGC
GGTTGGCAAAACAAAGTTAAGCATCGAATTGGCAAAAATGTTTGATGGGG
AGATTATTAGTGCAGATTCTATGCAGCTAACCAATCAAATCTCACTGTTC
ATCTCTACGAACCAATCAAATCTCACTGTTTGTCTCTACGAACCAATCAG
ATACACAGTCTGTTTTTTCCAACAATCATTTACCACACAACCGGGGAAAC
GCATTCAAGTTTAATGAAAAAACAACAAGATCAACCAGGCTCAAGCAAGT
TGATTGATAACAGAGATGTTATAGCAGAGACAGCGTTATATGATGAACTG
ATGAAGGTTGATCCAGAACGAGCCAATCAATTGCATCCAAACAATCTACG
AAAAATATCCAGAAGTTTGCAGAGCTTCGAAATCGAAAAGCATTTTTATT
TCCCGGTTCAAAACGAAGACACGGTGATAAGAATGAGGTGGATGACGAAG
AATCCGATCAAAGAGGTATACAAAGGTCTTGATATTATCACAAACAAAGT
GACACCAGAGGAGAAACAATGCATACCCCATCACATGATTGATATCTTTG
ACTCCACCCAAGAGTTCACCGTCATTGATTTCAAGCAACGAGCATTGAAA
GTCATCACAGATCTGGTAAAGAGACAGAAAGTTCCTATCATCGTTGGAGG
GACAAATTATTTCATTGAAGCATTATTATGGGATTTCTTGATCGAAGGAG
GGTTGGATGATGTGGATCCAAAGAAAGATGTTTGTACCTTTCTTCAAAAG
AATGATGTCATCAACAATGAACTCGTGCTACAAGGACACCAAATTGGTTG
TCATTCTGGGTAGTACGGCGGTTGGCAAAACAAAGTTAAGCATCGAATTG
GCAAAAATGTTTGATGGGGAGATTATTAGTGCAGATTCTATGCAGCTAAC
CAATCAAATCTCACTGTTCATCTCTACGAACCAATCAAATCTCACTGTTT
GTCTCTACGAACCAATCAGATACACAGTCTGTTTTTTCCAACAATCATTT
ACCACACAACCGGGGAAACGCATTCAAGTTTAATGAAAAAACAACAAGAT
CAACCAGGCTCAAGCAAGTTGATTGATAACAGAGATGTTATAGCAGAGAC
AGCGTTATATGATGAACTGATGAAGGTTGATCCAGAACGAGCCAATCAAT
TGCATCCAAACAATCTACGAAAAATATCCAGAAGTTTGCAGAGCTTCGAA
ATCGAAAAGCATTTTTATTTCCCGGTTCAAAACGAAGACACGGTGATAAG
AATGAGGTGGATGACGAAGAATCCGATCAAAGAGGTATACAAAGGTCTTG
ATATTATCACAAACAAAGTGACACCAGAGGAGAAACAATGCATACCCCAT
CACATGATTGATATCTTTGACTCCACCCAAGAGTTCACCGTCATTGATTT
CAAGCAACGAGCATTGAAAGTCATCACAGATCTGGTAAAGAGACAGAAAG
TTCCTATCATCGTTGGAGGGACAAATTATTTCATTGAAGCATTATTATGG
GATTTCTTGATCGAAGGAGGGTTGGATGATGTGGATCCAAAGAAAGATGT
TTGTACCTTTCTTCAAAAGAATGATGTCATCAACAATGAACTCGTGCTAC
AAGGACACCAAATTGGTTGTCATTCTGGGTAGTACGGCGGTTGGCAAAAC
AAAGTTAAGCATCGAATTGGCAAAAATGTTTGATGGGGAGATTATTAGTG
CAGATTCTATGCAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13219MSTRG.13219Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13219.7.p1MSTRG.13219.7.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13219.7.p1.exon8MSTRG.13219.7.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13219.7.p1.exon7MSTRG.13219.7.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13219.7.p1.exon6MSTRG.13219.7.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13219.7.p1.exon5MSTRG.13219.7.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13219.7.p1.exon4MSTRG.13219.7.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13219.7.p1.exon3MSTRG.13219.7.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13219.7.p1.exon2MSTRG.13219.7.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13219.7.p1.exon1MSTRG.13219.7.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000103_pilongenomesc0000103_pilon:1112719..1136161 -