|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000082_pilon:694529..701957+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.11386.3.p1 ID=MSTRG.11386.3.p1|Name=MSTRG.11386.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7429bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000082_pilon:694529..701957+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
gaaatgacacggatgtggagaaAGATTGGTCAGTAAtaggaaaaataaac
atttttttgcttatatcagcgtaaatataacaataggcagacactgtcct
gatatgaaatatgtgtctggtatgaaatggggacacttatgtaaaaacaa
aacctttaatgatTCGAACGATCAGGGGTTAAAGAAAAGGGTTCGGTTTA
TTCAAAGTGAATAATAGAAAGTAGAAGAGAAAACAGAACATGGTGTTTTG
GTTTCTGAGAATGCACAGTACAAACAATACCCAACGGTCTTTCACATAGA
GAAAAGCCAATTTCGTATCTatgtttttactttcaaaacGCATGCGTaga
tttttaattataaaaaacCTTAGTCGGTGTTGTCCACAATATACAAATAG
CAGTTGGGTGGTCTCACTTTCATTGGGTCGGGGATAGGGACGAtgaattt
atcgttctttattcgatttttttgttGCGAATttgcgccccccccccccc
actctaTCCGTTCTCTCAAACTAaaaccatgttcagacgttacggctCCG
TTCCGTTCCAAACtaaaacggttccgaaacaagtgttaacgtcaaaattc
gaaacgctaaaaagacgttacaaagcaaaacagatcgaaacggtttcgct
tcACTTTtctcatcggaacggaactgctccgttttcttgcgcCGAAACGT
CCCGAagccaatatgaacacactcgatccgtagcGAAAATCATACCAGAA
GGATACGAaactgtaacgtctgaacatggtctaagactCATCAGAATAAA
GGAAGATGATGACACCGTTCGatcattttattctttatcAATCTTTCCAC
TCATTTATATTTCTAGATCAGTGGTTTTGATGAGACTTTCAACGCAGAAC
CAGCACTACATGGGAAGTATGAAGCGGAACCAACTGGGTTGAAATTAGGT
GTTGTTATCAAAGAACTCGTCAAGGTTTGTTCTCCATCTCTCTCAGAAGT
CTTCTCTCTGAGATTTGCATGTCAATAGGTTCCGTTATCTGTTATTGACT
TGGATGCTCTGAAAAGGAAATTTAACTACTAAACTATACTTTGATCCTGC
TAAACTTATACCTTcgtaaaaaaacaaacgtgaaCTAGAATTTATAATCA
AATATTgagctgttccattaaaaaaccatacagggggggatTACCCTTAG
GAAATGTTcgtctaccccccccctgtatggatataaaatagaATGGCCCA
TTAAATTTGCTGTCTGATTGTGGTCACGGCAATACGAAACATTAGTTTTT
AGTCTCTCTCATATAGATTTATAATCGTGGCAAAAAGAAAGCTGTTGACC
GATTGAATCTTAAAATGTTTGAAGGACAAGTCACCGCCCTACTTGGTCAC
AACGGAGCTGGAAAGTCCACCACGATGTCTATTTTAACTGGTTTATTTCC
ACCTACATCGGGTACAGCACTTGTCAATGGTTTTGATATTCGCACCCAGA
TTGACGGTGTCCGTAAAAGTTTGGGATTATGTCCGCAGCATAATGTTTTG
TATGATTATTTGACGGTTGAGGAGCACATGTGGTTCTACGGACGTTTGAA
AGGGATGACTGAAAAAGAATTACCACAAGAAATTGAGAAGTAAGTCATTT
ACCAGATTgggattttccagaaaaagaatggatatcctactttattagta
aagaccccctggatatccactcttaaaaatattctcaacccctggatatc
ctctctaattgagatgcttacccctgaatatcgtattttttacttaaaag
GACACTTttccccctggatatccgctcccttgtagatatttaacaccctg
gatatccacttttgaacaaaaatcgttaactccctggatatccgatatcc
tcaacagggggcatggactatttctggaaaagcccattgctgTTTAGGAT
TGATCCATATTAAATTCACAACCTGGCGTACCGTGGCCGAATGTTTTACC
