MSTRG.1486.6.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.1486.6.p1
Unique NameMSTRG.1486.6.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000007_pilon:742112..749189+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.1486.6.p1 ID=MSTRG.1486.6.p1|Name=MSTRG.1486.6.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7078bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000007_pilon:742112..749189+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTCTAAACCTAAATTTGCCCAACATTGACTTTAGGGGCATCTTGAGCAAG
CTAAAGattatgtttgaaaaatgtCTTTAACAATCATTTTAGGATTAGTA
TAAGTAAGCTGGCTTGTTGTTCACTTGGAAATATGAAGAGATGCATTTTC
TTTATGGTGTTGGTATTCGTCATAATGCCAGGTTtgaataataatttatt
tagaAGATTGTTACttacatttatttttctctgtACACTCTACTagataa
tattttgcaaatatcaGCAGGAGTATACCTGCCTGtcacaaaatcatttt
ttgattatcttaattgaattgaattggtTGGGTTGaggttttcaaaatta
ataatcCCCTCGAGGTTTTCTGAGGTTCTTTTTATAGAGGGACAACTTTG
TGGCCAAATAACACAAAAGGCCTATAGCCTGATATTATTAAGACAGaaga
cccgtcctgtatttttataatctgatgagAATCTGATATATACAGAATTG
GTTTGAtctgtgaggcagatttctgccttGAAAATATTACAGtaggaaat
ttgaatttagtgCTGTCCTCACTTAATAAAACAACTTTCGGAACTTGGAT
ATTTTTTAAggaagtgtgaccagtgaaaaaATAACGAAACTTGATTGGCT
GTGCTTTGAACTTTcataggatctgggaaatttaGACTCATAGCCCAAAC
CATGCTTTTCATTTTGCCAtcagtttattaaaaaaaatcaaagaatggaC
CTGCAGGCTAGATTATCTTTGACCTATATTAGCTCCAACAGGATCATTAT
GTAAATAAACCAAAAGAATGATTCCAAACGTAAGTGGTAAACTTCATGGG
ATTAAAGCTATTTTATCAAATCTTCCATAGATTTGTCTGTGGCATCAGAT
AACGAAAAGAGGTTGTTTGACAACATCTTTGGTGATTATGATCCTGGTGT
GCGTCCAGTCATGGATGATAATGATACCATCAATGTGGACCTCACAATGA
ACCTCCATGCTATTGTGGATGTGGTAAGCTCAATGACGAGGAATTGCCTA
CACTTGAACCACTAACAGTATTCGTTCAATGAGTCCCTATATCTCGCCTA
CTTTCACATCTTTTGATATACAATCATgtacaaaaggtttgtagacttct
gcaattatttgcaaaatacttgaccaatatcgatcaaaaacaagttccta
agaggttctgggtgctttccaaacccatccaaagctgttcaaagtctatc
aaagtcacccactgcagtctacccactgcagtctaaccacaagggcttga
ttaactgacttacaccagtatcaaaacgctgattttttgcttgtggttcc
ctcaaaagcaattcaaaaccattgcaacgacttcaaaagtgtttttctta
acttccctccCCTTTCaaacacattgaagagtcattttgcactatttctc
ataatttttttactgaaatttcatttgtctacaaccttttgtccatgatt
gtaaaaCAATGTTCATTCTATGTTCAAAAAGTCGTTTCCATAAATAATTC
TGGATGAAAATTCTTCTAACATTTTAATGCTATGCTCTATGAAACAATCG
AATTTTAGAAGAATCATCGTATGGAAGAATTCACGAGCTTAACCTGGAAG
TCGATGAACAGTTGTGTTTATTCCCtttttttCAGCAAACGAAAAGTCAA
ACCTTAATCATGAGTGTCTTCATACAACAGGTAAAGAATTCTAAACAACA
TGGACTCTGTAGTGGACGACTTGACTTTTTCCCTGCTCTTCTCGAGTGAG
TTAGGGCAAGCTCCTAGATCTTTAGTAAAAAGGATATTTGGGCCAGTAAT
CTATTGCAGCCGGTGATCAgcaactttttagaaatatgtgttcttatctt
ctagcccagctggcacacaacgttgtttcaacgtttatctatcgttcaca
acgtccatgtaacgttagatgaacattgaaacaacgttgtgtgccagctg
ggagaaGACAACATGTTAAAAccttgatctgttctgatttctaTAGATTT
ATTATTGCTTTATGGTTGGATGTGTTCTGAATTCTAGGAAAGACTTTGTG
GCAAGATATACTTGTtggatatttgtttttttccttaaaatgtgttctga
agctttctagggttacctagacaacaagaacacattATACGACCTTGAGT
