MSTRG.12318.5.p1 (mRNA) -

Overview


Name	MSTRG.12318.5.p1
Unique Name	MSTRG.12318.5.p1
Type	mRNA
Organism	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence

The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000092_pilon:955301..1031673+
coding sequence from alignment at sc0000092_pilon:955301..1031673+

mRNA from alignment at sc0000092_pilon:955301..1031673+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR

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>MSTRG.12318.5.p1 ID=MSTRG.12318.5.p1|Name=MSTRG.12318.5.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=76373bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000092_pilon:955301..1031673+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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CTAGCGTATGTATCAGTAAATTGCGAAGTAATGTGTTTTCCTCTGGGTGT
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ATCATGTTCATCGTTACGACCTTGAATCGCAAATTGCGACCTTAAATCAC
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GGATAACACCAGTGCCAAAACACTACATATTAATGCTAGAATGATGCATG
CTTGCACTGCCCGTAGACTCTTGGTGATTTTCAACTCCTGGCAGACTATA
CAGCGACGTTCGCCTATATCTGTCTTACGATTATACTGTGTACATTCACG
CCAGAGACCGATTGATATGGTCTGCTTAACACCTCCGTTATCGATGCTTC
CGTCAACCCATTTCATCCAGCCCGTCATTTCGTCATGACCAATGCAAATA
GATGCAAAAAATGCTGTTATTTGTATGCAGATTAAGAAAATGATCGTCTT
TGCTATCTCCATTGTCTCTTTTGTATTTTCTGAAAGAAAGAAGATATAAG
TTAATAAAAAAGGTATCTAATAAGCAACGGTGTCTGAAAAAGATAAAGTG
TCAGAGACTCTGGGACTCTCGGGCGATCTCTAGACTAACCCTTTTGCTAA
GAATCTTacaacaattttgaaaaaagaaattcacaAGCACTTATGTACAG
CTTGAAAAAGCTATCCTCAGAAAGTTTAGCTATTCAATAATGTGATTGAA
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TTTGCATAATACCTCTCATTTACCCTCCGGTACATAACCCCTGCTTCTTC
CCTGAAACTACCTTGTCTCATAATTCATTTTACTAACTTTTAAAACTCTG
TTCATCTTGAAAGGAGCAGACTTCTTCCACTCCGTTTCAAACCTAACTCT
AACTCGTGTCATTCAAaagttttcccaaaaaaaaaccACAAGACTCTCGA
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GAATGTTCTATAATTTTAACTATTGAAACGTTTGCCTTGAATTCTGAACT
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AACTCTTGAGGATCAAAAAGGGGCCAACTGGATACTGCTCTTTATGTATT
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ACAGCTTGTAtttaaaagaaacatttttcaaaaaaataaatttgacgtca
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TCACCTGACAAGAACCTGACCCTTGATGAAGATGTGATTGACAACAACCG
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TACCAGCTGaatatgtttttgaataaaGGTTACAGAAAATACCAATGCAT
