MSTRG.1185.3.p3 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.1185.3.p3
Unique NameMSTRG.1185.3.p3
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000005_pilon:3421160..3442415-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.1185.3.p3 ID=MSTRG.1185.3.p3|Name=MSTRG.1185.3.p3|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=21256bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000005_pilon:3421160..3442415- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATATTGATAACTTTGATTAAAATTAGTGTAAGGAATGGTATAAATAAAAC AAAAAAGATATCAAAAGCACTTATTTACAAAATAATTTTAAATGCCTGGT AAAGCAAAGAAATTCCCTTGTCCAAATCCATTGTTTTTGGAATGGCTTGA AGAGTGGAAAACAGAAGCAGAGGAAAGAGGAAATAATTCCAAATGGACGT ATATCAAGGTATGAATTGGACTTTTTGAATATTTATGGATCGACCATTGA TTTGATTGTGCTAAAAAGCTGGTGGAATATTTCTTGTGGTGACACGAGAA TGATTCATCAAACAATATAAATATGGAGCAATCTTTATATTCTTTTTTTT GTTTTTCTGTATTGAAAAGAACTAAACTGTTTCTTTAATCTAGAGTGCAT CTTTGTATTTTTTGGCTTAGTTCACAATTTATGATTTCAAATTTACATCT CAAAACGATTTTGATTTCAACTTTTTCCTTTTATAGGCAATGAACTCATT AAAGAAGTATCCACTTCCTTTACATTCTGGTCAAGAAGCAAGAATCCTGG AAAATATTGGTATATAATATTGGCTATATCATGGGAATAATTAGGGTTGA AAAATAAGAGGCAATTTTTGTAGGTATCTTACTCTTAGAGAGACATTTTT TACTTTCATGATTTTTTTTACGTATAGGAAAGACTTCTGAAGTTTAAAAG TTTAGGCAATCAAAGGGACTATCTGACTTTTTGCTACGTTAAAGCAATGC CTAGAGGGAGGTTAGGTTTGAAGGCCTGAAAAGCCTACTTTTGTTTTCCG CGTTTCTTTATACCCATTTTGCTTTTAAATCACAGGCTGTTGTTGTGAGA TTGTGGTTAATCTATATTATAGATTTAGTATAATGATCTCGATCAAGCTA GTTTTTAAACTAAGGAAAAATAAAAATTTATTCAAATTAGTTTGATGACA 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ATCCCTTCAGTGACGTCATTGCACTAGAAGAACAACACCTGATACAATTC AATGAATTCTCATCACAAACCGATAAAAATAAGGTACATTGGGAAAGAAA TATTCATTAGTTTTGTCCATTTTTGTCCATTTATAAATCCCGAAGGGCTA GATGCCGTGCTATAAGCCATCTCTGGCAAAAAAAATTGAATATCGGAAAA AATATTATTGCTATTGTTTTCGAAAACCCGCGAAGCTTCTGATTGGTCAA GCGCTGAAATTCTGTTGTAATGTCGTCACATTTCCTAGATAGGATTTCCT ACCTAACCATAGCACACTTTTCAGCAAAAGTTTGACATCTAGCCCTTCGG GCTTTATAAATCTATGGTTTTGTCTACATTATCCTGGATGGATTCCCGGA CAATTCCCCCTGGTGAATTCCCCCCGGAAATGTCCCACCCGGTGAATTCC CCCCCTGGTGAACTAAAAAATCATGTAATTTGAAATAAGCCATTTTACTA TTTATTATATAAAAATCTGTGTAGAAGACTATCATGTAAAAATCTTTCAG TACTTTTCTCAGAATCAAAAAAAATGGGCGTTGTGATTCTTAAAACTTTG TAGACTATCATGTAAAAATCCTTGACCCTAAAATTGGAGGTTTGTTTCGA TTGAAAGTTTTAAATTAGTCTCTCTAAGGGTCGGAAAATTCAGGATTTTT AGGAAATTTTTTGATTTCCAGAGAAAAAATTGTAATAAAGTCTCTCTAAA GTCTAAGGGTAGGACTTTTTTCAAAAATCGAAAAAATATTCAAAAAGTCT CTCTAAGAGTCACCTTTTCAGCAAAAATCAATCTCTCTAAGGGTCGGTTT TCGGAGGTCCCGTCCGCACATACCTCTCATTCGCCAACCCTAGTACCCCC CCCCGGGTTACATTCCATGATTTCGAAACTTAAAAACACATATAAAAATA