MSTRG.11338.8.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.11338.8.p1
Unique NameMSTRG.11338.8.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000081_pilon:1343118..1366960-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.11338.8.p1 ID=MSTRG.11338.8.p1|Name=MSTRG.11338.8.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=23843bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000081_pilon:1343118..1366960- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GGCCGTCTCTTAAATTTAATCGAATATTTCAATTTGGCTCGAGCCTTATT AGACCATTTTTGAACTTTTGGAGTCTTAAGTCTCATGTTAAGACTCTACC CTTCCAACCTAAGTTAGAGCGCTTTCAAATCGATTGTGGCTATAAGATTT CGTGGGAATGTCTCTTTTCAAATATTACGACCATGATTGTAGCTCATTTT CAGAAAAATTTACTTTGAACACCTTTAAAATTATACCATATTTATGCTTA TTGGGTCAAGGGCTATTGTTTGCCATGGATAGATTATCTAAAAACCTTTT ACTTTACGAGATAGTGAACAAATCGGTCCTCGTTTATAAAAAATTGTGTA ATCCCATTAGTGAATTGGGGCTCGGCTTGACAATCGACCGACACCCATGC ATCCTGGTGTTAGTCCATTAGTGAATTGGGGCTCGGCTTGACAATCGACC GATATCCATGAATCCTGTGTTAGTCCCATTAGTGAATTGGGGGTCGGCTT GACAATCGACCGACACCCATGCATCTTGTGTTAGTCCCCTTTCCTTTAGC AGCTGATGTATTAATCGTGCGAAATCGTAGTCATTATAAAAACACTGGTC TGGAAGGCTTTTGTCTCTTTTTATTGTTAAAAGATGGAGCTTACATACTA AAATCGATTTATTTTGCAAAAATTTTGATCATGTGATTAGAAAATAGACC AATCCCAAGAGGAGATTTTGGTAACGTGATCAAAAAGTATGCAAATCGCA ACTTGTCTTTTGTTTGTAACAAAAGAAAATTGAACAAAAAGCTAAAACAA TACATTGCCCCAGACCAGGGCAAGACCGGTGTTTTTTATAATGACTATGG TGAAATTATAAAGATCTAGGATTTTATGATTTGATATTTTTTTCTACAGA TACTTAATAAATAATAAGAGAACACAAGAAATGAATAACGATCCAATTCT 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CCGTACCGAAGAAGATTTTATAGGGGTTCTAAAGAACTTTTTCATTTTTC CAGGGGATAAAAAGTTATTTTAAAACTTCCAGGGCGTAAATGATTCATTT CAGTATTTTAGTTCGTCAATACTCATTTTAGGGTATGAAGATTTTTCCAA TGATTTTCTGCAAATTCGCAACTCTCCACCAGGGGGGGGGGAATATTTTT GGCTTGAAAAGGTTCGTCCACCCACAACCCCCCCTGTACAGTTATTAAAC ATAGGTTGTTAAAATTGGTGAAATATACCTAGGAAATCTTTCGCCATTTT TGGTGCAATTTGGCGGAATTTATTTTGGCGATTTTATAAAATTTCTAAAT TTGGCGAGAATTAATTTTGGCGAACGACCCATTTTTGTTCAATATTTTAG CTGAAAAAAAGAGGAAAAAAAGGATTTTTAAGAGAAATACATTAATGGGA TAAACTTTCGCGGGGATTAAATTTCGCGGATTTCGCGGATGGGTGTCATC CGCGAAAATCTGCGAAATTAAGTCCCAATGGAAATTTGGAACGGCCTCAT CCGCGAAATATTTCTAAACAAAACTCAAAATATGCCAAATAAATACTATT TGAATGGTTAGTTGCATCAAAGAAGCGCAAATAATGTGTATTTCAACAAC CAACATGCATGATTTGACAGTAAAAGTCACAAAATCATGAAAATGTTGCC ACCCAATAGTGCCACCCACGAAATTTAATCCCCGCGAAAGTTTATCCCAT TAAAGTAGAGACTAAATTGATAGAAAATTAAATTTGGCGAGAATTTATTT TGGCGAATGATCTATAAATTTAAATTTGGCGGAAAGAAATTTTGGCGAAT CTGGCGAAATTTTTAGGCAATTCGCCAAATTCGCCAAAAAAATTTTTTGC