AACTTGTTGTTCTCTGGCAAAAGACCTCAGCATAAAAATCCATCATCAAG
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GGTCAAGGACTTACAGGCAAAATGTCAGGAATACCTAAAAGACAAAAATC
AAGTAGCTGATCTAATCCAGAGCCAATTTTCCGTCCTGGAAAAGAAGCTA
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ATGTGATATCGTATTTGACTGCAATCGAGTCTTCTTTGTACTCCTCTGGT
AAGCTCTTTCGAAAATCATCAATGAATTGTTGGCTCGTTCGAAAATATAG
TGTCTCTATTTGttcttcaaaatcaatttcaaagtCTATAATTACTTGCC
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ATATATTTCTCTTGCCTGATAAGGGTTGAGGTTTCGCCTTTAGCCcctcg
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gtgaggcagatttctgcctaaaaaaatttacagtgggaaattcgaattta
gcgatgtcctcacttactaaaataaaaaccaaccGACATTTATAGACCTG
CTGTTTTCCAGAACAACGAAATTTGTAGCGCTCACATGGATAATTTTTAG
TCCCCCTTCCGACAACAAACATCACCACAATATTGAAAACATTACAATTC
TCTCTTGaaaaaaaCACAATACAAGTCTCATAACATTGATTTTACTTAGA
GTTCGGTGAACCAAATTTTCTTTAGATAGCGAATGTTTCTAAAGcaattt
ccaatatttttttattcgtAGGTTTATGACCATCATGTTCTATTGGcgga
aaaaaatcacaaaattcgccaaaatgaATTCTCGCCAAATATAATTTCCA
GAAACCACTTTCTTGTGTTTGACCGtatagtttttttcttcattcgtcga
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tgagatgccttggagattttacaagatacttcactaattggtcatttaaa
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ATTTGACAAATAACAGGTCGCTCgctaaatttagaaattttgtcggatcg
caaaaataaattccgccaaatttcttctcttaagaaGTTATATAGAGTTC
GGTGAACCAAATTATCTTTAGATAGCGAATATTATTAAAGcaatttccaa
tattttttctatTCGTAGGTTTATGACTATCATGTTTTATTTGGAGAAAC
CTGAAGAAGGTGGAGAAACGGCTTTCCCTGCCGCTGATAACATCACTTAT
TCAGATGCTGTAAGTTTTCTCTTTTCCTCGATTAGCTCAAAGgttttcac
actttttacacccttagcACTTTCTCCCATTTTATTTCATTACAATTTTT
ACAGTGCACGTCTCGTGCACGTTCTATTTTGCGCAAGGCTTAAAATGGGA
CAGATTTCGAAAATTAAAGATTTGATAGATTTagagatttgaattttttc
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GCTAGTTTTTCAAGAGAAAGAAATATCTGAATGCTCTCTAGTGTTGAAAA
CTTTATCAACTTATCTTGAATTCACAGGAATTCCGTCGACACGGTTATCC
AGCAAAAGATTTATTCAACTTGAATGAACATTGTTACGATTCAAATCTTG
TTGTGAAGCCCCAAAAAAGATCAGCTGTAGCCTGGTATAACCATCATGTT
GATGCGAACACAGGCTGGTTGGGTGAAATTGATGATTGGTCTTTGCATGG
TGGTTGTGAAGTGCGCAAAGGTGAAAAATGGATTGCTAATTTATGGTTAA
CAGCTCCTTATGCTGGCGAAGAAACGAAATTGAGTATGTATTCGGCAGAA
TATATGGAAATGATGAGAGATAGAGGTGAAGATCTGTATTAAATGAACTA
AAATCATTTTAgtgtaaaatttttataaataatgAGTAGAATATATTAGT
TTAAAATTCGATAGGAATAAAAG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000092_pilon:955301..1031673+