TATGGGTGGGAATTCACCAGGGGGGAATTCACCGAGTGGGAATTTTCCGG GGGGGAATTCACCAGGGGGGGATTTACTGGGGGGGGATTCACCGGGGGGA ATTCACCAGGGGGGAATTGTCCGGACACCCCTGGATGCCACTTACGACTT TTTCATAGACTTGATAACGCCTTGCTGCATAAGGACACCGAGTTCTAGAG TTCTAGGCTACCAGCATCTCTCCAATTTTTTTTATGATGAGGGGTGTGAG TCGACCTCAAATATCACGTGTGCTTAGCAATTCTTCGCTGAAAAAGGTTT TTGAGATGGAGATCGTATAATGTCAGAGAAATTTCAGTGTGACGAAAAAG ATTACGGTACTCAAGTCCATGATTTGCTTTTTTATTCAATTCTGGTCAGT TAAGGTAGAGAGGTCACACCAGCAAACACTTTTTAAGCGGAAGTGTTTTT TGACTCGCATATCTTATAACGAAAACTATTTTAGGAAGGCGTGCAGCCTA GTTTTGTCCATACAGACTATTTTATGTTCTAAATTGTATTTATTATCAAC ACTGTCATAATGCACTTAGTAACATCATAAATGAATGATCGAAAAACTGG ATTCCAGTCCTTGTCGACAACGAAAAAATTACCAACCCCTGACAAGCCTG TCTCTTAAAGTGGCAATGAATCTGTTAGTTCAATAAATGAACTGAGAGTA AAGAACTACATTTATTAGCTGTTCTCTTAAATGTTTCAAAGCTGTTTCTT CTGGAAGTCGAATTTCATCCTTTTGAAAGTTTGTTGGGATGATCACTCGT CCCTTGGGCCATCACACTTTCATTAAACCTACCAATTATTAAATTTCAGG TGTTGACTTGTCGCGAGATGTTTGTCAAACAGTTAATGCAAATGAAGGGC GTTTCGGCCGAGCGGGCGGTGGCTATCGTTAATTTATACCCTACTCCTTC GTGGTAAGCCTGTGGAAAGTCCATTCGCATTGAGTGCGCATTCTTTTCGC TACCTTGTGGAAAACACGCCAGAGTAATAAAAATATAATTCACTTGAGGA AGACTGGTTTCAGCATTGTAGCAAAAGAGACTGCATACTTTAAAGCGAAT GGACTTTATGATCCTCGAAAAAATGCTTATAGTATGCTCATGAAATAAAA ACGAGGCTCACTCAGGATCAACTTGTACTTTTTCCAATTCTAACATGAAT TTGGTTAAAAGCGTTATGTTAAAACTTCTCTAATGTTTTTACAGACCGAG GTACCATTTTGAGACACGTGTAGCGTTCTCTTCTAGTTAAAATGAAGAAT AATCCGTTCGTTTGTTTGGAGCTCATAACGGTTACTTAGATTACACAATA TATTTGACAATATCGTTTTCGGACCGTAATGTACGAAGTAAATAACAGGT ACTCTATTATAAAAAGAAATTATCTTTCTATAAACAATCCCACTATATTG TTGAAAAATTGCAAATCGAGCTGACAATATATTGCGGACACCTTTTCAAT ATATTGCCGGCCCTCGGCAATTTATCATCAATATATTGCCTGACAATATA TTGTGTAGTGTATGTAGCCTTATAGATTTTATTTTTGTATTTCTGTTATA TTTACTCTTTATCATTTCGAGGAAGCATCCTTTCTGCTTTTAGTTTGATG GACGCACTTGACCAACTACCGACAAACGAACAGAAGATGAATATTGTTAC CGATCTCCCTTTCGGTAAAGCAAGGAAGTAAGTCAAGTACTTTTACATAT TATTTTCCACTTTTACTGAAGTTGACGCTCTCTTATTCGACGTTCTACTT TTCAATACGCTTCCTTATTATTCGACTCCAATTCCCCTGAAAATTAAATA CGAGAAATATTTTCAGAGATGTCTCAAAAACCTGAAAAATTGAGTGAGTC AGTGAATTATGGGGAAAAGTCAAGGTGAGGTCTCTGAAATTTCGGCAAAC CAAAAGTCAGGGGGGTTTGACCTTCCAAAAAATTCCCCTGTAAATTTGGA ATAATGCACGCAATTCAGAGAGGTGAGCTTCAGAATGAATGGTCTGTTGG TTCTCCTTTATTTGCTGTGCAACCCCATCATCTATTTGACCTGCTTCACG AAAATCCGGCTTAGCTAGTGGTTTAACCACTTGATTCGAAGAGTAAGTCC ACACGTGTTTCTTGATCTGCTGAATATTCAAGGAATAGATGCTACTTTAA GGCCTGAAGTAGTTTCAAATGGGGATGAAGCTTCAAATGATGAGCTAAAT AATGCGATCGCTCCAGAGGTTCAATTAAATAAAGAAATTGCCCCAGAAAA TGGATTAGATGATGAGAGCGCTGCAGAAATTCAATTTTTTAATAATGAGA GCGCTCCAGATATTCAATTGAAAGTGAAATTGAAAGACTGAAAAATGTGT