|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000080_pilon:158880..163787- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.11143.7.p1 ID=MSTRG.11143.7.p1|Name=MSTRG.11143.7.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4908bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000080_pilon:158880..163787- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CTCAAATATTCGATTAGAAATCCCCCTGATGTGTTTTATCTCACACGTGT
TTACACAAGCAGTCTGGGTACTAGCTACTTAACACGTTATATATACAGAG
GATTTGCAAGACAGACATTCACATTGTTGTTGGTATTTGTCGTCGTAGCA
TCTCATATTTTCGCAGAGCTCTTTATTCATCATGAATAAGTTTATAATCA
TCGCTTTGGTAAGTTGACTTTGAATATGGCATAGGGGATAGAGGATATAA
CATTTTTTGGAAATTTACCCCGCGGACAAGCATTCCTAGACATTAGCCTC
AAACAGAGCAAAATTACCCCAAACAGAGCAAGTTCACCCACCGCAAGTGA
ACTTTCAAAATCTGCAGCAAGTTTGATGAAATATTTGAGATAAAAATCTC
ATTTGCTCAAAAGTGGGGAGGCTCAAGTCTCTCCAGTCTCCCCGCTTCCT
TCCACCGGGCCTGAGAATGATCTAAAATTGGATCTTCATTTTTTTTTAGA
GTTTTATCCTTTCATTAAATGCAACTTTTCTTTTTATAATCAGGTTGGTT
TGGCCTGTTTGGCTTTGTCAGAGGCTAGCAGTAAGTAGAATTGAAAATTT
GATTTCATGTCGCTTACAAACACCCCTTTAGTGTAGTGGCTTGGCTTGAA
AAAATTCATTTTTTCATTTTTTATATTTTCATCTTAATTGCCATCATAAA
ATACAACTTTGGGCCAAATATATTTTGAATTTCCGGTTATGACATCATCA
CTAAAATGGCCTAAAAAAGAGTATTCCACCGATGAAAATTTAGGGGAATT
TTTTTATGTGGTTAAAGGATACTATAAGGAGGTGCAAAATTTTAAGCCGG
GTTATTTTGAATTTCCTACAAAGAGTGCTTTTTTAGCTGGCACGACCATA
CTACCTTTATGAGTGACCAAAAGAATTTTGATTCCCCAGGTTGTCTATGC
ATGAAAGGTTAGGATGTGTGCCGCCCTTAAAAATACCTTTTTGGACCTGG
AAGTCGTTGCAAGGATTGAAAGTTTCAAGTTTTTAATTTTTGAAAGATTG
AAATTTTGTTAAATTAGTCCCAACAACAGTCGTAAAAATTCACAAAATTT
TGCAACATTATTTTTCATAAAAACACGCTATACATTATTTTTCAGAATGT
AGTCCAGTTATGTGCAAAATGTTTTGCAAAAATGGATTCCAAAGAGATGC
AAATGGTTGTGAAGTCTGCAAATGCAATCGTAAGATCATTGATTTCAAAC
TCCGAATAGGCAAGACCCGAGACTCTTGGATGGGAAATGAATCCACTTAT
TTCTCATCCAAAATGCGTGACCCCGTGATTTTTACATAAACGCCAGAAAA
GTTTTCACGCACCTGCCCACGTGAGTACGTTCGAAAAGGTTTATTGAGGG
GCATTACGCTAAGGTTTGTAACAACATCTGCATGGATACGAGCGCTTACT
AAACTTGCCTTTATTTATAGAATGTCCACAACAGCAATGCCGTATGTTCT