ATAACCCTATCTCGTCAGAACACTTCTAGCTGATGGATTCACGAAACCCC
AATCAgcacagatcaatatttctagctgaaacatactctcagaacacatc
ggaaaaaaggcTGCTTTCGAACCTACTGATTTCCTTGAGAATAATCCCGT
CAAAGTAGTTTGAATATTTTGTAAACATGGAGGAAGGTTTGACATCTTGT
TCCTGATTTACGATGAGTCAATGAGTCAACAAGTGTccatgatctaagat
tgaaaagaaagaCGGAAAGGTCTAGATTCCAATTGTACTAACCCACATTG
TAATAATCGAATTAGCACATTTTGCACATAACTGCCGCACTATGCAATAC
AAAAGGCTGACACACATTGTAACAACACCCGACGCACTTTATAAAATAGG
CCTAAAAAGGGTAAACTGAGTTTGGGGTTTATTACTAAGTGTGTTAGTAC
AAAGAACCGAGATAAAAACATTACAATTATAGAAATGGAAAGATGAGACA
TTAACATGGAAAAAGGAAGATTATGGTGGACACATCAAGAGCATAAATGT
CGATCCTTCGCGAGTGTGGAAACCTGATATTGTTTTGTACAGCAAGTAAG
TTTGAAAGGCTCCATGGGCTTACCAACATTGTTCCAGGATATTCGCAATT
TGGATaatgacatttaaaaaaatcttttcttattACTGATTTGTCGATAT
ATAGTTAAGACCGACTTTGCTTCAATCAGATAAGACATACAGctgctaaa
aataaaaatagaccaCCGATTTCGAATCTGATAATGATACTAGGTTAAGA
ATAGAAATTATATTAATttgctaaattaaaaaaaaaaatcttgctaaATT
CTCGTCAAATTTATAAATATCCTTGAATCGTCGAAATAAGAAAGACGCTA
AGTTGCACCAAAATTTTCGAGTGCTCAAGTCCTTTACAGACTATTAAAAT
AGTCgcttattcattcattcattctttcattcattGCCTCCTATGCTTTA
CTTATAACAGTGCTGACGAAGACAAAACATTCGGTGGAAATTTAGATCGT
TTAAACACAAGAGTTCGTTTATTTTACGATGGTAATATCACGTGGCTTGC
ACCGATCATTCTGCGATCACAATGCAGTATCGACGTCACTTATTTCCCCT
TCGATACGCAAAATTGTACTTTGAAATTTGGCAGTTGGACATATGAACGA
GCAAGATTGAACCTCAGAGATGGAGGGATCAAAATGGCGCAAAGTAAGCT
CATTTTAGAAGCCTTTGTGGAAGATTGTATACAAGATTTTAGCCATCACA
CTCATTTTCAGCTCAGTCAATCCCGATTTCTTCAGTTTTTAAGAACACAA
GATCAACACATTTCGAAACTATAAATTATGGACCGAATTTAAGCCTagga
aaaatattcttataatgtCCTTAATATGGTTATTCTATTGattatttggc
ttaaaatggGCTTAAAGTTAGCACTTCAGATATAGGGCTGggatcactga
cctttatatatccctggaccaagttactcaatgccggccaagcaaaatgt
tatgatcggagtttctttgaaattggtacccgcggagagagcgGTAGATC
TAATTTCGCTGGTAcactaatgatgtagcgccgtttgtcgttaggcaaag
tttcaaacactaccaTGGCTTCTTCTCGagtaccaactttcaaaaaactt
cgatcaataatggtggatatagcttagtccagggatgtataaaggtcagt
ggctgTGATCTTAAAAATTTATCCATTTATTTTGACCAGAAAATAGCTCC
TTCTTCTTCAAAAGAGGCGTGTAGAGCCACACGTAAAGGTGAAACATATA
TATGAACGAGCAATCTCTTTTTCTCCATTACAGTTAAGGAGTACGAGGCA
AATTCCGAATGGAAATTGATTTCCACTTACAACATGCGCCATGACATCGA
ATATCCATGCTGTAAGGATGAATTTTACCCTGACATTACCTTCCATATCG
TCATTGCAAGAAGATCTTTGTTTTATTTGTGCAATTTGATTTTCCCCATG
ACCGTCATTGGAATGTTGACCATGCTCTCCTTTCTGTTACCTGCAGAATC
GGGTAAGtgtaataaattgatttttttttaatttttaactttttaacttt
ttaacttCACTCATTGCATTGTTCTTTGTTATTACAGATTTTGTCTCCTT
ATGTAAATAAGTTCTGCGATTAAAATATACCTAGGTAGTGGAGGGCACAA
CTTCTGCATGggattttttaactttacttttatcactttcttttaAATAC
TGAACATTGAACGAAAACGCATCGACTCATTCATGACCGAGCTGAAGGAT
GGAACCCCATCCTTATCCAAATCAACCAAATGTTCTACCTTTTTAGTAAA
TgtagtttttattgaaaacgaGGCTATTGCcctattaaaaacattttaca
cCATGTATAAGTTTCAAAGCTAGCGTCTTAATGAATTTGACGTCTCTGCC
AGGACTTATCACTAATTTGTTAGGATGTACACGTTTATTCttcataagaa
catcaaaagtttttgaagcctttcgatttctaaactttttgagttttaag
