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Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at sc0000005_pilon:2258734..2276429+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.1104 ID=MSTRG.1104|Name=MSTRG.1104|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=gene|length=17696bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000005_pilon:2258734..2276429+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CTTTGCTTTTCTTTCGAAGAGTAAGTTACTAGTCTAATAAATCGAGATGT
TACCCTATCaccaaattttatgaaaaagaacCTGCGAACCTTTCTACTTC
TTCTACCTTTTGTTttggtatatatttttcaaccaGTCAACTCTGACATC
TTTGGTGGTATTGCATTGCGGTGGTAGAAAGGGTAAGATTCTGATTTAAT
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aaGCCAttaaaaaagtcttgagtatcgatccttcgttgatccattatcga
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gattgcgttcgattgcgttcgatcgtcgattcattgaccccctgattgtt
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tcaatcgaacggaatcgacgatcgaaccagtcgaaccagtcgaacaacga
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ATAGGCTTTCAGCAGAAAAGTATATGGTTTAGTAGTATGTTTAAGTAGCA
CCCGAAAAAtgtgcacccgactgtcgggtgtttAAATTTCTAACTTCAAA
CACCCGACAACAGCACctgactgtcgggtgcaccgaCAGGGTCgtgattt
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tttttcaaagaggccaccctgttgaataattatgtagtccagcagaaaaa
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ttttgttagatctgacaaattgatgtttgtaagtgcactttatagttttg
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GGATATAGAGATATAGGGTAAAATAGGGAGCGTTTAAGCCTTATGGGAAA
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TTGCAAATAAAACCAATACAGTAGCAATATCATTTTtaaaacctataaaa
atctataaaaaaattattaaagagggtgaagcttctaaaataaaaaatct
tataaaaaatcaaaaaacttataaacaagcttatgttaaaacctcaaaaT
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ctcaaccaaatcgaaattgaaatcGAAAACAGCTCCATCACGATAGCTCC
CTATTTTCTCCCTAGCGCCCATAGTGTCCCAAACCTATTTTCCTCTAAGG
GGtctttgacaaaaaacttttgattttttatcggcattgggctgataagc
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GAAAACACAATTTCCTCCAATCTTGTCCGCCATCGCCTTCCCACACGTCA
TCgttgaatttttgtctatttgagtttgttcatacccgcattgatattgt
taatcaaaacaaaagttaaaatgacgagatgaagtcgcaacatttcgaag
gaaaaggcaGCGCactggccaatgaaaaaagagttttttatcaaagctat
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GAcccctccccccacccccTTATcagcccaatgccgataaaaaatttgtA
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AAAATAGGTATCCTACCCCAGCTCAAActaccaaatgcaagcaaccttgg
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CCTAGAGAGGGTActtatctaaaaaaatttttgactcaTACCACCCACCC
AaataagtacccgggtacttaatgACTTTTCCCTTCTAGACCCTATaccc
acccaaaaagtacccAGGTACTTAAGGACTTTTCTCTTCTAGACCCCATA
ccaacccaaaaagtacccgggtacttaaggACTTTTCCTTCTTAGACCCT
AtacctacaaaaaataaatttattacttATTAATCTTTCTCAATTCTACA
CTCATCAAAATTAAACCCACGCTTATAactgttaattttaattttccttt