GCAAGAACGGGTTCAAAAAAGATGTCAATGGATGTGAGATCTGCAAATGC
AACGGTAAGGGAATAACTATTTAGAATTGATATTTATTTAATGGATGCAC
ATCCTGTTTTATGGGAAATACGAACTTTAATATACCTGAGCTTTGATTGG
ATTTAATTTCGCGAGCCAAAAAATCACGAAATTTTCTGGATTTATTTTGA
CGAATTGGCGTTTTCAAATATTTCACGTTGTATTTTTGTAAAAACGCAAA
TAATTTTATCTGATTTAAAGTATGTCTCAGTAAAAGATTTCAGCCTATGC
TGAACTAAATGTCATCACTGTAATACTTATGTAAACAGCGTTAGTGCGTT
GATTCGGTAAGCGGCAAATTGTCATCTTCTTCTCATTCTTCGTTCTAGAA
TGTCCAATGCAAAGGTGTCGTATGAGATGTGAATATGGCTTCAAGAAGGA
TGAAGAAGGCTGTGAAATCTGTGAATGCAATGGTACTAAAAAGATCGATT
TTTTAACAATTGTACCTAACTTCTGTATTTCTGCATATGATTTTTATGTG
ATCTTAATAGTTCCAGGGAGGGGAGAGAAAAAAAATATTTTGGGTTCCAA
ATGTCCTCTTATGCAGTTTTACAGCGTAGGAAAAATTGAATTTATAATGT
TTTTAAGGGAGGTATCTTATTCTTAAGTAACTGGTGGAATGGTCGGTGGT
GACTAACATATCCCTTCAACAATATTGCAAATAAAGGAAAGGATTCACAG
TTCATGTCCTAAATATCAATTTCTTTTTGTATTTCACAGAATGCCCACAA
AGACAATGCAGAATGCGATGCCCAAATGGATTTGAGCAGACAAATTCTTT
TGATGCAAAATTGCATTAAGGATGGATCAGTTCATAAATATCAATTTGAT
TTCATTTGAAATATTCAAGGAGATCTGACAAATGCAAAAAAATGGCAAGG
TCAGAAAAATAAGAAAATGGCCCTTCATGGTGTTAAAAATATGTTAAAAA
TATTTCATAAACAAATTCAAAACTTTGCAAAATCAAAAGATTTCTGAATT
CAAGATAACTGTTTTTCTCCAATTTTATTTCAGAAGTCGCCCCAATGATG
GACGAAAAATGTCCAGAAAGACAATGCCGTATGTTCTGCAAGAACGGATT
CCAAAAGAACGCCAACGGATGTGAAATCTGCAAATGTAACAGTATGCAAC
TATATCAATTATTTTAGTTTAATATTTGTTAGATTTGTGAAACTTGTAAG
CCATTGGCACTCTCTAACACTCTGCTACTTCATTCAATTCAAATGATCTT
CAAAACTTAAATAATGCAAATCTGACACTTTTTACCGAAAGAAAATCACT
TTTCACTAAAACTAAATTTTTCATCCTGACAGAATGCCCACAAAGACAAT
GCAGAATGCGATGCCCAAATGGATTTGAACAAGACAAAAATGGTTGCCAA
ATCTGTCAATGCAAAGGTTAGAAAAAAGTTTTTAAAAAATATTGTTCAAT
TTCTATGAGAAAAGCGTTCACAGTATTTTTTCAGGTTATCTAACGGTAAG
AAAGCAACCCAAATTTGATTTAGGTCCCATAATCTGACTTATGTTTTATA
TTACATAAACAGGCAACCGAACTCTCAATTATATTTTAGAAGTTGCTCCA
ATGATGGACGAAAAATGCCCAGAAAGACAATGCCGTATGTTCTGCAAGAA
CGGATTCCAAAAGAACGCCAACGGATGTGAAATCTGCAAGTGCAATGGTA
TACAACTATTAAACACGCCTAATTCCAGATAGCAATAGTATTTTGGAGAG
AGGCTGAATGACATAATTCAAAGTCAGGGGAGAATTTCCACGCCTGACAA
