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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000389_pilon:208444..215935- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_045782 ID=XLOC_045782|Name=XLOC_045782|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7492bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000389_pilon:208444..215935- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TGTTGCATTTTCTTTTTCTTCTTCTTCAATTCAAAATTTTTTTCAAAAAT
CGGTCCGCAGAACATGAAGATAATACCAAAACTTTCTCTCGTTGGGTACT
TTTATCTTCTTGCATGGATCTGTCAAACTGTATGTGACCGAACACAGGTT
TGTTTATGTTCAACTTATACACCTTTTCGACCGTAGTCGCACGGTCATTC
GCGGCCATTTTATTATTTAATTACCCCCCTAAACTCGATCCAATCCTTTC
TTGACACCTTTTTCTATCGCTATAGGTACAAAAAAAGGACTGGGACGGTT
TTAGTGACGAAAAAATGTCCGTGCGGGAATTGGCGGCTATGGTCGAAAAG
GTGTACTAAATAGAAGGGTTTCCCATTGCGATATCTTTTTTTCTATTATT
CATCAAGAATCTTGCCTTGTTTTATGTCAATTCAATTTAAAGAGGGTCAA
AAAGCAATCCGTGGTTCCACCGCCTTGGCCTTCGTTTTAATGACCACCCT
TTCCCTTGGAAATCAAGGCGCCCGCCAAATTATTCAAGAGTGTATTCCCC
TGACATTTCAGCTTGACTACCGCAATTATTTTCCCATTTTTATACTATCC
TTTACAAGTCTGTACAAATATTTTGATAAATTTCACTGCTGAACCACAGA
TAAATTTCAGGGTACATATCGGACATTTTCTGGAATGGCTTGTTATCTTA
GTCTTAGTTTCTTTATGATAACTGAAATCTCCAAAATTAACGTAAGAACA
GTTTGCTGAATTCTTTCTGATTGTTGATGAATTCAACCAAACACCCCTGT
GTCACAGACCCGCTGGGACGCCAGCCTCACTGGAAAATATGGCAAAAATT
TTGTCCCCGGTAGGAAAATACCCTGGAATTTCAGCCCCATTGGGAAATTT
ACTTATATTTCCTCCCCACTCGAAATTTAATGTTTAAAAATTGCACTCCA
AAACCATCCCACTGAATTTTTTAACCTTTAAACAATAGAATTTCTATCCT
CATTGGGATTTCAATAGGAATTTATATCCCCACTGATGAAAAAAATTCCA
CCGGGGCTGTGAGACAGGGGTGTAACAAAGTTCACCAAAATTACCGATCT
GAAGAGGATTGGAGAGGGGGCACTGGTTCAACAGTAGACAATATCGAAGG
CTAGAAGTGAATTTTCTATAATCTCTAAAGTATTGAAACCACATACAAAT
GCCAAATTGGAAGTAACCTTTAATCATTACATTTTGAAAAATGTGCCACT
TGAAAGCTAAAAGAGTCGTAAATTCAATCCGTCATTTGAGCTGCAGCACA
AATCTTCACAAGACTTCAATTTTGGTCGCCTAAGAAAGGTTGAAGGTTCG
TCTCTAGCTAGCCTTCGATATTAATTTCTTTGCACCACCCTCTCCCTCCT
GCCACCCTACCTCTAATAAGAACTGATTATGTTTTCAGACTGGCGAAGTA
CCGAAAAACAACCATGGCTTTAATCCAGCCGTCCTGATTGGCGAAGAAGG
TAGATATTCCTTTTTTTCAATTACCAATTAACTTAAAAGACATCATTTAG