CAAAATTTGTTCCCTTAAGGTAAATCTGTTTTGTTTCTTTTGAACAGGTG GAAGAAGGTTATAGCAATGTTTATGGTATTGATTATTCACAACAAGCCAT CGAGCTTGCTGATGCTATCGCACTTTCAAGAGATGTCAAAACACAATGTC ATTTCTCTGTGAGTCTTCCATAAAATATGATTTTTTTGTCACATTAAAGG TTTTATTTTTACATAAGTGTGTCTGTTTCATATCAGGCACATGTTTCATA TCAGGACAGTGTCTGTTATGTGTATTGTTATGTTATGCTGATATAGGCAA AAACGTTTTTCTTTTCCTGTTTTTAACAAATCTTGCTCCATATCCGTACC AATCCAATGTGTAAAAGCTTATAAATTAAAATTGACGAGTAAGCAAACGA TGTCACTCTTATTTAAAAACAAAACCTTTAAAGTGCGATCTCATCGTAGC AGTAAAGTAGACTTCCACGCTAGTCAGGCTGGAACGATATCACGCGGGGG AAAAAGGAAGAAAGTAAGCATATGAGTTAGGTAAGCGTAGGAAGAAAGTT TTTGGGCAGGAGGGGCTGAAAGCAACGTGTTGAAAACGAGCGTGCAAAAC AGCAAATGTATGACCCTGTTGACATGGATCAAATTGAAGACAGGAAAAGT TTTTCCAAAATTCCAAAATCACCGCTGTACTTCTCGCTTGAAATTTTATT GAATGGTCTCCTACCAACCGGGTCTACAGGCGTAGGTTCACCCGGTTGAA TACTCTCGGGTACCATGAGATTGGGTAACTTGCATCAGTGGAGGCTAACA TGCATAGCCCTCAAATGAAAGACCTGGCTGGTCATTAAAATACAACTACG CAGCTCCGCTCTACTCTACCATTTTTGTTTTGATTTAATTTTGTATTTTA ATGACCAGCCAGGTCTTTCATTTGAGGGCTATGCATGTTAGACTTCACTG ATGCAAGTTACCCAATCTCACGGTACCTAATAGCTGGGGGGTTTGGAATA AGCGGGGGGGGGGGTTGGAAAAAGTCTCAAAACTTAATAAAGCGGAGGGG GGTTGGAATAAAAATGTCCTAGCTGGAAAATTTCCATAAATTATGCGCGC CCATAGAAAAATATTTTTAAAAACCCGTGAATATATAGCGAGTGGGCGCT TTTTAACCAATTAGGTGCACTCACATATTAAGGGAGAAATATCCCCTGCA GGCATGTTAGTTGAACTAGACCGTAAACCAGAAAATTAATCTTTAAAAAA CTAGACGATGAAATAGTTTACGGTCTGCATATCAAGGCTAATAAAATTCA TGTGGTTTAATGTGAGTTAAAAGTTAATGTGACAGATCCAGAAATGACCA TTTTCACTGTTCATGCATTGCAACCATGAAAAAGTCCCAATCTTGTTCAA ATTTACACATGAGCTGCATTATAGTCTCCATTAACATGATTCCATAATCA GCTTATTTGAAATAATTCTGTGTTGAGTTTGACAAATCAAGCCACCAATC GTCAAACGAGCGAGACAGATCCAGAAATAACCATTTTCACGCGTAGCATC ATGGAAAAAGTTCCAATCTTGTTCCAATTTACACATGGGCTCCATTTTCA TTTTAGTGTCCATTGCCAAATTCCAGAATCAGTTTACTTGAAATAATTAT GTGTTGAGTTTAAAAATCATACCACGTCTCACCACTGACCAGCGTTGTTT TGTTAACAGCCTGCTGAACAGCGACAGATCCAGATGTAGCATCAAGAAAA AAGTTCCAATCTTATTCAATTTTACACATCAGCTGCATTTCAGTTTATTT ATTTCTATATCAGAAGCCATTATTTCCTAAAAATTTATAAAGTCTTTTTG AAAACAAGAAACTAAAAATGAAAGTGATTTAAGGTAGAATTTTCACTCAT AAAACTTTATGAAAACTTGAGCAAAGACTATAAGATACCTATGGCACAAT GTTGAAAAAGGTTTATAAAGAAAAATATTTACAAAATTTCTTTGGTTTGA AAGTCTCTTGACCACTAAAGCAAAGAAAATGTTCAAGAAAGTACGAATCA ACCTCCTCGCTTCGACCGCCATCTTGTTTTGTTTTGAAAATTGTGGCAAG CTTTTCCCTCTCCAGACGGCAAAATTAAAAAGTGTGTTACTGGTTTTAAG CGCCGTTTCTACCAAAACGGACAGACAGATACACGGACGGAAAAGTGCTA ATGAAAGGCCCTATCGCTAGCGCTGGGCCAACTAGATAATTCGAGAAGTC AGATACAGTCAATTTCGCTAATTCGAACCTCTACTATTCGAATCTTTCTA AGAATAAATATACTTGTAGCTAATTCGAACTAAAATGTTTGTCGCCTTAG CTGAAAATTAGTATAAAATACTTTCGATAATTCGAATTTTTATCTAATTC