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GTATATTGATTACCTTATATTTTAAACATGAAAACAGATGAAAACAATGT
AAAAGCACTTTTTCACAATCTTACAAAATCTTACaacagttttaacaaaa
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CACTTTTAATCTAAACTCCATTTGTTATACTTCATTGAGCTTTGTTGTGA
GTGCCCACCCAGAATGTCTTAGAGAAGTTATTATCAGGTCAAAGCATGCA
ATCAAGCAATACCTATTGTGGtaaatagaaacaaaataatataatacgaa
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gAATAAAGAAGTAATCCCACAACTATACTGTAATAACGTAAGAAagcttt
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TTGGCAGAATTTAGGTGACATTATCtcgcaatatttttttgaaaagctgt
aataagtcagaaaaatgaaagaacaaattcaaaatgctaagaataaaatc
atgcttaaactttcaaaaaacaaataatGTAAATATTATATAGTCATTTA
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aaCCCTAAGTTATTAATAAGAAAGTACCCAAAACTAAATATATGGGAACA
GTTTTCAGGTGCTGGATAGTCTTATAAAGTCTATTTAATAGATTTAACAT
GGGTTTTCTCCTTTTCAGAAATAAATGGTGTGCTAGGCATCAAAACATCA
TCATGCTTGTCCATATAATGTTTCTCCAAATTGTACGACCAAACAATAGA
TTTACAGCCTTTTTCAGGGCACCCCTGTGATCTGTTGGTGCATGGATTAG
TCTTTTTGTTGAAGGTTTTTTTCCTGCCATAATCTGAAAAATACGGGCAA
TCGCTCCCGTCCTGTACAAGGGAGTAAAAGATATTGCCACTTCTTTTGCT
TGTTTTGATGTTTACAACACAGCTTCGATCCTGTCCACAAAAGCCACACG
TTGTTGCAGAGCCAATCTCTCCTCTGACGGTATGCCCTCCGACGTGGGCT
CGCATGTCTTCTAAAGGCACTCGTTTACGACACTGGTAACAGCTCTTTAT
CAGCTTACCATTATTCTGACTAGGTCctgattttaaaattaaaaaaaagg
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ACATTGAATATTAGTAGCTTATTTATCTAAATCAAAGTGAGAACAAAATA
GTGATGTTGCAAAATGATCTGGCTATTACCTTGCTCTGCAGAGTTTTGAT
TGAGAATTGAGAGATGAACGCCCATATCTTGAATCAATTGCTTATCAAAG
AAATAGCCTTTTGTATCCTTTGGTGGTTGCAGATCCAGCGTTGGTTTAAT
TGGGATACAGCTGGTTCCAGGTACAGAGAAAGCGGTCCCTTCAAAGTTTC
CGTTCCAAAAGAGTTTACCATCCACTTCAGTCAATGTTATTTCCCTTATT
TCAAGGAGAAGCAAAGTCATTTGAGAAATCTCCTTCTCAGTCAAATCAAT
TTGTCGAATTGGTTTGCTGGCATTCGTCATCTTGGTGATATTGCCAATCA
AAAATTCCCCTGATTGTTTGCTAAAAAGTACCGGGTCTCCAACCAATAAA
AGGTTGTCACAAGTGGGTGTTGCTGATGCTTGAGCAGGAAAAGATGAAAG
ACCTTGTATACGTCTCAATCTATCTTTTGACAATGGTTCCGACTTGAAGA
TTTTGGTCAAGCATGTggttttgtaaattttggaTCCATTGTCATCAAGG
AAATAGGGCAATGCTTTCGTGTTGACTGAGCGCATTTCCATCAAATTTTC
TTCCGTTTCATCATCAAACACTTCATTGATTTCAGCTGAATAAATGGATA
TTTTAGCAGGTTTAAGTCATAATTGAATACTAGTAAATCATTATCCTTTT
TTCATCATAAGATCATTGGATAAGATGGTTAAAAcatcaattaaaatatt
ttaagagtTTTGTGTAACTGGTGATCATAAGAAAAAACGTGATAGCAGAG
AAAAAACTAAATGTGGTTAAGAGTGGAAAACAGGCTGAATGCTAAATTAG
ATGAGATAATAAGTACAATCTGGTACAATACATATTTCAAGTTAATTCga
caaataaaaaatagttGGAAATTCACCTTCAGTAGCtacttcatcatcat
catctttgcTCCAATCAGCTGTAAGAACATTGACTCCAACAACATTTGCT
GATGTGAGGGGCTTCCGTAGTGTAATGGATTCCTTAAGCTCCTCAATTTC
TTCATCTTCTATGCCAATGGCTGCTAGTTCTGACAGGGCTAGATTGTACC
CACTAATCCAAGTGCTGCGTACGTTCAGATCTTTGCACAAAAGCTTTTCT
TTTTGCCAGTCCCTTGGATTTGAGTAGTCCAGGCATAGGCGTCTTTGAGT
TCTCCCCTTTTTTGACCATTCTGGGTGTTTGTTGGTCAAGATGTCATCAC