CGCATCTCTTTCAATTTGCTTACACATTGTTTTTCAAAGGAAAAGCAGGA
ACGCTTTCCTCCCTTCGGCGCCGCAGATTTTTTTTCTGTCAGCGGACGCA
GACCTGAATTAAAAACCGAAGGCTTGATGCAGCGGTCGAATATTTTTTTT
TAACGGCCGAAGACTTGGAGAAAATGAATTGTGGAAATTTGATATAAATC
TTTTTTTTTTAAATTCAATCAAGATTTTGATGTTTCAATGGAAAATAGTA
AAGTGAAAACAAATTAAGTTAAAAGATTTTAAACGAAAAAGAATGAAAAT
TAATGCCAATAACTCGTCTCAAACTACTCATCTTTCGTCTCCGATACCAC
TAGACTAACCACTGGACCATTGCACTTGATACCTGGCCGAGTGGTCCAAG
CAAGTTTAACTGACCCTAACTTATCTATCAGGTAACTTATCTATCGGCTG
GTCACTCGCTAAATCAGGTCTTCGGCCATTAAATCAGGTCGTCGGCCGTT
GAGGCGCCACACAATCAATAAAGTATTTTTAGAAATTCTTTTGTTTATTC
CGCTTTGCCAACATAGAGGCACGCCTCCTTTATTTATCACAAGAAAGAAT
ATCTTTGAAGGGAAAACATTTTAGAGGGAGCTGGCAGATGACGAAAAATA
ATGTCTCTCAGCTGGATACTCAATAATTATGGAAGGTCAGGGATGCAGGT
TTCCATTGGATGTTAAGGCAGTCTATAGGTCTTAGGACACCATCTACTGC
GTTCACAAACTTATGTGCTGTAAATGTTTTCTGCCCACCACGCTAAAGCT
CTAAAGGGATGGGTGAAAACATAACATAAGAATCTAACGAAAATGCTATC
TCAAAATCGTAAGGACCGCGGACTTATGAGCTGGATTTTGATTTAGGGTC
AATTCCATTGTATACTTTATATGTTAGTAGTGCGTAGTAAGCACGGAACT
CTGAGTGATGCAATGATTTTCCACACTTGTTCTTATACTTTTATACTTAG
GCGAGACCAATTTAATTTGTTGTTCTACGGACAGATCGTTAGAAAAAATA
TGGATCGGTCGGTCGGCAAAATAAGAATAAATTTTTCATTTATCAGGGTT
GGTAAGGTACCGAGAAAATTTTCAAAAAAAGTATCTGGATCAAAAATTCA
GTTTGTTTTTTATGAAGATCATAATAAAATTTTAGTGTATGGAATGTGAT
TTTTCAATTTCTTGAATTAATTTTCAGCTTTATTCAAGTTTAATTCTTAC
AAATAACTAGTGTATAATATATTGTAGTGGAAATTATTATTTTTTTTATT
TTTTTTTTATTTATTTTATTTATTTAACATTTATTCGACTTCAATTTTTA
CAAAATTGTTCTTCCGTCTAAACTAAGAATTATAAAAATGAAAATGCAAA
AGATATAAATTATTAAATTATTAAATATAGTAAAATTTTTATATTGATTT
AAAATGTAATTAAAGAATGCTAAAGACACAGGACTGGCAAGAGATTGAAT
TAAGGATGAGATATAGGTATAGAGCTAGGCCTGCTGGAAGTCAAGAAAAC
ATGGACGGTAAACAAAAGGCTGTAAGATTAATAAGTCAGTAAAGAAAAAA
AATATATATACCGTAAAATACATAAATAATTAAAGTAACAAAATATTTAT
AATGCTAATTATAATCACAGGGATAAAACCCTGGCTAATGCTTTATCAAA
ATAATATTTTTTAGCTTCTTTATTAAATTCTTCTAGAGTCTTTAAAGATT
TTATGTTTTCTGGCAGATCATCATACCAACGAGCTTGACATTGAAATGTA
CCATCATTAACAACTTTGATCATTGGTTCTTTGAGTGTACAGCGAAGCTT
CTTACTAGGGTTAGAGAATTCGACATTTAGATAACTGGGATGATTTTTAT
CTCGACGTGACTTGTGAACAATTTTAGCAGTGTTAAGTTCGATGTACTCT
TTGACTGGTAGCCATTTTAGTTGAATTACGTCATTTAAAGTAGCGAATCG