>MSTRG.12318.5.p1 ID=MSTRG.12318.5.p1|Name=MSTRG.12318.5.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3570bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000092_pilon:955301..1031673+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGACAATTTCAAACCCTCGAAAAAGAAAGGAAAGGGCCTGGGACCAGC
AGCTGATTTTGTAAACTGGGATCTCGATGAGAATAAAATCATTGATCTGA
ATGAGgtCCAATTGTTCTGTCGAAATTACAATTTCCTTTACTTCGACGAA
AAAGAAATTATAGAGATGTTCAAAAGAGTTGAAATCACTGAATTTGATGA
CGGTAAAATAACACCTGAGGAATTTGAGACGTTAAACACACTCGGTATCG
AAGATTACTTAAACATTGTGATGCGAGAACATCCCAAACATCGTCAACGA
ACTTCCGATCAAGTCTGGTTACCAATGTCTGAAGAATACGATGTAGTCCT
TAGCAACTTAAGAAACAGATCGTGCGTTACAAACCGGGAGGTCATTATCA
CGCACACCATGACACGGAAACACACAAAGCAACCAACAAACCGTGTTGTC
ATCACACCAGTACAGCAACCATCAAACAACATGGTAGATGTAGGCTATGC
AGGTTTATGAATGGACAATTTCAAACCCTCGAAAAAGAAAGGAAAGGGCC
TGGGACCAGCAGCTGATTTTGTAAACTGGGATCTCGATGAGAATAAAATC
ATTGATCTGAATGAGgtCCAATTGTTCTGTCGAAATTACAATTTCCTTTA
CTTCGACGAAAAAGAAATTATAGAGATGTTCAAAAGAGTTGAAATCACTG
AATTTGATGACGGTAAAATAACACCTGAGGAATTTGAGACGTTAAACACA
CTCGGTATCGAAGATTACTTAAACATTGTGATGCGAGAACATCCCAAACA
TCGTCAACGAACTTCCGATCAAGTCTGGTTACCAATGTCTGAAGAATACG
ATGTAGTCCTTAGCAACTTAAGAAACAGATCGTGCGTTACAAACCGGGAG
GTCATTATCACGCACACCATGACACGGAAACACACAAAGCAACCAACAAA
CCGTGTTGTCATCACACCAGTACAGCAACCATCAAACAACATGGTAGATG
TAGGCTATGCAGGTTTATGAATGGACAATTTCAAACCCTCGAAAAAGAAA
GGAAAGGGCCTGGGACCAGCAGCTGATTTTGTAAACTGGGATCTCGATGA
GAATAAAATCATTGATCTGAATGAGgtCCAATTGTTCTGTCGAAATTACA
ATTTCCTTTACTTCGACGAAAAAGAAATTATAGAGATGTTCAAAAGAGTT
GAAATCACTGAATTTGATGACGGTAAAATAACACCTGAGGAATTTGAGAC
GTTAAACACACTCGGTATCGAAGATTACTTAAACATTGTGATGCGAGAAC
ATCCCAAACATCGTCAACGAACTTCCGATCAAGTCTGGTTACCAATGTCT
GAAGAATACGATGTAGTCCTTAGCAACTTAAGAAACAGATCGTGCGTTAC
AAACCGGGAGGTCATTATCACGCACACCATGACACGGAAACACACAAAGC
AACCAACAAACCGTGTTGTCATCACACCAGTACAGCAACCATCAAACAAC
ATGGTAGATGTAGGCTATGCAGGTTTATGAATGGACAATTTCAAACCCTC
GAAAAAGAAAGGAAAGGGCCTGGGACCAGCAGCTGATTTTGTAAACTGGG
ATCTCGATGAGAATAAAATCATTGATCTGAATGAGgtCCAATTGTTCTGT
CGAAATTACAATTTCCTTTACTTCGACGAAAAAGAAATTATAGAGATGTT
CAAAAGAGTTGAAATCACTGAATTTGATGACGGTAAAATAACACCTGAGG
AATTTGAGACGTTAAACACACTCGGTATCGAAGATTACTTAAACATTGTG
ATGCGAGAACATCCCAAACATCGTCAACGAACTTCCGATCAAGTCTGGTT
ACCAATGTCTGAAGAATACGATGTAGTCCTTAGCAACTTAAGAAACAGAT
CGTGCGTTACAAACCGGGAGGTCATTATCACGCACACCATGACACGGAAA
CACACAAAGCAACCAACAAACCGTGTTGTCATCACACCAGTACAGCAACC
ATCAAACAACATGGTAGATGTAGGCTATGCAGGTTTATGAATGGACAATT
TCAAACCCTCGAAAAAGAAAGGAAAGGGCCTGGGACCAGCAGCTGATTTT
GTAAACTGGGATCTCGATGAGAATAAAATCATTGATCTGAATGAGgtCCA
ATTGTTCTGTCGAAATTACAATTTCCTTTACTTCGACGAAAAAGAAATTA
TAGAGATGTTCAAAAGAGTTGAAATCACTGAATTTGATGACGGTAAAATA
ACACCTGAGGAATTTGAGACGTTAAACACACTCGGTATCGAAGATTACTT
AAACATTGTGATGCGAGAACATCCCAAACATCGTCAACGAACTTCCGATC
