XLOC_045775 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_045775
Unique NameXLOC_045775
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000035_pilon:1625057..1637432-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_045775 ID=XLOC_045775|Name=XLOC_045775|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=12376bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000035_pilon:1625057..1637432- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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ACTTACAACAAACGATTTTAAACACATCTAAATCATGCAAAGTCAACATA TAAAAACAACGTCTTTAGATTCTTTATTTTGTCGAAACTTTCAGAAATTT GTACTCTTGAATTTCAAACAAAACAACTAATTTAGGCAATATACAATGCA AAGAAACTACAATAAAGTTCTAAAAGATATATTAATGAAACTATCGACTT AAAAGGATTGATGTCTCAGTTTTATGGGCGGAAATATATGAATGTTGATA TGTTTAAACTAACACTACTTCAGTCTAATAAAGTGCTAATTGGCTAGTTC CTACTACATCCGATTACTATAAATATTATTTTGTGTCAAATTTGATGACG CAAAGAATCACTAGATATATTGTTGATTTCAATGATTTCAAAAAAGCTTT CTTCATCAGTTGTACCCACATGAAAAAAAACGAAAAAAGGTCTAGCTATA TCAGACAATAGACCACATTTATCACTCAAACTGCCTGAATTTCTTTTTGA CGTGGAAGTACGTATTATTTTTACTTCTCGAGGAAGTTAAGGAAGTTCTA AAGAGGTATAGTGTTTGACACCCTATATTTCATTAGTTTAGCAAGAAGAG ATTTTTTACAGATTTGAGTCAGCATGCTAATAAGTAAAGGCTAATGTGTA AGTTTTTTTCAAAGAATCTTTTATAAGAACACTAAAAGAGTATCCATTCC ATTCGTAGTACTGTACAAATCTATCGCTACTTTTTTGTCTAAATCAGGTT TCAGGTCATGGACTCAAAATAATGATTTTACATACTCTTAGTATACCTAC CTCTGAAAATTGTATCTTTTTGTAATTTGGGCGAATTTGAAAGAAAGCTT ATACGGCAGCATATACTTAAAATTAGAAATATTGTAAATCAAACAAAATG ACATTATTTTTCACACATAGATCAGCGAGTAGATGTTAATAGGGGATAAG 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CTTTCACACTATATAGTAATACTATTTCAAAACAGATCATCTTTAGCCCT TGTATAATTCAACGTGGTATCAGAAAGTGAAGTAATACAGGCTAAAATGT TTTTGATAAGGATTTTCAAGGAAGTTTATGTTTGTTTTTATGAGATTATG AGACAGATTAGTCCGTTCTTTGAATTCTACCGACAATTTGGAGGTACGGT TAATTTGAAGGTTCTCTTTCCCCTGAAATTAAGTCACTAGAAAATTTTAT TTTTCAAATCAGTCACCAAAAAGTCATGACGATTTTCTAGGTGAACTCGC AGTGAAAAGTTGCAATCTATTGAGAAACTTCACATTTTCACGGTTAAGTA TTGATAGAATGCAGATCACCGCGAATACCTCAAATGTCCTTTGTATATGG AATATTATGGAAGATACGTGTTTTATAAGAACATCCAAAATTTTTTAATC