cctaaaaacgttcttaacatgtccttactttcaccatttttgagtatttt
tatccattttcttaagaaatcggttGTTTTTgtgtccgcaaagccttaaa
gtgttcttatctTGCTTTTAATATCTTGGGCATTGAAGCCTTGTGTCTTA
AATagttttaactcgtgttttaactcgagatattaacccttaaaaacagt
gtttttcagccagaaacatctgttttgtccagtttttgcgcttttggaag
ctcgatatctcgagttaggtactgaaatcacctatacttgcaatgattct
taattttttgagagtttttaaaaaatatgcAGCAGGTCtctattttctca
agctaaaattctaatttttgaccctataatTTTTGCATGAGACTGTCCGA
AAAACACACCAAAGTgtcagaaaaaaattggcacccaagttttgagcctt
aaatgtttcttgcatgtttctaaaaattttgaaacaatcagcctattttt
catgcagagaaaacatttgttttgattggaaggttcttaaaaaaccgaat
taaaaatgttattttctcattctcagcatcagcatgtttcttagttttta
ggcattctgagcctcatgttttaTAAAAGTGTGTTTTTTCCGTAGGTGAA
CGAATTTCATTAGCTATCACGTTGCTATTGGCAATGACAGTTTTCATGTT
GGTCGTCGCAGATATCATTCCGGCCACCAGTGACGTCATTCCTTTGGTTG
GGATTTTCTTCAGTGCTTCGATGATTGAGATGGTGATCATGATCGTTGTG
TTGTGTTATATTATGCGATTGTATCATAAAGGTCCCAATGATCCTCCAAT
GCCTCTTTGGATGAAAAAGTAAGTcaatcaaaattaagtttttcccAAAC
AGGGAAAAATACCAGAAAAACATTAAACATCGAACATTGTAAATAAATAG
CATTGGAATGTTACGTAGTTAAAAGTGAATTTTGCTGCCGACGGCGTTTT
ACCGGTAACGTAATCATTCTTTTTTCCCACagaatatattttcttttgga
aaatacACCTCTGTCACAATTTGGGTGAAAGTAATAAAGCCTGTTAAATA
CGAAGCGCAAAGGCCAATAATCTGGACGGAAAAGCCTGTTTTAATAGGTG
GGTATTTACTTAGTGTCTTTACCATCGGGAAAATAATAAATTGTAGTTTT
CAaagttcttttttaattttaaagcaTACTTCTCACTGGAACCAATCTTT
ATATATACACAAATAGAATCTTGTCATTTTTCCTATCACGTAGGTATATT
TACGACAGTCTCTCATACAAACTCCATATTCGACGTCGCAAAGAAGAAGA
AGGCGTAGAGGATACAGGGAACAATGAAGCACATCCTTTCATCCCAAACA
AACAGCAAGAACGTCAAAACGAGGCCATCTTTAACAATGGAACTGTAACT
GTCATCAACCGTCTCAAACCGATGACACAAGCTGAAAAATGGAATAATCA
CATGACGTCATTATCCTTGTTAGCCGCCAATCGTCAACCAAACAATAGGC
TGAGTGGTGCACCAACAGCCGCCGGCCACTTCATGAACAACACCATTCTT
CAACATCCTGAACAACCAGCAAGTGAAGCGCAAATCGTGATCAACAAATT
GAACATTTTAGTCAACAAATTAAAAGACATGGATGCTGAAGATGACGTCA
CTGCCGAATGGCGTACCGTTGCCATGACTCTTGATCGCTTATTggttatt
ttcttcttcgttgTTTACTTGGTTACCATCCTGGCTTGCTTCTTAAGATC
ACCAGGTTATGTTTCATGAGAAGAATTTttgttaagaatttttaaatata
cattttatcaaaattggatCATGGTGGAAGCTAGGTCTACCGGATGTGGG
TGTGTATTTCGCCCAAATATTGAAATTCGGCTATAATCAAATCGAAAACT
GCAGATAAAAGCCAAAAATAAATAGAGCCTTGTCGGGCCATTTTTCCGAA
ATCTAGCCTTTTCAagtgtgaatttttttatatattttgcaaCCTTTAAG
AATATATCGATTTAAGTCATGAttgtaattttaaatttcagtttttatag
aaaaatgttttcatatttttttaatagacCTCTTTGGAAATAAGCCCTGC
ATCatcaaattatttgaaaaagcttttaatcgggaaatatttctaaattt
aaatGTAGCATATAGATCTTATCATAAGCTTCTCTAGGTTTTAACTTGTT
GATAAATAACCCGCAAAGTAAGTACGGG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000007_pilon:742112..749189+

>MSTRG.1486.6.p1 ID=MSTRG.1486.6.p1|Name=MSTRG.1486.6.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=12408bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000007_pilon:742112..749189+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAGAGATGCATTTTCTTTATGGTGTTGGTATTCGTCATAATGCCAGA