AGGCCAAAATCCCCTTAGCTAAATCAATCATTTCTAAACAGTTCATCCCT
TTACTTTTGTACTGCATTCGACAATTGCCAAAGAATCTTTCAAGAGGGTC
GGTTCCATTCAAAACAAGATACAATGGGGATTCTGGAAAAAATTCCTTTC
CTTTGGCACATGTGAATAATGCATCAATAAAAGTGCAAATCAGGTCGTGG
TAAAGTTGGGCAGGCATCAGTTGAGTCTTGAATTGTCGGTACAGAAACAT
AAGCACATAAGCAGCTTGGGAGAATGCTTTCAGTTGCTCTGCTAACGAAT
ATTCTATGTTCACAAAAAACGCAAGAACTCCTTTAAATACTAAGCTGAGC
AAGTAAAGTTCATTCCTTATCGGGAGTAAGGCATATGGCAATGGCTTTTC
ATTTTCAGGTGAAACTGCTTCAATGAATGAAAGAAGAAAGTTTGATGCTG
ATGGAACGTTTTGTTTGTCCTTCGGGTAAAGGAGTTGTTGTTTGCTTTCA
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AACGATTCTCAACACCTCAACGCTTGTGCCACCGAGACACAACAGAACTC
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GACGCTGTTTTATCTACCTGCAATGCAAAACTACTTGCATGgcaaatatg
agattctaaaatggccttgtaaaatgaagttttctaaaaagattcCTTTT
TATCGCAGATAAGATTTAATTGGAAGagcaaaaatgaataaaatttttgt
gaatttcaattttgtttttatttcatttgtgcaaaaagaacgtcaacatc
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TTATTATATACTTATTTTTTGTAAACTACCTGCGGGCTCCCATGTCGATA
GATAAAATGAATGTAATAAAAGCTGACAAGCcacatagtttgcacccccc
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ggtaccgagatctgccgaaaaaactagggggatgggaatagtagggggga
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CAATAGATAATCAACTAAAGGGTTCCCATCGTCCCAATCGCATTTGctta
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AAAGGTACTTCATCAAAATTATCTTATATTTCCTAGTAATAAACTCTTCC
CTGTTCTCCCTGGTTCTCCGGAGTATTTCAGTATAAgttataaataattt
tctagTGTCACATATGATACAcatttttatctatttaaaaAGCCAAATAT
TGAATTTGGGAATTATTTCTGTTTCATCTTAGATTTAAGTCAATACAATT
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TTGGCGAAGGTGTGCATTTTTGACTGTTCTGTACTGATTGCTTTCCAAAG
TTTTGCAGTGCTTCcgaatagatttatttttgtgttgCCCAACAAAActt
gatataaaaaaaaagctttttgaaaatgctACAAACTCTGACATCTGATC
AGCAGACTTACTTTAAAAACCATGGTTAACCAAAAAAGCCAGTCACAAAG
CACTTGAGTGGGGATACCCTTACACTCTTTGCATTGATGTTAAATTAAGA
GATCGGAGCCCTATTTATTGTACAATCAATATCACAAAGTATTAATACAC
AAGTTGACTTGAATGAAAACTTATTGAATGtaatttattatatttttttc
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TTTTCAGGCGATCTAGAAGTGTCagaataaaaaactgtttgcCCATAGCC
GCCAACCTGTGGCGCCGCTCCTCGCATCCTTTGCCACTACATCAtggccc
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atttttctattataGGGTATTCCAAGTTCAGCTTTGCGAGAAATCTGTTT
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ctaactgaaaaaatccttcaatttaaccaaatttttatgctgtttttcta
tttatcaaaatttttatccaattcttttattgcaagtaaacattttatat
ttttagactTTATGATGTAATGCACAGTGAAAAGAAATTGACAATTGTAT
TTGAATATTGTGATCAGGTAAATTAATGATTATAATAGTTAATATAGAAA
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AACAAACTGAACTGAAGATTTAAGTTTGAATTCTCATCAATATGAATTTT
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tcgaatgaaatgaaaaacttaCCAAATTTACCTTTCATactaaattaacc
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tttaacaataaaacagAGGGTAACTCAAAGTACTACTctagaattctaaa