AGAAAGCACGTACCCAGCTGCAATTTTTTGGATCTTTTGAAGACGTTCTA
CTTGGTACTTTGGAATTTGCGCATAGACAACATTGCTGTAGTTAAGCTTG
GATAATATCATCGTTTCAGCCAGAGTCTTGCGAACATGAAATGGAGTAAA
GCGACTGAATTTTCGTAGTGCTCGTAATGTTCCTTGAGAGGATTTGATGA
TTTCGTTGATATGTGTTGACCATGTTAAGTTATGATCAAGATAGACACCA
AGCAATTTAACGTAGGTTTTGTGCTCGATTGATCGGCCAGAGCAGCGGAA
TAGTTGGCTTTGATTTTTTGGAAAATTCCTCAAGCGTTGAGAATGAAAAA
TGATGAGTTGTAGTTTGTCACTATTAAATAGTAGGTTACTGTCTTCTGAC
CACGACTGAAGGTTCTCAACATCCTTCTCCATATCCTTGATGGTTTGCTG
CAAGTCCTTGAGTTTACAGTGACGGTAAAGGGTGGTATCGTCAGCGTATT
GAATACTGGATGATGTTACTTGATCTGAAAGCTCGACGACATAAAGGTTG
AATAACACAGGGCCTAATATACTACCCTGTGGAACTCCAAAATACATAGG
TTTTATTGAAGAGGTTTTATCCTCAACCTGTACATACTGTCTCCTCTCCA
ATAAATAGCTCGATAGGATTTGTAGAGAATCAGAAGAAAAATTCATATCT
CGAAGTTTCAACAAGAGATTAAGATGGTCTATTGTGTCAAAGGCTTTGGA
GTAATCAATTAGAATGGAAAGAGTTACTTCACTTTTGCTCATTGCTTTCT
TGATGTCATCTCGAAGCTTGATCAGTAAGGTAGTTGTAGAATGTCCTTTA
CGAAACCCGGACTGCGTTTGACGATAGAGAGCTTTATCTTCAATAAATTT
ACAGAGCTGATGCAGGATAACTCGTTCAAAGACTTTCGAGAGCACAGGGA
GTACCGATATTGGGCGATAGTCTTTGATTTTGATAGGTAGGTCGATTTTC
GGAATAGGGCATACGCGAGCAATTTTCCATTGTCGAGGGAAGATTTTCTT
GTCAATGCAGTTATTGATGATATTGACAAGTGGCGATGTGATGAATTCCG
ATATCGGTTTTACAAAACGAATAGAGATATTATCAGAGCCGCAAGAACAG
TCATTTTTCAGGCTCTTTAAGATCTGACATACTTCATCATAAGTAACATG
ATGAATTTTAAAACGCGTTTTTCGTCATCTATCGTTTCGATATTATCTGG
TAATGTTGATTCTTCGTTAGGTTTGCCGGTGAGTTTCAGATGCTAATTTG
CAATAGTAATCATTCATCTCGGATGGATGGGTGCTTAATTCGGGATTTTT
GATTATCCAAAACTCGATGTATTGTACTCCAAACGGCTTTTGGATCCCTC
GAAGATAGGGATTTTCTGAAAAAGTTATTTTTGATTTCTTTCAGTCTCTT
TTTGTACTTTTTGAGGTTTTCTTTGTAGGTGGTTTTATCTTGTGGGTTCA
ACTTAGCCTGTTGACGAGAAAGTTCTAGTTGAGCTCGACAGTTTTTGATA
GCTGGGTCCCTCATCCATGGCGCGATGGGGCGGGTCAGCTTCACCCGTTT
CAGCGGAGCATGATTTTCGATGCATTCGAGGATTAGATAGTTGAGGATAT
CGATTTGGTCTTCTGGATTGTCGAAAGCATAGATGGTGTTAAAGGGTGCT
TGTGCTACATCATTGACATATGAGTTCATATTGAGATTTTTGTCATCACG
AAGAAACTTGTAGCGAGGTTGGAATCGTTCCTTTTTAATATTCAGCAAGA
TGTAGGGGGTATTATGGTCACTTATCTCGTCGGTGGGCATGACATTGCTG
TGGGTGACTTTGTTAGGAATATTGGTTATAATATGATCTATTAAAGTTTT
ATCAAGTCGTGTTGGTTTTGAGATATGCTGATAGAGGTTGTATGAGGTAA