CTTCGGATATTTTTGAGTTTTAAGCCTAAAATGTTCTTATTTTAGCCATT TTTTTTTGAGTATTTTTGTCCATTTCCCTAAGAAATTGGATGTTTTAGAG TCAGCAAAGCCTTAAGATGTTCTTAACTTGTTCTTAATACTTTTGCCATA GAAACCTTATGTTCTTATATAGTTTGTTCTTATAAAAAAAGTGTATTGAT AAAAGGGGTCTTTCTATTTTGATATGTTTGTAGCCAGTACTTGACTTTGT TGTTACACCGCATAAAGGAAAGTGATATGTACAGGCTAATAAAGCAGCAG CAAGCTATCCAGCTGAAATAATAACTTAATCAAATTTAACTGAATTAGTA GACCTTCAAAGAACATAAAGATTGAGGGTAAATCAGCCGGCACACAACGT CAAAACAACGTTCGTTTAACATTCATAACGTCCAATTAACGTTACTTGAA CGTTAAAACAACATCAATATTGAGAATCCAAAGAAGACGGTTGATTTTTG ATGTTTTTATTATGATGCTCTTGAGCTGTCTTTTTTTACAGTATTTCGGC ATTTTCCCTCTAATTAGATCCTTCTTATCTATGTTTGATAGGTAGGGTTT GTTTTTATCACTACATGAGGACAGCTTCCGTGTTGGTAACATCTTTTAAA CGTTTTTCTAACGTTACGATTTGGTACTAGTTTAGAAAAGCGGTGTAAAT CAAGGGACTAATTTAGGGTCATAAACTCCATTTATGGATAACCCCCGCCG GGTTGCTTGAGATCTAACACTTTTTCAGGTATATAATAAACCAAAAATGT CACTTTATTCTATCGCTCTAGTTATTTCTAAGGGCTATAACACCGCTCAA CCTCAAAACCTTCTTTTTAGAATTTTTCAATTAATTAATTCGTCTTTGCA GCGGATGATAGACATCTTTATCAGGTCAAAGACTTTTAATTATTGGTTTA CTAGCTTTCTGAACAGTTACCGTTTTATTAAGATCAATGTCGGTACGTCT CCTCTGTATTAAGGCTAATTGACCAGCATTGATCCGCTATCAACATTTGT GAGCAAAAAAAGGTATTTCTTTAAAACTTCGATAGAAAAAGTAAACTTTG CTGACAAGTGAGAAGTTACCGCTTATAGTCAGCGGCTTTTTAAAAACCAA TTTTGATGACAAAACATTAAATAGAAACTTAATTTCTATTACAGAAAAAT GAGTTAACTTTGGGTAGGCTATTTTTAAGCTTCTATACGTGTTTTTGGCG GGTATATTATAAAAGTTTATAATGGTCAAACAATTGAGTATGTCGTCATA TTACTGCGCGGTCTCCCGTTTGATTTTTTTCCAGGCGGTTAAACGCCTGG TAACGGCGTCAAATGTCGAAACGTTTTAAGGATTTTAATCTCTTTTAAAT GTTCGGTTATTATATCTAAAGAAGACAATAGAAAGTCAATAGGTTTTTAT AACTTTCTTTTTGTGTCTTTTTGATATAGCAATGAAGACAGCATTTTTCA AATTAATAAATTTTGATAAAGTGTAAAAATGGTGTTAAGAAAGAAACCCT TGAGAATCAAATGGGTGTCCGCGTCCGTCCTCTATTAGCCAATCATCAAA TATATATGATGAGCTGTTTTTTCAAGAGCATAGTCTACAGTATGTGTTCA TTATAAGGCTATCTATACTGAAATACCTATCTATATCCCTGAGCTCAAAT GGCCTTTGGAAGATTGCCTTTACAGGCTTGTACCTATAATCAGCACTTAA AATAATAGTGATATAGTTATGCACTATCCAAAGAGCTTATGATGCGTGGA CGATTATTGAAATCTCATTATATACGTCTGCGTGTATATTCATACTGCCC GCGCGAAGATTCTCTCCCGCCAGTTTCCGTTTTTCGTTTGTTTGGCGCAT TTCTCTAAAACGTTTTTCTTTCATCGCTTCGTATCAAGAACTCGTGTAGA