TTTGTCTGTGGCATCAGATAACGAAAAGAGGTTGTTTGACAACATCTTTG
GTGATTATGATCCTGGTGTGCGTCCAGTCATGGATGATAATGATACCATC
AATGTGGACCTCACAATGAACCTCCATGCTATTGTGGATGTGCAAACGAA
AAGTCAAACCTTAATCATGAGTGTCTTCATACAACAGAAATGGAAAGATG
AGACATTAACATGGAAAAAGGAAGATTATGGTGGACACATCAAGAGCATA
AATGTCGATCCTTCGCGAGTGTGGAAACCTGATATTGTTTTGTACAGCAA
TGCTGACGAAGACAAAACATTCGGTGGAAATTTAGATCGTTTAAACACAA
GAGTTCGTTTATTTTACGATGGTAATATCACGTGGCTTGCACCGATCATT
CTGCGATCACAATGCAGTATCGACGTCACTTATTTCCCCTTCGATACGCA
AAATTGTACTTTGAAATTTGGCAGTTGGACATATGAACGAGCAAGATTGA
ACCTCAGAGATGGAGGGATCAAAATGGCGCAAATTAAGGAGTACGAGGCA
AATTCCGAATGGAAATTGATTTCCACTTACAACATGCGCCATGACATCGA
ATATCCATGCTGTAAGGATGAATTTTACCCTGACATTACCTTCCATATCG
TCATTGCAAGAAGATCTTTGTTTTATTTGTGCAATTTGATTTTCCCCATG
ACCGTCATTGGAATGTTGACCATGCTCTCCTTTCTGTTACCTGCAGAATC
GGGTGAACGAATTTCATTAGCTATCACGTTGCTATTGGCAATGACAGTTT
TCATGTTGGTCGTCGCAGATATCATTCCGGCCACCAGTGACGTCATTCCT
TTGGTTGGGATTTTCTTCAGTGCTTCGATGATTGAGATGGTGATCATGAT
CGTTGTGTTGTGTTATATTATGCGATTGTATCATAAAGGTCCCAATGATC
CTCCAATGCCTCTTTGGATGAAAAAGTATATTTACGACAGTCTCTCATAC
AAACTCCATATTCGACGTCGCAAAGAAGAAGAAGGCGTAGAGGATACAGG
GAACAATGAAGCACATCCTTTCATCCCAAACAAACAGCAAGAACGTCAAA
ACGAGGCCATCTTTAACAATGGAACTGTAACTGTCATCAACCGTCTCAAA
CCGATGACACAAGCTGAAAAATGGAATAATCACATGACGTCATTATCCTT
GTTAGCCGCCAATCGTCAACCAAACAATAGGCTGAGTGGTGCACCAACAG
CCGCCGGCCACTTCATGAACAACACCATTCTTCAACATCCTGAACAACCA
GCAAGTGAAGCGCAAATCGTGATCAACAAATTGAACATTTTAGTCAACAA
ATTAAAAGACATGGATGCTGAAGATGACGTCACTGCCGAATGGCGTACCG
TTGCCATGACTCTTGATCGCTTATTggttattttcttcttcgttgTTTAC
TTGGTTACCATCCTGGCTTGCTTCTTAAGATCACCAGGTTATGTTTCATG
AATGAAGAGATGCATTTTCTTTATGGTGTTGGTATTCGTCATAATGCCAG
ATTTGTCTGTGGCATCAGATAACGAAAAGAGGTTGTTTGACAACATCTTT
GGTGATTATGATCCTGGTGTGCGTCCAGTCATGGATGATAATGATACCAT
CAATGTGGACCTCACAATGAACCTCCATGCTATTGTGGATGTGCAAACGA
AAAGTCAAACCTTAATCATGAGTGTCTTCATACAACAGAAATGGAAAGAT
GAGACATTAACATGGAAAAAGGAAGATTATGGTGGACACATCAAGAGCAT
AAATGTCGATCCTTCGCGAGTGTGGAAACCTGATATTGTTTTGTACAGCA
ATGCTGACGAAGACAAAACATTCGGTGGAAATTTAGATCGTTTAAACACA
AGAGTTCGTTTATTTTACGATGGTAATATCACGTGGCTTGCACCGATCAT
TCTGCGATCACAATGCAGTATCGACGTCACTTATTTCCCCTTCGATACGC
AAAATTGTACTTTGAAATTTGGCAGTTGGACATATGAACGAGCAAGATTG
AACCTCAGAGATGGAGGGATCAAAATGGCGCAAATTAAGGAGTACGAGGC
AAATTCCGAATGGAAATTGATTTCCACTTACAACATGCGCCATGACATCG
AATATCCATGCTGTAAGGATGAATTTTACCCTGACATTACCTTCCATATC
GTCATTGCAAGAAGATCTTTGTTTTATTTGTGCAATTTGATTTTCCCCAT
GACCGTCATTGGAATGTTGACCATGCTCTCCTTTCTGTTACCTGCAGAAT
CGGGTGAACGAATTTCATTAGCTATCACGTTGCTATTGGCAATGACAGTT
TTCATGTTGGTCGTCGCAGATATCATTCCGGCCACCAGTGACGTCATTCC
TTTGGTTGGGATTTTCTTCAGTGCTTCGATGATTGAGATGGTGATCATGA
TCGTTGTGTTGTGTTATATTATGCGATTGTATCATAAAGGTCCCAATGAT
CCTCCAATGCCTCTTTGGATGAAAAAGTATATTTACGACAGTCTCTCATA
CAAACTCCATATTCGACGTCGCAAAGAAGAAGAAGGCGTAGAGGATACAG
GGAACAATGAAGCACATCCTTTCATCCCAAACAAACAGCAAGAACGTCAA
