MSTRG.12921.54.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.12921.54.p1
Unique NameMSTRG.12921.54.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000100_pilon:367959..388985-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.12921.54.p1 ID=MSTRG.12921.54.p1|Name=MSTRG.12921.54.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=21027bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000100_pilon:367959..388985- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTTTCAATAAACATACTTTTCCGGCCAAAAATAATATATCTTAAATACTG TATATAATAATATATCTTCAATCACTTTAATTTATACTTTGCTCTAGTAA AAATTATTGACATGGAAGTTAAACAAATACCAATCAACAATGAAGATTTA CAGAGGTTTAACAGTGACTGTTATACATTTAAAGAGCATCCCTTGAGTAT GTTGGAACCATACCATCAAGTCTTTCCATCACTTTATATGGATCACCACA AATCATTTCAAGAAGCTGAAGTTTATGAAGATGATGTTTGGATTTGCACT TTCCCAAAATCAGGTTGAAATATTAACCAAGGAGATTACTTGGTACTAAT CTCTGAATTTGTAAAAGATAGATTAAGATTTTCTGTTCTTTAACAAAATC ATCACATAATAATTCATACAATTCACCATTCACCATTATTATTGCTTGTT TCCCTTTTTATCAACAATTGTTATTTTTCGATTTTCTTTGAAAGGCCTAC CAGGCAGGCTAAGATTGTTGACAAAAGTTTTTCTATTTAATCTCTATTTT TTATGTTCTAGGAACCCGTTGGATGCAAGAAATTGTCTCTTGTCTACGCA ATGGAATGGATTTTGAAAAAGTAAAGACCACCTCTTTGAACCTAAGAGTT CCATTCTTTGAGTAAGTTTTTAAAGGAAAATGAGAAAAAATATTCAAGAA GTAATGAAATATTTCAAAATTAATCCTGCCAACTTTATATCATTTGTATT TACAATTTAGTGTATCTGCTGTATGCAGCACTGCAGAGAAGGAACTCAAA GCATTGGGTTCCCTTTGTAAAACTGGAGCTGAACTTGTCAACCATACACC TCGACCAAGGACTATAAAAACTCATCTCAGCTATGAAATGTTGCCTCCAA AGATTCATGAAAAAGGTGCCAAGGTATCAAAGTTTCTTTTCCAAAACTTA 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AAAACTAAGTTACAGCAGCTAATACGATGGCAAATTTACCCCCCCCCCCA CTGCACCTATAATTTCTATAAGCCTTGTTTTCGTAGAGAAGTTGATATGT TCCATTCAACCATATTGTTTTCATAATCATTCATTTACCAGGTGATGCAT GCTTTTAAAATTCACGAGAGTGTCAGATATTTGCCACCGATTATGAAGAG CGTTTGACTAACATCATCACAAGCCCCCCCCCCATGAGCCATCTACTTTT TATTGTTCTTCAGTTTTTCTTTGGGTAGGTTGGACGTTTAGAAAATGCGA TTGGTTGGTACCATTCACATCCTGGATACGGATGCTGGCTTTCTGGTATC GACGTGTCCACACAAATGGTCAACCTACAGTTTCAAGAACAATTTGTAGC TATCGTTGTAAGATCTCTTTCTTTATCATGTCACTTTGCAGGAGTTGCTT GATTGCTTAAAAGTACAGGGGACGCTTACTTTGTATCTATAAATACTGTT TTGATTAAAATGAATTCCTCCAATTCGTGTCTTTATCTATTTGTGTTATT TTGGACCTACCTCCTGCATCACCTTCGGTATGATAACAAGAGTTGATCAA AATAGTACCAAAAGTATCATATTCCCTTTTTGGTATTTTTGAAAAAAATG ACGTCACTGTCTTTGTATCTCTAAAACATATCTCTTGGAGCACTTAGGGT TTTCAAAACATGTCAAATTATATTCACCGTCAGCAACCTATTGAGCATGA AAAAATATTTTGTTGTAAATAGGTGTACTCACCTCATTTTGTGACAACGT