ATAATACTTGATACAGCTCAAAGCTTCAAACAATTTTGAATTTTGAATTA
CCATCTAGCCTAAACTAGCTGTTTGTAAACCCGGGGTCTTCGAAACACAA
AAATGAAAAGTGAGAAAAAGTTGACACCCTGGGTATTCAGTGTACTGTTT
CTATATCATTTAATTTATCCATGTCAGTGTACCAACCCCTTTCCACAGAC
CCATTGGGATCCCTTCCCACTGAAGGGAAAGTCCAAAAAGTCGTCCCGGT
GAAAATTATTCTCCAATTTTTATCCCCACTGAAAATAATCAATTAAACCA
ATCCTCACTGCAAAATGTTATGCTATTTTTTCCATCCCCACTGAAATTTC
TGACTTGAAAACAAAAGAATTGAAAGCCCAAGTCATAAAAAATACGGGAA
TATCAATCCCAATCGAGTTTCAATCTGTTATTTTTATCCCCACTGGCTGA
AAAAATCCTACCGGGTCTGTGAGCAGGGGGTGTAGTGTACTGTTTCTAAG
AGGCTATTATTATCAGTGCTTGGGCAATGTTAATATATCTATATTGCATG
TTTTTTAGAATGTCCACAACAACAATGTCGTATGTTCTGCAAAAATGGAT
TCCAAAAGAACGCCAACGGCTGTGAGATCTGCAAATGCAACGGTAAGGGA
ACTGTTTAGTTGATTCAACTTGCCTGTATCACTAACCAAATAAAAGGGAG
TAATCGAAAGTGCTAAATCAGGAATAATGGAATATATCTTGCATGTTGTC
CAAGAATAGGACAATCCTAATGCTGAAAGCTCAGGCGACTCTTATATGAA
AGCTTAATCTAAATACTGTAGGACAGTTAAACTTTCTCGTTCCCAGGGAA
GTTTTCCTATAGCCACTATAGCGGAAAAAGGCCAACACGCGGGGAATGTA
AAAGTGATTTAAATTTGTTAGGTGTTGTGTATTATCTACGTGTTTGTACG
CAGCAAAAAAGCAGGTATACCCTTAAAAACACCGGAAAGATCTTGGAAAT
GCCACCAAAAATGTTTCCTCTGGATTGGAGAGAGTTTAGCTGTCCTACGG
TACCTTGGGAGGTGTAACTTGTTCTCTGCAACAAAATTACTTATAAATAT
TCTCTACAGAATGCCCACAAAGACAATGCAGAATGCGATGTCCAAATGGA
TTTGAACAAGACAAAAATGGTTGCCAAATCTGCCAATGCAAAGGTTAGAA
AAGACATTTGATTTGGTTAAATATTTTCTAAATATTCTGTGGTCTGAATC
TAGCCTAGAGTTAAGGAGATCTTTGTAAGTTAAAAAGCTGAGATTTTCTT
TTACTTCCATCTCATTCCCCTCTAAAATTTACCGTTTCGTTGAGATGATT
AAAGGAAAATTCAATCTCTTTTCTCTTTTTCAGAAGTCGCACCAATGTTT
TAAGAAGTGGACGAACTTGCGGAGTTATATAGATTTTGGCTATAGTTTTT
TTATACATTTTAGCAAATTTTGAGATATGACAAAATATAATAATATTCGA
AATAATATTAAAATTTTAATCTTTATCTTCGAAGAATTAGACTTCTTGTG
TATCTTGT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000080_pilon:158880..163787- >MSTRG.11143.7.p1 ID=MSTRG.11143.7.p1|Name=MSTRG.11143.7.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=5508bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000080_pilon:158880..163787- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAGTCGCACCAATGTTTTAAAATGCCCACAAAGACAATGCAGAATGCGAT