AACGAGGCCATCTTTAACAATGGAACTGTAACTGTCATCAACCGTCTCAA
ACCGATGACACAAGCTGAAAAATGGAATAATCACATGACGTCATTATCCT
TGTTAGCCGCCAATCGTCAACCAAACAATAGGCTGAGTGGTGCACCAACA
GCCGCCGGCCACTTCATGAACAACACCATTCTTCAACATCCTGAACAACC
AGCAAGTGAAGCGCAAATCGTGATCAACAAATTGAACATTTTAGTCAACA
AATTAAAAGACATGGATGCTGAAGATGACGTCACTGCCGAATGGCGTACC
GTTGCCATGACTCTTGATCGCTTATTggttattttcttcttcgttgTTTA
CTTGGTTACCATCCTGGCTTGCTTCTTAAGATCACCAGGTTATGTTTCAT
GAATGAAGAGATGCATTTTCTTTATGGTGTTGGTATTCGTCATAATGCCA
GATTTGTCTGTGGCATCAGATAACGAAAAGAGGTTGTTTGACAACATCTT
TGGTGATTATGATCCTGGTGTGCGTCCAGTCATGGATGATAATGATACCA
TCAATGTGGACCTCACAATGAACCTCCATGCTATTGTGGATGTGCAAACG
AAAAGTCAAACCTTAATCATGAGTGTCTTCATACAACAGAAATGGAAAGA
TGAGACATTAACATGGAAAAAGGAAGATTATGGTGGACACATCAAGAGCA
TAAATGTCGATCCTTCGCGAGTGTGGAAACCTGATATTGTTTTGTACAGC
AATGCTGACGAAGACAAAACATTCGGTGGAAATTTAGATCGTTTAAACAC
AAGAGTTCGTTTATTTTACGATGGTAATATCACGTGGCTTGCACCGATCA
TTCTGCGATCACAATGCAGTATCGACGTCACTTATTTCCCCTTCGATACG
CAAAATTGTACTTTGAAATTTGGCAGTTGGACATATGAACGAGCAAGATT
GAACCTCAGAGATGGAGGGATCAAAATGGCGCAAATTAAGGAGTACGAGG
CAAATTCCGAATGGAAATTGATTTCCACTTACAACATGCGCCATGACATC
GAATATCCATGCTGTAAGGATGAATTTTACCCTGACATTACCTTCCATAT
CGTCATTGCAAGAAGATCTTTGTTTTATTTGTGCAATTTGATTTTCCCCA
TGACCGTCATTGGAATGTTGACCATGCTCTCCTTTCTGTTACCTGCAGAA
TCGGGTGAACGAATTTCATTAGCTATCACGTTGCTATTGGCAATGACAGT
TTTCATGTTGGTCGTCGCAGATATCATTCCGGCCACCAGTGACGTCATTC
CTTTGGTTGGGATTTTCTTCAGTGCTTCGATGATTGAGATGGTGATCATG
ATCGTTGTGTTGTGTTATATTATGCGATTGTATCATAAAGGTCCCAATGA
TCCTCCAATGCCTCTTTGGATGAAAAAGTATATTTACGACAGTCTCTCAT
ACAAACTCCATATTCGACGTCGCAAAGAAGAAGAAGGCGTAGAGGATACA
GGGAACAATGAAGCACATCCTTTCATCCCAAACAAACAGCAAGAACGTCA
AAACGAGGCCATCTTTAACAATGGAACTGTAACTGTCATCAACCGTCTCA
AACCGATGACACAAGCTGAAAAATGGAATAATCACATGACGTCATTATCC
TTGTTAGCCGCCAATCGTCAACCAAACAATAGGCTGAGTGGTGCACCAAC
AGCCGCCGGCCACTTCATGAACAACACCATTCTTCAACATCCTGAACAAC
CAGCAAGTGAAGCGCAAATCGTGATCAACAAATTGAACATTTTAGTCAAC
AAATTAAAAGACATGGATGCTGAAGATGACGTCACTGCCGAATGGCGTAC
CGTTGCCATGACTCTTGATCGCTTATTggttattttcttcttcgttgTTT
ACTTGGTTACCATCCTGGCTTGCTTCTTAAGATCACCAGGTTATGTTTCA
TGAATGAAGAGATGCATTTTCTTTATGGTGTTGGTATTCGTCATAATGCC
AGATTTGTCTGTGGCATCAGATAACGAAAAGAGGTTGTTTGACAACATCT
TTGGTGATTATGATCCTGGTGTGCGTCCAGTCATGGATGATAATGATACC
ATCAATGTGGACCTCACAATGAACCTCCATGCTATTGTGGATGTGCAAAC
GAAAAGTCAAACCTTAATCATGAGTGTCTTCATACAACAGAAATGGAAAG
ATGAGACATTAACATGGAAAAAGGAAGATTATGGTGGACACATCAAGAGC
ATAAATGTCGATCCTTCGCGAGTGTGGAAACCTGATATTGTTTTGTACAG
CAATGCTGACGAAGACAAAACATTCGGTGGAAATTTAGATCGTTTAAACA
CAAGAGTTCGTTTATTTTACGATGGTAATATCACGTGGCTTGCACCGATC
ATTCTGCGATCACAATGCAGTATCGACGTCACTTATTTCCCCTTCGATAC
GCAAAATTGTACTTTGAAATTTGGCAGTTGGACATATGAACGAGCAAGAT
TGAACCTCAGAGATGGAGGGATCAAAATGGCGCAAATTAAGGAGTACGAG
GCAAATTCCGAATGGAAATTGATTTCCACTTACAACATGCGCCATGACAT
CGAATATCCATGCTGTAAGGATGAATTTTACCCTGACATTACCTTCCATA