GCGTGAAAACAAAAAAGGGCTAGACCCAATCCGCCATTCTAAAAGAAGTG CAAATCTTAAGACTTCACTTTTTCCTTGTGTGAGAAGATTGAAGATTCCG CTTTAGACTTTCGGGCTTCAAACACAATGCACTTTCACTCATATTTCTCT ATTTTATGTCAGGAAAATTGGTTTGCCGATCAGTCGTCAGCTGTATGCAC ACTACACTATGGTAGATGTACCACGTGATTGAATGTATCCAATGAGAAGT CGTTCGTTAGGTAACCATTTCGTTATACCTTGGGCCCTAGATATTGAAAC ACCCCCTTCTCATAGACCCAGTAGGATTTTTCAGCCAGTGGGGGTAAAAA GAACAGACCAAAACTGGATAGGGATTGATATTCTCATGTTTTTTATAACA AGGGATTCGAATTCCATTGCTTTCGAGTTAGAAAATTCAACAGGGATAGA AAAATAGCACAATATTTTGCAGTGTGGATTTGCTTAACTAATTATTTGCG ACGGGAGACAAAAATTTGAGTATAATTTTCCACTGAGGACGATATTTTCA CCAATTTTACAGGGGGAAGGGGTCCAAGTTTGCCTGAGTAGGGGTGTATT GAATTCTGAGAAACAGAATTTGCACGACAGTTTAACCCATTGCATACAAA AAGAGTTTAGGTTACTGGAATGAAAAAACTGTTCTGGAAGAACCTCAATC TTCATTGAAAACGATAAACAGTGTTTTAATGAATAATTCAAATAGATTTT TCGACACTCCAAAATCGTAGAATCGCTCTCTTAAGAACGAATAGAGAGAA TTAAATATTCACACTACTGTGTTATTCAATGCTTTTTATTCACTAATACT TTATAAAATATTATAATTTTTTCTCGATTCATTTTTTCAGAGAACGTTAA CTGGATGAAGAATATTTTTCTCAGTTTGAAAGCAAAGATGTTTTGGTAGC TTGGATTGTGAAGAAAAAAGAAAATCAAAAACGAAAATACAGAGAATTTT ACAAACTACAGCCTTGTGTAAAGATATTCTCGAAAAAGTGTGAAGTACTA CCAGATTGATCGATATAATATTATCGAGATAATCGAGTTTTAAACGAACA ATTTCATTAAAAGCATGTTCGTATTTGAAAAAGATTTCGAGATTACTCTT TGCGTTGTTTACGCTCTGGGCGCAGTAGCTAGCATCTGGGGTGCTTTGTT TTCACCTCACATCTTTGATTGGATCGGAGTCGAACTTGAACATAAAGTTG TTGGAAGAAACTGGCCTAAGAGGTTTCTATTATCTTTGGTAGCCCAACCG GTAACTTTTGCGGCGGCAGCAGTGGCGTTATGGTGGTACCCGCTTGTTGT TATAATTCCGCCTATTCACTTCTTTGCTACCATCTTTTGTTTGATTGTAA TTGACGTCACACGAAAAGAAGAAGCCTGGGAGAAGGGCTATCAAAGATTG TTTTGATTCAGATCTCATGTTCGTTATTTTGACCAAAAGTTTGTTTCGAT CAAATTTGGGAAAGTTACAAATTGGGAAAGCGTAGTAAACGTGTAGACAG GTACTGACAATGTTCTACGGTGTCCTGAAATTGAGAAGAAGTACTTTTTT CGATTTTCAACGACGTTAAATACTCAGATCTATCAGTTTTACATTTATTT TCTATTTGAAGTAATATGTACAGTGTATACGAATTTGAAATATTGCAATA TTAATATTGACATAGTATTCTATCAAATTTCATTATATTATATCTTAACA TGGCAG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000005_pilon:3421160..3442415-

>MSTRG.1185.3.p3 ID=MSTRG.1185.3.p3|Name=MSTRG.1185.3.p3|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=342bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000005_pilon:3421160..3442415- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTCGTATTTGAAAAAGATTTCGAGATTACTCTTTGCGTTGTTTACGC
TCTGGGCGCAGTAGCTAGCATCTGGGGTGCTTTGTTTTCACCTCACATCT
TTGATTGGATCGGAGTCGAACTTGAACATAAAGTTGTTGGAAGAAACTGG
CCTAAGAGGTTTCTATTATCTTTGGTAGCCCAACCGGTAACTTTTGCGGC
GGCAGCAGTGGCGTTATGGTGGTACCCGCTTGTTGTTATAATTCCGCCTA
TTCACTTCTTTGCTACCATCTTTTGTTTGATTGTAATTGACGTCACACGA