GTATTTCTTTGTAACGAGTTGTCGATTCTTTTTCTTGACCGATAAGATCA
ATGTTCATATCACCGGTCAGAATGATAACGCCATTCCATTTCGTGCAAAT
TTCAGCAATGGCGGTTTCAAATAAGTCTAACCAATGAAGCTTTTCTTTTT
CCTTGAAGTTCGGTTGGTAAACGGTGACAACGAGATAAGGTGTGTTTTTG
TTTCGGCCTCGGAATTCGGCAGCCAGAATTTCAAGGGATGAGTTTTTCGT
TAAGTCCTTGCGCGGTTGAAAATGATGATAGTATTTTGCGTAAAGACCAA
CTCCACCACCTCGTGTTTTTCGGTGCTTGAAAATGGGTACATAACCAGCA
ATTTCAACATATTTCGCTTGCTCCTTGTTGTCCTGAAGCCAAGTTTCGTT
GAGGGTAATAATGTCGAATTGTAGGTCCGTCAACATAGAAGAAAATTCAG
TGAACGTTGAAAGAAGTGATTGAGTGTTTAAGTGTGCGATGGAGGTTAGA
TTTCGATTATCGTTTAATAAATTTAAATGAGGATTTTCGATTATCAGTTC
ATCGATCGGAAAGACTGTCATTCAGATCTCGTAGACTAAAAAAATGGAAA
GACGGACATGATACATCCCTGACATGTCCATTCCACGACGTTTCGAGATG
TCATACGGTTTTGTTCATATTTTGAGAGGTTCGAACATGATGCATGGGTT
AGACACAGACATTTGGTACAATGTAGGCGCTTGCGATTTGTTCCAACTCC
TTTATCACACTCGGTGCATTTTGGTGCTGGTCCCGGATTGAGCTCGATAT
CACCAGATAATACAAGATTAAAAGTTGCATCAGAGTTCGAGTAATAACTG
ACAGGCGATTTCATTCTCTTGATTTTCGATGGGATGTGTTTACAAAAGGT
TTCATTCTTTGTAACAGCAACGTAATCAATTATCGAAGTGTGGACGAATG
CATTAAGTGTAATTAAAGTCATTAAAACAATTAAGCGATTCATCTCGAAA
AATAAAAAATGTTCAACTTTTTTCCGATCTGATGTATAAGAAAAAAGTGT
TTGTTGTGTGAGAAAAAAATGATCCAACTTCGATTTGAGTGTCAAATTTA
AACAGTTCTATTTATCTTTATCAGGATTCCCATAAGTTGATCTCGATTTT
TAGGTTGAAATATGTTTGAACAAACATGTACTATTAGTCCCTCAGTACTT
GCTCAAAACTATCAATCTTTGAAATTTCTTATGGGGAGATATAAAAGCGA
TCCAGCAGTAAAACAAACTCTTAAATCAAGAAAACAACAAATCCAGATAA
TCTTCAGATAAATAATTAACTCTCCATCCAAAAATATGTATACTACCAAG
GCAGTTTGTTTGAAAATTTAAAACTTCAAAATCAAAAAGTCAGAGCATGA
CCGCACGCCACGATGGCGTGGTGATTTTAGCAAAAATAGGGTCGGTCAGG
CCCGTAGAACAACGAATTAAATTGGTCTCGCCTTATATGTTATAATTTCA
GAGAAAGAAGTAAAACGTAACAGTCTTATTGCGATCGTACCAATTCTTTC
ACCCGAATGGAGCGTTAAACTTGACATGAGGTGGTACAATGAGACAATAA
TAAGCTCAGATTCGAGGTACGCTTGCAGTATTTTACAATTGTCGGCTAAT
GGTTTGGAAAACGGTTACGGTTGCCGTGTCCCTTTTATTGGTATGGGTAA
GAATTCTAAAAAGTTTGCAATATCGTCTGCTGTGAACGGAAACAGCAATC
ATAAAATCCCGCCAACACCACCTATCGTTAATATAAACAAAACGTACCAC
GTCGAGGTTCAACAACGATATGTCAGTAATGGTAATTACAGATATGACGT
CTTGATCGATGGAGTTGAAGTTTATAGTGTCCTGAACACTGATGCTCGGC
AATTTTACAATGTTCATGTGTACGCAGGAAACCCGTGGAATGACCCTTGC