TTTGAAATACGTTCGCTAAAGTTTCGCTGGGCTTGAACCAGCAACCTTTC
GGTCAACAGTCGAACGCGCCAATCAATTGCCCCATGGAGGCTTAATCAGA
TTGTACTAGAACCTAGTCTTGACGCAAAACTATGCTAGGGCGGCAGCTGT
AGCTGTCAGATTTCGGGTGTTCTTTTTTCagtgaaagatttataaaatcT
GCTATCTATCGCTATCGTTCGTGGTGCAATTTGATCACAATTTAATTGAC
CTCCTTTCTATTATACGATTATTAGTATAAATTCTACTTTCTGACCTAGA
TACCTTAATGACGTCGGTCTTCCCGAGAAGCGGCACGATCTTTCTTGCAA
CCTATCAGGCGGTATGAAACGGAAGTTGTCGGTGGCAATGGCGTTCATCG
CCAACTCCAAAACAGTCATTCTTGATGAACCGACTTCCGGTGTGGATCCT
TATTCGAGAAGAGCCATCTGGGATTTAATCCTCAAATACAAAGAAGGTAA
TATCAGTTTAagttgaaaaattctgaaatgaaTCCCTACTCTTGCTTACT
CTTGAGATCAATTTTGACCTAGGAAAACCAAAACAATTCACCGGCCAGAT
TTCTTGGAAACATTCGATGCAAAGACACGTTTATAACACGCCCAAACAAC
AAACTTCTCGATTGTCACTTAACAACGAAAAAATACATAGCTCAGAATCG
TGAAAATGAAACTGGCCTTAAATTCATCATCCATCACTTTGTTGAATTAT
TTCGTATAATTTGGCCATGCTCTTTAAATCAGCGAAATtgtactacctta
agggaattaattttcgcagcAACTATTATTTTCACGACTAACTTCGACTG
TAaattttcaccgggatttaatttggcgaattggcgaattttttcagatt
ttcacatttttcgatagtttgattacgagattttATgtgtacagtagagt
ctccataactcgaacggccacgaggaatgaaaatttattcgaattaaaga
gacattcgagtaatggagactcgtttaagagagtttcttagctgaaagaa
tttttagtgtaaaaaaaattaattttcgcgaggattaaatttcgtgaatt
TAGCGAGAGATGAGAGTTTCGCCAGGaattatatttcgcgaaaaagacga
aattcgcgaaaatttgcgaaatataatccccgcgaaaatttataccCTTA
AGGTATAGATAGTCATATTGTTGCCCTTATTCATTTGACCTgaagtcaaa
aaaatcaaaaaagaattgCATATGTACAATAAGTTGCAGGGATTTTTAAG
CCTCAAAATCAAAGTGAATTTAGTTTGTTTATTTCTTCTTGGTTTTCAAC
AGtagaataaaaacatgaacGAGTGAATTTAAATCATaatattttacttt
cgtttttgagaaaaatattatatCATAATCATATAAACTCCACAATAAAT
TTAATCAATATAATTCCAATGTTTACTAAAATACTCTATCATAAATAGCA
TTGCTCATTTGACCAGCTCTTTGTTTTTGCCGTTGTTGGTTATTGTTGTT
AGCGGGTGGGGCGGCGCCAGCCACTTTACCTCGTCTCACTGTATGCAACT
CAAACAATGAAGTTGGGACACGTGACAAAGTTGGTCCAAGGTCACACGGC
ATCGGGTCActccaaaaaaaatcatgatttaGTGCTGTGTCAGCATCCAT
TCTTTTTGACGGGTCTAAAATCAAAAGATGATCCACCAAATCCACACCAT
TCGTGTCTTTAGCGTATATCTTAATTTTCTCGCGTACGCAGCGCTTCAAA
TTTTGTGCCAACtccattttgttgaaaaattccaatttttcaaCGTCAGG
CCAGATTGGGGTATGAATCGAACCGCATAATTTACTTATAAGGTTTAACT
GCATTTGTTCGGTAGCACCTTGCATGATTGGAGCTCGAGTCCACATTTCA
GCCATTATGCAACCAGTGCCCCACATGTCAATGGCGGGTCCATAGTTTCT
TTCGCCCAATAAGAGCTCGGGTGGACGATACCAGAGTGTAACCACACGAT
TTGTGTATCTGAAAAGATAAAGATcagtttttaagctttttctatACTTT
CctattttctataagaaataTTTCGTGAGAGGCTGAGCAGAACCCTAAGC
TTGATTAAAGATAAATAAAGATTTCGATTTGCTAACTGAATTTTAACTGT
CGACTTCGCTCTCGTAAATTTTTACCAAAGTATTTTAAATCTAATCAACG
CACTCTGCGATTACGTTATTAGCGTGTATATCTTGGATGGCATGATGTCA
TAGAAAAGTTTAAGAAGTGCAGAGTTAATTGGATATCTTATTGGTGAAAA