AAAGAAGAAGCCTGGGAGAAGGGCTATCAAAGATTGTTTTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1185MSTRG.1185Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1185.3.p3MSTRG.1185.3.p3-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1185.3.p3.exon25MSTRG.1185.3.p3.exon25Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1185.3.p3.exon24MSTRG.1185.3.p3.exon24Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1185.3.p3.exon23MSTRG.1185.3.p3.exon23Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1185.3.p3.exon22MSTRG.1185.3.p3.exon22Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1185.3.p3.exon21MSTRG.1185.3.p3.exon21Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1185.3.p3.exon20MSTRG.1185.3.p3.exon20Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1185.3.p3.exon19MSTRG.1185.3.p3.exon19Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1185.3.p3.exon18MSTRG.1185.3.p3.exon18Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1185.3.p3.exon17MSTRG.1185.3.p3.exon17Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1185.3.p3.exon16MSTRG.1185.3.p3.exon16Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1185.3.p3.exon15MSTRG.1185.3.p3.exon15Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1185.3.p3.exon14MSTRG.1185.3.p3.exon14Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1185.3.p3.exon13MSTRG.1185.3.p3.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1185.3.p3.exon12MSTRG.1185.3.p3.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1185.3.p3.exon11MSTRG.1185.3.p3.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1185.3.p3.exon10MSTRG.1185.3.p3.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1185.3.p3.exon9MSTRG.1185.3.p3.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1185.3.p3.exon8MSTRG.1185.3.p3.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1185.3.p3.exon7MSTRG.1185.3.p3.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1185.3.p3.exon6MSTRG.1185.3.p3.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1185.3.p3.exon5MSTRG.1185.3.p3.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1185.3.p3.exon4MSTRG.1185.3.p3.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1185.3.p3.exon3MSTRG.1185.3.p3.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1185.3.p3.exon2MSTRG.1185.3.p3.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1185.3.p3.exon1MSTRG.1185.3.p3.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000005_pilongenomesc0000005_pilon:3421160..3442415 -