AAGTCTGGTTACCAATGTCTGAAGAATACGATGTAGTCCTTAGCAACTTA
AGAAACAGATCGTGCGTTACAAACCGGGAGGTCATTATCACGCACACCAT
GACACGGAAACACACAAAGCAACCAACAAACCGTGTTGTCATCACACCAG
TACAGCAACCATCAAACAACATGGTAGATGTAGGCTATGCAGGTTTATGA
ATGGACAATTTCAAACCCTCGAAAAAGAAAGGAAAGGGCCTGGGACCAGC
AGCTGATTTTGTAAACTGGGATCTCGATGAGAATAAAATCATTGATCTGA
ATGAGgtCCAATTGTTCTGTCGAAATTACAATTTCCTTTACTTCGACGAA
AAAGAAATTATAGAGATGTTCAAAAGAGTTGAAATCACTGAATTTGATGA
CGGTAAAATAACACCTGAGGAATTTGAGACGTTAAACACACTCGGTATCG
AAGATTACTTAAACATTGTGATGCGAGAACATCCCAAACATCGTCAACGA
ACTTCCGATCAAGTCTGGTTACCAATGTCTGAAGAATACGATGTAGTCCT
TAGCAACTTAAGAAACAGATCGTGCGTTACAAACCGGGAGGTCATTATCA
CGCACACCATGACACGGAAACACACAAAGCAACCAACAAACCGTGTTGTC
ATCACACCAGTACAGCAACCATCAAACAACATGGTAGATGTAGGCTATGC
AGGTTTATGAATGGACAATTTCAAACCCTCGAAAAAGAAAGGAAAGGGCC
TGGGACCAGCAGCTGATTTTGTAAACTGGGATCTCGATGAGAATAAAATC
ATTGATCTGAATGAGgtCCAATTGTTCTGTCGAAATTACAATTTCCTTTA
CTTCGACGAAAAAGAAATTATAGAGATGTTCAAAAGAGTTGAAATCACTG
AATTTGATGACGGTAAAATAACACCTGAGGAATTTGAGACGTTAAACACA
CTCGGTATCGAAGATTACTTAAACATTGTGATGCGAGAACATCCCAAACA
TCGTCAACGAACTTCCGATCAAGTCTGGTTACCAATGTCTGAAGAATACG
ATGTAGTCCTTAGCAACTTAAGAAACAGATCGTGCGTTACAAACCGGGAG
GTCATTATCACGCACACCATGACACGGAAACACACAAAGCAACCAACAAA
CCGTGTTGTCATCACACCAGTACAGCAACCATCAAACAACATGGTAGATG
TAGGCTATGCAGGTTTATGA

Gene-mRNA-Prot

This mRNA is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
MSTRG.12318	MSTRG.12318	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	gene

The following exon feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
MSTRG.12318.5.p1.exon1	MSTRG.12318.5.p1.exon1	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.12318.5.p1.exon2	MSTRG.12318.5.p1.exon2	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.12318.5.p1.exon3	MSTRG.12318.5.p1.exon3	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.12318.5.p1.exon4	MSTRG.12318.5.p1.exon4	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.12318.5.p1.exon5	MSTRG.12318.5.p1.exon5	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.12318.5.p1.exon6	MSTRG.12318.5.p1.exon6	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.12318.5.p1.exon7	MSTRG.12318.5.p1.exon7	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.12318.5.p1.exon8	MSTRG.12318.5.p1.exon8	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.12318.5.p1.exon9	MSTRG.12318.5.p1.exon9	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
MSTRG.12318.5.p1	MSTRG.12318.5.p1-protein	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	polypeptide

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000092_pilon	genome	sc0000092_pilon:955301..1031673 +

You are here

MSTRG.12318.5.p1 (mRNA) -