CATTATTTTCATAATTTAGCTGTCACTTTGTCAATATTTAGGGTTGATGA TTTGTCCTTGCACTTGTTCTGAAAACAACCATACCTTAGGCTCAAAAATT TACTTTCAAAATCAGACCCTTGCCTCACAGTGTAGAAATAGGCTACGAAA TTTAACACCCTTACAATGCAGAAACGGACAAAAAGTACCCCTTTACTTAC AGTGCATCATTCTTTTCATCAGACCTGTTCAATGAAACACCTCCCTTTCA ATTAAGGGTAATTTTTGAGACATACAGATGGGAAATATACCTGAGATCTT TAAAGTGAATTTTATTGAGGTCTAAAGATTTTTAAGAGAACCATTCCTTT CTATGATAAAGAAGAAAGAAAAAGTTCAATTTAGGACCTGGTAGTATGTC AGTAGTATACTGAAGAAGATTTTTTCACTCAACTGGTTCGCAAGAAAATT ACCCTAAACGAAATTAAGTATAGATGATATTTACACGTCTTACTCTGCCA ACCATTCTTATATAACAATTTGAAATTAGATTAAGAAAACAAAAAACAAT GGAAATTAAACAAATACCAATCAACAATGAAGATTTGGAGAAGTTTAGCA GCCATTGTCATACATATAAAGATCATCCCTTGAGTATGTTGGAACCATAC CATCAAGTCTTTCCACCATTTTATATGGATCACCACAAATCATTTCAAGA AGCTGAAGTTTATGAAGATGATGTTTTGATTTGCACTTTCCCAAAATCAG GTAGAATTTAATGGGTGCTTTTTTTGTGTATTCACAGCTTGAATTACAAA CTTTTTCCATATGGCAAATAATGTACCCTTGTGTCAGTTTAACCCGAATC TCCTTTGACATAGGTTTGAGATTGATCTTTTTAAATGAAACTTTTTGGAC CTACCTAAGGTAGTCCTTTATATTAACTCTTGTCCGTTCGTTCGTTCGTT CGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTCTGTTGCCAGCTTTTCTCGGGAT TGGCTCATTAGTTTTTTCTAATTTTTTGCACAATGATGCAAAATGGCAAT GCCCAAAATGTGACGGAGTCCGATTTTCGAAAAAAAAAAATTTCCGGCCG AAAATGGCGGAAATATGCCGGAAAAACTGTTTTTTCGGTATTTTCTCGAG ATTTCATCATTAGTTTTTTCTGATTTTTTGCTCAAAGATGCGTATTCCGG CCGAAAATGCCGGAAATATGCCGGAAATCGCCGTTTTTCTGGATTTTCAT TGGACTTTTCCATATAATTGGTTGTTTTTTCATTCTAGAAGATTATCAAT AGCAATGCCCACAATCAAGCATGTTTCAATTTTCAATAAAATTGATTTTT GAAGCCGGAACTATTTTAAAAATCGCCGGAACCTTTTTTCGCCGGAAAGA CAGTATTTCTCGAATTTCTCGAGCTGTACTTTATATATTTTTTATGAAAT TTTCACACTGATGCAATATGACAATACCTAAAATGTGACGGAGCCCGATT TTCAAAAAACATTTTTTTCCGGCCGAAAATGCCGGAAATATGCCGGAAAA CCGGTTTTTTAACTTTTTCTCGAATTTTCATTTTTAGTTTTTTCTGATTT TTTGCAGAAAGATGCGTATTAGCAATGCTCAAAAAATGGCCGAGTTCGAT TTTTGAGAAAAACGTTTTTCCGGTTGCTGGAAATCGCCGTTTTTGCAGAT TTTCATTGGATTTTTTCCTTGTATTTCTATGTTTTTCAAACAAAAACATT ATTGATAACAATGCTCACCATCAAGCATGATTCAATTGTCAATAAAACTG ATTTTTGCGACCAGAACTTCCTATTTATTTTTTCCCTACAACCCTTCTCT CTCCCCCCATCAACAATCAATGATGAATTTATTGTGTTGTGTATTTTCGC TAAATGCTATATTTTCTGACTGATTTTTTTCATTTTTCTTTTCGCATTGC TAACTAACTTTCATCATCAGGTAGGTCCATTCAGCATGTTGCTTGTTTTT CTTTACGAGTGCATATTGAAGCAGCCGGCATCCTAGGTATGTGAAGCTTT AAATAAGTGAAACCAATTACTGTCCGGTTAACTACTATTACAGCAAAACT ATAATTGTTTAAAGTTTTTATAGATGTTTTGAATTTAGGAAAAGGATGAT TTAGAGTAATAAGAAGTGTTCAATTCCAATATAACAAAGATCAAATCATT AGTATTTCTGAAGGATTTACTATTCTTTACTTTTCCAGGAACCCGTTGGA TGCAAGAAATTGTCTCTTGTCTGAGGAATGGCTTGGATTTTGAAAAAGCA