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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000080_pilon:456845..472627+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.11160.1.p1 ID=MSTRG.11160.1.p1|Name=MSTRG.11160.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=15783bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000080_pilon:456845..472627+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GAAttcaaaagcaaaattggtATACGTGCTACGGTCAAATAACATGTACG
CTAAATCATAAAAGGTCCGTACTGACTGAAAACCTGACCTGACGGAAAGC
ATTCGCAAAAAGACTTCGTAAGACAACATCAAGTCAAGCAAAGGCATTCC
ACAAGCTTATCTAAATAATTCAATTACATCTTAACTTGCTAAACAGTTAA
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GTGGTGTCAAGTCATATACCTAGTTTCCAGTATATGGATttcgtgtaact
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ttctatttctatttggttgagttgcaggaggctttaagGCCTATTTTccc
aactatagacgctttcaatgagtgccccgtcagcaccttggactgactac
ccaattcccctgctcacatggcatgggttgaatCGGGCGAatgttcattc
acttgccaagtgaaccgctgtgagtgggaatcgaacctcagtcgcctgtg
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TGTTGGCACATGcacctcttttcccatcttgcacccttattggaaaattg
aatgttggtacatttgaaattttgcttggcgtgaggcttgctgcacggaa
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cgtttccagacacatttgtttttcgatagttgcaaattttttttctcctg
tcgacaaacaattttcaaaatgttgcaaaacgttcggcattttaccaatt
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aaagttccaagggttcaaagttcacggaaaaatgaaacatttggtttgac
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GTTTTCCAGTTATTTCTGCACCGGACAAAGTCTGGTGTATCTGTAATGTA
AGCTCAAAATACGCTTTCGAAtggtttctaaagaaggcggaacaCACTAT
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ctttttacaatgtttctaaagaaggcgaaaTACAGCTATGTATGGATTTA
TTGTCCCAGTACTGtatagacaggagacccgttgtgtgtttttttataac
ttgatgtacacaagacgggttcaagctgtgagtccaatattgtcGTCTAC
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tccctaagatcaggggggggctacttactcaggggggctatttgtttagg
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GTTGATAAGAATTTCAAAGAAGACATTATACATTTGGTATCTCTTTCTCT
TGTGTGGACATGCAAAATGAAGACCCTgcattgtttgaatttttttccat
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aattttggtgggggCTAAATCTCTggggggggCTGAACCTTCAggggggg
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CTATCTTAGGTTTCAAACATCAAATTTCTACTTATCAACATCACTCTCTT
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tcagttagtcacactagcgtaccgccgaaatgcgtatcaaagattaatgc
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taaaacttctaaagggattcatgaaaaaataacccggcactttttaatga
aattaacattttcaaaaactatgagaaattgcctaaatttgagccataga