TCGTCATTGCAAGAAGATCTTTGTTTTATTTGTGCAATTTGATTTTCCCC
ATGACCGTCATTGGAATGTTGACCATGCTCTCCTTTCTGTTACCTGCAGA
ATCGGGTGAACGAATTTCATTAGCTATCACGTTGCTATTGGCAATGACAG
TTTTCATGTTGGTCGTCGCAGATATCATTCCGGCCACCAGTGACGTCATT
CCTTTGGTTGGGATTTTCTTCAGTGCTTCGATGATTGAGATGGTGATCAT
GATCGTTGTGTTGTGTTATATTATGCGATTGTATCATAAAGGTCCCAATG
ATCCTCCAATGCCTCTTTGGATGAAAAAGTATATTTACGACAGTCTCTCA
TACAAACTCCATATTCGACGTCGCAAAGAAGAAGAAGGCGTAGAGGATAC
AGGGAACAATGAAGCACATCCTTTCATCCCAAACAAACAGCAAGAACGTC
AAAACGAGGCCATCTTTAACAATGGAACTGTAACTGTCATCAACCGTCTC
AAACCGATGACACAAGCTGAAAAATGGAATAATCACATGACGTCATTATC
CTTGTTAGCCGCCAATCGTCAACCAAACAATAGGCTGAGTGGTGCACCAA
CAGCCGCCGGCCACTTCATGAACAACACCATTCTTCAACATCCTGAACAA
CCAGCAAGTGAAGCGCAAATCGTGATCAACAAATTGAACATTTTAGTCAA
CAAATTAAAAGACATGGATGCTGAAGATGACGTCACTGCCGAATGGCGTA
CCGTTGCCATGACTCTTGATCGCTTATTggttattttcttcttcgttgTT
TACTTGGTTACCATCCTGGCTTGCTTCTTAAGATCACCAGGTTATGTTTC
ATGAATGAAGAGATGCATTTTCTTTATGGTGTTGGTATTCGTCATAATGC
CAGATTTGTCTGTGGCATCAGATAACGAAAAGAGGTTGTTTGACAACATC
TTTGGTGATTATGATCCTGGTGTGCGTCCAGTCATGGATGATAATGATAC
CATCAATGTGGACCTCACAATGAACCTCCATGCTATTGTGGATGTGCAAA
CGAAAAGTCAAACCTTAATCATGAGTGTCTTCATACAACAGAAATGGAAA
GATGAGACATTAACATGGAAAAAGGAAGATTATGGTGGACACATCAAGAG
CATAAATGTCGATCCTTCGCGAGTGTGGAAACCTGATATTGTTTTGTACA
GCAATGCTGACGAAGACAAAACATTCGGTGGAAATTTAGATCGTTTAAAC
ACAAGAGTTCGTTTATTTTACGATGGTAATATCACGTGGCTTGCACCGAT
CATTCTGCGATCACAATGCAGTATCGACGTCACTTATTTCCCCTTCGATA
CGCAAAATTGTACTTTGAAATTTGGCAGTTGGACATATGAACGAGCAAGA
TTGAACCTCAGAGATGGAGGGATCAAAATGGCGCAAATTAAGGAGTACGA
GGCAAATTCCGAATGGAAATTGATTTCCACTTACAACATGCGCCATGACA
TCGAATATCCATGCTGTAAGGATGAATTTTACCCTGACATTACCTTCCAT
ATCGTCATTGCAAGAAGATCTTTGTTTTATTTGTGCAATTTGATTTTCCC
CATGACCGTCATTGGAATGTTGACCATGCTCTCCTTTCTGTTACCTGCAG
AATCGGGTGAACGAATTTCATTAGCTATCACGTTGCTATTGGCAATGACA
GTTTTCATGTTGGTCGTCGCAGATATCATTCCGGCCACCAGTGACGTCAT
TCCTTTGGTTGGGATTTTCTTCAGTGCTTCGATGATTGAGATGGTGATCA
TGATCGTTGTGTTGTGTTATATTATGCGATTGTATCATAAAGGTCCCAAT
GATCCTCCAATGCCTCTTTGGATGAAAAAGTATATTTACGACAGTCTCTC
ATACAAACTCCATATTCGACGTCGCAAAGAAGAAGAAGGCGTAGAGGATA
CAGGGAACAATGAAGCACATCCTTTCATCCCAAACAAACAGCAAGAACGT
CAAAACGAGGCCATCTTTAACAATGGAACTGTAACTGTCATCAACCGTCT
CAAACCGATGACACAAGCTGAAAAATGGAATAATCACATGACGTCATTAT
CCTTGTTAGCCGCCAATCGTCAACCAAACAATAGGCTGAGTGGTGCACCA
ACAGCCGCCGGCCACTTCATGAACAACACCATTCTTCAACATCCTGAACA
ACCAGCAAGTGAAGCGCAAATCGTGATCAACAAATTGAACATTTTAGTCA
ACAAATTAAAAGACATGGATGCTGAAGATGACGTCACTGCCGAATGGCGT
ACCGTTGCCATGACTCTTGATCGCTTATTggttattttcttcttcgttgT
TTACTTGGTTACCATCCTGGCTTGCTTCTTAAGATCACCAGGTTATGTTT
CATGAATGAAGAGATGCATTTTCTTTATGGTGTTGGTATTCGTCATAATG
CCAGATTTGTCTGTGGCATCAGATAACGAAAAGAGGTTGTTTGACAACAT
CTTTGGTGATTATGATCCTGGTGTGCGTCCAGTCATGGATGATAATGATA
CCATCAATGTGGACCTCACAATGAACCTCCATGCTATTGTGGATGTGCAA
ACGAAAAGTCAAACCTTAATCATGAGTGTCTTCATACAACAGAAATGGAA