GGCTAAAGCGCTTATTACTGCAGGTCGTCTTTCTTTTCAACCTTTTGAAG TCATCGCTATCTTATACACGTTTTTTTATAAGAACATCCAAAATTTTTGA AGCCTCTCGGATGTTCTTAACTTTTCGGGTTTTAAGCCTAAAAATGTTCT TAACATGTTCTTAATTCTACCATTTTGTGATCATTTTTACCTATTTTCCT AAGAAATTGGCTGTTTTAGAGTCCGCGAAGCTTTAAAGTATTCTTAACTT GTTCTTAACATTTTGGTCATCAAAGCTTTATGTTCTTATATAGTTTGTTC TTATAAAGAAATGTGTAAATTATGTTTTCTTTCGCTTGTCGCTTCTTTAT AGTGTACATCTCAAGCTTCCGCCTGCTTTTAATAAATACAAAAAATAGGG TATTTTATTTAATTACCTATATATAAAAAGGGTAATTAAAAACATATAAT ACCTTTTTATAATGTATTATATTATTGTATATTTAAAAGATGATGTAAAA CGAATTAAAGATGTGACCGCTAGAATTTTTTTTACGCGTTTTTTATAAGA GCAAACTGTAAGAACATAAGGCTTCAATGGCAAAAATATTAAGAACAAGT TAAGAACATTTAAGGCTTTGGGGACTCTAGAACACACGATTTCTTAGGAA AATGGACAAAAAGTGCTAACAAAATGGTGAAAATAATAATATTTTTAGAC TTGATCCCAAAAAAGTTAAGAACATCCGAAGGCTCCAAAAATGTTGGATG TTCTTATAAAAAATAGTGTAAAAAGCTTTGCGGAATGTAAAAAACCGGTC GGTCGGTAACACAAAAAAAAGTCGTAGAGAACACCACATGCTGATTATAA TAGTTCCTTATCCCAGCTTTAAAGGTGAGAGAATCGCTAGAAATTGGATG CTTAAACTGAGTACTAAAGGAAGTCACCGTGATGTTATAATCTCTTAACG AATGACGGCTTTTAGAAGTTCGGTTTTTTTTTTCGTTTTACCTTAATGCT TTTTTTTTATAGTAACGTTTGATGACTTTTTTAGATCATTTAAATAATAC AACTCCTTGATTAGTGAATTATAAGTAAATCAATGGCGGTAATACAGCTT TTCGACCGTAGCCGCCAATTGCCACACGGCCAATTTTTTGTTAGTTTTAC CATTTTAAAACCGTCCTAGTCTTTTTTTCCGCACTTGAAGACAATAGAAA AAAGTGTAAAAAAAAGGATTGGTGGTAAATTAAATAATAAAGTGGCACGT GCCTGACCGCTCGACTACGGTCGAAAGAATGTATGGCCTAAAATACCCCG AACATATGTTCAGCCCTTTTGCTGAAAACACGTTTCTCTGAACCACTCTT TAAATTTATTTCGTAAATAGGGCGAAGGTTTCTCAGCCTCGTTCCCTGTG TATTATGGGTGATTTGATGTTTACTGAAAACGCCAAATAATCCCCAAAGA GGGTGAACTCACACTAAACTACACTAGAGTAATCTTTAGCGTCCATCATT AACGTAAAATAAAGCCTCGAATACACGGGAAGAAGTTGAAGATACCTTAA ACTTTAGTTTGAAACTTAGAAAGAAAATAAGCGACGTAATTTTCCTTTTT TTTTAAATACCGCGATACTTCAACATGACTTTCACATATTTATCTATATT TTTTAGGATTATGGATTTAGTAATATACACAAAACGTACTAAAAACAGTA ATGTTTTATGTACATCTTTAAAACCATTTTCCTCAATCATTAAGGATAAT ATGTGATAATCATGTTCAAGTATTGCGACATAAAAGGACAATTCTTATTT CATTTGTTGGCACCCCGTGGTCGAAAGCTAAGTGTGACGTCAAAAGAGTA ATAGGTACCGCTCATATCTGATTCGAAAATAGAATTATGAATTTATGACG TCATGCCTATGAATAATTCCAAAAAGTTAGTTTCATCTTTGGTTATACAT GATTTTTTGACACGGAATCGAACTCTAGCCGACGCACGCAAAGCGCTAAA