GTCCAAATGGATTTGAACAAGACAAAAATGGTTGCCAAATCTGCCAATGC
AAAGAATGTCCACAACAACAATGTCGTATGTTCTGCAAAAATGGATTCCA
AAAGAACGCCAACGGCTGTGAGATCTGCAAATGCAACGAAGTTGCTCCAA
TGATGGACGAAAAATGCCCAGAAAGACAATGCCGTATGTTCTGCAAGAAC
GGATTCCAAAAGAACGCCAACGGATGTGAAATCTGCAAGTGCAATGAATG
CCCACAAAGACAATGCAGAATGCGATGCCCAAATGGATTTGAACAAGACA
AAAATGGTTGCCAAATCTGTCAATGCAAAGAATGTCCACAACAGCAATGC
CGTATGTTCTGCAAGAACGGGTTCAAAAAAGATGTCAATGGATGTGAGAT
CTGCAAATGCAACGAATGTAGTCCAGTTATGTGCAAAATGTTTTGCAAAA
ATGGATTCCAAAGAGATGCAAATGGTTGTGAAGTCTGCAAATGCAATCGT
TGGTTTGGCCTGTTTGGCTTTGTCAGAGGCTAGCAATGAATAAGTTTATA
ATCATCGCTTTGAAGTCGCACCAATGTTTTAAAATGCCCACAAAGACAAT
GCAGAATGCGATGTCCAAATGGATTTGAACAAGACAAAAATGGTTGCCAA
ATCTGCCAATGCAAAGAATGTCCACAACAACAATGTCGTATGTTCTGCAA
AAATGGATTCCAAAAGAACGCCAACGGCTGTGAGATCTGCAAATGCAACG
AAGTTGCTCCAATGATGGACGAAAAATGCCCAGAAAGACAATGCCGTATG
TTCTGCAAGAACGGATTCCAAAAGAACGCCAACGGATGTGAAATCTGCAA
GTGCAATGAATGCCCACAAAGACAATGCAGAATGCGATGCCCAAATGGAT
TTGAACAAGACAAAAATGGTTGCCAAATCTGTCAATGCAAAGAATGTCCA
CAACAGCAATGCCGTATGTTCTGCAAGAACGGGTTCAAAAAAGATGTCAA
TGGATGTGAGATCTGCAAATGCAACGAATGTAGTCCAGTTATGTGCAAAA
TGTTTTGCAAAAATGGATTCCAAAGAGATGCAAATGGTTGTGAAGTCTGC
AAATGCAATCGTTGGTTTGGCCTGTTTGGCTTTGTCAGAGGCTAGCAATG
AATAAGTTTATAATCATCGCTTTGAAGTCGCACCAATGTTTTAAAATGCC
CACAAAGACAATGCAGAATGCGATGTCCAAATGGATTTGAACAAGACAAA
AATGGTTGCCAAATCTGCCAATGCAAAGAATGTCCACAACAACAATGTCG
TATGTTCTGCAAAAATGGATTCCAAAAGAACGCCAACGGCTGTGAGATCT
GCAAATGCAACGAAGTTGCTCCAATGATGGACGAAAAATGCCCAGAAAGA
CAATGCCGTATGTTCTGCAAGAACGGATTCCAAAAGAACGCCAACGGATG
TGAAATCTGCAAGTGCAATGAATGCCCACAAAGACAATGCAGAATGCGAT
GCCCAAATGGATTTGAACAAGACAAAAATGGTTGCCAAATCTGTCAATGC
AAAGAATGTCCACAACAGCAATGCCGTATGTTCTGCAAGAACGGGTTCAA
AAAAGATGTCAATGGATGTGAGATCTGCAAATGCAACGAATGTAGTCCAG
TTATGTGCAAAATGTTTTGCAAAAATGGATTCCAAAGAGATGCAAATGGT
TGTGAAGTCTGCAAATGCAATCGTTGGTTTGGCCTGTTTGGCTTTGTCAG
AGGCTAGCAATGAATAAGTTTATAATCATCGCTTTGAAGTCGCACCAATG
TTTTAAAATGCCCACAAAGACAATGCAGAATGCGATGTCCAAATGGATTT