AGATGAGACATTAACATGGAAAAAGGAAGATTATGGTGGACACATCAAGA
GCATAAATGTCGATCCTTCGCGAGTGTGGAAACCTGATATTGTTTTGTAC
AGCAATGCTGACGAAGACAAAACATTCGGTGGAAATTTAGATCGTTTAAA
CACAAGAGTTCGTTTATTTTACGATGGTAATATCACGTGGCTTGCACCGA
TCATTCTGCGATCACAATGCAGTATCGACGTCACTTATTTCCCCTTCGAT
ACGCAAAATTGTACTTTGAAATTTGGCAGTTGGACATATGAACGAGCAAG
ATTGAACCTCAGAGATGGAGGGATCAAAATGGCGCAAATTAAGGAGTACG
AGGCAAATTCCGAATGGAAATTGATTTCCACTTACAACATGCGCCATGAC
ATCGAATATCCATGCTGTAAGGATGAATTTTACCCTGACATTACCTTCCA
TATCGTCATTGCAAGAAGATCTTTGTTTTATTTGTGCAATTTGATTTTCC
CCATGACCGTCATTGGAATGTTGACCATGCTCTCCTTTCTGTTACCTGCA
GAATCGGGTGAACGAATTTCATTAGCTATCACGTTGCTATTGGCAATGAC
AGTTTTCATGTTGGTCGTCGCAGATATCATTCCGGCCACCAGTGACGTCA
TTCCTTTGGTTGGGATTTTCTTCAGTGCTTCGATGATTGAGATGGTGATC
ATGATCGTTGTGTTGTGTTATATTATGCGATTGTATCATAAAGGTCCCAA
TGATCCTCCAATGCCTCTTTGGATGAAAAAGTATATTTACGACAGTCTCT
CATACAAACTCCATATTCGACGTCGCAAAGAAGAAGAAGGCGTAGAGGAT
ACAGGGAACAATGAAGCACATCCTTTCATCCCAAACAAACAGCAAGAACG
TCAAAACGAGGCCATCTTTAACAATGGAACTGTAACTGTCATCAACCGTC
TCAAACCGATGACACAAGCTGAAAAATGGAATAATCACATGACGTCATTA
TCCTTGTTAGCCGCCAATCGTCAACCAAACAATAGGCTGAGTGGTGCACC
AACAGCCGCCGGCCACTTCATGAACAACACCATTCTTCAACATCCTGAAC
AACCAGCAAGTGAAGCGCAAATCGTGATCAACAAATTGAACATTTTAGTC
AACAAATTAAAAGACATGGATGCTGAAGATGACGTCACTGCCGAATGGCG
TACCGTTGCCATGACTCTTGATCGCTTATTggttattttcttcttcgttg
TTTACTTGGTTACCATCCTGGCTTGCTTCTTAAGATCACCAGGTTATGTT
TCATGAATGAAGAGATGCATTTTCTTTATGGTGTTGGTATTCGTCATAAT
GCCAGATTTGTCTGTGGCATCAGATAACGAAAAGAGGTTGTTTGACAACA
TCTTTGGTGATTATGATCCTGGTGTGCGTCCAGTCATGGATGATAATGAT
ACCATCAATGTGGACCTCACAATGAACCTCCATGCTATTGTGGATGTGCA
AACGAAAAGTCAAACCTTAATCATGAGTGTCTTCATACAACAGAAATGGA
AAGATGAGACATTAACATGGAAAAAGGAAGATTATGGTGGACACATCAAG
AGCATAAATGTCGATCCTTCGCGAGTGTGGAAACCTGATATTGTTTTGTA
CAGCAATGCTGACGAAGACAAAACATTCGGTGGAAATTTAGATCGTTTAA
ACACAAGAGTTCGTTTATTTTACGATGGTAATATCACGTGGCTTGCACCG
ATCATTCTGCGATCACAATGCAGTATCGACGTCACTTATTTCCCCTTCGA
TACGCAAAATTGTACTTTGAAATTTGGCAGTTGGACATATGAACGAGCAA
GATTGAACCTCAGAGATGGAGGGATCAAAATGGCGCAAATTAAGGAGTAC
GAGGCAAATTCCGAATGGAAATTGATTTCCACTTACAACATGCGCCATGA
CATCGAATATCCATGCTGTAAGGATGAATTTTACCCTGACATTACCTTCC
ATATCGTCATTGCAAGAAGATCTTTGTTTTATTTGTGCAATTTGATTTTC
CCCATGACCGTCATTGGAATGTTGACCATGCTCTCCTTTCTGTTACCTGC
AGAATCGGGTGAACGAATTTCATTAGCTATCACGTTGCTATTGGCAATGA
CAGTTTTCATGTTGGTCGTCGCAGATATCATTCCGGCCACCAGTGACGTC
ATTCCTTTGGTTGGGATTTTCTTCAGTGCTTCGATGATTGAGATGGTGAT
CATGATCGTTGTGTTGTGTTATATTATGCGATTGTATCATAAAGGTCCCA
ATGATCCTCCAATGCCTCTTTGGATGAAAAAGTATATTTACGACAGTCTC
TCATACAAACTCCATATTCGACGTCGCAAAGAAGAAGAAGGCGTAGAGGA
TACAGGGAACAATGAAGCACATCCTTTCATCCCAAACAAACAGCAAGAAC
GTCAAAACGAGGCCATCTTTAACAATGGAACTGTAACTGTCATCAACCGT
CTCAAACCGATGACACAAGCTGAAAAATGGAATAATCACATGACGTCATT
ATCCTTGTTAGCCGCCAATCGTCAACCAAACAATAGGCTGAGTGGTGCAC
CAACAGCCGCCGGCCACTTCATGAACAACACCATTCTTCAACATCCTGAA