aattttggggttACCAAAATGACTGGGGGTACCTAAATTTTTTGGTGGTA
CCTGAACCCTGGAGGACCctatgatgaaatttaatgcgttatgcattttt
gctaaacgctatattttctgactatttgttttatttttctccttattgct
atctaactttcatcatcaggtaggtccattcagcatgtaccTTGTTTCAC
CTGACTTACATAAATATGAAATCTTTTTTACCATTTCTTACAATTTCAGG
ActtgaagaaatattttgacaGTTGTCAAGGCGAAATTGAACCCAACGTA
GTAAAGGTATGTACCATTTATTTTGAACTGATAAATACAACAAATTAAAG
TACTCCAGGTTGGCGACATTTCGAGCTTCTTCCTTAATATTTCTCaataa
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GTACAAAATGAAACTTACAATACGATATTAAGTATAAGACTAAAAACGGA
CTGAATGAATTCATTTTGTTTTAGTCCTTCATGTACCAGTTGCTGAAAGG
GTTGGCATTTTGTCATGAAAAACATATACTTCACCGAGATCTCAAACCTC
AAAATTTGTTGATAAATAAAGTAAGACCTCAACTGTAACATTTTTTCCTT
CTcttcttgaaaattaaaaaaaaggttcTCAGCATATACATATCCTGATA
TTCTTCTTCAACTTTTAACGTAGAAACCAGTGTAGCAACATTTCCATCTG
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TGGGTAATCTGGGTAACTCGTTGATCTCGGTTTTGTTAAAAGAATTAACA
CAACAAAAAGGAATGCTTTTAAGAGGTTCATGTTGTTGTAATTGAATTAT
TAtttttttttgaagacaggTGAACTGAAGCTAGCCGATTTTGGATTGGC
AAGAGCTTTCGGGATACCTGTCAGATGTTTTTCAGCTGAGGTAATTTTTC
ATTAGATTTATTGATTGCCATAATTCTCCTTGGAAATTTTATTTACATag
atatattttctttaaatagtATTGATTTACCCTTCAGCAAGAttttttct
aacaatttttatctacaatttttaccttttcttttGTAGGTTGTTACATT
ATGGTACAGGCCACCTGACGTATTGATGGGTGCCAAACTATACACAACTT
CAATCGATATCTGGTCAGCTGGCTGTATCTTTGCTGGTTCGTCAGTCTTT
TTATTAGCAATTTTGAGAACTCCTTCCAAAACCAAGTTCATCTCCATTAT
AACATCcattatataaaatttttcagaCGTCTGCCAGATTTTAGTTCTTC
TTGAGAGATGAAAATAAGATGAAAAagtgtttttgtttaaaaataaagga
TTGCAAATCTATGAGTgaaagtagagagtctatcaccatatttccctaac
atcCTGCCTGGAAGTGCTTGAGATTGGAACACAGTCAATTGCGGTGCAAG
GCTATGATcaaaaccttcacactaccaatcggcagaatgtgaatgtatac
cgagtttatcgttctacatctgcaattttagctttactaagctcatttga
cgtcaaccgatacttcgattatcagccggattgagaGAGAATGACATGTG
TTACACATCTTGGTTTCCTATTGTCAATTTTTCAACTCCAAGTTTTATTG
CTCCTAGTGTCTACTTGACTGGACTCGACGttacaaaaattatcaaaagg
caaagttcagccagaaagTCTGAGATTACTGATGATAAGATCAATGACTA
GATATTGATTAAAAAATGCTGTTTTTTCTCCAGAAATTGCGAATGCAGGG
CGTCCTTTATTCCCTGGAAGCGACGTCGATGACCaattgaaaagaatttt
cagGTTTGTTGTATATTGgtacttacaaaatataaatggTAAAAAGTTTG
ACTGTCTTTACAATCTTTGAGACTTGGTTTTTCGACCCGAAAACACTGCT
CTAATGAATATAATTGAAAGAGTGTACGTATATTTTCAGGAGGTGGGCTA
CTGAGGTTTCGAATCCAACTCGTAAAAGATAAACATCTTTATgacgaaaa
taaaagaaacttttcaatattaTGTCCGGTCTAAAAGGGTCAAATATCAG
TCAGTTACAGTTTTTCTTGATATCATTGACAGTTTGATATTTTAATTTAT
CCTTTTAGGTTATTAGGCTCTCCAACAGAAGAAAATTGGCCAGGAGTTTC
AAAATTGCCGCTATATAAGGTATTCCAAATCTCCTCTACACATTTTTGAA
TCGGTCTGAATCGGTTCAGATTCCATGAAATAACTTTTAAAACCAACCAT
AATGTGCAATCATCTCTCTTGAATAGAAAAGGTAcaactaaattttattt
ttcaacaaaaaattcatcatttcaATCCATTAACTATTATCTACTGTTAT
CTGGGCCTATGATCCTAGATAAAAATCCGACTCTCATAGGCTGATTTAAA
ATCTTTGTTCGGTAGTCAAAAAAGAGGGTTAGACTATTTGGGtcttttca
tttcataactTTCATGTGCATGATGATATGAAAGTAGTTAACAAATAACC