GAACAAGACAAAAATGGTTGCCAAATCTGCCAATGCAAAGAATGTCCACA
ACAACAATGTCGTATGTTCTGCAAAAATGGATTCCAAAAGAACGCCAACG
GCTGTGAGATCTGCAAATGCAACGAAGTTGCTCCAATGATGGACGAAAAA
TGCCCAGAAAGACAATGCCGTATGTTCTGCAAGAACGGATTCCAAAAGAA
CGCCAACGGATGTGAAATCTGCAAGTGCAATGAATGCCCACAAAGACAAT
GCAGAATGCGATGCCCAAATGGATTTGAACAAGACAAAAATGGTTGCCAA
ATCTGTCAATGCAAAGAATGTCCACAACAGCAATGCCGTATGTTCTGCAA
GAACGGGTTCAAAAAAGATGTCAATGGATGTGAGATCTGCAAATGCAACG
AATGTAGTCCAGTTATGTGCAAAATGTTTTGCAAAAATGGATTCCAAAGA
GATGCAAATGGTTGTGAAGTCTGCAAATGCAATCGTTGGTTTGGCCTGTT
TGGCTTTGTCAGAGGCTAGCAATGAATAAGTTTATAATCATCGCTTTGAA
GTCGCACCAATGTTTTAAAATGCCCACAAAGACAATGCAGAATGCGATGT
CCAAATGGATTTGAACAAGACAAAAATGGTTGCCAAATCTGCCAATGCAA
AGAATGTCCACAACAACAATGTCGTATGTTCTGCAAAAATGGATTCCAAA
AGAACGCCAACGGCTGTGAGATCTGCAAATGCAACGAAGTTGCTCCAATG
ATGGACGAAAAATGCCCAGAAAGACAATGCCGTATGTTCTGCAAGAACGG
ATTCCAAAAGAACGCCAACGGATGTGAAATCTGCAAGTGCAATGAATGCC
CACAAAGACAATGCAGAATGCGATGCCCAAATGGATTTGAACAAGACAAA
AATGGTTGCCAAATCTGTCAATGCAAAGAATGTCCACAACAGCAATGCCG
TATGTTCTGCAAGAACGGGTTCAAAAAAGATGTCAATGGATGTGAGATCT
GCAAATGCAACGAATGTAGTCCAGTTATGTGCAAAATGTTTTGCAAAAAT
GGATTCCAAAGAGATGCAAATGGTTGTGAAGTCTGCAAATGCAATCGTTG
GTTTGGCCTGTTTGGCTTTGTCAGAGGCTAGCAATGAATAAGTTTATAAT
CATCGCTTTGAAGTCGCACCAATGTTTTAAAATGCCCACAAAGACAATGC
AGAATGCGATGTCCAAATGGATTTGAACAAGACAAAAATGGTTGCCAAAT
CTGCCAATGCAAAGAATGTCCACAACAACAATGTCGTATGTTCTGCAAAA
ATGGATTCCAAAAGAACGCCAACGGCTGTGAGATCTGCAAATGCAACGAA
GTTGCTCCAATGATGGACGAAAAATGCCCAGAAAGACAATGCCGTATGTT
CTGCAAGAACGGATTCCAAAAGAACGCCAACGGATGTGAAATCTGCAAGT
GCAATGAATGCCCACAAAGACAATGCAGAATGCGATGCCCAAATGGATTT
GAACAAGACAAAAATGGTTGCCAAATCTGTCAATGCAAAGAATGTCCACA
ACAGCAATGCCGTATGTTCTGCAAGAACGGGTTCAAAAAAGATGTCAATG
GATGTGAGATCTGCAAATGCAACGAATGTAGTCCAGTTATGTGCAAAATG
TTTTGCAAAAATGGATTCCAAAGAGATGCAAATGGTTGTGAAGTCTGCAA
ATGCAATCGTTGGTTTGGCCTGTTTGGCTTTGTCAGAGGCTAGCAATGAA
TAAGTTTATAATCATCGCTTTGAAGTCGCACCAATGTTTTAAAATGCCCA
CAAAGACAATGCAGAATGCGATGTCCAAATGGATTTGAACAAGACAAAAA
