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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000084_pilon:886459..897596+ Legend: exonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.11578.1.p1 ID=MSTRG.11578.1.p1|Name=MSTRG.11578.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=11138bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000084_pilon:886459..897596+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
aatggAGAAGGAAAGTTGGAATGATGCTGTATGTTCCAAGTTTGGGATTG
AACATCTGAAAGAATATCAAATAGAGGCCATCAATTGTTTAATTCAGCAG
AAGAAAGACTTATTTGTGATCCAGCCAACTGGCAGTggcaaaagtttgat
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GACTGCTAGAGGTGACTCTGCTGATGTGGTTGAGGTAATTtgggtttttg
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tataaaaacttcaaaactagGCCTTACGCTAAGTATACAGCAGAAACAGA
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CTATTTCCAACAGTCTGGAAGAGCTGGAAGAGATGGCCAGAAAAGCCAGG
CTATTATCATCAAATATCCCCATTCTTGTGCCTCTCCCAAGATAgataaa
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ATTGTTGTGATATTTGTCAACAACAATGTTCATGCGGAAATTGTGATGCA
ATATGTACTGTACATGACTTAGTTTTATTTAAaccaaatgaaaaacaaaa
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ttttgcttagtattgatttgtttttaagagtgttttagaatacttttgTC
ATATACTTTGCAATATGATATTCACTAGGTAAAATTCTCATGTCAGGCTT
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GTTATATTTTTTAGTAAATATCAACATTAACTAGACCAAAGAATACAAGA
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AAGACtgcttttaaagtattttatttttatagaaatatgTTAACTAAATT
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CAGTGAAACACAATGCATGCTATATCTATCTGGATAAGTCTAAACACAAA
GCTTTTGATCTTGATTAATAATGTAAAAGTAGTGTCATTTCAATTATATT
CATTGTTATTAGACAAGTAgtgcaaattaaaaaaaaaaaattaaattgtg
gTTTGTCTTAAATGCACCTTGTCAATGGGTTGATTAGTAGATTAGattat
tataatataaatatttgttctagaaattattaaaaattttgtaaattgta
taaaaaaggagaaaataattAGAACTGTTTACCCAaaatgaagatttgaa
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CTTTCTTGCTGGCTTTTAGGATACTTTCAATGGcccaatttttaaatttt
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GTGTTTTTTGTCTTTCTCCTTTTGAAAtagtttcttttctttgtaCTGTT
CAGCTAACTCTAGCACGTCCGCCTTCCAACTGGGAGTGGTATGCCTCCCA
GATGGTTCTTTGACAGAAACCTGCTCGTCAAAATTAGATGCAATACTTCT
GAGCATATCATAGCTGCTACCAATTCGAAGAATCGATTTCTCTGTTATTG
TTCCCCGAAAtagtttaatttcttcttttgccCACTTGTTGCGGTGCTCC
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CGCCCTGTTCCAAGTAATTTCATGGGCCAAAGCTGGTGGCAACAGGTCGT
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GTGAGTgtgaaatataaaatgaaatatttatgGAGACGAATAATCCTTTC
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GTGCAAGGACATTTTTTGTGTAGTTGGGTACACTGTTGGTTTGTTGGTGT
GGTCCAAATTCAATTTCCTCTTCCATTTGATATGCAGGCATCAAAAATGT
TGTTACCATACCATCGCAAATCTTGTTGTAATTCTCTTTGGTTTGTTCAC
TGGCAATGATATTGttattgtttgataaaaaaaggtcGTAGGCTGCCAGT
AAGATTGCTTCAACATACTTCAGAAGCATTTCTTCTGAGGCATTGACACA
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gctaaaacaatttttaaaagtagTTAATCTTAGTTTTAAATCCTAATCTT
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AAGAACTAAATAACTCAAAAACAGACATCTCATTTTTAGTTCTTTGGGTC