GAGGAAAATTTTTTGCTTCTTGAAAGATCGAATTAGAGAGAGTCAAAAGT GAATCGGTAATTTTGAGTAAGTTTGTCATTAATCCAAAACATGTGTTTTT CTTGCATTCTCTTTTTCAAAGCAAGCTGATTTTCTCGACCCATCCACGTG GAAAATAAATGACGTCACTTTCGATTTATGCCATGACAAAGGAACTTTCG ATGCCGTATGTTTGAATCCAGACAATGCACAAGACAAAAGTCGACTTTAT ATCAAGAATTTGAAAACATTATTGAAAGAAGGTTCCTGGTTTTTAATTAC GTCTTGTAATTGGACTGGAGACGAGATAAAGAAATATTTTTCGGACGGTA TGTAAATATTTTTCGGACGGTATGCTAATATTTTTCGGACGGTATGTTAA TATTTTTCGGACGGTATGTTAATATTTTTCGGACGGTATGTTAATATTTT TCGGATGGTATGTTAATAATTTTCGGACGGTATGTTAATATTTTTCGGAC GATATGCTAATATTTTTCGGACGGTAAGCTAACATTTTTCGGACGGTAAG CTAACATTTTTCGGACGGTATGTTAATAATTTTCGGACGGTAAGCTAATA ATTTTCGGACGATATGTTAATAACTGCTTAAGCTCTAGTTTAGACGGCCC CCTTTTTGCCCTGCCTATTCTAATTGTGAATTAAAGAGGGCATAAAGTGG GCTGTCTAAAGTCGATGCATAGCCCTCTTTTGACGTCAATGCAATGTCTT CTTTCAAACCTTTCCAAGCAAAGATTTTAACAAACAACTTTGTGCCCTCT TTCTGCCTACTCTAACAATTAGAATAGGCAAGGCAGAAAGTCGGCCGTCT AAACTAGAGCTAACCCTTCAAACTCGAGTGACGTTTATACACGTATTTCT AAATTTAAAGTATTTAATTAATAATTTATTTAAAATATTTTCATAAAGAT TTTTAAAAAAACCTACTCCTATAGACTAGGCTATAATGGGCTCTTCCAGA AAAAATCCGTTCACTGGGGGTGGAGGATGAATTGTCCAGGGGTATTGAAA AAATACCAAAAAATTGTCCAGGGGGTAAATTGCAATGTCCAGGGGTAACT TTTTGTGTCCACGGGGTTGATTTGATGTTTGTCCAGGGGTATAACCCGTG TCCAGGGGGTTAAAAATCAAAATGTCCAGGGGTAATTCATGAAAAAATAA TATATCCTCCACCCCCCATGAACGGATTTTTTCTGGAAGAGCCCAATTCC AGACCATTTGAGTGGGACTCAGATTTGATTTGACCTAACAGGTGGTGACC CGTACCCTTTCACTTGCCCCCACCCTGACACTCACCGAAACTCCCAACGA GAGAAATTTTATTTTATATACGTTCTTTTTCCCAGGTTTCGAGTTTGTTT GTGACATTCCAGCACCAACTTTCCAATTTGGTGGACAGTCGGGCCAAACT GTAACTAGTAATGTTTTCAGACGTAAGTTTTGTTTTTGCTGTATTTACTA ACCCCCACTCTTTTGATATTAACACTTCACTTTCTTGAACAAATTTTGAA AAGAAGATGATGATATAAGCACATTTGAATATCTTTCCAACGATTTTATT ATACGACATAACTTATTCTATTGTACAAGCGCTTGGAAAATTATAGCCAA AAATAAAAATATTGTACATCTTTTTTTCACAGACTTTAAGATCTTGGTTA TTTTTTTAACTTTAACGTTTTTACTTATAGGAACTGGAGATTGATTATTC GGTGTGTTGGTAATTTCCGGTTTCGTCAATCATATACAGTGGTGACGGAC CTAATAGTTCAAACGTTGATAAGTCGATAGATGTCCTGGAAAGCTTCATA ACATCATTGAATAAAGGTTACATGGCGTTATCAACATAACTAGAGCTCAC AGTACGGTAGTTATGCTTTGGAACTTTTGTCCAGCTCCTATTTAATAATA CAACAACATGAACAAAAATGGTCCTATACTTTTTCACTAGCTCATCTTTT TATATCTCATACCATATCATTAAAAGACTTGGAAAAAATGATAATAATGA TAACAACATTGAAAAAAGGTTATATGGTTTCATCTACAATGGCTGTTGTT ATACTTGGTTTTTCCCAATTCTAGCCTAGTTAACTGAGCCCTTATTAACA AAGCTAGGTAGGACAAGCGGATTATGACAATATAGCGTTTTCGGCGCTTT AAAGATTTTTTTATTTTTGCGGACTTTAAGTTTGCCTCGGAATGGGCTTT TCCAGAAAAAAATTTTACCCCCACTTTTGAGGATATCGATTTTTCGAAGA TATCCTACTTTATTAGTAGAAACCCCCCTGGATATCCACTCTTAAAGATA TGCTTAACGACCCTGGATATCCTCTCTTATAAAGATGCTTACGCCTGGAT ATCGTATTTTTTACTTGAAAAGATACTTTACCCCCTGGATATCCGCTCCC TTGTAGATATTTAACCCCATGATTATCGACTTTTGAACAAAAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000081_pilon:1343118..1366960-