tgaaaaaatttgagcgaagccaaccttgagaactaatttgaagatcaact
tcccaagaaaaagatctaccgGGGAGACGGAATCCACCTAGATCTGCCAG
caagttctagttctagttctactAATAATAGATAATACGCTAacgtacat
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TGAGCATTCCACAAGGGTTTCCAAAGGTGCCCATTTATTCCAGATCCTTG
ATAAAATCAGCATGAAGGACTCTATAGGTGGAGGTTTTGGTTTAGCTGAT
CCAACAATTGACGTTAATTGTTCCACGATCTTTAGTCAAAGGATAGTTCC
CAGTGTTCAAAGCAGCCTGACCTGCTCTCACCCCATTTTCAATGCAAAAC
TGGACTGCCTCCTCTATTTGCTTGTTTTTCAAGTTTGTCTTTTTTCTAGT
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TTGGTTTCATTGTGatgtctttctttttaaatattattttgactaaaaaa
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AGTTTATGACAAAAAGTCCCAAAATGTACATGGAAACATTGGCTACATGT
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TGGGTTTTGGGGTACACATGATGTGGTTTATGTAGTACATTAGGTGGTTA
CTGAAAGCTTAAGTTTGCAGCTACATTATGCATGGCTAACAAATTAAGTA
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AGTGGCCATATTTATGCGTGTGGGGTTTGGGGTACATAgagtaaaaatat
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TGCGGTTTTTGGGGTCCATTATCTTGGGTGCTACATGCTAATTTGACCTT
ATATACTTcaaatcaaaaatggggaaaaagataatcaaaatggcaaaagt
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ATTCtccttaaaaaaagaattttttagatCTAGAAATCACTATTTCTAAG
CATAAATGTTGGATGtttttttaaccaaataatCTGTTATGTTAATAATC
GTAGGATTGTCCCTGTAACAAGTTTTAAAACTGTAAGGTTTGCCATTTTA
CTAGATAATGAACTAgatttttgaaatcgaaaaGGAAAAGTCCACATGAT
GGGAAATTGAATCTGGACCAATAGTTTGCTATTACAGAGTGTAAATATCT
TGTCTTGATTGTCAATATTTACCTTATTCTCATCTCAGATTTTTTAAGAT
GTATCCTGCAACTCATCAATGTGCACCAGGTGCCTGGGAAAAGGtaaaca
ttatttttcattgctactctatttttcaaaagtagattGATTGAATTCAA
GCTGTTAAGTATTGTGTTGAAATGAATCAATTATCTTTCAGCATTATGAA
TGTCAAGAATGAAAGAGAATTAACTATCAATAAAGAGCAGTCCTcttaaa
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TATTAGcataaaaaattttgtcaaCTCTTGTTTAATCTTGCATTTTTACT
GCGAAATATATTTTGTGAAGAGATACATCACTAATTGACTTGACATCATT
TCATATCATGTTTATTTTAGGAAAAGGTCAAGACATTActgaaaaaattc
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CTTTTCGTACGGGCTAAAAAACGGTGGAGATTACCATAGTCCAGTTAAAA
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TACTTTGCACTTGATTTAGGCGGAACCAATTTCCGTGTTTTATTGGTTAA
ACTGAACGATGGGAATGTGTCAATGAGTCATGAGACTTTTCCAATATCTC
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TGTCTTGcaaaatttgccaaactaaAGTTAGGTCAAGAGACAAGAAAACT
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GAGGATCATGATGTAGTTGCACTACTTCAGCAAGCAATTGAGAAACGCAA
TGTAAGTTTTGGACActaattcaaaaattattataaCAATATTTTAACTC
ATTGTAGCTCATATTGTTATTCACCTAAAAGGGCGATAATTCTTTCTTTC
TCGCCCAAAACTGAGCTTGTTTTAGACAAAAAGAATTAGGTAATTTTGAG
