MSTRG.11726.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.11726.1.p1
Unique NameMSTRG.11726.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000086_pilon:198549..220281-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.11726.1.p1 ID=MSTRG.11726.1.p1|Name=MSTRG.11726.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=21733bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000086_pilon:198549..220281- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AATATAATAATAAGATTTTGACTAAGAATAAAAGGTACTCTAGCTCCTAC TACGTAGTCGAAATCTTCCTCACCTCGATGAAAATCAAGGGAATTCTTTC CACCGCATTCAATTTTTTAAGTACAATTTATACCCTGCTAAAATTTCAAA TTTTAAAAATCGCATCCCACTGGATACTCAGCACTAGACGATCCTTTCGT CTTCACAAGGTCACTAAGAAGGGAATAATTTAGGAGGTGTTAGTGACAAA AATTTTTTTTCGACGGGTTTCAATGATGTGTTTGAGGAGTTATGAACCCT CTAATGTCCACTACTGGGTCTCAAAGGGAAGAAATTTTGGCGGGAATTTG AATTGGCAGATGGCTGCAAATACTTCTAGTGGGAATTGGATTTGGCGGAT TGCCAAAAAAATAATCTGGTGGAAAAAATAAAAATTGTAAGATATTACCT CCCAAAATAGCTATTTTATTAGCAAAAGGTCTATTTTAGACGTGAGAAAG GCACAAATTTCGGGAATGATTTAATTATATTAAATTTTGCGGGAATTTTG GTGGTAATTTAATAAGGCGGATATGGGGTTGAATCAGTCAAATTTTCTTT CTGCCAATGCAGTGGAGTTTCTTTAACTCGAACCTCTATAACTCGAGAGT CTCCTTAACTCGAAAAGGTTTTATGGTCCCTTCAATAAACAGTGCCATAT AAAGTTTACTTCTTAACTTAAAATTTCCCTAACTCGAACGAATTTGTGTC CCCCGTGCGCTTTGTTCGATTTATGAAGACTCCACTGTATTTATTCCTTT AAGGGCTCTGACCATAGTGAATTTTTCGTTAGACGGTGTATCTTTAACCA AACTAAAAAAAGATTTTCGGAAAATTTTTGTAAAAGCTTCTTTGTCTCAA AATCTTGAAAATACCGGTTGTTGACCAATTTTTCATCCCAATCTTTCGTA GAAAAACAGTTATAAATTTTGATACATCAATTTATAAAATTTTTCCGAAA ATTTTCAATTAGTTCAACTTTGCAGACAATTTAAAAAAAAAATCGAAAAG AAAACGTTAATTACCCATTGAAACTTAGCATTTTTTGCAAGCGAGGGTAA TATAACATTCTATCGACATCTTTTTAAAGTTCATAAGGTCATTTTTGCAA TTAAGAGTAATTAAATTCTTAATTACTCTTGATGGAATAAGTTTCCAAAC AACTTTTTGGCAATTTTTTGCTAAAAGTGTCAAGGAACCCAAAGCAAAAG TTTCATTTCAAATCTCTCAACAAATTTTTCAGAGCCCTTAAGTAGCATCA GAAAGTAGAATGGCATGAGAAAAATGCTAGAGTTGTTTGCAATCTACTCA CATTGCAATCTTAGTGGGAACTTACTTAATTTGGCAGATTTAGTAAACAA AAAAAGCAAAAATCCGTCAGACTAGTGTGATGTATCCAAAATTTCGAACT CATTGGATCCATTGGGATCCTGATAGGGACGTGGGGCTAAAAACTCATAA ATGATCCCCGACAGGGTCTCACAGTCCCTGGCTCATAGTGTCCCTTAAAC CACCAAAGTCCAAAGTTAGTCTCTCTCATACTCCCCTCATAGCTTTGAAC TCTCAATCTCTGGCTCTTGGAAGTTACACTGAACTCTCAACATAATCGGT GGAAAAACGACATAATTTAGAAAGTAACTCAAGCAATAGGTTTTTTTAGC TTTGAGTATATTGAAATTCGAAATCCACAGAAGATTTACTTTTGTATATT GATTAATATTTTCCCCACTGGCTAAAAAATTCTTATAGGCTATTTTGATA AATAATGGAGGGATGGATTACACATTCTATAATTTTACTAAGTAGTATAT