ACAAACATCTATCTAACGTTCATTCTTTATGTTAGTCGAACGTTGAAACA ACGTTGTGCATCAGCTTGGATATACGTTTTTTTATAAGAACAAACTATAT AAGAACATAAGGCTTCGATGGCCAAAATGTTAAGAACAAGTTAAGAATAT TCCAAGGCTTTTGGGACTCTAAAACACCCAATGTCTTAGGAAAATGGACA AATATACTCACAAAATAGGGAAAATAAGAACATGTTAAGAACATTTTTAG GCTCAAAACTCAAAAAGTTAAGAACATCTGAAGGCTTCAAAAATTTCAGA TATTCTTATAAAAAAACGTATATGAATTGGTCTGTTTTTTTATTTCAGAA AACCTAATATAGAAAATTCATACAAAGAAATCAATAGCTTACCCTTAATG ACCCTTAATGGCATATTTTACAGGATTAAGAGGGAAACCAAGAAAACACC TATTGAGCGGGAAGCCGCGGGAAGCCATTAAATTCGCATTTAATTAGCGA TTATGATTTTTAATTTTTGCGGACTCATTCATTTTGAAACGTGTACATAT TGCAATGGTGGATTCTTTTAGTTTTTTTTCAATTCCGCCCTGAAAGAACA TTTTAATGATACTTTAATATCTTCCGTTGATATTTTGATTGGCAACAATC GCACCTTTGTTTGTTTTGCAATGGATATATATTATCGGATTTTTTGGAAT TTTCTATCAAAGTTACCTTTGTTTTTACTAAATTTGCTTAAAATTGCCTT CTTCAAATTGATGTTCCTCTAATTCGACGTTCTTCTATGCAAACTACATT ATTCGATAATATTGAAAGTTACTCTTAACAAGAAACTATTCTTAACGACG CTCTACTAATCGATACGCTCTCGTATTCGATGAAGGTACACGATTCATCT TGGAGAAATTAAATCAACATCAATTGTTTACATAGTTGCCTGAAAAAGTG TCTCGTACAAAACATGCCATGAAAGTCCCAGTAGCAAATGTAGAAACTTT TGTATAATAATCAAACCATTAAATAATTATCATTTTATTAATTTTTAAGG CAGCAACGCGAGAAGAAGATCAAAAAGAAAGGAGGCCTGGTAAGTAGTGT GACGTCATTCATTCATTACATCATTTTGCACCAATCATTTATTGATTTGC AATCAATATCTTTCTTTAAACAGAATATAAAAGCATCATTGACCAATATT GAGATGGTTTAAGTGGTCTGCATGCAATACCGAGAAAAAATCAGCAATTG TTTCCTCGAATACCGTATTACCGGATAGAGGAAAAGGCAATACCGTATCA CCAAAAACGTTGAATTCCATTCAGAGGTTGAAAATTTTGCAAACGCGTAC TAAAAATGATGATAAACAATAGTGCCCTAAAACTCAACAATAAGAACTAA ACAGGCCTTCTTGAAGTCTCGCCGTTTCAACATATGTTCTTCATTCTTCA ATTTTTCTTTTCCAGAACTTGAAGAAACTCTCTAAACTGGAAAACGATGC AGTTTTACACGGATATGCAGAATCGTATGAATTTTGTCAACAAAACTTCA AATATGAACCATGGAATTGTCCTAAACCTCAAGCAGTTAAGAATGCTAAG CACCCTATCTCATTTACTGATATATATGAACATGGTAAGTTAATAGTCTA ACATAACTAAATTTGACAAAAAAACTTCTTCATACCAAATATGTGATCAA CCTTTTAGCCGGCACACGACGTTGTTTCAACGTCTATCTCACATTCACAA CGTCCATATAACGTTGAATGAACGTTGAAACAATGTTGTATGACAACTGA GTCACTTCACCCGGTCAAATGTCTCATGCTTAAAAACACTCAGAAAAATT CATAAAGAGATTTTCAAAAAGCAGCAATCGATATGTGGCGAATTTGAAAA TGTGTTTAACTACAGACTTTAAAGGGGACGTCAGCTTTGGAATATCATTT