AGAGAGTAATTATATCAAGAACCCGTTTTGGTGAGTTAGCGTTTtgtcaa
tacacgttttttttttaagaaacacacctttaagaaacacgaggctcaga
atgcctaaaaactaagaaacatctaagaaacatgctgagtctgagaatga
gaaaataacattttttaattcgttttttttaagaactttccaATCCAACC
TTCCATGaagctgattatgtcaaaaagtttagaaacatgtaagaaacatt
taaggctcaaaagacattgaggctgcttggtaaaactagtttcttaaaaa
aaaaaaaaacgtgtatttgcaAGATCTAATTTTGCGGTGAATTTTTTCAA
TACTGCCAAATTCACTAAAATCATCCATATCCAACAAATCAAAATTGGTT
CCCTAAGATTATCCATATCAACAGAACGTCTAGGTTAGTTCAGTTACTTC
AAAGTTGAGTATGACTGTacgtttttcacttttttgtcaAATCTACGAAA
AGAAATTGTGAATGCTTTGAGAGTCACTTTAAAGACCAAATAAACTTATT
CCAACCGTTCTTAAATACAAAAATTAAGCAAAGTTTTGAGGAGTATGTAT
AATAAAAATGAGCAAAATTATCCATTTCATGAGGGTGGTGTACCCCTTTT
TGAGCACTGGAAAGCAGTGACTCCACAGTGGAATAAGTGccggtggtggt
gtgacaaaGGTTTTCCCAAAATGGTATTTATTCATTACAGTGTCATGGAG
AAAGTGCATGACCCCCaataaaatgtctttaaaatgtCCCCCTAAAATGT
CTTTATATTGTTTATAGGAAATTGAAGTTGAGCAGATTGCGTTATTGAAT
GATACAACCGGAGTGATGATGTCTTGTGCTTATAACGATCCTGATGTTAT
GGTTGGGATGATCTTAGGTAAGAAAGTTGCATGTTGTTTGTACCGTATTT
CATATAATACCGATATACCCTGTCTAATTCCGTCATAACAACTTTCTggt
cttttaaatgtttataaaaccTTCTCAGTAAGCTGTTTAAAAGAACTACA
GAaactattttgcagaccagatacTTGTTATGACGGAATTGGACAAGGTT
ACACGAAGTTATGGCACATAATAATATCTGAACCATAAAAGTGGTCATAG
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GTATTGTTTGCAATAATGTTTTACTGCCGCTgcacccattgagtttaaag
ccccgaaggggctagagatgaatctttaacctttctcaagcaagaaaaag
tgagacCTTAAGGTTTGCGATTGTGTGTTATATTGGTGATGTCATTCTGT
GAGTCATTTTGATAAGATAACTATCAccttattgggcttttccagaaaaa
aaacgtataccccctgttgaggaggtccatccctctgtggctcgaaatgc
tgtaacccctctggaattctgaattttactatgatttaaaaagctacccc
atggaatttgagttatttttgacagatttttgtatctccctatgacATTC
CGCCACataccttacccccttggaacggaaatggaccttatgaggtatac
ggtttttttctggaaaaacttATTCCAAAGAACGACAACACTCGAGTTAT
TATTTCACCACCTTATTCCAAAGAATACTTCTCTGTGATGTGAGTTAATA
ACTTGTGAAATTATTCATTAATTAGTCAAAAATGATCTATGATCGagaca
atgcaatgacttcattcAACTCTGTTAAACTTAACTTGAACCAAGTCCTC
TTTAATACAGCTTTTAGAGCAAGGGTTGATAAAGATGTATTAAAAGTTTG
TATCGCCTAACATAAAAAACTTCTATAAAGACGCACTTTAAAGTTCGAGT
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TTTAATTTTCTCAGGTTTtaataaaacttctaattttCAGGAACTGGTTC
AAATGCCTGTTACATGGAGAAATTGGAATATGTTGGCAAATGGTTTCACC
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GGTGATATGGATGAATTGCAATCAGTTAGTACATCTTATGACAAGATTGT
TGATGAAGAATCATTATATCCTGGAAAACAATTGTAAGTGCTGGGTGATT
TTCCTGCtttttttatacaccttttcgaccgtagccgccaattgccgcgc
gggcattttttgtccgttttaccaacCTAAAACCGTccaagtcttttttt
cgcacctataggcaatagaaaaaggtgtacacaaaggattggatcgagtt
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ctatggtcgaaaaggtgtattttggTGTAGAGAACGGGAGTTGGTTGGTA