AAATCAAGTCCTCTAGGCTTAAGAGTACCTTTCTTTGAGTAAATATTTTT AATTTTTTTTTATTTAGAAGTATTGGCTGAAATTCTTGGGTTGAACTAAA TGGGAAATATCAAAACTGAAGATAAGATTGAAATAGATATTCAAAAGATT AACTTTCTTTGTAGTCAATAAGCATCAATGGTCACAATACATAATCTTTT CTCATTTTAGTTTTTCAGCCGTCTCTTATAACGCAGAAAAGATACTCAAA GGTTATGGTTCTTCTTGCAAAACTGGAGCTGAACTTGTTAATCATACACT TCGACCAAGGACCATAAAAACCCATCTCAGCTATGAAATGTTGCCTCCAA AGATTCATGAAAAAGGTACCAAGGTACCAGAACTTGTTTTTAGCTGATAT ACGGTTTCAATTGAAACAGTTTGATTTTTTTAATGTTAAAAATTCCCTGA TTTTAATTTTTTTTAACCAATGCAAATGATTTCTATTCAGATGATCAATG TAATACGAAACCCACGTGATGTTTGTGTATCATTTCTCAACCATCATGTT CTTACACAAAACTACACTGGTGATTTACAAACCATTGCAGAGATTATGTT ACAGGATGTAGGACCTATCAGTGCACCTTTCTTTACACATATCCTGAGCT ACTGGAACCAACGAGAAAATCCAAATCTTTTGATTGTTCACTATGAAGAG ATGCAGAAAGATATAACTGGTTTATATAAAATTTATATATAAATTTCTTT TGAATTTGTTTTTAATGAGGTCTAATTTTAACAGTTGAGCAGGGCATATA ATGTTAAATTCGTTACATAGGTGTTTC

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000100_pilon:367959..388985-

>MSTRG.12921.54.p1 ID=MSTRG.12921.54.p1|Name=MSTRG.12921.54.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2868bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000100_pilon:367959..388985- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATCAATGTAATACGAAACCCACGTGATGTTTGTGTATCATTTCTCAA
CCATCATGTTCTTACACAAAACTACACTGGTGATTTACAAACCATTGCAG
AGATTATGTTACAGGATGTAGGACCTATCAGTGCACCTTTCTTTACACAT
ATCCTGAGCTACTGGAACCAACGAGAAAATCCAAATCTTTTGATTGTTCA
CTATGAAGAGATGCAGAAAGATATAACTGGTTTATATAAAATTTATATAT
AATTTTTCAGCCGTCTCTTATAACGCAGAAAAGATACTCAAAGGTTATGG
TTCTTCTTGCAAAACTGGAGCTGAACTTGTTAATCATACACTTCGACCAA
GGACCATAAAAACCCATCTCAGCTATGAAATGTTGCCTCCAAAGATTCAT
GAAAAAGGTACCAAGGAACCCGTTGGATGCAAGAAATTGTCTCTTGTCTG
AGGAATGGCTTGGATTTTGAAAAAGCAAAATCAAGTCCTCTAGGCTTAAG
AGTACCTTTCTTTGAATGGAAGTTAAACAAATACCAATCAACAATGAAGA
TTTACAGAGGTTTAACAGTGACTGTTATACATTTAAAGAGCATCCCTTGA
GTATGTTGGAACCATACCATCAAGTCTTTCCATCACTTTATATGGATCAC
CACAAATCATTTCAAGAAGCTGAAGTTTATGAAGATGATGTTTGGATTTG
CACTTTCCCAAAATCAGATGATCAATGTAATACGAAACCCACGTGATGTT
TGTGTATCATTTCTCAACCATCATGTTCTTACACAAAACTACACTGGTGA
TTTACAAACCATTGCAGAGATTATGTTACAGGATGTAGGACCTATCAGTG
CACCTTTCTTTACACATATCCTGAGCTACTGGAACCAACGAGAAAATCCA
AATCTTTTGATTGTTCACTATGAAGAGATGCAGAAAGATATAACTGGTTT
ATATAAAATTTATATATAATTTTTCAGCCGTCTCTTATAACGCAGAAAAG
ATACTCAAAGGTTATGGTTCTTCTTGCAAAACTGGAGCTGAACTTGTTAA
TCATACACTTCGACCAAGGACCATAAAAACCCATCTCAGCTATGAAATGT
TGCCTCCAAAGATTCATGAAAAAGGTACCAAGGAACCCGTTGGATGCAAG