AACTTGAACTACTTGAGATCGATTGAGACAGACTGTCATACAACAAGGAA
TAAGCATGATAGTCAGCAcagttgaaaagaaaatactaTTTTTCTCTCAC
TTCTAACATGTTTCCAAAGGTATGGAAATCAGCAATGCCTGGCACCAACC
CTTCCAGTCTTTTTGTTGCAGTACTCGCATCTTTCTGATGTTCAATTCCA
TTCAACATCCTTTCATAAGTCAATAAATCACCAATGACGATTGTTCTTAA
CATATCTGGCGTGTCATGTCCAGGAACAAACTGATGTATCTCCCTCAATA
TCTTTGTTATTCCAGAACTGGTGTTCTCATTCAAATCGTGGACCCCCaaa
gaaaactaaaataaaaataagatgtATTCTACTTTGTCTTATTCAGCGTT
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CAGTTTGAAAAACCAAGATTCAGTTTTGCATTTAAAGCTTAAAGTACATA
ATGGCCTTGGTGAATGGAAATAAAAAACTCTTAGAAAAGATTCTTACTGT
TGTTGATGCAGTTTCTGTCTCTTTCATATACTTGTGAGTTATAACCTCTG
GTGTAAACTTCTTCATCCATTTCAACTCGTCTACATATTCTGCTAAATCC
CTAGCCACCAAAACCTTCAGCTCTTCTTTTAGATTTTGCTCGTCCGTTAT
GTTTGGAATATATTTAGTAAGATTGATATCACTTGCGTTTTGTATTTTGG
TCGCTGGTACACCAATCAGCTCTGCAGGGGTATTTACTCTGTTTTGGACG
GCAATGATGTGTGTAAGATGTCGATCTacgtttttttttccaattgtCAT
GTGGCGTCGTTTACTATTTACATCTAGGTTGTCAAGAACTATGATGAATT
TGTTCCAAAAGCTAAAAAAGAGTCATTTGTACATACATTACAGTCTAAAT
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TCTTAGAACCCTTCCCTTCTTAGCTGTCCTTTGAAAAGTAATAGGCATTA
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tctttaaaaattgaatCTATTCACCTTTTAAACGCTTTGAAGAAAATATc
cgttttgaaatgaaatttaacttGAGGGTTTGTCACCACCATttgtgttg
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TTCCATctgaattgtttttttcagaTACAACAGCTGGCTTTCCAGTTCTT
TCGCCCATTCAAGCACTGGGAGTTTGTAATCTTCACCTACAAATAAAGAG
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GGTAGTAGCCTACTATCTCTTCCAATCTCAATCACTCACCAATTTTTTCT
TGAACTTTGTGTGTTGTAGAATATGACATGCATAAACTCAATTTGTGCAG
TCGCGCAATACACATCTTGTCTGCTCTCCCTTTCCTCAATATCATGCTGC
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gtttcttccTATCCTAGGGTTGATTGCGATCTTCTGCACCACTGTGTAGA
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ttttgtAGAACAAATTACGGTGTAGACTTGTCCTAGAAAAAATACTTATA
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ATAGTGATGTGAAACTCTTTATAACAACACCTTACCTTTGAAAGGGCTCG
TTTTGTCTTTGAATATTGAGGAAATTTCGTTCGATATtactttctttaat
ttcttcaGAAACAGCTGATTCATTTTGGATGGTTCTTCTTTTTGCAGGAC
ATGGTACAAGGCTACAATATTTTCATCTCTTATAAATTGTATCAATTGTT
CTTTGATGGCAGGTGTCATGACTTTTCCAGGGTTTTGTGTTTTCTATTAA
AAAAGATGGTTTGTACATTCTGGTCATTTCCTTTTTATACTGACCCACCT
GAAATATATTTTCCTCTCCTAAGTTTGTAAGGCTTTGTAATTTCTAAAAT
AACCTTCAGATTTAATTAATTTCTCATTTGAtgtatttgatgtattttta
aagaaatattataagaaAATTCCCCAAAATCACGTGAATTTGAACTATTA
Aactctgaattaggatcctaacctgagaatgctgtaagaatattttagga
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GCTTTATaccattctcataaaaaagccaTTTCATCCtctttcatcatgga
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ttaagcataaaatggcattatTGTGAAaggagccttacttgggggtaatt
gacaattgaaaattgaaaatgttctaaaaatggcattcttagcttgagta
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attattattatcatgGACATTcctataaagtgtattcttataaaaaagcg
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TGTTCAAAGTAAAGTCATTAACAATTCTAAATTTTCACTCTCCCTGCAAT
TatcatttaattatttttctttgagaCAAAGTATAAAAAGATAACACAAT