>MSTRG.11338.8.p1 ID=MSTRG.11338.8.p1|Name=MSTRG.11338.8.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4809bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000081_pilon:1343118..1366960- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GAACTGGAGATTGAGTTTCGAGTTTGTTTGTGACATTCCAGCACCAACTT
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TGTCAAAACACAATGTCATTTCTCTGTTTGGTCACCAACGTATGGTAAAG
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CATTTTGGATGTTGGGTGTGGTAATGGATTGTTTGTTCACCATATGTTGG
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TTCACAACTTGGGACAAAGACTTAGAACTGGAGATTGAGTTTCGAGTTTG
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TTATATCAAGAATTTGAAAACATTATTGAAAGAAGGTTCCTGGTTTTTAA
TTACGTCTTGTAATTGGACTGGAGACGAGATAAAGAAATATTTTTCGGAC
GGTGGAAGAAGGTTATAGCAATGTTTATGGTATTGATTATTCACAACAAG
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TGTCATTTCTCTGTTTGGTCACCAACGTATGGTAAAGGTTATTAAGTACA
TTATGAAACAAAAAGATGTTTTACCGTTGGATTCAAACATTTTGGATGTT
GGGTGTGGTAATGGATTGTTTGTTCACCATATGTTGGGATGACATTTACG
AGAATGAATTGAAAAATTTCGCCGAAAATGAAGACGACGAAGGTGAAAAT
TGATGAATAACGATCCAATTCTTGAGCAACTCCCCTCTTCACAACTTGGG
ACAAAGACTTAGAACTGGAGATTGAGTTTCGAGTTTGTTTGTGACATTCC
AGCACCAACTTTCCAATTTGGTGGACAGTCGGGCCAAACTGTAACTAGTA
ATGTTTTCAGACCAAGCTGATTTTCTCGACCCATCCACGTGGAAAATAAA
TGACGTCACTTTCGATTTATGCCATGACAAAGGAACTTTCGATGCCGTAT
GTTTGAATCCAGACAATGCACAAGACAAAAGTCGACTTTATATCAAGAAT
TTGAAAACATTATTGAAAGAAGGTTCCTGGTTTTTAATTACGTCTTGTAA
TTGGACTGGAGACGAGATAAAGAAATATTTTTCGGACGGTGGAAGAAGGT
TATAGCAATGTTTATGGTATTGATTATTCACAACAAGCCATCGAGCTTGC
TGATGCTATCGCACTTTCAAGAGATGTCAAAACACAATGTCATTTCTCTG
TTTGGTCACCAACGTATGGTAAAGGTTATTAAGTACATTATGAAACAAAA
AGATGTTTTACCGTTGGATTCAAACATTTTGGATGTTGGGTGTGGTAATG
GATTGTTTGTTCACCATATGTTGGGATGACATTTACGAGAATGAATTGAA
AAATTTCGCCGAAAATGAAGACGACGAAGGTGAAAATTGATGAATAACGA
TCCAATTCTTGAGCAACTCCCCTCTTCACAACTTGGGACAAAGACTTAGA
ACTGGAGATTGAGTTTCGAGTTTGTTTGTGACATTCCAGCACCAACTTTC
CAATTTGGTGGACAGTCGGGCCAAACTGTAACTAGTAATGTTTTCAGACC
AAGCTGATTTTCTCGACCCATCCACGTGGAAAATAAATGACGTCACTTTC
GATTTATGCCATGACAAAGGAACTTTCGATGCCGTATGTTTGAATCCAGA
CAATGCACAAGACAAAAGTCGACTTTATATCAAGAATTTGAAAACATTAT
TGAAAGAAGGTTCCTGGTTTTTAATTACGTCTTGTAATTGGACTGGAGAC
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ATGGTATTGATTATTCACAACAAGCCATCGAGCTTGCTGATGCTATCGCA
CTTTCAAGAGATGTCAAAACACAATGTCATTTCTCTGTTTGGTCACCAAC