TGCACTATAGTGGTCTTTTAAATCTAGAGTGCTGCGCTATGACTTCAATC AATTGCTGTAATGATTGGATTCTCTTTTCCTGTCAACACAAACTGAACAT AATGTCGCAGGGGGTATTCCCATTTTAACAAGTCATTTAATTTTGTGTTG TCATGGTAATGAATTGGTAACTACTAAATTGACTAACATAAAGAAGATAG CAACTCTCGTATTTCTCGTATGAGAGTCTCGTTCATGTTATGAACTCTCA TACATAAGTTCAGATCTTTTCTGAGAAACTTTGCTTGAATCAATGTCAAT TGAATATTTCTAGTGACTATGCTTGAATCAAAACAAAATTTCCCGCTAAC CTGTGACGTCATGGGCATGCCCGAAGCTTTCGTAAATAAAAAGTGCGCGA AAAACATTCGAATGATCGAACAGTCGAACGTGCGTTCGAAAATTAGAAAG TGGCCAATCAAAACGTTTGTTTTTATGAATGAACATGCCCACAATCCTTT GCTTTATTTACAAATCATACGATTTGAAGAAAAAAAACTGAATAAAAATA AAAATATAGACAGACAGGAATGGTCACAGCGACCGAATCATTGAAAAAAT TTCAACGTAAACAAACCGAAGAAAACCGTCCTTCCTGTCAAGGGTATGTG ATTGTTTGCGTTCTATACAGGGAACTTTTAAACAAATATTTTGCCAAATT CCTGTTTCGTCTTGCAAGGGAATTTTCTGTCTAAAGTCAAATGGATTTTC CCTGTCTAAATCCCTACTCTATATAAAGTGAATCTCGTACTGCTTGGCTT TGTCAGTCATCTTCTACAGGAAACTTAATACGGTGTTGAACACAAATATT CCAAAACATCTTGCTTAAGATGGCTGACTTCTTAGTCTATTTATTAAATG GGATTCTTTCACAATCTGGCTCAGCTAAAATCGAGAGCTGGAAAGAAGCA AGCTTATTTTGTAAGTTAATCATTTTTAAATAGTTTTTATGCTTTTTTTT GGAGACTCTCAGTGCACTCTGTAAAAATATGATAGGCTAGCCAAAGGCGG ACATTGATTTCAAAGCCCGAGCTTCAAACTCGCGAAATCCTTAGCCTTTA TGGCATGGTACTTTTCCGGTCATATGATAAGTTCATGGTCAAGTAATATA TTCATTTCTTTGTCTTCAGGTAAATCAATCATACTGGAGGTTCAGTGTGT TCGTGGAAAATTGGTCAAGTGTTTACTGCCATTTGCTAAATTCGTGCTAC CATGGCCTCTTGTGTTTTTAGCAATTTTTGCACCCAGAGTTTGTTCCTCT GACACAAGTTCTGATAAGGAGGTGAGCGAAGAAAAGAAGAGAAAGTGTCA TTTTCTAGACGAACCCATCAGAAAAAAATCGTGCCAGTCCACATCACAGG AACTCCAAATTTGTCGACCTTCGAGTGATGGTTTCAACCTGCTGAGTTTT GACTTTGAGAATGACGAAGTGCTCTTTGAAGAAATAGCTTTAAAGCTTTG CCAAATTGGTGATGACATGATGGAGAAATACAATGCGAAAAGTTGGTACC AGTTTTGGTGATCGAATTAATCTTTTTAGATGCAAGTATAGTTAGAGTTT TTGTATATAGTTTATTTAGAGGAAGAGGTATATTTTAAAAGTTTATTTTA TCGAACTAGCTAAATTTGAAATATGAATTTTATCAATTTTGTAACATATT TGAATTATTTTTGTCCTATGATACTCCATGAATTTTATTTTGCAACTCTC TGTTTGTCTTATGGATTTATAAAAAAATAAAGGGAAACATTTTTGCTTTC AAGCTTTTGATTTCTATGAAATTACACATTTTA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000086_pilon:198549..220281-

>MSTRG.11726.1.p1 ID=MSTRG.11726.1.p1|Name=MSTRG.11726.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=7245bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000086_pilon:198549..220281- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTTGTCAACCAAAAACTTCACGATAACCTGATCAAGCTCTCTACTCATCC
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TTACAATCGGCGAAGAAGAACGATATTTACTTCGTGCAGTGTGTTGTTGT