AAATTGTCTCTTGTCTGAGGAATGGCTTGGATTTTGAAAAAGCAAAATCA
AGTCCTCTAGGCTTAAGAGTACCTTTCTTTGAATGGAAGTTAAACAAATA
CCAATCAACAATGAAGATTTACAGAGGTTTAACAGTGACTGTTATACATT
TAAAGAGCATCCCTTGAGTATGTTGGAACCATACCATCAAGTCTTTCCAT
CACTTTATATGGATCACCACAAATCATTTCAAGAAGCTGAAGTTTATGAA
GATGATGTTTGGATTTGCACTTTCCCAAAATCAGATGATCAATGTAATAC
GAAACCCACGTGATGTTTGTGTATCATTTCTCAACCATCATGTTCTTACA
CAAAACTACACTGGTGATTTACAAACCATTGCAGAGATTATGTTACAGGA
TGTAGGACCTATCAGTGCACCTTTCTTTACACATATCCTGAGCTACTGGA
ACCAACGAGAAAATCCAAATCTTTTGATTGTTCACTATGAAGAGATGCAG
AAAGATATAACTGGTTTATATAAAATTTATATATAATTTTTCAGCCGTCT
CTTATAACGCAGAAAAGATACTCAAAGGTTATGGTTCTTCTTGCAAAACT
GGAGCTGAACTTGTTAATCATACACTTCGACCAAGGACCATAAAAACCCA
TCTCAGCTATGAAATGTTGCCTCCAAAGATTCATGAAAAAGGTACCAAGG
AACCCGTTGGATGCAAGAAATTGTCTCTTGTCTGAGGAATGGCTTGGATT
TTGAAAAAGCAAAATCAAGTCCTCTAGGCTTAAGAGTACCTTTCTTTGAA
TGGAAGTTAAACAAATACCAATCAACAATGAAGATTTACAGAGGTTTAAC
AGTGACTGTTATACATTTAAAGAGCATCCCTTGAGTATGTTGGAACCATA
CCATCAAGTCTTTCCATCACTTTATATGGATCACCACAAATCATTTCAAG
AAGCTGAAGTTTATGAAGATGATGTTTGGATTTGCACTTTCCCAAAATCA
GATGATCAATGTAATACGAAACCCACGTGATGTTTGTGTATCATTTCTCA
ACCATCATGTTCTTACACAAAACTACACTGGTGATTTACAAACCATTGCA
GAGATTATGTTACAGGATGTAGGACCTATCAGTGCACCTTTCTTTACACA
TATCCTGAGCTACTGGAACCAACGAGAAAATCCAAATCTTTTGATTGTTC
ACTATGAAGAGATGCAGAAAGATATAACTGGTTTATATAAAATTTATATA
TAATTTTTCAGCCGTCTCTTATAACGCAGAAAAGATACTCAAAGGTTATG
GTTCTTCTTGCAAAACTGGAGCTGAACTTGTTAATCATACACTTCGACCA
AGGACCATAAAAACCCATCTCAGCTATGAAATGTTGCCTCCAAAGATTCA
TGAAAAAGGTACCAAGGAACCCGTTGGATGCAAGAAATTGTCTCTTGTCT
GAGGAATGGCTTGGATTTTGAAAAAGCAAAATCAAGTCCTCTAGGCTTAA
GAGTACCTTTCTTTGAATGGAAGTTAAACAAATACCAATCAACAATGAAG
ATTTACAGAGGTTTAACAGTGACTGTTATACATTTAAAGAGCATCCCTTG
AGTATGTTGGAACCATACCATCAAGTCTTTCCATCACTTTATATGGATCA
CCACAAATCATTTCAAGAAGCTGAAGTTTATGAAGATGATGTTTGGATTT
GCACTTTCCCAAAATCAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12921MSTRG.12921Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12921.54.p1MSTRG.12921.54.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12921.54.p1.exon4MSTRG.12921.54.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12921.54.p1.exon3MSTRG.12921.54.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12921.54.p1.exon2MSTRG.12921.54.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12921.54.p1.exon1MSTRG.12921.54.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000100_pilongenomesc0000100_pilon:367959..388985 -