TTACCAATAATAAGGATTGCAATCAGGAGGATTGATGATTTAGAATTATT TTTCAATCAAACTCATTCAATCAAACTCATACCCAGGGCTACTTTCTTAC TTACTGATGGACATGATACAATTGTGACCGCTACCAAAATGATAAGAAAA GTGCTAAGGGACTATATATGAGTTTGTTCTTCATTTTTTTTGTTTCTACT TTCAGCTACCAAAGAAGCATCGTATATCTACTCCATTGTAGCTGCTGGAG TAACCCATTACGTCATCCGAGCATGTCAACAAGGTAAAGACCGGAACTGT CAATGTAAAAGCAAGAAGCCAAAGAACGGCCTCGGCGCGCCAGTTGTGAT GTGCCAAAGTATTATTGATCACGGTACAAAACGTGCCCGACGTATTCTAA AGCAAATGGATTTCAAGAAAGTTTCAGATCCTGTCCGTAAAGCGTTCAAC TGGAAAAATGCTGCAAGCGGACTTCAGGTAAGCTGATATTTTTTTGTCGT TTAAATGACTGAGAACTGGTGGGCGGGCTGTCAATTGCAATAAATGTAGA AATTTGATTTTTCGGAGATTCAATCATGTGTTTTTCCAATCACTATTCAT ATTTATGTGACGAAATGAGAATTTCTGTCCAACTGTATATCTGTATATTC ACTCAGGAGATTAGGGTGGCAGTTTAAATGTGTCTATGCTTACAGAACCG GGCTGCACTGTTGAGCCCCGGGAAGAACGAAACACTTGTCTATTTGTAAT TAAAGTTTATTTTTTTCTATCTTTCTAGGTCTATCGACAATTAATGCCAA GGGAATGTCGATGCAGTGGAGTATCTGGTCACTGTACTGCAACTGTATGT TGGGAAGCTACTCCACCATCTTTAAAAGTACCAGCACAACAATTAAAACA ACTCTACAATAAAGCTGTTAAAATCAAACCAACTGAAATTGAAAAACCAT TTTTCCCAACTAAAAATCCAAACCGTAGCAGACCTGCACGTAACCTTGTC AATGATACAAAACTAATCTATATTACTGACTCTCCGAGTTATTGTAAACC TAATCCGTTATTAGGGTTACCTGGTACTTTAAACCGGGAATGTGACCACA CACAAGACAATAGTTGTAATAAATTATGCAGTAAATGTGGATATAGAAAA CATTCGGTAGTGAAGAAACATATCAATACGAAATGTAATTGTAAATTCCA TTGGTGCTGCAAGGTCACGTGTGATACTTGTATTGAACGTCGATTGGTTA CTAAATGTTATTTACCGTCATCCTGA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000035_pilon:1625057..1637432-

>XLOC_045775 ID=XLOC_045775|Name=XLOC_045775|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2064bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000035_pilon:1625057..1637432- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAGTTTGAGCTTGCGTTTCTGGTTTTGGCACAACTTGTTCTGCTCTA
CGGATGAAGTTTGAGCTTGCGTTTCTGGTTTTGGCACAACTTGTTCTGCT
CTACGGGCAGCAACGCGAGAAGAAGATCAAAAAGAAAGGAGGCCTGGCAG
CAACGCGAGAAGAAGATCAAAAAGAAAGGAGGCCTGAACTTGAAGAAACT
CTCTAAACTGGAAAACGATGCAGTTTTACACGGATATGCAGAATCGTATG
AATTTTGTCAACAAAACTTCAAATATGAACCATGGAATTGTCCTAAACCT
CAAGCAGTTAAGAATGCTAAGCACCCTATCTCATTTACTGATATATATGA
ACATGAACTTGAAGAAACTCTCTAAACTGGAAAACGATGCAGTTTTACAC