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AATTTGCAAAGTTGGATTTTCAAAACCCTAAGCATTTAGCTTTAGTGGCA
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TCAATCACAAAGTTTCAAGCAAACAAAAATTAGAGTTTGTCAACCAAAAA
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CTTCTTCTCCACACCAAGAATACGTAGTGGATAAGGAAGGATCGAATAAC
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AAAAATCTGAATGATTCGATCAGTTGAATGCTTTCTTACAATCGGCGAAG
AAGAACGATATTTACTTCGTGCAGTGTGTTGTTGTGCAAATGTTTTAGAA
GCTATTCATTCAAGATGGAAACATGATACTTTACCTCACATCTCACCATC
CGAACTTCAAGTCTTGAAAATCTTTGTTAACATCTCCACGAACAAGCGAA
ATTGTGAAAATGATTTCGAATTGGCAGCAATGGACAGTATACCGCAACTT
ATTCAAATTTTATGCAAAAATGTCATCAAAGATGAAACTATTAAACTTTT
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ATTTTCAAAACCCTAAGCATTTAGCTTTAGTGGCATCTGGGAGTATCACG
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CAAGCAAACAAAAATTAGAGTTTGTCAACCAAAAACTTCACGATAACCTG
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TGCGCTACGTGCCCTACGTCCACCACCTATCGCTACTTCTTCTCCACACC
AAGAATACGTAGTGGATAAGGAAGGATCGAATAACAATGGCAGTTTGATG
GGTGCTGTTGATAATCTTGATTTGCTGGACGTCCTAAAAATCTGAATGAT
TCGATCAGTTGAATGCTTTCTTACAATCGGCGAAGAAGAACGATATTTAC
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TGGAAACATGATACTTTACCTCACATCTCACCATCCGAACTTCAAGTCTT
GAAAATCTTTGTTAACATCTCCACGAACAAGCGAAATTGTGAAAATGATT
TCGAATTGGCAGCAATGGACAGTATACCGCAACTTATTCAAATTTTATGC
AAAAATGTCATCAAAGATGAAACTATTAAACTTTTCACTGCTGTGTTGTG
TGCTTTGACCAATCTGACTGCATTGGACGAAAGTCATTCGACATTGCTCC
CAAAAATGATTGTTTTTTGTGAGTTACTGACGCAATGTGAAATTGTTCAA
GTGAAGGAGAAGATTCGTAGCCTTGGATACTTACCCAAGATTATTCAAGT
CATCAAGTACCCTGATTTGGATGTCCAATGCCAAGTTGCTTTGTTGATTA
ATAACTTGGCAATGAATGTTCAAAATCAAACTGTACTAAAGCAAACCTGA
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ATTATAACTTTGAAAACGCTGTGTGATCAATCAGCATTCACTGAAATTCA
GATGGAATATTTGAAGCTTCAATTTGCAAAGTTGGATTTTCAAAACCCTA
AGCATTTAGCTTTAGTGGCATCTGGGAGTATCACGCTTGGATATGTTCTT
TACAAAACAATACAAACTTTTCAATCACAAAGTTTCAAGCAAACAAAAAT
TAGAGTTTGTCAACCAAAAACTTCACGATAACCTGATCAAGCTCTCTACT
CATCCGAACGAGGACATCCATAATCATGCGATGCGTGCGCTACGTGCCCT
ACGTCCACCACCTATCGCTACTTCTTCTCCACACCAAGAATACGTAGTGG
ATAAGGAAGGATCGAATAACAATGGCAGTTTGATGGGTGCTGTTGATAAT
CTTGATTTGCTGGACGTCCTAAAAATCTGAATGATTCGATCAGTTGAATG
CTTTCTTACAATCGGCGAAGAAGAACGATATTTACTTCGTGCAGTGTGTT
GTTGTGCAAATGTTTTAGAAGCTATTCATTCAAGATGGAAACATGATACT
TTACCTCACATCTCACCATCCGAACTTCAAGTCTTGAAAATCTTTGTTAA