GGATAATTCAGTTTAAATTATTAGACCTCTcttattttcattctttttct
tgtttttaggAATTCAATGTACCTCAGTCAGTCTCATTACATGCAGTcgt
tccaaaaatgacgtcatcagctaaAGATTTGTTACAGGTAGGACATTACA
ATGTAATGGACATTGCGCTTAGTTTTTGCCATCCTACTAAAATTTTATGG
GTTATTGTTATACTGGGTGcaacaaaaaaaagtatacaggtttgtcgaag
TATTGTGAGTTTccggatttaaattttttgttcattatttttttatcgca
tagaggatgctctaacttgaattttgagctatcatacataaaatttgaaa
acgtagttaaaaaattatttaaaaaaaactgacttttttttatgtcgaaa
tttcaaaaaaatcattaaaaacagcgagcaaacttttatcttgacactta
ccttctttacacataaaaataccaaaaaaatacaTCGGTGTTCATCGAAA
TTCCTTACggaatttaaaaatatggtaaaagaagctattcccatgtcgga
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tgtgagaaaacttttaaaaaaataaatcatcattcctcgactagttgctc
aaagaacttgggtctgcattgagttaaCTCGTGTTGTaaatgttcatgac
gtgcaaataagatagagaaactgttggcaaaatataaataagaaaaaaaa
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ccggtggggtgaaggtcctataaattcacctctgtccgttcatccgtccg
tctgtccgttcgttaccagcttttctcgagattgaatcatagaaatcatt
tgatttttggtacaaaggtgcaaaacagTGGTGGTCAAAATGTGACGGat
cccgattttcgaaaaaaaaattttttgggcaaatttgggccaaaaaacgg
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ttataagaatcactattaataagcatacatcaatgttcttagtcaaatta
ctcaatttctttatgagatagaagttttttttgctcatgagggcttactt
ttgaagaatatgtgtgtttagacatgaaattttggttgcttgtcgtgttt
ttataggaaaactggccaaattcgatatttttttataagcacattatatt
aagtattagcttttctcgagattggctctttcattctttatgattttttg
cacaaagatgcataactataaaccctcgaatgtgactgagcccgattttc
gaaaaaaatgtttttgggcaaatttgggccaaaaaaacggctaaaaaaag
ggttttttggactttgtgaaatactggatcgttgttttttttctgatttt
tttgcatgaaagtaggtaaaagatgggtcaagtagatatttgtaaaaaaa
cttttcagctcaaaaaacgcatctttatctataagaatcactattaataa
gcatacatcaatgttcttagccaaattactcaattttttgatgagataga
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ACAGATGCGattaatttattgaaaatattaacTGGTCTAACTTTTGCATG
ACACTCCTCCTCTGCCCTCTTCAATCCAGTGTGATCGGTGAGTAGAGGGA
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TCTTTTCAAATCAACAAGGAAAAGATTATCCACTGATCAAATAACCCCCT
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ccttcgggctttataaatctacgAGATTAAGTAAGACATTCTTGCGGGTA
TTAACGTACTCTCACGATTTGTTGTAGAGCTCAAGGATTCTATAACAATC
TGTCAAACATTAACATCGGAATGATCTTATCACGTTTCATCCATAATATT
TTTGGTTTGAGCACATTTATTTTGCGGCGCCAAACCCCGAATGTATTTTG
GGATTAATACGATAGGGATTTCGAAAGGTGAAACCGTGCATGTTAAAATC
GATCCCTTTTTATCACGAATATTATCGCGAATATTATCCATTTGTTTACT
CATGGGTTAAGTCCCGTCAAAGCGTCACCTTTCAATAACATTGCCCAACA
TTACATTAAAGGAAAATAGTaaattaatgaattttttttatgtttagtac
tagtagaatttttttatccttgGACATAGAgattatttatttgaatttta
cGGGAAAATATATCCGAACGaaagataatttttattattactttttcaat
ttttgagaacACACTCAAGCTAtcaatagcgagattatgtatctggaatt
ctctacggctacggctaaaatggcgagggaaatggcgagtaaggca
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000005_pilon | genome | sc0000005_pilon:2258734..2276429 + |
|