GTTTTTTGGCAACCAGAAAAGTTGTTGAAAGGGtgagaaatgcaattttt
tctattttgtgttaattccacagatctgtaaagcccgaagatttgcggct
tttatcgaaaagtgaagcctaggtttgaaaggatttcctaccaaagtcac
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gccgcctacttttttttgatctcgcgctccgaaaacaattaaaatgctag
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gattgaaattattttattttattcttcgTTTTTATACGACATTACAAATT
AGTCACTTTTACTGACTTTTCCTGACTTTTCCTCggctttcaattttctt
taattgTATAATTCGCTTGTTTTTACGATTACTTTAATGGCCTGAGAGAT
ATAATCCCGGGTTATGGAAACCTAAGTTATAaaatcccgagttatgacgt
cttAACTCGAATTTTTTAAGGTGTGCCTTTATTTTCCGAGCTAACTTCCG
AGTTAACTCAGTCATTTTAGATGTACCTAAATTTTCGATCTttataactc
gggttttccaggCCTCGATGTTTTTTAACAATTTAATTAACGAAACTCGA
AATGAAATGATTCATCTAATCAGTATCCACTGCTTTTACCTCTTACTTAG
ATTCGAGAAGATGATATCTGGCATGTATCTTGGTGAAATCGTTCGTCAAT
GCATTCTGTCTCTaatcaaagattttgtcttATTCCGAGGCTACATATCA
CCACAGTTGAGCAAAAAAGACAGTTTCACTACAATTTACGTATCTGAATT
TTGCAGGTAATAGGAAAACTTTGTTctgttttttaaaagtttttagatAA
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CTTGAGATTTGTACTGATTTTCATTCATATTCAGTAATTAgtcgagaaaa
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CACTTGAAGCGATTTTAACCTCCTTGACATAACATGAGGCTGGATGCTAT
GTATTTCTAAACTAGGGTGCCTGAAGGTCTACTACGCTGTATCGAAAATg
acgtattcatgatatgcaccactgcaatgacttcacgaaattatgcaact
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gttggaATAGAGAGGCTAGAAAACCTTAATCTGgtacccgatgtagaaat
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TAAAATcataatagatcttatcggagtttttgatttttctaaaaaagcga
tgcattgtgggattgtttcggcggtattacaatagaattcacTCGAGGAA
tttctaagagatttctattatAATACCCACaaagcttttttagaaaaata
aaaaagcccGATAAAATCATAATTCACAGTCTTTATATCTATTATTTTTC
CAGTGGTGATGCAATGAAATGTGTGAACATCTTACATCAATTAGGATATG
AGGCAGCCACCATTGAAGATTGTCACGTTATGCAAGATATTTGTATCGCT
GTTTCGCTTCGTGCCGCTCGATTAGCTGCCGCTGGTCTTACCTGCATTTT
AAGAGtgagatttctttttctttggcaaacgatatttaaaaaaaaagtta
tttacaAGTCTCTATGTTTAATTTAATTGAAGGCTGACGGCAAAGATTTC
CGACTTTATTACatgaatattactagtcattttatttattaacacgaatt
gaaaaatttcgtgttaataaaaacccccttaaatTATTAAGACCAGCCGT
GGTGTAATATTCGTGCAATAAGTAATATTCGTATAATAAGGTAGATTTCC
TGTTTGATTGATTTATcttggatttcatttttttcgaaacataAGTTTGA
ATAATAAACGGGTTCGAGTAAACGCgggggggggcgggaaaattttcaaa
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tttagagcagaataagggaccttctctttgaaagctgaaagaattcttaa
aaataaacaaacgggggggtcctaataaggtccggggggtttggaaaatt
ttcaaaaaagcgggggccgtttatttggcacctaagagtagctAATATGC
TGTCTAAACCCTATTTCTATTCGCCAAATCATCCATTTTAAGGGCAGATG
GTATTAAACCTCTTTGTGTTTCTTTTAGtgttttggttattttaagGCTA
TGAAAACCCCCCGGGTTActactgtttttattttaactttgctaaaattt