ATCATTgtcaaaaagtgacgaaaaaacgTTCGTATTACTTTACCTGTAGT
CTTTTCCAGAGTGAACTGCGCGTGCCAAGCCAAAATCTGTCAATTTTAAA
ACTCCCGATTTTGTCATCAAGATGTTGGATGTCTTCATGTCTCGATGCAA
GATGTGATTAAAGTGTAAAAAATATAATGCATTTAATAACATTTGcatca
ttttttttatctctGGTAAAGTGAATCTGATCGTTGCCAACAGACCTGCC
AAATCATGTTCACAAAACTCGAAGACCAGGTAAAACGTAGCCCGTAATTT
ATTATTAGGTGATGTTTTAGCACGACAAACTTCAATCAAATTGACAATAT
TATCATGATCCAAAAGTTGTAAAATACGGATTTCTCTTAACGCTGTAATT
GGGAAgccttctttttcattttccattaaGATTTTCTTGAGAGCTACTAA
ACGGCTTGAAGAACGATCTCTTGCTTTAAAAACTTCACCAAAAGTTCCTT
GGCCaactttcattaatttttcgTATTTTCCAACGTCATGGCAAAATGGA
AACTCCATACTTCTCCACTGTTCTGATGTTGTCAACTCtattctgtgttt
tttttttatttgagtgttatttgaaaaaaattgtatcatTTTTAAATTAT
GAGCATGTCGATTTCAGGTTTTCGATTGAGTTAATGAGTTAAGTCGTAAA
ATTCTTAGAAATTAatgtattattgtttttattttatcgttTTATTGAGA
GAATGAATGGACtttttttCTCTTAGGAATTACTTAGAACTTATTACTAT
TGGGAATAACATTGATTGTTCTCTATGGAAAAAATTTAAACGTGATGATT
GAATGATATAATGTTGTATTTATATTCGATATATTTGTATCACCTTTGAC
TCGTCACTTCTGCTTTGACTGTTCCCATGagaattttattgatttttttt
ccaccGCTCAAAAGTTTCTGGTCGCagtttaaatacagggtgtccctaat
taaagtatcgagtcgaaacacaactatgagtagaaagttttatgtgcgtg
ttcacaaaattgtattttaagctctccctcttttttctttgtcattacga
ttaatttatacgttgtaactacctgttgtaataagcctgtgtgatggaga
acgttcttatattttagcgataacacacacaaacttttctactcaatcgc
atgttcaaactcgatactttaattagggacaccctgtagttctatttata
ctgagacgattgTCTGAGACcagcaatttagaaaataagcattatggagg
agtgtactttccattcatgtttcaataaataggatctcctccacagatca
cattttaCAAACTTCTCGTCTTAGACGATTTTTCCGTCTCAGTATAAATG
GAACTAATATTGACCTTGTATTTCAGCAGCAGAATTAGACTAGAGCTTTT
TTATGATTCTTGATGACGTTGAGTCCAGTGAAGTAGACTAAGAGGATTTT
AGGAGGTCGTCATTTTGATCGacaaaaaattccaaataacgaaaaaaata
tatttagtgttgaaaatataattaagaacGGGAAAAAAGTCAGAACAAAC
ATGACTAACAGatttacaaaacattacttcatCCCAATTTTACCTTGCaa
aaaaaaCACACCCGCTTAAGCAAAAGCTATATTAAAGGGCTCTTTAAAAT
GTTTACAGAAAACGGATATCCGTTCTATTCTTTGTTTAAAATCGCAAATG
TTTAATTTCGTTAGCCGAAtcttaatctttttttataaaatacaccattt
cgactgtagccgccaattgctaCGCGAGAAAtgtttttgtccgttttacc
accctaaaaccgtcccagtcttcgTCCATCATTGTTTCGCACCTACAGAA
AATAGAATAAGGTGTAAAAAGAATTGGGTCGAGTTTAGGGGGGATtagtt
aaataataaagtgacaTTGTTTCACGATGGCTACAACAAAATGGTTTGGA
TCGATAGGGCCTTGCACAAACAGTTACTTCGTTTTGCTTGTTTACAGAGT
GTACTCCTTTtgaccaaaatcaaaaatttgaaaatatcttgcttaatttt
cattcaaagtttttcaaagtcACCGTCAACCAAGGTTAATTCGTAAATTC
GGCCCGcgtctttcattttcatttgggaTTCAACAGAAATATCTCTATCT
AAAGGTGTCCCTTCGCTCAACTGAATAGTGACAAGCTAATTCGACCATTT
ATTCAAAACTATATTTTTCTAGATCGTTCGATTTTACTATCAACTCATTA
TATGGACGAAGCTGATCTTCTTGGTGACAGAATCAACATCATATCAAAAG