CAACCAGCAAGTGAAGCGCAAATCGTGATCAACAAATTGAACATTTTAGT
CAACAAATTAAAAGACATGGATGCTGAAGATGACGTCACTGCCGAATGGC
GTACCGTTGCCATGACTCTTGATCGCTTATTggttattttcttcttcgtt
gTTTACTTGGTTACCATCCTGGCTTGCTTCTTAAGATCACCAGGTTATGT
TTCATGAATGAAGAGATGCATTTTCTTTATGGTGTTGGTATTCGTCATAA
TGCCAGATTTGTCTGTGGCATCAGATAACGAAAAGAGGTTGTTTGACAAC
ATCTTTGGTGATTATGATCCTGGTGTGCGTCCAGTCATGGATGATAATGA
TACCATCAATGTGGACCTCACAATGAACCTCCATGCTATTGTGGATGTGC
AAACGAAAAGTCAAACCTTAATCATGAGTGTCTTCATACAACAGAAATGG
AAAGATGAGACATTAACATGGAAAAAGGAAGATTATGGTGGACACATCAA
GAGCATAAATGTCGATCCTTCGCGAGTGTGGAAACCTGATATTGTTTTGT
ACAGCAATGCTGACGAAGACAAAACATTCGGTGGAAATTTAGATCGTTTA
AACACAAGAGTTCGTTTATTTTACGATGGTAATATCACGTGGCTTGCACC
GATCATTCTGCGATCACAATGCAGTATCGACGTCACTTATTTCCCCTTCG
ATACGCAAAATTGTACTTTGAAATTTGGCAGTTGGACATATGAACGAGCA
AGATTGAACCTCAGAGATGGAGGGATCAAAATGGCGCAAATTAAGGAGTA
CGAGGCAAATTCCGAATGGAAATTGATTTCCACTTACAACATGCGCCATG
ACATCGAATATCCATGCTGTAAGGATGAATTTTACCCTGACATTACCTTC
CATATCGTCATTGCAAGAAGATCTTTGTTTTATTTGTGCAATTTGATTTT
CCCCATGACCGTCATTGGAATGTTGACCATGCTCTCCTTTCTGTTACCTG
CAGAATCGGGTGAACGAATTTCATTAGCTATCACGTTGCTATTGGCAATG
ACAGTTTTCATGTTGGTCGTCGCAGATATCATTCCGGCCACCAGTGACGT
CATTCCTTTGGTTGGGATTTTCTTCAGTGCTTCGATGATTGAGATGGTGA
TCATGATCGTTGTGTTGTGTTATATTATGCGATTGTATCATAAAGGTCCC
AATGATCCTCCAATGCCTCTTTGGATGAAAAAGTATATTTACGACAGTCT
CTCATACAAACTCCATATTCGACGTCGCAAAGAAGAAGAAGGCGTAGAGG
ATACAGGGAACAATGAAGCACATCCTTTCATCCCAAACAAACAGCAAGAA
CGTCAAAACGAGGCCATCTTTAACAATGGAACTGTAACTGTCATCAACCG
TCTCAAACCGATGACACAAGCTGAAAAATGGAATAATCACATGACGTCAT
TATCCTTGTTAGCCGCCAATCGTCAACCAAACAATAGGCTGAGTGGTGCA
CCAACAGCCGCCGGCCACTTCATGAACAACACCATTCTTCAACATCCTGA
ACAACCAGCAAGTGAAGCGCAAATCGTGATCAACAAATTGAACATTTTAG
TCAACAAATTAAAAGACATGGATGCTGAAGATGACGTCACTGCCGAATGG
CGTACCGTTGCCATGACTCTTGATCGCTTATTggttattttcttcttcgt
tgTTTACTTGGTTACCATCCTGGCTTGCTTCTTAAGATCACCAGGTTATG
TTTCATGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1486MSTRG.1486Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1486.6.p1MSTRG.1486.6.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1486.6.p1.exon1MSTRG.1486.6.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1486.6.p1.exon2MSTRG.1486.6.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1486.6.p1.exon3MSTRG.1486.6.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1486.6.p1.exon4MSTRG.1486.6.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1486.6.p1.exon5MSTRG.1486.6.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1486.6.p1.exon6MSTRG.1486.6.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1486.6.p1.exon7MSTRG.1486.6.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1486.6.p1.exon8MSTRG.1486.6.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000007_pilongenomesc0000007_pilon:742112..749189 +