atgaaaaaaaagtgaTCTTGGATAgaactgaaattccaaaattttccatt
tttttccaaaaatctccCACATTTTATATGAATCTCCCCCAAAAAGGTAC
CCGACAAGAGTCTGTCCTGCCTGGGACTAATTGAGgagaaaaaggtaccc
tgaccagcggcataCCCCCATACCCTTTTGTGCTCAATTACCCACCGCGG
ATTTTGTCCCCTTTTGTGTACTGCATTGATAAacatataaatttcttttt
ttcacagCGTTTGAAACGATCATCAGTAAGTGTGGCCATGGACGGAAGTC
TTTACAAAAAACACCCAACGTTCAAACGATTCATGCATCAAGCATTGGAG
GAATTTTTGCCAACAACACAGGTTAATTTGAGGCTGGCTGAAGATGGCTC
AGGGCGTGGGGCGGCTGTTGTTGCAGCCGTAGCTCAACGACTTGCAAAAA
CCGCCCTTGTCGATTAGAAGAATCaagagattttttaaacaaCTGATTGA
TAATGGTAAAAAGCATCTAGAGTAGAGatataaaatttccaaatttgttA
ATTATTTTAGAATATGGTGAACTAATGTGATGGCCTTTCTATCGAGATGA
tactttttgtgccaagtattctGTCAGAATTTCCTCGAAACCTTGAAAAG
AATCTCTCACTGGGTTTCTTGGTACCGTTAGAATCTGAATTATATGTAGA
TTAATAAAATCCGAGTCTCACAATTAGGAAAATGAAATCAAACCTAAGGT
GTGATTTTTAGCTTTAACTAAAACTGGTGTATTTCTGAGCATCCCTTCTT
TTATCAGATATTATTAGACCACGCCGAACCTATCAAAGTCGTACGGTTTC
CAGTAGTGGTGAAGAAGTAAAGCTCGAATCTCATTGGCTTTCCACTTTTT
CAAAGATCCAGGCTATTTATTATCAAAGATTCAGGCTATTTAATTCCGTA
TTCTaattcaaagttgataaatttcagaattcaaatccgaatcttgtgtt
ctccgtgttcttgtgtccgcaatgggaaaaataaattttaagatggtaat
gactgaatcttgtgttctctgtgttcttgtgtccgattttatcaattaca
gaattcaaatccaaatcttgtgttcttgtgtccgattttatcaattacag
aatttccaaatccaaatcttgtgttttctgtgttcttgtgtccgatttta
tcaattacagaattcccaaatccaaatcttgtgttctctgtgttcttgtg
tccgattttacggttagtgtaaaacgcaggtcacaggtcacaggtcacgg
gtcacaggtcacaggtcagtgttgacaggtcagcttcaagtactgtaaaa
cacaaagaaaatgtttgaaaaacagttgttaatgtgaaaaatataattcc
aaaggtattttattgatctagaactattttaaagccaAAAATCTATCTAC
CTGCTTACCACGTGCtttcgcgttttatgccgtgtatataacacggacct
gtaatacttgtattatatattacacctAAATCaaacatgtaataaaaatt
atcttttcaatgttatatgcatgttaCGTATGTTAATACAAAGAATACgt
attaaaaaacattgatctcaccttttgctttaaactgccccctaacagga
aaatagctattacacaatcactatgtcatatctcattttaactcatgcat
caccttgggtatggtaacaagaattgatgaaaatagtatcaatgggatta
tattttataaatgtttcaatatttttatcccctgctttgtgtttttgata
aaatgacgtcactattttcatatctctaaaacagctctcttgcttcaaaa
cctgtcaatatatatccacttgcagcgaAGAACActgagaacacaagatt
cagtcttactattttataatttatttttcctatcgtggggacacaagaac
acagagaacacaagattcagtcttactattttagaatttaaTtttcccat
cacagtggacacaagaacacagagaacacaagattcagctttactatttt
agaatttattttttccatcgtggtggacacaagaacacagagaacacaag
attcagccttactattttagaatttatttttcccatcacggtggacacaa
gaacacagagaacacaagattcagccttactattttaaaatttatttttc
caatcGAAAAAATCATGACGAATCTAGGCTGAGAGATTATGTCAAGCCTG
ATGGTGAATCTAGCCCGTGAACATTTTTAGCCTGAATGACCAGTTCTtta
tcagccaatcagattgcttctTTACTTACTTCACCTTAACCCACGGTTTC
AAGGAAATGATTTTTGGGAACCCCGTTTTATAATGTTTGAGACAACAGTG
AGTGTTCAAATTGGCACCTTTTATCGCTTGGTCAGCACTTTTTCGAGGTa