CATCTCCACGAACAAGCGAAATTGTGAAAATGATTTCGAATTGGCAGCAA
TGGACAGTATACCGCAACTTATTCAAATTTTATGCAAAAATGTCATCAAA
GATGAAACTATTAAACTTTTCACTGCTGTGTTGTGTGCTTTGACCAATCT
GACTGCATTGGACGAAAGTCATTCGACATTGCTCCCAAAAATGATTGTTT
TTTGTGAGTTACTGACGCAATGTGAAATTGTTCAAGTGAAGGAGAAGATT
CGTAGCCTTGGATACTTACCCAAGATTATTCAAGTCATCAAGTACCCTGA
TTTGGATGTCCAATGCCAAGTTGCTTTGTTGATTAATAACTTGGCAATGA
ATGTTCAAAATCAAACTGTACTAAAGCAAACCTGATTGAGCTTTTACAAG
CTTTTAATGAAGATAATATTGAAAAAGAAGACCTGATTATAACTTTGAAA
ACGCTGTGTGATCAATCAGCATTCACTGAAATTCAGATGGAATATTTGAA
GCTTCAATTTGCAAAGTTGGATTTTCAAAACCCTAAGCATTTAGCTTTAG
TGGCATCTGGGAGTATCACGCTTGGATATGTTCTTTACAAAACAATACAA
ACTTTTCAATCACAAAGTTTCAAGCAAACAAAAATTAGAGTTTGTCAACC
AAAAACTTCACGATAACCTGATCAAGCTCTCTACTCATCCGAACGAGGAC
ATCCATAATCATGCGATGCGTGCGCTACGTGCCCTACGTCCACCACCTAT
CGCTACTTCTTCTCCACACCAAGAATACGTAGTGGATAAGGAAGGATCGA
ATAACAATGGCAGTTTGATGGGTGCTGTTGATAATCTTGATTTGCTGGAC
GTCCTAAAAATCTGAATGATTCGATCAGTTGAATGCTTTCTTACAATCGG
CGAAGAAGAACGATATTTACTTCGTGCAGTGTGTTGTTGTGCAAATGTTT
TAGAAGCTATTCATTCAAGATGGAAACATGATACTTTACCTCACATCTCA
CCATCCGAACTTCAAGTCTTGAAAATCTTTGTTAACATCTCCACGAACAA
GCGAAATTGTGAAAATGATTTCGAATTGGCAGCAATGGACAGTATACCGC
AACTTATTCAAATTTTATGCAAAAATGTCATCAAAGATGAAACTATTAAA
CTTTTCACTGCTGTGTTGTGTGCTTTGACCAATCTGACTGCATTGGACGA
AAGTCATTCGACATTGCTCCCAAAAATGATTGTTTTTTGTGAGTTACTGA
CGCAATGTGAAATTGTTCAAGTGAAGGAGAAGATTCGTAGCCTTGGATAC
TTACCCAAGATTATTCAAGTCATCAAGTACCCTGATTTGGATGTCCAATG
CCAAGTTGCTTTGTTGATTAATAACTTGGCAATGAATGTTCAAAATCAAA
CTGTACTAAAGCAAACCTGATTGAGCTTTTACAAGCTTTTAATGAAGATA
ATATTGAAAAAGAAGACCTGATTATAACTTTGAAAACGCTGTGTGATCAA
TCAGCATTCACTGAAATTCAGATGGAATATTTGAAGCTTCAATTTGCAAA
GTTGGATTTTCAAAACCCTAAGCATTTAGCTTTAGTGGCATCTGGGAGTA
TCACGCTTGGATATGTTCTTTACAAAACAATACAAACTTTTCAATCACAA
AGTTTCAAGCAAACAAAAATTAGAGTTTGTCAACCAAAAACTTCACGATA
ACCTGATCAAGCTCTCTACTCATCCGAACGAGGACATCCATAATCATGCG
ATGCGTGCGCTACGTGCCCTACGTCCACCACCTATCGCTACTTCTTCTCC
ACACCAAGAATACGTAGTGGATAAGGAAGGATCGAATAACAATGGCAGTT
TGATGGGTGCTGTTGATAATCTTGATTTGCTGGACGTCCTAAAAATCTGA
ATGATTCGATCAGTTGAATGCTTTCTTACAATCGGCGAAGAAGAACGATA
TTTACTTCGTGCAGTGTGTTGTTGTGCAAATGTTTTAGAAGCTATTCATT
CAAGATGGAAACATGATACTTTACCTCACATCTCACCATCCGAACTTCAA
GTCTTGAAAATCTTTGTTAACATCTCCACGAACAAGCGAAATTGTGAAAA
TGATTTCGAATTGGCAGCAATGGACAGTATACCGCAACTTATTCAAATTT
TATGCAAAAATGTCATCAAAGATGAAACTATTAAACTTTTCACTGCTGTG
TTGTGTGCTTTGACCAATCTGACTGCATTGGACGAAAGTCATTCGACATT
GCTCCCAAAAATGATTGTTTTTTGTGAGTTACTGACGCAATGTGAAATTG