CCTGTGTACATCAGTAATTTGAAATTAACAAACTTTTTGTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000389_pilon:208444..215935- >XLOC_045782 ID=XLOC_045782|Name=XLOC_045782|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1398bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000389_pilon:208444..215935- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TGTTGCATTTTCTTTTTCTTCTTCTTCAATTCAAAATTTTTTTCAAAAAT
CGGTCCGCAGAACATGAAGATAATACCAAAACTTTCTCTCGTTGGGTACT
TTTATCTTCTTGCATGGATCTGTCAAACTGTATGTGACCGAACACAGTGT
TGCATTTTCTTTTTCTTCTTCTTCAATTCAAAATTTTTTTCAAAAATCGG
TCCGCAGAACATGAAGATAATACCAAAACTTTCTCTCGTTGGGTACTTTT
ATCTTCTTGCATGGATCTGTCAAACTGTATGTGACCGAACACAGACTGGC
GAAGTACCGAAAAACAACCATGGCTTTAATCCAGCCGTCCTGATTGGCGA
AGAAGACTGGCGAAGTACCGAAAAACAACCATGGCTTTAATCCAGCCGTC
CTGATTGGCGAAGAAGAGAAAGAAGTAAAACGTAACAGTCTTATTGCGAT
CGTACCAATTCTTTCACCCGAATGGAGCGTTAAACTTGACATGAGGTGGT
ACAATGAGACAATAATAAGCTCAGATTCGAGGTACGCTTGCAGTATTTTA
CAATTGTCGGCTAATGGTTTGGAAAACGGTTACGGTTGCCGTGTCCCTTT
TATTGGTATGGGTAAGAATTCTAAAAAGTTTGCAATATCGTCTGCTGTGA
ACGGAAACAGCAATCATAAAATCCCGCCAACACCACCTATCGTTAATATA
AACAAAACGTACCACGTCGAGGTTCAACAACGATATGTCAGTAATGGTAA
TTACAGATATGACGTCTTGATCGATGGAGTTGAAGTTTATAGTGTCCTGA
ACACTGATGCTCGGCAATTTTACAATGTTCATGTGTACGCAGGAAACCCG
TGGAATGACCCTTGCCCTGTGTACATCAGTAATTTGAAATTAACAAACTT
TTTGTAAAGAAAGAAGTAAAACGTAACAGTCTTATTGCGATCGTACCAAT
TCTTTCACCCGAATGGAGCGTTAAACTTGACATGAGGTGGTACAATGAGA
CAATAATAAGCTCAGATTCGAGGTACGCTTGCAGTATTTTACAATTGTCG
GCTAATGGTTTGGAAAACGGTTACGGTTGCCGTGTCCCTTTTATTGGTAT
GGGTAAGAATTCTAAAAAGTTTGCAATATCGTCTGCTGTGAACGGAAACA
GCAATCATAAAATCCCGCCAACACCACCTATCGTTAATATAAACAAAACG
TACCACGTCGAGGTTCAACAACGATATGTCAGTAATGGTAATTACAGATA
TGACGTCTTGATCGATGGAGTTGAAGTTTATAGTGTCCTGAACACTGATG
CTCGGCAATTTTACAATGTTCATGTGTACGCAGGAAACCCGTGGAATGAC
CCTTGCCCTGTGTACATCAGTAATTTGAAATTAACAAACTTTTTGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000389_pilon | genome | sc0000389_pilon:208444..215935 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 211-699:490 |
| Aaloc | 148-207:6055 |
| Aaloc | 1-147:7493 |
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