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CCATATGTTGGGATGACATTTACGAGAATGAATTGAAAAATTTCGCCGAA
AATGAAGACGACGAAGGTGAAAATTGATGAATAACGATCCAATTCTTGAG
CAACTCCCCTCTTCACAACTTGGGACAAAGACTTAGAACTGGAGATTGAG
TTTCGAGTTTGTTTGTGACATTCCAGCACCAACTTTCCAATTTGGTGGAC
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CGACCCATCCACGTGGAAAATAAATGACGTCACTTTCGATTTATGCCATG
ACAAAGGAACTTTCGATGCCGTATGTTTGAATCCAGACAATGCACAAGAC
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CTGGTTTTTAATTACGTCTTGTAATTGGACTGGAGACGAGATAAAGAAAT
ATTTTTCGGACGGTGGAAGAAGGTTATAGCAATGTTTATGGTATTGATTA
TTCACAACAAGCCATCGAGCTTGCTGATGCTATCGCACTTTCAAGAGATG
TCAAAACACAATGTCATTTCTCTGTTTGGTCACCAACGTATGGTAAAGGT
TATTAAGTACATTATGAAACAAAAAGATGTTTTACCGTTGGATTCAAACA
TTTTGGATGTTGGGTGTGGTAATGGATTGTTTGTTCACCATATGTTGGGA
TGACATTTACGAGAATGAATTGAAAAATTTCGCCGAAAATGAAGACGACG
AAGGTGAAAATTGATGAATAACGATCCAATTCTTGAGCAACTCCCCTCTT
CACAACTTGGGACAAAGACTTAGAACTGGAGATTGAGTTTCGAGTTTGTT
TGTGACATTCCAGCACCAACTTTCCAATTTGGTGGACAGTCGGGCCAAAC
TGTAACTAGTAATGTTTTCAGACCAAGCTGATTTTCTCGACCCATCCACG
TGGAAAATAAATGACGTCACTTTCGATTTATGCCATGACAAAGGAACTTT
CGATGCCGTATGTTTGAATCCAGACAATGCACAAGACAAAAGTCGACTTT
ATATCAAGAATTTGAAAACATTATTGAAAGAAGGTTCCTGGTTTTTAATT
ACGTCTTGTAATTGGACTGGAGACGAGATAAAGAAATATTTTTCGGACGG
TGGAAGAAGGTTATAGCAATGTTTATGGTATTGATTATTCACAACAAGCC
ATCGAGCTTGCTGATGCTATCGCACTTTCAAGAGATGTCAAAACACAATG
TCATTTCTCTGTTTGGTCACCAACGTATGGTAAAGGTTATTAAGTACATT
ATGAAACAAAAAGATGTTTTACCGTTGGATTCAAACATTTTGGATGTTGG
GTGTGGTAATGGATTGTTTGTTCACCATATGTTGGGATGACATTTACGAG
AATGAATTGAAAAATTTCGCCGAAAATGAAGACGACGAAGGTGAAAATTG
ATGAATAACGATCCAATTCTTGAGCAACTCCCCTCTTCACAACTTGGGAC
AAAGACTTA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11338MSTRG.11338Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11338.8.p1MSTRG.11338.8.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11338.8.p1.exon7MSTRG.11338.8.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11338.8.p1.exon6MSTRG.11338.8.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11338.8.p1.exon5MSTRG.11338.8.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11338.8.p1.exon4MSTRG.11338.8.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11338.8.p1.exon3MSTRG.11338.8.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11338.8.p1.exon2MSTRG.11338.8.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11338.8.p1.exon1MSTRG.11338.8.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000081_pilongenomesc0000081_pilon:1343118..1366960 -