GGAAACTTCAATGCTCCGGCACATCACTCTTCTTAAAACGTCAATTCGGA
AAAGGTTATTTCCTAACAGTCACCAAAGATCAAGAAAATGCTGATAAATT
TGATATACAGGCTATCGGCAAATTCATCACCTCATTTATACCTGGATCGA
AACTCCATGAAGATTTTGAAACAGAGATTACGTTCTTATTGCCTTCCGCT
GCTCGGCTGACGGGCGAGTttacaaatttgtttgaaaatttggagAAAAG
TTTGGCAGATTTTGGAATAAAGAATTATGGTATCTCTGATACTACTTTGG
AAGAGGTAAGGTCTCTTTTCAAATACAGTCAACTAACCCGATTAACGCAC
ACTCTAAGATGGgtatttttgagccaaaaaaataaaaaagctgtTATCTT
GTGAAAAGCTTTTAATTAGTTTAAATAATTTAAATCCGTTAGCTCTCTAT
GTCTCTGACTtcataatttgaaagattttagaCCATGTTCCAATATTTTG
ATTGtagagctgaaaattttttgtctGTCCATATTTGACAATCAACGAAC
CTATAACAGTGGTGTTGTGAGATTTGAAAAAGTCATTAAACCTTGTCTTT
GTATTTTCAGGTTTTCTTGAGAGCATGTGAAGATGAACAAGATGATCTGT
TAGCCAATGATGGTAAGTtgttttattcattcattcattcattcattcat
tcattcattcattcattcgttcattcatC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000082_pilon:694529..701957+ >MSTRG.11386.3.p1 ID=MSTRG.11386.3.p1|Name=MSTRG.11386.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1230bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000082_pilon:694529..701957+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAACGGAAGTTGTCGGTGGCAATGGCGTTCATCGCCAACTCCAAAAC
AGTCATTCTTGATGAACCGACTTCCGGTGTGGATCCTTATTCGAGAAGAG
CCATCTGGGATTTAATCCTCAAATACAAAGAAGATCGTTCGATTTTACTA
TCAACTCATTATATGGACGAAGCTGATCTTCTTGGTGACAGAATCAACAT
CATATCAAAAGGGAAACTTCAATGCTCCGGCACATCACTCTTCTTAAAAC
GTCAATTCGGAAAAGGTTATTTCCTAACAGTCACCAAAGATCAAGAAAAT
GCTGATAAATTTGATATACAGGCTATCGGCAAATTCATCACCTCATTTAT
ACCTGGATCGAAACTCCATGAAGATTTTGAAACAGAGATTACGTTCTTAT
TGCCTTCCGCTGCTCGGCTGACGGGCGAGTttacaaatttgtttgaaaat
ttggagAAAAGTTTGGCAGATTTTGGAATAAAGAATTATGGTATCTCTGA
TACTACTTTGGAAGAGGTAAGGTCTCTTTTCAAATACAGTCAACTAACCC
GATTAACGCACACTCTAAGATGGgtatttttgagccaaaaaaataaaaaa
gctgtTATCTTGTGAATGAAACGGAAGTTGTCGGTGGCAATGGCGTTCAT
CGCCAACTCCAAAACAGTCATTCTTGATGAACCGACTTCCGGTGTGGATC
CTTATTCGAGAAGAGCCATCTGGGATTTAATCCTCAAATACAAAGAAGAT
CGTTCGATTTTACTATCAACTCATTATATGGACGAAGCTGATCTTCTTGG
TGACAGAATCAACATCATATCAAAAGGGAAACTTCAATGCTCCGGCACAT
CACTCTTCTTAAAACGTCAATTCGGAAAAGGTTATTTCCTAACAGTCACC
AAAGATCAAGAAAATGCTGATAAATTTGATATACAGGCTATCGGCAAATT
CATCACCTCATTTATACCTGGATCGAAACTCCATGAAGATTTTGAAACAG
AGATTACGTTCTTATTGCCTTCCGCTGCTCGGCTGACGGGCGAGTttaca
aatttgtttgaaaatttggagAAAAGTTTGGCAGATTTTGGAATAAAGAA
TTATGGTATCTCTGATACTACTTTGGAAGAGGTAAGGTCTCTTTTCAAAT
ACAGTCAACTAACCCGATTAACGCACACTCTAAGATGGgtatttttgagc
caaaaaaataaaaaagctgtTATCTTGTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000082_pilon | genome | sc0000082_pilon:694529..701957 + |
|
