MSTRG.1136.1.p1 (mRNA) -

Overview


Name	MSTRG.1136.1.p1
Unique Name	MSTRG.1136.1.p1
Type	mRNA
Organism	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence

The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000005_pilon:2773495..2794247+
coding sequence from alignment at sc0000005_pilon:2773495..2794247+

mRNA from alignment at sc0000005_pilon:2773495..2794247+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR

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>MSTRG.1136.1.p1 ID=MSTRG.1136.1.p1|Name=MSTRG.1136.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=20753bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000005_pilon:2773495..2794247+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TGTAGCGTGATCAAATTATTTTGTGTACTCCTGTGAATGCCCATGATTGA
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TGTTGCAACGTTTTTTAACGTTCACAAcctccatataacgttagatgaac
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CTCGGATATACTTGCTTTtcacttacacgttttttttattagaacgtcta
aaatttggctgagcctggatgtgcttaatttttttgcaattttcagtcta
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taaaaaaaacgtgtagtatttCTTGAATGACTTTGCTATAGAGTtgacag
gcccggcggaacaaccgttaaagtggggaggctgaagactcaaaatgaga
taaaatttggtAGGAATTTGAGGGAAAAATCTCATTTACTCAAAAGTGGA
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AAGAGAGTCAAGTCCCTATCAAATAAATTCAGGTCAAAAATAATTAGTAG
CAAAATCGTTTTATAGCTTAAGAATctttatcttcaaaaaaaaaccATGA
AGGGAAAAACTGAGTCAACAAGTTTAGACAATTCAAGTCGAAAAACgtct
ttttacattttctcaaaatgaattCCTCGGGGACTAGGTTTGGCAGATGT
GGGGTGTGTGTGGACGGTTCCTTCTAAAACTAACCCTTagagaaaacatt
ttgaaaatgttgtctttaattttcgaaaagtgtCCTACTCTTAGAGAGAT
TCCTTTATTATTTTCTAATGTTTGCAGCCCGTAGAGAGACTTTTGAACGT
TACAAATTACAAACTTAGCCTTCTCGTCTGCATATACTCTGCATTCATTT
TTGCCAAAGCATGTACCCCTCTTCTCCTGGAAACGAACTTATTGAACTTA
CCGGATATCTACTTTAGACGGAAGCATACAACACGAAACGGCCACAGAAA
AATACAAAGAGTCAATAATTTTGAACAAAACTATCCCGTTGGTACTGTAA
TACTAGGGACCGTTAGCATCTAGGACGGCAACTTGAATGAGGACGtgaag
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AATATCACATTGACAAATTCATTTAAATGTAGtcaagtttttgtaaaaaa
tgacgttataaTTCTCGAGTGATTCATATCATTTAAAACTCTTCCTTTAC
CTTCTTCATCCCAAAAACAGcgttaaaaaagaattttcaagacGTCTTGA
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GAAAATTGATACGAAAAGAATAGAACCTTGCTACGATCCAGATATCAATC
CCTAAGAGCTTTCTTCTTGTTCAATCTTGCCGTACTTTTTCAAAGTTGCC
GAACGTATAATCCAAAATGACTTGATTATGGAACCAATGAGATATGGCCG
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TGATTATTGCTCCCTAGCATTTTGCTATATTTTATTGGTTAGGACAAAAT
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gtcagggtaaaattttcaatatttaaatgCATATTGCGCTGTTAGGacaa
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tcttcttcatagtCTTTTGAATTACTTTTCTCAGAAATTATAGTgttctg
aattatcttttcaacgatatAATGGCATGTTAAAATTGTGGAAATGGACT
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GCTTAAGAAAGACCAGTTGGTAAACCAGAAACATCAAGAATAAAAACCTG
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ATACAGAGGGGtattgtaaattgaaattttgagtaTAACATAAACTgtgt
att

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000005_pilon:2773495..2794247+

>MSTRG.1136.1.p1 ID=MSTRG.1136.1.p1|Name=MSTRG.1136.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2658bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000005_pilon:2773495..2794247+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTTACAAATCACTGGAGCAATGGGAACGTCAACGAAGTCACATGCT
GGTTCTGATGGCATTCCAACAACTCATGAACgGTATTGAATACAGCATCA
CATACGCAACAATGTGGCTTTACATCAAATCTGTTGATCCTTTGGCATCC
GATTCAAAAAATCGCATCTTCTATTCGTTAATCGCAACAAGTAAATTTGC
CAGCACCATATTGTTTTCACCTATCATCGGCAAAATAATGGATAAGCACC
GTAATTTACGTACTCTAACTCTATTCGCTAATATTTTAGCTGTTATTGGT
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GCAGGTGCAGATGGTGTTGGCTTCTTGATCGGtcctgttttaaatttctt
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ATGCTGCAGTTGGTTTCTTAGCTATAGTGTACTTGATTCTGATCATAGCT
GACGTCATCTTTCTGAAAGACATTTCGAAAGATTTGGAATTGAGTGGTGA
AAGATCTCTTTTacttgatgaagaagaagatgcgGACAAGGAAGATGATG
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GCTATTATAGCGTGTCTAACATTCTTAACAGCTTTCTTACCATACATGGA
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AAGAAATGAACATCTTCTTCCTCATTTGCGCAATCTCATCTATAATTACC
ATGGtcattttcattaaattcaATTTCACTGGAAGCACGCTATACTATTT
AGCTATCACGTGGATTCTAGcattgctgattcagcaaaactTAACAGCAT
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ATCGTGGGTGTAGCAACAACTCAGATTGTGTCAATGGAGTATTActattt
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CGCTTTTGTTATGATTTTGTTGATAGCATTCGTGTTTCGGAAGGATTCTT
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AACAACTCGTCCTATTGGCTACAGTGAAGTTTCCAGATGCTACAGTAAAG
ATGAAGTCCAATCTAAGCTAGCCTTAACTGCAGGTGCAGATGGTGTTGGC
TTCTTGATCGGtcctgttttaaatttcttcttcatcaatgtCGATATCAA
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GATTATTGATATCCAAGGTTTAACAGTGAAAGAAATGAACATCTTCTTCC
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ACATGGTGGGATGTTTAATAGCCTCCTTAGCAGGCCCttatctttttctt
tacttAGAATACGAAGTTTTATTTGTGAACGCTTTTGTTATGATTTTGTT
GATAGCATTCGTGTTTCGGAAGGATTCTTTTGTAAACCCTAAAGTTATTA
TCAATTAA

Gene-mRNA-Prot

This mRNA is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
MSTRG.1136	MSTRG.1136	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	gene

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
MSTRG.1136.1.p1	MSTRG.1136.1.p1-protein	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	polypeptide

The following exon feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
MSTRG.1136.1.p1.exon1	MSTRG.1136.1.p1.exon1	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.1136.1.p1.exon2	MSTRG.1136.1.p1.exon2	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.1136.1.p1.exon3	MSTRG.1136.1.p1.exon3	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000005_pilon	genome	sc0000005_pilon:2773495..2794247 +

You are here

MSTRG.1136.1.p1 (mRNA) -