MSTRG.1005.1.p2 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.1005.1.p2
Unique NameMSTRG.1005.1.p2
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000005_pilon:672581..691775+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.1005.1.p2 ID=MSTRG.1005.1.p2|Name=MSTRG.1005.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=19195bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000005_pilon:672581..691775+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ACATCACACAGTTTCGAGTACCTTTATTGGAATGCTCAATCGTGGTAGCT CGAAGGGAAACCAAAACAAAGTAAAATGGCGCTCCCTACGATCAAGCCGA GTTGGATCAAAACTTACAAATCCAGAGCAGATTTCTCAACCAAAAGGACC GAGAAAGAAAACCAAGTTCGTTCAACATGGAGTAATCACAATGCTTACTT TAACAAGGCTAATAATATCGTAAGTAAGAATGACGATTGGACTTCTCAAC Gatcgaaaaataaaagtttaaatgctgttgaaaaacttttcaatgaaatt gaaagaaaggaaagCTCTCTAAACAATTTGGAATATAGACGAGACAAGCT CAGGAGCTTACTCTATTCAGAAGATGAAAAATATAGGAAGGAGATTCAAA GTGTGAGGGGTAATAGGTATTCAAGTACTGAAGCCATGCAAGAAAAGTTA AATGCTTTAGCAGCTGTCAAAGAAACTAAACGCAAAAAGGAGGCAGATGA AAAACTTTATGAACATTGGAGGCAAAATGAACCAAGACTTAGGGAATTAG aatcaaaaagaattgaaaagaatGCTTTAGGACAGTGggaaaatcaaatt caagaaAAGGAGGAAgtgatcaaaacaaattttgaaacacAAAGAAAGCT TGATAACTACTTAAAAGAAGAGAATTTAAGAGCACAAGCTGAGGAAATCG AGAAAGAAGaggcaagaaaaatgaaagcaagaaTGTTGGCAGAGGAGCAG CAACAACAAATAACTGAATTGAAAAGAAAGGAAAGTGAAGCTGATTTTCT TCGAGGAGAAGAGcaaaaacttattgaaaatgAACAGTTATTGGAAAAAA CTGAAGCAAAGCGCAAACTTTTCGATGAACAAAGGAAAAGACAAGACTAT GGGATGGTTTTGATTAGGCAATACAAGCAACAACTAAAGCGAAAAAGCAA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000005_pilon:672581..691775+

>MSTRG.1005.1.p2 ID=MSTRG.1005.1.p2|Name=MSTRG.1005.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2538bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000005_pilon:672581..691775+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCGCTCCCTACGATCAAGCCGAGTTGGATCAAAACTTACAAATCCAG
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AAATATGCCCATGGAAGTTGTTTTCGTGGATATCTCTCTGATCACAGCTT
TGGTGTTTGTGGGCACTGCTTCACCAAAACTAGAATAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1005MSTRG.1005Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1005.1.p2MSTRG.1005.1.p2-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1005.1.p2.exon1MSTRG.1005.1.p2.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1005.1.p2.exon2MSTRG.1005.1.p2.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1005.1.p2.exon3MSTRG.1005.1.p2.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000005_pilongenomesc0000005_pilon:672581..691775 +