GGATATGCAGAATCGTATGAATTTTGTCAACAAAACTTCAAATATGAACC
ATGGAATTGTCCTAAACCTCAAGCAGTTAAGAATGCTAAGCACCCTATCT
CATTTACTGATATATATGAACATGCTACCAAAGAAGCATCGTATATCTAC
TCCATTGTAGCTGCTGGAGTAACCCATTACGTCATCCGAGCATGTCAACA
AGGTAAAGACCGGAACTGTCAATGTAAAAGCAAGAAGCCAAAGAACGGCC
TCGGCGCGCCAGTTGTGATGTGCCAAAGTATTATTGATCACGGTACAAAA
CGTGCCCGACGTATTCTAAAGCAAATGGATTTCAAGAAAGTTTCAGATCC
TGTCCGTAAAGCGTTCAACTGGAAAAATGCTGCAAGCGGACTTCAGCTAC
CAAAGAAGCATCGTATATCTACTCCATTGTAGCTGCTGGAGTAACCCATT
ACGTCATCCGAGCATGTCAACAAGGTAAAGACCGGAACTGTCAATGTAAA
AGCAAGAAGCCAAAGAACGGCCTCGGCGCGCCAGTTGTGATGTGCCAAAG
TATTATTGATCACGGTACAAAACGTGCCCGACGTATTCTAAAGCAAATGG
ATTTCAAGAAAGTTTCAGATCCTGTCCGTAAAGCGTTCAACTGGAAAAAT
GCTGCAAGCGGACTTCAGGTCTATCGACAATTAATGCCAAGGGAATGTCG
ATGCAGTGGAGTATCTGGTCACTGTACTGCAACTGTATGTTGGGAAGCTA
CTCCACCATCTTTAAAAGTACCAGCACAACAATTAAAACAACTCTACAAT
AAAGCTGTTAAAATCAAACCAACTGAAATTGAAAAACCATTTTTCCCAAC
TAAAAATCCAAACCGTAGCAGACCTGCACGTAACCTTGTCAATGATACAA
AACTAATCTATATTACTGACTCTCCGAGTTATTGTAAACCTAATCCGTTA
TTAGGGTTACCTGGTACTTTAAACCGGGAATGTGACCACACACAAGACAA
TAGTTGTAATAAATTATGCAGTAAATGTGGATATAGAAAACATTCGGTAG
TGAAGAAACATATCAATACGAAATGTAATTGTAAATTCCATTGGTGCTGC
AAGGTCACGTGTGATACTTGTATTGAACGTCGATTGGTTACTAAATGTTA
TTTACCGTCATCCTGAGTCTATCGACAATTAATGCCAAGGGAATGTCGAT
GCAGTGGAGTATCTGGTCACTGTACTGCAACTGTATGTTGGGAAGCTACT
CCACCATCTTTAAAAGTACCAGCACAACAATTAAAACAACTCTACAATAA
AGCTGTTAAAATCAAACCAACTGAAATTGAAAAACCATTTTTCCCAACTA
AAAATCCAAACCGTAGCAGACCTGCACGTAACCTTGTCAATGATACAAAA
CTAATCTATATTACTGACTCTCCGAGTTATTGTAAACCTAATCCGTTATT
AGGGTTACCTGGTACTTTAAACCGGGAATGTGACCACACACAAGACAATA
GTTGTAATAAATTATGCAGTAAATGTGGATATAGAAAACATTCGGTAGTG
AAGAAACATATCAATACGAAATGTAATTGTAAATTCCATTGGTGCTGCAA
GGTCACGTGTGATACTTGTATTGAACGTCGATTGGTTACTAAATGTTATT
TACCGTCATCCTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_045775XLOC_045775-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000035_pilongenomesc0000035_pilon:1625057..1637432 -
Properties
Property NameValue
Aaloc535-1032:499
Aaloc265-534:1070
Aaloc94-261:1762
Aaloc55-93:2177
Aaloc1-51:12377