tttttggccgaaaaagtACCCTTTATTGTTTGATTTTACGAATCTTTTCC
GAAACGGCTTCTCCTTGAGGCTCTGAGGATGTTTATCTTTTAGGGGTACT
GGTTTGCCCGAAAACGGGTGTGTGTCGCTTAattcttgaaattgaaattt
agtcacaattcaagaaaaaaaaattgggagtTTGACTGATTTTTACCGAA
ATGTAACTTTTGGAgggtcaaaaaatattttcgttcgatatttgcttttt
tataaCCCTTAGGGGGACCAAAGTAGATTTTATATTATTCACTACCCTCA
GCGGGATTTCAAAGTTCAAACAGCAACCAAGTGCTAAAATTCCGCTTCTA
ATAGTATATACAAAGGAATCTGACTTTTAAAAGAGCTAAATACTGATACT
GATTTTGATGttatattttgtataaaattgtAACATGCATTATAGACTTT
GAGATTACACCTTATATCTATGAttttgtcaattctttgagggtttgttt
tactttgttcagtttcttttcttcaattttcataaaagtgatgcactttt
cttttttataccgcatattttttttagctttataaAATGGATAATTTAAG
tagaatttttatattatttatctCATAGAATAATgaccaaaaacatttta
aatacTTTCAAgggaaaaaaacttttgcagagtaataaacttttgatatt
ttcgtttatttcgggcatattcgcgaaagttaaactttggccatgaaatt
ttcccaaaatagaTTGATTTATTTATAATATTG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000080_pilon:456845..472627+ >MSTRG.11160.1.p1 ID=MSTRG.11160.1.p1|Name=MSTRG.11160.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=9702bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000080_pilon:456845..472627+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTATCCTGCAACTCATCAATGTGCACCAGGTGCCTGGGAAAAGGAAAA
GGTCAAGACATTActgaaaaaattcgaatttccacGCGAATCAGCAGAAG
AATTGATTTCAAAGATGAATGAAGACTTTTCGTACGGGCTAAAAAACGGT
GGAGATTACCATAGTCCAGTTAAAATGTTGTTGACTTATGTACATGGTCT
TCCAGATGGCACTGAAACAGGGGACTACTTTGCACTTGATTTAGGCGGAA
CCAATTTCCGTGTTTTATTGGTTAAACTGAACGATGGGAATGTGTCAATG
AGTCATGAGACTTTTCCAATATCTCAAGAAATTATGAAAGGTGATGCCGA
TGGTTTGTTTGGATACATTGCAGAATGTCTTGcaaaatttgccaaactaa
AGTTAGGTCAAGAGACAAGAAAACTTGGAACAGTAGggtttactttttct
tttcctgtaCGCCAGGAAAGTTTGACCTGTGGATCATTGATTAAATGGAC
TAAAGGTTTTGATGTGGACGATGTGGAGGATCATGATGTAGTTGCACTAC
TTCAGCAAGCAATTGAGAAACGCAATGAAATTGAAGTTGAGCAGATTGCG
TTATTGAATGATACAACCGGAGTGATGATGTCTTGTGCTTATAACGATCC
TGATGTTATGGTTGGGATGATCTTAGGAACTGGTTCAAATGCCTGTTACA
TGGAGAAATTGGAATATGTTGGCAAATGGTTTCACCCACAATCTCCTTAC
AAAGAGTGCATTATCAATACGGAATGGGGAGCATATGGTGATATGGATGA
ATTGCAATCAGTTAGTACATCTTATGACAAGATTGTTGATGAAGAATCAT
TATATCCTGGAAAACAATTATTCGAGAAGATGATATCTGGCATGTATCTT
GGTGAAATCGTTCGTCAATGCATTCTGTCTCTaatcaaagattttgtctt
ATTCCGAGGCTACATATCACCACAGTTGAGCAAAAAAGACAGTTTCACTA
CAATTTACGTATCTGAATTTTGCAGTGGTGATGCAATGAAATGTGTGAAC
ATCTTACATCAATTAGGATATGAGGCAGCCACCATTGAAGATTGTCACGT
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AG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
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|---|
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|