TGAATGATTGGATGTTAATGATGTTAAAAATGAAACGGTTGAAACTAATG
GCATATAATGATGAATCTACTGTCTATCAGAGGTAAATTTTTCTCAGTAC
ATTAGAGCTAAGATGTAGTGGTATTTAAGAAAATGAACTTTTGTttagta
aattttgttttacaaaatttggtcaaaaatggcattttgaaTAAACTCTT
TTGctgtggttttttttttttttcaggtggtGATGCAGTAAGACGGATTA
TCCTTGGAATTTCCATCAGAAAAAGCCCTTAAAAAAGAACACTTAAAATG
AAAGCTTCTTAACATTTTGTTATTAAATTTGAACGTTCAAAGTCTATTTA
TGGTTGGATTAAACTGTATTTTGAAAGTCAGGCAGACTACGTGAGTATGG
ATCAACTCGAAACAAACACTATATCACATTTTCTATCCCTATTTATCCAA
TGATTATCTTACTTttattattttgcaattttgtcaaactttaccaaatt
ttatttctgaaacaatgaaatacTTCTTGAATTACTCTGCTATAATAACT
GTgatcttttgacaaaaaaagagcCTTTTGCTAGTGAACCAGATAACgtt
tttaaataataatttCTCGTTGATTGACGTTTAAATGATAAAGATATTCT
TATTGAATAGCAcaattttacagaaatttcttttcatcttcCCTTGCTTC
TTGTATTTTCTATTTGATAAAACTCCTCTCCTATTTGGAGACTGTGTGTC
AACAATTACCCCCAGCCCTTCATGTAATTTATACCAAGAATATACAAGAC
CATATGGGATAGACTGCTTATTAAGAATGCTTAATTTGtcatatacactt
ttttttataagaaccagtaaattttttctgaggctcggctgctcttattt
ttttggcactttaagccttgaattgttcttattttttccttattttttct
aaggtcaaaaaaaagtttactatttagaggattttagaaaccagtgattc
tttttgttataactatatattttcattatctcccacatcccttatattca
tataatattatatcattatGACCTCTCAATTGTGGAAACtactttttaaa
atactttcagCCTCTTCACTTTTCTTACATTTTTGTGC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000084_pilon:886459..897596+ >MSTRG.11578.1.p1 ID=MSTRG.11578.1.p1|Name=MSTRG.11578.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1323bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000084_pilon:886459..897596+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atggAGAAGGAAAGTTGGAATGATGCTGTATGTTCCAAGTTTGGGATTGA
ACATCTGAAAGAATATCAAATAGAGGCCATCAATTGTTTAATTCAGCAGA
AGAAAGACTTATTTGTGATCCAGCCAACTGGCAGTggcaaaagtttgatt
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TCCTTTGACCTCTTTGATCAAAGATCAAATGACAAAGCTTGAAGCTGTAG
GTATCAAATCTGTTCATTtgatgtcaaaatttgaagaggAACAAGAGGTG
ACTGCTAGAGGTGACTCTGCTGATGTGGTTGAGTATAAAAAGATAACACA
ATTGAATGATTGGATGTTAATGATGTTAAAAATGAAACGGTTGAAACTAA
TGGCATATAATGATGAATCTACTGTCTATCAGAGgtggtGAatggAGAAG
GAAAGTTGGAATGATGCTGTATGTTCCAAGTTTGGGATTGAACATCTGAA
AGAATATCAAATAGAGGCCATCAATTGTTTAATTCAGCAGAAGAAAGACT
TATTTGTGATCCAGCCAACTGGCAGTggcaaaagtttgatttttttttcc
ctTCCAGTGATAAAAGAAGGGGGTATAGTTTTGGTCATCTCTCCTTTGAC
CTCTTTGATCAAAGATCAAATGACAAAGCTTGAAGCTGTAGGTATCAAAT
CTGTTCATTtgatgtcaaaatttgaagaggAACAAGAGGTGACTGCTAGA
GGTGACTCTGCTGATGTGGTTGAGTATAAAAAGATAACACAATTGAATGA
TTGGATGTTAATGATGTTAAAAATGAAACGGTTGAAACTAATGGCATATA
ATGATGAATCTACTGTCTATCAGAGgtggtGAatggAGAAGGAAAGTTGG
AATGATGCTGTATGTTCCAAGTTTGGGATTGAACATCTGAAAGAATATCA
AATAGAGGCCATCAATTGTTTAATTCAGCAGAAGAAAGACTTATTTGTGA
TCCAGCCAACTGGCAGTggcaaaagtttgatttttttttccctTCCAGTG
ATAAAAGAAGGGGGTATAGTTTTGGTCATCTCTCCTTTGACCTCTTTGAT
CAAAGATCAAATGACAAAGCTTGAAGCTGTAGGTATCAAATCTGTTCATT
tgatgtcaaaatttgaagaggAACAAGAGGTGACTGCTAGAGGTGACTCT
GCTGATGTGGTTGAGTATAAAAAGATAACACAATTGAATGATTGGATGTT
AATGATGTTAAAAATGAAACGGTTGAAACTAATGGCATATAATGATGAAT
CTACTGTCTATCAGAGgtggtGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000084_pilon | genome | sc0000084_pilon:886459..897596 + |
|