TTCAAGTGAAGGAGAAGATTCGTAGCCTTGGATACTTACCCAAGATTATT
CAAGTCATCAAGTACCCTGATTTGGATGTCCAATGCCAAGTTGCTTTGTT
GATTAATAACTTGGCAATGAATGTTCAAAATCAAACTGTACTAAAGCAAA
CCTGATTGAGCTTTTACAAGCTTTTAATGAAGATAATATTGAAAAAGAAG
ACCTGATTATAACTTTGAAAACGCTGTGTGATCAATCAGCATTCACTGAA
ATTCAGATGGAATATTTGAAGCTTCAATTTGCAAAGTTGGATTTTCAAAA
CCCTAAGCATTTAGCTTTAGTGGCATCTGGGAGTATCACGCTTGGATATG
TTCTTTACAAAACAATACAAACTTTTCAATCACAAAGTTTCAAGCAAACA
AAAATTAGAGTTTGTCAACCAAAAACTTCACGATAACCTGATCAAGCTCT
CTACTCATCCGAACGAGGACATCCATAATCATGCGATGCGTGCGCTACGT
GCCCTACGTCCACCACCTATCGCTACTTCTTCTCCACACCAAGAATACGT
AGTGGATAAGGAAGGATCGAATAACAATGGCAGTTTGATGGGTGCTGTTG
ATAATCTTGATTTGCTGGACGTCCTAAAAATCTGAATGATTCGATCAGTT
GAATGCTTTCTTACAATCGGCGAAGAAGAACGATATTTACTTCGTGCAGT
GTGTTGTTGTGCAAATGTTTTAGAAGCTATTCATTCAAGATGGAAACATG
ATACTTTACCTCACATCTCACCATCCGAACTTCAAGTCTTGAAAATCTTT
GTTAACATCTCCACGAACAAGCGAAATTGTGAAAATGATTTCGAATTGGC
AGCAATGGACAGTATACCGCAACTTATTCAAATTTTATGCAAAAATGTCA
TCAAAGATGAAACTATTAAACTTTTCACTGCTGTGTTGTGTGCTTTGACC
AATCTGACTGCATTGGACGAAAGTCATTCGACATTGCTCCCAAAAATGAT
TGTTTTTTGTGAGTTACTGACGCAATGTGAAATTGTTCAAGTGAAGGAGA
AGATTCGTAGCCTTGGATACTTACCCAAGATTATTCAAGTCATCAAGTAC
CCTGATTTGGATGTCCAATGCCAAGTTGCTTTGTTGATTAATAACTTGGC
AATGAATGTTCAAAATCAAACTGTACTAAAGCAAACCTGATTGAGCTTTT
ACAAGCTTTTAATGAAGATAATATTGAAAAAGAAGACCTGATTATAACTT
TGAAAACGCTGTGTGATCAATCAGCATTCACTGAAATTCAGATGGAATAT
TTGAAGCTTCAATTTGCAAAGTTGGATTTTCAAAACCCTAAGCATTTAGC
TTTAGTGGCATCTGGGAGTATCACGCTTGGATATGTTCTTTACAAAACAA
TACAAACTTTTCAATCACAAAGTTTCAAGCAAACAAAAATTAGAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11726MSTRG.11726Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11726.1.p1MSTRG.11726.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11726.1.p1.exon8MSTRG.11726.1.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11726.1.p1.exon7MSTRG.11726.1.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11726.1.p1.exon6MSTRG.11726.1.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11726.1.p1.exon5MSTRG.11726.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11726.1.p1.exon4MSTRG.11726.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11726.1.p1.exon3MSTRG.11726.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11726.1.p1.exon2MSTRG.11726.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11726.1.p1.exon1MSTRG.11726.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000086_pilongenomesc0000086_pilon:198549..220281 -