TGGTTGCCAAATCTGCCAATGCAAAGAATGTCCACAACAACAATGTCGTA
TGTTCTGCAAAAATGGATTCCAAAAGAACGCCAACGGCTGTGAGATCTGC
AAATGCAACGAAGTTGCTCCAATGATGGACGAAAAATGCCCAGAAAGACA
ATGCCGTATGTTCTGCAAGAACGGATTCCAAAAGAACGCCAACGGATGTG
AAATCTGCAAGTGCAATGAATGCCCACAAAGACAATGCAGAATGCGATGC
CCAAATGGATTTGAACAAGACAAAAATGGTTGCCAAATCTGTCAATGCAA
AGAATGTCCACAACAGCAATGCCGTATGTTCTGCAAGAACGGGTTCAAAA
AAGATGTCAATGGATGTGAGATCTGCAAATGCAACGAATGTAGTCCAGTT
ATGTGCAAAATGTTTTGCAAAAATGGATTCCAAAGAGATGCAAATGGTTG
TGAAGTCTGCAAATGCAATCGTTGGTTTGGCCTGTTTGGCTTTGTCAGAG
GCTAGCAATGAATAAGTTTATAATCATCGCTTTGAAGTCGCACCAATGTT
TTAAAATGCCCACAAAGACAATGCAGAATGCGATGTCCAAATGGATTTGA
ACAAGACAAAAATGGTTGCCAAATCTGCCAATGCAAAGAATGTCCACAAC
AACAATGTCGTATGTTCTGCAAAAATGGATTCCAAAAGAACGCCAACGGC
TGTGAGATCTGCAAATGCAACGAAGTTGCTCCAATGATGGACGAAAAATG
CCCAGAAAGACAATGCCGTATGTTCTGCAAGAACGGATTCCAAAAGAACG
CCAACGGATGTGAAATCTGCAAGTGCAATGAATGCCCACAAAGACAATGC
AGAATGCGATGCCCAAATGGATTTGAACAAGACAAAAATGGTTGCCAAAT
CTGTCAATGCAAAGAATGTCCACAACAGCAATGCCGTATGTTCTGCAAGA
ACGGGTTCAAAAAAGATGTCAATGGATGTGAGATCTGCAAATGCAACGAA
TGTAGTCCAGTTATGTGCAAAATGTTTTGCAAAAATGGATTCCAAAGAGA
TGCAAATGGTTGTGAAGTCTGCAAATGCAATCGTTGGTTTGGCCTGTTTG
GCTTTGTCAGAGGCTAGCAATGAATAAGTTTATAATCATCGCTTTGAAGT
CGCACCAATGTTTTAAAATGCCCACAAAGACAATGCAGAATGCGATGTCC
AAATGGATTTGAACAAGACAAAAATGGTTGCCAAATCTGCCAATGCAAAG
AATGTCCACAACAACAATGTCGTATGTTCTGCAAAAATGGATTCCAAAAG
AACGCCAACGGCTGTGAGATCTGCAAATGCAACGAAGTTGCTCCAATGAT
GGACGAAAAATGCCCAGAAAGACAATGCCGTATGTTCTGCAAGAACGGAT
TCCAAAAGAACGCCAACGGATGTGAAATCTGCAAGTGCAATGAATGCCCA
CAAAGACAATGCAGAATGCGATGCCCAAATGGATTTGAACAAGACAAAAA
TGGTTGCCAAATCTGTCAATGCAAAGAATGTCCACAACAGCAATGCCGTA
TGTTCTGCAAGAACGGGTTCAAAAAAGATGTCAATGGATGTGAGATCTGC
AAATGCAACGAATGTAGTCCAGTTATGTGCAAAATGTTTTGCAAAAATGG
ATTCCAAAGAGATGCAAATGGTTGTGAAGTCTGCAAATGCAATCGTTGGT
TTGGCCTGTTTGGCTTTGTCAGAGGCTAGCAATGAATAAGTTTATAATCA
TCGCTTTG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000080_pilon | genome | sc0000080_pilon:158880..163787 - |
|
